结直肠癌C-erbB-2基因启动子CpG岛甲基化状态及其与C-erbB-2蛋白表达的关系

目的了解结直肠癌组织C—erbB-2基因启动子区CpG岛甲基化状态、C-erbB-2蛋白表达水平及两者之间的关系。方法取经病理确诊的43例结直肠癌组织和相应癌旁组织，分别用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）和免疫组织化学法（IHC）检测C-erbB-2启动子区CpG岛的甲基化和C-erbB-2蛋白表达水平。结果癌组织和癌旁组织中C—erbB-2启动子区CpG岛甲基化率分别为44．2％和74．4％，差异具有统计学意义（P=0．004）。癌组织和癌旁组织中C—erbB-2蛋白过度表达率分别为67．4％和27．9％，差异具有统计学意义（P=0．000）。C—erbB-2蛋白表达水平与肿瘤分期相关。结直肠癌组织C—erbB-2启动子区CpG岛甲基化状态与C—erbB-2蛋白表达水平呈显著相关（r=0．331，P=0．03）。结论结直肠癌中C—erbB-2基因启动子区CpG岛的低甲基化可能在C—erbB-2蛋白过度表达中起一定作用，有望成为有用的肿瘤分子诊断标记和治疗靶点。     

结直肠癌C-erbB-2基因启动子CpG岛甲基化状态及其与C-erbB-2蛋白表达的关系

目的了解结直肠癌组织C-erbB-2基因启动子区CpG岛甲基化状态、C-erbB-2蛋白表达水平及两者之间的关系。方法取经病理确诊的43例结直肠癌组织和相应癌旁组织,分别用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和免疫组织化学法(IHC)检测C-erbB-2启动子区CpG岛的甲基化和C-erbB-2蛋白表达水平。结果癌组织和癌旁组织中C-erbB-2启动子区CpG岛甲基化率分别为44.2%和74.4%,差异具有统计学意义(P=0.004)。癌组织和癌旁组织中C-erbB-2蛋白过度表达率分别为67.4%和27.9%,差异具有统计学意义(P=0.000)。C-erbB-2蛋白表达水平与肿瘤分期相关。结直肠癌组织C-erbB-2启动子区CpG岛甲基化状态与C-erbB-2蛋白表达水平呈显著相关(r=0.331,P=0.03)。结论结直肠癌中C-erbB-2基因启动子区CpG岛的低甲基化可能在C-erbB-2蛋白过度表达中起一定作用,有望成为有用的肿瘤分子诊断标记和治疗靶点。     

ABO基因启动子CpG岛甲基化与白血病的相关性

近年来研究发现ABO血型与许多疾病的发生发展相关，某些肿瘤导致A、B血型物质减少的现象已日益引起关注。本研究探讨ABO基因启动子CpG岛甲基化与白血病的相关性。采用流式细胞仪和激光共聚焦显微镜检测了不同血型的健康人群和各种血液病患者外周血红细胞表面ABH抗原的相对含量，用PCR和MSP—PCR分别检测血液病患者和健康人ABO基因启动子DNA序列和CpG岛甲基化，以及ABO基因启动子-102位点的甲基化。结果发现，白血病患者均出现不同程度的A、B抗原减少；通过对比检测健康人和患者的ABO基因启动子序列，未发现有序列的不同，说明启动子序列高度保守；利用重亚硫酸盐对DNA样本进行修饰后，通过对健康人和患者的ABO基因启动子序列进行扩增和测序，发现健康人和再生障碍性贫血患者在ABO基因启动子的CpG岛区没有甲基化的位点，而急性髓性白血病（AML）、急性淋巴细胞白血病（ALL）、慢性粒细胞白血病（CML）和部分骨髓增生异常综合征（MDS）患者在位置为-102、-101、-100、-99和-97位置的C碱基均有甲基化的现象。结论：甲基化是造成白血病患者AB抗原下降的原因；-102、-101、-100、-99和-97这几个甲基化位点有可能是白血病的特异性表现；针对-102住点检测结果提示-102位点是否甲基化有可能作为白血病鉴别诊断中一个有意义的分子标识物。     

