独活寄生汤干预腰椎间盘突出症的可视化“药靶蛋白模型”分析

目的：构建独活寄生汤干预腰椎间盘突出症的“方药-靶基因-病种”生物预测模型,明确独活寄生汤作用于腰椎间盘突出症的核心靶点及作用通路。方法：首先,通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）中的靶点预测功能收集独活寄生汤的化学成分及靶点,利用UniProt蛋白质数据库确定基因靶点简称;其次,对在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、疾病相关的基因与突变位点数据库（DisGeNET）、比较基因组数据库(CTD)等数据库进行腰椎间盘突出症疾病靶标查询;最终,综合提取中药复方与疾病的核心作用靶点,借助STRING数据库的蛋白质相互作用分析平台和Cytoscape软件的拓扑分析功能,获取“方药-靶基因-病种”的关系网络,使用R语言进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,以及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,确定独活寄生汤干预腰椎间盘突出症的核心靶点与关键通路。结果：筛选出独活寄生汤202个有效化学成分,276个潜在基因靶点,其中与腰椎间盘突出症的共同靶点基因88个。PPI网络分析发现AKT1、IL6、JUN、MAPK、VEGFA、IL1B是独活寄生汤干预腰椎间盘突出症的核心靶点。GO富集分析明确了107个富集条目,主要涉及蛋白酶的激活、细胞因子的结合、DNA结合转录与RNA聚合酶Ⅱ特异性的富集形态;KEGG通路注释及富集分析筛选出了153条与独活寄生汤相关的蛋白通路,差异蛋白表达靠前的通路包括慢性炎症作用通路IL-17、促炎通路TNF及细胞凋亡信号转导通路等。结论：独活寄生汤配伍科学严谨,靶点覆盖全面,体现了中医的辨证论治与现代医学的“精准治疗”的科学内涵。独活寄生汤通过多靶点、多通路作用于腰椎间盘突出症,主要起到抗炎症免疫反应、细胞修复的作用,后期当进一步通过从分子、动物、临床等层面,借助计算机、体内、体外的一系列技术进行验证,为临床用药组方提供新思路。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症的分子作用机制

目的 运用网络药理学的研究方法,初步分析独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症(DLSS)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索和筛选独活寄生汤方药物的活性成分,同时在GeneCards、OMIM数据库中检索DLSS的靶点。利用Venny平台得到独活寄生汤治疗DLSS的潜在作用靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建独活寄生汤治疗DLSS的“单味药—活性成分—作用靶点”网络和蛋白质相互作用网络(PPI),并通过David数据库对独活寄生汤治疗DLSS的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究独活寄生汤治疗DLSS的作用机制,并通过分子对接来模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况。结果 共探索出独活寄生汤主要涉及1939个有效活性成分及对应292个潜在靶点,DLSS靶点1258个,筛选出共同靶点122个。经PPI互作图显示蛋白ALB、AKT1、IL-6、IL-1B、CASP3等存在较多连线。药物-活性成分-靶点网络图显示,度值较高的活性成分主要涉及柚皮素、芒柄花黄素、甘草查尔酮A、黄芩素等,被影响较多的靶点...     

仙灵骨葆胶囊治疗绝经后骨质疏松症的生物信息学和网络药理学分析和实验验证

目的：基于生物信息学和网络药理学挖掘仙灵骨葆胶囊(XLGB)治疗绝经后骨质疏松症(PMOP)的活性成分和作用机制。方法：采用生物信息学挖掘PMOP相关靶点,采用网络药理学筛选XLGB的活性成分并预测作用靶点,阐明XLGB治疗PMOP的相关靶点,富集分析其信号通路以探究分子机制。动物实验采用去卵巢SD大鼠动物模型,XLGB灌胃3月,检测骨密度,血清活性氧水平,TUNEL染色检测骨组织凋亡情况,蛋白质免疫印迹法检测骨组织内凋亡相关蛋白B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)表达量。结果：筛选出差异表达基因883个,筛选出XLGB活性成分119种,共预测1 734个靶蛋白。通过对XLGB和PMOP共有的26个共同靶点分析显示,AKT1、NFKB1、BAX等靶点及细胞凋亡、破骨细胞分化、cAMP、AMPK等信号通路起重要作用。XLGB组骨密度明显改善,血清活性氧水平降低,TUNEL染色显示XLGB可减少骨组织凋亡情况,提高抗凋亡蛋白Bcl-2、降低促凋亡蛋白Bax的水平。结论：XLGB治疗PMOP具有多成分、多靶点的特点,与调控细胞凋亡密切相关。     

