158株结核分枝杆菌北京基因型的耐药特征研究

我国是结核病高耐药国家,而高耐药率给结核病患者的治疗带来很大困难,并对其流行产生严重影响.本研究同时采用IS6110-RFLP、spoligotyping对结核分枝杆菌进行基因分型,探讨不同地区不同基因型的耐药特点及北京基因型与4种药物[利福平(RFP)、异烟肼(INH)、链霉素(SM)、乙胺丁醇(EM8)]耐药的关系.     

结核分枝杆菌耐药表型与耐药基因型相关性研究进展

20世纪80年代以来,结核病（tuberculosis,TB）疫情呈全球性回升趋势,我国作为全球最大的发展中国家,同时也是全球TB疫情最严重的国家之一［1］。随着全球耐药结核病（drug resistant tuberculosis,DR TB）的出现和传播,特别是耐多药结核病（multidrug resistant TB,MDR TB）、广泛耐药结核病（extensively drug resistant TB,XDR TB）,以及全耐药结核病（totally drug resistant TB,TDR TB）发生率的增高,全球TB的有效治疗和控制受到严重威胁。深入研究结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,MTB）的耐药分子机制,发现基因突变是MTB产生耐药的重要原因。现就各抗结核药物的耐药表型与耐药基因型的相关性研究进行综述。     

河南省结核分枝杆菌北京家族基因型及耐药分析

目的了解河南省结核分枝杆菌北京家族基因型的分布、流行特点、与耐药性的相关性。方法 2009年6月-2010年11月在河南省尉氏县结核病防治机构实验室分离培养的165株结核分枝杆菌,采用比例法进行药物敏感性检测,应用RD 105缺失基因检测法和琼脂糖凝胶电泳技术进行北京家族基因型鉴定。结果 164株结核分枝杆菌对4种一线抗结核药物,异烟肼(IN H)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)药敏情况:全部敏感的菌株为126株(76.8%);任意耐药菌株38株(23.2%),其中,单耐药菌株14株(8.5%),多耐药菌株24株(14.6%);结核分支杆菌对4种一线药的耐药率依次为:INH 16.5%(27/164)、SM 15.9%(26/164)、RFP 9.1%(15/164)、EMB 7.3%(12/164)。164株结核分枝杆菌中,北京家族基因型(Beijing fam ily)占89.6%(147/164),17株为非北京家族基因型,占10.4%;147株北京家族基因型菌株中,全部敏感的菌株为111株(75.5%);耐任一种药菌株36株(24.5%),其中耐多药(MDR)菌株13株(8.8%...     

宁波地区不同基因型利福平耐药结核分枝杆菌耐药特征

目的 应用全基因组测序技术分析宁波市利福平耐药结核分枝杆菌(RR-TB)耐药特征,为RR-TB感染患者的临床诊疗及疫情防控提供科学依据。方法 选取宁波市耐药肺结核唯一定点诊疗机构(宁波市第二医院)耐药监测期间保存的2018-2019年59株RR-TB临床分离株,提取总DNA后进行全基因组测序。应用Perl脚本处理原始数据,并通过结核分枝杆菌(MTB)耐药基因数据库确定耐药基因相关突变,同时结合表型药敏试验结果综合分析本地区RR-TB临床分离株对异烟肼(INH)、利福平(RIF)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)、阿米卡星(AM)、卷曲霉素(CAP)、左氧氟沙星(LFX)、丙硫异烟胺(PTO)及对氨基水杨酸(PAS)9种抗结核药物的耐药特征。结果 59株RR-TB菌株INH、RIF的耐药率分别为83.05%、100.00%;基于全基因组测序的59株RR-TB菌株共检测到40种耐药相关基因突变类型,其中以katG基因Ser315Thr(62.71%),rpoB基因Ser450Leu(62.71%),rpsL基因Lys43Arg(50.85%)和embB基因Met306Val(30.51%...     

RD105基因缺失法鉴定95株结核分枝杆菌北京基因型及其耐药相关性分析

目的鉴定吉林省结核分枝杆菌(MTB)中的北京基因型及其与耐药性的关联。方法 95株结核分枝杆菌分离自2008-2009年吉林省临床肺结核病人的痰液标本,培养方法为改良酸性罗氏(L-J)培养基。分离出的抗酸杆菌经对硝基苯甲酸(PNB)培养基初步鉴定后选出结核分枝杆菌复合群并应用比例法进行药敏试验(DST)。北京基因型的鉴定采用RD105基因缺失法。实验结果应用Epi Info统计软件和卡方检验进行分析。结果 95株结核分枝杆菌中,北京基因型占88.4%(84/95)。北京基因型中,异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、卡那霉素和氧氟沙星的耐药率分别为31.7%、23.2%、15.9%、31.7%、13.4%和18.3%,均位于非北京基因型菌株耐药率的95%置信区间内。北京基因型中的多重耐药(MDR)结核(TB)率占19.5%,通过卡方检验与非北京基因型中的MDRMTB进行比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 RD105基因缺失法是鉴定MTB北京基因型的简便、有效方法;北京基因型为吉林省结核分枝杆菌的优势株;北京基因型与非北京基因型耐药率无统计学意义上的差别。     

