五个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析

利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、波尔山羊、南江黄羊（黑）、南江黄羊（黄）五个山羊群体的分子水平上的遗传多样性,结果表明：7个微卫星位点均为高度多态位点。可以用于山羊群体遗传多样性的评估;平均多态信息含量（PIC）达0．8341～0．9026;5个山羊群体平均观察杂合度（0．6258-0．8629）均低于平均期望杂合度（0．8594—0．9115）,证明5个山羊种群具有丰富的遗传多样性和广泛的遗传基础,但品种内存在着一定程度的近交,尤其波尔山羊近交较严重。以Nei氏标准遗传距离为基础的UPGMA和N-J聚类结果表明：吕粱黑山羊与南江黄羊（黑）首先聚为一类,而没和黎城大青羊先聚：国内四个山羊群体与国外品种波尔山羊亲缘关系较远。     

利用微卫星标记分析兰坪长毛山羊遗传多样性

本研究旨在利用微卫星标记技术分析兰坪长毛山羊群体的遗传多样性,并以波尔山羊为参考群分析该群体与云南省10个地方山羊群体的遗传关系,利用14个微卫星标记对12个山羊群体的基因频率、多态信息含量、有效等位基因数量、杂合子数量和遗传距离等进行计算分析。结果表明:在兰坪长毛山羊的25个样本中共检测出85个等位基因,片段大小在125 bp~265 bp之间,基因频率在0.02~0.82之间。兰坪长毛山羊群体平均PIC为0.618,所有位点均为中高度多态位点群体,具有丰富遗传多样性。Structure软件分析结果表明兰坪长毛山羊具有较为独立的群体遗传特征,Nei氏遗传距离构建的聚类图说明兰坪长毛山羊与云南省10个地方山羊群体及参考群波尔山羊群体的亲缘关系相对较远。研究结果将为云南省本地山羊资源的保护提供遗传信息基础。     

微卫星标记在湖羊中多态性检测

本实验的目的在于检测微卫星OarAE101在湖羊中的多态性及这些多态性变化和多胎性的相关关系,为进一步在杂交育种中检测并跟踪决定多胎这一性状的主效基因做早期选种准备.     

微卫星标记在羊遗传育种中的应用

本文在对微卫星的产生机制、特征以及微卫星标记原理进行概述的基础上,重点对微卫星标记在绵、山羊遗传育种中的应用进行了综述。     

DNA遗传标记在山羊遗传多样性研究上的应用

本文综述了DNA遗传标记在山羊的遗传多样性分析上的应用。分别叙述了RFLP、线粒体DNA多态性、RAPD、微卫星标记、AFLP等几个方面目前在山羊上的研究。     

羊微卫星标记的研究进展

微卫星DNA在染色体上随机分布．是十分有效的遗传标记。目前在羊中应用的微卫星位点除了少数是直接从DNA文库中筛选的以外．大部分都是借用牛的微卫星住点。这些位点已被广泛的应用于父权的鉴定、遗传多样性和种群结构的分析、QTL定位、遗传图谱的构建等方面的研究。然而微卫DNA的数量目前还远不能满足研究的需要。将来要分离更多的微卫星住点．构建微卫星住点的遗传和物理图谱。这样微卫星DNA才能在羊的研究中发挥更大的作用。     

十五个微卫星标记在超细型细毛羊上的遗传多样性的研究

本研究选取了绵羊1号和3号染色体上的十五个微卫星位点,对超细型细毛羊的六个父系半同胞的232个后代的遗传多样性进行了检测。计算了各位点的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(N)。结果表明:十五个微卫星位点中有七个未检测到多态,另外八个在超细型细毛羊中表现出较好的多态性。在这八个多态性标记中,微卫星MAF64位点的多态信息含量最高(PIC=0.8399),微卫星BL-4位点的多态信息含量最低(PIC=0.4201)。多态性标记在群体中的平均等位基因数为5.6个,平均多态信息含量PIC=0.64,平均杂合度H=0.67,平均有效等位基因数N=3.7。经分析,超细型细毛羊群体中的遗传杂合度较高,表明其遗传背景复杂,遗传多样性较为丰富。同时这八个多态性微卫星位点也可用于超细型细毛羊羊毛各性状的进一步研究。     

微卫星标记及其在动物基因图谱构建中的应用

本文阐述了微卫星标记的结构特点、多态性及保守性 ,介绍了分离微卫星标记的两种策略 ,着重阐述了微卫星标记在动物基因图谱构建中的应用     

皖系长毛兔微卫星标记多态性及其与产毛量相关的研究

本研究利用微卫星标记技术,分析了4个微卫星座位多态性与皖系长毛兔1岁时的产毛量之间关系。结果表明:皖系长毛兔4个微卫星座位上平均检测到4.5(3~6)个等位基因,平均杂合度为0.680(0.630~0.721),平均多态信息含量为0.642(0.559~0.705)。Sol33微卫星座位与1岁时产毛量呈显著相关(P<0.05),其中基因型为AD和BD个体1岁时产毛量与其他3种基因型个体间均存在显著差异(P<0.05)。其他座位Sat4、Sat13和Sol44与皖系长毛兔1岁时产毛量相关不显著(P>0.05)。     

