阜新市HIV-1感染者和AIDS患者原发性整合酶基因耐药突变分析

目的 了解阜新市HIV感染者和AIDS患者整合酶基因的变异情况,分析阜新市原发性整合酶基因突变及相关耐药情况,为治疗提供参考依据.方法 收集2018年-2019年阜新市102例HIV-1感染者和AIDS患者外周静脉血,分离血浆,-80℃冻存备用.采用反转录巢式聚合酶链式反应扩增病毒pol基因区并进行序列测定,分析IN区...     

合肥市HIV/AIDS未治疗人群的耐药基因及亚型分析

目的了解合肥地区HIV/AIDS未治疗人群基因亚型和原发性耐药情况。方法应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 pol区聚合酶基因,经DNA测序后进行系统进化树分析和耐药性分析。结果收集79例合肥地区HIV/AIDS未治疗者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列65例,基因分型以CRF01-AE重组亚型最多39例（60.0%）;其次依次是CRF07-BC 21例（32.3%）、B亚型4例（6.2%）和CRF08-BC1例（1.5%）。1例蛋白酶抑制剂（PIs）主要耐药基因突变,2例反转录酶抑制剂（RTIs）耐药基因突变。总耐药突变率为4.6%（3/65）。结论当前合肥市主要的HIV-1流行亚型是CRF01-AE和CRF07-BC,HIV原发性耐药的发生率在国内处于较低水平。     

浙江省HIV/AIDS未治疗人群耐药基因特征研究

目的：横断面了解浙江省未治疗人群耐药基因变异情况,补充耐药监测本底数据。方法：选取2004-2006年期间在各市县接受流行病学调查的104例未治疗HIV/AIDS感染者,对病毒载量高于最低检测限的99个样本进行HIV蛋白酶（PR）全长和部分逆转录酶（RT）基因区进行RT-PCR扩增测序。使用Stanford HIV Drug Resistance Database（ht-tp：//hivdb.stanford.edu）的在线耐药序列分析软件HIV DB进行序列分析,寻找耐药相关突变位点,并做出样本对各药物敏感性的结论。结果：扩增得到74份PI区序列,1份样本存在蛋白酶抑制剂（PIs）主要相关突变,耐药突变率为1.35%;得到83份RT区序列,4份样本存在逆转录酶抑制剂（RTIs）相关突变,耐药突变率为4.8%。总耐药突变率为6.02%（5/83）。结论：浙江省未治疗HIV感染者中耐药相关突变处于低流行状态。但具体感染者体内存在的PR和RT区主要耐药突变位点,会导致对抗病毒治疗药物不同程度的耐药,应该争取条件对治疗前病人进行基因型耐药检测。     

广西新诊断HIV/AIDS患者HIV-1整合酶区基因突变及整合酶抑制剂耐药分析

目的 了解广西新诊断HIV-1感染者整合酶抑制剂（integrase stand transfer inhibitors,INSTIs）耐药率、HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点的突变率及影响因素。方法 使用课题组2019年10月—2020年3月收集的广西新诊断HIV/AIDS患者血液样本，提取HIV-1整合酶区RNA、巢式PCR扩增整合酶基因并测序。利用斯坦福HIV耐药数据库确定患者HIV-1整合酶区耐药突变位点并计算患者耐药率。通过序列比对分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变位点，使用多因素logistic回归分析HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点发生突变的影响因素。结果 320例HIV-1患者的HIV-1整合酶区序列中，以CRF01＿AE亚型（39.4%）为主，耐药率为2.19%，主要耐药突变位点为E92K(0.62%),次要耐药突变位点主要为E157Q(1.25%)。发生频率较高的HIV-1整合酶区耐药相关多态性位点有L74V(0.94%)、E138D(1.25%)和G163E(3.13%)。多因素logistic回归分析显示：HIV-1整合酶区耐药相关多态性突变的影响...     

