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目的 基于网络药理学和分子对接的方法探究活血温通方治疗冠心病的作用机制。方法 通过TCMSP平台检索活血温通方药物靶点,通过GeneCards数据库检索冠心病疾病靶点,使用Cytoscape软件绘制“活血温通方-冠心病网络图”,通过STRING数据库绘制蛋白质互作网络图,利用DAVID数据库进行基因富集分析,利用Autodock vina软件进行分子对接。结果 检索得到活血温通方药物靶点158个,疾病靶点3095个。核心成分为木犀草素、丹参酮IIA、β-谷甾醇、7-甲氧基-2甲基异黄酮、刺芒柄花素、黄芩素等,核心靶点为TP53、IL6、VEGFA、MYC、MAPK1、EGFR等。KEGG通路富集分析得到103个条目,涉及PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路。分子对接结果显示核心成分与核心蛋白具有较好的结合能。结论 活血温通方治疗冠心病是多成分、多靶点、多通路相互作用的结果,其机制可能涉及抑制细胞凋亡、减轻炎症、促进血管新生等方面。 相似文献
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目的 利用系统药理学方法探究冠心Ⅱ号方治疗冠心病的作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选出冠心Ⅱ号方五味药所含有效化学成分,用DrugBank数据库和PharmMapper服务器对有效化学成分进行作用靶点预测;通过GeneGards和CTD数据库筛选出与冠心病相关靶点,将疾病相关靶点与化合物靶点进行对比得到交集靶点,利用David在线分析工具对交集靶标基因进行GO分析和KEGG分析,用IGEMDOCK软件验证靶标基因与活性成分的结合活性。结果 共得出150个活性成分,对应176个靶点,与冠心病相关靶点22个,网络分析结果表明靶点参与血压调节、一氧化氮生物合成过程的正调控、谷胱甘肽代谢过程等生物学过程;线粒体、细胞外间隙、神经元胞体等细胞组成;超氧化物歧化酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性等分子功能;调节FOXO信号转导通路、ErbB信号通路、HIF-1信号通路和AMPK信号通路等通路发挥治疗冠心病作用。结论 本研究从系统药理学层面初步揭示了冠心Ⅱ号方治疗冠心病的作用机制,冠心Ⅱ号方治疗冠心病具有多成分、多靶点、多途径等特点,为下一步深入验证研究提供了良好的理论基础和新的思路。 相似文献
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目的 运用网络药理学和分子对接的方法研究黄山药干预冠心病(coronary heart disease,CHD)的多成分、多靶点、多通路作用机制,旨在为其基础研究及临床应用提供依据。方法 通过PharmMapper数据库检索并筛选黄山药的活性成分及作用靶点,利用GeneCards、DisGeNet、OMIM、DRUGBANK筛选冠心病相关靶点,取两者交集靶点;利用STRING11.0获得蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.7.2 构建PPI网络,MCODE插件分析黄山药干预冠心病关键靶点;采用R3.6.1中的ClsuterProfiler程序包进行GO、KEGG基因富集分析,得到黄山药干预冠心病的潜在作用通路,并利用Cytoscape3.7.2构建成分-靶点-通路图;采用 AutoDock Tools 1.5.6、MOE2019进行分子对接研究。结果 黄山药中筛选得到10个活性成分,其中涉及冠心病作用靶点62个,MCODE分析最终筛选出10个关键靶点;分子对接验证亦显示评分大于4.25者占总数90%,大于5者占88.3%,即大部分靶点与成分的结合活性较好;KEGG富集分析关键靶点主要被富集在MAPK 信号通路、Ras信号通路、PI3K-Akt信号通路、雌激素信号通路、IL-17信号通路等20个显著相关通路,涉及炎症反应、免疫调节等140个显著相关生物过程。结论 基于网络药理学探讨了黄山药干预冠心病多成分-多靶点-多通路的作用特点,预测黄山药主要活性成分胡萝卜苷、延龄草苷、新甾体皂苷、progeninⅢ等,可能通过ALB、EGFR、SRC、MAPKs等靶点,作用于MAPK、雌激素、Ras、PI3K/Akt等信号通路干预冠心病,分子对接结果显示,黄山药中的核心化合物胡萝卜苷、延龄草苷、新甾体皂苷、progeninⅢ等与主要靶点(ALB、EGFR、SRC、MAPK1)的结合活性较强,为进一步开展黄山药干预冠心病作用机制研究提供了新的思路和方法。 相似文献
