凉山彝族自治州HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素分析

目的 了解凉山彝族自治州（凉山州）HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素,为预防HIV-1耐药毒株的传播提供参考依据。方法 分别于2017年1月1日至6月30日、2018年1月1日至6月30日在凉山州开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,应用HyPhy 2.2.4和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1耐药毒株传播网络分析。结果 研究对象464例HIV/AIDS,HIV-1毒株为CRF07_BC亚型的占88.6%（411/464）,总的HIV-1耐药率为9.9%（46/464）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）和蛋白酶抑制剂（PI）耐药率分别为6.7%（31/464）、1.9%（9/464）和0.4%（2/464）;有1组HIV-1新型重组毒株URF_01BC亚型独立成簇并携带相关耐药突变位点;多因素logistic回归分析结果显示,与异性性传播人群相比,注射吸毒人群的HIV-1耐药风险较高（aOR=3.03,95% CI：1.40～6.54）。结论 凉山州HIV/AIDS抗病毒治疗前的HIV-1耐药率较高,且有新型重组毒株URF_01BC亚型携带相关耐药突变位点的成簇传播,建议加强HIV-1耐药毒株传播的预防工作。     

泸州市新报告HIV-1感染者基因亚型及分子传播特征研究

目的 分析四川省泸州市2021年新发现人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV）感染者传播情况,了解HIV-1传播网络的危险因素和特点,为本地区艾滋病疫情防控提供数据。方法 收集2021年363份泸州市新报告的HIV-1感染者血样及人口学信息。通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因序列,根据pol区基因序列进行病毒亚型和传播性耐药分析,基于最适基因距离（d=1.5%）构建分子网络,分析分子传播网络特征及其影响因素。结果 共获得有效序列346份,包括CRF07＿BC亚型113例（32.66%）,CRF01＿AE亚型107例（30.92%）,CRF08＿BC亚型99例（28.61%）,CRF105＿0108亚型18例（5.20%）,其他亚型9例（2.60%）。HIV-1传播性耐药率为15.03%(52/346),4份样本检出双重耐药。以1.5%作为基因阈值构建分子传播网络,共形成34个分子簇,簇内病例数分别在2～25例,入网病例148例,入网率为42.77%。不同年龄、文化程度、感染途径、基因亚型和户籍入网差异有统计学意义（P<0.05...     

浙江省湖州市新诊断HIV/AIDS的HIV-1亚型和分子传播特征研究

目的 了解浙江省湖州市HIV-1亚型和分子传播特征,为HIV疫情流行趋势和防治提供科学依据。方法 对408例2019年7月—2021年6月新诊断的HIV感染者/AIDS患者(以下简称HIV/AIDS)开展分子流行病学研究,先后采用反转录-聚合酶链反应和巢式聚合酶链反应扩增其pol区基因,再进行基因测序,通过MEGA6.0软件构建Neighbor-Joining系统进化树,得到初步亚型分析结果,利用Cytoscape3.6. 0软件对遗传距离≤0.01的序列构建HIV分子簇,通过CPR6.0在线软件工具分析耐药突变位点。结果 测序得到277份有效序列,发现14种亚型,流行重组型(CRF)CRF07＿BC占50.5%(140/277),CRF01＿AE亚型占28.5%(79/277)。基因遗传距离为1.0%时形成27个分子簇(簇内例数为2例～10例),其中CRF07＿BC亚型入网率为35.0%(49/140),高于CRF01＿AE亚型入网率为[20.3%(16/79)],差异无统计学意义(χ²=2.464,P=0.117);发现CRF07＿BC亚型3个较大分子簇C1、...     

浙江省男男性行为人群HIV-1新近感染者的毒株亚型和传播簇研究

目的 了解浙江省MSM中的HIV-1新近感染者的毒株亚型组成和传播特征.方法 233例2011年新报告的MSM感染者经BED捕获酶免试验(BED-CEIA)检测为新近感染,其中107例纳入分子流行病学研究,收集血浆样本提取RNA核酸,用反转录/巢式PCR扩增HIV病毒的pol基因片段,测序后进行生物信息学分析.结果 107例研究对象与当年MSM新近感染者在社会人口学特征上差异无统计学意义.序列获得率为94.4％(101/107),CRF01 AE占比最高(62.4％),其次是CRF07 BC(31.7％),另有3例B亚型,1例CRF55_01B和2例独特重组型.毒株在系统进化树上主要分为CRF01 AE的簇1、簇2和CRF07_BC的簇3,杭州地区的毒株散播于各个进化分支.共发现10个传播簇,80％涉及≥2个的地市,90％与现住址为杭州的病例有关; 共发现有3个样本各存在一个监测性耐药突变,分别为M46I、T215S和G190A,传播性耐药率为2.97％.结论 浙江省MSM的HIV亚型呈现复杂性趋势,但传播性耐药处于低度流行水平;HIV的跨地区传播较为普遍,杭州在地域上可能发挥着核心传播作用,全省已形成混杂交织的复杂网络.     

