基于网络药理学及分子对接探讨仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的物质基础及作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选仙鹤草的活性成分并预测其作用靶点；通过GeneCards、OMIM数据库筛选慢性萎缩性胃炎相关靶点；将活性成分靶点与慢性萎缩性胃炎靶点取交集，通过String 12.0数据库构建蛋白相互作用（PPI）网络，并运用Cytoscape 3.10.1软件构建“中药–疾病–化合物–交集靶标”网络图；通过R软件对核心靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析以预测作用机制；通过AutoDock软件进行分子对接验证。结果 从仙鹤草中筛选出5个活性成分，作用于90个靶点，其中仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的核心活性成分为鞣花酸、山柰酚、儿茶素、木犀草素、槲皮素；核心靶点为B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3（CASP3）、表皮生长因子受体（EGFR）、缺氧诱导因子-1A（HIF-1A）、原癌基因（MYC）等；作用机制主要涉及抗肿瘤、调节免疫、调节脂代谢、抗病毒等多条信号通路；分子对接显示，仙鹤草核心活性成分与核心靶点具有较高亲和力。结论 仙鹤草可能通过调节细胞增殖、凋亡、炎症、代谢等相关基因及通路发挥多靶点、多通路的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接的薏苡附子散对类风湿性关节炎及慢性心力衰竭“异病同治”作用机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接方法探讨薏苡附子散治疗类风湿性关节炎(RA)及慢性心力衰竭(CHF)"异病同治"的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选薏苡附子散的活性成分,并利用 Pubchem 数据库获得 Smile 号,进而通过 Swiss Target Prediction 数据库获取活性成分对应的靶点。在 GeneCards 和 OMIM数据库平台预测 RA 及 CHF 疾病作用靶点。对活性成分靶点与疾病交集靶点进行蛋白质相互作用(PPI)网络构建及核心靶点筛选,并进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。筛选核心成分和核心靶点,利用 AutoDock 软件进行分子对接验证。结果 从薏苡附子散中共筛选得到符合条件的活性成分 10 个,活性成分潜在作用靶点 403 个,RA 疾病靶点 1 112 个,CHF 疾病靶点 2 983 个,取交集,获得药物、疾病交集靶点 69 个。GO 富集分析结果显示主要与炎症反应的调节、MAPK 级联调控、对氧化应激的反应、骨化的调节、平滑肌细胞增殖等相关;KEGG 通路富集分析得到 236 条通路,与RA及CHF相关且排序较靠前的通路有 PI3K-Akt 信号通路、NF-κB 信号通路、MAPK 信号通路等。分子对接结果表明,薏苡附子散中的核心成分多根乌头碱、水黄皮素、豆甾醇具有与核心靶点 TNF、SRC、ESR1 和 PTGS2良好的结合潜力。结论 薏苡附子散治疗 RA 和 CHF 具有多靶点效应,涉及多条生物过程和信号通路,可能通过调控炎症反应、氧化应激反应、血管生成和发育、心脏收缩调节及 MAPK 级联调控等发挥"异病同治"作用。     

基于网络药理学及实验验证瑞巴派特对慢性萎缩性胃炎的作用机制

目的 运用网络药理学和实验探究瑞巴派特改善慢性萎缩性胃炎小鼠的作用靶点及通路。方法 通过PubChem中进行检索得到瑞巴派特的详细信息,并分别导入Targetnet、SwissTarget Prediction、Super-PRED、PharmMapper数据库进行检索得到与瑞巴派特作用相关的靶点。通过在Pharmgkb、OMIM、GeneCards、Disgnet、CTD数据库筛选出慢性萎缩性胃炎相关的疾病靶点。利用韦恩图获取药物与疾病的交集靶点,将获得的交集靶点导入STRING数据库,建立蛋白相互作用(PPI)网络图,借助DAVID进行基因本体论(GO)功能、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后对可能的核心靶点进行分子对接验证。采用幽门螺杆菌和亚硝酸盐建立慢性萎缩性胃炎小鼠模型,通过苏木素–伊红(HE)染色、免疫组化染色法、实时荧光定量(RT-qPCR)法验证瑞巴派特对慢性萎缩性胃炎的炎症因子和部分关键靶点的调控作用。结果通过数据库筛选出相关药物靶点506个,疾病靶点2 115个,“药物–疾病”交集靶点169个,共获得20个核心靶点、10类生物过程,凋亡及叉头转录...     

