乙肝肝硬化患者肠道微生物元基因组学的研究

目的比较分析乙肝肝硬化患者与正常人远端肠道微生物群的差异,探讨乙肝肝硬化与肠道微生物群变化的关系。方法选取11例乙肝肝硬化患者及20例正常人,提取其肠道微生物元基因组,采用高通量Solexa测序方法,通过基因比对、主成分分析、属种定量及功能代谢组成等生物信息学分析方法,找出疾病相关的属种和基因信息。结果与结论属种定量及组成分析发现,乙肝肝硬化患者存在不同程度的肠道菌群失调,表现为肠杆菌科（尤其是大肠杆菌、肺炎克雷伯菌和志贺菌属）以及韦荣球菌属富集（P〈0.05）,拟杆菌属缺失（P〈0.05）;功能及代谢分析发现,乙肝肝硬化患者富集较多的执行氨基酸和碳水化合物膜转运及代谢功能的基因。     

蜡样芽孢杆菌治疗对肝硬化患者肠道菌群的影响及其意义研究

目的：研究微生态制剂对肝硬化患者肠道菌群失调的治疗作用。方法：选择肠道菌群中具有代表性的细菌共5种进行培养和计数。选择24名正常人为对照组，计数肠道菌群中5种细菌的数量；60例肝硬化患者随机分成常规治疗组（28例）及蜡样芽孢杆菌微生态治疗组（32例），分别治疗4w，观察治疗前后肠道菌群落计数及血清脂多糖结合蛋白（LBP）的变化。结果：①肝硬化组患者存在不同程度的肠道菌群失调，主要表现为厌氧菌减少（P〈0．05），而需氧菌显著增多（P〈0．05）；②蜡样芽孢杆菌微生态治疗组可明显提高肝硬化患者肠道厌氧菌的数量（P〈0．05），降低需氧菌的数量（P〈0．05），并可降低肝硬化患者血清中LBP的浓度（P〈0．05）。结论：蜡样芽孢杆菌微生态制剂可有效改善肝硬化患者肠道菌群失调，并可降低血清LBP浓度，可以作为肝硬化患者的辅助治疗措施。     

制霉菌素引起的肠道菌群失衡及代谢物水平的变化

目的 研究广谱抗真菌药对肠道菌群平衡改变及代谢产物的影响.方法 选用C57BL/6雌性小鼠,用含广谱抗真菌药制霉菌素饮用水喂养7 d,分离小鼠血清进行代谢组学分析.分离口服制霉菌素7 d后小鼠结肠内容物,提取肠道菌群基因组进行16S rDNA扩增子测序、构建SMRT Bell文库,利用PacBio公司SMRT分析软件进行操作分类单元(OTU)物种注释.通过PCoA和PCA、NMDS等降维图和样品聚类树分析群落结构差异,选用t检验、MetaStat、LEfSe、Anosim和MRPP等方法对物种组成和群落结构进行差异显著性检验.结果 结肠内容物菌群基因组测序结果表明,微生物多样性分析显示制霉菌素降低肠道菌群多样性;与对照组比较,服药组硬壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)细菌增加;拟杆菌门(Bacteroidetes)、糖杆菌门(Saccharobacteria)细菌丰度降低;血清代谢组检测结果显示,服药组增加的物质包括葡萄糖、甘氨酸、丙氨酸、4-羟基丁酸、亮氨酸、谷氨酰胺,降低的物质为谷氨酸、乳酸.结论 小鼠肠道菌群稳态的改变可能与连续服用制霉菌素有关,厚壁菌门和拟杆菌门等优势菌种的变化明显,而且瘤胃菌群、毛螺菌科及拟杆菌群在两组之间结构差异显著,导致谷氨酸、亮氨酸等氨基酸代谢增加,而糖类代谢减慢.     

维持性血液透析终末期肾病患者肠道菌群特点探讨

 目的 探讨维持性血液透析终末期肾病(end stage renal disease,ESRD)患者肠道菌群的特点。方法 收集维持性血液透析的稳定ESRD患者和健康对照组受试者各22例粪便样本,提取样本DNA,进行16S rRNA基因测序,对肠道菌群的分布情况进行分析。结果 (1)维持性血液透析ESRD组观察到的各样品微生物物种量、物种多样性较健康对照组低,物种多样性在18～44岁组有统计学差异;(2)两组在纲、目、科、属、种分类水平上分别发现2、4、9、29、28个相对丰度有统计学差异的物种(P<0.05); 其中Negatibicutes纲、粪球菌属-3相对丰度维持性血液透析ESRD组低于健康对照组,而丹毒丝纲、目、科、属、种水平相对丰度维持性血液透析ESRD组高于健康对照组;(3)通过KEGG代谢途径的差异分析,推测两组间有3个存在统计学差异的代谢途径(P<0.05),其中与碳水化合物代谢途径相关基因在健康对照组粪便样品中显著富集,而与细胞运动性及药物耐药途径相关基因在维持性血液透析ESRD组粪便样品中显著富集。结论 维持性血液透析ESRD组患者肠道微生物群落多样性降低,与健康对照组比较在微生物群落相对丰度、KEGG功能预测相关基因代谢途径上存在差异。     

