padi4—104单核苷酸多态性与河北省汉族人群类风湿关节炎的相关性研究

目的 探讨中国河北汉族人群肽酰基精氨酸脱亚胺酶4-104（padi4-104）单核苷酸多态性（SNP）与RA易感性的关系.方法 用PCR-DNA测序法对无血缘关系的115名RA患者和106名健康体检者的PADI4基因padi4-104位点的SNP进行检测分析.结果 padi4-104的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0.05）,AA、AG、GG基因型和A、G等位基因分布在RA病例组与对照组间差异均无统计学意义（P值分别为0.368、0.245、0.252）,比值比（OR）分别为0.709（95%可倩区间：0.336～1.498）、0.636（95%可信区间：0.296～1.364）、0.800（95%可信区间：0.546～1.172）.结论 河北汉族人群PADI4基因的padi4-104位点具有多态性,但此单核苷酸多态性与RA的易感性无相关性.     

肽酰基精氨酸脱亚胺酶4与类风湿关节炎相关性的研究进展

类风湿关节炎是一类具有严重致残性的慢性炎症性自身免疫性疾病,其发病机制尚不清楚,治疗仍是我们面临的重大难题。近些年来,肽酰基精氨酸脱亚胺酶4(PADI4)被发现在类风湿关节炎的发生发展中起着重要的作用,其与类风湿关节炎的相关性研究将有助于我们进一步阐述其发病机制,并有望在此方面发现特异性指标用于疾病诊断、预测疗效,甚至为基因治疗提供有效靶点。     

PADI4单核苷酸多态性与类风湿关节炎相关性的Meta分析

目的探讨肽酰精氨酸脱亚胺基酶4(PADI4)基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎(RA)发病风险的关系。方法采用Meta分析方法对相关研究结论进行合并效应值估计,进行异质性检验、发表偏倚评估和风险比的Meta分析。结果共有国内外符合条件的13篇文献纳入分析,累计病例和对照者数分别为11 039例和10 395例。因存在异质性,将PADI4-94研究结果分亚洲人组和欧洲人组进行Meta分析,发现PADI4-94单核苷酸多态性(SNP)与亚洲人种RA风险相关,而与欧洲人种的RA风险无关,综合采用随机效应模式Meta分析时,总体显示PADI4-94与RA风险相关;PADI4-104文献中有一篇存在异质性,排除后经固定效应模式Meta分析显示,PADI4-104 SNP与RA风险存在相关性。发表偏倚评估显示虽有一定的发表偏倚,但剪补法分析显示偏倚不改变相关性结论。结论 PADI4-94和PADI4-104 SNP与RA的发病风险相关。     

肽酰基精氨酸脱亚胺酶4与类风湿关节炎相关性的研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种常见的具有较高致残性的系统性自身免疫性疾病,主要表现为对称性、慢性、进行性多关节炎。关节滑膜的病理改变为慢性炎症、增生形成血管翳、侵犯关节软骨、软骨下骨、韧带和肌腱等,造成关节软骨、骨和关节囊破坏,最终导致关节畸形和功能丧失。     

类风湿性关节炎滑膜组织PADI4的表达

目的 研究类风湿关节炎(RA)、骨关节炎(OA)和强直性脊柱炎(AS)滑膜液中肽酰基精氧酸脱亚胺酶4(PADI4)的表达.方法 收集RA(n=73)、OA(n=96)和AS(n=32)滑膜液标本及RA(n=6)、OA(n=6)和AS(n=32)关节滑膜标本,应用酶联免疫吸附法(ELISA)和蛋白印迹分析的方法检测滑膜液中PADI4蛋白表达,应用实时定量PCR比较RA、OA和AS患者滑膜中PADI4的mRNA的表达,并研究抗环瓜氨酸肽(CCP)抗体和类风湿因子(RF)、C反应蛋白(CRP)与PADI4的相关性.结果 RA患者滑膜液中PADI4、抗CCP抗体、RF含量较高,OA、AS患者滑膜液中PADI4、抗CCP抗体、RF含量无明显改变,RA患者与OA、AS患者比较差异有统计学意义(P<0.05).结论 以上结果证实RA患者滑膜中PADI4表达较高,PADI4在RA发病过程中发挥作用,PADI4的表达水平可能与一些临床表现有关.     

