无锡地区H3N2流感病毒流行情况实验室分析

目的 了解无锡地区H3N2流感病毒血凝素基因变异情况和人群中HI抗体水平,分析H3N2流感病毒流行情况.方法 选取2007～2010年哨点医院的H3N2流感病毒进行基因序列比对;选择2008年9月～2009年5月健康体检人群及流感监测哨点医院就诊病例血清140份,2010年9月～2011年1月血清98份进行人群中HI抗体分析.结果 对无锡地区分离的42株H3N2流感病毒的HA基因进行分析,核苷酸序列同源性为98.1％～99.6％,病毒之间的核苷酸序列同源性差异较小.2008年9月～2009年5月人群中H3N2 H1抗体阳性率为86.40％、保护率为84.30％、GMT为1∶58.56,2010年9月～2011年1月人群中为100.00％、100.00％、1∶78.88,两者之间HI抗体阳性率、保护率和GMT差异有统计学意义(P均=0.000).结论 根据对无锡地区2007 ～2011年H3N2亚型流感病毒监测、基因进化分析和人群中抗体保护检测情况分析,推测近期H3N2流感病毒不会有较大流行.     

成都市2009年流感病毒H3N2亚型血凝素基因分析

[目的]了解某市流行的H3N2流感病毒分子生物学特征、进化情况,及其血凝素基因与猪流感病毒血凝素基因的关系。[方法]对该市分离的2009年H3N2亚型流感病毒40株血凝素基因进行逆转录-聚合酶链(RT-PCR)扩增,然后测序,分析该市流感病毒H3N2亚型的核酸序列和氨基酸序列,与2009年疫苗推荐株及四川省猪流感病毒基因序列比对分析。[结果]该市2009年流感病毒H3N2亚型的流行株,与2009年的疫苗株比较,碱基同源性为99.5%,抗原性有一定的差异,但不是重组变异病毒,其流行强度有限。与A/swine//Sichuan/1/2006(H3N2)比较,同源性为94.4%,说明人源流感病毒A/H3N2与猪源流感病毒A/H3N2具有一定的同源性,但抗原决定簇区和受体结合位点具有差异,在种间互相流行的可能性较低。[结论]该市流感A/H3N2流行株虽然有一定的变异,但没有大流行的预警提示出现。长期监测具有必要性。     

甲型流感病毒血凝素基因历史进化规律

目的探讨甲型流感病毒不同亚型血凝素（HA）基因的历史进化演变规律。方法从NCBI数据库中收集到140多个甲型不同亚型流感病毒株,涵盖人、猪、禽三个物种的不同历史时期及不同地区的病毒的HA基因序列。利用PHYLIP软件包对所选序列进行基因进化分析,构建NJ进化树;采用Clustal X软件对与2009年新型甲型H1N1流感病毒聚在同一进化分支的其他猪流感病毒的HA基因的氨基酸序列进行分析。结果人类三种主要亚型H1N1、H2N2和H3N2具有不同的时间分布特征,表现为1957年之前,主要流行株为H1N1亚型,1957-1968年为H2N2亚型,从1968年起主要流行株为H3N2亚型和H1N1亚型共同在人间传播;从20世纪80年代起流感病毒物种间隔离现象逐渐模糊,陆续出现了猪/禽/人病毒混合感染的病例,H5N1亚型流感病毒物种间隔离最弱;2009年新型甲型流感病毒与猪H1N1流感病毒聚在一支,提示2009年波及全球的新型甲型流感病毒为猪H1N1亚型病毒造成的;氨基酸序列分析显示：2009年新型甲型流感病毒HA基因中共有13个特有的氨基酸变异位点,提示这些位点可能参与了猪和人H1N1亚型病毒物种隔离屏障的限制,其功能尚需进一步确定。结论甲型流感病毒亚型间存在相互演化关系,不同物种间病毒混合感染的发生,病毒变异的机会增加。     

