奥密克戎毒株最新权威解答

<正>当前,多地报告发现奥密克戎变异株感染病例,引发广泛关注。针对奥密克戎变异株,国家卫生健康委组织中国疾控中心专家就有关问题作了最新解答:奥密克戎变异株的发现和流行情况2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒变异株。11月26日,世界卫生组织(WHO)将其命名为Omicron (奥密克戎)变异株。全球新冠病毒数据库GISAID显示,截至2022年1月17日,     

严防奥密克戎新变异株输入

当前全球新冠肺炎新增确诊病例仍在增加,我国实施的“外防输入,内防反弹”措施将有利于及时发现输入我国的奥密克戎变异株。一、什么是奥密克戎变异株2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒变异株,11月26日,WHO将其列为“需要关注”的变异毒株,并以希腊字母“奥密克戎”命名,定义为奥密克戎变异株。     

应高度关注新型冠状病毒变异株奥密克戎

目前,新型冠状病毒在全球流行,已经出现多种流行变异株,给社会带来巨大危害.2021年11月26日,世界卫生组织将B.1.1.529变异株列为"关切变异株",用希腊字母Omicron表示,这也是全球第五种"关切变异株".奥密克戎变异株已经在南非、美国和英国等国广泛流行,引起人们高度关注.本文就奥密克戎变异株的发现与流行、...     

新型冠状病毒奥密克戎变异株临床特征和防控对策

奥密克戎(Omicron)变异株为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的最新变体,自发现后在全球引起广泛传播。该变异株具有传染力强、传播速度快,短距离内引起广泛传播等特性,同时具有疫苗逃逸能力。了解病毒的临床特点及流行现状,并进行针对性预防是控制疫情的重要措施。本研究将对Omicron的流行现状、传播特征、致病机制、临床特征、疫苗的有效性和防控措施进行综述,以期为COVID-19的疫情防控提供参考。     

厦门市境外输入新冠病毒奥密克戎变异株基因组特征分析

目的 分析厦门市输入性新冠病毒奥密克戎（Omicron）变异株的基因组序列特征,为防控境外输入性Omicron变异株引起的本土疫情提供理论依据。方法 采集厦门市2021年12月—2022年2月输入的144例新冠肺炎病例鼻拭子样本,用二代测序技术进行新冠病毒基因组测序,对获取的全基因组序列进行变异位点检测,并基于邻接法用Mega软件构建进化树。结果 去除低质量序列后,共获得119例病例的组装完整的病毒基因组序列,1×覆盖度99.3%～99.6%。Pangolin分型显示,共鉴定出17个Omicron变异型,包括11个BA.1及其分支,6个BA.2及其分支。共发现149个核苷酸突变位点,71个新发氨基酸突变位点：其中ORF1ab区50个、S蛋白区4个、ORF3a区6个、ORF7a区2个、ORF8区2个、N蛋白区7个。在S蛋白的受体结合域关键位点上未发现变异。结论 在Omicron变异株流行初期,揭示了厦门市输入性Omicron变异株病毒序列的基因组变异特征,为持续监测新冠病毒基因组变异奠定了基础。     

新型冠状病毒疫苗对奥密克戎变异株免疫保护效果研究进展

新型冠状病毒（新冠病毒）奥密克戎变异株自2021年11月被发现后,快速地在世界各地广泛传播,目前已成为全球新冠病毒传播的主要流行毒株。在奥密克戎变异株大流行的背景下,以新冠病毒原型株为基础构建的新型冠状病毒疫苗（新冠病毒疫苗）对奥密克戎变异株感染的免疫保护效果成为了全球关注的焦点,许多学者围绕不同类型新冠病毒疫苗及不同免疫策略开展了新冠病毒疫苗对奥密克戎变异株免疫保护效果的研究,以观察疫苗对奥密克戎变异株感染的保护作用。本文系统地概述了2021年11月1日 — 2022年7月26日发表的关于新冠病毒疫苗对奥密克戎变异株免疫学效果和保护效果的研究报道,为新冠病毒疫苗接种策略的优化调整及其研发等公共卫生决策提供参考依据。     

