2 210例江西籍汉族骨髓供者的HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型频率

目的分析江西汉族骨髓供者人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1等位基因频率和HLA单倍型频率。方法根据2210例江西汉族无关骨髓供者的HLA基因型数据,采用最大似然性方法计算HLA-A、B、DRB1的基因频率和单倍型频率。结果江西汉族骨髓供者中共观察到72个HLA等位基因,其中A*02、A*11、A*24、A*33、B60、B*46、B*13、B*58、B*51、B75、B62、DRB1*09、DRB1*12、DRB1*15、DRB1*04、DRB1*08、DRB1*11、DRB1*14和DRB1*13的频率高于0.05。358条A-B单倍型中,A2-B46、A11-B60、A33-B58等26条单倍型的频率高于0.01,68条单倍型表现为显著的正连锁不平衡;420条B-DR单倍型中,B46-DR9、B13-DR15、B75-DR12等22条单倍型频率高于0.01,82条单倍型表现为显著的正连锁不平衡;2518条A-B-DR单倍型中,386条单倍型有意义(频率大于等于4.52×10-4),A2-B46-DR9、A2-B46-DR8、A11-B13-DR15、A33-B58-DR13、A33-B58-DR17、A30-B13-DR7等39条单倍型频率高于0.005。结论江西汉族HLA-A、B、DRB1等位基因和HLA单倍型的分布特征接近南方汉族人群,但又有其自身特殊性,本研究群体的HLA等位基因频率和单倍型频率可作为江西汉族人群的参考标准。     

中国部分汉族人群362种HLA单倍型的家系调查及重组单倍型分析

本研究旨在发现中国人群人类白细胞抗原（humanleukocyteantigen,HLA）-A—B—DRBI新单倍型,调查mA单倍型分布特征。采用179个家庭及子女HLA．A、B、DRBl位点的基因分型结果,通过家系和HLA遗传模型特征分离分析791条HLA单倍型。结果发现4条新的HLA重组单倍型,重组位点位于HLA—DRB1基因座位,其中3条重组单倍型来自父源染色单体,1条来自母源染色单体,其比例为3：1。HLA—DRB1与A或B基因位点重组率为0．92％（4／433）。通过家系调查HLA分离分析得到362种HLA～A—B～DRB1单倍型,其中A33-B58-DR17、A2．B46．DR9、A30-B13-DR7、A11-B13-DR15、A11-B75-DR12和A2-B46-DR14单倍型检出频率最高,与应用非血缘供者人群的HLA基因分布调查资料的结果-致,但A1-B63-DR12、A29-B46-DR15、A1-B61-DR10、A34-B35-DR9、A29-B54-DR4、A23-B13-DR16、A34-B62-DR15等单倍型是非血缘供者人群HLA基因分布调查资料为未被报道过的罕见单倍型。结论：通过家系HLA单倍型调查能清楚地确定HLA—A—B—DRB1单倍型型别。本研究结果将为人类HLA研究、器官移植及HLA疾病相关性分析等提供重要依据。     

安徽汉族HLA-A、B、DRB1基因多态性和单倍型的分布特征

目的分析安徽汉族人群中人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1基因和单倍型的分布特征。方法根据2816例安徽汉族无关骨髓供者的HLA基因型数据,分别采用方根法和最大似然性方法计算HLA-A、B、DRB1基因频率和单倍型频率,并进行群体比较。结果安徽汉族中共检出78个HLA基因,其中A*02、A*11、A*24、A*33、A*30、B*13、B*46、B60、B62、B*58、B61、DRB1*09、DRB1*15、DRB1*04、DRB1*07、DRB1*12、DRB1*08、DRB1*13、DRB1*11和DRB1*14最常见。440条A-B单倍型和481条B-DR单倍型中,A2-B46、A30-B13等26条A-B单倍型以及B13-DR7、B46-DR9等27条B-DR单倍型最常见;另外,至少80条A-B单倍型和102条B-DR单倍型呈现显著的正连锁不平衡,其中A2-B46、A30-B13、A33-B58、A33-B44、A2-B38等17条A-B单倍型以及B13-DR7、B46-DR9、B58-DR17、B44-DR13、B54-DR4、B52-DR15、B58-DR3、B57-DR7等18条B-DR单倍型表现为强连锁不平衡。3488条A-B-DR单倍型中,537条A-B-DR单倍型的频率大于等于3.55×10-4,A30-B13-DR7和A2-B46-DR9等27条单倍型频率高于0.005。结论安徽汉族人群HLA-A、B、DR基因和单倍型的分布比较接近中国北方汉族人群,但一定程度上受到南方汉族人群的影响。     

