Xpert MTB/RIF 检测系统对肺结核临床诊断病例的应用价值

目的 评价Xpert MTB/RIF检测系统对肺结核临床诊断病例的应用价值。方法 对296例肺结核临床诊断病例的同一痰标本分别进行BACTEC MGIT 960液体培养和Xpert MTB/RIF检测,以BACTEC MGIT 960液体培养病原学检测和药敏结果为金标准计算Xpert MTB/RIF检测系统的检验效能指标。结果 Xpert MTB/RIF检测系统与金标准存在的差异具有统计学意义 (P<0.005),其病原学诊断灵敏度为84.9%(118/139),特异度为97.5%(153/157),筛查利福平耐药的灵敏度为85.2%(23/27),特异度为100.0%(91/91),一致性检验发现两种方法在病原学诊断和利福平药敏筛检的kappa值分别为0.829和0.899。结论 Xpert MTB/RIF检测系统用于肺结核临床诊断病例的实验室诊断和利福平耐药的筛检都不同于BACTEC MGIT 960检测系统,Xpert MTB/RIF检测系统借助其较高的灵敏度和特异度、快速和操作方便的优势,值得在中国结核病实验室推广应用。     

RT-LAMP与LAMP法检测结核分枝杆菌的效果比较

目的 比较RT-LAMP、LAMP、L-J法检测MTB的效果,为结核病的快速诊断提供依据。方法 用常见的非结核分枝杆菌与其他常见的呼吸道感染病菌(金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌)检测特异性,并用酶切实验对结核分枝杆菌特异性产物进行酶切鉴定;用RT-LAMP、LAMP、L-J法检测100名结核病患者和22名来自无结核病患者痰标本中的结核分枝杆菌测试灵敏性;对浓度为1 ng/μL H37Rv标准株进行对倍比稀释用于RT-LAMP极限检测实验。结果 RT-LAMP、LAMP、L-J方法的阳性率分别为100%,92%和88%;RT-LAMP和L-J, RT-LAMP和LAMP差异均有统计学意义;RT-LAMP的灵敏度比LAMP高10倍;RT-LAMP不仅可以识别活菌,并且能够重复检测MTB的单一拷贝。结论 RT-LAMP检测效果优于LAMP及L-J,适于基层医院结核病诊断的推广和应用。     

荧光PCR探针熔解曲线技术检测涂阳患者痰标本中结核分枝杆菌耐药性的价值

目的 评估荧光PCR探针熔解曲线(MeltPro)技术检测涂阳患者痰标本中MTB耐药性的效能。方法 收集2016年9月至2018年8月西安市胸科医院500例痰涂片阳性患者的痰标本,分别进行痰涂片镜检、GeneXpert MTB /RIF检测、BACTEC MGIT 960(简称“MGIT 960”)液体培养、表型药物敏感性试验(简称“药敏试验”),并应用MeltPro法检测痰标本中MTB菌株对利福平、异烟肼、二线注射类和氟喹诺酮类等抗结核药物的耐药性,并以表型药敏试验为标准,评价MeltPro法的检测效能。结果 以表型药敏试验结果为标准,MeltPro法检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为98.7%(76/77)和94.2%(343/364),检测对异烟肼耐药性的敏感度和特异度分别为82.3%(102/124)和96.2%(304/316),检测对阿米卡星耐药性的敏感度和特异度分别为8/9和99.5%(432/434),检测对卷曲霉素耐药性的敏感度和特异度分别为6/7和99.1%(432/436),检测对左氧氟沙星耐药性的敏感度和特异度分别为90.6%(48/53)和99.2%(386/389),检测对莫西沙星耐药性的敏感度和特异度分别为88.1%(37/42)和96.5%(386/400)。以表型药敏试验结果为标准,GeneXpert MTB/RIF检测MTB对利福平耐药性的敏感度和特异度分别为94.8%(73/77)和94.0%(342/364)。GeneXpert-MTB/RIF和MeltPro法与表型药敏试验结果一致性均较好(Kappa值分别为0.81和0.84),但MeltPro法检测效能与表型药敏试验检测结果的一致性更高。结论 MeltPro法检测涂阳患者痰标本中MTB菌株对利福平、异烟肼,以及二线注射类和氟喹诺酮类抗结核药物耐药性有较好的效能。     