类风湿关节炎患者血液中PADI4表达的研究

目的探索肽基精氨酸脱亚胺基酶4（PADI4）在早期类风湿关节炎（RA）患者血液中的表达。方法收集早期RA（发病六个月）和早期骨关节炎（发病六个月）（OA）患者的血清,EusA方法检测患者血清中的PADI4,anti—CCP和RF的水平,同时检测超过三年的RA患者血浆中这三种物质的水平。另外还采集了健康者以及系统性红斑狼疮（SLE）患者的血样进行分析。作为对照。结果68．7％的早期RA患者的PADI4水平明显高于早期OA患者。长时间患RA病人的PADI4表达量高于SLE病人,但与健康人水平没有多大的差剐。在RA患者血液中,PADI4的水平与RF和anti—CCP的水平密切相关。蛄论PADI4可能在RA发病起始过程中发挥作用,PADI4的表达水平可能与疾病活动争一些临床表现有关。     

PADI4对NB4细胞分化过程中炎性因子表达水平的影响

目的:探讨全反式维甲酸(ATRA)诱导人急性早幼粒细胞白血病细胞株NB4向粒细胞分化过程中肽酰基精氨酸脱亚胺酶4(PADI4)的表达变化及其是否参与炎性因子的表达.方法:建立ATRA诱导的NB4细胞分化模型,采用Wright-Giemsa染色观察细胞形态学变化;采用流式细胞术检测细胞表面分化抗原CD11b的表达;RT-...     

类风湿关节炎患者滑膜抗环瓜氨酸肽 表位表达与肽酰基精氨酸脱亚氨酶4基因的相关性分析

目的 探讨类风湿关节炎患者滑膜抗环瓜氨酸肽(CCP)表位表达与肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(PADI4)基因的相关性。方法 2013年2月～2015年选择在湖北医药学院附属东风医院风湿免疫科住院的类风湿关节炎患者110例作为观察组,同期选择在该院进行体检的健康者110例作为对照组,两组都进行滑膜抗CCP表位表达阳性率检测与PADI4基因表达检测,同时进行相关性分析。结果 观察组与对照组的滑膜抗CCP表位表达阳性率分别为70.9%和9.1%,观察组明显高于对照组(χ2=23.289,P<0.05)。观察组PADI4-104基因型的表达频率与对照组对比差异有统计学意义(χ2=2.984,P<0.05),多为G/G表达,而对照组多为C/G表达。Pearson相关性分析显示在观察组中,滑膜抗CCP表位阳性表达情况与PADI4-104基因型表达频率之间存在明显相关性(r=0.344,P<0.05); logistic逐步回归分析显示PADI4-104基因型表达频率是影响滑膜抗CCP表位表达的主要因素(P<0.05)。结论 类风湿关节炎患者的滑膜抗CCP表位表达阳性率明显增加,同时也存在PADI4基因多态性紊乱情况,两者也存在明显的相关性,从而影响类风湿关节炎的发病状况。     

中国汉族人群血管内皮细胞生长因子基因的单核苷酸多态性研究

目的探讨中国汉族人群血管内皮细胞生长因子 (VEGF)基因的单核苷酸多态性 (SNPs)分布规律。方法应用等位基因特异性扩增技术 ,对 2 5 2名中国汉族正常人的VEGF基因SNPs进行检测 ,并与文献报道的欧洲白人数据进行比较。结果VEGF基因启动子区的多态位点C2 5 78A的基因型频率分布中 ,CC为 48 8%、CA为 46 0 %、AA为 5 2 % ;C等位基因频率为71 8% ,A等位基因频率为 2 8 2 %。与欧洲白人相比较 ,各基因型和等位基因分布存在非常显著性差异 (P <0 0 1)。结论中国汉族人群VEGF基因SNPs与欧洲白人显著不同 ,中国人低VEGF表达的 2 5 78A/A纯合子明显少于欧洲白人。     

类风湿关节炎患者滑膜组织中瓜氨酸化蛋白质及肽酰基精氨酸脱亚氨酶4的表达研究

目的 研究瓜氨酸化蛋白质(citrullinated protein,Cit P)及肽酰基精氨酸脱亚氨酶4(peptidylarginine deiminase,PAD4)在类风湿关节炎(RA)患者关节滑膜组织(synovial tissue,ST)中的表达。方法 无菌条件下获取手术切除的RA和骨性关节炎(osteoarthritis,OA)患者的关节ST,用免疫组织化学法检测ST中Cit P、Ig G及补体C3成分;western blot法检测RA和OA患者ST中PAD4蛋白的表达情况。分析RA患者ST中PAD4蛋白质表达与血清抗环瓜氨酸肽(CCP)抗体、抗链球菌溶血素O(ASO)、类风湿因子(RF)、C反应蛋白(CRP)和疾病活动性评分系统(DAS28)等临床指标的相关性。结果 RA和OA患者ST中均有Ig G和C3表达,但Cit P仅在RA患者ST中表达;RA患者ST中PAD4蛋白的表达量明显高于OA患者(P<0.05),且其表达量与CRP存在负相关关系(P<0.05),但未发现与其他临床指标存在相关性。结论 RA患者ST中PAD4、Cit P蛋白表达水平较高,PAD4在RA的致病过程中可能发挥一定的作用。     