TFPI-2基因CpG岛甲基化与胰腺癌的关系

目的:检测胰腺癌组织组织因子途径抑制物-2(TFPI-2)基因CpG岛甲基化的状态,并分析甲基化改变与胰腺癌的关系。方法:应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测45例胰腺癌组织、相应癌旁组织中TFPI-2基因的甲基化状态。结果:胰腺癌组织中TFPI-2基因的甲基化阳性率为71.1%(32/45),明显高于癌旁组织的31.1%(14/45)(P<0.01)。8例正常胰腺组织中均未发生甲基化。TFPI-2基因甲基化阳性率还与胰腺癌的临床分期、组织分化程度、肿瘤直径有相关性(P<0.05)。结论:TFPI-2基因在胰腺癌组织中出现异常甲基化,可能与胰腺癌的发生发展关系密切。     

结直肠癌患者RAS、BRAF基因突变与MSI状态的相关性及其临床病理特征

目的：结直肠癌是人类最常见的恶行肿瘤之一,其发病率和病死率呈逐年上升趋势。本研究旨在分析结直肠癌患者大鼠肉瘤病毒癌基因(rat sarcoma viral oncogene,RAS)、鼠类肉瘤病毒癌基因同源物(V-Raf murine sarcoma viral oncogene homolog B,BRAF)突变与微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)状态相关性及其临床病理特征,为结直肠癌临床治疗及预后评估提供依据。方法：回顾性分析444例结直肠癌患者的临床病理资料,并提取肿瘤组织基因组DNA,采用荧光定量PCR法检测Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(Kirsten rat sarcoma viral oncogenehomolog, KRAS)、 Neuroblastoma大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(neuroblastomaratsarcomaviraloncogene homolog,NRAS)第2、3、4外显子及BRAF V600E突变;运用PCR-毛细血管电泳行MSI状态分析。结果：K(N)RAS基因突变184例(41.44%,184/444),其中KRAS突变173例(94.02%,173/184),NRAS突变11例(5.98%,11/184),K(N)RAS共突变3例。BRAF V600E突变21例(4.7%,21/444)。微卫星高度不稳定(microsatellite instability high,MSIH)48例(10.81%,48/444),微卫星低度不稳定(microsatellite instability low,MSI-L)和微卫星稳定(microsatellite stable,MSS)共396例(89.19%,396/444)。K(N)RAS基因突变右半结肠癌多于左半结肠癌,且黏液腺癌突变率高于单纯腺癌(均P<0.05)。K(N)RAS基因突变与患者性别、年龄、肿瘤大小、肉眼分型、组织学分化程度、淋巴结转移、病理分期均无关(均P>0.05)。女性BRAF V600E突变高于男性,低分化高于中分化(均P<0.05),BRAF V600E突变与患者发病年龄、肿瘤位置、大小、肉眼分型、组织学类型、淋巴结转移、病理分期均无关(均P>0.05)。发生MSI-H的患者中,右半结肠癌多于左半结肠癌,肿瘤直径≥4.5 cm病例多于直径更小病例,隆起型多于其他肉眼分型,黏液腺癌多于单纯腺癌,低分化多于高分化(均P<0.05),而与患者性别和年龄均无关(均P>0.05)。K(N)RAS突变与MSI-H发生无关(P>0.05),但RAS基因Gly位点突变与MSI-H发生相关(P<0.05)。携带RAS基因Gly位点突变的MSI-H结直肠癌患者男性多于女性,发病年龄无差异,右半结肠多于左半结肠,肉眼分型多为溃疡型,单纯腺癌比例高于黏液腺癌,多为中低分化,较多处于病理分期I～II期,常不伴淋巴结转移和BRAF V600E突变,Gly突变位点多为Gly12Ser/Asp突变。BRAF V600E突变与MSI-H发生有关(P<0.05)。与K(N)RAS突变型MSI-L/MSS结直肠癌比较,K(N)RAS突变型MSI-H结直肠癌较易发生于右半结肠,肿瘤直径≥4.5 cm的病例较多,组织学类型多为黏液腺癌,较少发生淋巴结转移,多处于病理分期I～II(均P<0.05);K(N)RAS突变型MSI-H结直肠癌与性别、年龄、肿瘤肉眼分型、组织学分化均无相关(均P>0.05)。与RAS野生型-MSI-L/MSS结直肠癌比较,RAS野生型-MSI-H结直肠癌多发生于右半结肠,肿瘤直径≥4.5 cm,多为溃疡型和隆起型,较多为黏液腺癌,且多为中低分化(均P<0.05),而RAS野生型-MSI-H结直肠癌与性别、年龄、淋巴结转移、病理分期均无关(均P>0.05)。结论：结直肠癌KRAS基因Gly位点突变、BRAF V600E突变与MSI-H发生相关;MSI-H-RAS基因Gly点突变结直肠癌患者有其独特的临床病理特征;RAS-MSI基因状态与临床病理特征相关;K(N)RAS、BRAF V600E、MSI检测有利于结直肠癌患者个体化治疗及预后评估。     