基于网络药理学附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征的作用机制

目的 基于网络药理学方法和分子对接技术,探讨附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征(CFS)的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选附子归芍颗粒的有效成分及作用靶点;利用人类基因数据库、在线《人类孟德尔遗传》数据库筛选慢性疲劳综合征的相关基因,运用cytoscape构建附子归芍颗粒活性成分-靶点图,通过STRING数据库对关键靶点构建网络互作(PPI)网络,DAVID数据库进行基因本体(GO)基因、京都基因和基因百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接。结果 通过数据库的查找和筛选,最终获得136个主要活性成分和214个作用靶点;交集靶点100个,其中核心靶点10个;通路富集结果共119个。结论 初步探讨了附子归芍颗粒防治慢性疲劳综合征的主要活性成分、相关靶点及相关通路,发现附子归芍颗粒能通过多成分、多靶点、多通路发挥防治作用,为其防治CFS临床使用提供了一定的参考依据。     

基于网络药理学探讨祛痰合剂祛痰镇咳的作用机制

目的：基于网络药理学方法,探讨祛痰合剂的祛痰镇咳作用机制。方法：从中药系统药理学数据库与分析平台、Symmap数据库和BATMAN数据库获取祛痰合剂的成分,以口服生物利用度≥30%、化合物类药性≥0.18为标准筛选出药物中的有效成分,利用PubChem数据库和SwissTargetPrediction数据库筛选活性成分并预测其作用靶点,通过Cytoscape构建疾病-药物-成分-靶点网络;利用STRING数据库对靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,并通过R语言计算核心靶点,最后采用DAVID数据库对药物作用疾病相关靶点进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果：通过筛选得到22个主要活性成分、药物-疾病相关靶点298个,提示祛痰合剂可能是通过药物应答、磷脂酶C激活G蛋白偶联受体信号通路及细胞增殖正向调节作用等生物过程,酶结合、蛋白激酶活性及药物结合等分子功能发挥祛痰镇咳的作用,其机制可能与神经活性配体-受体相互作用、环腺苷酸信号途径和钙信号通路等多个通路的调控作用密切相关。结论：祛痰合剂可以通过多成分、多靶点、多通路的方式发挥其祛痰镇咳的作用机制,本研究为进一...     

基于网络药理学与分子对接探究鼻渊通窍颗粒治疗慢性鼻窦炎的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术探究鼻渊通窍颗粒治疗慢性鼻窦炎的作用机制。方法 通过设置药物的参数范围在TCMSP平台筛选鼻渊通窍颗粒的活性成分,并挖掘各个活性成分相对应的靶点,在DrugBank、GeneCards、OMIM、PharmGKB和DisGeNET数据库探索“慢性鼻窦炎”的有关靶点,将上述共同靶点导入String数据库,获得蛋白相互作用（PPI）网络,利用Cytoscape3.8.0的CytoNCA插件获取网络核心靶点。再利用R语言进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,采用Cytoscape 3.8.0软件进行“药物–活性成分–作用靶点–疾病”网络模型构建与分析,最后使用Sybyl软件进行核心靶点和药物成分的分子对接并预测其结合能力。结果 鼻渊通窍颗粒有14种药物组分,共筛选出149个活性成分,这些活性成分和慢性鼻窦炎的共同靶点有85个,其中核心靶点有7个,主要与血脂和动脉粥样硬化通路、人巨细胞病毒感染通路、PI3K/Akt信号通路、白细胞介素-17信号通路等相关。分子对接结果显示,核心靶点与活性成分均有一定的结合活性,其中CASP3...     