Xpert MTB/RIF、荧光染色镜检、改良罗氏培养在肺结核实验室诊断中的应用

目的评价Xpert MTB/RIF、荧光染色镜检、改良罗氏培养在肺结核实验室诊断中的应用价值。方法收集2015年1月至2016年8月在北京市昌平区结核病防治所门诊1967例初诊被怀疑为肺结核的患者的痰标本,每例患者至少留取两份合格痰标本,实验室人员对每份痰标本均进行涂片镜检和固体培养,选择其中一份痰进行Xpert MTB/RIF检测;培养阳性菌株完成对硝基苯甲酸(P-nitrobenzoic acid,PNB)初步菌种鉴定,对鉴定为结核分枝杆菌的菌株采用比例法进行利福平药敏试验。结果 720例确诊肺结核患者中,涂片镜检、固体培养和Xpert MTB/RIF检测的灵敏度分别为18.06%(130/720)、26.94%(194/720)和36.25%(261/720)。Xpert MTB/RIF检测诊断肺结核病的灵敏度显著高于涂片镜检(χ~2=60.25,P0.01)和固体培养(χ~2=14.42,P0.01)。以比例法药敏试验结果为金标准,Xpert MTB/RIF检测利福平耐药的灵敏度和特异度分别为100%(10/10)和96.97%(160/165)。结论 Xpert MTB/RIF检测灵敏度和特异度较高,可更好的为临床肺结核病早期诊断及指导患者用药提供实验室依据。     

三种分子生物学方法检测结核分枝杆菌耐药性的效能分析

目的 评价GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)、基因芯片检测及实时荧光定量PCR熔解曲线法(简称“PCR熔解曲线法”)检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性的价值。方法 选取2017年1月至2018年1月西安市胸科医院有表型药物敏感性试验(简称“表型药敏试验”)结果的痰MTB培养阳性的774例肺结核患者作为研究对象,收集其表型药敏试验、GeneXpert、基因芯片及PCR熔解曲线法检测结果。以表型药敏试验结果为参照标准,评估3种分子生物学方法检测MTB耐药性的效能;根据受试者工作特征曲线(ROC曲线)下面积比较3种分子生物学方法检测MTB对利福平(RFP)耐药性的准确度。结果 以表型药敏试验结果为参照标准,GeneXpert检测MTB对RFP耐药性的敏感度和特异度分别为95.6%(87/91)和93.6%(249/266);基因芯片检测MTB对RFP和异烟肼(INH)耐药性的敏感度分别为92.8%(90/97)和78.8%(130/165),特异度分别为96.8%(610/630)和99.1%(557/562);PCR熔解曲线法检测MTB对RFP、INH、左氧氟沙星(Lfx)和阿米卡星(Am)耐药性的敏感度分别为:94.4%(51/54)、82.4%(61/74)、87.1%(27/31)、75.0%(6/8),特异度分别为:93.9%(138/147)、95.3%(121/127)、98.8%(164/166)、99.5%(188/189)。以表型药敏试验结果为参照标准,GeneXpert检测MTB对RFP耐药性ROC曲线下面积为0.95±0.02,基因芯片法和PCR熔解曲线法检测MTB对RFP耐药性曲线下面积均为0.93±0.03。结论 GeneXpert、基因芯片及PCR熔解曲线法检测MTB培养阳性肺结核患者对一线抗结核药物耐药性均比较可靠;PCR熔解曲线法检测MTB对Lfx和Am耐药性比较可靠。     