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目的 通过网络药理学方法全面系统筛选白虎加人参汤治疗2型糖尿病(T2DM)的治疗靶点及相关信号通路,并通过动物实验进一步明确其作用机制。方法 应用TCMSP、TCMID和PubChem数据库获取白虎加人参汤的化学活性成分及相关靶点信息,在GEO数据库获得影响T2DM的差异基因,并与白虎人参汤靶点交集获取共同靶点;运用STRING V11.0数据库进行蛋白互作分析并获取蛋白互作网络图及核心靶点;通过DAVID 6.8分析平台,获得GO功能注释结果及KEGG通路富集结果,分析通路相关基因及功能,并通过实验进行验证。选取MKR小鼠24只,随机分为模型组、低剂量白虎加人参汤组、高剂量白虎加人参汤组,各8只,另选取8只同龄同性别FVB小鼠作为对照组。各组给药4周后,测定小鼠空腹血糖(FBG),采用酶联免疫吸附测定(ELISA)检测小鼠血清中白细胞介素-6(IL-6)、IL-1β、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测PI3K、AKT、NF-κB的蛋白表达,实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测PI3K、AKT、NF-κB的mRNA相对表达量。结果 筛选得到白虎加人参汤中101种潜在成分和70个共同靶点,成分-靶点网络图显示白虎加人参汤可能通过VEGFA、FYN、AR、ABL1等蛋白靶点,经由磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路发挥治疗T2DM的作用。动物实验结果显示,与模型组比较,白虎加人参汤降低MKR小鼠空腹血糖及血清中IL-6、IL-1β及TNF-α水平(P<0.05,P<0.01),下调PI3K/ AKT信号通路上的PI3K、AKT、NF-κB蛋白表达及其mRNA相对表达量(P<0.01)。结论 白虎加人参汤可以通过多成分、多靶点、多通路的作用效应治疗T2DM,实验证实了白虎加人参汤能够下调PI3K/ AKT通路相关蛋白表达及mRNA相对表达量,降低MKR小鼠血糖和血清炎症因子水平,验证了网络药理学结果,为深入研究白虎加人参汤治疗T2DM提供了依据。 相似文献
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目的 运用网络药理学方法分析预测血府逐瘀汤治疗失眠的作用机制。方法 借助TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选血府逐瘀汤的有效活性成分及作用靶点;Genecards、OMIM获得失眠的疾病靶点,Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点网络并分析;STRING及Cytoscape构建PPI网络;利用Bioconductor对作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,预测其作用机制。结果 血府逐瘀汤包含227个中药活性成分和303个靶点,作用于失眠的有110个活性成分和52个靶点。其中关键成分有槲皮素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、豆甾醇、山奈酚、β-谷甾醇,核心靶点为ALB、APP、IL-6、FOS。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示血府逐瘀汤主要涉及神经递质水平的调节、细胞因子受体结合等生物过程,通过作用于糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、神经活性配体-受体相互作用等多条通路发挥治疗失眠的作用。结论 本研究初步揭示了血府逐瘀汤治疗失眠的活性成分、作用靶点及通路,提示血府逐瘀汤具有多成分、多靶点、多途径的协同作用特点,为进一步深入研究其作用机制提供了重要依据。 相似文献
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目的 本研究利用网络药理学、分子对接技术,探索黄芪生脉散治疗糖尿病的潜在作用机制,并结合体外细胞实验对相关信号通路进行初步验证。方法 查阅多个数据库和结合文献筛选黄芪生脉散的有效成分和对应靶点及糖尿病相关靶点,通过DAVID数据库进行疾病预测以及治疗机制预测,将黄芪生脉散有效成分与成分靶点构建黄芪生脉散的成分-靶点网络。此外,选取成分-靶点网络中度值较大的15个关键靶点和FDR值排名前10的疾病构建黄芪生脉散治疗疾病-靶点网络。再进一步使用AutoDock vina软件对黄芪生脉散的有效成分和糖尿病关键靶点进行分子对接。最后利用HepG2细胞胰岛素抵抗(IR)模型对黄芪生脉散提取物的石油醚部位、乙酸乙酯部位、正丁醇部位进行降血糖活性验证,并通过Western-blotting实验探究其石油醚部位对PI3K-Akt信号通路的影响。结果 共挖掘到黄芪生脉散54个有效成分,411个潜在成分靶点及279个糖尿病相关靶点。此外,预测到黄芪生脉散治疗疾病182种,其中2型糖尿病(T2DM)与靶点关联性最强(degree值=12),由此推测黄芪生脉散可能在治疗糖尿病方面具有显著作用。