2005～2007年H1N1亚型流感病毒流行情况及对金刚烷类耐药性分析

[目的]了解河北省2005～2007年两个流行期H1N1亚型流感病毒流行情况及其对抗流感药物-M2受体阻滞剂的敏感性,为防治流感提供依据。[方法]采集流感监测哨点门诊流感样病例(ILI)咽拭子标本,MDCK细胞分离病毒,血凝抑制(HI)试验鉴定病毒。随机对两个流行期30份H1N1亚型流感病毒提取核酸,RT-PCR扩增耐药相关M2基因片断并测序,DNAStar6.0生物学软件分析耐药相关的氨基酸位点。收集2005～2007年度ILI监测数据,Excel软件处理数据。[结果]2005～2006年流行期分离流感病毒92株,H1N1亚型61.96%(57/92)。2006～2007年流行期分离到H1N1亚型23.86%(21/88),H3N2亚型75.00%(66/88)。两个流行期高峰分别在2005年12月和2007年1月。RT-PCR扩增耐药相关M2基因片段25份,23株成功测序,M2蛋白变异主要发生在跨膜区第31位氨基酸,丝氨酸被天冬酰胺置换,耐药率73.9%(17/23)。[结论]2005～2006年流感流行期以H1N1为优势株,2006～2007年流行期H1N1有流行,但以H3N2为主,两个流行期H1N1、H3N2和B型同时并存。H1N1亚型流感病毒对金刚烷类药物有一定的耐受性。     

2010-2012年贵州省H3N2亚型流感病毒HA1基因变异分析

目的了解2010-2012年贵州省H3N2亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血凝抑制试验分型鉴定,选取23株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取,逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因产物测序,测定的序列用相关的生物信息软件进行分析。结果贵州省2010年及2012年H3N2亚型流感病毒流行株与WHO疫苗推荐株A/Perth/16/2009(H3N2)亲缘关系较远,以至于H3亚型在我省成为优势株,引起广泛流行。结论 2010年及2012年H3N2亚型流感病毒流行株与WHO推荐的疫苗株之间的匹配性不完全一致。同时在2010-2012年间贵州省H3N2亚型流感病毒有持续的变异。     

深圳市南山区2005～2007年流感病毒分离结果分析

[目的]了解深圳市南山区近3年的流感病毒变异、变化及流行规律,做好流感预防控制工作.[方法]采用常规狗肾传代细胞(MDCK)法分离流感病毒并进行毒株鉴定.[结果]2005年共分离流感病毒64株,其中H1N1亚型9株、H3N2亚型44株、B型11株;2006年分离流感病毒48株,H1N1亚型18株、H3N2亚型2株、B型28株;2007年分离流感病毒69株,H1N1亚型2株、H3N2亚型57株、B型10株.3年的阳性分离率分别为13.3%、12.0%、22.6%.[结论]3年的流感病原学监测中,虽然未发现新的突变株,但流感病毒株的流行每年都发生型别的变化;2005年本地区以H3N2亚型流感病毒流行为主,2006年以H1N1亚型和B型(Victoria系)为主,2007年又以H3N2亚型流感病毒流行为主.     

青海省流感病毒病原学监测及H3亚型血凝素基因变异研究

目的 监测青海省2007～2008年度季节性流感病毒型与亚型分布,了解2007～2008年度部分A/H3N2分离株血凝素(HA)基因变异情况.方法 采集监测哨点医院流感样病例的鼻咽双拭子标本,接种MDCK细胞,采用标准抗血清鉴定阳性分离株型与亚型,并对2007～2008年度部分H3亚型流感病毒进行HA基因测序,分析HA基因变异情况.结果 2007～2008年度在哨点医院送检标本中共分离到144株流感病毒,其中124株为A/H3N2,B型20株,型与亚型有明显分布强弱特征.H3亚型HA序列分析,青海省6株分离株与2008、2009年部分省份分离株及江西同期分离株接近,与WHO 2008～2009年度疫苗推荐株相近.结论 WHO推荐的2006～2007年度疫苗株A/Hiroshima/52/2005滞后于在我省流行的流感病毒毒株.     

