交叉引物恒温扩增技术快速检测金黄色葡萄球菌

目的建立一种快速、特异、灵敏的交叉引物恒温扩增(crossing priming amplification,CPA)技术检测金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)耐热核酸酶基因(nuc)。方法从GenBank上下载多条金黄色葡萄球菌nuc基因序列,在其保守区域设计CPA引物及探针,建立CPA恒温扩增快速检测技术,并对反应条件进行优化,同时验证方法的特异性和敏感性。结果本方法对金黄色葡萄球菌检测具有高度特异性,对构建的阳性质粒DNA灵敏度达到1.0×10~1 copy/μl,对12份临床标本的检测阳性率与荧光PCR法相同,同时CPA法实验过程操作简便、反应迅速,且无需使用昂贵仪器,最快可在40 min内出检测结果。结论本研究建立的CPA法快速、简便、灵敏、特异,适用于金黄色葡萄球菌核酸快速检测。     

双重PCR检测副溶血性弧菌的tlh和tdh基因方法建立与初步应用

目的 建立同时检测副溶血性弧菌的tlh和tdh基因的双重聚合酶链式反应(PCR)法. 方法 根据副溶血性弧菌的tlh、tdh基因序列设计引物,进行PCR扩增及电泳检测.同时优化反应体系,测定稳定性、重复性、特异性及灵敏度. 结果 本实验设计的引物能特异性地扩增副溶血性弧菌的450、269 bp的片段,而对其它种类的菌物无特异性扩增,结果表明该方法特异性好,双重PCR检测灵敏度为100 cfu/ml.并进行了肛门拭子样品的检测. 结论 初步建立能在8h内快速、灵敏、特异地检出副溶血性弧菌毒力菌株的双重PCR技术.     

交叉引物等温扩增技术在恶性疟疾快速检测中的应用

目的 建立一种快速、敏感、特异检测恶性疟原虫的交叉引物等温扩增(cross priming amplification,CPA)技术.方法 根据疟原虫的18S rRNA基因保守序列,设计CPA引物和探针.分别用CPA法、吉氏染色镜检法检测78份发热患者血样,验证CPA法特异性和灵敏性.结果 采用CPA法对不同病原体核酸的检测结果显示,38份含有恶性疟原虫血样中检出37例阳性,其他病原体检测结果均为阴性,证明其特异性良好;该方法检测的灵敏度可达102拷贝/μl;与镜检法比较,其检测的灵敏度为97.37％,特异性为100％,准确度为98.72％.结论 用于检测恶性疟原虫的CPA检测体系具有简便、快速、灵敏、特异的优点,可用于临床、预防和出入境口岸现场疟疾的快速检测.     

TaqMan-实时荧光PCR快速检测副溶血性弧菌

[目的]建立TaqMan-实时荧光PCR快速检测副溶血性弧菌(Vibrio parahemolyticus,VP)的方法,用于食物中毒快速诊断和食品中VP的污染状况调查。[方法]根据GenBank公布的VP tdh基因序列,设计引物和探针,建立TaqMan-实时荧光PCR快速检测体系,应用于食品中VP检测。[结果]TaqMan-实时荧光PCR快速检测体系灵敏度为1.3×104cfu/ml(33 cfu/PCR反应体系),特异性好,无交叉反应。[结论]TaqMan-实时荧光PCR检测体系灵敏度高,特异性强,能提高VP的检出率和准确性,可应用于VP食品污染状况调查和食物中毒的快速诊断。     

水产品中致病性弧菌PCR快速检测研究

〔目的〕建立一种快速、准确、特异的方法,快速检测和鉴定出食品中的非致病性和致病性霍乱弧菌与副溶血性弧菌。〔方法〕针对霍乱弧菌的种特异性基因ompW、毒力基因tcpA、ctxA和副溶血性弧菌的种特异性基因tl、毒力基因tdh设计引物,建立PCR检测体系。〔结果〕检测结果显示,该方法能够特异性检出副溶血性弧菌或霍乱弧菌,并进一步确定其是否携带tdht、cpA或ctxA毒力基因,检测的灵敏度可达到5×101cfu/ml菌浓度。〔结论〕与传统方法比较,该方法快速、特异、灵敏,能在较短时间内对大量水产品样品进行检测。     