东莞市36例HIV-1感染者的原发性耐药及亚型分析

目的了解东莞市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)未治疗人群基因亚型和耐药毒株流行情况。方法收集50份即将进入HIV-1抗病毒治疗者的血样,从血样中提取病毒RNA,采用巢式PCR扩增HIV-1 pol基因序列并测序,用Genotyping以及斯坦福大学HIV Drug Resistance Database等工具对序列信息进行分析。结果 36份样本获得pol基因序列,基因分型以CRF01_AE和CRF_07BC重组毒株为主,各占36.11%(13/36),其次为B亚型和CRF55_01B,各占13.89%(5/36)。36例HIV-1抗体阳性患者的蛋白酶(PR)和逆转录酶(RT)序列,耐药率为13.89%,其中对核苷类逆转录酶抑制剂耐药率为11.11%,对蛋白酶抑制剂耐药率为2.78%;发现1例对所有蛋白酶抑制剂耐药,4例对所有核苷类逆转录酶抑制剂耐药。结论目前东莞市主要HIV-1流行亚型是CRF01_AE和CRF_07BC,HIV原发性耐药性发生处在国内较低水平,但出现了中度及以上的耐药毒株,增加了东莞市耐药毒株传播的风险。     

2014年四川省部分地区HIV/AIDS患者抗病毒治疗效果和耐药性影响因素分析

目的 了解成都、绵阳、达州、乐山和宜宾HIV/AIDS在治患者治疗效果和耐药性影响因素。方法 2014年对以上地区抗病毒治疗半年以上,年龄≥15岁的HIV/AIDS患者进行血浆HIV病毒载量(VL)及基因型耐药检测,采用统计学卡方检验及logistic回归分析治疗效果及病毒抑制失败患者耐药发生的影响因素,以及各亚型毒株间耐药突变规律。结果 4 087例符合调查标准,其中VL＜400拷贝/ml 3534例(86.47%),VL＞1 000拷贝/ml 510例(12.48%)。多因素logistic回归分析发现患者所在地区、年龄、传播途径及治疗时间对治疗效果的影响有统计学意义。VL＞1 000拷贝/ml患者样本中,389例(76.27%)核酸扩增阳性并获得基因序列,189例(48.59%)发生耐药突变,主要导致核苷类逆转录酶抑制剂和非核苷类逆转录酶抑制剂耐药,多因素logistic回归分析初始治疗方案、治疗前CD4水平及感染CRF_01AE亚型毒株对耐药发生率的影响有统计学意义。耐药突变序列中,部分位点耐药突变率在CRF_01AE和CRF_07BC两种亚型毒株间差异具有统计学意义。结论 四川省成都、绵阳、达州、乐山和宜宾地区HIV/AIDS患者中,地区、年龄、传播途径及治疗时间是治疗效果的影响因素;病毒抑制失败患者中,初始治疗方案、基线CD4水平及感染不同亚型毒株是耐药的因素影响;CRF_01AE和CRF_07BC亚型毒株比较,前者更易发生T69、M184、V75、Y181突变,而后者更易发生Q58、A71突变。     

蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者耐药及分子传播网络研究

目的 分析安徽省蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者基因亚型、治疗前耐药特征和HIV分子传播网络情况,为当地制定干预措施提供依据。方法 收集蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者样本90份,扩增pol基因并测序,借助Blast HIV sequence database对每条序列进行同源性分析,采用MEGA 7.0构建NJ系统进化树判定所有HIV感染者基因亚型。将所得序列上传至美国斯坦福大学HIV耐药数据库,分析基因型耐药情况。利用Cytoscape实现传播网络的可视化,分析新报告HIV感染者耐药传播特点和网络关联情况。结果 蚌埠市85例新报告HIV感染者基因亚型主要为CRF01＿AE(58.82%)和CRF07＿BC(23.53%),耐药率为10.59%(9/85),主要为非核苷类药物耐药(5/85,5.88%)。在0.5%基因距离阈值下的分子传播网络中,CRF01＿AE入网率为44%,存在1个较大的耐药传播簇,耐药位点为L33F;CRF07＿BC入网率为10%。分子传播网络中的HIV感染者主要为五河县50岁及以上男性,文化程度较低。结论 蚌埠市新报告HIV感染者耐药率...     

