叶酸代谢相关基因多态性与山西地区非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的:研究叶酸代谢相关基因MTHFR基因rsl801133、MTHFD1基因rs2236225位点多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法:通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测265例NSCL/P患者和276例正常对照者的MTHFR基因rsl801133、MTHFD1基因rs2236225位点的多态性。结果:MTHFR基因rsl801133位点、MTHFD1基因rs2236225位点的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MTHFR基因rsl801133位点、MTHFD1基因rs2236225位点的等位基因频率分布在NSCL/P组与对照组之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:MTHFR基因rsl801133位点、MTHFD1基因rs2236225位点的多态性与NSCL/P的发生无关。     

亚甲基四氢叶酸还原酶C677T多态性与非综合征性唇腭裂的关系

目的研究亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性与非综合征性唇腭裂的关系。方法利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法（PCR-RFLP）,在168例非综合征性唇腭裂患者和192名正常对照中,对MTHFR基因C677T单核苷酸多态性（SNP,rs1801133）进行检测。利用拟合优度卡方检验,分析基因型分布频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;应用UNPHASED软件包分析多态性位点与非综合征性唇腭裂的相关性。结果MTHFRC677T多态性基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MTHFR C677T等位基因分布在NSCL／P组与对照组之间有显著性差异（P〈0.05）,正常组中T等位基因的频率明显高于NSCL／P组。结论MTHFR C677T多态性位点在中国人群中与非综合征性唇腭裂形成的发生相关联。     

MTHFR基因单核苷酸多态性与新疆地区维吾尔族非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的:探讨MTHFR基因rs1801133、rs3818762、rs1801131、rs1476413、rs1994798位点单核苷酸多态性与新疆地区维吾尔人群非综合征型唇腭裂的相关性。方法:研究对象均为新疆地区世居维吾尔族,病例组非综合征性唇腭裂患者100例,对照组为60例因上呼吸道感染而住院的儿童,用DNA二代测序技术对目标区域进行测序,进行遗传学分析。结果:在新疆维吾尔人群中,与对照组相比,NSCL/P组rs1801133、rs3818762、rs1801131、rs1476413、rs1994798位点基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义。连锁不平衡分析显示:以上5个位点位于同一个单倍体域,rs3818762和rs1476413等2个位点存在较强的连锁不平衡(r²=0.938,D’=1)。单倍型分析可推测出最常见的单倍体型共5种:GCTAA>GCTAG>CTGGG>GCTGG>GCGGG,5种单倍体型在病例组与对照组间分布差别无统计学意义。结论:MTHFR基因rs1801133、rs3818762、rs1801131、rs1476413、rs1994798等5个位点基因型及等位基因频率在患儿与正常人之间比较没有统计学意义。     

MSX1基因多态性与山西地区非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的:研究MSX1基因外显子区rs13127820(M146L)、rs62636562(A274V)位点多态性与非综合征性唇腭裂(non-syn-dromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关系。方法:通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测243例非综合征性唇腭裂(NSCL/P)患者和292例正常对照者全血标本中MSX1基因rs13127820(M146L)、rs62636562(A274V)位点的多态性。结果:MSX1基因位点rs13127820(M146L)、rs62636562(A274V)基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MSX1基因位点rs13127820(M146L)、rs62636562(A274V)等位基因频率分布在NSCL/P组与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05)。结论:结果显示MSX1基因位点多态性与NSCL/P的发生有关。     

THADA基因多态性与非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的:探讨中国北方人群甲状腺腺瘤相关基因(THADA) rs7590268、rs13035011和rs6729902位点单核苷酸多态性(SNPs)与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法:应用聚合酶链式反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)检测方法,在335例NSCL/P患者和525例健康体检者中,对THADA基因的rs7590268、rs13035011和rs6729902位点进行检测。结果:rs7590268和rs6729902多态性位点等位基因频率在唇裂组与对照组间的分布差异有统计学意义(P＜0.05),rs13035011位点基因型及等位基因频率在病例组和对照组间的分布差异无统计学意义。结论:THADA基因的rs7590268和rs6729902位点单核苷酸多态性可能与中国北方人群非综合征性唇腭裂的发生相关。     

