携带Pyk2基因的shRNA质粒构建及其在Lovo结肠癌细胞系中的表达

目的:构建重组质粒PGCsi-Pyk2 shRNA,并检测所引起的Pyk2 mRNA和蛋白在Lovo结肠癌细胞系中的表达.方法:设计合成3对pkv2基因shRNA序列,形成双链后将其依次连入带有U6启动子并含有潮霉素B的pGcsi空载体,构建成能产生Pyk2短发卡RNA的质粒:采用双酶切和测序分析鉴定插入基因的序列:脂质体介导重组质粒pGCsi-Pyk2 shRNA稳定转染Lovo细胞系并通过潮霉素B筛选,获得比较单一的转染细胞;分别采用RT-PCR、Western blot等检测转染前后Pyk2的水平表达.结果:酶切鉴定和测序分析表明重组表达质pGCsi-Pyk2 shRNA构建无误:绿色荧光照相及PCR表明质粒转染成功:RT-PCR和Western blot均表明,与转染空质粒PGCsi组和转染仅含免疫荧光基因组细胞相比,转染重组表达质pGCsi-Pyk2 shRNA细胞t'Pyk2mRNA及蛋白表达水平均明显降低.结论:成功构建重组质pGCsi-Pyk2 shRNA.并证明他能降4Pyk2在Lovo胞株系中的表达,为进一步研究Pyk2何调控Hic-5/ARA55,Paxillion等下游靶基因的表达和参与结肠癌表观遗传学发生机制奠定了基础.     

pGPU6/GFP质粒介导的表达钙网织蛋白基因的短发夹RNA的构建和鉴定

目的构建靶向钙网织蛋白(CRT)基因的短发夹RNA(shRNA)表达质粒并鉴定。方法设计并合成4对针对CRT基因的shRNA链,退火形成双链,与酶切的质粒pGPU6/GFP连接,构建4个重质粒,转化DH5а菌株,提取质粒,进行酶切鉴定和测序分析。脂质体法转染人乳腺癌MDA-MB-231细胞,通过荧光倒置显微镜判定转染效率,并通过Western印迹法检测细胞中CRT基因及蛋白的表达水平。结果经酶切鉴定筛出的重组质粒测序结果与目的序列相同,重组质粒pGPU6/GFP/Neo-CRT构建成功;转染MDA-MB-231细胞后,CRT基因在mRNA及蛋白水平的表达均降低,其中pGPU6/GFP/CRT1的抑制效果最好。结论成功构建了靶向CRT基因的shRNA表达质粒,并筛选出1种对CRT基因有显著抑制作用的shRNA。     

STAT3靶向短发夹RNA干扰重组载体对结肠癌SW480细胞的沉默作用

目的 探讨STAT3基因短发夹RNA(shRNA)表达质粒对结肠癌SW480细胞STAT3基因的干扰作用.方法 根据siRNA设计原则,构建靶向STAT3基因的短发夹RNA干扰质粒(pGPU6/GFP/STAT3),使用脂质体法转染人结肠癌细胞系(SW480),通过RT-PCR和 Western 印迹检测结肠癌SW480细胞STAT3基因mRNA和蛋白表达水平.结果 pGPU6/GFP/STAT3重组质粒经限制性内切酶酶切及测序证明基因插入正确.质粒成功转染SW480细胞后,该细胞的STAT3 mRNA和蛋白表达明显下降(P<0.05).结论 成功构建靶向STAT3基因的shRNA表达载体,转染SW480细胞,能有效抑制细胞的STAT3 mRNA和蛋白表达,为STAT3基因靶向治疗提供前期的实验依据.     

靶向SET的shRNA真核表达质粒的构建及鉴定

目的:针对PP2A内源性抑制剂SET基因的不同部位,构建靶向SET的shRNA真核表达质粒,鉴定并筛选出最佳抑制效率的表达质粒.方法:针对SET基因的不同部位设计4对短发卡RNA(shRNA)的寡核苷酸片段,克隆到真核表达载体pGPU6中,构建靶向SET的shRNA真核表达质粒pGPU6/GFP/Neo-SET-shR...     

