黑龙江省2018年新发现HIV-1感染者毒株亚型分子簇及耐药情况

目的 分析黑龙江省HIV-1感染者的毒株亚型构成、分子簇形成和耐药株流行情况.方法 对2018年1-6月期间新诊断的、尚未进行抗病毒治疗的黑龙江省HIV-1感染者,采集血样、提取病毒RNA,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)/巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因,测序后进行生物信息学分析.结果 获得157例H...     

MSM人群急性HIV-1感染者病毒亚型分析

目的研究2007-2009年男男性行为人群（MSM）艾滋病病毒-1型（HIV-1）的基因亚型,以监测MSM人群HIV病毒株的最新流行情况。方法采集95例MSM急性HIV-1感染者的外周全血,从外周全血浓缩白细胞中提取脱氧核糖核酸（DNA）,用巢式聚合酶链反应（Nested-PCR）对HIV-1的前病毒DNA进行扩增,然后检测并分析PCR扩增产物的核苷酸序列,确定病毒的基因亚型。结果 95例感染者平均年龄为（35.02±9.15）岁,其中20～50岁的青壮年45例（94.74%）,未婚51例（53.68%）,大专或大学及以上文化程度者30例（占31.58%）。感染者中共发现CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型（包括CRF07_BC和CRF08_BC）及C亚型4种亚型。其中CRF01_AE重组亚型56例（占58.95%）,B亚型28例（占29.47%）,BC重组亚型10例（占10.53%）,C亚型1例（1.05%）。结论 MSM人群急性HIV-1感染者年轻化,文化程度普遍偏低。小样本流行病学调查显示,急性HIV-1感染者中有CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型及C亚型4种亚型病毒株流行,CRF01_AE亚型为MSM人群的主要亚型。     

出入境人群HIV-1型env C2-V3区段基因序列分析和亚型研究

目的 了解出入境人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者毒株基因亚型分布及流行特征.方法 收集2001年以来上海口岸HIV抗体检测确认阳性的血样标本,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应进行体外扩增,获得包膜蛋白区基因(env)的核酸片段,测定其序列和进行亚型分析.结果 获得20例标本的亚型分析结果,共检出8个亚型,包括B亚型7例,CRF02-AG 3例,C亚型3例,CRF01-AE 2例,A亚型2例,B、CRF07-BC和CRF08-BC亚型各1例.上海口岸HIV-1毒株亚型分布于11个国家和地区,主要流行B亚型.结论 上海口岸流行的HIV-1毒株复杂多样,出入境人员是我国HIV毒株输入的主要渠道,流行毒株以性接触传播为主.     

河北省不同途径感染人群HIV-1基因亚型分析

目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B’亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。     

浙江省2003-2005年HIV-1感染者分子流行病学研究

目的掌握浙江省2003-2005年新发现感染者艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株基因亚型分布和变异情况。方法对2003-2005年浙江省境内检测新发现的HIV-1感染者进行一般流行病学调查并采集血样,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应对gag基因区进行扩增并测定其序列。结果采集143份血样,112份扩增阳性,检出CRF01-AE亚型43例,CRF07-BC 37例,CRF08-BC 11例,B亚型20例,CRF02-AG 1例。CRF01-AE分布在11个市中的9个市,主要存在于异性性途径感染者中(53.5%),并已成为外省籍注射吸毒感染者的主要构成(44.8%)。CRF01-AE和CRF07-BC的亚型组内平均离散率在静脉吸毒感染者和性传播感染者中比较,差异有统计学意义。结论浙江省2003-2005年新检出感染者HIV-1毒株呈现多重组型别特征,CRF01-AE成为分布最广的类别,呈现扩大流行的趋势。HIV-1在性乱人群之间的传播要比在注射吸毒人群复杂,变异更大。     

重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

目的对重庆市流行的艾滋病（AIDS）病毒1型（HIV-1）进行分子流行病学调查,为艾滋病预防控制策略的制定提供依据.方法用套式聚合酶链反应（nested-PCR）对31份重庆市HIV-1抗体阳性者外周血单个核细胞（PBMC）中前病毒DNA的膜蛋白基因的C2-V3区,及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果31份标本中有21份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为67.6%.经过基因离散率计算和系统树分析后证实：1份标本为CRF01-AE流行重组毒株,20份标本为HIV-1 BC重组毒株.结论目前重庆市HIV-1 BC重组病毒为优势流行株,为有效控制HIV流行,需要重点在吸毒人群中开展行为干预措施.     