非综合征型唇腭裂与新疆维吾尔族、汉族 MTHFR 基因多态性的研究

目的：探讨新疆维吾尔族、汉族非综合征型唇腭裂与 MTHFR 基因多态性的关系和民族差异。方法：170例 NSCL／P儿童患者和100例健康儿童对照,SNaPshot 分型方法检测 rs1801131、rs1801133位点多态性,分析基因型、等位基因频率和2个位点联合作用与 NSCL／P 的关系以及民族间差异。结果：rs1801133TT 与 T 等位基因在维、汉两民族间有统计学差异（P ＜0．05）;rs1801133CT 与 CT ＋TT 基因型在总病例组和总对照组间均有统计学差异（P ＜0．05）;rs1801131和 rs1801133的联合分析在维族内、汉族内、两民族间、维汉总人群中病例组和对照组均有统计学差异（P ＜0．05）;rs1801131多态性在维族内、汉族内、两民族间以及维汉总人群中均无统计学差异（P ＞0．05）。结论：rs1801133TT 与 T 等位基因的汉族比维吾尔族更易罹患 NSCL／P;rs1801131AC 和 rs1801133CC 联合作用与 NSCL／P 相关且维吾尔族罹患风险高于汉族;rs1801131多态性与 NSCL／P 不相关并无民族差异;rs1801133CT 与 CT ＋TT 基因型均是避免疾病的保护因素。     

MTR基因rs1805087位点多态性与非综合征性唇腭裂的关联性研究

目的:研究蛋氨酸合成酶(methionine synthase,MTR/MS)基因rs1805087位点单核苷酸多态性与山西人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对135个NSCL/P核心家庭、150例正常新生儿及其母亲的MTR基因rs1805087位点多态性进行检测;用人群关联研究、病例组核心家庭的传递不平衡检验(TDT)和单体型的相对危险度(HHRR)进行统计分析。结果:本研究中GG基因型较少,故将AG和GG基因型合并后与AA基因型比较。病例组子代及母亲和对照组之间,基因型分布和等位基因频率比较,差异均无统计学意义(P>0.05);唇裂组和唇腭裂组子代及母亲基因型分布和等位基因频率,与对照组差异均无统计学意义(P>0.05);病例组核心家庭分析,TDT检验χ2=0.083,P>0.05,HHRR分析χ2=0.112,P>0.05,说明携带有突变基因G并不能增加NSCL/P的发病风险。结论:本研究结果未显示MTR基因rs1805087位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂之间存在相关性。     

叶酸代谢相关基因与非综合征性唇腭裂的关系

目的：研究叶酸代谢相关基因在中国华北人群中与非综合征性唇腭裂的关系。方法：利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,在115例非综合征性唇腭裂患者和192名正常对照个体中,对CBS和SHMT1基因2个单核苷酸多态性（SNP）rs397589和rs1979276进行检测。利用拟合优度卡方检验,分析基因型分布频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;应用UNPHASED软件包分析单个基因多态性位点以及基因-基因相互作用与非综合征性唇腭裂的相关性。结果：2个基因上的SNP位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡;等位基因分布在NSCL/P组与对照组之间无显著性差异;rs397589TT和rs1979276TT基因型能增加NSCL/P患病风险（OR=2.60,95%CI=0.43-15.87;OR=1.62,95%CI=0.22-11.70）;携带rs397589GT-rs1979276CT个体在患者中的频率高于对照组（χ2=4.780,P=0.029）。结论：CBS和SHMT1基因相互作用可能参与非综合征性唇腭裂的发生。     

MTR基因Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的研究5-甲基四氢叶酸-高半胱氨酸甲基转移酶（5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase,MTR）SNPs位点Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测174例非综合征性唇腭裂患者和169例正常对照组的MTR基因Rs1805087的多态性。结果 MTR基因Rs1805087位点基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MTR基因Rs1805087位点基因型及等位基因的分布在NSCL/P组与对照组之间均无统计学意义（P〉0.05）。结论结果未显示MTR基因Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的发生有关。     