基于网络药理学的四君子汤治疗胃炎的作用机制研究

目的通过网络药理学预测四君子汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库收集四君子汤及其中4味中药党参、白术、茯苓、甘草的化学成分,经口服吸收率(OB)、类药性(DL)、半衰期(HL)3个条件筛选得到药物的有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库进行有效成分靶点预测;同时从TTD、Drugbank和DisGeNET数据库对胃炎的靶点进行检索及筛选;成分靶点与疾病靶点映射后使用Cytoscape 3.2.1软件构建药物有效成分-靶点蛋白相互作用网络,使用String数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络;对靶点蛋白利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG分析,构建核心有效成分-核心靶点-代谢通路网络图。结果从四君子汤中筛选出68个化学成分,涉及治疗胃炎的10个靶点;GO分析结果表明其涉及单孢素代谢过程、杂环代谢过程、药物代谢过程、药物分解过程、类固醇代谢过程等9个生物过程,涉及氧结合、单加氧酶活性、氧化还原酶活性等10个分子功能,包括细胞器膜、内质网膜等6个细胞组成;KEGG分析结果表明其可能通过药物代谢-细胞色素P450、亚油酸代谢、细胞色素P 450对外源性物质代谢的影响、神经活性配体与受体的相互作用、化学致癌、类固醇激素生物合成、视黄醇代谢7个信号通路治疗胃炎。结论四君子汤通过多靶点、多通路治疗胃炎,为今后分子机制的研究奠定一定的基础。     

基于网络药理学探讨赤芍抗肿瘤转移的作用机制

目的 通过网络药理学的方法探究赤芍抗肿瘤转移的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和Pharm Mapper数据库获取赤芍的活性成分及靶点,通过Gene Cards和在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库中获得肿瘤转移的相关靶点,进而获得药物活性成分治疗疾病的潜在靶点。构建蛋白质互作（PPI）网络,用DAVID数据库对潜在靶点进行富集分析,并利用Cyto Scape 3.9.0软件对核心成分和关键靶点进行筛选,同时进行分子对接验证。结果 共得到符合条件的药物活性成分29个及其作用靶点132个、交集靶点115个。主要信号通路有癌症信号通路、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌等。分子对接结果表明赤芍抗肿瘤转移的核心成分与疾病的核心靶点有较强的结合活性。结论 赤芍通过多成分、多靶点、多途径发挥抗肿瘤转移作用。     

基于网络药理学和分子对接探究桑白皮治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在作用机制

目的 利用网络药理学的方法研究桑白皮治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用靶点以及分子机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取桑白皮的活性成分及活性成分的作用靶点;在OMIM和GenCards数据库中检索筛选COPD相关的靶点,两者取交集获得桑白皮治疗COPD的核心靶点。由Cytoscape 3.7.0构建活性药物-疾病-成分-靶点网络;STRING数据库构建靶点蛋白互作网络;DAVID数据库对靶点基因开展生物功能与通路富集分析,构建桑白皮活性成分-核心靶点-作用通路网络图。结果 从桑白皮中筛选得到31个活性化合物和93个相应靶点,COPD 3565个相关靶点,两者映射获得治疗COPD作用的活性成分22种：主要为槲皮素、山奈酚等,作用于IL6、VEGFA、EGFR、MAPK8等76个COPD核心靶点,生物功能与通路富集分析表明,桑白皮主要通过调控凋亡过程、细胞增殖、氧化还原过程、老化等生物行为,对信号通路PI3K-Akt、TNF、MAPK、P53、HIF-1等施以调节,起到治疗COPD作用。结论 研究结果体现了桑白皮治疗慢性阻塞性肺疾病多成分、多靶点、多途径的作用特点,...     

基于网络药理学和分子对接探讨心可舒片治疗高血压的作用机制

目的 基于网络药理学方法和分子对接技术探究心可舒片治疗高血压的作用机制。方法 利用TCMSP、HERB、ETCM数据库和Swiss Target Prediction平台检索心可舒片的活性成分及作用靶点;通过OMIM、Gene Cards、TTD和DrugBank数据库获取高血压的相关靶点。筛选出药物与疾病的交集靶点,通过Cytoscape 3.7.2软件和STRING数据库分别构建“中药–活性成分–靶点–疾病”及蛋白相互作用(PPI)网络并筛选出关键活性成分和核心靶点。运用DAVID数据库进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用AutoDockTools软件进行分子对接验证。结果 共获得心可舒片活性成分147个,药物与疾病的交集靶点262个。心可舒片治疗高血压的关键活性成分为丹参醇A、香紫苏醇、三裂鼠尾草素等;核心靶点为原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、肿瘤坏死因子(TNF)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)等。GO富集分析涉及238个生物学过程,41个细胞组分,81个分子功能。KEGG富集分析涉及131条信号通路,包括钙信号通路、神经...     