BRAF基因与结肠癌的关系及临床意义

近年研究发现畸形隐窝灶-增生性息肉-锯齿状腺瘤-癌序列是结肠癌形成的另一条重要途径,它由RAS-RAF-MEK-ERK信号传导通路调控,BRAF基因是该通路重要的调节因子.微卫星稳定性、CpG岛甲基化表型与BRAF基因突变、结肠癌发生部位、结肠癌的类型及患者的性别等因素有关.     

结肠直肠癌RAS及BRAF基因突变检测的意义

结肠直肠癌的发病率位居全球恶性肿瘤第二位,每年有超过100万例的新增患者,且每年约有608 000例患者死于转移性结肠直肠癌及其相关的临床并发症[1]。即使采用细胞毒药物联合方案化疗,转移性结肠直肠癌患者的中位生存时间也仅从6个月延长至约2年。分子靶向治疗开启了肿瘤诊疗的个体化时代,同时也为转移性结肠直肠癌患者的治疗提供了新选择。仅2005年至2010年,美国临床肿瘤学会年度进展报告中就有5项与结肠直肠癌相关的靶向治疗研究入选年度重大研究进展,其中     

基因启动子区域CpG岛异常甲基化与急性髓系白血病的研究进展

人类的主要表观遗传学修饰方式是DNA甲基化,而功能基因启动子区域CpG岛的高度甲基化能够使该基因沉默.本文选择在急性髓系白血病(AML)中启动子区域CpG岛异常甲基化水平高、对AML患者的预后有显著影响的数个功能基因(CDKN2B/P15,WNT5A,MEG3,ESR1和DBCl)进行介绍,以期为临床评估AML患者的治疗反应和预后提供有潜力的综合检测指标,并为甲基化转移酶抑制剂治疗AML的机制研究提供一些研究思路.     