另外,PPI网络中degree > 20的靶点有AKT1、PIK3CA、PIK3R1和VEGFA等,推测这些靶点可能为黄芪生脉散治疗糖尿病的关键靶点。同时,分子对接结果显示黄芪生脉散8个有效成分(degree值≥15)与糖尿病关键靶点有较强的结合能力,并且KEGG富集分析发现与糖尿病相关的主要调控通路为PI3K-Akt信号通路。体外细胞实验发现,黄芪生脉散提取物可浓度依赖性的增加HepG2细胞胰岛素抵抗模型对葡萄糖的摄取,比阳性药盐酸二甲双胍的药效更强。Western-blotting实验结果表明,黄芪生脉散石油醚部位可显著改善HepG2细胞IR模型Akt、GSK3β蛋白表达水平的异常升高以及p-Akt和p-GSK3β的异常降低(与IR组相比P<0.05)。结论 黄芪生脉散的活性成分可能通过作用于INSR、AKT1、PIK3CA等多个糖尿病相关靶点,调节PI3K-Akt信号通路,降低胰岛素抵抗从而发挥对糖尿病的治疗作用。 相似文献
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目的 基于网络药理学与分子对接技术研究蒙药三味檀香汤治疗缺血性心脏病的作用机制,并分析关键活性成分在缺血性心脏关键靶点中的分子调控机制。方法 通过TCMSP数据库获取三味檀香汤的活性成分及其作用靶点,与Gene Cards等数据库获取的疾病靶点取交集,筛选出三味檀香汤对缺血性心脏病的治疗作用靶点,利用Cytoscape软件对“三味檀香汤-缺血性心脏病”的“活性成分-作用靶点”网络进行可视化处理;再利用String数据库构建蛋白互作网络,并筛选出关键靶点,然后在关键活性成分和关键靶点间进行分子对接验证;同时通过DAVID数据库对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析。最后探讨“关键活性成分-关键靶点-信号通路”间的关系。结果 ①得到活性成分20个,治疗靶点175个;②槲皮素、木犀草素、柚皮素、山柰酚、异鼠李素为三味檀香汤的关键活性成分;③MAPK3、MAPK1、JUN、RELA、AKT1为蛋白互作网络中的关键靶点;④关键活性成分和关键靶点间具有良好的结合活性;⑤DAVID富集分析主要涵盖细胞对活性氧的反应、细胞对氧化应激的反应、老化等生物学过程,涉及B细胞受体、AGE-RAGE及Toll样受体等信号通路。⑥三味檀香汤通过多个靶点、多种信号通路治疗缺血性心脏病。结论 本文研究采用网络药理学分析了三味檀香汤治疗缺血性心脏病的潜在作用机制,可为进一步研究其药效物质基础及作用靶点提供参考。 相似文献
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目的 该研究通过网络药理学和分子对接技术探讨新香冲剂治疗流感的作用机制。方法 首先,基于SymMap、PubChem、FAF-Drugs4、TargetNet等网站工具,筛选新香冲剂中的活性成分,预测其靶点。通过GEO数据库获得人类流感疾病靶点。利用Cytosacpe3.6.0软件构建中药-成分、成分-靶点、药物-疾病蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,对网络进行拓扑结构分析,筛选出关键化合物和关键靶点。提取核心子网络,利用DAVID6.8在线工具对核心子网络的靶点做基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京东基因百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。利用分子对接方法分析关键化合物和关键靶点的相互作用关系。结果 成分-靶点网络分析得到9种重要的活性化合物,关键化合物为芹菜素(Apigenin)。药物、疾病网络的共同靶点基质金属蛋白酶9(Matrix Metalloproteinase-9,MMP9)是关键靶点。GO分析显示核心子网络与抗炎、调节免疫等多个生物学过程相关。KEGG富集分析得到甲型流感疾病通路。分子对接显示,芹菜素与MMP9可通过氢键结合形成稳定的构象。结论 新香冲剂通过抗病毒、抗炎、调节免疫等机制治疗流感,调控宿主细胞MMP9的表达是其发挥作用的途径之一,以上结论有待进一步开展实验验证。 相似文献
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目的 本研究探讨补阳还五汤治疗高脂血症的物质基础与作用机制。方法 运用TCMSP数据库和STICH数据库收集补阳还五汤化学成分和靶点信息,通过HPO数据库筛选疾病的靶点,然后利用Cytoscape 3.6.1软件对成分靶点和疾病靶点进行网络拓扑学分析,获取补阳还五汤治疗高脂血症的作用靶点,再运用DAVID在线分析工具对作用靶点进行KEGG通路富集及分析,最后构建“补阳还五汤-化学成分-核心靶点-关键通路”的多层次网络关联图。结果 共得到补阳还五汤潜在活性成分107个,药物靶点487个,疾病靶点95个,拓扑分析共得核心靶点113个,主要KEGG通路20条。本研究结果表明,补阳还五汤治疗高脂血症的作用机制可能与CREBBP、TP53和PPARA等靶点及脂肪细胞因子、FoxO、TNF、HIF-1和PI3K-Akt信号通路有关。结论 本研究筛选了补阳还五汤治疗高脂血症的关键靶点和通路,为补阳还五汤用于临床治疗提供了科学依据。 相似文献
