新型冠状病毒核酸混合样本检测的研究进展

新型冠状病毒(2019 novel coronavirus, 2019-nCoV)的流行给临床检验工作带来了许多挑战。混合样本检测成为提升检测效率的主要方法。本文回顾了混合样本检测应用于病原体检测的背景,分析其在新型冠状病毒肺炎筛查的应用,根据人群阳性率确定样本池计数,从而最大程度提升检测效率。     

医疗机构新型冠状病毒核酸检测工作手册(试行第二版)

为落实国务院应对新型冠状病毒感染肺炎疫情联防联控机制《关于做好新冠肺炎疫情常态化防控工作的指导意见》(国发明电[2020]14号)要求,进一步规范新型冠状病毒(以下简称新冠病毒)核酸检测的技术人员、标本单采、标本混采、标本管理、实验室检测、结果报告等工作,保证检测质量,提高检测效率,满足新冠病毒核酸检测需求,特制定本手...     

新型冠状病毒检测技术的研究进展

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)具有高传染性和高隐蔽性,并且不断发生变异,产生不同类型病毒变异株,其主要传播途径是呼吸道飞沫传播、接触传播、气溶胶传播。快速准确的病毒检测技术对疫情防控工作具有重要意义。本文就SARS-CoV-2的病原学结构特点和当前实验室主要检测技术(病毒分离鉴定、高通量测序、荧光定量PCR、反转录环介导恒温扩增、基因芯片、抗原抗体检测和基于CRISPR/Cas系统的核酸检测)作一综述。     

多部位样本核酸检测持续阳性的新型冠状病毒肺炎患者1例分析

目前新型冠状病毒肺炎（COVID-19）正在我国及世界其他国家流行,患者感染病毒后的临床症状不一,甚至呈现为无症状感染状态,这给整个疫情的防控提出了更高的要求。新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测作为COVID-19诊断的主要手段,在抗击疫情的过程中发挥着重要的作用,因此备受关注。本文报告一例无明显消化道症状,但粪便及肛拭子核酸检测持续阳性的COVID-19病例。患者为武汉某大学在校学生,在校期间即出现呼吸道症状,后放假回家,因病情加重而就诊入院,根据病情发展和诊疗需要,该患者进行了多次核酸检测,在症状明显好转,咽拭子核酸检测转阴后,其痰液、肛拭子及粪便样本的核酸检测仍持续阳性,由此,讨论多部位样本核酸检测对COVID-19诊疗的临床意义,并探讨疫情防控策略。     

污染环境样本新型冠状病毒核酸检测结果分析

新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）主要经呼吸道飞沫和密切接触传播,在相对封闭的环境中经气溶胶传播;接触被病毒污染的物品后也可造成感染。因此,落实“人、物、环境同防”已成为当前疫情防控的重点。SARS-CoV-2核酸检测是目前实验室诊断的主要方法,环境样本核酸检测成为疫情防控中不可或缺的手段之一。污染环境中不同物品表面SARS-CoV-2核酸检测结果存在差异。另外,研究发现环境“假污染”也不少见,给疫情防控带来诸多困扰。笔者根据疫情防控工作经验,结合文献资料分析,对核酸检测方法、污染环境样本阳性率、阳性位点分布、处置措施等方面进行了探讨。     

2019新型冠状病毒核酸检测体系性能验证

目的:评估2019新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测体系在质量上是否能满足临床需求.方法:对本实验室采用的新冠核酸采样管、提取试剂、两种扩增试剂及相应仪器在配套使用时的阴阳性符合率、批内精密度、批间精密度及最低检测限、交叉反应等项目进行性能验证.结果:本实验室的新冠核酸检测体系阴阳性符合率100％;ORF1ab...     