KOD DNA聚合酶荧光PCR技术在肺结核诊断中的应用评价

目的 评估基于KOD DNA聚合酶的荧光PCR技术在肺结核诊断中的临床应用价值。方法 采集2019年10月至2020年4月疑似肺结核的住院患者痰标本,进行涂片抗酸染色、MGIT960液体培养、KOD DNA聚合酶荧光PCR和Taq DNA聚合酶荧光PCR检测。以临床诊断结果为参照,MGIT960液体培养法为金标准,荧光PCR与Taq DNA聚合酶荧光PCR法比较,评价KOD DNA聚合酶荧光PCR法检测MTB的效能。结果 共对337例临床样本进行检测,MGIT960液体培养法、Taq DNA聚合酶荧光PCR和KOD DNA聚合酶荧光PCR检测MTB的敏感度分别为71.56% (156/218)、76.15% (166/218) 和76.61% (167/218)。KOD DNA聚合酶荧光PCR与MGIT960液体培养检测敏感度差异无统计学意义 (χ²=1.445,P=0.229>0.05)。KOD DNA聚合酶荧光PCR检测MTB的敏感度和特异度分别为92.31% (144/156)和86.39% (146/169),涂阴患者中检测敏感度和特异度分别84.21% (64/76)和88.48% (146/165)。结论 KOD DNA聚合酶荧光PCR检测MTB敏感度和特异度较高,能够为临床诊断肺结核提供依据,操作简便、快速,适合在我国各级结核病实验室推广。     

结核病诊断T-SPOT.TB、Gene Xpert MTB/RIF技术应用价值研究北大核心CSCD

目的评估结核分枝杆菌及其利福平耐药株实时荧光定量核酸扩增(Gene Xpert MTB/RIF)和结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)在结核病诊断中的价值。方法分析2020年1月-2022年3月济宁市公共卫生医疗中心收治的住院及门诊病患者643病例的抗酸染色镜检、960液体培养、Gene Xpert MTB/RIF检测和结核抗体、T-SPOT.TB检测结果,评价Gene XpertMTB/RIF和T-SPOT.TB检测诊断结核病的特点和价值,以临床诊断为金标准,以检测方法的敏感度、特异度及绘制的ROC曲线等作为评价指标。结果抗酸染色、960快速培养和Gene Xpert MTB/RIF检测结核病的敏感度分别为21.57%、39.21%和59.80%,特异度分别为100.00%、97.22%和100.00%。ROC曲线分析显示,抗酸染色、960结核菌培养和Gene XpertMTB/RIF的AUC分别是0.60、0.70和0.80,差异有统计学意义(P<0.05);95%置信区间范围分别为0.50~0.70,0.61~0.78,0.73~0.87。T-SPOT.TB和结核抗体检测的敏感度分别为84.61%和70.19%,特异度分别为95.83%和79.16%。ROC曲线分析结核抗体与TSPOT检测的AUC分别为0.75和0.90,95%,置信区间范围分别为0.64~0.86和0.84~0.97。T-SPOT.TB和Gene Xpert MTB/RIF的阳性率分别为86.47%和36.60%。结论在结核病诊断中,Gene Xpert MTB/RIF和T-SPOT.TB检测结核病的敏感性高于痰涂片和痰培养检查及结核抗体检测,其中T-SPOT.TB检测的阳性率较高。Gene Xpert MTB/RIF和T-SPOT.TB均可应用于肺结核的临床诊断以提高肺结核的诊治效率。     