重庆造血干细胞捐献者资料分库HLA单倍型研究

目的了解重庆造血干细胞捐献者资料分库HLA-A、B、DRB1基因多态性,分析其中HLA-A、B、DRB1单倍型频率的分布特征。方法采用PCR-SSP方法对中国造血干细胞捐献者资料库重庆分库(简称重庆分库)的3957名无血缘关系的捐献者进行基因分型,计算HLA基因频率和单倍型频率。结果在重庆分库的人群中,最常见的A-B单倍型是A2-B46、A11-B60和A33-B58,占单倍型频率总数的22.2%;最常见的A-DR单型是A2-DR9、A11-DR12和A11-DR15,占单倍型频率总数的18.6%;最常见的B-DR单倍型是B46-DR9、B58-DR17和B75-DR12,占单倍型频率总数的13.6%。A2-B46、A33-B58和A30-B13为重庆分库最常见、连锁不平衡最显著的单倍型。结论重庆分库的HLA单倍型分布特征与南方汉族人群相近,但也有其自身特点。     

11755名中国北方汉族造血干细胞供者HLA-A、B、DRB1基因和单倍型研究

为了研究中国北方汉族造血干细胞供者的人类白细胞抗原（HLA）-A,B,DRB1等位基因、HLA单倍型频率及其连锁不平衡特征,采用PCR-SSP和PCR-SSO流式微磁珠检测方法对中华骨髓库陕西分库内11755名中国北方汉族骨髓供者进行HLA基因低分辨分型,并根据HLA表型群体资料,运用基于最大数学预期值算法（Expectation-Maximization,EM）的计算机软件Arleguin计算HLA单倍型频率。结果表明：11755例样本符合Hardy-Weinberg平衡检验,共检出HLA-A、B、DRB1等位基因（按分解抗原统计）分别为18、42、15种,包括很少在汉族人群中检测到的HLA-A25、B42、B53、B73和DR3,未发现HLA-A36,A43,A80,B78,B82和DR18等6种特异性。HLA-A＊02,A＊11,A＊24,A＊33,A＊30,A＊01,A＊03,A＊13,B62,B＊51,B＊46,B60,B61,B＊35,B＊44,DRB1＊15,DRB1＊09,DRB1＊04,DRB1＊07,DRB1＊12,DRB1＊11,DRB1＊14,DRB1＊08,DRB1＊13的频率〉0.05。EM法计算求得频率〉10-6的HLA-A-B-DR单倍型共计2026种,其中HLA-A30-B13-DR7、A2-B46-DR9、A33-B58-DR17等26种单倍型频率〉0.005,A30-B13-DR7是中国北方汉族最常见单倍型。计算求得的HLA-A-B、A-DR、B-DR单倍型共计538、227、522种,频率〉10-6者分别有409、195、423种,其中A30-B13,A2-B46,A33-B58等28种单倍型频率〉0.01;A2-DR9,A2-DR15,A30-DR7等26种单倍型频率〉0.01;B13-DR7,B46-DR9,B13-DR12等24种单倍型频率〉0.01。具有统计学意义（P〈0.05）的连锁不平衡HLA-A-B、A-DR和B-DR单倍型分别有296种（72%）、130种（67%）和308种（73%）,其中A30-B13、A33-B58、A1-B37、A30-DR7、A33-DR13、A1-DR10、B37-DR10、B8-DR17、B13-DR7、B58-DR17等单倍型表现为显著的正连锁不平衡。结论：本研究使用EM算法获得了目前中国北方汉族样本量最大的HLA-A/B/DRB1等位基因多态性、单倍型频率分布及连锁不平衡的特征,这将有助于临床为患者寻找合适供者,为移植免疫、HLA与疾病相关性及本地区群体遗传学等方面的研究提供了重要依据。     