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目的:运用网络药理学及分子对接探索瓜蒌-薤白治疗冠心病的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TCM筛选符合口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥018的瓜蒌-薤白活性成分及作用靶点;使用GeneCards数据库在线获取冠心病相关靶点;将瓜蒌-薤白与冠心病的交集靶点导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape分析网络的核心靶点,运用ClueGO及DAVID在线数据库对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后使用Autodock软件对核心活性成分及作用靶点进行分子对接验证。结果:瓜蒌-薤白中共得到22种活性成分,201个靶点,与冠心病相关靶点116个,在构建核心靶点PPI网络后得到包括肿瘤坏死因子(TNF)、苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤蛋白P53(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、上皮生长因子A(EGFA)等核心靶点,涉及生物学过程对缺氧的反应、对药物的反应、聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控和衰老等,KEGG通路包括HIF-1信号通路、TNF信号通路和cancer信号通路等,分子对接表明活性成分中槲皮素、β-谷甾醇、香叶木素、柚皮素、羟基芜花素活性成分可作用于磷酸肌醇3激酶(PIK3CG)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、环加氧酶2(PTGS2)、MAPK3、TNF和AKT1等核心靶点。结论:瓜蒌-薤白中槲皮素、β-谷甾醇、香叶木素、柚皮素、羟基芜花素可能作用于PIK3CG、MAPK1、PTGS2、MAPK3、TNF和AKT1而影响TNF、HIF-1和晚期糖基化终产物及受体(AGE/RAGE)等通路发挥治疗冠心病的作用。 相似文献
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目的 采用网络药理学和分子对接的研究方法分析瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的药物作用机制。方法 检索TCMSP数据库,筛选瓜蒌、薤白、半夏3味药物的主要活性成分并检索其作用靶点,根据GeneCards数据库查询与冠心病有关的靶点。Cytoscape3.7.2软件构建成分-靶点网络图,运用STRING绘制蛋白质相互作用(Protein-protein interactions,PPI)网络,分析相关生物功能注释和通路,用SYBYL-X 2.0软件完成靶基因与有效成分的分子对接。结果 筛选得到瓜蒌薤白半夏汤有效活性成分46个,药物相应靶点277个,疾病靶点450个,获取交集靶点82个,PTGS2、ADRB2、SCN5A、CASP3、NR3C2、AR等靶点处于网络图的核心位置。富集分析显示,主要通过RNA聚合酶II启动子转录的正调控、转录正调控,DNA模板、药物反应、基因表达的正调控、信号转导、缺氧反应、炎症反应等生物学过程干预冠心病;细胞组分主要涉及细胞外间隙、质膜、胞外区、胞质、细胞外泌体等;具有蛋白质结合、酶结合、蛋白质同源二聚体活性、细胞因子活性、受体结合、转录因子活性等分子功能。瓜蒌薤白半夏汤可能通过PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路、MAPK信号通路、FoxO信号通路等发挥治疗作用;分子对接显示瓜蒌薤白半夏汤有效成分与核心靶点具有较好的结合能力。结论 本研究系统筛选了瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的作用靶点和生物学机制,为后续深入研究中医药治疗冠心病的药物机制提供理论基础。 相似文献