新冠病毒奥密克戎变异株的特点与防控措施

自2021年11月新型冠状病毒奥密克戎变异株出现以来,几个月内迅速席卷全球。世界各国都出现了以奥密克戎为主要流行毒株的新一轮疫情,我国香港、深圳、上海等城市也未能幸免。奥密克戎刺突蛋白含有大量突变,具有强大的免疫逃逸能力,对现有的疫苗和抗体相关治疗造成了巨大的威胁。虽然奥密克戎变异株引起的疾病症状较轻,但由于其超高的传播率,全球卫生系统均承受了巨大的压力。本文就奥密克戎变异株的病原学特征、变异来源、传播特征、流行现状及防治措施等方面进行综述,以期为科学防控提供参考。     

2022年底新型冠状病毒奥密克戎变异株流行期新生儿感染的临床特征

目的 分析2022年底新型冠状病毒奥密克戎变异株流行期新生儿感染的临床特征,为临床新生儿新型冠状病毒感染处置提供参考。方法 选取2022年12月17日-2023年1月9日厦门大学附属妇女儿童医院收治的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染新生儿为研究对象,回顾性分析新生儿感染病例的实验室检查结果及临床特征。结果 共纳入100例新型冠状病毒感染患儿,年龄为17.5(8.3,22.0)日龄,出生胎龄39.3(38.4,40.1)周,出生体质量3 165(2 991,3 522)g; 100例患儿中轻型84例,15例普通型,1例重型;患儿均有明确接触史,大部分为水平传播获得感染;临床表现以发热为主(91.0%),间断发热2.5(1.5,3.0)d; 40例(40.0%)合并呼吸系统症状,23例(23.0%)有消化系统症状;实验室检测WBC计数未见明显升高,C-反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)绝大部分在正常范围内;患儿年龄、体温与住院时间均呈负相关(P<0.05),发热时间与住院时间呈正相关(P<0.05),但相关关系均不密切;出生体质量、胎龄和最初病毒载量均与住院时间不相关。结论 ...     

奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨

目的 通过奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨,为发现阳性病例和混采检测阳性、院内发现密切接触者等人员、急诊患者出现阳性病例、医院工作人员出现阳性病例等特殊情景下应急处置工作提供导则。方法 复盘山东省本轮新冠肺炎疫情流行以来各地卫生健康行政管理部门和医疗机构的应对行为与政策举措,总结应急处置过程和暴露的短板,探讨应对策略。结果 建立健全区域性、系统性医院感控应急预案体系,树立医疗机构感控意识和提升组织管理能力、风险管控能力、个人防护能力,制定医疗机构感染防控的应急处置指引。结论 本次奥密克戎变异株流行形势下医疗机构感染防控策略探讨,暴露出医疗机构疫情防控中的短板和弱项。应整合与组织资源的能力和医疗服务保障能力,推动医院感染精准防控,做好人力短缺调配,保障重点科室服务延续性,实现协调联动、协同治理。     

2022年河南省安阳市本土新型冠状病毒奥密克戎变异株基因组特征

目的 分析安阳市本土新型冠状病毒（新冠病毒,SARS-CoV-2）奥密克戎（Omicron）变异株基因组特征,为掌握安阳市新冠病毒感染的变异变迁特点提供科学依据。方法 通过对2022年11月安阳市报告的13例本土新冠病毒感染病例咽拭子样本进行三代纳米孔测序,获得全基因组序列,应用在线分析平台,判断病毒型别;利用MEGA 11.0软件进行序列比对和分析,构建系统进化树,鉴定特异性变异位点,分析病毒的分子学特征。结果 13株新冠病毒均为Omicron变异株,基因组序列长度分别为29 615 nt～29 752 nt,覆盖度为99.1%～99.7%,共有103个核苷酸突变位点,94个氨基酸突变位点,突变位点分布在新冠病毒的8个基因编码区、5’端非编码区和3’端非编码区;其中S蛋白的突变对新冠病毒变异的影响最大,R346T和C1243F是BF.7.14在S蛋白上特有的氨基酸变异位点,T883I是BA.5.2.49特有的氨基酸变异位点,Q241K是DY.2特有的氨基酸变异位点。13条序列在Pangolin数据库上的分型分别为DY.2、BA.5.2.49和BF.7.14,Nextclade进化分析...     

