实时荧光定量PCR检测人组织因子及其剪切体方法的构建

目的建立检测人组织因子(flTF)及其剪切体(asTF)的实时荧光定量PCR检测技术。方法分别采用文献报导及自行设计的检测人flTF和asTF的引物及TaqMan探针,经优化反应体系及反应条件后,用于检测人flTF和asTF基因。将扩增的人flTF和asTF的基因片段纯化后分别与pMD19-T载体连接,分别克隆构建含flTF和asTF基因片段的重组质粒,作为实时荧光定量PCR检测flTF和asTF基因表达的标准品。结果 PCR扩增产物分别经测序证实为flTF和asTF的特异性片段。本法检测flTF和asTF基因表达的灵敏度均为40拷贝/μl,线性范围均为4.00×101~4.00×107拷贝/μl,相关系数均为1.000;扩增效率分别为flTF 91.15%,asTF 90.53%,批间变异系数分别为flTF 3.04%~9.31%,asTF 3.01%~9.64%。结论成功建立了检测人flTF和asTF的实时荧光定量PCR方法,且该方法特异性好,灵敏度高。     

实时荧光定量PCR检测人apoM方法的构建

目的 建立检测人载脂蛋白M(apoM)的实时荧光定量PCR技术.方法 采用Primer Express Versions 2.0设计引物及TaqMan探针,检测apoM基因.将扩增的apoM基因片段纯化后与pMD19-T载体连接,克隆构建含apoM基因片段的重组质粒,作为定量检测apoM基因表达的标准品.结果 PCR扩增产物经测序分析证实为apoM特异性片段.本法灵敏度为40 copies/μl,线性范围为4.00×10~1～4.00×10~8copies/μl,相关系数为1.000,扩增效率E为90.5%,批间变异系数为6.38%～17.9%.结论 成功建立了检测人apoM的实时荧光定量PCR方法,且该方法特异性好,灵敏度高.     

实时荧光定量PCR检测MT2-MMP在肺癌中的表达及其临床相关性

目的建立实时荧光定量PCR检测肺癌组织中膜型基质金属蛋白酶2(MT2-MMP)基因表达的方法,并探讨MT2-MMP的临床相关性。方法肺癌组织及癌旁正常组织取自21例非小细胞肺癌手术患者。设计人MT2-MMP、内参照β-actin基因的引物及Taq Man探针,将MT2-MMP及β-actin基因扩增片段纯化后分别构建重组质粒,制备标准品。检测肺癌及癌旁正常组织中MT2-MMP及β-actin的基因表达水平,并分析其临床相关性。结果经测序验证,PCR扩增产物为MT2-MMP及β-actin基因的特异片段。MT2-MMP、β-actin基因表达灵敏度分别为600拷贝/ml、300拷贝/ml,线性范围分别为6×102~6×107拷贝/ml、3×102~3×107拷贝/ml,相关系数均为1.000,扩增效率分别为88.1%、86.2%,批间变异系数分别为0.40%~1.55%、0.59%~3.98%。MT2-MMP在肺癌组织中的基因表达水平显著高于癌旁正常组织(P<0.05),但与患者临床病理参数无相关性。结论成功构建了检测人MT2-MMP的实时荧光定量PCR方法,该法特异性好,灵敏度高;MT2-MMP可能参与肺癌的...     

双重荧光实时 PCR 法鉴定 SRBⅠ基因敲除小鼠

目的 建立一种双重荧光实时 PCR 鉴定 B 族Ⅰ型清道夫受体（SRBⅠ）基因敲除小鼠的方法。方法 提取小鼠尾尖 DNA, 应用自行设计的鉴定野生型和敲除型 SRBⅠ基因的引物和探针, 经 PCR 扩增后, 在 FAM 通道及CY5 通道判断小鼠基因型。同时应用基因测序技术对结果进行验证, 并构建质粒标准品分析该方法的灵敏度和重复性。结果 仅在 FAM 通道出现典型 S 型扩增曲线的为 SRBⅠ基因野生型小鼠, 仅在 CY5 通道出现典型 S 型扩增曲线的为 SRBⅠ基因敲除型小鼠, 在两个通道都出现典型 S 型扩增曲线的为 SRBⅠ基因杂合型小鼠。结果与 DNA测序法吻合, 检测野生型和突变型的灵敏度均达 4×101拷贝/μL。结论 新方法简单、 快速、 准确, 适用于分型SRBⅠ基因敲除小鼠。     