地中海贫血患者找到人类白细胞抗原A-B-DR单倍型及抗原全相合供者的可能性

背景：选择适合的人类白细胞抗原匹配供者是实施造血干细胞移植治疗的关键，不同人种、地区和疾病人群的人类白细胞抗原与单倍型频率分布是评估地中海贫血患者选择适合供者的重要遗传学依据。目的：分析地中海贫血患者人类白细胞抗原A—B—DRB1单倍型和表型频率分布格局，估算其与骨髓库相合供者相配的概率。设计：病例一对照分析。对象：患者组为2000-06／2006-12广东地市级以上13家医院诊断为地中海贫血的108例患者，广东籍，彼此无血缘关系。正常对照组为2000-08／2006-12中华骨髓库招募的5352名广东籍健康供者，与患者无血缘关系。方法：应用最大似然性算法计算两组人类白细胞抗原A，B，DRB1单倍型及表型频率分布。根据人类白细胞抗原单倍型遗传特征，某一个体人类白细胞抗原A，B，DRB1表型频率等于相应的基因型频率之和。在由n个供者组成的供者群体找到至少1例与患者表型仝相同供者的概率P，应用公式P=1-（1-Df）^n计算，Df为供者表型频率。结果：患者组和对照组最常见单倍型和表型频率分布格局不同。正常对照组常见的单倍型为A2-B46-DR9，A33．B58-DR17，A11-B75-DR12，A11-B13-DR15和A33-B47-DR13：患者组常见的单倍型为A2-B46-DR9，A33-B58-DR17，A2．B46-DR14，A11-B60-DR12和A11-B75-DR12。正常对照组常见的表型频率分布情况为A2，33；B46，581DR9，17，A2，11；B46，751DR9，12，A11，33；B58，75；DR12，17，A2．2；B46，46；DR9，9和A2，11；B13，46：DR9，15；患者组常见的表型为A2，33；B46，58；DR9，17，A2，2；B46，46；DR9，9，A2，2：B46．46：DR9，14，A2，11；1346，60；DR9、12和A2，11；B46，75；DR9，15。两组之间相匹配的表型有19种，表型匹配概率为0．44％（19／4282）。人类白细胞抗原A24-B51-DR8，A3-B38-DR7，A24-B50-DR12，A3-B38-DR4，A24-B51-DR8和A24-B60-DR7等34条单倍型及A2．33：B46，58；DR9，17，A2，2：B46，46：DR9，9和A2，11；B46，75；DR9，15等67种表型，其频率在正常对照组有不同程度的降低，携带有这些单倍型或表型患者找到人类白细胞抗原单倍型相合或全相合供者的概率降低。结论：地中海贫血患者人类白细胞抗原A-B—DR单倍型频率分布呈高度遗传多态性，患者找到人类白细胞抗原全相合供者的概率取决于供者群体人类白细胞抗原表型频率。     

127个家系的HLA-A、B、DR单倍型分析

目的分析中国人的人类白细胞抗原(HLA)的多态性及其单倍型。方法运用PCR-SSP的方法对来本院进行HLA配型的127个家庭进行HLA-A、B、DRB1位点的基因分型,确定其抗原,通过家系分析确定HLA的单倍型,并进行统计分析。结果127个家庭的HLA-A、-B、-DR的基因频率与文献报道汉族人群体HLA基因频率无显著差别。统计分析表明,HLA-A-B有22种单倍型、HLA-A-DR有14种单倍型、HLA-B-DR有26种单倍型、HLA-A-B-DR有16种单倍型均存在显著的连锁不平衡。最常见的单倍型有A30-B13-DR7,A2-B46-DR9,A33-B58-DR13。观察到单倍型的等位基因交换重组现象,单倍型的等位基因发生交换重组的频率<1%。结论此家系研究的资料可以为大规模的群体资料的单倍型分析提供参考,并可为HLA分型和为临床移植寻找合适的供受者提供有参考价值的数据。     