8种微卫星DNA标记在草原红牛杂交群体中多态性的研究

选用由利木赞与草原红牛杂交后代组成的试验牛群体共计24头,经过牛血液基因组DNA的提取、8对微卫星引物的PCR扩增、扩增产物的聚丙烯酰胺电泳分型、UVIRAND计算机凝胶成像分析系统分析各位点等位基因及全部个体的标记基因型、PPAP3、0软件计算基因频率、多态信息含量(PIC)和杂合度等步骤从分子水平上分析了在8个位点的遗传多态性。结果表明,BM2113、ETH225、IDVGA2、IDVGA46、IDVGA44、BM1824、IDVGA55和TGLA44这8个位点的等位基因数分别为4、5、4…454,4和6,多态信息含量(PIC)分别为0、6432、0、5943、0．6593、0、5794、0、7259、0、6121、0．6120和0、6204,杂合度为0．7034,均属于高度多态性位点。用于寻找与生产性能相关的遗传标记的研究是较理想的。     

DNA指纹图与生化标记分析在近交系大鼠遗传检测中的比较研究

目的 :建立DNA指纹图技术实现对近交系大鼠遗传物质的精确检测。方法 :采用DNA指纹图法对国内已知的 6个品系 8个近交系大鼠群体进行分析 ,并与常规生化标记分析法进行比较。结果 :①生化标记分析中除 2个群体SHR(哈 )和WKY(哈 )在Es_3位点出现可疑带外 ,其他位点均与国标标准相一致。②DNA指纹图在 4.0～ 2 3.1kb间的平均图带数为 14～ 19条。③同一品系不同个体间DNA指纹图带的相似系数 (F)及共有带率 (X) ,除SHR(哈 )和WKY(哈 )在 0 .7以下外 ,其他均在 0 .9以上。④不同品系个体之间DNA指纹图带的相似系数和共有带率在0 .0 7以下 ,相同DNA指纹图概率小于 10 _2 2 。⑤相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致。结论 :经比较 ,DNA指纹图在动物遗传检测中比生化标记分析显示出较大的优势 ,它不但能区分品系与品系、品系与亚系间 ,而且还能反映出动物个体间、群体间及品系间的变异程度、亲缘关系及遗传距离 ,具有较高的灵敏度和稳定性     

BDNF基因多态性与剖宫产产妇产后抑郁的相关性分析

目的 研究脑源性神经营养因子(BDNF)基因多态性与剖宫产产妇产后抑郁(PPD)的相关性.方法 选择2014年2月-2015年2月在中南大学湘雅三医院和湖南省妇幼保健医院进行椎管内麻醉下剖宫产手术的产妇360例,记录患者的一般资料.应用爱丁堡产后抑郁量表(EPDS)分别对产妇产前1d、产后第42天的精神状态进行评估,以EPDS评分12分(总分13分)作为产后抑郁的评定界值.采用Sequenom?Mass Array SNP对BDNF基因G712A、rs56164415、rs11030100、rs11030101、rs6265位点的基因型进行测定,分析产妇一般资料、不同基因型与产后抑郁的相关性.结果 本组360例产妇产后抑郁的发生率为7.2%.Logistic回归分析显示,孕期压力大、孕期心情差、围产期单核细胞数值升高、产前抑郁情绪是剖宫产后抑郁的危险因素,而BDNF基因rs6265位点突变是剖宫产产后抑郁的保护因素(P<0.05).BDNF基因G712A、rs11030101、rs11030100、rs56164415位点突变与产后抑郁的发生无关(P>0.05),且其单倍体型与产后抑郁也无关.结论 携带BDNF rs6265CC基因型、孕期压力大、孕期心情差、围产期单核细胞数值升高以及产前抑郁情绪是产后抑郁的危险因素.     