新型细菌耐药基因NDM-1实时PCR检测方法的建立

目的 建立灵敏、特异、快速的TaqMan荧光定量PCR方法用于快速检测新型细菌耐药基因NDM-1.方法 根据NCBI数据库中β-内酰胺酶类相关耐药基因的序列,详细进行比对,选择特异性最高的片段设计引物和TaqMan探针,建立基于TaqMan探针的实时荧光PCR方法.对所建立的实时荧光PCR检测方法进行灵敏度和特异度评价.结果 本方法对各种细菌病原体的新型细菌耐药基因NDM-1的检测具有高度特异性和灵敏度.优化后的引物浓度为200 nmol/L,探针浓度为100 nmol/L,灵敏度和特异度均为100％.该方法的检测下限能达到1.0×102拷贝/μl,远远高于普通PCR1.0×105拷贝/μl的检测下限.结论 所建立的方法能够特异和敏感地检测携带NDM-1基因的超级细菌,能够作为携带有该基因细菌的灵敏快速的检测方法.     

疟原虫新型恒温扩增快速筛检方法的研究

目的建立可现场使用的疟原虫快速检测方法,为检验检疫基层实验室开展筛检和监控工作提供技术手段。方法通过合成特异引物和探针,系统筛选,优化恒温扩增条件,建立疟原虫核酸等温扩增方法,用免疫层析试纸条快速检测扩增产物,并测试其灵敏度和特异性。结果疟原虫交叉引物恒温扩增方法灵敏度达到103拷贝/ml,反应特异,操作简便,不需要特殊设备,3h可报告结果。结论本研究应用交叉引物恒温扩增技术(CPA)对疟原虫的核酸进行扩增,并应用试纸条检测技术检测核酸扩增产物,检测时间短,具有一定的应用价值。     

交叉引物等温扩增技术在肠出血性大肠杆菌O157:H7快速检测中的应用

目的建立一种快速、敏感、特异的肠出血性大肠杆菌(EHEC)O157:H7的交叉引物等温扩增(Cross Priming Amplification,CPA)检测方法。方法根据EHEC O157:H7 stx1基因特征性保守序列(Gen Bank83460),设计交叉引物、剥离引物和检测探针,建立了EHEC O157:H7的CPA检测技术。用该方法检测19株细菌常见的食源性细菌,以验证其特异性;并用菌液浓度梯度稀释的方法对该方法的检测灵敏度进行评价。并通过60份食品模拟样品验证其在实际应用中的可性行,该检测结果与经典的细菌分离培养鉴定方法及常用的荧光定量PCR法进行比较。结果在检测的19株细菌中,只有EHEC O157:H7菌株的检测结果为阳性。其它菌株检测结果均为阴性,证明其特异性良好;通过浓度梯度稀释证明该方法检测的灵敏度可达l02cfu/m L;与分离培养鉴定法及荧光定量PCR法比较,其检测的灵敏度均为96.77%和96.67%、特异度分别为93.10%和90%、准确性分别为95%和93.33%。结论用于EHEC O157:H7的CPA检测体系具有简便、快速、灵敏、特异的优点,可用于进出境口岸现场及食品EHEC O157:H7的快速检测。     

霍乱毒素基因(ctx)和耐热直接溶血素基因(tdh)双重TaqMan实时PCR检测方法的建立

[目的]建立霍乱毒素和耐热直接溶血素基因双重TaqMan实时-PCR实验室检测方法。[方法]根据霍乱毒素基因(Cholera toxin gene,ctx)和耐热直接溶血素基因(thermostable direct hemolysin,tdh)的保守序列设计引物和TaqMan探针,建立检测霍乱毒素和耐热直接溶血素两种毒力基因的双重TaqMan实时PCR方法。对所建立的霍乱毒素基因和耐热直接溶血素基因双重TaqMan实时PCR检测方法进行灵敏度和特异度评价。[结果]建立了霍乱毒素基因和耐热直接溶血素基因双重TaqMan实时PCR的实验室检测方法。优化的tdh和ct双重TaqMan实时PCR反应体系中,ct引物和探针的浓度分别为200nmol/L和100nmol/L;tdh引物和探针的浓度分别为200nmol/L和100nmol/L。反应体系的灵敏度和特异度均为100%。优化的反应体系对两种质粒模板的检测下限均为1.0×102拷贝/μl,扩增效率分别为94%和97.7%。[结论]本研究建立了基于TaqMan探针的tdh和ct双重实时PCR检测方法,具有令人满意的灵敏度和特异度。检测下限能达到1.0×102拷贝/μl,高于普通PCR100倍。并且双重实时PCR能够在一个反应体系中同时检测两种毒力基因,这为费时又繁琐的传统检测方法提供了一种可靠又快速的替代选择。     