多重耐药结核临床分离株耐药性和北京基因型相关性分析

目的初步分析探讨多重耐药结核分枝杆菌(multiple drugs resistant bacillus tuberculosis,MDR-MTB)和北京型的相关性。方法从涂阳病人痰液中分离结核分枝杆菌,用固体培养基比例法对其进行一线和二线抗结核药物敏感性试验,筛选出耐多药菌株,对上述多重耐药菌株及随机抽取的20株全敏株进行间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)检测,采用χ2检验进行统计学分析。结果从154例涂阳病人痰液中分离得到138株结核分枝杆菌,RFP、INH、SM、EMB、OFX、AMK、KM、CPM的耐药率分别为49.28%(68/138),58.70%(81/138),44.93%(62/138),28.99%(40/138),57.25%(79/138),17.39%(24/138),13.04%(18/138),21.01%(29/138),一线药和二线药全耐率分别20.29%(28/138)和4.35%(6/138),MDR-MTB占43(31.16%)株。39株北京型中MDR-MTB为33株(84.62%),全敏株为6株(15.38%),MDR发生率高于非北京型菌株经检验具有统计学意义(χ2=12.64,P﹤0.05)。结论本研究分离得到的MDR-MTB的耐药性和北京基因型有一定的相关性。     

18株耐药结核分枝杆菌散在分布重复单位基因型分析

目的:了解宁波市江北区流动人口结核耐药菌株的基因型,为探讨流行病学传播规律,正确制定防控策略提供依据。方法:随机抽取江北区流动人口分离的耐药结核分枝杆菌22株,先用PCR检测耐药基因,再对耐药菌株进行MIRU基因分型,同时对12个MIRU位点的多态性进行比较。结果:随机抽取的22株耐药菌株中耐药基因阳性18株,MIRU分型结果有18种MIRU基因型,12个MIRU位点的h值为0.73～0.88之间,显示了较高的多态性(h>0.6)。结论:江北区流动人口肺结核耐药菌株MIRU基因型呈"唯一性",说明发病以内源性、散发为主。MIRU分型简单快速有效。     

唐山地区结核分枝杆菌耐药及基因突变特征

目的 了解唐山地区结核分枝杆菌的耐药特征及其药物靶基因位点突变特征。方法 问卷调查193名研究对象的一般情况和疾病相关情况,并分析其特征与分离菌株药敏类型的相关性;抗酸染色和胶体金法确定结核分枝杆菌感染;采用试剂盒鉴定药敏类型;通过测序鉴定靶基因位点突变情况。结果 不同药敏类型菌株宿主的BMI、职业、居住地和抗生素用药史的差异具有统计学意义（P＜0.05）;193株临床分离株对一线、二线药物耐药率为37.31%和75.65%;耐药率排序前三位的药物为阿莫西林（53.37%）、氯法齐明（39.38%）和对氨基水杨酸（25.39%）;总突变率前三位分别为embB 306位点（80.66%）,ropB 531位点（72.62%）和rpoB 526位点（55.36%）;60%的基因位点只测得一种突变类型。结论 唐山地区结核分枝杆菌耐药率较高,药物靶基因位点突变率与其他研究报道相近但突变类型较为单一。     

青海地区结核分枝杆菌快速检测及耐药特征研究

目的探讨青海地区耐药结核分枝杆菌(MTB)的相关基因型特点,为开展耐药结核病快速诊断提供依据。方法选择2011年6月-2012年12月西宁市区、农村和农牧区结核病患者的MTB标本各300份,采用MTB微量最低抑菌浓度(MIC)法对耐药结核病进行快速诊断,同时用传统的罗氏药敏法作为对照,采用测序方法分析耐药MTB在不同人群中的分布率,了解青海地区MTB耐药的基因突变特征,基因突变分布和主要流行突变位点。结果西宁市区与农牧区单一耐药及多耐药MTB耐药率比较,牧区明显高于西宁市区和农村,差异有统计学意义(P<0.05);rpoB、katG、gyrA突变率西宁市区分别为52.83%、52.83%、37.74%,农村分别为70.97%、62.90%、45.16%,牧区分别为92.55%、86.17%、81.91%,牧区的基因突变率与西宁市区、农村比较,差异有统计学意义(P<0.05);利福平最常见的突变位点为drpoB(531)占43.66%,异烟肼最常见的突变位点为katG(315),占61.27%;氧氟沙星最常见的突变位点为gyrA占59.52%。结论对青海地区耐药结核分枝杆菌的耐药特征有了进一步了解,为临床医师治疗结核病合理选药提供了依据。     