龙岩市63例HIV/AIDS患者治疗效果分析

目的分析龙岩市2016年新发现HIV/AIDS患者抗病毒治疗效果,评估治疗前后外周血CD4~+T淋巴细胞数(CD4)及HIV-1病毒载量(VL)变化情况,为防治提供参考。方法收集2016年龙岩市新发感染HIV并接受抗病毒治疗的个案信息及血样标本。用描述流行病学方法分析血样CD4~+T淋巴细胞及HIV-1VL检测结果。结果 63例HIV/AIDS从确证到接受抗病毒治疗时间9～307d,首次CD4~+T淋巴细胞平均(238.7±208.1)个/mm~3,治疗满1年时平均(382.6±246.3)个/mm~3,治疗满2年时平均(441.4±286.6)个/mm~3,治疗满2年时CD4细胞数高于治疗前,CD4细胞数随治疗时间延长而增加。HIV-1VL水平:治疗满1年时病毒抑制率90.5%、治疗满2年时病毒抑制率93.7%,治疗满1年时及2年时均高于治疗前。结论 HIV/AIDS患者通过长期规范性服药,可有效增加其外周血CD4~+T淋巴细胞数,降低病毒载量值,能切实改善免疫状况。     

云南省景颇族人群HIV-1感染相关基因多态性研究

目的:了解云南省景颇族人群与HIV-1感染相关基因CCR5-Δ32、CCR2-64I、SDF1-3′A的频率和多态性分布。方法:以云南省113例景颇族人群为研究对象,采用PCR、PCB/RFLP(聚合酶链式反应/限制性片段长度多态性分析)计算基因频率,并用统计学方法进行分析。结果:未发现CCR5-Δ32突变;CCR2-64I突变基因频率为16.37％;SDF1-3′G/3′G突变基因频率为17.70％,突变基因频率低于汉族。结论:由于未发现CCR5-Δ32突变和SDF1-3′G/3′G等位基因频率较低,云南省景颇族人群可能比汉族人对HIV-1(包括R5和X4HIV-1)有较大的遗传易感性。     

广西仫佬、壮和汉三民族HIV辅助受体CCR5基因多态性研究

目的了解广西仫佬、壮和汉三民族人群中HIV辅助受体CCR5△32和CCR5-894C缺失等位基因突变频率和多态性的特点,为评估这三个民族人群对HIV的遗传易感性和艾滋病的防治提供理论依据。方法以197例仫佬族,100例壮族和100例汉族为研究对象,应用PCR和DNA测序等方法检测CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体。结果未发现CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体,均为野生型。结论由于未发现CCR5△32和CCR5-894C缺失突变体,推测广西仫佬、壮和汉三民族人群对HIV-1病毒感染可能具有较大的遗传易感性。     

凉山彝族自治州HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素分析

目的 了解凉山彝族自治州（凉山州）HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素,为预防HIV-1耐药毒株的传播提供参考依据。方法 分别于2017年1月1日至6月30日、2018年1月1日至6月30日在凉山州开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,应用HyPhy 2.2.4和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1耐药毒株传播网络分析。结果 研究对象464例HIV/AIDS,HIV-1毒株为CRF07_BC亚型的占88.6%（411/464）,总的HIV-1耐药率为9.9%（46/464）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）和蛋白酶抑制剂（PI）耐药率分别为6.7%（31/464）、1.9%（9/464）和0.4%（2/464）;有1组HIV-1新型重组毒株URF_01BC亚型独立成簇并携带相关耐药突变位点;多因素logistic回归分析结果显示,与异性性传播人群相比,注射吸毒人群的HIV-1耐药风险较高（aOR=3.03,95% CI：1.40～6.54）。结论 凉山州HIV/AIDS抗病毒治疗前的HIV-1耐药率较高,且有新型重组毒株URF_01BC亚型携带相关耐药突变位点的成簇传播,建议加强HIV-1耐药毒株传播的预防工作。     