基于网络药理学和蛋白质组学探讨加减血癥汤对浸润型胃癌的作用

目的通过网络药理学和蛋白质组学方法探讨加减血癥汤治疗浸润型胃癌的潜在作用机制。方法利用TCMSP检索加减血癥汤有效成分及其作用靶点, 采用高效液相色谱法串联质谱联用(HPLC-MS/MS)法测定浸润型胃癌的靶点, 加减血癥汤预测的靶基因与浸润型胃癌的靶点蛋白质数据进行维恩分析, 获取作用靶基因, 通过STRING获得蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI), 采用Cytoscape软件构建方剂-药物-化合物-基因网络, 通过DAVID数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果筛选出加减血癥汤中69个有效成分, 215个药物靶点;660个在浸润型胃癌过表达蛋白质, 10个药物靶点和基因靶点的共有靶点。PPI网络包括10个蛋白节点, 其中3个核心节点为CASP3、BCL2L1和STAT1。KEGG富集到11条通路, 包含PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、癌症中蛋白聚糖、细胞凋亡、Jak-STAT信号通路等。结论加减血癥汤可能通过PI3K-Akt信号通路、p53信号通路和Jak-STAT信号通路介导凋亡发挥抑制作用。本研究为加减血癥汤治疗浸润型胃癌作用机制的进一步研究提供理...     

基于网络药理学推测和分子生物学验证探讨半枝莲抗胰腺癌的活性成分及其作用机制

目的运用网络药理学预测和分子生物学验证探讨半枝莲抗胰腺癌的活性成分及其作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选半枝莲的活性成分和相关潜在靶点;应用毒性与基因比较数据库(CTD)、治疗靶点数据库(TTD)、药物基因组学知识库(PharmGKB)建立胰腺肿瘤靶点数据库;基于半枝莲潜在靶点与胰腺肿瘤靶点的匹配结果,构建PPI网络,拓扑分析筛选核心靶点;基于核心靶点的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析建立半枝莲抗胰腺癌的信号通路图;采用Westernblotting验证半枝莲中核心成分木犀草素对胰腺癌细胞PANC-1中P53、Bax和Bcl-2关键靶点的调控作用。结果共筛选出28种活性成分,包括槲皮素、木犀草素、汉黄芩素等;91个半枝莲作用靶点,经拓扑筛选获得24个核心靶点,涉及TP53、AKT1、JUN、VEGF等。GO功能富集分析显示,半枝莲作用靶点共涉及到73条生物学过程,KEGG通路富集筛选出18条信号通路参与胰腺癌的治疗,主要是通过NF-κB、p53、PI3K-Akt和VEGF信号通路来调节肿瘤炎性微环境、细胞周期阻滞、促细胞凋亡以及抗血管生成。分子生物学实验发现半枝莲中木犀草素可调节p53信号通路中关键靶点促进胰腺癌细胞的凋亡,证明了本研究中网络药理学分析结果的可靠性。结论初步证实了半枝莲具有多成分-多靶点-多途径协同作用的特点以及治疗胰腺肿瘤的潜在分子机制,为进一步探索其作用机制及临床应用奠定基础。     