输入性新冠病毒奥密克戎XBB.1型全基因组测序及特征

目的 针对江苏口岸1例境外输入性新冠病毒（SARS-CoV-2）感染者咽拭子样本,通过二代测序技术进行全基因组测序及序列分析,掌握输入性SARS-CoV-2基因型及分子特征,为口岸新冠病毒防控提供理论支持。方法 通过荧光定量PCR和二代测序技术对入境感染者咽拭子样本进行新冠病毒核酸检测,对Ct≤32的阳性样本开展全基因组测序。结果 获得1株输入性SARS-CoV-2全基因组序列（GenBank:OQ048285）,基因组全长29 772 bp,基因型为奥密克戎XBB.1型。与参考毒株（GenBank:NC＿045512.2）相比,该毒株有56个碱基位点缺失,有88个位点发生了替换;氨基酸缺失位点有13个,突变位点有63个。结论 奥密克戎XBB.1型是江苏口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型,为当地口岸新冠病毒的防控及分子溯源提供重要技术支持。     

某新冠定点救治医院新型冠状病毒奥密克戎变异株环境污染调查

 目的 评估新型冠状病毒奥密克戎变异株对病区公共环境及医务人员个人防护用品的污染情况。方法 对某新冠定点救治医院病区公共区域、脱卸区域和个人防护用品进行采样,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测新型冠状病毒核酸并报告Ct值,分析个人防护用品新型冠状病毒阳性相关因素。结果 共采集病区公共区域环境标本100份,病区公共区域环境新型冠状病毒核酸检测总阳性率为30.00%,脱卸区电梯地面、走廊公共区域地面、脱卸电梯按钮新型冠状病毒核酸检测阳性率最高,分别为60.00%、60.00%、40.00%。一脱区和二脱区新型冠状病毒核酸检出率分别为18.33%、1.67%。48.33%的工作人员个人防护用品检出新型冠状病毒核酸,其中外层鞋套鞋底、外层手套和防护服检出率最高,分别为35.00%、21.67%、8.33%。单因素分析结果显示医生岗位和高风险操作医务人员个人防护用品新型冠状病毒核酸检测阳性率高(均P<0.05)。结论 新型冠状病毒奥密克戎变异株对病区公共环境、一脱区和个人防护用品可造成不同程度污染,做好个人防护和定期环境清洁消毒,可以降低医务人员感染风险。     

一起由新型冠状病毒奥密克戎BA.2.76变异株引起的暴发疫情特征分析

目的 分析2022年9月四川省遂宁市发生的一起新型冠状病毒肺炎本土疫情特征,为遂宁市的疫情防控提供参考依据。方法 收集本次疫情相关资料,对感染者的流行病学特征进行描述性分析。结果 本起疫情持续15 d,共报告205例感染者,男性85例,女性120例,年龄中位数M(P25,P75)为52(34.5,60)岁;无症状感染者90例,确诊病例115例（轻型106例、普通型3例、重型4例、危重型2例）,无死亡病例报告。病毒基因测序为奥密克戎变异株BA.2.76,未完成新冠疫苗加强免疫组患重症的比例为2.44%,高于完成新冠疫苗加强免疫组的0.49%;未完成新冠疫苗加强免疫组首次核酸阳性ORF1ab靶标为25.10、N靶标Ct值中位数为25.10,均低于完成新冠疫苗加强免疫组的29.30和28.45。结论随着防控措施的落实,疫情得到快速有效控制。新冠疫苗加强免疫可以有效降低感染者体内病毒载量,减少重症病例的发生。     

