DNA甲基化与肝癌的关系

甲基化是真核细胞DNA正常的修饰方式。DNA异常甲基化与肝癌的发生发展有着密切关系。肝癌细胞总体甲基化比正常细胞低,但是伴有抑癌基因上游启动子区域的异常甲基化。转甲基化酶抑制剂5-氮杂脱氧胞苷可以使高甲基化的启动子序列去甲基化。     

DNA甲基化与肝癌的关系

甲基化是真核细胞DNA正常的修饰方式,DNA异常甲基化与肝癌的发生发展有着密切关系。肝癌细胞总体甲基化比正常细胞低,但是伴有抑癌基因上游启动子区域的异常甲基化。转甲基化酶抑制剂5-氮杂脱氧胞苷可以使高甲基化的启动子序列去甲基化。     

胃癌DNA甲基化差异片段的筛选与分析

目的筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段。方法通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive-representationaldifferenceanalysis,MS-RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析。结果获得3个甲基化差异片段CRS1308、CRS1309、CRS1310序列。其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107。CRS1309序列与LOC440683基因、LOC440887基因的3'端、DRD5基因均有很高的相似性;CRS1310序列与1999年MinoruToyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性。结论胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,LOC440683、LOC440887、DRD5基因的异常甲基化可能与胃癌的发生相关,胃癌中CRS1310序列所在核糖体RNA上的CpG岛易发生甲基化。     

胃癌中DNA甲基化转移酶3A的表达与幽门螺杆菌感染的关系

目的 探讨胃癌患者胃黏膜上皮组织中DNA甲基化转移酶3A(DNMT3A)表达与幽门螺杆菌(Hp)感染的关系.方法 选取胃癌(GC)、腺瘤性息肉(GA)、慢性萎缩性胃炎(CAG)、慢性非萎缩性胃炎(CNAG)患者各30例,比较不同患者胃黏膜组织中DNMT3A mRNA的表达水平及Hp的感染情况.结果 4种胃部疾病患者胃黏膜组织中DNMT3A mRNA的相对表达量比较,差异有统计学意义(P﹤0.01).随着病情的发展,DNMT3A mRNA的相对表达量呈逐渐升高趋势.GC患者胃黏膜组织中DNMT3A mRNA的相对表达量高于CAG和CNAG患者,GA患者胃黏膜组织中DNMT3A mRNA的相对表达量高于CNAG患者(P﹤0.05).在同种疾病的胃黏膜组织中,Hp感染胃部疾病患者胃黏膜组织中DNMT3A mRNA的相对表达量高于非Hp感染的胃部疾病患者(P﹤0.05).低分化、伴有淋巴结转移GC患者GC组织中DNMT3A mRNA的相对表达量分别高于高中分化、不伴淋巴结转移的GC患者(P﹤0.05).结论 Hp感染可诱导胃黏膜中DNMT3A高表达,DNMT3A表达的上调可能促进GA、GC的发生发展,Hp感染和DNMT3A可协同作用参与从慢性炎症向GC发展的过程.     

DNA低甲基化与胃癌发病的关系

随着对胃癌研究的不断深人，人们逐渐开始关注DNA甲基化这种表观遗传学改变在胃癌发病中所起到的作用。DNA甲基化异常有高甲基化和低甲基化之分，两者均与胃癌的发病密切相关。其中DNA低甲基化主要通过影响胃癌原癌基因、肿瘤-睾丸抗原及浸润、转移相关基因的表达，在胃癌的发生发展中发挥重要作用。     

肿瘤抑制基因DNA甲基化与肝癌

DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一.肿瘤抑制基因(tumor suppressor genes,TSGs)DNA甲基化是肝癌的常发事件,该文从转录调节因子、负调控转录因子、细胞周期调控因子、信号通路的调节因子、DNA损伤修复因子等方面综述了TSGs DNA甲基化状态在肝癌发生、发展中的作用,对肝癌早期诊断、分期、预后、个体化治疗具有重要意义.     