基于CRISPR/Cas系统的核酸即时检测技术现状及研究进展

在全球疫情背景下,现场条件下的核酸检测在疫情防控中发挥越来越重要的作用,这促使核酸即时检测（point-of-care testing,POCT）工具的开发面临空前的需求。基于规律间隔成簇短回文重复序列及其相关蛋白系统（clustered regularly interspaced short palindromic repeats-associated nuclease,CRISPR/Cas）应用于核酸POCT在近年来得到飞速发展并取得良好成果。在疫情封控区、海关以及灾区等特殊现场,可以将恒温放大技术与CRISPR有机结合并集成到小型手持设备中,这些技术使用起来更简单,非专业人员能够更快捷准确地进行感染源的核酸检测。这篇综述首先简要介绍了CRISPR/Cas系统和不同的效应蛋白,回顾了基于CRISPR/Cas系统特异识别和切割特性在核酸POCT中的不同应用策略,最后讨论CRISPR/Cas用于核酸POCT面临的挑战及未来的研究前景。     

基于纸基微流控的核酸分子快速检测技术研究进展

核酸分子具有丰富的遗传信息,对疾病诊断具有关键价值。传统核酸检测技术受限于耗时长、需大型仪器设备等局限,严重制约了其在大规模、突发性疾病检测中的应用。纸基微流控具有便携、自驱动等优势,在整合等温扩增技术后,为核酸分子快速、准确的检测提供可能。本文从纸基微流控的设计出发,综述纸基微流控在核酸分子检测中的研究进展,分析影响其检测灵敏度、稳定性等的干扰因素,为推动纸基微流控向临床转化提供重要参考。     

经9次核酸检测终确诊的新型冠状病毒肺炎患者1例分析

目前新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情在全球蔓延,形势严峻,并对全球公共卫生事业构成巨大挑战,快速准确的诊断COVID-19对疫情的防控有重要意义。本文报道1例COVID-19患者的调查和确诊过程,以对COVID-19确诊和疫情防控提供有价值的参考。患者为赴渝务工于2020年1月23日返乡人员,在渝期间,其同工地的一同事确诊为COVID-19,之后该工地接连有另外8位同事被确诊。患者返乡后2月2日被当地疫情防控单位采取医学隔离。患者于隔离后不久出现咳嗽,阵发性,干咳为主,偶可咳出黄色痰液等COVID-19相关临床症状,遂被当地新型冠状病毒肺炎定点医疗单位收治,后经市级新型冠状病毒肺炎诊治专家组远程视频会诊转入四川大学华西医院资阳医院。患者先后经历9次核酸检测,在前8次核酸检测均为阴性的情况下,于第9次核酸检测结果为阳性,2月21日最终确诊为新型冠状病毒肺炎。     

寨卡病毒基因序列分析及核酸检测方法

目的 分析寨卡病毒基因组序列特征,建立寨卡病毒的核酸检测方法.方法 构建81种虫媒传播黄病毒和寨卡病毒的系统进化树,比较寨卡病毒与登革病毒4型、日本脑炎病毒的核酸和氨基酸序列差异,分析亚洲型和非洲型寨卡病毒基因变异位点,尤其是中国的4株输入性寨卡病毒基因序列.通过比较亚洲型和非洲型寨卡病毒全基因组核酸序列,设计一组寨卡病毒实时荧光定量PCR检测的引物和探针,并检测其敏感性与特异性.结果 81种虫媒传播黄病毒中,寨卡病毒与Spondweni、Kedougou病毒同源性最近.全基因组核酸序列比较结果显示寨卡病毒与登革病毒4型的同源性比日本脑炎病毒更近,而氨基酸序列比较结果显示寨卡病毒与日本脑炎病毒的同源性更近.与传统亚洲型寨卡病毒比较,广东GD01株有5个氨基酸突变位点,广东GDZ16001株有3个,浙江ZJ03株有6个,赣县VE Ganxian株有33个.所设计的PCR引物和探针对质粒标准品检测呈阳性,检测下限为100拷贝/mL,对细胞培养的寨卡病毒RNA检测呈阳性,而对登革病毒1～4型和日本脑炎病毒检测呈阴性.结论 寨卡病毒与Spondweni病毒同源性最近,赣县VE Ganxian株的高变异显示寨卡病毒正在快速变异.本研究设计的PCR引物和探针可用于亚洲型和非洲型寨卡病毒株检测,具有较高的敏感性和特异性.     