基于网络药理学与分子对接的化肝煎对失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病“异病同治”作用机制探讨

目的 以中医“异病同治”理论为依据，采用网络药理学与分子对接方法探讨化肝煎“异病同治”失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点及可能作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）等中药化合物数据库结合文献挖掘获取化肝煎的化学成分和作用靶点；结合GeneCards、OMIM、PharmGKB、DRUGBANK、TTD数据库获取化肝煎治疗失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病的作用靶点。采用Cytoscape软件绘制化肝煎中药-成分-靶点网络，利用Venny软件得出相关交集基因。基于Cytoscape软件绘制化肝煎-成分-靶点可视化网络图，借助STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用（PPI）网络，分析获得核心作用靶点。采用Metascape平台工具对其进行基因本体论（GO）注释及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。使用AutodockTools软件对化肝煎主要活性成分与疾病作用靶点进行分子对接。结果 筛选得到化肝煎化学成分56个，疾病靶点：失眠438个，慢性萎缩性胃炎868个，胃食管反流病4 252个，以及20个药物成分和疾病共同靶点。PPI网络中关键蛋白排名靠前的靶点为IL6、NCF1、PTGS2、CRP、MPO、PPARG、TNF等。获得GO富集分析结果排名靠前的有452种生物过程（BP）、19种分子功能（MF）、6种细胞组分（CC），KEGG信号通路主要有6条信号通路。分子对接结果显示关键成分与对应靶点具有较好的结合活性。结论 化肝煎治疗失眠、慢性萎缩性胃炎和胃食管反流病可能涉及TNF、IL6、PTGS2、PPARG、CRP等为代表的核心靶点，其实现异病同治的作用可能与脂质信号通路调控炎症、细胞因子反应等有关。     

康妇炎胶囊联合头孢噻肟钠治疗子宫内膜炎的临床研究

目的探讨康妇炎胶囊联合头孢噻肟钠治疗子宫内膜炎的临床疗效。方法选取2018年5月-2019年5月在眉山市人民医院治疗的子宫内膜炎患者84例,根据用药的差别分为对照组(42例)和治疗组(42例)。对照组静脉滴注注射用头孢噻肟钠,2.0 g/次加入生理盐水100 mL,2次/d;治疗组在对照组基础上口服康妇炎胶囊,1.2 g/次,3次/d。两组均治疗2周。观察两组患者临床疗效,同时比较治疗前后两组患者临床症状积分,GQOLI-74、FSFI和VAS评分,及血清C反应蛋白(CRP)、白细胞介素-4(IL-4)、白细胞介素-8(IL-8)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和基质金属蛋白酶-2(MMP-2)水平。结果治疗后,对照组临床有效率为80.95%,显著低于治疗组的97.62%,两组比较差异具有统计学意义(P<0.05)。经治疗,两组患者症状评分均显著下降(P<0.05),且治疗组比对照组下降更明显(P<0.05)。经治疗,两组患者GQOLI-74评分明显升高(P<0.05),而FSFI和VAS评分均明显降低(P<0.05),且治疗组GQOLI-74、FSFI和VAS评分明显好于对照组(P<0.05)。经治疗,两组患者血清CRP、IL-4、IL-8、TNF-α、MMP-9水平均显著降低(P<0.05),且治疗组患者明显低于对照组(P<0.05)。结论康妇炎胶囊联合注射用头孢噻肟钠治疗子宫内膜炎患者可有效改善患者临床症状,降低机体炎症反应,提高患者性生活质量,具有一定的临床推广应用价值。     