Runx3 基因甲基化与胃癌发生和转移的关系

 目的 探讨Runx3基因启动子甲基化与胃癌发生发展过程的关系。方法 采用逆转录一聚合酶链反应（RT-PCR）检测80例胃癌组织及肿瘤周围粘膜组织中Runx3mRNA的表达，同时用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测Runx3基因启动子甲基化情况。结果 80例胃癌组织标本中Runx3基因的表达（0．5971±0．1013）较肿瘤周围组织中表达明显下调（0．8297±0．2912），差异有统计学意义（P〈0．05）。正常粘膜组织中未发现有Runx3基因启动子的甲基化，80例胃癌组织中有43例检测到Runx3基因启动子的甲基化，胃癌组织Runx3基因启动子甲基化率显著增高（P〈0．（15）。胃癌标本中Runx3 mRNA的表达与其病理临床特征密切相关，在低分化和有淋巴结转移胃癌组织标本中Runx3mRNA的表达显著下调（P〈0．05）。结论 Runx3基因启动子甲基化是导致Runx3基因失活的主要原因之一并且与胃癌的发生、发展密切相关。     

DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌关系研究进展

目的：总结DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌关系的研究现状。方法：应用PubMed及万方数据知识服务平台检索系统,以“胃癌、DNA甲基化、Eu钙黏蛋白基因和CpG岛”等为关键词,检索1979-01-2013-05的相关文献,共检索到英文文献2093篇,中文文献672篇。纳入标准：1）关键词包括胃癌及DNA甲基化;2）文中包括E-钙黏蛋白基因启动子区CpG岛甲基化。剔除标准：1）非E-钙黏蛋白基因启动子区CpG岛的甲基化;2）关键词有E-钙黏蛋白但文中无甲基化描述。符合纳入标准的中文文献56篇,英文文献43篇,根据剔除标准剔除中文文献46篇,英文文献23篇,最后纳入分析30篇文献。结果：DNA甲基化在基因表达、调控过程中发挥重要作用,其功能紊乱在恶性肿瘤形成过程中具有重要作用,与胃癌的发生密切相关。E-cadherin基因能抑制肿瘤细胞的浸润和转移,E-cadherin基因启动子区CpG岛甲基化是胃肠道肿瘤E-cadherin基因失活的主要原因,可引起E-cadherin表达下降或缺失,与胃癌的发生、浸润、转移和预后密切相关。结论：DNA甲基化和E-cadherin基因甲基化与胃癌的形成、浸润和转移等关系密切,但其要成为胃癌防治的靶点仍需进一步研究。     

Runx3 基因甲基化与胃癌发生和转移的关系

目的 探讨Runx3基因启动子甲基化与胃癌发生发展过程的关系。方法 采用逆转录一聚合酶链反应（RT-PCR）检测80例胃癌组织及肿瘤周围粘膜组织中Runx3mRNA的表达,同时用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测Runx3基因启动子甲基化情况。结果 80例胃癌组织标本中Runx3基因的表达（0．5971±0．1013）较肿瘤周围组织中表达明显下调（0．8297±0．2912）,差异有统计学意义（P〈0．05）。正常粘膜组织中未发现有Runx3基因启动子的甲基化,80例胃癌组织中有43例检测到Runx3基因启动子的甲基化,胃癌组织Runx3基因启动子甲基化率显著增高（P〈0．（15）。胃癌标本中Runx3 mRNA的表达与其病理临床特征密切相关,在低分化和有淋巴结转移胃癌组织标本中Runx3mRNA的表达显著下调（P〈0．05）。结论 Runx3基因启动子甲基化是导致Runx3基因失活的主要原因之一并且与胃癌的发生、发展密切相关。     

DNA甲基化与胃癌的相关性

在胃癌的发展过程中常发现肿瘤相关基因的异常甲基化存在,其中包括全基因组的低甲基化和某些抑癌基因的高甲基化.另外,DNA甲基化水平似乎还与胃癌的预后密切相关.近年来为揭示DNA甲基化与胃癌的相关性进行了大量研究.     