以肠道菌群为靶点的代谢综合征运动干预研究进展

代谢综合征已成为威胁全球的公共健康问题。大量实验证明,肠道菌群可通过调节宿主脂肪吸收存储相关基因影响宿主能量平衡,肠道菌群结构失调会导致宿主血液内毒素增加,诱发慢性低度炎症,致使胰岛素抵抗;适宜运动可有效干预肠道菌群结构和功能,帮助机体建立健康菌群。运用元基因组学、微生物分子生态学和代谢组学方法,揭示与代谢综合征相关的肠道菌群结构失调,鉴定出代谢综合征相关的特定细菌类群及功能,使得通过以肠道菌群为靶点的运动干预防治代谢综合征成为可能。     

异基因造血干细胞移植对肠道菌群的影响

正常情况下,肠道微生物群多样性对维持免疫稳态至关重要,但其组成及其多样性受多种因素干扰。肠道微生物群组成和多样性的改变与许多疾病如肠道移植物抗宿主病（graft-versus-host disease,GVHD）紧密相关。肠道GVHD是异基因造血干细胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo HSCT)后并发症之一,明显增加移植相关死亡率。随着高通量测序技术的不断进步,肠道GVHD与菌群多样性的关系得到了验证。然而国内关于如何改善患者预后方面的研究甚少,作者对allo HSCT后患者的肠道菌群与GVHD之间的关系作一综述,进一步总结通过平衡肠道菌群的多种治疗方法,为临床上改善手术预后,降低患者死亡率提供治疗策略。     

16S核糖体DNA Amplicon测序法分析2型糖尿病患者口腔微生物多样性

目的探讨2型糖尿病患者口腔微生物多样性及结构的差异。方法采集23例2型糖尿病患者与23名正常人的唾液与龈上菌斑样本,提取口腔菌群的总DNA,利用16S核糖体DNA（16S ribosome DNA,16SrDNA）Amplicon测序法进行测序,使用Pandaseq、Qiime等软件分析菌群多样性及结构。结果2型糖尿病患者和正常人口腔菌群丰度及优势菌属差异无统计学意义(P>0.05)。2型糖尿病患者样本中布雷德菌属、瘤胃菌科、幽门螺杆菌科丰度较高,正常人样本中韦荣菌科、Selenomonadales目、Negativicutes纲、月形单胞菌属、丁酸弧菌属、Anaeroglobus属、Candidatus Saccharibacteria门、Saccharibacteria_genera_incertae_sedis属、诺卡菌科、气微菌属丰度较高,差异有统计学意义（P<0.05）。结论用16SrDNA Amplicon测序法分析2型糖尿病患者与正常人口腔菌群结构具有相似性,幽门螺杆菌与2型糖尿病之间的关系还有待于进一步的研究。     

不同减肥方式对肠道菌群影响的研究进展

单纯性肥胖所致个体罹患心脑血管疾病、糖尿病及肿瘤的几率大大增加。目前有大量研究证实:肠道菌群组成成分与结构失衡是导致肥胖发生的重要诱因,但减肥过程中肠道菌群及其代谢产物的变化趋势及相关机制研究尚缺乏报道。本文就目前应用较广的补充功能食品减肥、有氧运动减肥、外科手术减肥对肠道菌群及其代谢产物变化的影响进行综述。     

利用气质联用方法研究功能性消化不良患者血浆代谢谱的变化

目的采用基于气质联用的代谢组学技术研究功能性消化不良（functional dyspepsia,FD）患者血浆中小分子代谢物的变化。方法采集FD女性患者血浆样本16例及正常女性14例,经气相色谱-飞行时间质谱（gaschromatography/time-of-flight mass spectrometry,GC/TOF-MS）联用检测后,应用SIMCA-P10.0软件对积分数据进行偏最小二乘法-辨别分析（partial least squares-discriminant analysis,PLS-DA）。结果 GC/TOF-MS共检测得到色谱峰122个,其中鉴定出代谢产物31个。统计分析结果显示,与正常人相比,FD女性患者血浆中尿素、甘氨酸、苯丙氨酸、缬氨酸、磷酸、亚油酸、胆固醇等代谢物含量发生了明显变化。结合代谢途径分析发现,FD患者体内的能量代谢升高,而且患者体内氨基酸、脂肪酸以及肠道菌群等代谢也受到影响。结论本文所采用的气质联用代谢组学方法能清晰地反映FD女性患者血浆中的代谢物变化,其所揭示的代谢途径变化使得该技术在发病机制的探讨上具有良好的应用前景。     