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目的通过系统药理学和分子对接方法,对薤白治疗冠心病的作用机制进行研究。方法收集薤白的有效化合物;预测这些化合物对冠心病的作用靶点;对这些靶点进行PPI网络图的构建、GO富集分析和KEGG通路注释分析;将这些化合物与靶点进行分子对接。结果薤白共收集到11个有效化合物,作用于30个冠心病相关靶点。PPI网络图显示ALB、ACE、REN、MMP9、MAPK1、NOS3、F2、MMP2、SELE、PPARG为10个联系最多的靶点。GO富集分析显示出66个生物过程、22个分子功能、11个细胞成分,涉及雌激素反应、凝血、冠脉炎症、RAAS系统、抗氧化、稳定粥样斑块6个方面。KEGG通路注释分析显示出13条通路,其中6条通路与冠心病相关,分别是:Estrogen signaling pathway、PPAR signaling pathway、Complement and coagulation cascades、Renin-angiotensin system、HIF-1 signaling pathway and TNF signaling pathway。330组分子对接结果显示233组具有较好的结合活性。结论枳实薤白桂枝汤治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,可能通过抗凝血、稳斑块、抗氧化、抗炎症、降血脂、抑制RASS系统、增加NO保护、促进雌激素分泌8个方面发挥治疗冠心病的作用,且Estrogen signaling pathway是薤白作用冠心病的最主要通路。 相似文献
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目的观察真武汤辨证加减治疗冠心病慢性心力衰竭(CHF)的疗效。方法将106例患者按随机数字表法随机分为对照组和观察组各53例,对照组给予常规治疗。观察组在对照组治疗基础上联合真武汤辨证加减治疗,2个疗程后对比治疗结果。结果观察组总有效率92.45%,优于对照组的73.58%,治疗后两组中医证候评分、N端脑钠肽原血清水平均较治疗前降低,左室射血分数、6min步行距离均较治疗前提高,观察组均较对照组改善更为明显,差异均有统计学意义(均P〈0.05)。结论真武汤加减治疗冠心病CHF可促进患者病情缓解,抑制心室重构,改善心肺功能状态,提高临床疗效。 相似文献
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目的观察舒心解郁汤治疗合并抑郁症的冠心病心绞痛临床疗效。方法将90例伴抑郁症的冠心病心绞痛患者随机分为对照组与治疗组各45例。对照组常规给予单硝酸异山梨酯、阿司匹林、阿托伐他汀及抗抑郁药黛力新治疗。治疗组在对照组治疗基础上加用舒心解郁汤口服。共治疗4周。采用汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分定期进行疗效评定。结果总有效率对照组为77.78%,治疗组为91.11%,两组差异有统计学意义(P<0.05)。两组HAMD量表评分比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论舒心解郁汤治疗合并抑郁症的冠心病心绞痛。功效较单用西药治疗明显提高.可以减少抗抑郁西药的用量及降低其副作用发生率。 相似文献
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目的 观察丹参饮合四妙勇安汤对冠心病患者的临床疗效.方法 将60例冠心病患者随机分为两组各30例,对照组用拜阿斯匹林加倍他乐克及洛汀新治疗,治疗组在对照组治疗基础上加用中药丹参饮合四妙勇安汤化裁治疗.两组疗程均为1个月.结果 治疗组患者的心绞痛缓解总有效率为90.00%,高于对照组的73.33% (P< 0.05);治疗组在减少心绞痛发作频率、缩短发作持续时间、心电图改善方面均优于对照组(P<0.05);QT离散度及校正的QT离散度较治疗前两组均缩短,治疗组缩短更明显(P<0.05).结论 丹参饮合四妙勇安汤治疗冠心病心绞痛疗效确切. 相似文献
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目的 通过血清代谢组学技术,考察通阳化浊方与四妙勇安汤在治疗冠心病家兔中的作用机制。方法 40只雄性白兔,随机分为空白组、模型组、通阳化浊方组与四妙勇安汤组4组,每组10只。空白组正常饮食,模型组给予高脂饲料喂养至第8周,于第4周结束后,用球囊法手术损伤实验兔的右侧颈总动脉;在模型组基础上,两个实验组分别在术后,灌胃给予通阳化浊方和四妙勇安汤,连续4周,每日1次。给药结束后,模型组与实验组每组抽取3只家兔,采集全血后,用LC-MS技术进行血清代谢组学检测,运用PCA与OPLS-DA分析法来寻找差异性表达的代谢物和代谢途径。结果 相较于模型组,通阳化浊方与四妙勇安汤组分别存在45和27个差异化合物,通阳化浊方组涉及18条代谢通路,根据Impact值 > 0.05筛选出5条主要代谢通路,包括精氨酸和脯氨酸代谢、组氨酸代谢、牛磺酸和牛磺酸代谢、精氨酸生物合成和α-亚麻酸代谢;四妙勇安汤组涉及11条代谢通路,筛选出2条主要代谢通路分别为牛磺酸和牛磺酸代谢、组氨酸代谢。结论 通阳化浊方与四妙勇安汤在治疗冠心病模型家兔的过程中存在差异性代谢产物,干预相应的代谢通路可能会对药物在模型中的作用产生影响。 相似文献