炭疽杆菌双重实时荧光PCR检测方法的建立

目的 建立同时检测炭疽杆菌capA基因、PA基因的双重实时定量荧光PCR方法,用于应对突发传染病疫情和流行病学调查、突发公共卫生事件应急处置的早期检测及防范生物恐怖威胁.方法 设计和合成分别针对炭疽杆菌capA基因、PA基因的引物对和荧光双标记探针,构建质粒标准品,通过优化探针、引物浓度、反应体系试剂组分等参数,建立可同时检测capA基因、PA基因的双重实时荧光PCR方法,测试方法的灵敏度和特异性,并在实战检测中应用.结果 双重实时荧光定量PCR的炭疽杆菌capA基因、PA基因检测的灵敏度分别可达到每反应5和50拷贝,并具有良好的特异性,在实战应用中亦经过考验.结论 双重实时荧光定量PCR技术具有可以同时筛查、经济、快速、特异性强等优点,在炭疽杆菌检测方面有良好应用价值.     

重组毕赤酵母中Textilinin-1基因拷贝数的荧光定量PCR法检测

 目的 利用荧光定量PCR法检测重组毕赤酵母外源纤溶酶抑制剂Textilinin-1基因的拷贝数。方法 采用双标准曲线法,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶（glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH）基因为内源参照基因,分别利用含有GAPDH和Textilinin-1基因的质粒,进行荧光定量PCR反应,建立标准曲线。对重组毕赤酵母基因组进行荧光定量PCR反应,通过标准曲线计算出外源Textilinin-1基因在毕赤酵母基因组中的拷贝数。结果 GAPDH和Textilinin-1基因的扩增效率分别95.04%和96.36%,两条标准曲线的决定系数均为0.999,且均具有良好的重复性,共检测10个单菌落,均得到Textilinin-1基因拷贝数为2。结论 建立的方法能够鉴定重组毕赤酵母中Textilinin-1基因的拷贝数。     

地鼠多瘤病毒PCR检测方法的建立

目的  建立地鼠多瘤病毒（hamster polyomavirus, HaPyV）PCR检测方法,并应用于乙型脑炎减毒活疫苗生产过程中地鼠肾细胞的感染检测。方法  设计针对HaPyV衣壳蛋白VP1基因片段的特异引物,以含HaPyV VP1片段的质粒PMD19T-HaPyV688为模板进行PCR扩增并测序确认扩增产物。以多种病毒DNA为模板进行PCR扩增并对扩增产物进行斑点杂交鉴定以验证PCR方法的特异性。将定量的质粒PMD19T-HaPyV688 10倍系列稀释后进行PCR敏感性检测。以小鼠多瘤病毒(murine polyomavirus, MuPyV)检验PCR法对质粒DNA和病毒DNA检测的一致性。应用建立的方法对生产用地鼠肾细胞悬液进行HaPyV DNA检测。结果  仅含有质粒PMD19T-HaPyV688和MuPyV DNA的样品能够扩增出600 bp的片段,经斑点杂交及测序证明其分别为HaPyV和MuPyV的VP1特异基因片段。PCR所能检出的PMD19T-HaPyV688和MuPyV 的最少DNA拷贝数分别为5300和590。7个亚批生产用地鼠肾细胞悬液的HaPyV检测结果均为阴性。结论  建立的PCR方法具有较高的敏感性和特异性,可用于生产用地鼠肾细胞HaPyV感染的检测。     