肠道菌群在冠心病合并心衰患者中的变化及益生菌干预效果研究

目的 探讨肠道菌群在冠心病合并心力衰竭(心衰)患者中的变化及益生菌干预对炎性因子的影响.方法 ①选择2019年1-8月郑州大学第五附属医院体检科健康体检者15人为对照组,特需病房就诊的冠心病患者20例为冠心病组,冠心病合并心衰患者20例为合并组.采用PCR扩增及基因测序方法完成3组肠道菌群测定;将扩增后获得的PCR产物...     

活菌制剂对肝硬化患者血氨水平的影响

肝硬化患者肝功能衰竭时期,由于胃肠道功能紊乱和分泌减少,消化吸收功能下降,肠内菌群紊乱,其所分泌的与氨基酸代谢有关的酶和尿素酶增加,影响尿素肠肝循环,使外源性产氨增加,加剧了血氨浓度的升高.随着对微生态制剂的研究的进展,发现其具有生物化学屏障、改善肝脏和肠道功能等作用.     

主动脉弓缩窄模型小鼠肠道菌群的变化

目的 研究主动脉弓缩窄模型(TAC)小鼠肠道菌群的变化,为预防和治疗心血管疾病寻找新靶点.方法 12只C57BL/6小鼠随机分为假手术组(N组)和主动脉弓缩窄组(TN组),每组6只.TN组采用微创手术将小鼠主动脉结扎缩窄到适宜程度,N组除不结扎外其他操作与TN组相同.获取处理后22d小鼠粪便样本,通过16S rDNA测序检测其微生物组成,应用微生物生态学定量观察进行生物信息学分析.结果 与N组比较,TN组小鼠粪便样本吉氏副拟杆菌属丰度增加,乳杆菌科、乳杆菌属和耳蜗形梭菌丰度降低.结论 主动脉弓缩窄模型小鼠肠道菌群发生改变.肠道菌群可能是一种潜在的预防或治疗心血管疾病的靶点.     

肠道菌群对运动系统和运动机能的影响研究进展

肠道菌群作为隐形的"内分泌器官",广泛参与机体神经、内分泌、循环及消化等系统的调节,与宿主健康和多种慢性疾病的发生与发展息息相关.综述运动与肠道菌群相关文献发现:肠道菌群可通过调节运动系统的骨骼和骨骼肌的代谢,进而从免疫功能、能量代谢、代谢产物、抗氧化能力等方面影响机体的运动机能,并在延缓运动性疲劳的产生和消除等方面具...     

益生菌酸奶调节飞行员肠道菌群的考察

目的观察富含益生菌酸奶对飞行员肠道菌群以及飞行员腹泻率的影响。方法采集食用益生菌酸奶前后不同时间点飞行员便标本,细菌培养法测定肠道常见菌群含量,计算肠道定值抗力（CR）值,分析肠道菌群的变化。调查表调查飞行员腹泻率,比较食用不同时间益生菌酸奶飞行员腹泻率的差异。结果益生菌酸奶明显增加肠道菌群中双歧杆菌、消化球菌含量,降低肠球菌含量,增加CR值,对肠杆菌和拟杆菌无显著影响。停止食用益生菌酸奶后飞行员肠道菌群中5种细菌及CR值与对照组比无明显差异。长期食用益生菌酸奶可使飞行员腹泻率明显降低。结论益生菌酸奶具有调节飞行员肠道菌群,降低腹泻率的作用。     

20例肝硬化患者的口服葡萄糖耐量试验和血浆胰岛素测定结果分析

本文报告了20例肝硬化患者口服葡萄糖耐量试验(OGTT)和血浆胰岛素的测定结果。发现符合糖尿病标准者9例(45％),OGTT降低者6例(30％)。9例失代偿期肝硬化(伴有食管静脉曲张)的空腹血浆胰岛素(49.5±22.99μu/ml)与正常人(22.93±10.44μu/ml)相比差别非常显著,而6例代偿期肝硬化(伴有食管静脉曲张)的空腹血浆胰岛素(24.2±8.73μu/ml)与正常人相比差异不显著,提示空腹血浆胰岛素值升高与肝脏灭活能力降低有关,而与门体静脉分流无关。另发现本组患者OGTT曲线愈高,胰岛素释放曲线愈低,二者呈负相关,提示胰腺分泌胰岛素的功能是低下的。     