基于网络药理学和生物信息学的旋覆代赭汤治疗胃食管反流病的作用机制研究

目的:采用网络药理学技术和生物信息学方法探讨旋覆代赭汤治疗胃食管反流病(GERD)的机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID、BAT-MAN数据库筛选旋覆代赭汤活性成分和预测靶点;通过GEO数据库和R语言分析GERD差异表达基因;通过TTD、DisGeNET、GeneCards数据库筛选GERD相关靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件构建化合物-靶点-疾病网络和靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;基于DAVID数据库和R语言进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选得到旋覆代赭汤活性成分382个、预测靶点2364个;GERD基因表达分析共获得差异基因1549个;获得GERD疾病靶点2996个,与旋覆代赭汤的交集靶点共816个;根据化合物-靶点-疾病网络和PPI网络的拓扑学分析结果,筛选出白桦脂醇、姜酮、槲皮素、延胡索乙素、葫芦巴碱等36个关键药效分子和E1A结合蛋白P300 (EP300)、磷脂酰肌醇3-激酶CA (PIK3CA)、肿瘤蛋白p53 (TP53)、蛋白激酶B1 (Akt1)、CREB结合蛋白(CREBBP)、信号传导及转录激活蛋白3 (STAT3)等164个关键靶点;富集到P0.05的GO条目1018个,涉及细胞增殖的阳性调节、细胞因子活动、炎症反应、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联等;富集到P0.05的KEGG通路183条,涉及内分泌抵抗、核转录因子-κB (NF-κB)信号通路、含血清素的神经突触、胃酸分泌、FoxO信号通路等。结论:初步探讨了旋覆代赭汤治疗GERD的潜在作用机制和有效活性成分,为旋覆代赭汤治疗GERD的后续研究提供依据。     

基于网络药理学探析生血补髓汤预测骨质疏松症的分子作用机制

目的 基于网络药理学方法探析生血补髓汤预测骨质疏松症的分子作用机制。方法 通过TCMSP和TCMID数据库检索生血补髓汤的活性成分和对应靶点；通过GEO DataSets数据库获取骨质疏松症GSE84500和GSE35958疾病芯片并合并数据；将生血补髓汤对应靶点与疾病差异基因取交集，获得生血补髓汤防治骨质疏松症预测靶点；利用Cytoscape 3.8.1软件构建“中药-疾病”可视化调控网络。交集基因导入STRING 11.0平台获得PPI网络，利用CytoNCA进行PPI拓扑分析。利用R语言对交集基因进行GO和KEGG富集分析。利用Dycharts平台绘制KEGG通路分类占比饼图。利用Cytoscape 3.8.1软件构建“成分-靶点-通路”可视化调控网络。结果 筛选得到生血补髓汤活性成分87个，包括槲皮素、木犀草素、山奈酚等；交集基因97个，PPI拓扑分析核心基因17个，包括血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。GO富集分析共得到条目1 645条；KEGG富集分析得到通路115条，主要涉及脂质...     

基于网络药理学探讨酸枣仁汤抗抑郁的作用机制

目的 采用网络药理学方法预测酸枣仁汤抗抑郁的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索酸枣仁汤的活性成分及相应靶点,在GeneCards、OMIM及DRUGBANK数据库获取抑郁症相关的靶点;使用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络;对交集靶点利用DAVID数据库进行基因本体论（GO）富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析;使用Cytoscape 3.7.1软件构建“酸枣仁汤-成分-靶点-通路”网络。结果 从酸枣仁汤中筛选出15个核心活性成分,涉及槲皮素、山柰酚、柚皮素等;32个核心靶点,涉及STAT3、JUN、AKT1、MAPK1等;GO富集得到的条目共276个[伪发现率（FDR）<0.01],KEGG富集得到114个信号通路（FDR<0.01）,涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路等。结论 此研究初步探讨了酸枣仁汤抗抑郁的多成分、多靶点、多通路作用机制,为抑郁症的治疗提供思路和参考。     

葛根芩连汤改善新型冠状病毒肺炎临床症状的网络药理学研究

目的采用网络药理学方法探索葛根芩连汤改善新型冠状病毒肺炎(COVID-19)临床症状的活性成分、靶标、作用通路。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取葛根芩连汤组方中每味中药的化学成分及作用靶点,结合Drug Bank查询干咳、发热及呼吸困难的作用靶点。运用Cytoscape软件构建化合物-靶点(基因)网络,通过DAVID将靶标进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果葛根芩连汤治疗干咳的化合物-靶点网络包含17个化合物及76个相应靶点,治疗发热的化合物-靶点网络包含18个化合物及65个相应靶点,改善呼吸困难的化合物-靶点网络包含20个化合物及45个相应靶点,均涉及ADRA1B、ADRB2等关键靶点。以P0.05为筛选条件,GO功能富集分析得到77个涉及干咳的条目,8条KEGG信号通路;93个与发热有关的GO条目,19条KEGG信号通路;18个关于呼吸困难的GO条目,7条KEGG信号通路。ADRB2与各核心化合物进行分子对接,结果显示ADRB2与化合物5,2,6-三羟基-6,7甲氧基黄酮、黄芩黄酮Ⅱ、维斯托尔具有较好的亲合力。结论网络药理学研究表明葛根芩连汤可有效治疗COVID-19引发的干咳、发热及呼吸困难,可为葛根芩连汤临床应用和COVID-19药物的研发提供参考。     

