校内宋内志贺菌暴发疫情的溯源和耐药性分析

目的对由宋内志贺菌引起的2所学校细菌性痢疾暴发分离株进行分子流行病学分析,追溯传染来源;同时了解分离株的耐药状况。方法对该起疫情中分离的32株宋内志贺茵,用BInⅠ酶切进行PFGE分子分型,所得图谱用Bionumerics6.0软件UPGMA算法进行聚类分析,观察患者分离株之间及和环境株的相似性;利用K-B法对宋内志贺菌进行耐药性检测。结果从患者分离的31株和自备井水分离1株宋内志贺菌指纹图谱完全相同,聚类分析相似度为100%;32株菌均对氨苄西林、四环素、萘啶酸、链霉素、复方新诺明、磺胺异噁唑、甲氧苄氨嘧啶、头孢噻肟耐药。结论引起2所学校宋内志贺痢疾的暴发菌株和环境株为同一来源菌株,结合流行病学调查结果判断为井水受到污染引起疫情暴发,且引起该起疫情的菌株对多种抗生素耐药。     

上海市静安区儿童腹泻中分离的宋内志贺菌脉冲场凝胶电泳分析

[目的]研究上海市静安区2006～2008年儿童腹泻标本中分离的20株宋内志贺菌的耐药性和脉冲场凝胶电泳图谱特征。[方法]采用K-B法检测对16种抗生素的敏感性,并用WHONET5.3软件对菌株的耐药性进行分析。通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行分子分型,通过同源性分析以确定菌株间的亲缘关系。[结果]20株宋内志贺菌对利福平和奈啶酸100%耐药,对四环素、氨苄青霉素、复方新诺明的耐药率≥85%。主要分为6种复合耐药型。19株宋内志贺菌被分成16个带型,聚类分析显示属于来源高度相似的克隆系。[结论]建立了本区的宋内志贺菌脉冲常凝胶电泳分析方法和初步带型数据库。宋内志贺菌存在多重耐药现象,抗生素型与基因型间无明确关系。     

江苏省2010年宋内志贺菌耐药相关整合子分析及分子分型研究

目的分析江苏省2010年宋内志贺菌的整合子分布及分子分型特征。方法对江苏省2010年分离的33株宋内志贺菌采用K-B纸片法检测抗菌药物敏感性,联合PCR和限制性片段多态性(RFLP)进行整合子分类和可变区检测,利用测序技术判断整合子可变区耐药基因,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子同源性分析。结果宋内志贺菌多重耐药率为63.64%,对复方新诺明、四环素、萘啶酸和氨苄西林耐药率较高,分别为84.85%、75.76%、66.67%和63.64%。33株宋内志贺菌中51.52%的菌株检出I类整合子,其中4株可变区阳性,携带dfrA17-aadA5基因盒;81.82%的菌株检出II类整合子,携带dfrA1-sat1-aadA1基因盒;两类整合子同时存在时耐药性更为显著。PFGE图谱分为13个不同带型,同一带型菌株大多分散于江苏各地。结论整合子在宋内志贺菌中广泛存在,参与其多重耐药机制。多重耐药性在不同地区、不同克隆的菌株间扩散传播。     

一起水源性细菌性痢疾暴发疫情的病原学特征及溯源分析

目的 分析一起学校水源性细菌性痢疾暴发疫情中病例分离株之间及其环境分离株之间的病原学和分子分型特征及遗传相关性,追溯传染源。 方法 对疫情病例与外环境井水分离到的29株志贺菌进行分离鉴定、血清分型和药敏试验,通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)获得电泳图谱,利用BioNumerics软件对图谱进行聚类分析,探讨菌株间的相关性。 结果 疫情病例和外环境井水中分离的29株志贺菌均为宋内Ⅰ相,29株志贺菌耐药结果显示产超广谱β-内酰胺酶菌株占96.55%。PFGE方法显示有3种脉冲场凝胶电泳图谱,相似率在72.8%~100%之间,井水中分离的2株志贺菌与疫情病例分离的25株菌株之间100%同源。 结论 结合实验室结果和流行病学调查,可以证实该事件是一起因饮用和使用宋内志贺菌污染的井水而导致的细菌性痢疾暴发疫情。     