基因甲基化与胃癌前病变和胃癌的相关性

DNA甲基化是一种重要的表遗传学表达机制，也是基因表达调控的一种方式，与肿瘤的发生关系密切。胃癌的发生是多阶段、多因素异常累计的结果，其中基因的甲基化与胃癌及胃癌前病变关系密切。这为胃癌的早期诊断、治疗、预后提供了新的思路。本文就基因甲基化与胃癌前病变和胃癌的关系进行阐述。     

基因甲基化与胃癌前病变和胃癌的相关性

DNA甲基化是一种重要的表遗传学表达机制,也是基因表达调控的一种方式,与肿瘤的发生关系密切。胃癌的发生是多阶段、多因素异常累计的结果,其中基因的甲基化与胃癌及胃癌前病变关系密切。这为胃癌的早期诊断、治疗、预后提供了新的思路。本文就基因甲基化与胃癌前病变和胃癌的关系进行阐述。     

微小RNA与DNA甲基化相互调控在胃癌中的作用

表观遗传修饰在胃癌发生发展及预后中起重要作用.微小RNA( miRNA)和DNA甲基化是表观遗传学的两个重要调控机制.miRNA抑制靶基因信使RNA的翻译,参与基因转录后水平调控.基因启动子区CpG岛的异常甲基化与肿瘤的发生关系密切,可导致癌基因、抑癌基因或其他肿瘤相关基因的表达异常.胃癌中存在miRNA和DNA甲基化...     

Aberrant DNA methylation of cancer-associated genes in gastric cancer in the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC-EURGAST)

Epigenetic events have emerged as key mechanisms in the regulation of critical biological processes and in the development of a wide variety of human malignancies, including gastric cancer (GC), however precise gene targets of aberrant DNA methylation in GC remain largely unknown. Here, we have combined pyrosequencing-based quantitative analysis of DNA methylation in 98 GC cases and 64 controls nested within the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) cohort and in cancer tissue and non-tumorigenic adjacent tissue of an independent series of GC samples. A panel of 10 cancer-associated genes (CHRNA3, DOK1, MGMT, RASSF1A, p14ARF, CDH1, MLH1, ALDH2, GNMT and MTHFR) and LINE-1 repetitive elements were included in the analysis and their association with clinicopathological characteristics (sex, age at diagnosis, anatomical sub-site, histological sub-type) was examined. Three out of the 10 genes analyzed exhibited a marked hypermethylation, whereas two genes (ALDH2 and MTHFR) showed significant hypomethylation, in gastric tumors. Among differentially methylated genes, we identified new genes (CHRNA3 and DOK1) as targets of aberrant hypermethylation in GC, suggesting that epigenetic deregulation of these genes and their corresponding cellular pathways may promote the development and progression of GC. We also found that global demethylation of tumor cell genomes occurs in GC, consistent with the notion that abnormal hypermethylation of specific genes occurs concomitantly with genome-wide hypomethylation. Age and gender had no significant influence on methylation states, but an association was observed between LINE-1 and MLH1 methylation levels with histological sub-type and anatomical sub-site. This study identifies aberrant methylation patters in specific genes in GC thus providing information that could be exploited as novel biomarkers in clinics and molecular epidemiology of GC.     

肝细胞癌血浆LINE-1启动子区甲基化水平的研究

目的 探讨肝细胞癌（HCC）患者血浆中长散布核元件-1（LINE-1）基因启动子区CpG位点甲基化水平变化的临床意义。方法 应用亚硫酸氢盐测序 PCR（BSP）检测33例HCC患者（HCC组）、18例肝硬化患者（肝硬化组）及16例健康志愿者（正常组）的外周血血浆中LINE 1启动子区的CpG位点甲基化程度。结果 HCC组的LINE-1启动子区多个CpG位点甲基化水平及整体甲基化水平下降;进一步通过ROC曲线分析发现CpG位点1、位点7、位点8的甲基化水平对诊断HCC的能力较优,其敏感度和特异度分别为80.0％和78.8％、81.8％和71.4％、82.9％和75.8％。结论 LINE-1基因启动子区甲基化水平在HCC中明显下降,其中CpG位点1、位点7、位点8的甲基化水平可能对HCC诊断有意义。     

DNA methyltransferase expression and DNA hypermethylation in human hepatocellular carcinoma