快速检测耐药结核分枝杆菌的方法学进展

一度被认为可以控制并在全球消失菌的结核病,近况不容乐观,甚至在全球部分地区出现了结核病危机,尤其是抗结核药的耐药问题日益严重,导致抗结核病治疗的有效率下降。目前快速的结核分枝杆菌耐药检测方法,改变了传统药敏检测方法耗时长、操作繁琐、不利于疾病快速诊断治疗的状况。其中重点发展了表型耐药检测和基因型耐药检测。每种检测方法各有特点,也存在着不同的缺陷。本综述将介绍几种快速结核分枝杆菌耐药检测技术。不同方法的选择和联合运用可能会提高耐药菌的检出率。     

绵阳地区结核分支杆菌北京基因型菌株的鉴定和感染因素分析

目的鉴定MTB北京基因型,了解北京基因型菌株在绵阳地区的分布特征,为本地结核病的防治和分子流行病学研究提供科学依据。方法随机选取绵阳涪城和江油两个区县的结核分支杆菌临床分离菌株,收集患者流行病学资料。菌株常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型菌株。药物敏感性试验采用比例法。率的比较采用χ2检验。结果共对79株结核分支杆菌了进行北京基因型鉴定,北京基因型菌株33株,占41.77%;非北京基因型菌株46株,占58.23%。北京基因型菌株耐药率(36.36%)明显高于非北京基因型菌株耐药率(10.87%),差异有统计学意义(χ2=7.395,P=0.007)。患者性别、年龄组、所在地区和治疗史与感染北京基因型菌株无关。结论北京基因型菌株在绵阳地区呈一般流行趋势。北京基因型菌株感染与耐药相关,与患者性别、年龄、所在地区和治疗史无关。     

天津地区临床分离结核分枝杆菌分型的初步研究

目的探讨天津地区结核分枝杆菌临床分离株分子流行病学特征。方法连续收集天津市海河医院2005年8月16日11月25日就诊患者痰培养阳性的结核分枝杆菌100株，采用间隔区寡核苷酸分型（spoligotyping）和多位点可变串联重复序列（VNTR）两种方法进行基因分型，并运用软件对二者的结果进行分析。依据北京分化支的定义，运用多重和实时定量PCR方法将其区分为W菌／典型北京家族菌株和非典型北京菌株，Χ^2检验分析两种亚群与患者年龄和耐药性之间的联系。结果排除污染菌株，共对96株结核分枝杆菌临床分离株进行两种方法的基因分型，spoligotyping结果91．7％为北京基因型（含3株类北京基因型）结核分枝杆菌（88／96）。VNTR分型可将北京基因型分为60种基因型。在北京分化支结核分枝杆菌中，W菌／典型北京家族菌株占93．2％（82／88）。两种北京分化支亚群与患者年龄及耐药性之间差异无统计学意义（P〉0．05）。结论天津地区结核病患者临床分离的结核分枝杆菌中，北京基因型呈现较为明显的优势。VNTR的分辨率明显高于spoligotyping。北京分化支的两种亚群在天津地区临床结核病患者中均有流行，但以W菌／典型北京家族菌株为主。     

Drug susceptibility of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and association with MDR TB

To determine differences in the ability of Mycobacterium tuberculosis strains to withstand antituberculosis drug treatment, we compared the activity of antituberculosis drugs against susceptible Beijing and East-African/Indian genotype M. tuberculosis strains. Beijing genotype strains showed high rates of mutation within a wide range of drug concentrations, possibly explaining this genotype's association with multidrug-resistant tuberculosis.     

Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis and drug resistance

Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis is widespread, may be increasing, and may have a predilection for drug resistance. Individual-level data on >29,000 patients from 49 studies in 35 countries were combined to assess the Beijing genotype's prevalence worldwide, trends over time and with age, and associations with drug resistance. We found 4 patterns for Beijing/W genotype tuberculosis (TB): 1) endemic, not associated with drug resistance (high level in most of East Asia, lower level in parts of the United States); 2) epidemic, associated with drug resistance (high level in Cuba, the former Soviet Union, Vietnam, and South Africa, lower level in parts of Western Europe); 3) epidemic but drug sensitive (Malawi, Argentina); and 4) very low level or absent (parts of Europe, Africa). This study confirms that Beijing/W genotype TB is an emerging pathogen in several areas and a predominant endemic strain in others; it is frequently associated with drug resistance.     