支气管镜肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF技术诊断早期耐药肺结核的临床意义

目的分析支气管镜肺泡灌洗液(BALF)Xpert MTB/RIF技术用于早期耐药肺结核快速诊断的临床意义。 方法采集疑诊肺结核102例BALF标本,行抗酸涂片、罗氏培养、Xpert MTB/RIF检测,以罗氏培养菌种鉴定及药敏试验为金标准,分析Xpert MTB/RIF技术检出结核分枝杆菌(MTB)及早期耐药肺结核的价值。 结果102例疑诊肺结核经临床确诊为肺结核76例(74.51%);抗酸染色诊断肺结核敏感度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为19.74%、88.46%、37.25%、83.33%、27.38%,罗氏培养诊断敏感度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为40.79%、80.77%、50.98%、86.11%、31.82%;Xpert MTB/RIF敏感度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为64.47%、100.00%、73.53%、100.00%、49.06%,与临床诊断一致性高于抗酸染色及罗氏培养(P<0.05);以罗氏培养为金标准,Xpert MTB/RIF检出MTB敏感度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为96.77%、57.78%、73.68%、61.22%、96.30%,一致性Kappa值为0.500,MTB分级：高分级5例,中分级14例,低分级15例,极低15例;Xpert MTB/RIF检出早期耐药肺结核敏感度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为100.00%、91.67%、93.55%、77.78%、100.0%,一致性Kappa值为0.832,MTB耐药位点以探针Probe E(529~533)为主;Xpert MTB/RIF技术检查耗时短于抗酸染色及罗氏培养(P<0.05)。 结论Xpert MTB/RIF技术(BALF标本)对涂阴肺结核及耐药肺结核综合诊断效能优于传统抗酸涂片及罗氏培养,耗时短,具有临床意义。     

The diagnostic value of GeneXpert MTB/RIF of the lapping suspension of the thoracoscopic biopsy tissue in tuberculous pleural effusions

目的 评价内科胸腔镜胸膜活检组织标本研磨悬液行结核分枝杆菌GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)检测对结核性胸膜炎的诊断价值。方法 选择2017年1月1日至12月31日在沈阳市胸科医院胸膜炎病房住院,行内科胸腔镜检查的不明原因胸腔积液患者51例,均未经过抗结核药物治疗。所有患者胸膜活检组织标本一部分行常规病理检查,另一部分研磨处理后制成悬液,行BACTEC MGIT 960分枝杆菌液体培养(简称“MGIT 960培养”)及Xpert 检测。以MGIT 960培养阳性并菌种鉴定为结核分枝杆菌和胸膜组织活检病理肉芽肿性病变并抗酸染色阳性作为确诊标准,评价活检组织研磨悬液行Xpert检测在结核性胸膜炎诊断中的价值。结果 51例患者中有34例确诊为结核性胸膜炎,其中通过MGIT 960培养阳性并菌种鉴定为结核分枝杆菌而确诊者20例(39.2%,20/51),通过胸膜组织活检病理阳性而确诊者17例(33.3%,17/51),其中3例患者被2种检测方法同时确诊;17例(33.3%)诊断为非结核性胸腔积液。以最终诊断结果为金标准,Xpert法、MGIT 960培养法、病理检查诊断的敏感度和特异度分别为64.7%(22/34)和100.0%(17/17)、58.8%(20/34)和100.0%(17/17)、50.0%(17/34)和100.0%(17/17);Xpert 法检测的敏感度高于MGIT 960培养法和病理诊断,但差异无统计学意义(χ ²=1.53,P=0.466)。结论 内科胸腔镜直视下取胸膜组织活检标本,通过研磨后使其液化,再行结核分枝杆菌Xpert检测,敏感度及特异度均较高,对结核性胸膜炎的确诊具有一定的临床意义。     