宁夏回汉族人群Wnt3基因单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂相关性的研究

目的 探讨宁夏回汉族人群中Wnt3基因rs142167和rs7216231位点单核苷酸多态性（SNP）与非综合征型唇腭裂（NSCL/P）的相关性。方法 收集宁夏地区回汉族人群非综合征型唇腭裂患者371例为病例组,其中汉族患者166例,回族患者205例;收集患者父亲196例,患者母亲224例,其中150例患者为NSCL/P核心家系;258例健康新生儿为对照组,其中汉族190例,回族68例。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测Wnt3基因多态位点rs142167和rs7216231基因型,对比分析2组的基因型和等位基因,并进行传递不平衡检验（TDT）和以家系为基础的相关性检验（FBAT）分析。结果 回汉族人群病例组与对照组比较及其民族分层比较,唇裂、腭裂、唇腭裂及总病例组rs142167和rs7216231位点均无统计学差异（P＞0.05）。TDT分析结果显示：rs142167和rs7216231位点的等位基因均不存在过传递（P＞0.05）。FBAT分析结果显示：单倍型G-G具有统计学意义（P<0.05）。结论 Wnt3基因多态性与宁夏地区回汉族人群非综合征型唇腭裂不存在相关性。     

非综合征型唇腭裂与MTHFR基因多态性的相关性研究

目的：研究亚甲基四氢叶酸还原酶（methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR）基因位点C677T和A1298C与中国江苏地区汉族人群非综合征型唇腭裂（（nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P）发生的相关性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测法对200例NSCL/P患者和213例健康人进行基因型检测。结果：MTHFR C677T对照组与病例组在基因型分布无统计学差异（P〉0.05）,TT基因型和携带T等位基因儿童罹患NSCL/P的风险分别是CC基因型儿童的1.84倍及1.57倍。进一步分层分析发现TT基因型和CT基因型能分别显著增加儿童唇裂伴或不伴腭裂和单纯性唇裂的发病风险。MTHFR A1298C病例组和对照组在基因型频率和等位基因频率有统计学差异（P〈0.05）,AC基因型和携带C等位基因的儿童罹患NSCL/P的风险分别比AA基因型儿童降低49%及43%。分层分析中,AC基因型和携带C等位基因可降低罹患唇裂伴腭裂及唇裂伴或不伴腭裂的风险。结论：MTHFR C677T可能为中国江苏地区汉族儿童NSCL/P的危险因素,而MTHFR A1298C有可能是NSCL/P发生的保护因素。     

中国北方人群非综合征性唇腭裂与BMP4基因多态性的关系

目的探讨BMP4基因rs17563多态性与中国北方人群非综合征性唇腭裂的相关性。方法使用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法,在116例非综合征性唇腭裂患者和123名健康对照中,对BMP4基因单核苷酸多态性进行检测。利用SPSS13.0软件分析BMP4基因多态性与非综合征性唇腭裂的相关性。结果 BMP4基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。在非综合征性唇腭裂组中CC纯合子明显高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。结论 BMP4基因rs17563多态性可能与中国北方人群非综合征性唇腭裂的发生相关。     

中国人群非综合征性唇腭裂患者IRF6基因突变检测

目的 探讨干扰素调节因子6(interferon regulatory factor 6, IRF6) 在非综合征性唇腭裂(non-sydromic cleft lip and/or cleft palate,NSCL/P)患者中的突变情况。方法：收集119例NSCL/P患者及288名健康人对照样本的外周血血样并提取DNA。在IRF6基因的全部外显子分别设计引物,PCR扩增其序列,通过测序找出IRF6基因突变,并将这些突变在对照样本中进行验证。结果：共发现5种在正常人中没有的突变,其中4种是新发现的突变。结论：IRF6基因突变在中国人群中参与了非综合征唇腭裂疾病的发生。     

MSX1基因A274V多态性与非综合征性唇腭裂的关系

目的 研究同源异型盒基因1 (muscle segment homeobox1,MSX1) A274V多态性与非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关系.方法 利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,在162例非...     