珠海市男男性行为人群HIV-1感染者基因突变分析

目的分析珠海市男男性行为(MSM)人群HIV-1流行亚型的分布与变化。方法收集珠海市2011年-2016年386例MSM人群HIV-1抗体阳性血清标本,提取病毒RNA,套式PCR对HIV-1 pol基因进行扩增、测序亚型序列分析。结果 CRF_07BC和CRF_01AE基因亚型占主要地位,分别为155例(占48.87%)和99例(占32.03%);其次是CRF55_01B亚型30例(占9.71%),同时也发现了B亚型11例(占3.56%)、CRF59_01B亚型10例(占3.24%)、CRF_08BC亚型3例(占0.97%)、CRF65_01B亚型3例(占0.97%)、CRF_01C亚型2例(占0.65%)。系统进化树显示CRF_07BC内部未见明显的分簇,CRF_01AE内部可分为两簇。结论珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF_01AE和CRF_07BC为主,其他多种基因型共同流行的现象,应加强该人群的干预和监测力度。     

杭州市2020—2021年男男性行为人群HIV-1感染者分子网络及治疗前耐药特征

目的了解杭州市男男性行为人群(men who have sex with men, MSM)HIV-1感染者的分子网络及治疗前耐药特征。方法收集杭州市2020—2021年新确证HIV-1感染且未经抗病毒治疗的MSM病例血样, 扩增HIV-1pol区基因并测序。使用MEGA6.0软件构建系统进化树判断亚型, 通过Cytoscape3.7.0软件绘制分子传播网络图。使用美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线分析耐药情况。结果共获得1 158条pol基因序列和9种HIV-1亚型, 以CRF07_BC(49.9%, 573/1 158)和CRF01_AE (36.7%, 425/1 158)为主。初始CD4+T淋巴细胞个数在不同亚型间的差异有统计学意义(χ2=37.02, P<0.001)。以1.0%基因距离阈值绘制HIV-1分子传播网络, 形成104个传播簇(簇内病例数2～72例), 入网率34.7%(402/1 158);发现一个包含72例患者的CRF07_BC活跃传播簇。治疗前耐药株流行率为7.5%(87/1 158);对蛋白...     

广西南宁市注射吸毒人群HIV-1感染者基因亚型及耐药分析

目的 分析广西南宁市注射吸毒人群中HIV-1分子基因亚型及耐药的特征。方法 2017—2019年在南宁市连续收集感染HIV-1的注射吸毒人群样本225份,通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因,基于最适基因距离构建分子传播网络,并分析入网率、耐药情况及其相关影响因素。结果 163份样本获得 HIV-1 pol区序列,检测到4种HIV-1基因型,其中以CRF08_BC（55.2%,90/163）和CRF01_AE（35.6%,58/163）为主。共有83条序列入网,入网率50.9%（83/163）,形成19个分子传播簇,其中有1个传播簇包含19个节点。163条序列进行耐药分析,共出现24例HIV-1耐药株,NRTIs、NNRTIs和PIs的耐药率分别为2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）、10.4%（17/163,95% CI:5.7%~15.2%）和2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）。83条未治疗序列中获得4条治疗前耐药株,其中1例出现PIs低度耐药,2例出现NNRTIs高度耐药,1例同时产生NRTIs和NNRTIs耐药突变。结论 南宁市IDU HIV-1感染者中病毒基因亚型呈现多样性,其中以 CRF08_BC占优势,并出现超级传播者。抗病毒治疗耐药情况较为严峻,以NNRTIs耐药为主,原发性耐药处于较低水平,一线抗病毒疗法仍有效,但要密切关注耐药监测,防止多重和交叉耐药毒株的流行。     

