西安地区幽门螺杆菌vacA基因型与致病性研究

目的:探讨幽门螺杆菌菌株vacA基因型与上消化道疾病的关系。方法:从胃十二指肠疾病患者的胃粘膜活检组织中分离培养到幽门螺杆菌88株。按标准酚-氯仿抽提法提HP基因组DNA。用PCR扩增反应及鉴定,用卡方检验分析vacA在不同胃十二指肠疾病中幽门螺杆菌的差异。结果:88株幽门螺杆菌中vacA s1/m-的阳性率为17.0%,vacA s1/m2的阳性率为55.7%,vacA s1/m1a+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m1a的阳性率为2.3%,vacA s1/m1a+m1b的阳性率为1.1%,vacA s1/m1b+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m1b的阳性率为17.0%,vacA s2/m2的阳性率为2.3%。结论:西安地区幽门螺杆菌菌株的vacA基因型以s1/m2为主,但vacA各基因亚型均与临床结局无相关性。     

PCR方法测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因

目的建立幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因的PCR测定方法.方法应用多聚酶链反应方法对62例慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定.结果62株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因,所有菌株的vacA基因型均为sla/m2型.cagA基因的总阳性率为56.45%;慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为55.56%、54.17%和63.64%(P＞0.05).结论本研究建立的PCR测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因方法敏感性高、特异性强.     

Lack of correlation of vacA genotype, cagA gene of Helicobacter pylori and their expression products with various gastroduodenal diseases

目的　研究幽门螺杆菌vacA基因型、cagA基因 ,空泡形成细胞毒素和血清CagA抗体与胃十二指肠疾病的关系。　方法　应用多聚酶链反应方法对 6 2例慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定 ;应用Hela细胞方法测定体外空泡形成细胞毒素活性 ;应用酶免疫测定方法检测同一患者的血清CagA抗体。结果　 6 2株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因 ,所有菌株的vacA基因型均为sla/m2型。cagA基因的总阳性率为5 6 4 5 % ;慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为 5 5 5 6 %、5 4 17%和6 3 6 4 % (P >0 0 5 )。空泡形成细胞毒素的阳性率为 37 10 % ,慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株表达空泡形成细胞毒素的阳性率分别为 33 33%、2 9 17%和 6 3 6 4 % (P >0 0 5 )。慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者血清CagA抗体分别为 70 37%、79 17%和 4 0 0 0 % (P >0 0 5 ) ,血清CagA抗体的总阳性率为 6 8 85 %。结论　幽门螺杆菌vacA基因型、cagA基因、空泡形成细胞毒素和血清CagA抗体不能预示H pylori感染个体将更可能发生何种类型胃十二指肠疾病。     

镇江地区胃肠病患者幽门螺杆菌vacA基因i、d区分型特点及临床关联

目的：研究镇江地区胃肠病患者感染的幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H.pylori)的主要毒力因子vacA基因i、d型的分布特点、cagA基因状态,以及与临床结果的相关性。方法：选取快速尿素酶试验和(或)组织学染色H.pylori阳性患者的胃窦活检黏膜,PCR法检测H.pylori cagA基因状态、vacA基因的s、m、i、d区分型。结果: 179例H.pylori患者,2例为混合感染(1.1%,2/179),剔除后,i1、i2亚型分别为96.6%(171/177)、1.1%(2/177);d1、d2亚型分别为98.9%(175/177)、1.1%(2/177);cagA阳性率为97.7%(173/177);s1/m2/i1/d1型为优势基因型(56.5%,100/177),s1/m1/i1/d1型次之(38.4%, 68/177)。s2/m2型与i2、d2型相关(P＜0.05),s1、i1、s1/i1型及cagA阳性均与d1型相关(P均＜0.05)。比较vacA基因的s、m、i、d分型及cagA基因状态在慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌中的分布,差异无统计学意义(P 均＞0.05)。结论: 镇江胃肠病患者感染的H.pylori菌株,96.6%表现为i1亚型、98.9%为d1亚型,vacA s1/m2/i1/d1/cagA(+)为优势基因型;幽门螺杆菌基因型之间存在关联;vacA基因型、cagA基因状态与胃肠疾病的分布无相关性。     