The value of Xpert MTB/RIF detection technology in diagnosis of tuberculosis

目的 评价Xpert MTB/RIF 检测技术在综合性医院结核病诊断中的价值。方法 收集2016年6月至2017年8月入住株洲市中心医院疑似结核病患者的各类标本376份,其中痰标本227份(60.37%),肺泡灌洗液109份(28.99%),脑脊液21份(5.59%),胸腔积液15份(3.99%),其他标本4份(1.06%,包括引流液、脓液、分泌物、尿液各1份),分别进行GeneXpert MTB/RIF检测(简称“Xpert法”)、夹层杯液基集菌抗酸染色涂片镜检法(简称“夹层杯法”)和传统固体罗氏培养法(简称“固体培养法”)检测结果的比较和临床分析。采用SPSS 19.0软件进行数据资料处理,计数资料采用χ ²检验,以P<0.05为差异有统计学意义。 结果 376例疑似结核病患者的各类标本中,最终临床诊断为结核病349例,非结核病27例。Xpert法检测阳性率(37.50%,141/376)明显高于夹层杯法(22.87%,86/376)和固体培养法(17.82%,67/376)(χ ²值分别为19.09、36.39,P值均<0.05);以临床诊断结果为标准,Xpert法检测敏感度(40.11%,140/349)明显高于夹层杯法(23.50%,82/349)和固体培养法敏感度(19.20%,67/349)(χ ²值分别为19.86、35.98,P值均<0.05),且Xpert法检测结果与临床确诊结果的一致性(K=0.080)高于夹层杯法(K=0.016)与固体培养法(K=0.033)。140份Xpert法检测阳性的标本中利福平耐药率(15.71%,22/140)与63份固体培养法检测阳性的标本中利福平耐药率(14.29%,9/63)差异无统计学意义(χ ²=0.07,P>0.05),且耐利福平患者一致。 结论 Xpert法检测技术操作简单、快捷、敏感度高,对综合性医院早期诊断、治疗结核病具有很高的临床应用价值。     

灌洗液Xpert MTB/RIF检测在涂片阴性及无痰疑似肺结核患者中的应用分析

目的 探讨灌洗液Xpert MTB/RIF检测在涂片阴性及无痰疑似肺结核患者中的诊断效能.方法 选取河南省胸科医院结核科2020年1月1日至2020年6月30日期间收治的疑似肺结核患者98例为研究对象,留取气管镜灌洗液行抗酸染色、Xpert MTB/RIF检测、分枝杆菌液体培养,以灌洗液分枝杆菌液体培养结果、病理诊断结...     

Xpert MTB/RIF对结核菌利福平耐药的诊断价值及rpoB基因突变特点的分析

目的分析Xpert MTB/RIF检测对结核分枝杆菌利福平耐药的诊断价值及rpoB基因突变特点。方法回顾分析2016年1月至2020年6月期间来院就诊患者相同标本,同时进行了结核分枝杆菌培养及药敏试验和Xpert MTB/RIF检测,且任一种方法检出MTB。结果用Xpert MTB/RIF及培养药敏两种方法检测标本共7659例,Xpert MTB/RIF对MTB的检出率高,且有统计学意义(P<0.05)。两种方法同时检出MTB 3621例,Xpert MTB/RIF检出利福平耐药262例,培养药敏检出利福平耐药238例;两种方法检测利福平耐药的一致率为99.01%;采用Kappa检验,两种方法的检测结果完全符合。RR-TB探针突变的频率为E探针63.37%、D探针20.16%、B探针8.23%、A探针4.53%、C探针0.82%、联合探针突变2.88%;以培养药敏结果为利福平耐药的金标准,Xpert无探针突变组利福平耐药的准确性要明显低于有探针突变组;初治和复治病例探针突变频率差异有统计学意义。结论Xpert MTB/RIF检测可以快速有效的诊断利福平耐药结核,有助于早发现、早治疗。利福平耐药结核探针突变主要发生在E探针和D探针,C探针突变最少。     