基于“成分-靶点-通路”的鹿茸网络药理学研究

目的:基于网络药理学研究鹿茸活性成分-靶点-通路及其药理机制。方法:利用网络药理学分析平台(BATMAN-TCM)获取鹿茸活性成分及其对应靶点;利用STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用ClueGO插件对关键靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集;利用Metascape数据库分析靶点的(KEGG)信号通路。结果:获得17-β-雌二醇、α-雌二醇、视黄醇、雌酮等14个成分及306个靶点,发现了MED1、ADCY1、RXRA、CXCR4、ESR1、DRD2等26个关键靶点。ClueGO分析57个GO生物过程得到G蛋白耦合受体蛋白信号通路的负调节、一氧化氮生物合成、前列腺发育等7个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及癌症、内分泌系统、癌症特定类型、抗肿瘤耐药性、免疫系统、物质依赖、信号转导等7大类68条信号通路。结论:鹿茸是通过多成分、多靶点、多信号通路协调发挥治疗疾病作用,其中在治疗骨质疏松症和抗肿瘤方面具有潜在的优势。     

基于网络药理学及分子对接探讨杜仲叶防治骨质疏松的作用机制

目的：采用网络药理学-分子对接预测杜仲叶防治骨质疏松症的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction分析平台对杜仲叶活性成分及作用靶点进行筛选,使用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)对骨质疏松症的对应靶标进行筛选,将中药靶基因与疾病靶基因相交集,将交集靶点导入Cytoscape软件构建成分靶点网络,使用STRING分析平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。对中药-疾病共同靶标进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路,最后运用AutoDock与Pymol软件对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果：筛选后得到杜仲叶治疗防治骨质疏松症的有效成分7个,杜仲叶-骨质疏松症共同靶标231个,并推断其作用机制可能与动脉粥样硬化信号通路的下游核因子κB信号通路,MAPK信号通路、TNF、PI3K-AKT、IL-17及HIF-1信号通路等有关,且MAPK1、STAT...     

基于网络药理学的麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘作用机制

目的利用网络药理学技术,探索麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取麻黄、甘草的化学成分及其作用靶点,UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,通过OMIM数据库获取哮喘相关靶点,将疾病靶点与药物靶点进行交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白。利用Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,通过Cytoscape软件构建"中药活性化合物-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果筛选出115个活性成分,12个作用于小儿哮喘的蛋白靶点;GO富集(P0.01)提示有24个生物过程条目、3个分子功能条目、3个细胞组分条目,KEGG富集29条通路(P0.01),关键靶点包括TNFRSF1A、TNF、IKBKG、TP53、NFKBIA、IKBKB等,关键通路包括细胞凋亡、NF-κB信号通路、TNF信号通路、小细胞肺癌、脂肪细胞因子信号通路、RIG-I样受体信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等。结论该研究通过网络药理学初步揭示了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的多维调控网络,从多角度探索了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的潜在分子机制及药理作用,为其的临床应用提供了理论依据。     

基于网络药理学及分子对接探讨苏子降气汤治疗哮喘的潜在机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术预测并验证苏子降气汤治疗哮喘的作用机制。方法：通过TCMSP和UniProt数据库预测苏子降气汤的活性成分及靶点，根据GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选哮喘相关靶点，利用Venny 2.1平台筛选中药和疾病共同基因，利用Cytoscape 3.9.1进行可视化分析；利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图，利用Bioconductor数据库和R版本4.1.3 (64 bit)软件进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，并通过Autodock软件对核心成分及靶点进行分子对接。结果：筛选出54种化合物，257个靶点，涉及哮喘的治疗靶点共134个。其中槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA、黄芩素等为关键活性成分。丝裂原激活蛋白激酶14(MAPK14)、表皮生长因子受体(FGFR)、原癌基因蛋白(MYC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)、肿瘤蛋白P53(TP53)为关键基因靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得到人巨细胞病毒感染、MAPK信号通...     