依赖核酸扩增技术在轮状病毒检测中的应用

目的将一种新颖的核酸扩增技术—依赖核酸扩增技术(nucleic acid sequence-based amplification NASBA)应用于轮状病毒的快速检测与辅助诊断。方法根据美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)轮状病毒VP7基因保守序列设计引物,建立NASBA检测方法,进行特异性、灵敏度和重复性试验,以所建立方法和RT-PCR方法同时对108例临床病毒性腹泻患者粪便样本进行检测。结果所建立的NASBA方法对轮状病毒具有较好的稳定性和高度特异性,与诺如病毒等8种腹泻相关病毒均无交叉反应,灵敏度达5μg/L。108份粪便样本中,用RT-PCR方法检出轮状病毒阳性11份,用NASBA方法检出阳性样本13份。结论本研究应用的轮状病毒NASBA检测方法特异、灵敏、快速简便,适用于轮状病毒的日常监测和暴发疫情的应急诊断。     

TaqMan荧光定量RT-PCR技术快速检测EV71方法的建立

目的:建立特异、灵敏、快速的TaqMan荧光定量RT-PCR方法,用于快速检测71型肠道病毒(EV).方法:从Genebank下载EV71型VP1基因序列,在其保守区域设计特异性引物与TaqMan探针,并对荧光定量PCR体系与反应条件进行优化,同时验证方法的特异性、敏感性和重复性.结果:该方法对EV71具有高度特异性,与非71型肠道病毒等均无交叉反应,检测灵敏度达2×10-2 TCID50/mL,反应体系具有很高的稳定性,整个操作过程仅需2.5 h.结论:所建立的TaqMan荧光定量PCR方法特异、灵敏、快速,适用于EV71的日常监测和暴发时应急诊断.     

实时荧光定量PCR检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌方法的建立与应用评价

目的利用实时荧光定量PCR技术,建立快速敏感特异的检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的方法。方法以MRSA mecA基因为靶序列设计引物和探针,以自MRSA中提取的DNA为模板,优化引物、探针的浓度和退火温度,同时验证方法的特异性、敏感性、重复性、灵敏度和线性范围,并与K-B法和微量琼脂稀释法(MIC)相比较。结果建立的反应体系在上游引物、下游引物浓度为0.2 mmol/L、退火温度为55℃时,具有良好的特异性和敏感性,与大肠埃希菌等8种细菌均无交叉反应;对MRSA检测的灵敏度达到10 CFU/ml。结论建立的实时荧光PCR方法特异、灵敏、快速,能对MRSA做出快速准确的报告,实现准确、快速和定量检测。     

应用SYBR Green Ⅰ荧光PCR快速检测副溶血弧菌及其毒力基因

目的利用SYBR Green Ⅰ荧光PCR反应检测副溶血弧菌及其trh和tdh毒力基因。方法根据副溶血弧菌tlh基因设计引物,建立检测副溶血弧菌SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,利用33株副溶血弧菌分离株以及22株其他种属细菌进行特异性和灵敏度评价。根据副溶血弧菌trh和tdh毒力基因序列设计引物,建立检测副溶血弧菌毒力基因的单重和双重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,并对这两种方法进行特异性和灵敏度评价。结果本研究中基于tlh基因的荧光PCR检测对全部33株副溶血弧菌检测为阳性,检测下限为5×101拷贝/μl,而22株其他种属细菌均为阴性。毒力基因trh和tdh均能特异性检测,其单重荧光PCR检测下限为5×101拷贝/μl,双重荧光PCR检测下限为5×102拷贝/μl。结论本研究建立了tlh作为靶基因检测副溶血弧菌的单重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法和同时检测副溶血弧菌trh和tdh毒力基因的双重SYBR Green Ⅰ荧光PCR检测方法,简化了毒力基因检测,有良好的实际应用前景。     