广西口岸出入境人员HIV毒株基因多态性研究

目的分析广西口岸出入境人员艾滋病感染者中HIV毒株遗传特征。方法收集2017年广西各口岸出入境人员HIV感染者血液样本,提取病毒RNA,运用巢式PCR的方法对env区和pol区进行扩增,将扩增产物进行基因测序和进化树分析。结果共获得C亚型2例, AE亚型5例,BC亚型2例,AD亚型1例等10份样本的亚型,其中中国、越南与泰国的毒株聚集成一簇流行簇,具有较高的遗传同源性。结论广西口岸出入境人员HIV毒株主要以CRF01-AE流行为主,传播途径以性接触传播为主。各口岸要加强出入境人员HIV的监测,防止HIV毒株亚型在国内进行传播及重组,引起国内HIV毒株亚型流行的复杂化。     

广西南宁市注射吸毒人群HIV-1感染者基因亚型及耐药分析

目的 分析广西南宁市注射吸毒人群中HIV-1分子基因亚型及耐药的特征。方法 2017—2019年在南宁市连续收集感染HIV-1的注射吸毒人群样本225份,通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因,基于最适基因距离构建分子传播网络,并分析入网率、耐药情况及其相关影响因素。结果 163份样本获得 HIV-1 pol区序列,检测到4种HIV-1基因型,其中以CRF08_BC（55.2%,90/163）和CRF01_AE（35.6%,58/163）为主。共有83条序列入网,入网率50.9%（83/163）,形成19个分子传播簇,其中有1个传播簇包含19个节点。163条序列进行耐药分析,共出现24例HIV-1耐药株,NRTIs、NNRTIs和PIs的耐药率分别为2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）、10.4%（17/163,95% CI:5.7%~15.2%）和2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）。83条未治疗序列中获得4条治疗前耐药株,其中1例出现PIs低度耐药,2例出现NNRTIs高度耐药,1例同时产生NRTIs和NNRTIs耐药突变。结论 南宁市IDU HIV-1感染者中病毒基因亚型呈现多样性,其中以 CRF08_BC占优势,并出现超级传播者。抗病毒治疗耐药情况较为严峻,以NNRTIs耐药为主,原发性耐药处于较低水平,一线抗病毒疗法仍有效,但要密切关注耐药监测,防止多重和交叉耐药毒株的流行。     

湖北省2006年艾滋病抗病毒治疗耐药监测结果分析

目的了解湖北省艾滋病患者接受免费抗病毒治疗的效果,分析在抗病毒治疗过程中HIV耐药出现情况以及影响因素。方法对湖北省接受抗病毒治疗的239名艾滋病患者进行了调查,采集抗凝全血,测定CD4~ T淋巴细胞以及病毒载量,同时扩增HIV-1 pol区基因片段的核酸序列,并进行序列测定及耐药基因型分析。结果艾滋病患者在接受抗病毒治疗平均24个月后,主要临床表现明显改善,CD4>200比例平均达到78.67%,病毒载量低于检测限的比例平均达到59%。病毒载量低于检测限的比例与在固定时间服药>90%的比例存在线性关系。在病毒载量>1000拷贝/ml的78名艾滋病患者中,通过PCR共扩增出51份HIV基因片断,其中对NRTI类药物中度以上耐药的比例达到19.84%。对NNRTIs类药物高度耐药比例高达28.16%,其中对2种药耐药比例达到26.88%,3种药均耐药比例达到17.28%。结论随着抗病毒治疗时间的延长,耐药性逐渐增加,出现了对NNRTIs类药物的高度耐药和交叉耐药,对NRTIs中高度耐药的毒株也大量出现,这将导致临床用药选择极为困难。     