拮抗Wnt信号通路的CpG岛甲基化表型在肝癌预后中的临床价值

目的评价CpG岛甲基化表型（CIMP）在肝癌预后中的价值。方法收集108例肝癌（HCC）、癌旁组织、血浆及60例健康体检者血浆,采用甲基化特异性PCR方法对所有标本APC,SFRP-1,DKK-3和E-cad基因表达进行分析。结果APC在肝癌组织阳性中阳性表达率为44．44％,血浆为24．07％,APC血浆标本约为组织标本阳性表达的54．17％;SFRp-l则分别为37．04％和28．7％,血浆标本约为组织标本阳性的77．5％;DKK分别为36．1％和23．15％,血浆标本约为组织标本阳性的64．1％;E-cad分别为34．3％和16．67％,血浆标本约为组织标本阳性的48．65％。在肿瘤组织中CIMP状态与乙型肝炎表面抗原阳性与否、甲胎蛋白浓度以及肿瘤淋巴结转移有明显差异（P〈O．05）。丙型肝炎病毒抗体、肝硬化无明显差异。而在血浆中也发现CIMP状态与乙型肝炎表面抗原阳性与否、甲胎蛋白浓度以及肿瘤淋巴结转移有明显差异（P〈O．05）,与丙型肝炎病毒抗体、肝硬化无明显差异。经过一年随访后发现CIMP阳性组与CIMP阴性组在转移和复发上有明显不同。结论血浆中CIMP的表达可以作为晚期肝癌预后不良的分子标志。     

白血病细胞孕酮受体双启动子CpG岛甲基化的实验研究

白血病细胞存在多种基因启动子高甲基化，如雌激素受体(estrogen receptor，ER)基因。孕酮受体(Progesterone renceptor，PR)作为功能性ER，其基因有两个亚型(PRA和PRB)，其表达受两个启动子调控。为探讨白血病细胞中PR基因双启动子甲基化状态及5′-杂氮-2′-脱氧胞苷(5′-Aza-Dc)对其脱甲基化的作用，以HL-60、K562和Jurkat细胞为样本，观察了5′-Aza-Dc对白血病细胞株作用前后的PR基因甲基化状态及PR mRNA的表达情况。     

结直肠腺癌BRAF基因突变的检测及其临床意义

目的:探讨结直肠腺癌BRAF基因突变的检测及临床意义。方法:采用PCR直接测序法检测结直肠腺癌患者石蜡包埋肿瘤组织中BRAF基因突变情况,分析BRAF基因突变与患者性别、年龄、组织学分级及临床分期的相关性。结果:17例BRAF基因突变结直肠腺癌病例中,16例为15外显子突变,1例为11外显子突变。16例中,突变位于15外显子第600位密码子14例,包括第1 799位碱基T突变为A(Val600Glu,V600E)13例(92.9%),第1 799、1 800位碱基T、G突变为A、A(Val600Glu,V600E)1例;突变位于15外显子第594位密码子2例,均为第1 780位碱基G突变为A(Asp594Asn,D594N)。1例11外显子突变位于第468位密码子,第1 403位碱基G突变为C(Gly468Va,G468V)。BRAF基因突变与患者性别、年龄无相关性;组织学分级为Ⅲ级的BRAF基因突变患者数多于Ⅱ级(P=0.029);临床分期为Ⅳ期的BRAF基因突变患者数多于Ⅱ期、Ⅲ期(P=0.011)。结论:BRAF基因突变与结直肠腺癌组织学分级和临床分期相关,随着组织学分级和临床分期的增加,BRAF基因突变率升高。     

K-ras基因突变表达谱与结直肠癌肝转移的相关性分析

目的探讨K-ras基因突变谱与结直肠癌肝转移的相关性,为进一步阐明结直肠癌肝转移的分子机制提供理论依据。方法收集2008年1月至2010年8月在我院治疗的结直肠癌肝转移患者30例,进行K-ras基因突变检测,分析K-ras基因的突变类型及频率,探讨K-ras基因的突变谱与结直肠癌肝转移患者性别、年龄、原发灶位置、转移位置、病灶形态及TNM分期的相关性。结果 30例结直肠癌肝转移患者组织中K-ras基因突变者14例,突变率为47%,其中12密码子突变9例,突变率为30%;13密码子突变者5例,突变率为17%。突变表达谱在性别、年龄、原发部位、肝脏转移灶部位、病灶形态、TNM分期方面差异无统计学意义（P〉0.05）。结论 K-ras基因在结直肠癌肝转移的患者中突变率较高,以12,13号密码子突变最为常见,突变类型及频率在性别、年龄、原发部位、肝脏转移灶部位、病灶形态、TNM分期方面无显著性差异。     