小鼠TRAF6基因shRNA真核表达载体的构建与表达

目的:构建并筛选肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)短发夹RNA(shRNA)表达质粒.方法:针对小鼠TRAF6 mRNA设计4条理论上最佳的siRNA序列,经退火成互补双链,将相应双链DNA插入pGCsi-U6/GFP/Hygro质粒中,构建重组表达质粒pGCsi-TRAF6 -shRNA1,2,3,4,并以不同比例DNA质粒/脂质体转染重组质粒(1∶2、2∶5、1∶3和1∶4)至RAW 264.7细胞中,观察转染效果.结果:靶向TRAF6 mRNA的4个shRNA重组质粒载体pGCsi-TRAF6 shRNA1,2,3,4,经测序分析,shRNA编码序列与设计的片段完全一致,证实载体构建成功.应用荧光显微镜分析转染效率显示,DNA(g)/脂质体转染重组质粒(L)按1∶2、2∶5、1∶3和1∶4比例转染细胞的效率分别为13.7%±1.2%、24.5%±2.1%、19.3%±1.7%、16.3%±2.8%,以2∶5为最佳比例.只加了脂质体未加质粒(试剂对照)的细胞无荧光表达.结论:TRAF6靶向RNA干扰重组表达质粒构建成功,为进一步研究阻断TRAF6表达对急性肝衰竭过度炎症反应的基因治疗奠定基础.     

Rac1shRNA对卵巢癌细胞株Skov3细胞周期及凋亡的影响

目的 为Rac1 shRNA应用于卵巢癌治疗提供实验依据.方法 将筛选的有效的Rac1 shRNA载体pGPU6/GFP/Rac1-524以LipofectimineTM2000介导转染卵巢癌细胞株Skov3,48 h后收集细胞,RT-PCR检测转染细胞cyclin D1 mRNA的表达;将转染细胞标记AnnexinⅤ,流式细胞术检测分析转染细胞的凋亡情况.结果 转染Rac1 shRNA pGPU6/GFP/Rac1-524的卵巢癌细胞株Skov3的cyclin D1 mRNA表达量下降;Annexin Ⅴ阳性细胞数(54%)明显高于未转染组(5.6%);Annexin Ⅴ和PI双阳性的细胞数(32.3%)也明显高于未转染组(3.2%).结论 Rac1 shRNA pGPU6/GFP/Rac1-524可以下调cyclin D1的表达,并促使Skov3细胞凋亡.     

构建shRNA真核表达质粒抑制CXCR4对人食管癌细胞Eca-109迁移的影响

目的 构建人CXCR4 mRNA的shRNA真核表达载体质粒,特异性抑制人食管癌细胞CXCR4的表达,并筛选抑制效果理想的质粒,研究对食管癌细胞迁移的影响.方法 以人CXCR4 mRNA编码区中3条不同序列作为RNA干扰靶点,分别构建3个shRNA真核表达载体质粒GYJ-1、GYJ-2、GYJ-3,并进行测序.用脂质体转染人食管癌细胞株Eca109,实时定量逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）检测mRNA水平.应用细胞划痕试验研究干扰质粒对食管癌细胞迁移的影响.结果 GYJ-1呈高效特异地抑制人CXCR4的表达;而GYJ-2及GYJ-3抑制效果较GYJ-1差.GYJ-1显著抑制食管癌细胞的迁移.结论 通过构建CXCR4的shRNA真核表达载体导入食管癌细胞,可有效抑制人食管癌细胞中CXCR4的表达,并影响食管癌细胞的迁移.     