多重实时定量PCR检测G1—G4型轮状病毒方法探索

 目的  对多重实时定量PCR（real-time quantitative PCR，qPCR）进行反应体系筛选和方法探索，使其用于G1—G4型轮状病毒VP7基因的快速分型和定量分析。方法  设计G1—G4型轮状病毒VP7基因特异性引物和探针，以特异性体外转录RNA为模板，筛选多重qPCR反应体系，建立多重qPCR方法。采用单因素方差分析和配对样本t检验对多重与单重qPCR检测结果进行比较。结果  经筛选，得到6组三重qPCR反应体系和1组四重qPCR反应体系。所建立的三重和四重qPCR中，除四重qPCR的G1型参数〔标准曲线决定系数（R²）为0.982、扩增效率为89.221%〕略低于要求外，G2—G4型的标准曲线R²均＞0.99，扩增效率均在90%至110%之间；检测灵敏度达102拷贝/μl。多重与单重qPCR检测同一样本的相关性较好（R²＞0.95）。三重与单重qPCR（t值为1.420~25.786，P值均>0.05）、四重与单重qPCR（t值为2.505~4.851，P值均>0.05）检测结果间的差异均无统计学意义。结论   建立的多重qPCR可同时对3种以上目的基因进行分型和定量检测，为未来多价轮状病毒疫苗及混合病毒样本中毒株的快速分型和定量检测方法的建立提供了借鉴。     

炭疽杆菌双重可视化LAMP检测方法的建立

目的：建立同时检测炭疽杆菌 capA 基因、PA 基因的双重环介导等温扩增（ Loop?mediated isothermal amplification,LAMP）方法,用于防范生物恐怖威胁。方法设计和合成分别针对炭疽杆菌capA基因、PA基因的引物对,通过优化参数,建立可同时检测capA基因、PA基因的双重LAMP方法,测试敏感性和特异性,并应用于模拟样本和实战检测。结果双重LAMP的检测capA基因、PA基因的敏感性均可达到50模板拷贝每反应,并具有良好的特异性,在重大保障活动中得到检验。结论双重LAMP方法具有可以同时筛查、简单快速、灵敏度高等优点,在炭疽杆菌检测方面有良好应用前景。     

双重实时荧光定量PCR技术检测中药制剂中沙门氏菌和大肠埃希菌

目的: 建立双重实时荧光定量 PCR( multiplex quantitative real-time PCR,multiplex q PCR) 快速检测中药制剂中沙门氏菌和大肠埃希菌 2 种常见控制菌的方法。方法: 筛选两种目标菌株的特异性引物与探针,扩增沙门氏菌的 inv A 基因和大肠埃希菌的 uid A 基因,优化反应体系,建立双重荧光定量 PCR 方法。结果: 两对引物探针对沙门氏菌和大肠埃希菌均有较好地扩增效率,人工污染中药制剂中沙门氏菌的检出限为 10¹CFU·m L^{- 1},大肠埃希菌的检出限为 10¹CFU·m L^{- 1}。结论: 本研究建立的双重实时荧光定量 PCR 方法具有特异性强、重复性好,灵敏度高等特点、适用于中药制剂中沙门氏菌和大肠埃希菌的快速检测。     

外标准法实时定量反转录-聚合酶链反应方法的建立

目的为了检测BALB/C小鼠甲状腺促甲状腺激素受体(TSHR)表达,建立外标准法实时定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法。方法取正常BALB/C小鼠甲状腺提取甲状腺总RNA,逆转录后进行PCR,PCR产物经回收纯化后作为real-timePCR的标准品,制作标准曲线,优化反应条件使溶解曲线有特异扩增。检测豚鼠TSHR分子免疫的BALB/C小鼠甲状腺TSHRmRNA的表达。结果建立的外标准法SYBRGREENⅠ实时定量RT-PCR方法可以灵敏检测到10copies的核酸,灵敏度为普通PCR的104倍;溶解曲线只有特异峰;不同标准点批间变异系数范围为5.8%￣14.3%(n=6)。与对照组比较,TSHR大分子免疫的BALB/C小鼠甲状腺组织TSHRmRNA水平显著升高(P<0.05)。结论外标准法实时定量RT-PCR具有灵敏度高、特异性强、重复性好的特点,可精确地检测出小鼠甲状腺组织TSHRmRNA的水平。     