中山市一起奥密克戎变异株新冠感染聚集性疫情调查

目的 对中山市2022年一起奥密克戎(Omicron)变异株新冠感染聚集性疫情及关联个案开展调查,理清传播链、了解个案暴露与传染期,为疫情处置提供依据。方法 收集该起疫情报告个案及关联个案发病时间、初筛阳性时间、暴露史等信息,用Drawin软件绘制传播链图;针对单次暴露传播案例,描述个案暴露时间和二代传播发生时间的间隔。结果该起疫情首发个案发病前7 d均在中山市三角镇,基因测序提示为奥密克戎变异株BA.2.2进化分支,与采样时间2022年6月来自香港地区的序列最相近,推测本起疫情可能为香港地区输入;疫情累计报告65例,其中中山市29例、外省市36例,所有个案均在同一条传播链。疫情于7月9日发现,首例7月3日发病,疫情在中山市持续15 d,传播5～6代,6 d实现社会面清零;疫情集中在7个家庭,家庭以外的传播场所包括奶茶店、医疗机构、餐厅和网约车等。2例阳性个案通过医疗机构、网约车和餐厅同时空传播给12个人,两代个案暴露时间差中位数68 h(40～123 h)。结论 面对源头不清晰的本土聚集性疫情,中山市快速响应,75.9%的个案在管控人群中发现;病毒传播链被快速阻断,未发生大规模社区传...     

新冠病毒奥密克戎变异株流行下的方舱医院后勤管理探索

为满足新冠感染者病例骤增和隔离收治要求,方舱医院在新冠病毒感染者的救治中起到了重要作用。本轮上海疫情主要由于新冠病毒奥密克戎变异株的流行,因此在疫情传播控制方面的要求更高,对方舱医院后勤管理更应当格外重视。作者团队先后参与了上海漕宝路方舱医院及西岸A馆方舱医院的筹建及运行管理,提出了“一体、二分、三定、四急、五备”的管理原则,在实际运行中着重贯彻全员一体化与岗位个体化管理,并在2022年8月的海南三亚抗疫实践中取得成功,为今后疫情防控中的方舱医院后勤管理提供重要参考。     

河南省某定点医院356例14岁以上新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者临床特征

目的 分析新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的临床特点,为疫情防控和患者诊疗提供参考依据。方法 纳入2022年1月12日至2月22日全程在安阳市第五人民医院住院的大于14岁、有完整病历资料的356例奥密克戎变异株感染者,收集其临床表现和血常规检测资料,分析其临床特点。结果 356例感染者,平均年龄(28.00±16.18)岁,男性150例,女性206例。15～20岁感染者中女性占51.12%,低于20岁以上女性占比的69.17%(χ²=13.11,P<0.05)。轻型和普通型分别为256例(71.91%)和100例(28.09%),无重症和死亡。临床表现以上呼吸道症状和低到中等度发热为主,咽干咽痛、咳嗽、鼻塞流涕和发热分别为57.02%、37.08%、35.39%和26.40%。普通型病例发热占38.00%,高于轻型病例的21.88%(χ²=9.62,P<0.05)。42例(11.80%)病例外周血白细胞低于正常值,30例(8.43%)淋巴细胞低于正常值。轻型病例外周血白细胞值为(3.18±0.29)×10⁹/...     

上海某方舱医院新型冠状病毒 奥密克戎变异株感染者流行病学特征分析

[摘要]　目的　探讨上海某方舱医院新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的发病情况及流行病学特征。方法　以2022年4月9日—5月5日上海国家会展中心方舱医院收治的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者为研究对象,对感染者年龄、性别、地区、疫苗接种等疫情数据进行流行病学特征分析。结果　122 151例新型冠状病毒感染者均为奥密克戎变异株BA.2或BA.2.2亚型感染,其流行病学特征结果显示：患者男女比例为1.51:1;平均年龄为（44.91±15.38）岁;0～17岁、18～30岁、31～60岁和≥61岁感染者分别占4.74%、20.80%、62.52%和11.94%;无症状感染者占80.80%,轻型患者占19.20%;平均住院时间为（7.00±2.77）d;未接种和完成1、2和3次疫苗接种的感染者分别占20.30%、3.18%、31.30%和45.22%,其中≥61岁且完成3次疫苗接种的感染者仅占10.10%。结论　各个年龄段人群对于新型冠状病毒奥密克戎变异株普遍易感。无症状感染者是本次疫情的主体人群,临床症状不典型,早期隐匿传播,积极加强核酸检测是早期发现疫情的必要手段。     