PCR方法测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA 基因

目的：建立幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因的PCR测定方法，方法：应用多聚酶链反应方法对62例慢性胃炎，消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定，结果：62株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因，所有菌株的 vacA基因型均为sla/m2型，cagA基因的总阳性率为56．45％，慢性胃炎，消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为55．56％，54．17％和63．64％（P＞0．05），结论：本研究建立的PCR测定幽门螺杆菌vac A基因型和cagA基因方法敏感性高，特异性强。     

幽门螺杆菌vacA及cagA基因型与胃疾病的关系

目的探讨幽门螺杆菌(Hp)vacA、cagA基因型与胃疾病的关系。方法选取105例胃疾病病人,包括慢性浅表性胃炎(CSG)45例,慢性萎缩性胃炎(CAG)48例,胃癌(GC)12例。于胃窦处取3块胃黏膜,分别进行快速尿素酶反应、病理检查和聚合酶链反应(PCR)。提取胃黏膜基因组DNA,用6对引物检测Hp vacA、cagA基因的表达。结果快速尿素酶反应、病理检查均阳性的标本57例,Hp的阳性率为54.2%(57/105)。Hp vacA s1/m2、s1/m1、s2/m1、s2/m2的阳性率分别为53%(30/57)、18%(10/57)、8%(5/57)、21%(12/57);Hp cagA的阳性率为89%(51/57)。vacA、cagA基因型在CSG、CAG和GC之间差异无显著性(P>0.05)。结论Hp菌株的优势基因亚型为Hp cagA、vacA s1/m2;Hp vacA、cagA基因与特定胃疾病间无显著相关性,不能预示Hp感染的临床结果。     

浙江省幽门螺杆菌cagA、vacA基因型的流行病学研究

目的 调查浙江地区幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)基因型的分布及其与临床疾病的关系.方法 采用特异引物聚合酶链反应(PCR)分析262株幽门螺杆菌的vacA基因多态性分布特点,并对其进行初步统计分析.结果 浙江8个地区分离培养的Hp菌株262株,VacA m1b基因型占27.10%(71/262);VacA m2基因型占64.89%(170/262);VacA m1b-m2基因型占4.20%(11/262);不同地区间VacA s区基因型和VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P＞0.05).慢性胃炎分离株中VacA m1b基因型占26.47%(27/102);VacA m2基因型占66.67%(68/102);VacA m1bm2基因型占2.94%(3/102).消化性溃疡分离株中VacA m1b基因型占29.41%(40/136);VacA m2基因型占61.76%(84/136);VacA m1bm2基因型占3.68%(5/136).胃癌分离株中VacA m1b基因型占16.67%(4/24);VacA m2基因型占75.00%(18/24);VacA m1bm2基因型占4.17%(1/24).不同临床疾病间VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P＞0.05).结论 浙江8个地区Hp菌株的优势基因型为cagA 、vacAs1/m2,vacA的s区和m区的分布与分布个体的临床类型无关.     