石莼、网地藻多糖含量与藻际微生物丰度关系研究

目的：研究石莼、网地藻藻际微生物丰度对多糖含量的影响。方法：通过实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术对石莼、网地藻所附着的藻际微生物丰度进行研究(细菌16S rDNA以及真菌18S rDNA丰度)。结果：石莼多糖含量、藻际微生物总DNA含量均显著高于网地藻(p <0.05)。石莼藻际微生物丰度(细菌1.04×1010-1.42×1010拷贝数/g干样,真菌1.01×107-1.38×107拷贝数/g干样) 显著高于网地藻(细菌2.05×108-6.9×108拷贝数/g干样、真菌2.59×105-4.79×105拷贝数/g干样)(p<0.01)。典型对应分析(CCA分析)表明石莼、网地藻多糖含量与藻际微生物(细菌、真菌)丰度显著相关。结论：石莼、网地藻藻际微生物丰度对多糖含量有一定影响。     

TaqMan荧光定量PCR检测细胞中逆转录病毒的方法验证

目的 验证Taqman荧光定量PCR检测生物制品生产用细胞中逆转录病毒的方法。方法 从专属性、检测限、线性、重现性、耐用性、准确性、精密度几个方面验证该方法在质量控制中的可行性。结果 该方法可检测2BS细胞、Vero细胞中的逆转录病毒，检测限可达1.0×10³ pU/μl逆转录酶。该法线性良好，决定系数＞0.960。该方法重现性好。试剂经5次冻融，体系在室温放置1 h均不影响实验结果。外加标准品的回收率均高于70%，相对标准偏差＜5%。结论 Taqman荧光定量PCR法可用于检测用于2BS细胞和Vero细胞是否被逆转录病毒污染。     

婴儿健脾散中川贝母荧光PCR检测方法的建立及应用

目的 探讨双重实时荧光PCR检测方法对婴儿健脾散中川贝母成分真伪鉴别的可行性。 方法 使用特异性Taqman引物和探针建立双重荧光PCR检测法，对川贝母及其常见伪品进行鉴别，并对其灵敏度、特异性和自制模拟婴儿健脾散处方进行评估。进一步使用该方法对市场流通的婴儿健脾散中的川贝母真伪进行检测。结果 建立的双重实时荧光PCR检测方法特异性高，灵敏度达0.0001ng/μL；对49批婴儿健脾散样品抽查检出6批不合格，其中2批未检出贝母属成分，4批检出贝母属成分但未检出川贝母成分。结论 本双重实时荧光PCR法可成功鉴定婴儿健脾散中川贝母的真伪，可为含川贝母成分复方制剂的川贝母真伪鉴别提供依据。     

重组痘苗病毒艾滋病疫苗细胞免疫评价方法的优化

目的  优化酶联免疫斑点试验（enzyme-linked immunospot assay,ELISPOT）方法,提高其在重组天坛株痘苗病毒艾滋病疫苗细胞免疫评价中的灵敏度。方法  将疫苗或对照痘苗病毒皮内免疫BALB/c小鼠,50 μl/只,6周后无菌采集小鼠脾脏。用ELISPOT对分泌IFN-γ的脾淋巴细胞〔斑点形成细胞（spot-forming cell,SFC）〕进行检测。比较不同脾淋巴细胞密度（2×10⁵、1×10⁶、2×10⁶个/孔）和不同刺激肽质量浓度（2、4 μg/ml）对SFC的影响。分别采用单因素方差分析和t检验进行多组间和两组间数据比较。结果  3个细胞密度组（F=0.023,P>0.05）和2个刺激肽浓度组（t=-1.762~-0.110,P值均>0.05）间的SFC数差异均无统计学意义。当细胞密度为2×10⁵个/孔、刺激肽质量浓度为4 μg/ml时,疫苗组的SFC数达到（107.00±42.01）个/106细胞,高于原实验条件（细胞密度为1×10⁶个/孔、刺激肽质量浓度为2 μg/ml）的SFC数〔（76.55±64.45）个/10⁶细胞〕,但两者间的差异无统计学意义（t=1.252,P>0.05）。前者的SFC阳性率达到100%,而后者仅为50%。结论  通过优化ELISPOT方法中的细胞密度和刺激肽浓度,进一步提升了该法在重组痘苗病毒艾滋病疫苗细胞免疫评价中的灵敏度。     