脉冲场凝胶电泳分型技术应用于宋内志贺菌溯源分析

目的：分析四川省成都市2006年崇州、大邑两地相继暴发的宋内志贺菌食源性感染疫情中病人分离菌株之间,及其环境分离菌株之间的分子分型特征和遗传相关性,推断传染来源。方法：收集两地疫情暴发期间分离的宋内志贺菌株,用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对菌株进行分子分型,所得结果用BioNumerics V4.0软件UPGMA方法进行聚类分析。结果：共测试56株菌,用XbaⅠ酶切后PFGE可分为14个带型。其中崇州菌株38株,有26株带型完全相同（包括1株环境株）;有37株菌分布于5种带型,其相似性在97%以上。大邑菌株18株,有10株带型完全相同;其余8株有7种带型,相似性较差。两地之间菌株分子分型差异明显,其相似性小于92%。结论：确证崇州、大邑两地确有宋内志贺菌食源性感染疫情的暴发,但两地之间无交叉传染关系;提示崇州的宋内志贺菌疫情是由食物凉拌菜引起;提示大邑本地有较高的宋内志贺菌流行水平和复杂的传染源。     

河南省2011-2014年D群宋内志贺菌病原学监测与分子流行病学研究

目的 分析2011-2014年河南省腹泻患者粪便中分离的216株D群宋内志贺菌毒力基因携带情况、耐药谱及代表性菌株的PFGE指纹图谱特征,为志贺菌病的病原学监测及暴发溯源提供基线数据与方法学参考。方法 采集腹泻患者粪便样本,SS平板分离培养18~24 h,采用克氏双糖铁(KIA)/动力-吲哚-尿素(MIU)与API20E系统进行生化鉴定,利用志贺菌分型血清进行玻片凝集;使用热裂解法制备DNA模板,采用多重PCR鉴定毒力基因种类。根据国际PulseNet细菌性传染病分子分型监测网络公布的宋内志贺菌PFGE分型技术方案进行PFGE分子分型与聚类分析。结果 216株D群宋内志贺菌中,98株为宋内Ⅰ型,118株为宋内Ⅱ型;各菌株均携带不同的毒力因子编码基因,包括SHET-1B、SHET-2、ial、ipaH,具有4种毒力基因组合类型;216株宋内志贺菌均为耐2种以上抗生素的多重耐药菌株,其中耐2~4种为34株(15.7%),耐5~8种为147株(68.1%),耐9~10种为24株(11.1%),耐11种为7株(3.2%),耐13种为4株(1.9%)。100株宋内志贺菌经XbaⅠ酶切与PFGE后共分为31种不同带型,相似度为68.6%~100.0%,各带型包含菌株数为1~13株不等。结论 2011-2014年河南省宋内志贺菌均携带致病性毒力基因,菌株耐药现象比较严重,其PFGE指纹图谱呈现多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性与相同的聚集性。     

浙江省引起暴发的宋内志贺菌的耐药性及分子分型研究(2006)