海南汉族居民胃十二指肠疾病与幽门螺杆菌cagA,vacA和babA2基因型的关系

目的 调查海南汉族慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H.pylori) babA2、cagA、vacA基因型和亚型的分布,探讨H.pylori基因型差异与临床感染结局的关系。方法 自176例胃十二指肠疾病患者的胃镜活检胃黏膜标本中分离幽门螺杆菌菌株,提取幽门螺杆菌DNA,用聚合酶链反应检测H.pylori的cagA、vacA（vacAs1/ vacAs2/ vacAm1/ vacAm2）及babA2基因型。 结果 176例患者中H.pylori cagA的阳性率72.72%（128/176）;babA2 54.55%（96/176）;vacAs1 73.30%（129/176）;vacAm2 67.05%（118/176）;vacAs1/cagA 65.34%（115/176）;vacAs1/babA2 51.70%（91/176）;cagA/babA2 50.00% (88/176);vacAs1/cagA/babA2 51.14% (90/176)。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者中vacAs1、cagA、cagA/ vacAs1基因型阳性率明显高于慢性浅表性胃炎患者(P<0.05)。其他基因型在各疾病间分布的差异无统计学显著性意义(P>0.05)。结论 海南汉族H. pylori感染的优势基因型为cagA, vacAsl, vacAm2, cagA/vacAs1。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中vacAs1、cagA 、cagA/vacAs1基因型更多见。未发现babA2基因型与H.pylori临床感染结局的相关性。 【关键词】 幽门螺杆菌 cagA基因 vacA基因 babA2基因 聚合酶链反应     

河南地区消化性溃疡人群中幽门螺杆菌babA2检测

目的:检测河南地区消化性溃疡人群中幽门螺杆菌babA2的表达情况.方法:分别从河南地区67例消化性溃疡患者和41例非溃疡性消化不良患者体内分离幽门螺杆菌,通过聚合酶链式反应检测cagA、iceA、vacA和babA2在患者体内的表达情况,并分析babA2与幽门螺杆菌中cagA、iceA和vacA的相关性.结果:从消化性溃疡患者体内分离到的67株幽门螺杆菌中,babA2阳性27株(40.3%);从非溃疡性消化不良患者体内分离到的41株幽门螺杆菌中,15株(36.6%)babA2阳性,2者比较差异无统计学意义(P=0.701).babA2与幽门螺杆菌中cagA、iceA和vacA的出现无关.结论:河南地区人群中幽门螺杆菌babA2并不是一个实用的可预测消化性溃疡的毒力标志物.     

幽门螺杆菌vaeA cagA基因亚型与抗生素耐药的关系

[仇军文,胡家露,吴开春,彭道荣,施炳龙,季万胜,樊代明.世界华人消化杂志,2001;9(7):739-742] 目的研究幽门螺杆菌(H.pylori)cagA vacA基因亚型及其与抗生素耐药的关系.方法用琼脂稀释法测定50例H.pylori 临床分离株对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑的最低抑菌浓度(MIC),并计算MIC50和MIC90值.用多重PCR鉴定H.pylori菌株的vacA(sla,slb,s2,ml,m2)及cagA的型别.结果克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑对H.pylori的MIC52和MIC90分别为:＜0.01 6 mg@L-1,0.016 mg@L1;0.016 mg@L-1,0.047 mg@L-1;16.000 mg@L-1,52.000 mg@L :25.140 mg@L -1 ,76.800 mg@L-1.H.pylori菌株对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑的耐药率分别为0%,0%,20%和38%.在对替硝唑敏感的H.pylori菌株中,vacA sla,slb和s2型分别占50.0%,42.5%和7.5%;vacA ml和m2型占60.0%和40.0%;vacA sla/ml,slb/ml,sla/m2,slb/m2和s2/m2型分别占32.5%,27.5%,17.5%,15.0%和12.5%;cagA-和cagA型为87.5%和12.5%.在对替硝唑敏感的H.pylori菌株中,vacA sla,slb和s2型分别占50.0%,40.0%和10.0:vaccAml和m2型占40.0%和60.0%;vacA sla/ml,slb/ml,sla/m2,slb/m2和s2/m2型分别占20.0%.,20.0%,30.0%.20.0%和10.0%;cagA+和cagA-型为80.0%和20.0%.结论 H.pylori菌株对甲硝唑的耐药率明显高于H.pylori 对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑的耐药率,不同cagA vacA基因亚型的H.pylori菌株对替硝唑的耐药率无显著差异. (潘伯荣)     