加味丹参饮治疗心肌梗死的网络药理学研究

目的 基于网络药理学的方法，分析加味丹参饮对于治疗心肌梗死的潜在作用机制。方法 借助TCMSP、Drugbank、Pubchem、Swiss Target Prediction等数据库及参考文献获取加味丹参饮的有效成分及靶标。通过HPO、OMIM平台检索心肌梗死疾病相关的靶标，并借助STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络（PPI），获得关键靶标。使用Cytoscape3.6.0软件对加味丹参饮-心肌梗死疾病进行网络可视化，并构建“加味丹参饮-化学成分-靶点”、“疾病-靶点”、“加味丹参饮-相关化学成分-疾病-关键靶点”网络图，使用DAVID数据库对关键靶点进行GO生物过程和KEGG代谢通路分析。结果 从加味丹参饮中共筛选出94个有效成分，148个与心肌梗死相关的作用靶点，其中有效成分与疾病对应的相同靶点21个，其中包含血管内皮生长因子A（VEGFA）、酪氨酸激酶2（JAK2）、肿瘤坏死因子（TNF）等。经GO和KEGG通路富集分析，靶点主要涉及G蛋白偶联受体信号通路、调节细胞增殖、RNA聚合酶II转录因子活性等功能过程，可能通过调节PI3K-Akt信号通路、微小RNA-癌症相关通路、AMPK信号通路、VEGF信号通路、JAK-STAT信号通路等多条代谢通路来发挥加味丹参饮治疗心肌梗死的作用。结论 通过建立靶点网络图，可从多方位阐明复方加味丹参饮治疗心肌梗死多成分、多靶点的机制，可进一步为深入研究加味丹参饮治疗心肌梗死相关疾病机制提供理论依据。     

基于“胃脘痈”与“炎-癌链”理论治疗慢性萎缩性胃炎的机制分析

目的探讨黄连-蒲公英药对治疗慢性萎缩性胃炎阻断“炎-癌链”的可能机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取黄连-蒲公英药对的主要活性成分,并用Uniprot数据库矫正靶点,利用人类基因数据库(Gene Cards)筛选慢性萎缩性胃炎的疾病靶点,采用Venny 2.1软件将药物靶点和疾病靶点取交集,获得黄连-蒲公英治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),使用DAVID 6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并绘制中药-成分-靶点-通路图。结果最终得到黄连-蒲公英药对有效成分17个,交集基因63个,最主要的有效成分为槲皮素、巴马汀、七叶亭、黄连素等,PPI网络图中度值较高的靶点有白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、细胞肿瘤抗原53(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素8(CXCL8)、转录因子AP-1(JUN)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、Caspase3、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK1)、基质金属蛋白酶(MMP)-9、IL-10。GO富集分析共430个生物学过程;KEGG通路图中与慢性萎缩性胃炎密切相关的有:癌症的途径、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、细胞凋亡、癌症中的蛋白多糖、核转录因子(NF)-κB信号通路。结论基于“胃脘痈”理论的黄连-蒲公英药对治疗慢性萎缩性胃炎是通过多成分、多靶点、多通路共同阻断“炎-癌链”的进程。     

基于网络药理学研究白仙风汤剂治疗类风湿性关节炎的药理机制

目的 基于网络药理学探讨白仙风汤剂治疗类风湿性关节炎的活性成分,并预测其可能机制。方法 白仙风汤剂中白芍、甘草、青风藤、威灵仙4味草药在TCMSP数据库中检索,经口服吸收率（OB）、类药性、半衰期条件筛选得到药物有效成分,并进行靶点预测;从OMIM、TTD、PharmGKB和GAD数据库对类风湿性关节炎靶点进行检索;使用Cytoscape 3.2.1软件构建药物成分靶点蛋白相互作用网络,对该网络进行拓扑学分析得到核心化学成分及核心靶点;对核心靶点基因进行GO通路分析和KEGG生物过程分析。结果 筛选得到白芍有效成分10个,甘草有效成分66个,青风藤有效成分6个,威灵仙有效成分8个,删除共有的有效成分,共有83个有效活性化合物,对这些化合物进行靶点预测,共得到260个药物靶点;对疾病相关靶点进行检索,共得到58个疾病靶点。通过对药物成分-疾病靶点网络节点的拓扑学分析得到槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、甘草素等19个核心化学成分,及丝裂原活化蛋白激酶14、雌激素受体、糖皮质激素受体等9个核心靶点,对这些靶点进行通路富集发现药物治疗疾病涉及血管内皮生长因子（VEGF）信号通路、调节脂肪细胞中的脂肪分解、催乳素信号通路、雌激素信号通路、TNF信号通路等11条通路。结论 白仙风汤剂主要通过VEGF信号通路、调节脂肪细胞中的脂肪分解、催乳素信号通路等多条途径实现类风湿性关节炎的治疗作用,表现出多成分、多靶点、多通路的特点,与类风湿关节炎治疗机制相一致。     