短发卡RNA抑制人端粒酶逆转录酶表达对人脑胶质瘤细胞增殖及凋亡的影响

目的探讨短发卡RNA(shRNA)对人端粒酶逆转录酶(hTERT)表达的抑制作用,以及其对人胶质瘤细胞U251增殖、凋亡的影响。方法构建针对hTERT的shRNA表达质粒,脂质体介导转染人胶质瘤细胞U251,采用RT-PCR、Western blotting技术检测目的基因的表达,PI-DNA染色、流式细胞仪检测细胞的增殖及凋亡。结果成功构建了hTERT的shRNA表达质粒,其转染U251胶质瘤细胞后,hTERT基因表达明显降低(P<0.05),细胞进入S期出现障碍,停滞在G0/G1期的细胞增多,凋亡细胞增加。结论针对hTERT的shRNA干扰效果明确,其可抑制胶质瘤细胞增殖,促进其凋亡。     

shRNA基因沉默靶向治疗对乳腺癌细胞HER2表达的影响

目的 构建针对HER2基因RNA干扰的真核表达载体并筛选出HER2基因的高效RNA干扰序列.方法 采用化学合成方法合成三段针对HER2基因的shRNA,通过酶切连接方法与真核表达载体pSuper/GFP/neo相连接,构建针对HER2基因的RNA干扰载体,并通过酶切和测序方法鉴定是否含有设计的shRNA.应用脂质体转染试剂分别转染载体到人乳腺癌SK-BR-3细胞中,采用实时定量PCR和Western印迹检测其对HER2基因沉默的效果.结果 EcoRⅠ和HindⅢ进行双酶切鉴定,281 bp条带出现,证明质粒中插入外源基因,再经测序证实含有设计的shRNA序列.实时定量PCR和Western印迹结果显示3段shRNA均可降低HER2 mRNA的水平并且降低跨膜蛋白HER2的表达,其中shRNA2的HER2 mRNA抑制效率最高,达到89%.结论 构建了3个真核表达载体pSuper/GFP/neo-HER2,并筛选出shRNA2这段序列,可以有效沉默人乳腺癌细胞系SK-BR-3 的HER2基因,为乳腺癌的HER2基因沉默靶向治疗奠定了基础.     

靶向XIAP的shRNA重组质粒的构建

目的:设计以X染色体连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)为靶向的shRNA,构建携带此shRNA的重组质粒,检测其抑制XIAP表达的效应,筛选RNA干扰作用最强的shRNA片段.方法:设计4对针对XIAP基因不同位点的shRNA片段,构建携带此shRNA片段的真核表达载体psiRNA-Hhneo-XIAP,通过脂质体介导的方法将重组质粒转染到肝癌细胞株HepG2细胞中.采用逆转录酶链式反应(RT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)方法检测XIAP的mRNA及蛋白表达情况,比较转染前后其表达差异,以判断各shRNA的干扰效应.结果:成功构建含shRNA片段的重组质粒.经质粒测序证实,插入的DNA片段的序列与设计序列完全一致.重组质粒转染HepG2细胞后,XIAP基因的mRNA水平及蛋白表达水平明显下调,其中以1号重组质粒效应最强.shRNA作用48h后,对HepG2细胞中XIAP mRNA和蛋白的抑制率与3,4号重组质粒相比,均具有显著性差异(mRNA:94.5% vs 81.5%,82.6%,均P<0.01:蛋白:92.6% vs 80.7%,82.9%,均P<0.01).结论:成功构建了携带以XIAP为靶向的shRNA的重组质粒,其对肝癌细胞内XIAP的表达具有显著抑制效应.X染色体连锁凋亡抑制蛋白;;短发夹状RNA;;肝癌;;逆转录聚合酶链式反应;;免疫蛋白印迹     