幽门螺杆菌及其vacA基因亚型和cagA基因与胃上皮HLA-DR抗原表达的关系

【目的】探讨幽门螺杆菌及其空泡毒素基因 (vacA)亚型、细胞毒素相关基因 (cagA)与胃上皮HLA DR抗原表达间的关系。【方法】①自 39例幽门螺杆菌阳性患者中分离培养出 39株幽门螺杆菌菌株 ,采用PCR方法鉴定 39株菌株的ca gA及vacA亚型 ;②采用HLA DR小鼠抗人单克隆抗体 ,对上述已行cagA及vacA亚型鉴定的幽门螺杆菌阳性患者及 2 2例阴性患者的胃窦活检标本行免疫组化染色。【结果】①幽门螺杆菌阳性患者胃上皮HLA DR表达较阴性患者更显著 ;②幽门螺杆菌定植密度与胃上皮HLA DR抗原表达程度间存在正相关 ;③感染cagA 菌株患者较感染cagA-株者胃上皮HLA DR抗原表达更明显 ;④本研究中vacAs1a/m2亚型占 90 % ,故未对不同vacA亚型与胃上皮HLA DR表达间的关系进行统计分析。【结论】①幽门螺杆菌感染可诱导胃上皮HLA DR抗原异常表达 ;②cagA 菌株可能通过胃上皮HLA Ⅱ类分子介导而与宿主发生更为密切的相互作用 ,从而较cagA-菌株引起更为显著的胃上皮损伤。     

对中国4个不同地区幽门螺杆菌菌株的多位点序列分析研究

目的 了解国内4个不同地区(北京、上海、重庆和广州)收集的幽门螺杆菌(H.pylori)临床株的遗传背景和可能的来源.方法 从胃肠疾病患者黏膜标本中分离培养幽门螺杆菌,应用多位点序列分析(multilocus sequence typing, MLST)对鉴定阳性的菌株进行ST分型比较,并且以PCR方法测定vacA基因型.结果 30株临床分离的幽门螺杆菌菌株,vacAs1a阳性25株(83.3 %),vacA s1b阳性5株(16.7 %),vacA m2阳性为30株(100 %),未发现s2型菌株,其中标准株NCTC11637为vacAs1a/ m1型.共确定了28种ST型.结论 MLST作为幽门螺杆菌分型方法,分辨率高,结果准确,易于标准化.通过信息学分析可以将MLST分型、vacA基因型和遗传背景、临床来源结合起来,适于进行分子进化学研究.     

中国幽门螺杆菌vacA基因型标签序列与VacA活性关系的分子系统发育分析

目的探讨中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列分子系统发育关系及其对VacA活性的影响。方法从GenBank数据库中下载所有中国幽门螺杆菌VacA全长氨基酸序列,利用ClustalX 2.0和MEGA 5.05软件对vacA基因s、m和i区氨基酸序列及VacA全长氨基酸序列进行生物信息学分析,构建分子系统发育树。结果中国幽门螺杆菌无毒弱毒株vacA基因型全为s1/m2/i1型,而强毒株除Ch2菌株为m1-m2杂合型之外,全为s1/m1/i1型,s1型和i1型强相关。分子系统发育分析显示,中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列都呈现明显的地理特异性,其中m区分子系统发育树能够将VacA强毒株和无毒弱毒株分开,而s和i区分子系统发育树则不能将两者完全分开。结论 vacA基因m区氨基酸序列更适合作为中国幽门螺杆菌VacA的毒力标志。     

