幽门螺杆菌基因特征与宿主临床结果相关性研究进展

幽门螺杆菌感染是全世界最常见的慢性感染，其致病机制涉及到菌体毒力因子、宿主及感染后引起的炎症与免疫反应等多方面因素。近年来，随着幽门螺杆菌全基因组测序的完成，幽门螺杆菌基斟多态性逐渐成为研究的热点。本文对幽门螺杆菌相关毒力基因cagA、vacA、各黏附基因、oipA、iceA及dupA基因结构多态性、编码蛋白功能的差异及其与宿主临床结果之间的相关性作一综述。     

贵阳地区幽门螺杆菌临床分离株中ureA、cagA、vacA、iceA基因的分布及分析

目的了解贵阳地区临床分离的幽门螺杆菌（Hp）的毒力基因ureA、cagA、vacA、iceA的分布特征,探讨不同毒力基因型与上消化道疾病的关系。方法用特异的16SrDNA聚合酶链反应进行临床分离Hp的菌种鉴定,对经过鉴定的152株幽门螺杆菌进行ureA、cagA、vacA、iceA基因及亚型的PCR检测。结果 ureA基因的检出率为100%（152/152）,vacA基因的检出率为100%（152/152）,vacA基因亚型以s1a-m2型为主,占76.3%（116/152）,cagA基因检出率为39.5%（60/152）,ieeA1基因检出率36.8%（56/152）,iceA2基因检出率为34.2%（52/152）,13.2%（20/152）的菌株iceA1和iceA2基因均阳性,不同基因型菌株在慢性胃炎和消化性溃疡中的检出率无统计学意义（P〉0.05）。结论贵阳地区幽门螺杆菌毒力基因vacA以s1a-m2型为主,cagA阴性比例高于cagA阳性,不同基因型菌株与消化性疾病间无明显相关性。     

西安地区幽门螺杆菌cagA, iceA基因与其所致疾病的相关性

目的: 研究幽门螺杆菌( H pylori) cagA、iceA基因及其不同组合对H pylori感染结局的影响, 探讨西安地区H pylori的优势致病基因型.方法: 用快速尿素酶试验(rapid urease test,RUT)筛选出H pylori阳性胃黏膜标本101例,细菌基因组DNA提取试剂盒提取DNA, 用聚合酶链反应(PCR)扩增尿素酶C( ureC)基因的方法筛选出H pylori阳性标本91例. 经PCR及琼脂糖凝胶电泳对cagA, iceA的基因亚型进行检测, 用χ2检验以及Fisher精确检验分析各基因及其不同组合与疾病的相关性.结果: cagA基因的阳性率为79.1%, iceA的总检出率为75.82%, 其中iceA1为50.5%, iceA2为38.5%, cagA+/ iceA1+的检出率高于其他组,单一基因及其不同组合在各疾病组中分布没有显著差异. iceA与cagA存在相关性. iceA2分别发现有229、334、439、549 bp以及229bp+334 bp的基因片段.结论: cagA+/ iceA1+是西安地区H pylori的优势致病基因型, cagA、iceA1、iceA2各单一基因以及其不同组合与感染的临床结局无关. iceA与cagA基因可能存在协同作用, 该地区iceA2基因有较大的变异性.     

幽门螺杆菌iceA1基因地域分布特征

iceA基因是近年来发现的一种幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)毒力相关基因.H.pylori与胃黏膜上皮接触后可引起iceA1基因表达上调,该基因与nlaIIIR基因(位于乳糖奈瑟氏菌)具有相似性,其编码的蛋白质产物具有NlaIIIR样限制性核酸内切酶活性.研究表明,iceA1阳性...     