2018年新报告HIV-1感染者省际传播特征分析

目的 分析省际1 型艾滋病病毒(HIV-1)的传播特征,为实施精准防控进而减少HIV-1在我国的流行提供科学数据.方法 对2018年当年新报告的HIV-1感染者进行抽样调查.收集血样并提取病毒核糖核酸,获得pol区部分片段的序列,构建系统进化树.运用HIV-TRACE构建分子网络并筛选出跨省分子簇.结果 共调查31个省...     

河南驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV亚型分析北大核心

目的分析河南驻马店市经性传播的艾滋病病毒(HIV)感染者中,HIV流行毒株亚型及其毒株特征。方法通过专业问卷调查,了解驻马店地区经性传播HIV感染者的基本状况。采集感染者的EDTA抗凝静脉血,检测其CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数,提取外周血浆中病毒核糖核酸(RNA),使用反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法扩增病毒全长gag和部分pol基因,利用Clustal软件比对序列,利用BioEdit软件手工校对,利用NCBI网站HIV分型工具分析病毒亚型,利用MEGA软件构建NJ树,分析病毒系统进化关系。结果共收集到HIV感染者血液74份,全部经性传播感染HIV。经过测序,共获得HIV全长gag基因56条(75.7%),全长pol基因38条(51.4%)。对61例HIV感染者感染病毒亚型进行了分析,其中B亚型毒株47例(77.0%),CRF01_AE毒株6例(9.8%),CRF07_BC毒株4例(6.6%),C亚型毒株2例(3.3%),新型重组毒株2例(3.3%)。系统进化分析显示,所有的B亚型毒株均为Thai B毒株。38例获得pol区序列的样本中,有4例具有耐药突变。结论驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV毒株构成复杂,Thai B亚型毒株是优势毒株,CRF01_AE、CRF07_BC、C等亚型毒株均已进入该人群,而且出现了新型重组毒株。针对该人群的HIV流行毒株监测至关重要。     

甘肃省HIV-1毒株基因序列测定和亚型分析

目的对甘肃省流行的艾滋病病毒（HIV）开展分子流行病学调查.方法用套式聚合酶链反应对23份甘肃省HIV-1感染者外周血淋巴细胞中前病毒脱氧核糖核酸（DNA）的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果甘肃省流行的HIV-1分属B＇亚型（6例）、C亚型（1例）、CRF-BC亚型（16例）.其中CRF-BC亚型（70%）为主要流行毒株.结论甘肃省HIV-1流行亚型以重组毒株CRF-BC为主,在吸毒人群中广为流行;加强对高危人群监控,是遏制艾滋病在甘肃省蔓延的重中之重.     

九江市HIV-1流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的了解九江市艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亚型分布情况。方法对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得gag基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株4株,B亚型和A/E重组亚型HIV-1毒株各1株。结论HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。     

广州市外籍HIV-1抗体阳性者的基因型耐药分析

目的了解广州市外籍人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（HIV-1）抗体阳性者中,耐药毒株的流行情况。方法应用巢式聚合酶链反应（PCR）方法,从广州市2008-2010年新确证的外籍HIV-1抗体阳性样本中,扩增蛋白酶（PR）和反转录酶（RT）基因序列,并与斯坦福耐药数据库比对,辨别耐药突变位点,分析耐药性。结果共获得90例外籍HIV-1抗体阳性者的PR和RT序列,耐药率为23.33%（21/90）,其中对蛋白酶抑制剂（PIs）耐药率为15.56%（14/90）,且集中表现为对NFV/r耐药,对核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为6.67%（6/90）,对非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药率为5.56%（5/90）;发现1例对除DRV/r外的所有其他PIs耐药,4例对所有NNRTIs耐药,2例对所有NRTIs耐药;发生频率较高的突变是L10I/V和K20I。结论广州市外籍HIV-1抗体阳性病例中存在耐药株的流行,尤其是耐多药毒株的存在,增加了广州市耐药毒株传播的风险。     