江西省2006～2008年流感监测哨点医院病原学监测结果分析

[目的]对2006～2008年江西省流感病原学监测结果进行分析,进一步了解流感病毒的流行趋势,探索流感流行的规律. [方法]根据全国流感监测方案,采集国家级监测哨点医院流感样病人的鼻咽拭子标本,用MDCK细胞分离流感病毒,用红细胞凝集抑制法(HI)鉴定病毒. [结果]2006-2008年共采集标本4589份,共分离出流感病毒558株,分离率12.16%,其中H1N1亚型158株,占阳性株的28.32%,H3N2亚型154株,占阳性株的27.60%,B(Victoria系)142株,占阳性株的25.45%,B(Yamagata系)104株,占阳性株的18.64%. [结论]2004-2007年江西省有H1N1亚型、H3N2亚型和B(Victoria系)、B型(Yamagata系)流感病毒流行,2006年B(Victoria系)为流行优势株,2007年H3N2亚型为流行优势株,2008年H1N1亚型为流行优势株.     

2010-2013年中山市流感病毒(H3N2)血凝素基因特征分析

目的研究中山市2010-2013年流行的H3N2亚型流感病毒的血凝素基因特征,分析其基因变异情况。方法选取2010-2013年中山市流行的H3N2亚型流感病毒6株,用MDCK细胞分离病毒,提取病毒RNA,RT-PCR扩增HA基因并测定序列,利用BLASTn对序列进行相似性检索,分析其与疫苗株,不同年份、区域流行株的进化变异情况。结果共分离鉴定到6株H3N2亚型流感病毒,其中2株为2010年流行株,2株为2012年流行株,2株为2013年流行株。各年流行株与其他国家或地区当年大部分流行株在一个分支上,其进化距离随着进化时间变长而变远。2012年流行株相对2010年流行株在HA1区发生12个氨基酸位点变异,有3个位于B、C区。2013年流行株相对2012年流行株发生4个氨基酸位点变异,有2个位于A区。2012年、2013年流行株相对于疫苗株分别发生6、8个氨基酸位点变异,分别有2、4个位于A、B、C区。受体结合位点未发生变异。结论中山市H3N2亚型流感病毒流行株在年度之间存在一定变异程度,进化距离随着进化时间变长而变远,相对于疫苗株也存在一定程度上的变异。     

2014 - 2015年度淮安市甲型H3N2流感病毒的流行及血凝素基因特征分析

目的 了解淮安地区甲型H3N2流感病毒的流行特征和基因型别。方法 收集2014年4月 - 2015年3月间2家哨点医院采集的流感样病例咽拭子,利用实时荧光RT - PCR方法进行流感病毒的快速检测,对流感病毒核酸阳性的样本进行流感病毒HA基因扩增、测序。利用Lasergene软件进行序列比对及核苷酸同源性分析,并分析血凝素主要的抗原位点,利用Mega6.0软件构建系统进化树,对该时间段内的H3N2病毒流行情况进行统计分析。结果 H3N2亚型流感病毒淮安株的核苷酸同源性为98.9 %～99.9 %,所收集的淮安株均为H3N2亚型的3C.3a系,在进化关系上与广西株A/Guangxi - Longan/1100/2015和淮安株A/Jiangsu - Qingpu/1660/2015关系较近,H3N2流行主要发生在秋冬季节。结论 与疫苗株相比,淮安地区H3N2病毒发生变异,提示疫苗株免疫效果下降。     

无锡地区2008—2009年流感监测情况分析

目的及时了解无锡地区流感流行情况,分析预测流感流行的趋势和特点,为流感预防提供科学依据。方法采集门诊流感样病人的鼻咽拭子和漱口液,接种于MDCK细胞进行病毒分离和型别（亚型）鉴定。结果 2008年1月—2009年4月无锡市CDC从827例流感样病例标本中分离到95株流感病毒,分离阳性率为11.49%,其中季节性流感A/H1N1型流感病毒31株（占32.63%）、A/H3N2型流感病毒43株（占45.26%）、B-victoria系流感病毒6株（占6.32%）、B-yam agata系15株（占15.79%）。结论 2008—2009年度无锡地区流感的流行情况较为平静,A/H1N1型、A/H3N2型、B-victoria系和B-yam agata系均出现,夏季的优势株可能成为冬春季的流行株。     