SNP及其在畜牧业中的应用前景

SNP(single nucleotide polymorphisns-单核苷酸多态性)是继限制性片段长度多态性和微卫星之后,新发展起来的第3代分子标记。已成为一类新的遗传标记,广泛应用于基因定位、克隆和遗传多样性研究。本文介绍了SNP的特性、检测方法及其在畜牧业研究生产中的广泛利用前景。并提出了SNP研究中遇到的一些问题。     

和田羊KRT31和KRT85基因遗传多态性及其 与羊毛性状关联性分析

试验旨在研究KRT31和KRT85基因是否是影响和田羊羊毛性状的候选基因,为今后和田羊的育种工作和改善羊毛性状提供科学依据。采集400只和田羊血样,运用PCR-SSCP和DNA测序等技术对和田羊个体的KRT31和KRT85基因进行遗传多态性分析。结果表明:和田羊KRT31和KRT85基因具有多态性,且均存在两种基因型,都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),KRT31基因多态信息含量(PIC)为0.233,属于低度多态(PIC<0.25)。KRT85基因多态信息含量(PIC)为0.346,属于中度多态(0.250.05)。KRT85基因在外显子2的204bp处存在A到G的突变,可以记作A204G。对氨基酸序列进行比较分析,该基因上A204G处的突变并未使氨基酸的编码发生改变,此位点突变为同义突变。与羊毛性状关联分析得出,AA和AB两种基因型的羊毛长度及细度差异均不显著(P>0.05)。说明和田羊KRT31基因可以作为影响和田羊羊毛性状的候选基因。     

年龄、季节对波尔山羊种公羊精液质量的影响

通过对不同年龄的波尔山羊种公羊在不同季节中的采精量和精子活力等精液质量指标的分析研究表明 ,年龄和季节变化对波尔山羊种公羊精液质量的影响达到极显著水平 (p <0 .0 1) ,其年龄和季节的交互作用对种公羊精液质量不存在显著影响 ;季节因素对不同年龄种公羊精液质量的影响程度是一致的 ,其季节间采精量的从多到少的顺次为秋季、夏季、冬季和春季 ,且季节间差异大多极显著 (p <0 .0 1) ,精子活力从优到劣的顺次为夏季、冬季、春季和秋季 ,但季节间差异大多不明显     

尿酸相关基因及其多态性在疾病中的作用研究进展

随着全基因组关联研究在全球范围内热度的不断攀升,人们逐渐把目光聚焦于疾病的遗传和基因多态性.单核苷酸多态性(SNP)是人类基因中最常见的基因变异,可影响基因的表达、转录、翻译、修饰,是疾病易感性的重要原因之一.尿酸相关基因的SNP不仅易感于高尿酸血症及痛风,并在神经、循环、呼吸等各系统疾病中具有重要作用.该文综述了尿酸相关基因SNP在临床疾病中的作用及研究进展.     

Genotyping diptera using amplified fragment length polymorphism (AFLP): development of a genetic marker system for species in the families Calliphoridae and Sarcophagidae

Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) analysis of entomological material provides a means of obtaining a reproducible DNA profile in a relatively short period of time. AFLP profiles were obtained using larval samples from Cochliomyia macellaria, Phormia regina and Sarcophaga bullata. Genomic DNA was isolated using the DNeasy Tissue Kit (Qiagen, Valencia, CA), double-digested by two restriction endonucleases (EcoRI and MseI) and ligated to oligonucleotide adapters. Two consecutive PCR reactions (preamplification and selective amplification) were performed using a modification of the AFLP protocol described by Gibco (Invitrogen, Rockville, MD). The DNA fragments were separated by capillary electrophoresis using the CEQ 8000 DNA Fragment Analyzer. Species specific profiles were developed for all three species. The results indicate that the AFLP technique is a viable and valuable technique for identification of entomological material.     

XRCC2基因多态性与中国北方人群肺癌易感性的相关性研究

目的 研究DNA双链断裂修复基因XRCC2多态性与中国北方人群肺癌易感性的关系.方法 采用病例对照研究,收集河北石家庄及其周边县市区的原发性肺癌患者300例为肺癌组,同时选择与患者同一地区的健康人300例为对照组,应用PCR-RFLP方法分析了肺癌组和对照组的XRCC2基因(C41657T)位点的多态性,比较不同基因型与肺癌易感性的关系,以及基因多态性与吸烟之间对肺癌易感性的交互作用.结果 XRCC2(C41657T)C/T等位基因频率肺癌组为84.67%、15.33%,对照组为87.50%、12.50%,两组间分布无显著性差异(P=0.16);C/C、C/T、T/T基因型频率肺癌组分别为72.7%、24.0%、3.3%,对照组分别为76.3%、22.0%、1.7%,C/C及C/T基因型频率两组间比较无显著性差异(χ2=0.48,P=0.48).非吸烟者C/T基因型频率肺癌组高于对照组(χ2=6.67,P=0.01);相对于C/C基因型,C/T基因型的个体患肺癌的(OR＝2.11,95%CI＝1.19～3.73);吸烟者C/C及C/T基因型频率肺癌组与对照组无显著性差异(OR=0.69,95%CI=0.41～1.16,P=0.16).结论 XRCC2(C41657T)基因多态性总体上对肺癌易感性无明显影响,但其C/T基因型可增加非吸烟中国北方人群患肺癌的危险性.