幽门螺杆菌及其vacA基因亚型和cagA基因与胃上皮HLA—DR抗原表达的关系

[目的]探讨幽门螺杆菌及其空泡毒素基因（vacA)亚型，细胞毒素相关基因（cagA)与胃上皮HLA-DR抗原表达间的关系。[方法]（1）自39例幽门螺杆菌阳性患中分离培养出39株幽门螺杆菌菌株，采用PCR方法鉴定39株菌株的ca-gA及vacA亚型；（2）采用HLA-DR小鼠抗人单克隆抗体，对上述已行cagA及vacA亚型鉴定的幽门螺杆菌阳性患及22例阴性患的胃窦活检标本行免疫组化染色。[结果]（1）幽门螺杆菌阳性患胃上皮HLA-DR表达较阴性患更显；（2）幽门螺杆菌定植密度与胃上皮HLA-DR抗原表达程度间存在正相关；（3）感染cagA^ 菌株患较感染cagA^-株胃上皮HLA-DR抗原表达更明显；（4）本研究中vacAsla/m2亚型占90%，故未对不同vacA亚型与胃上皮HLA-DR表达间的关系进行统计分析。[结论]（1）幽门螺杆菌感染可诱导胃上皮HLA-DR抗原异常表达；（2）cagA^ 菌株可能通过胃上皮HLA-Ⅱ类分子介导而与宿主发生更为密切的相互作用，从而较cagA^-菌株引起更为显的胃上皮损伤。     

盐城市幽门螺杆菌感染及vacA和cagA基因型的流行特征及其与常见胃肠疾病的关系

目的：研究盐城市幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,Hp）感染的流行特征,并探讨Hp的vacA和cagA基因型与常见胃肠疾病的关系。方法：取江苏盐城确诊的1 892例常见胃肠疾病的近幽门胃黏膜组织,培养菌株,提取基因组DNA,采用PCR法检测Hp的vacA和cagA基因型。结果：2 682例消化病患者,胃肠疾病确诊率为70.54%,发病率男性高于女性（P < 0.01）;1 892例样本,胃肠疾病Hp总感染率为41.81%,良性胃肠疾病Hp感染率之间无差异（P > 0.05）,胃癌低于良性胃肠疾病,差异显著（P < 0.05）;各县区Hp的临床感染,市区感染率低于其他县区（P < 0.05）,而各县区无差异（P > 0.05）;Hp基因型中,cagA阳性率盐城地区为88.85%,各市县区无差异（P > 0.05）,响水达95.92%,与最高的射阳相比较,差异显著（P < 0.05）;vacA阳性率各县市区无差异（P > 0.05）;cagA和vacA均为阳性、cagA阳性而vacA阴性、cagA阴性而vacA阳性三者各县市区比较,均无差异（P > 0.05）。盐城市Hp的vac基因亚型中,各市县区均无差异（P > 0.05）。胃溃疡、复合性溃疡、胃癌和胃淋巴瘤与其他胃肠病之间,Hp的cagA阳性率比较,有差异（P < 0.05）,Hp的vacA阳性率比较,差异亦显著（P < 0.01）,Hp的cagA和vacA均为阳性比较,差异显著（P < 0.01）,而Hp的cagA阳性和vacA阴性的比率及Hp的cagA阴性和vacA阳性的比率比较,差异无意义（P > 0.05）,各种胃肠病Hp感染的vac基因亚型,各种胃肠病之间经统计学处理无差异（P > 0.05）;s1b阳性率经统计学处理无差异（P > 0.05）。结论：盐城胃肠疾病发病率男性高于女性;盐城地区市区Hp感染率低于其他县区;盐城地区Hp的vacA和cagA亚型以cagA 、vacA均阳性和cagA阴性而vacA阳性两种形式存在。     

幽门螺杆菌VacA基因型与胃疾病

目的:探讨幽门螺杆菌(H.pylori)VacA基因型在各种胃肠疾病中的分布及关系.方法:从胃十二指肠疾病患者胃粘膜标本中分离培养H.pylori,PCR测定VacA基因型.结果:108株H.pylori菌株,VacA s1a阳性为85株(79%),VacA s1b阳性22株(20%),VacA m1阳性29株(27%),VacA m2阳性77株(71%),VacA s1a/m2阳性66株(61.1%),未发现s2型菌株.其中,慢性胃炎患者VacA s1a阳性率为65.4%(34/52),消化性溃疡患者VacA s1a阳性率为90%(36/40),胃癌患者VacA s1a阳性率为94%(15/16).结论:H.pylori菌株VacA基因型绝大多数为s1a/m2型,该型菌株存在于各种胃肠疾病中,无s2型.     