2005年广州市结核病现况抽样调查

目的了解广州市结核病的流行现状及危害程度，评价广州市结核病防治措施，为制定广州市2006至2010年结核病防治规划提供科学依据。方法采用整群随机和按人口比例抽样方法，抽样人口比例为1：158。广州市应有流行病学调查点为24个，平均每个调查点的应检人数为1656人。对调查点0～14岁儿童进行结核菌素纯蛋白衍生物试验，询问其卡介苗接种史并检查卡痕；对结核菌素反应≥10mm，或虽〈10mm但伴有水疱等强反应的儿童和≥15岁应检人口进行X线胸透；对疑有肺结核症状者、X线胸透有异常阴影及已知肺结核患者均拍摄胸部X线片；对X线胸透异常及疑有肺结核症状者进行痰涂片和痰培养检查，对培养阳性的标本进行菌种鉴定。结果广州市活动性肺结核患病率为201／10万，涂阳肺结核患病率为33／10万，菌阳肺结核患病率为43／10万；14岁以下儿童中未发现活动性肺结核患者，15～50岁组活动性肺结核患病率为72．5／10万～176．8／10万，80岁以上达高峰，以老年男性最高（2341／10万）；已知活动性肺结核、涂阳和菌阳肺结核分别为35．0％（28／80）、61．5％（8／13）和47．1％（8／17）；初治活动性肺结核、涂阳和菌阳肺结核分别为81．3％（65／80）、69．2％（9／13）和58．8％（10／17）；55岁以上组的复治活动性肺结核患者占80．0％。结论广州市的结核病患病率仍较高，老年菌阳肺结核仍较多。     

广州市男男性行为者HIV-1分子流行病学研究

目的了解广州市男男性行为人群（MSM）中,人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（HIV-1）亚型流行状况和基因变异特征。方法从2006～2007年广州市发现的、全部19份经男男性传播感染的HIV-1阳性血清样本,应用套式聚合酶链式反应（Nested—PCR）分别扩增gag和fitly区基因,并测定、分析序列。结果被成功扩增的有17份样本,获得13份env基因序列和17份gag基因序列。经系统进化树分析,11份（64．71％）为CRF01_AE,2份（11．76％）为CRF07_BC,4份（23．53％）为B。各亚型组内基因离散率：在env区,CRF01_AE为（8．27±0．93）,CRF07_BC为（11．04±1．72）,B为（16．65±1．78）;在gag区,CRF01_AE为（5．36±0．68）,CRF07_BC为（4．29±1．14）,B为（11．75±1.35）。V3环顶端四肽分析显示：8份CRF01_AE和2份CRF07_BC V3环顶端四肽均为GPGQ;3份B亚型中2份为GPGR,1份为GWGR。根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况,结果显示：所有样本均被预测使用CCR5辅助受体。结论广州市MSM人群HIV-1感染者中,至少存在CRF01_AE、CRF07_BC 2种重组亚型和B亚型的流行,且大部分流行株可能为使用CCR5辅助受体的巨嗜细胞嗜性／NSI毒株。     

Intrafamilial transmission of HIV-1 infection from individuals with unrecognized HIV-1 infection

OBJECTIVE: To describe the clinical, epidemiological and molecular evidence for transmission of HIV-1 infection from a person with unrecognized HIV infection to a family member in two unconnected families where the route of transmission could not be conclusively determined. DESIGN: Case studies, molecular analysis of viral strains and a clinical and laboratory investigation of risk factors for transmission. SETTING: State referral centres for HIV/AIDS in two Australian teaching hospitals. RESULTS: Previously unrecognized HIV-1 infection was diagnosed in two unconnected females following blood donation in different Australian cities. Initially, no source of infection was identified but subsequently HIV-1 infection was diagnosed in the sister of one case and the adult son of the other. Using nucleic acid-based methods, it was demonstrated that one index case and her sister were infected with highly homologous 'Russian-type' HIV-1 subtype A, and the other index case and her son were infected with highly homologous HIV-1 subtype E (CRF01_AE). Sexual history taking from the sister and the son of the respective index cases revealed prior sexual partners from geographical areas in which the corresponding subtypes are known to be prevalent. Extensive history taking, cross-validated by independent reviewers, found no evidence whatsoever that any form of sexual contact or known blood contact could explain the HIV-1 infection in the two index cases. However, there was evidence that some form of domestic contact involving unperceived blood transfer may have occurred. CONCLUSION: Intra-familial transmission of HIV-1 infection should be considered when a source of HIV-1 infection cannot be determined.     