COL1A1-shRNA表达质粒构建及抑制COL1A1表达的有效序列的筛选

目的: 构建和筛选对大鼠肝星状细胞前Ⅰ型胶原α1链(COL1A1)mRNA有抑制作用的COL1A1短发夹RNA (shRNA)的表达质粒.方法:从NCBI网站获得大鼠的COL1A1 cDNA序列, 根据Whitehead研究所的siRNA设计软件设计3条理论上最佳的siRNA序列, 相应的双链DNA被插入pGPU6/GFP/Neo质粒中, 即pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B和pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C. 为得到高效沉默COL1A1-siRNA, 以脂质体LipofectAMINE2000, 将1、2、3、4 μg DNA质粒转染至HSC-T6细胞中, 并观察转染效果. 将最佳沉默siRNA导入HSC-T6细胞, RT-PCR分析各组的COL1A1 mRNA表达水平.结果: 靶向COL1A1 mRNA的3个shRNA重组质粒载体pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B和pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C经测序分析, shRNA编码序列与设计的片段完全一致, 经酶切凝胶电泳证实载体构建成功. 1、2、3、4 μg组转染效率分别为16.7%、20.3%、23.5%和22.3%, 以2 μg siRNA为最佳剂量, pGPU6/GFP/Neo-shRNA-A、pGPU6/GFP/Neo-shRNA-B和pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C对COL1A1 mRNA的抑制率分别为16.6%, 63.3%和80.3%. 结论:筛选出的pGPU6/GFP/Neo-shRNA-C表达质粒能高效地抑制转染细胞COL1A1 mRNA的表达, 从而为肝纤维治疗提供新的方法和材料.     

靶向表皮生长因子受体shRNA质粒表达载体的构建和鉴定

目的构建靶向表皮生长因子受体（EGFR）的短发卡状RNA（shRNA）质粒表达载体并进行鉴定。方法设计两个小分子干扰RNA（siRNA）序列，体外合成DNA模板引物，与Pgenesil-1质粒构建成编码shRNA的表达载体，进行酶切鉴定和测序，再转染人大肠癌LoVo细胞，进行荧光摄像和G418抗性筛选。结果构建的质粒表达载体完全符合设计要求，转染成功的细胞在荧光显微镜下显示为绿色，G418可以筛选出阳性克隆。结论成功构建了编码EGFR—shRNA的质粒表达载体，并可以进行稳定筛选。     

ROCK-Ⅱ基因shRNA质粒表达载体的构建与鉴定

目的 构建表达Rho激酶(ROCK)-Ⅱ特异性siRNA的重组质粒.方法 按照Elbashir等设计原则和siRNA表达载体的要求,利用Ambion公司在线siRNA Tatget finder软件,设计带有BamH I、Bbs I酶切黏性末端、终止识别序列和LOOP环的shRNA,并将其克隆入载体pGPU6/GFP/Neo,构建成ROCK-Ⅱ特异siRNA重组质粒,然后进行酶切鉴定及基因测序.结果 设计的shRNA成功克隆入载体pGPU6/GFP/Neo,构建成ROCK-Ⅱ特异siRNA重组质粒,酶切鉴定及基因测序表明设计序列完全相符,目的 基因序列准确无误.结论 重组质粒构建成功,为今后体外或体内研究ROCK基因在脊髓损伤后的功能修复提供了一种有效的方法.     

缺氧诱导因子-1α shRNA 重组质粒的构建及对人结肠癌细胞生长的影响

目的 构建靶向缺氧诱导因子-1α特异性短发卡RNA(shRNA)的真核表达载体,为结肠癌的靶向治疗奠定基础.方法 设计、合成针对缺氧诱导因子-1α的特异性短链寡核苷酸,构建缺氧诱导因子-1α特异性shRNA的重组质粒,稳定转染结肠癌SW480细胞;采用氯化钴制备缺氧诱导培养基,模拟肿瘤缺氧状态.采用实时定量聚合酶链反应和免疫印迹法检测转染前后SW480细胞中缺氧诱导因子-1α的表达;MTT法检测SW480细胞活性.结果 经酶切和测序鉴定,成功构建HIF-1α特异性shRNA的重组质粒,并能转染SW480细胞.转染后,缺氧诱导因子-1α mRNA和蛋白水平表达分别下降约86.1%和79.7%,肿瘤细胞增殖活性明显降低.结论 运用pGenesil-1质粒载体构建的靶向HIF-1α特异性shRNA的重组质粒已成功构建,该质粒可转染SW480细胞,有效抑制HIF-1α的表达;本研究可为结肠癌的靶向治疗提供新方法.     