自贡市2009年流感哨点医院检测结果分析

[目的]了解自贡市流感病毒感染状况,为制定预防和控制流感措施提供依据。[方法]采集2009年6～12月自贡市流感哨点医院流感样病人的咽拭子标本,分别用实时荧光Real-time PCR与逆转录聚合酶连反应(RT-PCR)方法对甲型H1N1、季节性流感A(H1N1)亚型、季节性流感A(H3N2)亚型和乙型流感病毒的RNA进行检测。[结果]收到的327例流感样患者的咽拭子标本中,检出甲型H1N1流感119例,阳性率36.4%、季节性流感A(H1N1)亚型阳性16例,阳性率4.9%;季节性流感A(H3N2)亚型阳性4例,阳性率1.2%;未检出乙型流感病毒。甲型H1N1流行时间分布:9月开始流行,当月检出阳性率为38.9%,11月达到顶峰,10月、11月、12月甲型H1N1流感检出的阳性率分别为34.4%、64.5%、29.5%。[结论]自贡市2009年流感流行以甲型H1N1流感为主,流行在11月达到高峰,12月甲型H1N1流感疫情出现明显下降趋势,流感防控取得阶段性成果;季节性流感以A(H1N1)和A(H3N2)亚型为主,无乙型流感发生。     

上海市浦东地区2007年流感病原学特征分析

[目的]了解上海浦东地区流感病原学特征,为流感防治提供科学依据。[方法]选择浦东2个流感监测点医院,采集类流感病人呼吸道咽拭子,利用病原学、血清学结合流行病学资料进行分析。[结果]2007年采集类流感病人呼吸道咽拭子标本210份,分离到98株流感病毒,总检出率为46.7%。未分离到A(H1N1)亚型。分离到A(H3N2)亚型、B/Y亚型、B/V亚型62、32、4株,分别占总检出数的63.3%、32.6%、4.1%。呈现1—3月和7—9月2个活动高峰。[结论]2007年浦东地区流感病毒优势株亚型不断发生变化,从年初的A(H3N2)优势株亚型逐渐过渡为A(H3N2)亚型与乙型共存,到年末则优势株亚型全部为乙型流感(B/Y,B/V)。流感发病人群在各年龄段均有分布并且与性别无明显相关。     

无锡市2007年度流行性感冒监测结果

目的了解2007年无锡地区流感流行的特点,探讨流感优势株的变化,进一步加强监测工作,为做好流感预防控制工作提供科学依据。方法对采集的流感病例标本用MDCK细胞、0.75%的人“O”型红细胞作微量血凝试验（HA）,血凝抑制试验（HI）进行流感病毒培养、分离、鉴定。结果2007年度共做流感样病例标本650份,分离出流感病毒122株,平均分离率为18.77%。最高月份为42.11%,分离的病毒型别为甲1型3株,时空分布在冬春季;甲3型55株,冬春季和夏季各占1/2;B型Victoria系6株,分布在冬春季;B型Yamagata系58株,主要分布在夏季。结论甲（H3N2）亚型和B型Yamagata系为无锡市2007年流行优势株,需加强防范该毒株引起的暴发流行。     

上海某哨点医院2007—2009年流感监测分析

[目的]分析本院2007—2009年流感监测结果,探索流感流行特征及规律,为制定预防和控制策略提供依据。[方法]对2007—2009年国家流感监测哨点医院发热门诊流感样病例(ILI)发病动态以及流感病毒分离结果进行监测和分析。[结果]2007年ILI 1 656例,患病率为1.20%,2008年ILI 1 606例,患病率为1.12%,2009年ILI5 486例,患病率为3.10%,明显高于2007、2008年水平。流感病毒监测结果:2007年标本采集330份,阳性标本为45份,分离率为13.6%,优势株A(H3N2)占68.9%,2008年标本采集229份,阳性标本为30份,分离率为13.1%,优势株B型占60%,2009年标本采集713份,阳性标本为250份,分离率为35.1%,优势株甲型H1N1占70.8%,其次为A(H3N2)型,占20.4%。2009年8月标本的阳性率明显上升,优势株为季节性A型(H3N2)流感病毒(58.7%),出现新的亚型即甲型H1N1流感(34.7%)病毒,12月甲型H1N1流感病毒成为优势株(91.4%)。[结论]上海徐汇区哨点医院附近地区流感流行高峰期为夏季与冬季,2007年该地区的流行毒株以A(H3N2)亚型为主,2008年该地区的流行毒株以B型亚型为主,2009年8—10月该地区出现季节性流感A(H3N2)亚型与甲型H1N1流感共同流行,11—12月以甲型H1N1流感流行为主。     