东莞市HIV-1主要毒株基因分型及其对耐药影响的研究

目的 了解东莞市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（HIV-1）感染者流行毒株基因亚型的分布特征及耐药情况。方法 收集2015年10月至2016年2月东莞市疾病预防控制中心未经抗病毒治疗的50例HIV感染者血浆,提取病毒RNA,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）法扩增pol基因序列并测序,应用BioEdit、Genotyping和MEGA等生物学软件对pol基因进行HIV-1基因亚型分析,并将获得的核酸序列提至美国斯坦福大学HIV耐药数据库（http：//hivdb.stanford.edu）进行耐药位点分析。结果 50例样本最终成功扩增得到35份样本的pol基因序列,在这35例研究对象中,88.6%（31/35）为男性,65.7%（23/35）为经性接触感染。35条pol基因序列中,CRF01_AE亚型占37.1%（13/35）,CRF07_BC亚型占37.1%（13/35）,B亚型占14.3%（5/35）,CRF55_01B亚型占11.4%（4/35）。在35条基因序列中检测到11条（占31.4%）含有耐药相关突变,以CRF01_AE和CRF55_01B重组亚型为主,原发性耐药率为11.4%（4/35）。结论 东莞市HIV-1感染者存在着多种基因亚型,以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,基因序列发生原发耐药性,应引起重视。     

云南省德宏州HIV-1新近感染者基因型耐药分析

目的 了解云南省德宏州HIV-1新近感染者中耐药的发生情况.方法 收集德宏州2006年7-12月期间所有的HIV-1阳性样品共1048份,使用BED捕获酶免疫试验进行新近感染检测,共检出新近感染样品101份;使用Bayer公司的TruGene方法进行基因型耐药检测,应用所有样品的序列构建系统进化树以确定样品的亚型.结果云南省德宏州HIV.1新近感染者巾的耐药发生率为6.25%(4/64),样品PR区中M36I/V、L63P和H69K等次要耐药突变出现的频率较高,分别占81.25%、70.31%和65.63%;HIV-1流行株以C/CRF07 BC/08_BC为主,占65.63%(42/64).结论德宏州HIV-1新近感染者中耐药的流行处于中等水平;有必要加强HIV-1的耐药监测.     

云南省德宏州2014年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 调查2014年云南省德宏州未经抗病毒治疗的HIV感染者的耐药株传播水平。方法 2014年1-8月在德宏州收集70份新报告的16~25岁HIV-1感染者的血浆样品,对符合耐药警戒线调查要求的58份样品进行HIV-1基因型耐药检测和耐药株传播水平分析。结果 50份样品完成了基因型及耐药鉴定,中国籍占34.0%,缅甸籍占66.0%。通过进化分析对pol区进行分型,主要的基因型包括CRF01_AE、C亚型、URFs、CRF62_BC、CRF08_BC、CRF07_BC、CRF64_BC、B亚型和CRF55_01B,分别占28.0%、20.0%、20.0%、10.0%、8.0%、4.0%、4.0%、4.0%和2.0%。在1个序列中检测到1个针对蛋白酶抑制剂类药物的耐药突变位点(M46I),按照耐药警戒线的统计方法估算耐药株流行率<5%。结论 德宏州16~25岁新报告的HIV-1感染人群中外籍比例较高,HIV新型重组开始传播,但HIV-1耐药性传播尚处于低度水平。     

河南省人免疫缺陷病毒1型流行现状研究

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传播来源和传播规律.方法 对2006-2007年在河南省采集的1287例HIV-1感染者抽取静脉血,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸的env基因和gag基因进行扩增,并测定和分析核苷酸序列.结果 1287份样本中存在B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型,其在所有分析样本中的比例分别为95.882%(1234/1287)、0.466%(6/1287)、2.875%(37/1287)、0.777%(10/1287).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(9.327±0.245)%、(5.214±0.183)%、(6.278±0.194)%、(5.332±0.1 58)%.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.     

2018年珠海市HIV-1基因型及耐药分析

目的 了解2018年广东省珠海市新确诊且未接受抗病毒治疗的HIV-1抗体阳性病例不同感染途径病毒亚型分布和耐药情况。 方法 收集研究对象血浆标本207份,提取病毒RNA,采用巢氏RT-PCR扩增HIV -1多聚酶pol区,测序定型和耐药分析。 结果 在男男性行为者中流行基因型为CRF07_BC(43.3%)、CRF01_AE(36.1%)和CRF55_01B(13.4%);在异性性感染人群优势基因型为CRF01_AE(52.5%)、CRF07_BC(31.1%)和CRF08_BC(6.6%);在3例注射吸毒感染人群检出CRF01_AE;有1例血源性感染病例检测基因型为H亚型;在MSM和异性性感染人群产生低度耐药,低度耐药率分别为4.1%和4.9%;在注射吸毒和血源性传播感染人群未检出耐药病例。 结论 在经性传播途径感染HIV-1多种基因型共同流行,以CRF01_AE和CRF07_BC基因型为主;在四类人群未检出低度以上耐药病例,总体传播性耐药呈低度流行。