2000-2005年广州地区稻叶型霍乱弧菌的分子分型

目的：分析20002005年广州地区霍乱暴发点、散发事件和环境监测分离的稻叶型霍乱弧菌的致病相关基因型和脉冲场凝胶电泳技术（PFGE）分型，探讨该稻叶型霍乱的流行特征和趋势。方法：对分离株进行噬菌体生物分型，采用多重PCR方法检测菌株的4种致病相关基因，应用PFGE进行分子分型，并采用软件BioNumerics Version4．0进行聚类分析。结果：广州地区稻叶型霍乱菌株中存在3种致病相关基因型：A、B和C型。98％感染者分离株为致病相关基因A型，45％环境分离株为C型。82株菌分为39个不同的PFGE型。各年份稻叶型暴发与散发事件中均存在具有PFGE分型特征一致的菌株，而环境中菌株则存在多种不同的PFGE型，来源不同地区分离株也均有相似的分型特征。结论：噬菌体一生物分型、致病相关基因分型和PFGE分型存在一定的关联规律性，分子分型可为分析霍乱疫情和预警提供技术平台。     

Socio-demographic and epidemiological characteristics associated with human immunodeficiency virus type I (HIV-1) infection in HIV-1-exposed but uninfected individuals, and in HIV-1-infected patients from a southern Brazilian population

The ability to control human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection and progression of the disease is regulated by host and viral factors. This cross-sectional study describes the socio-demographic and epidemiological characteristics associated with HIV-1 infection in 1,061 subjects attended in Londrina and region, south of Brazil: 136 healthy individuals (Group 1), 147 HIV-1-exposed but uninfected individuals (Group 2), 161 HIV-1-infected asymptomatic patients (Group 3), and 617 patients with AIDS (Group 4). Data were obtained by a standardized questionnaire and serological tests. The age of the individuals ranged from 15.1 to 79.5 years, 54.0% and 56.1% of the Groups 3 and 4 patients, respectively, were men. The major features of groups 2, 3, and 4 were a predominance of education level up to secondary school (55.8%, 60.2% and 62.4%, respectively), sexual route of exposure (88.4%, 87.0% and 82.0%, respectively), heterosexual behavior (91.8%, 75.2% and 83.7%, respectively), and previous sexually transmitted diseases (20.4%, 32.5%, and 38.1%, respectively). The patients with AIDS showed the highest rates of seropositivity for syphilis (25.6%), of anti-HCV (22.3%), and anti-HTLV I/II obtained by two serological screening tests (6.2% and 6.8%, respectively). The results documenting the predominant characteristics for HIV-1 infection among residents of Londrina and region, could be useful for the improvement of current HIV-1 prevention, monitoring and therapeutic programs targeted at this population.     

Antibodies to soluble CD4 in HIV-1-infected individuals

A direct enzyme immunoassay (EIA) using the recombinant soluble form of CD4 (sCD4) produced in rodent cells as antigen was applied to detect antibodies to CD4 in sera from HIV-1- and HIV-2-infected patients. High titers of antibodies to sCD4 were found in sera from 12.6% of the HIV-1-infected persons included in this study, but not in 120 normal human sera. The reactivity of these antibodies with sCD4 was confirmed by a Western blot analysis. A possible anti-idiotypic origin of those antibodies was thought to be unlikely in view of the lack of inhibition of the binding of the biotin-labeled monoclonal antibody (mAb) anti-Leu3a by sCD4 positive sera. Attempts to correlate the evolution of the disease with the presence or absence of antibodies to sCD4 in a panel of well documented HIV-1-seropositive cases did not reveal any clear correlation. Sera from HIV-2-infected people (nine sera analysed), sera from HIV-1-infected chimpanzees (10 sera analysed) and sera from humans immunized with a recombinant vaccinia virus expressing gp160 (10 sera analysed) scored negative for antibodies to sCD4. The possible origin and biological significance of the observed antibodies to sCD4 are discussed.