Argininosuccinate synthetase gene is silenced by CpG methylation in children with phenylketonuria

Objectives

The concentration of tyrosine and the ratio of branch-amino acid to the aromatic amino acid in phenylketonuria (PKU) patients are much lower than that of normal people, which reveal that PKU patients have amino acid metabolism disorder. The aim of the present study was to investigate the arginine level in blood, the expression of argininosuccinate synthetase (ASS), the rate-limiting enzyme in arginine synthesis pathway, and the methylation of ASS in patients with PKU.

Design and Methods

Twenty-five children with PKU and 65 healthy controls were investigated in this study. Blood concentration of arginine was analyzed by automatic amino acid analyzer. The methylation of ASS gene promoter was evaluated by using methylation-specific polymerase chain reaction (MSP) and bisulfite sequencing PCR (BSP) methods, and the mRNA level of ASS was evaluated by semi-quantitative RT-PCR.

Results

Blood concentration of arginine in PKU patients without dietary control was 0.017 ± 0.009 mmol/L while in normal persons was 0.129 ± 0.007 mmol/L, which is statistically significant (P < 0.001). The promoter of ASS was methylated in PKU (15/15, 100%) but not in normal persons (0/15). The mRNA level of ASS in PKU patients was lower than that of normal people, which was well correlated with its methylation status.

Conclusions

The silencing of ASS due to aberrant promoter CpG methylation may be an important mechanism for arginine biosynthesis disorders in PKU. High levels of phenylalanine and low levels of arginine are common characteristics in PKU patients. These findings would extend the current understanding of arginine, ASS in the development of PKU disease.     

膀胱癌组织中上皮细胞钙依粘连蛋白基因启动子区CpG岛甲基化状态的分析

目的　探讨膀胱癌中肿瘤抑制基因上皮细胞钙依粘连蛋白(E cadherin)启动子区CpG岛的甲基化状 态及其与mRNA表达的关系。方法　收集30例新鲜的膀胱癌组织及其癌周正常组织;采用甲基化特异聚合酶 链反应(MSP)检测E cadherin基因启动子区CpG岛的甲基化状态;采用逆转录PCR检测E cadherin基因的mR NA表达。结果　E cadherin基因在膀胱癌组织中的甲基化阳性率(43.3%)显著高于在癌周正常组织中的甲基 化阳性率(6.7%,P<0.01);在复发性膀胱癌中的甲基化阳性率(64.7%)显著高于在原发性膀胱癌中的甲基化 阳性率(15.4%,P<0.05);在不同分级、分期膀胱癌中的差异无显著性。13例异常甲基化的膀胱癌组织中有10 例未检测到CDH1mRNA的表达,而13例未甲基化膀胱癌组织中有2例未检测到,二者差异有显著性(P< 0.01)。结论　E cadherin在膀胱癌组织中有一定程度的过甲基化,但与膀胱癌的临床分期和病理分级无显著相 关性,提示其可能参与了膀胱癌的发生;E cadherin基因CpG岛的过甲基化可能成为判断膀胱癌复发的指标之 一;E cadherin基因CpG岛的过甲基化可能是造成E cadherinmRNA不表达的原因之一。     