广州市2008-2015年未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群HIV-1感染者耐药分析

目的 了解广州市未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群（IDU）HIV-1感染者耐药株流行情况。方法 收集2008-2015年新确证HIV-1抗体阳性、现住址为广州市、传播途径为注射吸毒、确证时未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的血清样本,提取HIV-1 RNA,采用巢式PCR法扩增pol区蛋白酶（PR）基因全序列与反转录酶（RT）基因部分序列并测序后,提交到美国斯坦福大学HIV耐药数据库做耐药分析。结果 518例HIV感染者中,有407例（78.57%）血清样本成功获得pol区基因片段。年龄18~64（37.44±8.14）岁,男性占89.68%（365/407）,汉族占89.93%（366/407）,未婚者占55.28%（225/407）,文化程度以初中及以下为主（83.78%,341/407）。HIV-1亚型以CRF07_BC为主（47.18%,192/407）,CRF01_AE占23.83%（97/407）和CRF08_BC占22.85%（93/407）,其他亚型占6.14%（25/407）。总耐药率为3.44%（14/407）,蛋白酶抑制剂耐药率为1.47%（6/407）,核苷类反转录酶抑制剂耐药率为0.25%（1/407）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药率为1.72%（7/407）。突变发生率为12.29%（50/407）,蛋白酶区和核苷类反转录酶区未检出主要耐药突变,非核苷类反转录酶区中V179E突变率更高的是其他亚型和CRF07_BC亚型,其他亚型中的CRF55_01B亚型8例全部发生此突变;E138A突变率最高的是CRF08_BC亚型,为3.23%。有2例病例对NNRTIs的4种药物全都耐药。结论 2008-2015年广州市未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的耐药率处于较低水平,大多数IDU HIV-1感染者对现有抗病毒治疗药物敏感。应加强IDU HIV-1感染者的耐药监测,控制耐药性毒株多重、交叉耐药的流行。     

湖北省抗病毒治疗和未治疗的HIV-1感染者耐药基因变异研究

目的研究湖北省流行的HIV-1毒株在经过高效抗逆转录病毒治疗（HAART）及未治疗人群中耐药基因变异情况。方法采集HIV-1感染者抗凝外周血，提取前病毒DNA，用巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因约2kb的核酸序列，进行序列测定并通过斯坦福耐药基因数据库进行耐药基因型分析。结果抗病毒治疗组19例，未治疗组25例。在所有的HIV-1感染者样本序列中，发现针对蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药突变：D30N（2．27％），D30G（2．27％），M461（4．55％），M46N（2．27％），147V（4．55％），184V（4．55％），184L（2．27％），N88S（2．27％），L90S（2．27％），以及针对PIs的次要耐药基因突变；A71T（29．55％）。在治疗组中出现针对逆转录酶抑制剂（NRTIs及NNRTIs）的主要耐药基因突变的样本5例，突变主要有M41L（5．26％），A62V（5．26％），D67N（5．26％），L210W（5．26％），T215Y（15．79％）；K103E（5．26％），K103N（10．53％），Y181C（5．26％），G190A（5．26％），K238N（5．26％）。在未治疗组中出现针对逆转录酶抑制剂（NRTIs及NNRTIs）的主要耐药基因突变的样本5例，突变主要有M184V（4％），K65N（4％），Y115M（4％），F116L（4％），M1841（4％）；V179D（4％），G190R（4％）。在逆转录酶（RT）基因中耐药意义不明的突变F214L，与药物的使用有统计学上的相关性（P=0．03）。结论湖北省HIV-1感染者RT基因的耐药突变，在治疗和未治疗人群样本中差异有统计学意义，说明药物治疗已经对HIV耐药基因突变的产生有了一定影响。同时，耐药意义尚未明确的突变位点F214L也可能与治疗或是某些药物的使用有一定的相关性。     