幽门螺杆菌iceA基因型与胃黏膜病变的相关性

目的:研究幽门螺杆菌(H pylori)iccA基因型与胃黏膜病变的相关性.方法:用PCR方法检测552例慢性胃炎患者胃黏膜活检标本中H pylori的iceA基因在慢性炎症、活动性炎症、腺体萎缩和肠上皮化生中的存在情况.结果:在552例样本中,iceA1和iceA2亚型菌株单独检出率分别为67.2%,21.7%,iceA1和iceA2亚型均阳性的检出率7.6%,iceA1和iceA2亚型均阴性的比率3.4%.在H pylori感染的慢性炎症、活动性炎症、腺体萎缩、肠上皮化生的重度炎症iceA1的阳性率明显高于中度炎症.两者比较差异有统计学意义(83.1% vs 10.8%,85.5% vs 10.5%,75.6% vs13.0%,75.6% vs 13.0%,均,P<0.05).腺体萎缩和肠上皮化生iceA1的阳性率明显高于其他组(P<0.05).感染iceA1亚型菌株与未感染ieeA1亚型的胃黏膜病变程度差异有显著性(P<0.05).结论:iCeA1是河南地区的优势基因亚型,iceA1阳性率随炎症程度加重逐渐升高.iceA1亚型菌株与重度炎症特别是腺体萎缩和肠上皮化生关系密切.     

幽门螺杆菌dupA基因在胃十二指肠疾病中的研究进展

幽门螺杆菌感染是一个主要的全球公共卫生问题,在发展中国家更为普遍。最近的一项系统回顾显示,全球幽门螺杆菌感染率约为48.5%,约有44亿人为幽门螺杆菌阳性。幽门螺杆菌感染是慢性胃炎和消化性溃疡的主要病因,同时也是胃癌和胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤的危险因素,幽门螺杆菌具有遗传多样性,不同菌株引起的临床症状存在差异,其与宿主的遗传易感性和生存环境有关,主要与细菌毒力因子有关。目前关于幽门螺杆菌dupA基因的研究取得了一定的进展,本文就幽门螺杆菌dupA基因相关研究的最新进展作一综述。     

上海地区幽门螺杆菌菌株iceA、babA2基因型与临床的关系

目的检测上海地区幽门螺杆菌(Hp)感染患者中Hp菌株iceA、babA2的分布特征，探讨与Hp临床感染结局相关的菌株基因型。方法141株Hp菌株分离自43例慢性胃炎(CG)、47例十二指肠球部溃疡(DU)、30例胃溃疡(GU)和21例非贲门部胃癌患者的胃镜活检标本。采用PCR方法检测Hp菌株的iceA、babA2、cagA和vacA基因型。结果141株Hp菌株中，iceA1、iceA2和babA2的总检出率分别为74．5％(105／141)、15．6％(22／141)和63．8％(90／141)，其中2例(1．4％)为iceA1、iceA2均阳性，16例(11．3％)为iceA1、iceA2均阴性。DU组的babA2检出率显著高于GU组(74．5％比50．0％。P=0．028)，DU组的cagA^ ／babA2^ 检出率亦显著高于GU组(70．2％比46．7％，P=0．039)。其余疾病组之间的babA2检出率差异无显著性。未发现不同临床疾病与iceA基因型的相关性。结论上海地区Hp感染者的菌株基因型主要是iceA1^ ／babA2^ ，babA2在DU和GU的发病机制中起不同作用。未发现iceA亚型与Hp临床感染结局有相关性。     

幽门螺杆菌iceA基因亚型的表达与鉴定

目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)26695、J99菌株中粘膜接触诱导因子(induced by contactwith epithelium,iceA)等位基因的iceA1、iceA2基因片段,并将其转入大肠埃希菌中,用IPTG诱导表达目标蛋白,为Hp相关感染菌型诊断奠定基础。方法根据标准菌株Hp 26695、Hp J99的iceA不同基因亚型的开放阅读框设计引物,用PCR方法分别从Hp 26695、Hp J99菌株的基因组DNA中扩增iceA1、iceA2基因片段,分别插入表达载体pET28a和pGEX-4t-1,构建重组表达载体pET28a/iceA1和pGEX-4t-1/iceA2,经序列测定鉴定后,转化大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞,IPTG诱导重组质表达目标蛋白。表达蛋白经SDS-PAGE、飞行时间质谱鉴定。结果成功构建了重组表达载体pET28a/iceA1和pGEX-4t-1/iceA2,转入大肠埃希菌中,经IPTG诱导后,SDS-PAGE和飞行时间质谱鉴定证实,表达目标蛋白量分别占细菌总蛋白的16.1%和14.2%。结论成功构建了可高效表达IceA1和IceA2蛋白的重组表达载体,为进一步开展相关疾病的诊断研究奠定了基础。     