白细胞介素23受体的基因多态性与类风湿关节炎的相关性

目的 探讨白细胞介素23受体(interleukin 23 receptor,IL23R)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)易感性之间的关系。方法 采用病例对照研究,以228例RA患者和228例正常对照为研究对象,从Hapmap中国人群数据库中选取IL23R基因的标签SNPs(tag-SNPs)。用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS)对IL23R基因的14个tag-SNPs位点进行基因分型,分析其等位基因分布频率及位点间的交互情况。结果 所检测的14个tag-SNPs中,共有3个位点rs10489628、rs10889675和 rs10889677的基因型频率分布在RA组和对照组之间差异有统计学意义(P<0.05)。各类型的单倍体在两组间的分布差异均无统计意义(P>0.05)。结论 IL23R基因的rs10489628、rs10889675和 rs10889677与RA之间存在相关性。     

贵州省汉族人群类风湿关节炎患者TRAF1/C5基因多态性研究

目的：探讨肿瘤坏死因子受体相关因子1（TRAF1）／补体5（C5）单核苷酸多态性与类风湿关节炎（RA）的相关性。方法提取300例 RA 患者（RA 组）和300例健康者 DNA（对照组）,实时荧光定量 PCR 方法检测 TRAF1／C5基因 rs3761847和rs10818488的单核苷酸多态性。结果TRAF1／C5存在基因多态性,但 RA 组与对照组比较基因多态性位点的单倍体基因型和等位基因频率的差异均无统计学意义（P ＞0．05）。连锁不平衡分析发现 rs3761847与 rs10818488之间存在强连锁不平衡。rs3761847位点 A 等位基因与类风湿因子（RF）阴性（P ＝0．001,OR ＝0．57,95％CI ：0．41～0．79）,抗 CCP 抗体（抗-CCP）阴性（P ＝0．001,OR＝0．51,95％CI ：0．35～0．76）及抗 Sa 抗体阴性均相关（P ＝0．02,OR ＝0．72,95％CI ：0．55～0．94）;rs10818488位点 G 等位基因仅与 RF 阳性相关（P ＝0．01,OR＝1．40,95％CI ：1．09～1．81）。结论TRAF1／C5基因多态性可能与贵州汉族人群 RA 的遗传易感性无关。     

Affordable assays for genotyping single nucleotide polymorphisms in insects

Insect genome projects and DNA sequence databases are providing unprecedented amounts of information about variation at specific nucleotides in protein- and RNA-coding genes. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are abundant in all insect species so far examined and are proving useful in population genetics, linkage mapping and marker-assisted selection. A number of studies has already identified SNPs associated with insecticide resistance, especially mutations conferring reduced target site sensitivity. Unfortunately, most modern, high-throughput, automated SNP detection technologies are expensive or require the use of expensive equipment and are therefore not accessible to laboratories on a limited budget or to our colleagues in developing countries. In this review, we provide a chronological and comprehensive list of all SNP methods. We emphasize and explain those techniques in which genotypes can be identified by eye or that only require agarose gel electrophoresis. We provide examples where these techniques have or are currently being applied to insects.     

血清类黏蛋白1样蛋白3基因单核苷酸多态性与儿童肺炎支原体感染相关哮喘的相关性

目的：探讨血清类黏蛋白1样蛋白3（orosomucoid 1-like protein 3,ORMDL3）基因单核苷酸多态性与儿童支原体肺炎（mycoplasma pneumoniae,MP）所致哮喘的相关性。方法：选取2015年1月至12月在山东大学附属省立医院儿科接受诊治的200例3～12岁MP住院患儿为研究对象,随访观察1年以上,分为MP哮喘组和MP非哮喘组。选取哮喘易感基因ORMDL3的2个位点rs4794820和rs7216389,对各组患儿的基因型分布进行分析。结果：失访6例,最后纳入194例MP感染患儿,其中男性为女性的2.3倍。MP发展为哮喘的患儿占32.5%（63/194）,MP哮喘组和MP非哮喘组的年龄构成分布差异无统计学意义。两组患儿的ORMDL3基因rs4794820、rs7216389位点基因型及等位基因分布差异均有统计学意义（P<0.05）,其中rs4794820 位点GG基因型和rs7216389位点TT基因型均是患儿发生哮喘的危险因素（OR=2.036,95%CI 1.104～3.754,χ2=5.258,P=0.022;OR=2.274,95%CI 1.221～4.236,χ2=6.841,P=0.009）。MP哮喘组患儿血清IgE升高比例明显高于MP非哮喘组（P<0.05）。结论：ORMDL3基因多态性与儿童MP相关哮喘相关,rs4794820位点GG基因型、rs7216389位点TT基因型及血清IgE水平升高均是儿童MP进展为哮喘的危险因素。     