发酵乳酸杆菌PCR快速检测方法研究

〔目的〕建立一种特异、灵敏的发酵乳酸杆菌快速检测方法。〔方法〕根据发酵乳酸杆菌纤维二糖tuf基因延伸因子基因tu设计一对PCR引物,进行引物的特异性和灵敏度试验。〔结果〕PCR得到了较好的特异性扩增,其他干扰菌都无扩增,灵敏度达1.3×104cfu/ml。〔结论〕该方法能够实现发酵乳酸杆菌的快速检测,具有灵敏度高、特异性好的特点。     

多重PCR检测副溶血弧菌和伤寒沙门氏菌

目的 快速准确地检测副溶血性弧菌(VP)和伤寒沙门氏菌(ST).方法:根据VP的tdh基因和ST的H1-d基因顺序设计二对引物,通过聚合酶链反应检测食品或其它待检样品中的VP和ST,将扩增产物电泳.结果 :分别出现与已知阳性对照细菌条带大小一致的202和458bp的tdh和H1-d基因片断的条带,判定该样品中相应细菌为阳性.结论 :本法特异性强、灵敏度高,能在24小时内出结果,可适用于食品或其它样品中VP和ST的快速检验.     

应用多重PCR快速检测空肠弯曲菌

目的:建立能快速、特异检测空肠弯曲菌的多重PCR技术。方法:选用针对空肠弯曲菌外膜蛋白A(mapA)基因和马尿酸酶(hipO)基因的2对引物,在同一扩增体系中进行PCR,优化反应体系,测定特异性和灵敏度,并进行了鸡肉模拟样品检测。结果:该方法扩增目的基因片段分别为589 bp和323 bp,特异性和灵敏度均高。细菌纯培养物的检测灵敏度为105 cfu/ml,鸡肉模拟样品42℃预增菌36 h后检测灵敏度能达到101 cfu/ml。结论:初步建立能快速、灵敏、特异地测定空肠弯曲菌的多重PCR检测技术。     

志贺菌依赖解旋酶DNA恒温扩增技术建立

目的利用依赖解旋酶DNA恒温扩增技术(HDA),建立一种快速检测志贺菌(Shigella)的新方法。方法根据志贺菌的ipaH基因序列设计特异性引物,优化反应体系和反应条件;并对方法进行特异性和灵敏度评价。结果对21株实验菌株检测,3株志贺菌均为阳性,其余18株非志贺菌均为阴性,灵敏度为5.1×103cfu/mL,与普通PCR方法检测结果相当。结论 HDA法检测志贺菌具有特异、灵敏及仪器要求低等特点,具有广阔的应用前景。     

凝结芽孢杆菌PCR快速检测方法研究

目的:建立一种特异、灵敏的凝结芽孢杆菌快速检测方法。方法:根据凝结芽孢杆菌寡聚-1,6-葡萄糖苷酶基因设计一对PCR引物,进行了引物的特异性和灵敏度试验。结果:PCR得到了较好的特异性扩增,其它干扰菌都无扩增,灵敏度达5×103cfu/ml。结论:该方法能够实现凝结芽孢杆菌的快速检测,具有灵敏度高、特异性好的特点。     

荧光定量PCR结合TaqMan-MGB检测肾移植后患者尿中BK病毒

目的:建立一种检测肾移植术后患者尿中BK病毒的荧光PCR方法。方法:选择VP1基因作为检测目标,设计引物、探针,探针5′端用FAM标记,3′端标记MGB,建立重组质粒标准曲线,评价特异性、灵敏度、重复性;对本院收集的肾移植患者尿液标本进行检测。结果:本研究以BK病毒VP1基因中75 bp为靶基因,建立结合TaqMan-MGB的荧光PCR方法,灵敏度为10拷贝/μl,R2:0.999;批间和批内的重复性(CV%)均小于5%。102例临床标本中检测到10例阳性标本,阳性率为9.8%,上述结果与测序验证结果一致。结论:结果表明BK病毒TaqMan-MGB探针荧光PCR方法的特异性好、灵敏度高、操作简便,可特异、快速、灵敏地对临床标本的BK病毒进行定量检测,可用于早期诊断BK病毒感染和预防肾移植术后BK病毒感染造成的相关肾病等方面。