大鼠STAT3基因靶向shRNA真核表达载体的构建及鉴定

目的针对大鼠信号转导子及转录激活子3（STAT3）基因序列,构建特异性短发夹状RNA（shRNA）真核表达载体。方法根据STAT3基因序列及shRNA设计原则,设计4条干扰效果最佳的shRNA,化学合成4对引物,通过PCR扩增获得dsDNA模板,采用DNA重组技术与pGCsi-U6/Hygro/GFP空载体连接,转化DH5a感受态细胞经诱导表达筛选阳性克隆子,抽提重组质粒,进行DNA测序鉴定。结果转化大肠杆菌涂布平板长出阳性菌落,测序结果与所设计的STAT3 shRNA转录模板序列一致。结论所设计的shRNA编码序列被正确地插入到质粒骨架中,成功构建了STAT3基因的shRNA表达载体。     

Cbl-b shRNA稳定转染乳腺癌MDA-MB-231细胞系的构建

目的构建靶向Cbl-b基因的短发夹环RNA（shRNA）真核质粒表达载体,建立Cbl-b shRNA稳定转染人乳腺癌MDA-MB-231细胞系,为探讨Cbl-b的生物学功能奠定基础。方法设计Cbl-b shRNA序列BLAST进行同源性分析。化学合成法合成shRNA序列,将配对的单链合成双链,以T4连接酶连接于pSilencerTM 4.1-CMV表达载体,加入感受态细胞。将菌液涂布于含有氨苄青霉素的LB平板,筛选阳性菌落,测序确认后进行大量复制、扩增,提取重组质粒。脂质体法将上述质粒转染至MDA-MB-231细胞中,G418持续压力选择和有限稀释法获得稳定转染的细胞系。结果 DNA测序证实靶向Cbl-b基因的shRNA真核质粒表达载体构建正确,G418压力筛选出阳性克隆,Western blot检测发现MDA-MB-231/Cbl-b shRNA转染细胞株中Cbl-b蛋白表达水平明显下调。结论成功构建了基因沉默Cbl-b的MDA-MB-231细胞株,为进一步探讨其生物学功能奠定实验基础。     

胰岛素生长因子结合蛋白-2 siRNA表达载体的构建及鉴定

目的构建针对胰岛素生长因子结合蛋白-2(IGFBP-2)的小干扰RNA(siRNA)表达载体,研究载体介导的RNAi技术对人U251脑胶质瘤细胞株中IGFBP-2表达的抑制作用。方法根据GenBank提供的IGFBP-2基因(NM-000597)核苷酸序列及siRNA的设计原则,设计合成4对带有BamHⅠ、HindⅢ酶切位点的发夹结构寡核苷酸序列,筛选得到576⁵94 nt、908594 nt、908⁹26 nt、938926 nt、938⁹56 nt 3个19 bp片段靶序列,同时随机组合出一条无关序列,应用限制性内切酶酶切和测序技术鉴定重组克隆。用脂质体介导转染人U251胶质瘤细胞株,采用RT-PCR和Western印迹方法检测细胞IGFBP-2 mRNA和蛋白表达。结果酶切筛选得到4个目的片段的阳性克隆,测序证实重组表达载体中插入序列与设计一致。RT-PCR和Western印迹检测显示构建的siRNA表达载体可显著降低U251细胞中IGFBP-2 mRNA和蛋白表达水平。结论成功构建载体介导的IGFBP-2靶向RNA干扰重组体,并能有效抑制U251细胞中IGFBP-2基因的表达。     