山东地区结核分枝杆菌临床菌株基因型特征研究

目的 探讨山东地区结核分枝杆菌临床分离菌株的基因型特征,评估不同基因型分布对于耐药结核菌近期传播的影响.方法 在山东地区选取13个结核病防治机构作为监测哨点收集临床分离菌株和相关信息,应用分枝杆菌散在重复单位(MIRU)技术分析结核分枝杆菌DNA多态性.结果 1年的研究期内共获得558株结核分枝杆菌,对12个MIRU位点进行检测共产生143个基因型,其中成簇基因型66个,成簇率86.2%.74.6%的菌株属于北京家族,177个(31.7%)菌株属于山东基因型.耐多药菌株的近期感染估计值明显低于敏感菌株.结论 山东地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,山东基因型菌株在人群中具有较强的传播能力.     

宜昌地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的鉴定及VNTR分型

 目的 研究宜昌地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的多态性和流行特征,揭示该地区结核病的分子流行病学特征,为结核病防治提供科学依据。方法 选择2018年1月-2019年12月具有完整病例信息的结核分枝杆菌298株,进行人型结核分枝杆菌的鉴定,用扩增RD105缺失片段的多重PCR (DTM-PCR)鉴定北京基因型菌株;应用优化的9位点数目可变串联重复序列技术(VNTR)分析北京基因型菌株的多态性。结果 298株结核分枝杆菌中,260株为人型结核分枝杆菌,DTM-PCR鉴定发现北京基因型菌株140株(53.85%),非北京基因型菌株120株(46.15%)。北京基因型菌株耐药率(32.14%)高于非北京基因型菌株耐药率(10.83%),差异有统计学意义(P<0.05)。VNTR-9位点对北京基因型菌株的分辨率为0.998 5,成簇率为12.15%。结论 北京基因型菌株在宜昌地区呈较高流行趋势,且北京基因型菌株耐药率更高。VNTR-9位点基因分型方法用于该地区结核分枝杆菌北京基因型菌株的鉴别,能准确反映宜昌地区结核分枝杆菌的分子流行病学特征。     

Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype

Molecular epidemiologic studies of strains of Mycobacterium tuberculosis are currently conducted worldwide. The genetically distinct Beijing family of strains has been associated with large outbreaks of tuberculosis, increased virulence, and multidrug resistance. However, in this first population-based search for Beijing strains in the Danish DNA fingerprint database, analysis of 97% of all culture-positive tuberculosis patients in 1992 to 2001 showed that 2.5% of 3,844 patients, 1.0% of Danish-born patients, and 3.6% of immigrants (from 85 countries) had Beijing strains. No Beijing strains were found among 201 strains from Danish-born patients sampled in the 1960s, and no evidence of an increase in Beijing strains was found over time. The true prevalence of Beijing strains worldwide is unknown because only a fraction of global strains have been analyzed.     

结核分枝杆菌耐多药情况分析

目的：评估上海市近年来耐多药结核病（MDR—TB）发生情况。方法：对本市2749株结核分枝杆菌耐药性测定结果进行分析。结果：共查出234株耐多药菌株，其中新发病。组156株（6．8％），复治病人组35株（18．9％），外地病人组43株（15．8％）。234株耐多药菌株中，耐2药133株（56．8％），耐3药66株（28．2％），耐4药35株（15．0％）。耐2药菌株中，以HR耐药为主，占27．8％。耐3药菌株中，以HRS耐药为主，占66．7％。复治病人和外地病人组的耐多药率显著高于新发病人组，P＜0．01。结论：必须加强对复治病人和外地病人的管理和治疗。     

兰州地区结核分支杆菌耐药性分析

目的 分析兰州地区2005～2007年结核分支杆菌耐药情况,为结核病的防治提供科学依据.方法 利用比例法对215株菌株进行药物敏感性检测,用SPSS 11.0进行统计分析.结果 兰州地区结核分支杆菌总耐药率为47.51％,耐多药率4.75％,低于2001～2004年统计结果,原发性耐药占耐药菌株总数的55％,获得性耐药率为46.59％.结论 兰州地区结核病患者结核分枝杆菌耐药率有所下降,但结核病传染源的控制、结核病防治宣教及结核病短程化疗(DOTS)健康教育和促进工作都需进一步加强.