吉林骨髓库汉族造血干细胞捐献者HLA-A、B、DRB1基因分布和单体型分析

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库吉林分库HLA基因及单体型分布特征。方法采用PCR-SSP、PCR-SSO和PCR-SBT法对吉林分库内10 120份吉林籍汉族捐献者HLA-A、B、DRB1基因低分辨分型,用Excel软件计算HLA基因频率、单倍型频率及其连锁不平衡参数。结果吉林分库内汉族捐献者的HLA-A、B、DRB1基因(含血清学特异性)分别有21、45、13种,频率高的基因是:A*02、A*24、A*11、A*30,B*13、B*60、B*61、B*62、B*35、B*46、B*51,DR*01、DR*03、DR*04、DR*07、DR*09、DR*12、DR*15。HLA单体型分布,两座位连锁频率较高的有:A30-B13、A02-B46、A02-B61、A02-B58,B13-DR07、B13-DR12、B46-DR09、B61-DR09,A2-DR09、A30-DR07、A02-DR12、A02-DR15;三座位连锁频率较高的是:A30-B13-DR07、A02-B46-DR09、A02-B13-DR12、A02-B61-DR09。结论为临床造血干细胞移植寻找合适匹配的供受对,以及吉林地区汉族人群HLA基因多态性与HLA相关疾病的研究提供了有意义的参照数据。     

20596名汉族造血干细胞供者HLA多态性统计学分析

目的了解中国汉族人群中HLA-A,B,DRB1基因和单体型频率分布特征。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物和序列特异性寡核苷酸探针技术,对20596名健康汉族无关供者进行HLA基因分型,并翻译为相应的抗原特异性;采用最大数学预期值算法(expectation-maximization,EM)计算HLA基因和单体型频率,并统计相关的遗传参数。结果20596名汉族无关供者中,频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24,B46、B13、B60,DR9、DR12、DR4、DR15;频率>0.05的A-B、B-DRB1单体型为A2-B46、A33-B58、A30-B13、B46-DR9、B13-DR7,频率>0.03的A-B-DRB1单体型为A30-B13-DR7、A2-B46-DR9、A33-B58-DR17;频率>7.27×10-5的有意义两座位单体型中,A30-B13、A69-B52、A33-B58、B8-DR17连锁不平衡强度最高(RLD>0.8)。结论中国汉族人群HLA基因和单体型多态性较为丰富,其频率分布数据和相关遗传参数为临床移植供者的选择、资料库志愿者招募策略的制定提供了重要参考。     

四川造血干细胞捐献者资料库HLA-A,B,DRB1基因和单倍型研究

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库四川分库(以下简称“四川分库”)HLA基因及单倍型分布特征。方法采用PCR-SSP及PCR-SSO对四川分库内11134名四川籍捐献者HLA-A、B、DRB1基因低分辨分型,用Excel软件计算HLA基因频率、Hardy-Weinberg平衡吻合度、单倍型频率及其连锁不平衡参数。结果在四川分库内,HLA-A、B、DRB1基因(含血清学特异性)分别有18、41、13种,累积频率>50%的显著高频率基因是:A*11、A*02,B*46、B*40(60)、B*13、B*58、B*15(75),DRB1*09、DRB1*12、DRB1*15、DRB1*04。频率大于5%的单倍型有A*02-B*46、A*11-B*40(60)、A*33-B*58、B*46-DRB1*09、A*02-DRB1*09、A*11-DRB1*12、A*11-DRB1*15、A*02-B*46-DRB1*09。紧密相关的单倍型是A*33-B*58、A*30-DRB1*07、B*37-DRB1*10、A*02-B*37-DRB1*10。结论此资料有助于为临床移植寻找合适匹配的供受对,并为四川地区健康人群HLA基因多态性以及HLA相关疾病的研究提供有意义的参照数据。     