幽门螺杆菌iceA、cagA相关性研究

目的研究幽门螺杆菌(Helicobecterpylori)cagA、iceA与胃十二指肠疾病的关系及二者的相关性。方法从138例胃黏膜活检组织中分离培养H·pylori,PCR扩增检测cagA、iceA,并测序。结果cagA /iceA1 /iceA2 在消化性溃疡中的阳性率明显高于慢性胃炎和胃癌。cagA、iceA1同时阳性为55·4%(62/112),cagA阴性iceA1阳性为11·5%(3/26),存在统计学差异。cagA、iceA2同时阳性为51·8%(58/112),cagA阴性iceA2阳性为30·8%(8/26),存在统计学差异。结论cagA /iceA1 /iceA2 菌株可能与消化性溃疡的发生、发展相关,cagA和iceA1可能存在协同作用,和iceA2关系不大。     

幽门螺杆菌感染动物模型的实验研究

幽门螺杆菌感染动物模型的实验研究是目前研究热点之一。一个成功的幽门螺杆菌感染动物模型,有利于幽门螺杆菌疫苗的研制。本文对幽门螺杆菌感染模型所用细菌、动物以及动物模型的病理改变等方面的研究进展作一综述。     

宿主免疫基因多态性与幽门螺杆菌感染相关疾病的关系

幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染与消化性溃疡、萎缩性胃炎、胃MALT(Mucosa-associated lymphoid tissue)淋巴瘤及胃癌等疾病的发生密切相关。H.pylori感染引起的不同临床结局主要与H.pylori致病因子、宿主因素和环境因素三方面有关。目前宿主基因易感性的差异在H.pylori感染致病的作用已成为研究热点,本文就宿主免疫基因的多态性与幽门螺杆菌感染所致疾病关系的研究进行总结,从宿主TOLL样受体、NOD受体、CD14及HLA等免疫因子基因多态性进行综述。     

黔南州和贵阳市幽门螺杆菌临床菌株的耐药性、基因多样性及其与疾病的关系

目的 了解贵州省贵阳市和黔南州少数民族地区幽门螺杆菌的耐药性、基因多样性及其与临床疾病的关系。方法 通过内窥镜采集样本分离培养幽门螺杆菌,测定耐药性和基因型特征,比较不同地区、疾病类型的差异,分析幽门螺杆菌结构特点及黔南州幽门螺杆菌不同菌型混合感染情况。结果 两地区cagA可变区EPYIA分型构成比差异有统计学意义(P=0.012),vacA基因型构成比差异有统计学意义(P=0.000);MLST方法得到两地区幽门螺杆菌菌株94.6%(53/56)新的序列型。黔南州幽门螺杆菌不同菌型菌株混合感染率为44.4%,不同临床疾病的幽门螺杆菌不同菌型混合感染构成比差异无统计学意义(P=0.349)。结论 黔南州和贵阳市两地区幽门螺杆菌cagA可变区EPIYA分型和vacA基因型构成比存在差异。     

细胞毒素相关基因A(+)幽门螺杆菌根除对原发性高血压患者外周血循环内皮微粒及动脉弹性的影响

目的 探讨细胞毒素相关基因A(+)幽门螺杆菌根除对原发性高血压患者血管内皮功能及动脉弹性的影响.方法 选择细胞毒素相关基因A(+)幽门螺杆茵感染的原发性高血压患者62例为根除治疗组,同期就诊的62例无幽门螺杆菌感染的原发性高血压患者为对照组.在常规降压治疗基础上,根除治疗组给予根除幽门螺杆菌治疗1周,对照组给予安慰剂治疗1周,随访6个月.两组研究对象在研究前后均行血脂、外周血循环内皮微粒水平及动脉弹性检测.结果 与根除前比较,根除治疗组根除后血浆胆固醇、外周血循环内皮微粒水平明显降低,小动脉弹性指数(C2)明显升高,差异有显著性(P＜0.05).结论 对合并细胞毒素相关基因A(+)幽门螺杆茵感染的原发性高血压患者,根除幽门螺杆菌可能改善患者血管内皮功能及动脉弹性.     