膀胱癌组织中上皮细胞钙依粘连蛋白基因启动子区CpG岛甲基化状态的分析

目的探讨膀胱癌中肿瘤抑制基因上皮细胞钙依粘连蛋白(E-cadherin)启动子区CpG岛的甲基化状态及其与mRNA表达的关系.方法收集30例新鲜的膀胱癌组织及其癌周正常组织;采用甲基化特异聚合酶链反应(MSP)检测E-cadherin基因启动子区CpG岛的甲基化状态;采用逆转录PCR检测E-cadherin基因的mRNA表达.结果 E-cadherin基因在膀胱癌组织中的甲基化阳性率(43.3%)显著高于在癌周正常组织中的甲基化阳性率(6.7%,P＜0.01);在复发性膀胱癌中的甲基化阳性率(64.7%)显著高于在原发性膀胱癌中的甲基化阳性率(15.4%,P＜0.05);在不同分级、分期膀胱癌中的差异无显著性.13例异常甲基化的膀胱癌组织中有10例未检测到CDH1 mRNA的表达,而13例未甲基化膀胱癌组织中有2例未检测到,二者差异有显著性(P＜0.01).结论 E-cadherin在膀胱癌组织中有一定程度的过甲基化,但与膀胱癌的临床分期和病理分级无显著相关性,提示其可能参与了膀胱癌的发生;E-cadhenn基因CpG岛的过甲基化可能成为判断膀胱癌复发的指标之一;E-cadhenn基因CpG岛的过甲基化可能是造成E-cadherin mRNA不表达的原因之一.     

维生素D结合蛋白基因多态性与结直肠癌的相关性研究

目的 探讨大连市汉族人群维生素D结合蛋白(VDBP)基因的2个单核苷酸多态性(SNP)位点rs4588和rs7041与结直肠癌(CRC)易感性的关系.方法 选择2015年1月至12月大连医科大学附属第一医院收治的120例汉族CRC患者作为研究对象,纳入CRC组.采用简单随机抽样法选择同期于大连市血液中心无偿献血的127例汉族健康献血者纳入对照组.采用TaqMan-MGB探针实时荧光PCR技术对受试者全血提取DNA样本的rs4588和rs7041位点进行扩增.采用x2检验统计学方法比较2组受试者VDBP基因rs4588和rs7041位点各基因型及等位基因频率分布的差异.本研究遵循的程序符合大连血液中心人体实验委员会制定的伦理学标准,得到该委员会批准.结果 ①经Hardy-Weinberg遗传平衡检验,CRC组和对照组rs7041和rs4588位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(CRC组:x2 =2.13、1.64,对照组:x 2=0.70、1.32;P＞0.05).②CRC组患者VDBP基因rs7041位点的TT基因型频率、GT基因型频率、GG基因型频率、T等位基因频率及G等位基因频率分别为45.0％、48.3％、6.7％、69.2％及30.8％,对照组分别为52.8％、41.7％、5.5％、73.6％及26.4％;2组rs7041位点基因型频率及等位基因频率分别比较,差异均无统计学意义(x2=1.491、1.201,P＞0.05).③CRC组患者VDBP基因rs4588位点的CC基因型频率、AC基因型频率、AA基因型频率、C等位基因频率及A等位基因频率分别为44.2％、48.3％、7.5％、68.3％及31.7％,对照组分别为44.9％、50.3％、4.7％、70.1％及29.9％;2组rs4588位点基因型频率及等位基因频率分别比较,差异亦均无统计学意义(x2=0.843、0.176,P＞0.05).结论 本研究未发现大连地区汉族人群VDBP基因rs7041和rs4588位点的SNP与CRC易感性相关.     

某地区结直肠癌患者KRAS基因及BRAF基因突变状态的检测分析

目的 检测某地区结直肠癌患者KRAS基因和BRAF基因的突变状态及其与年龄、性别的关系.方法 由某地区30例结直肠癌患者石蜡组织中提取DNA,通过直接测序法及荧光定量PCR法检测KRAS基因及BRAF基因突变状态.结果 KRAS基因突变率为43.3%,共发现6种突变类型,主要位于12、13密码子,其中以c.38G>A突变率最高(38.5%).单因素及多因素分析均提示KRAS突变与年龄或性别无相关性.BRAF基因突变率为0.结论 某地区结直肠癌患者KRAS基因突变率高,靶向治疗前进行突变状态检测具有重要临床价值.