结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术诊断艾滋病患者肺结核的临床应用评价

目的:探讨结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测(Xpert MTB/RIF)技术诊断艾滋病患者肺结核的应用价值。方法:回顾性分析2017年7月至2019年11月上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心收治的226例疑似肺结核的艾滋病患者的临床资料。分别进行痰涂片荧光染色显微镜下检查、BACTEC MGIT 960液体培养(或罗氏固体培养)和Xpert MTB/RIF检测,并分析在艾滋病患者中Xpert MTB/RIF技术诊断MTB感染和利福平耐药的灵敏度和特异度。结果:226例疑似肺结核患者中,痰培养阳性94例(41.6%),其中MTB阳性51例(54.3%),非结核分枝杆菌(nontuberculosis mycobacteria,NTM)阳性43例(45.7%)。以痰分枝杆菌培养阳性且结核分枝杆菌分泌蛋白64抗原阳性为金标准,Xpert MTB/RIF技术诊断MTB的灵敏度为72.6%[95%可信区间(confidence interval,CI)66.7%~78.4%],特异度为97.1%(95%CI 95.0%~99.3%)。Xpert MTB/RIF技术诊断痰涂片阳性患者MTB的灵敏度为76.7%(95%CI 67.7%~85.8%),特异度为90.0%(95%CI 83.6%~96.5%)。Xpert MTB/RIF技术诊断痰涂片阴性患者MTB的灵敏度为50.0%(95%CI 41.8%~58.2%),特异度为99.3%(95%CI 97.9%~100.0%)。18例患者同时检测利福平表型和基因型耐药,以表型耐药为金标准,Xpert MTB/RIF技术检测利福平基因型耐药的灵敏度为75.0%,特异度为100.0%。结论:艾滋病患者中Xpert MTB/RIF技术诊断肺结核的灵敏度和特异度均较高,且能快速区分MTB和NTM,具有较好的应用价值。     

利用Xpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌及利福平耐药性的研究

目的初步评价Xpert结核分枝杆菌/利福平(Mycobacterium tuberculosis/Rifampicin,MTB/RIF)技术对不同类型临床标本进行结核分枝杆菌及其耐药性的检测中的应用价值。方法对627例结核病患者标本分别采用Xpert MTB/RIF、涂片及培养法检测,对结果进行比较。结果 (1)经统计学分析,总体Xpert MTB/RIF法阳性率41.78%(287/627)高于涂片法阳性率24.56%(154/627),差异有统计学意义(χ~2=261.87,P0.01);Xpert MTB/RIF法阳性率高于培养法阳性率26.63%(167/627),差异有统计学意义(χ~2=249.72,P0.01);涂片法与培养法间差异无统计学意义(χ~2=20.71,P0.05)。(2)Xpert MTB/RIF和比例法药敏试验检测RFP的耐药率分别为21.43%(33/154)、20.78%(32/154),二者间差异无统计学意义(χ~2=20.02,P0.05);二种方法所得结果一致率96.75%(149/154)。结论 Xpert MTB/RIF法具有快速、简单、敏感度高、便于操作、对生物安全要求不高等优点,能同时检测出结核分枝杆菌和是否对利福平耐药,具有广泛的应用前景。     

支气管肺泡灌洗液行Xpert MTB/RIF检测对涂阴肺结核的诊断价值

目的评价支气管肺泡灌洗液行Xpert MTB/RIF检测对涂阴肺结核的诊断价值。方法选取从2014年11月至2015年12月徐州市传染病医院收治的3次痰涂片阴性的可疑肺结核患者110例,对所有患者行支气管镜检查进行刷检及收集BALF,进行涂片镜检找抗酸杆菌、结核分枝杆菌培养及Xpert MTB/RIF检测,同时进行诊断。分别以BALF的罗氏培养结果及临床诊断标准作为肺结核诊断的阳性标准,计算Xpert MTB/RIF诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度、阳性预测值及阴性预测值。结果以BALF培养阳性结果作为判断肺结核的阳性标准,BALF行Xpert MTB/RIF检测对诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为100%、97.4%、97.8%、100%。以临床诊断标准为诊断肺结核的阳性标准,BALF行Xpert MTB/RIF检测对诊断涂阴肺结核的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为81.9%、97.4%、98.3%、74.0%。以DST结果为金标准,Xpert MTB/RIF检测利福平耐药的敏感度、特异度分别为75.0%、96.0%。结论BALF行Xpert MTB/RIF检测在涂阴肺结核中的敏感度、特异度均较高,且检测快速并能判断是否利福平耐药,对涂阴肺结核的快速诊断及治疗具有较大的应用价值。     