肠道菌群——运动干预防治代谢性疾病的新靶点

<正>近年来,肠道菌群作为参与机体稳态调节的新靶点已引起医学界的广泛关注。肠道菌群寄居于人体肠道,通过对肠道的保护、营养以及参与调节机体代谢而对宿主健康产生影响。机体肠道菌群失调可诱发包括肥胖、非酒精性脂肪肝、糖尿病和癌症等多种代谢相关疾病。因此,肠道菌群的改变是评估机体生理健康状况的一项重要指标。运动作为一种环境刺激性因素可有效调节肠道菌群的成分和结构、提高肠道菌群的丰     

肠道菌群失调与炎症性皮肤病研究进展

<正>肠道菌群是通过摄取体内营养物质来维持机体的生存及代谢,起到调节营养代谢、能量供给、感染防御及加强肠道屏障、增强免疫系统等作用,是维持机体内环境的重要屏障。肠道菌群被认为是与机体共生的重要器官之一,对疾病的发生、发展起到重要作用。益生菌为肠道菌群的重要组成,包括类杆菌、乳杆菌、双歧杆菌和消化球菌等,当给予足够数量益生菌时,对健康有益的活微生物,可对宿主发挥有益作用。益生菌的补充可改变肠道内环境,     

基于多重置换扩增技术的胃癌患者胃内微生物的宏基因组学研究

目的 通过多重置换扩增技术（multiple displacement amplification,MDA）与宏基因组鸟枪法测序相结合的方法研究胃癌患者和健康受试者胃内微生物的组成特征。方法 纳入2017年9月—2017年12月在医院就诊的胃腺癌患者4例,健康受试者4例,收集受试者胃液标本,经过标本预处理、DNA提取、MDA扩增提取的DNA、构建测序文库、高通量测序和生物信息学分析,研究2组受试者胃内微生物的组成特征,寻找与胃癌显著相关的菌种,并评估该方法用于胃内微生物宏基因组学研究的可行性。结果 MDA能显著扩增从胃液样本中提取的微量微生物DNA（207.27±33.17）倍,扩增后的DNA量能满足构建高质量测序文库的要求;总体上看,所有样本共鉴定出131个菌种,胃癌患者胃内菌群多样性显著低于健康受试者（P<0.01,t=4.189）;在细菌门水平,受试者胃液菌群主要由变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、梭杆菌门组成;优势物种的组间差异分析表明,与健康受试者相比,牙髓卟啉单胞菌、口腔链球菌、干燥奈瑟菌在胃癌患者胃液中富集(P<0.05)。结论 MDA能有效用于扩增胃内微量微生物DNA;胃癌患者的胃液菌群构成与健康人存在显著差异;部分口腔及上呼吸道条件致病菌与胃癌显著相关,是潜在的胃癌生物学标志物;通过全基因组扩增和高通量测序相结合的方法可以从菌种甚至菌株的水平上寻找与胃癌发生、发展相关的微生物。     

褪黑素在γ射线诱导的小鼠放射性肠损伤中对肠道菌群的影响

目的探讨褪黑素在γ射线诱导的小鼠放射性肠损伤中对肠道菌群的影响。方法采用简单随机分组法将C57BL/6J雄性小鼠分为3组, 即对照组(不给予任何处理)、照射组(以13 Gy剂量对小鼠进行腹部照射)和褪黑素+照射组(对小鼠实施褪黑素给药, 连续5 d, 然后以13 Gy剂量进行腹部照射), 每组5只, 共15只。照射后3 d收集小鼠粪便, 进行16S rDNA扩增子测序, 分析小鼠肠道菌群的变化, 应用Uparse软件进行操作分类单元聚类和物种注释, 应用Qiime微生物组分析平台进行样品复杂度分析和多样品比较分析。结果巴斯德菌属、分节丝状菌属和拟杆菌属是褪黑素+照射组小鼠肠道中丰度最大的菌群。与对照组相比, 褪黑素+照射组小鼠肠道菌群的丰度和多样性均下降(均P<0.01), 群落结构增加(P<0.001)。由门至种的不同分类级别的变形菌门/纲、肠杆菌目/科、巴斯德菌目/科/属/种和梭状芽孢杆菌纲/目是褪黑素+照射组小鼠肠道菌群组间丰度最大的菌群。在构建小鼠肠道菌群优势菌属共发生网络中, 确定了变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和厚壁菌门这四大门类下占互作主导地位的菌属以及它们之间...     

肠道菌群与肝性脑病的关系及其治疗措施研究进展

肝性脑病(HE)是临床上终末期肝病并发的一种常见的、复杂的神经精神综合征.HE的出现往往提示肝病患者结局较差.HE涉及的病理机制复杂,确切的机制尚不明确.近年来,随着对肝硬化患者肠道菌群的深入研究,肠道菌群改变与HE发生的相关性已成为临床关注的焦点.目前通过调节肠道菌群治疗HE已取得一定疗效.该文就肠道菌群与HE的关系...