幽门螺杆菌上皮接触诱导基因iceA1的克隆及序列特征

目的:克隆和分析镇江地区来源于不同疾病的(胃癌、溃疡和胃炎)幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)的表皮接触诱导基因iceA1.方法:从胃十二指肠疾病患者胃黏膜组织中分离培养获得H.pylori,PCR扩增检测iceA1基因,并克隆至pMD18-T载体上,进行测序和序列分析.结果:克隆和测序了镇江地区来源于不同疾病的(胃癌、溃疡和胃炎)共12株H.pylori的i c e A1基因片段,并与标准菌株60190比对,结果显示镇江地区的H.pylori的iceA1基因中存在着3处框内缺失突变热点(780del6、809del5、914del7),这些缺失突变在溃疡和胃炎中均存在,但是胃癌株只存在809del5.对缺失片段周围的序列进行分析,这些缺失序列的两端基本都与同向重复序列相连,这可能与复制过程中滑动错配的小片段缺失模型有关.结论:iceA1序列的变异性有可能作为分析H.pylori群体遗传学的有用工具.     

淮南地区幽门螺杆菌iceA1、babA2基因分布及其细胞免疫功能研究

目的研究淮南地区幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori,Hp)iceA1、babA2基因分布特征及其细胞免疫功能。方法对244例有消化道症状者行胃镜检查,并在胃窦部取活检粘膜作Hp的分离培养,利用聚合酶链反应技术(PCR)测定分离培养出的Hp菌株的iceA1、babA2基因,并采用生物素-链霉亲和素(biotin-sreptavidin,BSA)系统检测患者外周血T细胞亚型,ELISA法检测其细胞因子。结果244例中,检出Hp菌株185例,其中慢性胃炎、萎缩性胃炎、胃溃疡及十二指肠球部溃疡阳性率分别为70.65%(65/92)、74.14%(43/58)、85.25%(52/61)及75.76%(25/33);基因测定结果显示,185株分离株中,79.46%(147/185)含iceA1基因,75.14%(139/185)含babA2基因;其中慢性胃炎、萎缩性胃炎、胃溃疡及十二指肠球部溃疡iceA1、babA2基因检出率分别为66.15%(43/65)、56.92%(37/65);79.07%(34/43)、74.42%(32/43);90.38%(47/52)、88.46%(46/52);92.00%(23/25)、96.00%(24/25);差异均具显著性(P<0.01)。细胞免疫功能检测,iceA1 、babA2 患者的CD 3、CD 4、CD 4/CD 8、IL-2下降,IL-6、IL-8水平升高,差异有显著性(P<0.001)。结论淮南地区Hp感染多为iceA1 、babA2 菌株,iceA1 、babA2 Hp菌株为高毒力菌株,是致消化性溃疡的重要因素;iceA1 、BabA2 菌株可使患者细胞免疫功能下降,引起患者以Th1为主的浸润反应。     

基于GSEA和WGCNA分析幽门螺杆菌感染机制

背景幽门螺杆菌在世界范围内感染率高,参与胃溃疡、胃恶性肿瘤等多种疾病的发生发展,亟需对其感染及致癌机制进行研究。目的通过基因集富集分析(GSEA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)预测幽门螺杆菌感染的可能分子机制及枢纽基因。方法从基因表达综合数据库(GEO数据库)下载GSE27411数据集,通过GSEA分析与幽门螺杆菌感染相关的通路。利用WGCNA分析与幽门螺杆菌感染相关模块及枢纽基因,并对模块内的基因进行GO和KEGG富集分析。使用GEPIA对枢纽基因表达水平与胃癌的生存预后进行探索。结果通过GSEA分析挑选出10条hallmark通路和13条KEGG通路。通过构建WGCNA共表达网络,确定brown模块与幽门螺杆菌感染密切相关,该模块内的基因富集得到16个生物学过程及19条KEGG相关通路。GSEA和WGCNA交集得到4条KEGG通路。对模块基因筛选得到TNF、KIF2C、RRM2、CHEK1、PLK1、RAD51、CENPA、ASF1B共8个枢纽基因。利用GEPIA探索发现,KIF2C、RRM2、CHEK1、PLK1、RAD51、CENPA、ASF1B在胃癌组织中高表达,其中ASF1B与胃癌患者较差的总生存期及无疾病生存期相关。结论本研究通过GSEA和WGCNA分析方法,筛选出与幽门螺杆感染相关的4条核心KEGG通路,1个枢纽模块及8个枢纽基因。     