人胃黏膜幽门螺杆菌基因亚型检测与胃疾病

目的 探讨利用胃黏膜直接提取DNA检测幽门螺杆菌(Hp)基因亚型,以进行临床Hp感染判定的可行性,并进而探讨各基因亚型Hp感染与胃疾病的关系.方法 选取已知病理诊断的胃黏膜活检标本217例,进行细菌培养,同时提取黏膜Hp-DNA及菌种DNA,利用聚合酶链反应分别检测幽门螺杆菌ureB、cagA、vacA、iceA和baba2基因亚型.结果 胃黏膜来源HP-DNA与菌种来源Hp-DNA检测ureB、cagA、vacAs1、vacAm1b、vacAm2、iceA1、iceA2和baba2亚型,两者符合率分别为74.23%,73.39%,93.69%,62.16%,78.16%,89.13%,88.37%和75%,差异均无统计学意义(P＞0.05).各疾病组间,幽门螺杆菌ureB、cagA、vacAs1、vacAm1b、iceA1、iceA2和baba2亚型分布频率差异均无统计学意义(P＞0.05);vacA s1m1基因型在浅表性胃炎组(22.22%)分布频率最高,与萎缩性胃炎组(5.71%)相比,差异有统计学意义(x2=8.416,P=0.004);vacA slm2基因型在萎缩性胃炎组(47.14%)分布频率最高,与浅表性胃炎组(18.89%)相比,差异有统计学意义(x2=13.336,P=0.000).结论 胃黏膜直接提取DNA检测Hp基因型可以用于Hp感染的快速诊断.VacA s1m1基因型与浅表性胃炎相关,VacA s1m2基因型与萎缩性胃炎相关.     

慢性胃炎、消化性溃疡患者携带株幽门螺杆菌基因分型

目的:探讨慢性胃炎、消化性溃疡患者携带株幽门螺杆菌(Hp)的基因分型方法.方法:对Hp标准株和慢性胃炎、消化性溃疡、非胃炎非溃疡患者携带株基因组DNA进行随机扩增多态性分析(RAPD),PCR扩增空泡毒素基因(vacA)和致病岛基因(cag-PAI)的cagA、cagE、cagT片段,并测定全部菌株的VacA活性.采用聚类分析进行基因分型.结果:单纯RAPD分型结果显示不同基因型别Hp与不同疾病结局无关(P=0.068 5).依据vacA cag-PAI分型结果显示不同基因型别Hp与不同疾病结局无关(P=0.268 5).将RAPD分析结果与vacA cagPAI检测结果进行综合聚类,全部菌株可分为3个型别,慢性胃炎、消化性溃疡和非胃炎非溃疡分别有自己的优势基因型,且各型间的总体分布差异有统计学意义(P=0.006 7).VacA的活性表达情况在各基因型之间的分布差异无统计学意义(P=0.265 5).结论:Hp基因型与疾病类型有关,空泡毒素基因和致病岛基因可作为Hp基因分型的靶基因,RAPD是有效的基因分型手段.     

宁波地区幽门螺杆菌优势基因型及其与耐药性的关系

目的探讨宁波地区幽门螺杆菌（Hp）优势基因型及其与Hp耐药性的关系。方法选取宁波地区慢性胃炎和消化性溃疡患者的胃镜活检标本,对40株临床分离菌株,采用PCR法检测tip的cagA、vacAm1、vacAm2、vacAsla和babA2基因型;采用纸片扩散法作药敏试验。结果40株Up中cagA、vacAml、vacAm2、vacAsla和babA2基因型的阳性率分别为100％、52．5％、85．5％、92、5％和57．5％;慢性胃炎和消化性溃疡患者中分离的Hp基因型的检出率差异均无显著性（P〉0．05）：Hp对甲硝唑的耐药率高于阿奇霉素（P〈0．05）,并显著高于阿莫西林和克拉霉素（P〈0．01）;Hp的甲硝唑耐药株与敏感株之间cagA、vacA和babA2基因型分布差异无显著性（P〉0．05）。结论宁波地区慢性胃炎和消化性溃疡患者中分离的Hp以cagA、vacAm2、vacAsla、babA2、vacAsla／m2基因型为主。Hp基因亚型的确定尚不能对Hp根治疗法中抗生素的选择提供帮助。     