高效液相色谱法测定大鼠血浆中总槲皮素浓度及其药动学的应用

目的：建立高效液相色谱法测定大鼠血浆中总槲皮素的浓度,并应用于其药动学研究。方法：血浆样本在酸性条件下经酶水解后,经乙酸乙酯进行萃取,以乙腈-0.2%磷酸水溶液（30：70）为流动相,阿魏酸作内标,采用Inertsil ODS-SP（4.6 mm×150 mm,5 μm）色谱柱进行分离,检测波长366 nm,进样体积20 μL,流速1.0 mL·min^-1,柱温30℃。8只SD雄性大鼠单次灌胃槲皮素50 mg·kg^-1后采集血样,以高效液相色谱法测定槲皮素浓度,采用DAS3.0软件计算药动学参数并进行分析。结果：槲皮素在0.10~10.07 μg·mL^-1范围内线性关系良好,方法定量下限为0.10 μg·mL^-1,回收率为88.85%~101.66%,日内精密度为1.11%~2.79%,日间精密度为2.60%~3.64%。大鼠单次灌胃50 mg·kg^-1的槲皮素后的C_max=（1.97±0.41） μg·mL^-1,t_1/2=（6.10±2.84） h,t_max=（8.63±3.89）h,AUC_0-∞=（29.07±8.24） μg·h·mL^-1。结论：该方法专属性强、灵敏度高,能准确地定量大鼠血浆中槲皮素的总浓度,适用于槲皮素的药代动力学研究。     

流感疫苗病毒株在MDCK细胞中的培养条件

 目的   研究4价流感疫苗所用病毒株在MDCK细胞中的扩增条件。方法 在6孔细胞培养板中以不同感染复数（multiplicity of infection,MOI）（0.100 0、0.010 0、0.001 0、0.000 1）和对甲苯磺酰-L-苯丙氨酸氯甲基酮（TPCK）-胰蛋白酶（胰酶）浓度（0、2、4、8 μg/ml）进行病毒接种和扩增,感染后72 h收获细胞上清液,检测病毒血凝素效价,确定病毒最佳扩增条件。随后,在搅拌瓶中进行MDCK细胞微载体悬浮培养,研究不同起始细胞接种密度（1.5×10⁵、2.0×10⁵、3.0×10⁵ 个/ml）和微载体浓度（3、5、10 g/L）对MDCK细胞生长的影响,确定细胞最佳扩增条件。根据确定的最佳扩增条件,在搅拌瓶培养体系中扩增4种病毒。结果 6孔板中4种流感病毒的最佳接种条件分别是,A/Michigan/45/2015(H1N1) pdm09：MOI 0.010 0、TPCK-胰酶浓度2 μg/ml;A/Hongkong/4801/2014(H3N2)：MOI 0.010 0、TPCK-胰酶浓度4 μg/ml;B/Brisbane/60/2008：MOI 0.001 0、TPCK-胰酶浓度4 μg/ml;B/Phuket/3073/2013：MOI 0.010 0、TPCK-胰酶浓度4 μg/ml。在搅拌瓶中以3.0×10⁵ 个/ml初始细胞密度接种,3 g/L微载体浓度培养,MDCK细胞能够实现较好的扩增,最高密度可达2.1×10⁶ 个/ml;搅拌瓶悬浮培养,以最佳接种条件接种后,4种病毒的血凝素效价为：6.75~8.42log₂ 血凝素单位/50 μl。结论   通过摸索病毒接种最佳MOI、TPCK-胰酶浓度及优化MDCK细胞微载体悬浮培养条件,能够在MDCK细胞微载体悬浮培养体系中有效扩增4价流感疫苗用病毒株,为后期工艺放大研究奠定基础。