硫氧还蛋白基因TXN单核苷酸多态性与中国汉族人群肺癌易感性研究

目的 探讨硫氧还蛋白基因TXN的单核苷酸多态性与肺癌易感性间的关系.方法 采集经病理组织学确诊的肺癌患者292例,相同地区、性别、年龄频数匹配的体检健康对照307例,针对筛选出的TXN基因9个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型检测,通过统计分析研究基因频率与肺癌风险的关系,并探讨吸烟在其中的影响.结果 3个TXN基...     

宫颈癌患者IL-18基因单核苷酸多态性的筛选

目的 筛选宫颈癌患者IL-18基因单核苷酸多态性位点,初步探讨IL-18基因单核苷酸多态性与宫颈癌相关性,为后续选择合适的单核苷酸多态性标志进行宫颈癌风险预测提供参考.方法 常规方法对原发性宫颈癌患者和健康人群46例进行外周血单个核细胞DNA抽提;自行设计引物,对IL-18基因5′端和6个外显子(长约5 kb)进行PCR法,产物采用DNA测序方法进行分析.结果 在IL-18基因5′端2 kp和6个外显子区域内共筛查出7个候选单核苷酸多态性,频率约0.14%,其中rs1946518和rs1946519的单核苷酸多态性基因型在宫颈癌和健康人之间差异有统计学意义(P＜0.05),且二者存在连锁关系;另有3个位点rs360719、rs360717和rs360718也存在连锁关系,可能与宫颈癌呈负相关,但差异无统计学意义(P＞0.05);位于E4的rs11547404和1个未登陆的单核苷酸多态性分别在1例患者中检测到.结论 采用小样本对特定人群IL-18基因进行测序可有效地筛选出候选单核苷酸多态性.初步发现宫颈癌与IL-18基因上游调控区rs1946518和rs1946519单核苷酸多态性有一定关系,为后续利用单核苷酸多态性标志进行宫颈癌风险预测提供了研究基础.     

BTNL2基因多态性与广东汉族女性乳腺癌易感性的相关性研究

目的探讨位于基因BTNL2（butyrophilin-like2）位点chr6-32478813和chr6-32470723的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNP）与广东汉族女性乳腺癌易感性的关系。方法采用MassARRAY-IPLEX SNP分型技术,以南方医科大学南方医院的216例广东汉族女性乳腺癌患者及216例同期女性健康体检者为研究对象,对以上2个多态性位点进行基因分型,利用χ2检验统计分析病例组和对照组的基因型频率有无差异,非条件Logistic回归计算比数比（odds ratio,OR）和95%可信区间（confidence interval,CI）,由此评价这两个位点多态性与乳腺癌的相关性。随后,将病例组按雌激素受体（estrogen receptor,ER）和孕激素受体（progesterone receptor,PR）免疫组化结果的不同进行进一步的分层分析。结果位点chr6-32478813和chr6-32470723基因型分布频率在病例-对照分组分析中无统计学差异（P〉0.05）;而进一步的分析发现这两位点的基因型分布频率在ER阴性（-）与ER阳性（＋）乳腺癌分组中有一定的差别,但统计学意义不显著;在PR阴性（-）与PR阳性（＋）分组中,差异有统计学意义（P〈0.05）,携带杂合基因型（chr6-32478813,CT;chr6-32470723,GA）的个体更倾向于PR（-）乳腺癌（OR=0.53,95%CI：0.29～0.94,P=0.028;OR=0.44,95%CI：0.19～0.99,P=0.043）。结论 BTNL2基因chr6-32478813和chr6-32470723位点多态性与乳腺癌患病风险均无明显相关性,但两位点的杂合基因型均与乳腺癌组织PR阴性（-）明显相关。     

轻型β-珠蛋白生成障碍性贫血患者β-珠蛋白基因单核苷酸多态性分析

目的对临床诊断为轻型β-珠蛋白生成障碍性贫血患者进行β-珠蛋白基因单核苷酸多态性分析.方法用PCR法对β-珠蛋白基因进行扩增,扩增产物经纯化后测序,确定其单核苷酸多态性.结果β-珠蛋白基因分析片段中共发现3个位点存在单核苷酸多态性,分别是外显子1第59位的T/C多态性、内含子2第-16位的G/C多态性及内含子2第-74位的T/G多态性.结论同国外报道的正常人群相比,轻型β-珠蛋白生成障碍性贫血患者的β-珠蛋白基因单核苷酸多态性位点显著减少,各位点的碱基频率也有不同.