基于网络药理学桃核承气汤防治脓毒症心肌功能障碍的作用机制探讨

目的运用计算机网络药理学技术预测桃核承气汤治疗脓毒症心肌功能障碍的作用靶点和信号通路,进一步分析其防治脓毒症心肌功能障碍的基础和作用机制。方法运用中药系统药理学成分分析平台Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP)数据库获取桃核承气汤的有效成分及作用靶标基因,从GeneCards数据库收集脓毒症心肌功能障碍的靶标基因,将两者取交集后得到疾病-药物蛋白靶基因,运用STRING构建蛋白质间相互作用网络,并通过Cytoscape软件将结果进行网络可视化展示,通过网络结构和节点间加权重联系的计算分析算法筛选出作用的关键基因。借助Webgestalt在线工具进行疾病-药物交集靶基因的基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并可视化展示。最后利用CTD数据库并结合文献学习,获取关键基因于脓毒症心肌功能障碍的疾病治疗作用。结果桃核承气汤的135个化合物中有64成分通过20个靶点与脓毒症心肌功能障碍相互关联。其中AKT1、HMOX1、JUN、TNF、IL1B、MAPK14、NOS3、PPARG、ICAM1、NOS2、VCAM1、STAT1等关键基因主要通过调控炎症反应、促进细胞存活、抗细胞凋亡、参与能量代谢、病原识别、毒物代谢等路径,在质膜、细胞膜、吞噬细胞、线粒体自噬等分子反应中发挥作用。结论网络药理学方法科学预测桃核承气汤防治脓毒症心肌功能障碍的关键靶标及其参与的相关通路,提示该方剂对脓毒症心肌功能障碍的防治作用为多靶点、多通路、多选择的复杂机制,并且多与抗炎、抗细胞凋亡、促进细胞存活等机制相关。     

基于网络药理学与分子对接探讨二妙散治疗宫颈人乳头瘤病毒感染的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨二妙散治疗宫颈人乳头瘤病毒（HPV）感染作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索二妙散的有效成分和作用靶点;GeneCards、OMIM数据库检索宫颈HPV感染相关疾病靶点。将药物有效成分作用靶点与疾病靶点取交集;利用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用（PPI）网络,利用Cytoscape3.8.2软件对PPI进行拓扑分析;将潜在作用靶点导入DAVID数据库进行基因本体功能（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用AutoDock Tools 1.5.7软件和Pymol软件对核心作用靶点与有效成分进行分子对接及可视化。结果 获得二妙散有效成分28个,作用靶点为221个,筛选出核心靶点5个,包括蛋白激酶B1(Akt1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、雌激素受体α(ESR1)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)。GO富集分析显示,潜在作用靶点与细胞增殖的正向调节、细胞凋亡过程的负调控、转录的正调控、RNA聚合酶II启动子转录的正调控等生物过程有关;KEGG富集分析结果包括磷脂酰肌醇...     

基于网络药理学与分子对接的温胆汤治疗冠心病合并抑郁作用机制探讨

目的 运用网络药理学联合分子对接方法探讨温胆汤治疗冠心病合并抑郁的作用机制。方法 通过TCMSP与TCMIP数据库获取温胆汤的活性成分及其作用靶点,以UniProt数据库将靶点规范化命名。通过GeneCards、Disgenet数据库获取冠心病与抑郁相关疾病靶点并取二者交集,取温胆汤与冠心病合并抑郁的交集靶点并进行基因本体论（GO）功能分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,利用AutoDock软件将主要的活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 网络药理学分析显示温胆汤中43个有效成分与49个靶点与冠心病合并抑郁关联密切,与炎症反应、免疫反应、细胞凋亡、胰岛素抵抗、NO的生物合成、平滑肌细胞增殖调控、DNA结合转录因子的调控、细胞外间隙、类固醇结合等生物学过程密切相关,作用涉及HIF-1、肿瘤通路、雌激素信号通路、TNF信号通路、T细胞受体通路等,分子对接结果显示成分与靶点结合较好的是黄芩苷-ALB与黄芩苷-TNF。结论 温胆汤作为一种临床常用方剂可以通过多靶点、多通路、多机制对冠心病合并抑郁进行干预。     