基于网络药理学与分子对接技术的化湿败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎作用机制及活性成分筛选研究

目的:采用网络药理学与分子对接技术相结合的方法研究化湿败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制及活性成分筛选。方法:采用中药系统药理学分析平台筛选化湿败毒颗粒活性成分及预测作用靶点,与OMIM和Gene Cards数据库筛选的病毒及肺炎靶基因取交集,得到潜在靶基因。利用Cytoscape软件构建“化合物-靶点”网络并进行分析。取平均度数较高的重要活性成分分别与3CLpro、ACE2及RdRp 3种靶蛋白采用AutoDock Vina进行分子对接,筛选关键活性成分。采用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析化湿败毒颗粒的作用机制。结果:化湿败毒颗粒作用“化合物-靶点”网络包含123个化合物和237个相应靶点,关键靶点涉及PTGS2、PTGS1、ESR1、NCOA2、AR、NOS2、PPARG、SCN5A、PRSS1等。GO功能富集分析得到GO条目1 147个(P0.05),KEGG通路富集筛选得到170个通路(P0.05),涉及AGE-RAGE、IL-17、TNF、C-type lectin receptor及HIF-1等信号通路。分子对接结果显示:Kaempferol、Baicalein等与3CLpro蛋白亲和力较好;Stigmasterol、Shinpterocarpin等与ACE2蛋白亲和力较好;Beta-sitosterol、Shinpterocarpin等与RdRp蛋白亲和力较好。结论:采用网络药理学与分子对接技术相结合的方法筛选化湿败毒颗粒抗COVID-19关键活性成分并对其作用机制进行了分析,可为治疗化湿败毒颗粒的临床应用提供参考。     

白头翁汤治疗溃疡性结肠炎分子机制的网络药理学分析及初步验证

该文通过网络药理学分析白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的分子机制,并通过动物实验对相关靶点作初步验证。应用Cytoscape软件,通过TCMSP,GeneCards,Uniprot数据库构建"活性成分-靶点-疾病"网络。通过STRING数据库构建蛋白互作网络,推测核心靶点。使用R软件对靶点进行GO,KEGG富集分析。使用Autodock Vina软件对活性成分和核心靶点进行分子对接。用白头翁汤干预葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导UC小鼠,通过HE染色法观察小鼠结肠的病理改变,通过免疫组化分析相关基因的表达情况。结果表明,通过网络药理学从白头翁汤中找到26个有效成分,30个核心靶点。GO富集分析显示,这些基因主要影响核受体的活性、转录因子的活性、类固醇激素受体活性、泛素样蛋白连接酶结合、蛋白质异二聚化活性、转录辅助因子的结合等生物过程。KEGG富集分析显示,P53信号通路、EGFR信号通路、TNF信号通路、PI3K-AKT信号通路和一些癌症相关通路基因富集较多。分子对接显示,与有效成分对接较好的基因有EGFR,PPARG,CASP3,NOS3,caspase-9,CCND1,ADH,IL6,NFKB1。实验验证白头翁汤对小鼠结肠病理有改善作用,EGFR是其作用的靶点之一。该研究证明白头翁汤可通过多靶点、多通路治疗UC,为未来研究提供了理论依据。     

基于网络药理学探讨固本止崩汤对功能失调性子宫出血的机制研究

目的:运用网络药理学的方法探讨固本止崩汤对功能失调性子宫出血的可能性机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台筛选固本止崩汤的活性成分并预测其潜在作用靶点,将获得靶点导入UNIPROT数据库进行基因的标准化处理;在GeneCards和OMIM数据库查找功能失调性子宫出血的相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,将二者交集靶点运用STRING平台分析蛋白间的相互作用关系。用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体（GO）生物功能和富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并以图表形式展示。结果:以口服生物利用度(OB)和类药性(DL)2个筛选标准得到固本止崩汤中有效活性成分58个,得到靶点135个;在GeneCards和OMIM查找功能失调性子宫出血靶点共2 164个,韦恩图获得药物与疾病的交集靶点共85个,关键靶点涉及IL6、VEGFA、TP53、TNF、EGF等。以P富集分析得到GO条目135条,其中生物过程38条、分子功能36条、细胞组分61条,主要涉及对缺氧的反应、一氧化氮生物过程的正向调节、细胞外空间、细胞外区域、酶结合、类固醇结合等;KEGG富集分析得到25条通路(P<0.05,FDR＜0,05),靶基因主要富集在癌症信号通路等信号通路中。结论:固本止崩汤治疗功能失调性子宫出血具有多成分、多靶点、多通路的特点,其作用机制较为复杂,为后续的实验验证提供物质基础和理论依据。     