Association between BMP4 gene polymorphisms and cleft lip with or without cleft palate in a population from South China

ObjectivePrevious studies have suggested an association between several polymorphisms of the BMP4 gene and susceptibility to non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) in various populations. However, this association may vary according to ethnic group and the form of NSCL/P. This study analyzed the association between the BMP4 gene polymorphisms rs762642, rs17563, and rs10130587 with the risk of cleft lip only (CLO), cleft palate only (CPO), and cleft lip with palate (CLP) in a population from South China.MethodsThis case-control study included 165 patients with NSCL/P (53 patients with CPO, 52 with CLO, and 60 with CLP) and 52 healthy volunteers. Peripheral blood samples were collected from all subjects to genotype the rs762642, rs17563, and rs10130587 polymorphisms by direct sequencing. Genotype and allelic frequencies of these polymorphisms were compared between healthy volunteers and patients with various forms of NSCL/P.ResultsThe genotype and allelic frequencies of rs762642 differed significantly between subgroups (CPO and CLP) and normal controls, whereas a significant difference was observed only in the CLO subgroup for the rs17563 polymorphism and in the CLO and CLP groups for the rs10130587 polymorphism. In addition, we identified a novel association of a BMP4 gene polymorphism, which was in linkage disequilibrium with the rs10130587 polymorphism, with CLO and CLP.ConclusionThe BMP4 gene polymorphisms rs762642, rs17563, and rs10130587 exhibit different associations with different forms of NSCL/P, suggesting that different forms of NSCL/P may have different etiologies.     

非综合征性唇腭裂与亚甲基四氢叶酸还原酶基因A1298C相关性的研究

目的 研究亚甲基四氢叶酸还原酶基因(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)A1298C多态性与中国华北人群非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关系.方法 通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性,在158例NSCL/P患者和192名健康对照中,对MTHFR基因A1298C单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)rs1801131进行检测.利用拟合优度卡方检验分析基因型分布频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;应用Unphased软件分析等位基因频率与NSCL/P的相关性.结果 MTHFR基因A1298C多态性基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;等位基因和基因型频率在唇裂合并或不合并腭裂组和健康对照组之间差异无统计学意义;基因型分布单纯腭裂(AA 78%、AC+CC 22%)与健康对照组(AA 74%、AC+CC 26%)比较,差异有统计学意义(χ2＝4.256,P=0.039),AC+CC基因型频率健康对照组(26%)高于单纯腭裂组(22%)(OR=0.8,95%CI=0.381～1.683).结论 MTHFR A1298C多态性位点可能与中国人群非综合征性单纯腭裂的发生有关.

Abstract：

Objective To investigate the association between a polymorphism of methylenetetrahydrofolate reductase with Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate(NSCL/P)in Chinese population. Methods The polymerase chain reaction (PCR)-based restriction fragment length polymorphism(RFLP)technique was used to detect a single nucleotide polymorphism(SNP), rs1801131, at the methylenetetrahydrofolate reductase(MTHFR)gene in both 158 patients with NSCL/P and 192 healthy individuals. The Hardy-Weinberg equilibrium for genotypic distributions was estimated by the goodness-of-fit test. The UNPHASED program was applied to perform the association analysis. Results The genotypic distribution of A1298C was not deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium in both controls and patients. No association was found between cleft lip with or without palate(CL/P)and controls. There was significant difference of cleft palate only(CPO)and the healthy individuals(χ2＝4.256, P=0.039). The frequency of AC+CC genotype was higher in control group than that in CPO group(OR=0.8, 95%CI=0.381-1.683),26 among 100 healthy individuals carried AC+CC genetypes,which were carried by 22% of CPO patients. Conclusions The polymorphism of MTHFR A1298C may be involved in the occurrence of non-syndromic cleft palate only in Chinese population.