试剂盒法和福林酚法测定鹿瓜多肽注射液中多肽的比较研究

目的 筛选藿朴夏苓汤治疗早期新型冠状病毒肺炎（COVID-19）湿邪郁肺证的物质基础,预测其作用机制。方法 查阅文献及临床报道分析藿朴夏苓汤与早期COVID-19湿邪郁肺证的方证关系。运用TCMSP数据库筛选藿朴夏苓汤中潜在活性成分,将活性成分与新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶、血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接,根据结合能筛选与两者均有较好结合作用的核心成分。借助Cytoscape软件构建关键成分靶点蛋白互作网络,筛选出核心靶点;通过STRING数据库进行核心靶点的GO分析,Cytoscape软件ClueGO插件进行Pathway、KEGG富集分析。结果 方证关系分析藿朴夏苓汤用于治疗早期COVID-19湿邪郁肺证,筛选出藿朴夏苓汤中潜在作用成分12个,核心靶点67个。其中通草中的通脱木皂苷元I,茯苓、猪苓中的过氧麦角甾醇,半夏中的黄芩苷与SARS-CoV-2 3CL水解酶、ACE2均具有较好的结合活性。GO、Pathway、KEGG富集分析结果显示藿朴夏苓汤中12个潜在作用成分参与调节刺激反应、信号转导、细胞死亡等生物过程以及白介素信号通路、癌症EGFR信号通路、酪氨酸激酶信号转导途径、编程性细胞死亡途径、MAPK信号通路等。结论 藿朴夏苓汤以化湿解毒、宣肺透邪治疗早期COVID-19湿邪郁肺证患者,菲酮、黄芩苷、酸枣仁皂苷、啤酒甾醇、常春藤皂苷元、过氧麦角甾醇、柠檬二烯醇、麦角甾-7,22-二烯-3-酮、通脱木皂苷元I、泽泻醇B-23-醋酸酯、泽泻醇B、新橙皮苷可能为其主要的物质基础,通过阻断SARS-CoV-2病毒蛋白合成,阻止病毒进入宿主细胞,通过调控白介素信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、T细胞受体信号通路、C型凝集素受体信号通路,抑制相关炎症因子的表达发挥作用。     

基于网络药理学探讨调神攻坚汤治疗肝纤维化的作用机制

目的 基于网络药理学研究方法探讨调神攻坚汤治疗肝纤维化的作用机制。方法 检索 TCMSP 和BATMAN-TCM数据库得到调神攻坚汤的有效活性成分及其相关作用靶点；并与检索OMIM和Genecards数据库得到的肝纤维化疾病作用靶点利用R语言筛选共同靶点；通过STRING数据库构建靶点间的蛋白互作PPI网络，随后利用Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析；利用 Cytoscape 3.7.2软件构建“中药-活性成分-疾病”靶点网络图，并经Cytohubba插件的MCC算法筛选出核心蛋白；再将其导入Genecards数据库中获得亚细胞分布。结果 通过筛选共计获得调神攻坚汤有效活性成分166个，作用靶点596个；经匹配后此方剂治疗肝纤维化的潜在靶点为193个；其中核心包括FN1、MMP2、TNF、IL-6、STAT3、CTNNB1等；GO以及KEGG分析显示调神攻坚汤可能通过调控炎症反应、脂质代谢、细胞凋亡等生物学过程治疗肝纤维化，并且涉及HIF-1、Foxo、PPAR等细胞信号转导通路。结论 通过网络药理学方法初步验证调神攻坚汤治疗肝纤维化是一个“多组分-多靶点-多通路”的过程，并预测其潜在作用机制，为后续临床及基础研究提供理论依据。