基于网络药理学探讨健脾清化方改善2型糖尿病胰岛素抵抗的作用机制和分子靶点

目的利用网络药理学探索健脾清化方改善2型糖尿病胰岛素抵抗(IR)的作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取健脾清化方的活性成分和作用靶点。通过分析IR患者与胰岛素敏感者的差异表达基因,获得IR相关靶点。构建靶点蛋白质相互作用(PPI)网络并将结果可视化;对交集靶基因进行GO与KEGG功能富集分析,构建基因通路网络筛选关键靶基因。结果健脾清化方中共鉴定出114种活性化合物和273个对应靶点;在IR患者和对照组之间筛选出472个差异表达基因(P0.05,|log2(fold change)|0.5),获得16个与IR相关的靶基因。目的基因的生物学过程与小分子物质代谢过程、氧化应激、酒精代谢、脂质代谢等过程相关,涉及肝脏代谢通路、前列腺癌信号通路、酪氨酸代谢相关通路、脂质分解代谢通路等。预测AR、ADH1C、ADH1A、GSTP1、NFKBIA、APP和HSPB1共7个基因是健脾清化方改善IR的关键靶基因。结论健脾清化方对外周和中枢的IR改善作用可能与特定的生物学过程和相关途径调节有关。     

基于网络药理学探讨中药金银花治疗痤疮的作用机制

目的：基于网络药理学的研究思路及方法探索中药金银花治疗痤疮的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选金银花活性成分及对应靶点,利用GeneCards、OMIM、TTD数据库进行检索得到与痤疮有关的靶点基因,通过Venny 2.1.0得到药物与疾病的共同靶点。借用Cytoscape 3.9.0绘制金银花活性成分-相关靶点网络图,采用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,将药物-疾病共同靶点通过Metascape数据库分别进行基因本体论（GO）富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：本研究共筛选得出槲皮素、木犀草素、豆甾醇、山柰酚以及β-谷甾醇等23个活性成分,药物靶点211个,痤疮相关靶基因612个,主要涉及主要涉及肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）、白蛋白（Albumin,ALB）、白细胞介素（Interleukin,IL）-6、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、IL-1β、基质金属蛋白酶9(Matrix Metallopeptidase 9,MMP9)等43...     

独活寄生汤治疗绝经后骨质疏松症疗效及安全性的Meta分析

目的:系统评价独活寄生汤治疗绝经后骨质疏松症(PMOP)的疗效和安全性.方法:计算机检索万方、中国知网、维普、CBM、PubMed、Embase、Web of Science、EBSCO数据库,纳入独活寄生汤治疗PMOP的随机对照试验(RCTs)文献并提取数据,运用Cochrane标准评价文献质量,使用软件Revman...     

加减苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的网络药理学机制

【目的】 采用网络药理学方法探讨加减苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的作用机制。【方法】 使用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选加减苍附导痰汤中中药的活性成分,通过UniProt数据库获得活性成分可能的作用靶点,应用GeneCards数据库获得多囊卵巢综合征的作用靶点,利用R数据包VennDiagram对加减苍附导痰汤潜在活性成分靶基因和多囊卵巢综合征相关的靶基因制作韦恩图,筛选交集基因,并将交集的基因构建蛋白相互作用网络,最后利用 R 数据包colorspace、stringi、DOSE、clusterProfiler、pathview 对交集靶基因进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路分析,并用 Omicshare 在线制图软件将其结果可视化。【结果】 筛选出加减苍附导痰汤活性成分159个,预测获得与多囊卵巢综合征相关靶点2 270个,蛋白相互作用网络筛选出关键靶点89个。其主要与细胞炎症、增殖、分化、凋亡等生物学过程有关,可以作用于动脉粥样硬化信号通路、甲状腺激素信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）信号通路、P53信号通路、内分泌拮抗信号通路、催乳素信号通路、雌激素信号通路中的关键靶点。【结论】 加减苍附导痰汤治疗多囊卵巢综合征的作用机制与抑制炎症、凋亡、内分泌调节、组织稳态调节等途径有关。