2009～2010年山西省流行性感冒监测资料分析

[目的]掌握山西省流行性感冒(流感)的流行动态和病原学特征,为山西省流感防控提供科学依据。[方法]对2009年第20周至2010年第13周山西省流感监测哨点医院报告的流感样病例就诊比(ILI%)和流感样病例标本病原学检测资料进行。[结果]2009年第20周至2010年第13周,流感样病例就诊比(ILI%)为4.33%,高峰在第45周(13.89%);累计检测流感样病例标本5 656份,流感病毒核酸阳性的2 022份,阳性率为35.75%,其中甲型H1N1流感核酸阳性的占54.90%;季节性流感A(H3N2)亚型核酸阳性的占22.35%,季节性流感B型核酸阳性的占22.01%,季节性流感混合型核酸阳性的占0.49%,季节性流感A(H1N1)亚型核酸阳性的3份,占0.15%;季节性A型未分型2份,占0.10%。[结论]2009年第20周至2010年第13周山西省流感监测哨点医院报告的流感样病例就诊比与病原学监测结果基本一致。     

郴州市2009年流感病原学监测及A(H1N1)NA基因特征研究

[目的]了解2009年郴州市流感病毒流行株的病原学特征,为流感防控提供科学依据。[方法]采集哨点医院ILI咽拭子标本,用MDCK细胞进行病毒分离,采用HA和HI试验对流感病毒进行分型鉴定;采集暴发疫情ILI咽拭子用PCR法检测流感病毒核酸;随机抽取4、10月份的季节性A(H1N1)流感毒株进行NA基因测序,测序结果与国内各省市流行株及WHO推荐的北半球疫苗株作同源性比对,绘制种系进化树。[结果]分离哨点医院监测标本2284份,阳性254份:其中季节性A(H1N1)109株、A(H3N2)97株、甲型H1N130株、B型18株;PCR检测3024份标本,甲型H1N1核酸阳性1002份,阳性率33.13%;BLAST比对结果显示,4、10月份的季节性A(H1N1)毒株与2009年WHO推荐的北半球疫苗毒株A/Brisbane/59/2007的核酸同源性分别为99%和98%;种系进化分析结果表明4月份分离株与疫苗株亲缘关系最近,而10月份分离株较4月份分离株已明显发生变异。[结论]2009年郴州市甲型流感病毒异常活跃,其中1～6月季节性A(H1N1)为优势毒株,7～9月A(H3N2)为优势毒株,10～12月甲型H1N1为优势毒株,且出现甲型H1N1流感大流行。季节性A(H1N1)病毒在流行过程中NA基因已经发生了一定的变异,有必要持续跟踪和监测其变异情况。     

2005～2009年内蒙古地区流行性感冒病原监测结果分析

[目的]分析内蒙古地区流感病毒的变化情况,为制定防控措施提供科学依据。[方法]对2005年10月至2009年3月呼和浩特市和包头市6个哨点医院暴发疫情时采集流感样病例咽拭子标本进行流感病毒分离鉴定。[结果]2005-2009年合计采集流感样病例样本2 997份,分离流感病毒354株,阳性检出率为11.81%。分离的流感病毒毒株中,季节性A（H1N1）亚型207株,占58.47%;乙型147株（99株为Victoria系,48株为Yamagata系）,占41.53%。其中,2005-2006年度季节性A（H1N1）亚型与B型同时存在,2006-2007年度、2008-2009年度都以季节性A（H1N1）为主要流行株,2007-2008年监测期间以B型为主要流行毒株。[结论]内蒙古地区2005-2009年流感主要流行毒株是季节性A（H1N1）亚型和乙型。