靶向mcl-l基因的shRNA真核表达质粒的构建与筛选

目的: 构建靶向髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,mcl-1)的shRNA的真核表达质粒,并筛选出沉默mcl-1基因效果最明显的shRNA表达质粒.方法: 设计3对针对mcl-1基因不同位点的shRNA片段,构建携带此shRNAfi片段的真核表达质粒(shRNAl-3)并行酶切鉴定和测序分析.然后通过脂质体将重组质粒转染到肝癌细胞株HepG2中,48 h后测定转染率,并分别采用RT-PCR及Western blot检测mcl-1 mRNA和蛋白表达情况.结果: 重组质粒经酶切鉴定与测序证实构建成功.质粒在HepG2细胞中的转染率约为64%.shRNAl-3导入HepG2细胞48 h后.mcl-1,mRNA水平和蛋白水平均明显低于空白对照组和阴性对照组(0.61±0.02,0.56±0.02,0.46±0.01 vs 0.97±0.01,0.95±0.00;0.53±0.01.0.48±0.03,0_36±0.01vs0.90±0.03.0.88±0.01,均P<0.01).与shRNAl和shRNA2相比,shRNA3对mcl-1 mRNA和蛋白的抑制作用均最强(52.6%VS 36.3%,42.9%:63.2%vs41.5%,49.6%,均P<0.01).结论: 成功构建并筛选出的靶向mcl-1的shRNA真核表达质粒对肝癌细胞HepG2内的mcl-1表达具有明显抑制作用.     

大鼠CREB结合蛋白RNA干扰重组慢病毒载体的构建与鉴定

目的构建大鼠CREB结合蛋白(CREB binding protein,CBP)基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,并观察该载体对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)CBP表达的沉默效应。方法设计合成4条CBP基因的siRNA序列,将筛选确定的CBP RNAi有效靶序列与pFU-GW-iRNA载体连接产生CBP shRNA慢病毒表达载体,转化、PCR筛选阳性克隆及测序鉴定。脂质体2000将CBP shRNA慢病毒载体和慢病毒包装质粒共转染293T细胞,完成慢病毒颗粒包装及滴度测定。包装产生的重组慢病毒感染大鼠VSMCs,实时定量RT-PCR检测CBP mRNA的表达,并与未转染及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞进行比较。结果 PCR扩增和测序结果证实,成功构建大鼠CBP shRNA慢病毒载体。经包装产生的慢病毒滴度为2×10~9 TU/ml,与未转染慢病毒及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞比较,CBP shRNA慢病毒转染可使VSMCs的CBP mRNA分别下降88.5%和92.7%。结论成功构建CBP基因RNAi慢病毒表达载体,对VSMCs的CBP表达具有良好沉默作用,为后期基因治疗血管增殖性疾病奠定基础。     

人MEF2C基因shRNA慢病毒载体构建及其对Daoy细胞MEF2C mRNA表达的影响

目的构建人肌细胞增强因子2C(MEF2C)基因短发卡RNA(shRNA)慢病毒载体,观察其对髓母细胞瘤Daoy细胞MEF2C mRNA表达的影响。方法设计MEF2C基因特异性siRNA靶点,构建于慢病毒pGLV3/H1/GFP/Puro载体,筛选有效shRNA慢病毒载体,继而在293T细胞中包装成病毒颗粒,将其感染髓母细胞瘤Daoy细胞,Real-time PCR检测MEF2C mRNA。结果构建的MEF2C基因shRNA慢病毒载体测序正确,包装获得的shR-NA慢病毒颗粒感染Daoy细胞后其MEF2C mRNA表达量较阴性对照组下降了81.1%。结论成功构建了MEF2C基因shRNA慢病毒表达载体并包装成慢病毒颗粒,其能够有效抑制MEF2C mRNA的表达。