二代测序技术检测临床痰标本中结核分枝杆菌的初步评价

目的 评价二代测序(NGS)技术对临床痰标本中结核分枝杆菌的检测效能。方法采用前瞻性研究方法,选取北京市疾病预防控制中心(北京结核病控制研究与防治所)2021年8—10月接诊的49例疑似肺结核患者痰标本,同时进行抗酸杆菌涂片镜检(简称“涂片”)、分枝杆菌培养(包含罗氏培养和MGIT 960液体培养;简称“培养”)、GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)和NGS技术检测结核分枝杆菌,比较4种方法检测不同分类患者阳性率差异,并以最终临床诊断为参照标准,评价4种检测方法的检测效能。结果49例疑似肺结核患者中,最终肺结核诊断者40例(包括病原学确诊患者25例、病原学阴性临床诊断患者15例),非肺结核患者9例(包括肺炎6例,非结核分枝杆菌感染、慢性阻塞性肺疾病和哮喘各1例)。NGS技术检测49例疑似肺结核患者的阳性率[69.4%(34/49)]明显高于涂片[44.9%(22/49)]、培养[51.0%(25/49)]和Xpert[49.0%(24/49)],差异均有统计学意义(χ²=17.614、17.018、20.753,P值均=0.000);检测病原学阴性肺结核患者的阳性检出率为46.7%(7/15)。 以临床诊断结果为参照标准,涂片、培养、Xpert、NGS技术对49例疑似患者痰标本的检测敏感度分别为55.0%(22/40)、60.0%(24/40)、60.0%(24/40)、80.0%(32/40),特异度分别为9/9、8/9、9/9、7/9,一致率分别为63.3%(31/49)、65.3%(32/49)、67.3%(33/49)、79.6%(39/49),Kappa值分别为0.310、0.297、0.355、0.459。结论以临床诊断为参考标准,NGS技术检测的敏感度最高,与临床诊断的一致性也最高,能够快速、高效检测痰标本中的结核分枝杆菌,可早期辅助诊断疑似肺结核患者。     

A comparison between the efficiency of the Xpert MTB/RIF assay and nested PCR in identifying Mycobacterium tuberculosis during routine clinical practice

Objectives

Polymerase chain reaction (PCR) for the detection of Mycobacterium tuberculosis (MTB) is more sensitive, specific, and rapid than the conventional methods of acid-fast bacilli (AFB) smear and culture. The aim of this study was to determine if the Xpert MTB/rifampicin (RIF) assay had additional advantages over nested PCR for the detection of MTB in a geographical area with intermediate tuberculosis (TB) incidence.

Methods

Between February and December 2013, the Xpert MTB/RIF assay and MTB nested PCR, as well as AFB smear and culture, were simultaneously performed on 198 clinical samples (160 pulmonary and 38 non-pulmonary specimens) collected from 171 patients hospitalized at Hallym University Medical Center for possible TB. The accuracy of the diagnosis of MTB culture-positive TB and the turnaround time of reporting laboratory results were calculated and compared. Rifampin resistance by the Xpert MTB/RIF assay was reviewed with that of conventional drug susceptibility testing (DST).

Results

The sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values of the Xpert MTB/RIF assay and MTB nested PCR for diagnosis of MTB culture-positive pulmonary TB were 86.1% vs. 69.4% (P=0.1563), 97.8% vs. 94.1% (P=0.2173), 91.2% vs. 75.8% (P=0.1695), and 96.4% vs. 92.0% (P=0.2032), respectively. The median turnaround times of the Xpert MTB/RIF assay and MTB nested PCR were 0 [0-4] days and 4 [1-11] days, respectively (P<0.001). Two cases of rifampin resistance, as determined by the Xpert MTB/RIF assay, were found to be multi-drug resistant (MDR) pulmonary TB by DST.

Conclusions

The Xpert MTB/RIF assay seemed to be sensitive, specific, and comparable to nested PCR for identifying MTB among clinically suspected TB patients, and the assay can be valuable in giving a timely identification of resistance to rifampin.     