676株肠球菌耐药性监测及万古霉素耐药基因研究

摘要:目的　探讨临床分离的肠球菌分布和耐药情况,以及耐万古霉素肠球菌（VRE）的基因型。方法　统计分析2013年1月-2014年3月,临床分离的肠球菌与药敏结果,VRE进一步用E-test药敏试验确认,PCR法检测VRE的耐药基因。结果　共分离出肠球菌属菌676株,以粪肠球菌354株（占52.4%）和屎肠球菌299株（占44.2%）为主;标本分布中以中段尿（占33.9%）、痰等呼吸道标本（占23.1%）和创面分泌物（占21.2%）为主;肠球菌属菌对万古霉素和替考拉宁仍极敏感,万古霉素耐药粪肠球菌和屎肠球菌检出率分别为0.3%、2.7%。粪肠球菌对氨苄西林、呋喃妥因、青霉素和磷霉素耐药率较低,分别为2.6%、6.0%、6.9%和8.2%,对左氧氟沙星和氯霉素耐药率＜30%;屎肠球菌耐药性明显高于粪肠球菌,对氨苄西林和青霉素的耐药率都超过95%,对左氧氟沙星、红霉素和利福平的耐药率均在90%左右,但对氯霉素的耐药率明显低于粪肠球菌,仅为5.1%。检出9株VRE,其基因型均为VanA。结论 已发现9株VRE,应该加强医院感染控制,防止VRE的暴发流行。     

浙江省台州市未接受抗病毒治疗HIV感染者CD+4T淋巴细胞计数自然变化研究

目的探讨浙江省台州市未接受抗病毒治疗的HIV感染者CD4+T淋巴细胞计数自然变化速率及相关影响因素。方法对1996-2011年台州市报告发现的无抗病毒治疗史或接受抗病毒治疗前至少有过两次CD4+T淋巴细胞计数检测的HIV感染者进行回顾性队列研究,描述CD4+T淋巴细胞计数自然变化速率,并运用Lo-gistic回归分析其影响因素。结果共纳入研究对象412例,CD4+T淋巴细胞计数月均自然变化速率中位数M=-2.9(IQR:-9.7～1.6);286例(69.4%)HIV感染者末次CD4+T淋巴细胞计数结果低于首次;130例(31.6%)HIV感染者末次CD4+T淋巴细胞计数较首次水平下降≥30%,即显著下降。Logistic多因素回归分析显示,HIV感染者CD4+T淋巴细胞计数显著下降与年龄、职业、首次CD4+T淋巴细胞计数水平及首末次检测时间间隔存在关联。结论浙江省台州市HIV感染者CD4+T淋巴细胞计数自然变化总体平缓,但部分感染者CD4+T淋巴细胞计数快速下降且与多种因素有关。应定期随访检测HIV感染者CD4+T淋巴细胞计数水平,密切观察变化速率,以评估其病情进展并适时启动抗病毒治疗。     

河南省HIV-1感染者抗病毒治疗效果及耐药发生的研究

目的 了解河南省部分地区HIV-1感染者高效抗逆转录病毒治疗效果及耐药变异发生情况.方法 招募HIV-1感染者105例,每半年进行1次调查,利用流式细胞技术对CD4+T淋巴细胞计数,使用NASBA方法测定病毒载量,利用RT-PCR方法扩增HIV-1 pol区基因,进行基因型耐药性分析.结果 接受抗病毒治疗后HIV-1感...     

云南省德宏州HIV-1新近感染者基因型耐药分析

目的 了解云南省德宏州HIV-1新近感染者中耐药的发生情况.方法 收集德宏州2006年7-12月期间所有的HIV-1阳性样品共1048份,使用BED捕获酶免疫试验进行新近感染检测,共检出新近感染样品101份;使用Bayer公司的TruGene方法进行基因型耐药检测,应用所有样品的序列构建系统进化树以确定样品的亚型.结果云南省德宏州HIV.1新近感染者巾的耐药发生率为6.25%(4/64),样品PR区中M36I/V、L63P和H69K等次要耐药突变出现的频率较高,分别占81.25%、70.31%和65.63%;HIV-1流行株以C/CRF07 BC/08_BC为主,占65.63%(42/64).结论德宏州HIV-1新近感染者中耐药的流行处于中等水平;有必要加强HIV-1的耐药监测.