目的：了解引起浙江省菌痢暴发的宋内志贺菌耐药性及分子分型情况，为流行病学溯源及合理有效使用抗生素提供依据。方法：77株志贺菌均按GB16002-1995标准进行鉴定分型，并采用Kirby-Bauer法检测其对14种抗生素的敏感性，并采用WHONET5．3软件，对菌株的耐药性进行分析。同时，通过脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对菌株进行分子分型，通过同源性分析以确定菌株间的亲缘关系。结果：77株宋内志贺菌对氨苄西林、利福平的耐药率最高，达100．0％，其次是红霉素98．7％；对诺氟沙星、环丙沙星最敏感，其敏感性高达98．7％。脉冲场凝胶电泳分型77株试验菌株共分为3个PFGE基因型，1型16株占20．8％，庆元、苍南菌痢暴发可能源于同一宋内志贺菌克隆系；2型34株占44．2％，常山、龙湾菌痢暴发可能源于同一宋内志贺菌克隆系；3型27株，均分离自江山，占35．0％。结论：宋内志贺菌是2006年引起浙江省菌痢暴发的主要菌型，多重耐药现象严重，基因型间差异较小，抗生素型与基因型间无明确关系。     

一起学校细菌性痢疾暴发疫情的病原追溯 和流行病学特征分析

摘要:目的　对学校发生的一起细菌性痢疾暴发疫情进行调查,并采用脉冲凝胶电泳（PFGE）方法对菌株进行同源性分析,为查找传染源、切断传播途径,提供参考依据。方法　开展现场流行病学调查,采用描述流行病学的方法对暴发原因进行分析,同时采集患者粪便、水样进行细菌学培养,运用PFGE对分离的菌株进行同源性分析。结果　此次暴发疫情的调查共发现病例60例,罹患率为10.12%,发病人群均为小学学生;从53例患者的粪便中共检出30例痢疾阳性病例,且菌群均为宋内志贺菌;水样检测发现2号水井及其旁边的水塘存在宋内志贺菌;对4份病例的粪便、2份水样进行PFGE分析,其结果显示,6份样本所检出菌株的电泳带型完全相同。结论　该事件是一起因饮用宋内志贺菌污染的水源而导致的细菌性痢疾暴发疫情。     

一起学校细菌性痢疾暴发疫情流行病学调查

分析学校发生的一起细菌性痢疾暴发疫情状况,并采用脉冲凝胶电泳(PFGE)方法对致病菌株进行同源性分析,为今后此类疫情的防控提供经验.方法 开展现场流行病学调查,采用描述和分析流行病学的方法对暴发原因进行分析,同时开展病原学检测,运用PFGE对分离的菌株进行同源性分析.结果 此次疫情波及2所学校,即A中学和B小学.共发现病例358例(疑似病例291例,确诊病例67例),其中A中学233例,罹患率为4.82%;B小学125例,罹患率为2.88%,均为学生.从37例患者的粪便中共检出20株宋内志贺菌;对23株宋内志贺菌进行PFGE分析,发现A中学和B小学的菌株分型为同一带型.饮用直饮水生水是该次疫情发生的主要危险因素(OR=2.04,95%CI=1.18~3.53),但不排除与相似症状病人接触和不洁的生活习惯是可能危险因素.结论 在学校开学之际落实各项菌痢防控措施,提高学校卫生工作质量非常重要.     

北京市2010年细菌性痢疾病原学分析

目的掌握北京市2010年细菌性痢疾的血清学分布以及脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)分子分型特征,为流行病学研究提供合理依据。方法从形态特征、生化反应、血清分型、PFGE分子分型方面对北京市6个区的肠道多病原监测点分离到的195株志贺菌进行了系统鉴定和病原学分析。结果 195株志贺菌包括福氏志贺菌33株(16.92%)、宋内志贺菌162株(83.08%);福氏志贺菌血清型以F2a为主。7、8、9三个月志贺菌的发病率最高。选择其中55株宋内志贺菌进行脉冲场凝胶电泳分析,结果显示55株菌可以分为27个带型,其中以J16X01.BJ0016带型(11株)和J16X01.BJ0011(7株)为主。结论北京市2010年6个监测区县分离到的志贺菌包括福氏和宋内2种血清群,以宋内志贺菌为优势血清群,福氏志贺菌以F2a血清型为主。8月份为志贺菌高发季节。J16X01.BJ0016为宋内志贺菌PFGE优势型别。