二代测序技术检测临床痰标本中结核分枝杆菌的初步评价CSCD

目的:评价二代测序(NGS)技术对临床痰标本中结核分枝杆菌的检测效能。方法:采用前瞻性研究方法,选取北京市疾病预防控制中心(北京结核病控制研究与防治所)2021年8—10月接诊的49例疑似肺结核患者痰标本,同时进行抗酸杆菌涂片镜检(简称“涂片”)、分枝杆菌培养(包含罗氏培养和MGIT 960液体培养;简称“培养”)、GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)和NGS技术检测结核分枝杆菌,比较4种方法检测不同分类患者阳性率差异,并以最终临床诊断为参照标准,评价4种检测方法的检测效能。结果:49例疑似肺结核患者中,最终肺结核诊断者40例(包括病原学确诊患者25例、病原学阴性临床诊断患者15例),非肺结核患者9例(包括肺炎6例,非结核分枝杆菌感染、慢性阻塞性肺疾病和哮喘各1例)。NGS技术检测49例疑似肺结核患者的阳性率[69.4%(34/49)]明显高于涂片[44.9%(22/49)]、培养[51.0%(25/49)]和Xpert[49.0%(24/49)],差异均有统计学意义(χ^(2)=17.614、17.018、20.753,P值均=0.000);检测病原学阴性肺结核患者的阳性检出率为46.7%(7/15)。以临床诊断结果为参照标准,涂片、培养、Xpert、NGS技术对49例疑似患者痰标本的检测敏感度分别为55.0%(22/40)、60.0%(24/40)、60.0%(24/40)、80.0%(32/40),特异度分别为9/9、8/9、9/9、7/9,一致率分别为63.3%(31/49)、65.3%(32/49)、67.3%(33/49)、79.6%(39/49),Kappa值分别为0.310、0.297、0.355、0.459。结论:以临床诊断为参考标准,NGS技术检测的敏感度最高,与临床诊断的一致性也最高,能够快速、高效检测痰标本中的结核分枝杆菌,可早期辅助诊断疑似肺结核患者。     

结核分枝杆菌及利福平耐药核酸扩增检测成本分析

目的 比较固体培养、比例法药敏和结核分枝杆菌及利福平耐药核酸扩增（Xpert Mtb/RIF）(简称“Xpert”)检测在中国基层实验室应用的检测成本。 方法 选取4个县（区）级结核病防治机构收集3次固体培养和Xpert检测成本数据,2个省参比实验室收集3次对硝基苯甲酸（PNB）菌群鉴定和比例法利福平药敏试验成本数据。采用要素法计算每种方法单位检测成本,计算每例患者不同检测方法的检测成本。在不同结核病患病率人群中,以固体培养试验为金标准,比较Xpert检测在不同检测效能下检出1例结核病患者的成本。在不同利福平耐药率的可疑人群中,以传统药敏试验为金标准,比较Xpert检测在不同检测效能下检出1例利福平耐药结核病患者的成本。调整Xpert检测设备和试剂价格后,分析Xpert检测的单位成本。 结果 固体培养、菌群鉴定、利福平药敏试验和Xpert检测的单位检测成本分别为47.87、46.73、82.86和118.62元。传统方法检测每例结核病患者所需成本（2份培养,1份传代,1份PNB鉴定试验）为172.57元。传统方法检测每例耐药结核病患者的平均成本（2份固体培养,1份传代,1份PNB鉴定及药敏试验）为208.84元。当Xpert检测结核病或利福平耐药特异度为85%时,如果检测敏感度大于70%,在结核病患病率或利福平耐药结核病患病率1%～70%的任何人群中,Xpert检出1例结核病或利福平耐药结核病患者的成本均低于传统方法。试剂价格变化对于检测成本的影响远远大于设备价格变化的影响。 结论Xpert检测是一种比传统方法更经济并快速的检测方法,适合在中国基层实验室推广。