Aberrant DNA methylation and increased expression of DNA methyltransferases (DNMTs) are features of tumor cells. To investigate roles for DNMTs during hepatocarcinogenesis, we examined DNMT expression at both the mRNA and protein level in hepatocellular carcinomas (HCCs) and paired non-neoplastic liver tissues, along with measuring the DNA methylation status of five tumor suppressor genes. Expression of DNMT1, DNMT3a and DNMT3b mRNA was detected in 33.3, 59.3, and 55.6% of HCCs and 40.7, 22.2, and 0% of non-neoplastic liver tissues, respectively. DNMT1 and DNMT3a were immunoreactive in 100 and 48% of HCCs and 52 and 0% of non-neoplastic liver tissues. The DNMT3a mRNA expression profile showed significant correlation with its immunoreactivity (P=0.022). DNA methylation status of five tumor suppressor genes, HIC-1, p16, RASSF1A, p53, and RB1 was detected in 85.2, 48.1, 44.4, 22.2, and 0% of HCCs, respectively. There was no significant correlation between DNMT mRNA expression and DNA methylation (P>0.05). DNMT immunoreactivity was also not associated with DNA methylation except HIC-1 (P=0.036) and p53 methylation (P=0.009). Despite the lack of correlation between DNA methylation status and DNMT expression, the frequency of hypermethylation of tumor suppressor genes remained relatively high in HCCs, suggesting that regional DNA hypermethylation is involved in hepatocarcinogenesis and that there may be other mechanisms for increasing DNA methylation.     

MicroRNA与DNA甲基化相互调节机制在肝细胞癌中的研究进展

肝细胞癌是原发性肝癌的主要类型,也是人类恶性程度较高的肿瘤之一,其发病机制至今尚未完全阐明.表观遗传学机制在肿瘤的发生、发展中起重要作用,DNA甲基化和微小RNA (microRNA,miRNA)的调控机制属于表观遗传学的研究范畴.研究表明,DNA甲基化及miRNA在肝细胞癌的形成中分别或协同发挥着重要作用,miRNA是一类在转录后水平调节基因表达的非编码短链RNA.研究表明,DNA甲基化和组蛋白修饰不仅可以调节蛋白编码基因的表达,而且可以调节miRNA的表达.在肝细胞癌中,一些异常表达的miRNAs(如miR-125b、miR-1-1、miR-124、miR-203和miR-191)是通过表观遗传学机制调控的.另外,在肝细胞癌中还发现了一类miRNAs通过调控表观遗传学通路中关键分子来改变整个基因组的表观遗传学状态.本文就DNA甲基化和miRNA之间复杂的相互调节机制在肝细胞癌发生和发展中的研究进展进行综述.     

MSRE-gPCR技术分析多基因DNA甲基化对肝细胞癌的诊断价值

背景与目的:DNA甲基化是潜在的肿瘤标志物.本研究运用自行建立的甲基化敏感性限制性内切酶一定量PCR(methylation-sensitive restriction enzymes-based quantitative PCR,MSRE-gPCR)方法检测肝细胞癌(hepatocellutar carcinoma,HCC)组织中多个基因的DNA甲基化状态,筛选可用于HCC诊断的DNA甲基化标志物组合.方法:以47对HCC患者癌组织和癌旁组织、8例正常人肝组织为材料,运用MSRE-gPCR方法检测这102例肝组织中APC、GSTPI、RASSFIA、p16、SFRP1、RUNX3、Hint1、SOCS1和HIC-1基因的启动子甲基化状态.结果:APC、GSTPI、RASSF1A、p16、SFRP1、RUNX3基因在肿瘤组织中的甲基化率分别为70.2%、70.2%、63.8%、29.8%、44.7%和36.2%,均显著高于对应癌旁组织(P均＜0.05);而Hintl、SOCSI和HIC-1基因甲基化水平在HCC肿瘤和癌旁组织间无显著差异.联合检测APC、GSTP1、RASSF1A和SFRP1 4个靶点,可检出所有HCC病例.这些基因的甲基化水平与患者肿瘤大小、分化、包膜及HBV感染等临床病理参数均无显著相关性.结论:联合检测APC、GSTPI、RASSFIA和SFRPI的DNA甲基化状态对于HCC风险评估和分子诊断具有重要价值.