造血干细胞移植56例人类白细胞抗原基因和单倍型分析

背景：收集56例欲行造血干细胞移植的供受者,均为无血缘关系的江西省汉族人群。了解个体的人类白细胞抗原基因型和单倍型。目的：分析56例造血干细胞移植供受者的人类白细胞抗原基因频率,单倍型频率。方法：收集56例欲行造血干细胞移植的供受者,均无血缘关系的江西省汉族人群。应用PCR-SSP的方法进行人类白细胞抗原（HLA）-A、B、DRB1基因分型,计算出HLA-A、B、DRB1各位点的基因频率和单倍型频率。结果与结论：56例供受者测出HLA-A位点等位基因8种,HLA-B位点等位基因19种,HLA-DRB1位点等位基因13种,呈现出丰富的基因多态性。56例供受者两位点共224条等位基因中,A﹡02-B﹡46、A﹡11-B﹡40、B﹡46-DRB1﹡09单倍型的频率高于0.10。有10种A-B单倍型,4种B-DRB1单倍型呈现出显著的连锁不平衡。提示江西省汉族人群人类白细胞抗原基因具有较丰富的基因多态性。     

黑龙江地区汉族HLA-A、B、DRB1基因及单倍型的研究与应用

目的研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库汉族捐献者HLA-A、B、DRB1等位基因和单体型频率分布特征,探讨中国广大地区乃至世界其他人种利用黑龙江汉族捐献者进行造血干细胞移植的可能性。方法采用序列特异性引物(PCR-SSP)和序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)基因分型技术,对黑龙江地区汉族捐献干细胞的9 019名供者进行HLA-A、B、DRB1基因低分辨检测。结果共观察到77个HLA等位基因,其中频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24、B13、DR15、DR9、DR7、DR12、DR4。432条A-B单体型中,25条单体型的频率高于0.01,101条单体型呈现显著的正连锁不平衡,21条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40);437条B-DRB1单体型中,22条单体型的频率高于0.01,115条单体型呈现显著的正连锁不平衡,16条表现为强连锁不平衡;2 002条A-B-DRB1单体型中,971条单体型有意义(频率≥1.66×10-4),18条单体型频率高于0.005。截止2007年3月通过中国造血干细胞捐献者资料库管理中心检索,成功移植20例。结论黑龙江汉族人群HLA-A,B,DRB1等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,与中国汉族人总体分布特征相似。未发现群体特有的基因和单体型,但具有其自身分布特征。不同地区、不同人群有可能在中国造血干细胞库黑龙江地区汉族捐献者中寻找到HLA相合的供者。其中中国人群最容易找到HLA相合供者,其次是日本人和韩国人。     