Dominant cagA/vacA genotypes and coinfection frequency of H. pylori in peptic ulcer or chronic gastritis patients in Zhejiang Province and correlations among different genotypes, coinfection and severity of the diseases

Background Almost half of the world’s population suffer from the Helicobacter pylori (H. pylori) infection, but only some individuals develop gastric diseases with clinical symptoms. One reason for the phenomenon may be the different pathogenicity of infected H. pylori strains. The presence of cytotoxin-associated gene A (cagA) and expression of vacuolating cytotoxin activity encoded by vacuolating cytotoxin gene A (vacA) are considered the two major virulent markers of H. pylori. The aim of this study was to detect dominant cagA/vacA genotypes and coinfection frequency of H. pylori in patients with peptic ulceration (PU) or chronic gastritis (CG), and to determine correlations among different cagA/vacA genotypes, coinfection and severity of the diseases. Methods For each of 139 patients in Zhejiang Province who had been diagnosed as PU or CG based on clinical symptoms and gastroscopy, two gastric biopsy specimens (one from antrum and the other from corpus) for H. pylori isolation were taken by two different disinfected biopsy forceps. One hundred and fifty-six H. pylori strains were isolated from both the antrum and corpus biopsy specimens of 78 patients (36 PU and 42 CG). PCRs were performed to detect cagA genes, and signal (s) and middle (m) regions of vacA genes in the H. pylori isolates. The amplified fragments of dominant vacA gene s and m subtypes from representative H. pylori isolates were sequenced after TA cloning. Dominant cagA/vacA genotypes of the H. pylori isolates, coinfection frequency and correlations among the different genotypes, coinfection and severity of the diseases were determined.Results Of the H. pylori strains isolated from the antrum specimens, 96.2% were cagA gene positive, as were 97.4% of the H. pylori strains isolated from the corpus specimens. Only one s region subtype (s1a) and four m region subtypes m1, m2, m1b and m1b-m2 of vacA gene were found. The proportions of vacA gene subtypes s1a/m1, s1a/m2, s1a/m1b and s1a/m1b-m2 in the 83 strains isolated from the antrum specimens were 7.2%, 61.5%, 30.1% and 1.2%, respectively, while those in the other 84 strains isolated from the corpus specimens were 9.5%, 58.3%, 28.6% and 3.6%, respectively. s1a/m2 (58.3% vs 30.1%, χ2=13.47, P&lt;0.01) and then s1a/m1b (28.6% vs 9.5 %, χ2=9.88, P&lt;0.01) were the dominant vacA gene subtypes in the H. pylori isolates. The dominant H. pylori genotype was cagA+s1a/m2 (59.0% from antrum specimens and 57.1% from corpus specimens), and followed by cagA+s1a/m1b (28.9% from antrum specimens and 27.4% from corpus specimens). Sixteen of 78 patients (20.5%) were infected with two or three H. pylori strains with different genotypes. However, no statistically significant differences among cagA occurrence, the different vacA subtypes and PU or CG could be found (each P&gt;0.05). Similarities of the nucleotide sequences from vacA gene s region PCR products of six isolates and from vacA gene m region PCR products of four isolates were 93.2% to 98.3% and 93.8% to 97.6%, respectively, compared to the reported corresponding sequences.Conclusions The dominant genotypes of H. pylori in PU or CG patients in Zhejiang area may be cagA+ s1a/m2 and cagA+ s1a/m1b. Numerous coinfections with different H. pylori strains in PU or CG patients indicate diversity of the infected H. pylori origins. s and m regions of vacA gene from different H. pylori isolates show high nucleotide sequence similarities. cagA gene positive rate, different vacA gene subtypes and coinfection with different H. pylori strains are not closely associated with severity of the diseases.