上海市228例新型冠状病毒奥密克戎变异株感染患者核酸转阴的影响因素

目的 比较不同临床特征对新型冠状病毒（SARS-CoV-2）奥密克戎（Omicron）变异株感染后核酸检测转阴时间的影响,为新型冠状病毒肺炎的隔离治疗提供科学依据。方法 收集2022年4月27日—2022年6月8日上海市杨浦区五角场定点医院收治的228例上海市确诊SARS-CoV-2奥密克戎变异株感染的轻症患者流行病学和临床资料,以核酸转阴时间为结局变量,以核酸转阴时间（≤18 d）120例为A组和（>18 d）108例为B组。利用单因素及多因素logistic回归分析影响核酸转阴时间的因素。结果 228例患者的平均核酸转阴时间为（18.7±12.1）d,中位时间18 d。其中A组平均核酸转阴时间为（13.2±2.0）d,B组为（20.8±1.3）d。单因素分析发现,高血压、冠心病、糖尿病、低钾血症、恶性肿瘤疾病对核酸转阴时间的影响差异无统计学意义（P>0.05）;而合并有脑血管病、白细胞减少症、呼吸系统慢性疾病及疫苗接种对核酸转阴时间的影响差异有统计学意义（P<0.05）。进一步通过多因素Logistic回归分析发现,合并慢性呼吸系统疾病、未接种疫苗对核酸转阴时间延...     

The state of point-of-care testing: a european perspective

Point-of-care testing (POCT) refers to any diagnostic test administered outside the central laboratory at or near the location of the patient. By performing the sample collection and data analysis steps in the same location POCT cuts down on transport and processing delays, resulting in the rapid feedback of test results to medical decision-makers. Over the past decades the availability and use of POCT have steadily increased in Europe and throughout the international community. However, concerns about overall utility and the reliability of benefits to patient care have impeded the growth of POCT in some areas. While there is no agreed-upon standard for how success should be judged, the increases in speed and mobility provided by POCT can lead to substantial advantages over traditional laboratory testing. When properly utilized, POCT has been shown to yield measurable improvements in patient care, workflow efficiency, and even provide significant financial benefits. However, important organizational and quality assurance challenges must be addressed with the implementation of POCT in any health care environment. To ensure maximal benefits it may be necessary to evaluate critically and restructure existing clinical pathways to capitalize better on the rapid test turnaround times provided by POCT.     

核酸检测与抗体检测在艾滋病诊断中的价值

目的 探讨核酸检测、抗体检测在艾滋病诊断中的临床价值。方法 回顾性分析2017 年4 月～2019 年4 月我市收集的100 例艾滋病患者的完整临床资料,100 例患者均接受过抗体检测、核酸检测,对比分析核酸检测、抗体检测诊断早期、中晚期艾滋病感染者的诊断符合率及灵敏度。结果 经核酸、抗体检测,核酸检测早期艾滋病感染者的诊断符合率（93.33%）高于抗体检测（75.00%）;抗体检测诊断中晚期艾滋病感染者的诊断符合率（97.50%）高于核酸检测（75.00%）;核酸检测诊断早期艾滋病感染者的灵敏度（96.55%）高于抗体检测（80.36%）;抗体检测诊断中晚期艾滋病感染者的灵敏度（88.64%）高于核酸检测（71.43%）（P＜0.05）。结论 在艾滋病感染的早期诊断中,核酸检测早期艾滋病感染者的准确率、灵敏度均较高,而在艾滋病感染的中晚期诊断中,抗体检测的准确率、灵敏度则均较高。因此,核酸检测与抗体检测各有优势,临床医师应依据实际情况选择适宜的检测方式,如有必要,可尝试将二者结合应用,进一步提高临床检测艾滋病感染的诊断准确性和灵敏度,帮助医师尽早确诊艾滋病,早期予以患者相应的抗病毒治疗。     

两种不同释放剂核酸提取法的新型冠状病毒RT-PCR内标检测结果比较

目的 对新型冠状病毒核酸释放剂一步提取法进行优化,提高内标在荧光定量逆转录PCR中的检出效率,降低因内标未检出带来的复查率,提高核酸检测报告时效性.方法 对深圳市宝安中医院PCR实验室的新型冠状病毒核酸检测标本,采用本实验室优化方法用释放剂一步法提取核酸,与试剂盒说明书原方法进行比较,观察两种方法提取核酸后内标扩增曲线...