新冠病毒变异株奥密克戎的变异特点及对免疫学特性的影响

  目的   分析奥密克戎变异株流行期浙江省老年新型冠状病毒肺炎（COVID-19）本土感染者流行特征,为完善老年人群本土奥密克戎疫情防控工作提供依据。  方法   通过中国疾病预防控制信息系统收集2022年3月1日 — 4月30日浙江省 ≥ 60岁COVID-19本土感染者个案资料,结合现场流行病学调查信息,统计描述感染者的流行特征以及临床症状严重程度。  结果  共报告 ≥ 60岁COVID-19本土感染者163例,其中确诊病例82例,占50.31 %;无症状感染者81例,占49.69 %。确诊病例中轻型69例,占84.15 %;普通型13例,占15.85 %;无重型/危重型及死亡病例报告。感染者男女比为0.92 : 1;年龄最小60岁,最大95岁,中位年龄68岁;职业以非社会就业人员为主,共113例,占69.33 %;75例患有基础性疾病,占46.01 %;93例完成新冠病毒疫苗加强免疫接种,占57.06 %;发现方式以集中隔离为主,共114例,占69.94 %。与无心脑血管疾病组相比,心脑血管疾病组普通型（以无症状感染者为参照）构成比更高（P = 0.008）;与未完成新冠病毒加强免疫接种组相比,加强免疫接种组普通型（分别以无症状感染者、轻型为参照）构成比更低（P = 0.015;P = 0.012）。  结论   推进老年人新冠病毒疫苗加强接种以及加快研制更具针对性的奥密克戎疫苗具有重要意义;奥密克戎变异株流行期老年感染者总体症状较轻,仍需关注其病情变化,并应重视老年人日常社区生活和职业相关疫情风险环节,提高疫情早期发现和管控能力。     

山东省新型冠状病毒奥密克戎变异株阳性感染者疾病严重程度影响因素分析

目的 探讨新型冠状病毒(以下简称新冠病毒)奥密克戎变异株感染者的疾病严重程度及其影响因素,为制定针对性防控措施提供科学依据。方法 回顾性收集2022年1月1日-5月30日山东省部分地市新冠病毒肺炎定点医院收治的奥密克戎变异株感染者资料,按疾病严重程度进行临床分型,分析不同年龄、核酸转阴时间、住院时间、接种新冠病毒疫苗剂次感染者的疾病严重程度差异。采用多因素二元logistic回归分析奥密克戎变异株感染者疾病严重程度的影响因素。结果 共纳入新冠病毒奥密克戎变异株感染者573名,临床分型包括无症状感染者315人(55.0%)、轻型感染者214人(37.3%)、普通型感染者44人(7.7%)、重型感染者0人(0%)。已进行疫苗加强接种397人(69.3%),未进行加强接种176人(30.7%)。573名感染者中,83.6%(479/573)的感染者年龄集中在18～69岁年龄段。不同年龄段感染者的疾病严重程度差异有统计学意义(χ²=17.775,P<0.01),不同核酸转阴时间感染者的疾病严重程度差异有统计学意义(χ²=13.693,P<...     

1株境外输入性新冠病毒奥密克戎BQ.1.1全基因组测序及特征分析

目的 针对1例境外输入性新冠病毒感染者咽拭子样本开展全基因组测序,掌握输入性新冠病毒基因组特征,为口岸新冠肺炎疫情防控提供科学依据。方法 对1例从江苏口岸入境的输入性新冠病毒感染者的咽拭子样本,用二代测序技术进行全基因组测序,并通过生物信息学软件进行序列分析并构建进化树。结果 获得1株输入性新冠病毒全基因组序列（GenBank No. OP804248）,基因组全长29 762 bp,基因分型结果显示为奥密克戎BQ.1.1型。与原始毒株（GenBank No. NC＿045512.2）相比,该毒株共有78个碱基发生了突变,59个区域发生了缺失;氨基酸突变有62个,氨基酸缺失14个。结论 奥密克戎BQ.1.1型为江苏口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型,为当地口岸新冠病毒的溯源及防控提供重要科学依据。