TGF-β1-509C/T基因多态性与胃癌幽门螺杆菌感染的相关性

目的研究TGF-β1基因-509位点C/T多态性,探讨其与胃癌易感性及幽门螺杆菌感染的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测80例胃癌患者与102例正常对照者TGF-β1基因-509位点C/T等位基因及基因型分布,并分析该基因多态性与胃癌幽门螺杆菌感染的相关性。结果胃癌组和正常对照组TGF-β1基因型频率无显著性差异;与正常对照组相比,胃癌组TGF-β1-509位点T等位基因频率显著增高(P=0.044,OR=1.550,95%C I=1.010~2.379)。胃癌患者TGF-β1基因型及等位基因频率与是否感染幽门螺杆菌无关。结论TGF-β1基因-509位点T等位基因可能是胃癌的遗传易感基因,而该位点基因多态性可能与是否感染幽门螺杆菌无关。     

C-myc、p16、p53基因与老年患者胃黏膜癌变幽门螺杆菌感染的关系研究

[目的]探讨老年患者幽门螺杆菌感染与胃黏膜癌变的相关性,并对可能存在的C-myc、p16、p53基因机制进行分析。[方法]对260例胃黏膜病变患者幽门螺杆菌感染状况进行检测,并对C-myc、p16、p53基因表达进行检测,比较不同胃黏膜病变患者检测结果。[结果]浅表性胃炎组除p16基因阳性表达率比胃癌组高外(P0.05),C-myc阳性率,p53阳性率,幽门螺杆菌感染率均低于胃癌组(P0.05);萎缩性胃炎组幽门螺杆菌感染率、C-myc阳性率,p53阳性率均低于胃癌组(P0.05);胃溃疡组患者p53表达阳性率低于胃癌组(P0.05);萎缩性胃炎组患者C-myc与p53基因表达阳性率与幽门螺杆菌感染率间关联具有统计学意义(P0.05),胃溃疡组患者C-myc与p16基因表达阳性率间关联具有统计学意义,胃癌组C-myc、p16、p53基因表达阳性率与幽门螺杆菌感染率间关联均具有统计学意义(P0.05)。[结论]老年胃癌患者幽门螺杆菌感染与C-myc、p16、p53基因表达存在一定的关联。     

儿童幽门螺杆菌iceA1、babA2基因分布及其细胞免疫功能研究

目的探讨儿童幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)iceA1、babA2基因分布特征及其细胞免疫功能。方法对152例有消化道症状患儿行胃镜检查,并在胃窦部取粘膜作Hp的分离培养,利用聚合酶链反应技术(PCR)测定分离培养出的Hp菌株的iceA1、babA2基因,并采用生物素-链霉亲和素(biotin-sreptavidin,BSA)系统检测患者外周血T细胞亚型,ELISA法检测其细胞因子。结果152例中,检出Hp菌株98例,其中iceA1阳性菌株65例,轻度胃炎、中至重度胃炎iceA1阳性率分别为43.59%(17/39)、79.25%(42/53),差异有统计学意义(P<0.01);babA2阳性菌株71例,轻度胃炎、中重度胃炎babA2阳性率分别为48.72%(19/39)、86.79%(46/53),差异有统计学意义(P<0.05);6例活动性胃炎均为iceA1、babA2阳性;iceA1 、babA2 患儿的CD3 、CD4 、CD4 /CD8 和IL-2下降,IL-6、IL-8水平升高(P均<0.001)。结论儿童Hp感染多为iceA1 、babA2 菌株。iceA1 、babA2 Hp菌株为高毒力菌株,易引起较严重的慢性胃炎,使患者细胞免疫功能下降,引起以Th1细胞为主的炎症浸润反应。