我国汉族人群HLAⅠ类经典基因单倍型及连锁分析

本研究旨在探讨我国汉族人群HLAI类经典基因座位HIA—A、HLA—B、HIA—Cw位点的基因频率，单倍型频率及连锁特征。采用序列特异性引物（SSP）PCR低分辨基因分型技术对1014例随机选择的无关个体的经典HIAⅠ类位点进行基因分型，并对其相关遗传学参数进行统计学分析。结果发现汉族人群中较为常见的HIA—Ⅰ类基因是A＊02（0．33）、A＊11（0．24）、B＊15（0．14）、B＊13（0．13）、Cw＊03（0．25）、Cw＊07（0．18）；较为常见的单倍型是A＊02-B＊46（0．071）、A＊11—B＊15（0．051）、A＊02-Cw＊01（0．084）、A＊11—Cw＊03（0．079）、B＊46-Cw＊01（0．095）和B＊13-Cw＊03（0．071）等，其中A＊02-B＊46、A＊30-B＊13、A＊30-Cw＊06、A＊02-Cw＊01、B＊46-Cw＊01和B＊58-Cw＊03等单倍型呈现出显著的连锁不平衡；而A＊02-B＊15、A＊02-B＊40、A＊24-Cw＊03、A＊02-Cw＊03、A＊31—Cw＊03等连锁不平衡性相对较低，其中A＊24-Cw＊03在重组事件中较常出现。此外，A＊02-B＊46-Cw＊01（0．075）、A＊30-B＊13-Cw＊06（0．046）、A＊11—B＊13-Cw＊03（0．045）、A＊33-B＊58-Cw＊03（0．044）、A＊11—B＊15-Cw＊08（0．027）、A＊02-B＊38-Cw＊07（0．023）、A＊11—B＊40-Cw＊07（0．022）等为常见扩展单倍型。结论：本研究较系统地分析了我国汉族人群的HIA遗传学分布特点，为群体进化、临床移植及疾病相关研究等提供了有价值的遗传学资料。     

Human histocompatibility leukocyte antigen (HLA) haplotype frequencies estimated from the data on HLA class I, II, and III antigens in 111 Japanese narcoleptics

In order to deduce the predominant haplotypes in Japanese narcoleptics, we have studied a total of 111 Japanese patients with narcolepsy and six multiple-case families for HLA class I and class II antigens, and for class III HLA-linked complement markers. In Japanese narcoleptics, the most frequent haplotypes were B35-DR2, B15-DR2, and B51-DR2. These haplotypes were rare in normal Japanese population. In contrast, the most frequent haplotype of HLA-DR2 in normal Japanese, A24-C blank-Bw52-C4A*2 B*Q0-BF *S-C2*C-DR2-DQw1, had a decreased frequency to one-third of the normal controls. Haplotypes B35-DR2, B15-DR2, and B51-DR2, which were more frequent among Japanese narcoleptics, were different from the haplotype found more frequently among Caucasoid narcoleptics, A3-Cw7-B7-DR2-DQw1. Haplotype analysis on six families showed that B35-DR2 and other rare haplotypes in normal Japanese were associated with narcolepsy. There were four cases without any signs of narcolepsy among 19 subjects with the disease susceptibility haplotypes. This finding suggests an incomplete penetrance of hypersomnia. Haplotype analysis of family members was also useful for the early detection of the high risk children to narcolepsy.     

Different HLA haplotypes in Mexican Americans with IDDM

The study of HLA histocompatibility antigens and insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) in non-White populations may provide a unique opportunity to more accurately define the diabetes susceptibility gene(s) located within the HLA region. To determine whether HLA haplotypes differ between ethnic groups, we compared 105 HLA haplotypes from 55 Mexican-American IDDM patients with 272 haplotypes from 136 IDDM patients of non-Hispanic White descent. The accurate determination of genotypes and haplotypes requires the study of family units. Therefore, all diabetic patients in this study were from studies of families having one or more siblings with IDDM. In the Mexican-American group, HLA-DR3 and -DR4 were the most common HLA-DR alleles and were present in comparable frequencies in the non-Hispanic White group (HLA-DR3, 27% of Mexican-American and 29% of non-Hispanic White haplotypes; DR4, 46% of Mexican-American and 43% of non-Hispanic White haplotypes). However, the HLA-B/DR-containing haplotypes and haplotype frequencies differed between the two groups. Several common haplotypes (B8/DR3, B15/DR4) in the non-Hispanic White group occurred less frequently in the Mexican-American group. In contrast, uncommon haplotypes in the non-Hispanic White group comprised nearly 50% of the DR4-containing haplotypes (B35/DR4, B40/DR4, B44/DR4) in the Mexican-American group. Although both DR3- and DR4-haplotype frequencies differed significantly between the two groups, the relative frequency of DR3- but not DR4-containing haplotypes was similar in both ethnic groups. This adds to the evidence suggesting that different susceptibilities are provided by the haplotypes carrying the DR3 and DR4 alleles.