中国甘肃汉/回族人群C1GALT1、DEFA基因多态性与IgA肾病易感性的关系北大核心CSCD

目的:探讨β-1,3-半乳糖基转移酶(C1GALT1)基因rs1008898位点及α防御素(α-defensin,DEFA)基因rs2738081位点多态性与中国甘肃省汉族人群和回族人群Ig A肾病易感性的关系,筛查预测Ig A肾病的分子标记。方法:本研究选取甘肃地区患Ig A肾病的汉族个体146例、回族个体83例作为实验组,另选取健康汉族个体180例、健康回族个体100例作为对照组。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法以及PCR产物基因测序法对单核苷酸多态性基因位点进行基因分型,采用卡方检验比较各基因型、等位基因在病例组和对照组中的分布差异,评价各基因型、等位基因与Ig A肾病发病风险的关系。结果:(1)汉族Ig A肾病患者rs1008898位点的GG基因型频率与健康对照组之间有统计学差异(OR=2.489,95CI:1.259~4.922,χ~2=7.037,P=0.008),且G等位基因可能增加患Ig A肾病的风险(OR=1.268,95%CI:1.056~1.523,χ~2=6.709,P=0.01)。(2)回族Ig A肾病患者rs1008898位点的多态性与健康对照组之间差异无统计学意义(P>0.05)。(3)rs2738081位点多态性在汉族、回族Ig A肾病患者及其健康对照组之间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:rs1008898位点G等位基因可能增加甘肃地区汉族人群患Ig A肾病的风险。     

TBX21基因rs16947078位点的多态性与哮喘易感性的研究

目的研究TBX21基因的rs16947078位点的多态性与哮喘易感性的关系。方法应用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)平台及MassARRAY-IPLEX技术,分别对重庆地区汉族人群中199名正常对照组和223名哮喘患者组的TBX21基因rs16947078位点进行检测并分析其基因型及等位基因分布情况,研究TBX21基因rs16947078位点的多态性与哮喘易感性间的关系。结果 TBX21基因rs16947078位点基因型和等位基因在病例组与对照组间均存在显著差异,P值分别为0.010和0.011;对年龄和性别进行校正后,相对于AA基因型,AG基因型的人群患哮喘的风险增加(OR=9.433,95%CI:1.170~76.022);等位基因G的携带者患哮喘的风险也有所增加(OR=9.232,95%CI:1.152~74.006)。结论研究结果提示TBX21基因中rs16947078位点与哮喘的易感性相关。     

云南地区汉族人群PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎的关联研究

目的 研究云南汉族人群中PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的相关性.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法对177例RA患者及288名健康对照PSMB8基因的rs2071543、rs55745125、rs138635403位点和PSMB9基因的rs17587多态性位点进行基因分型,应用多聚酶链反应扩增阻碍系统法对TAP2基因的rs2228396多态性位点进行基因分型.计算基因型及等位基因频率.采用Epi Info 7软件计算上述多态位点在RA组及正常对照组之间的比值比(OR值).结果 rs138635403及rs17587位点的等位基因及基因型频率在RA组和对照组间差异有统计学意义(P＜0.05),其中RA组rs17587的GG基因型频率(0.672)高于对照组(0.524)(OR=1.862,95％CI:1.261～2.749).结论 云南汉族人群PSMB9基因的rs17587位点多态性与RA存在关联.     

CDKAL1基因rs4712523多态性与内蒙古地区汉族人群2型糖尿病相关

目的 研究内蒙古地区汉族人群CDKAL1基因rs4712523单核苷酸多态性(SNP)的等位基因和基因型频率分布与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 采用等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR),对382例内蒙古地区汉族人(其中T2DM组192例,对照组190例)rs4712523进行基因分型.结果 T2DM组中rs4712523的G等位基因频率和GG基因型频率分别为47.4％和6.3％,均显著高于对照组的35.3％和3.2％(P＜0.05).G等位基因携带者患T2DM的风险是A等位基因的1.654倍(OR=1.654,95％ CI=1.237-2.212).结论 CDKAL1基因rs4712523多态性位点的G等位基因可能是内蒙古地区汉族人T2 DM的易感基因之一.     

雌激素受体1 基因rs2046210 位点多态性与乳腺癌患病风险性关系初步研究

目的: 探讨雌激素受体1 基因(Estrogen receptor 1,ESR1) 周围区域单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs2046210 与女性乳腺癌发生的相关性。方法:选取114 例乳腺癌患者的组织切片和141 例健康对照者的外周血,抽提基因组DNA,采用Taqman 探针法检测SNP 位点rs2046210 的基因型,计算基因型与基因频率,先检测Hardy-Weinberg 平衡性,然后采用字2 检验进行组间比较。结果:经检测rs2046210 等位位点T、C 及其三种基因型CC、TC、TT 均符合Hardy-Weinberg 平衡性定律,具有群体代表性(字2 值分别为2.78、2.95,v=1,P 均>0.05)。等位位点T、C 在乳腺癌组的分布频率为43.40%、56.60%,在健康组的分布频率为38.30%、61.70%。两组比较差异无统计学意义(P<0.05),该位点等位基因在病例组与对照组的分布无明显差别。多态性位点的三种基因型CC、TC、TT 在乳腺癌的频率分别为35.75%、11.35% 和53.90%,对照组35.96%、22.81%和41.22%,两组间比较差异有显著统计学意义(P<0.05)。进一步比较发现,基因型CC/ TT在两组中分布差异无统计学意义(P>0.05),相对风险比值OR 为1.94(0.92 ~ 4.1,95% CI),基因型CC/ TC 在两组中分布差异无统计学意义(P =0.228>0.05),相对风险比值OR 为0.74(0.43 ~1.28,95%CI),而基因型TT/ TC 在两组中分布差异有显著统计学意义(P =0.008<0.05)。结论:在贵州地区人群,雌激素受体1 基因rs2046210 位点的单核苷酸多态性可能与乳腺癌的遗传易感性相关,特别是rs2046210 TT 基因型可能增加个体患乳腺癌的风险,而CC 基因型降低了乳腺癌的患病风险。     

基质金属蛋白酶-3基因多态性与脑卒中亚型的相关性

目的 探讨中国北方汉族人群基质金属蛋白酶-3(matrix metalloproteinase-3,MMP-3)基因多态性与缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)亚型的相关性.方法 应用病例对照研究,选取289例急性缺血性脑卒中患者(发病≤3d)和175名同期健康体检者.卒中组按急性卒中治疗低分子肝素试验病因分型法分为大动脉粥样硬化性(large artery atherosclerotic,LAA)脑卒中185例,小动脉闭塞性(small artery occlusion,SAO)脑卒中104例.选取MMP-3基因rs3025058(-11715A/6A),rs522616(-709A/G)及rs679620(133A/G)3个常见单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,应用聚合酶链反应限制性片段长度多态性或直接测序法对MMP-3基因3个SNP位点进行基因分型.结果 3个位点存在不完全连锁不平衡,且基因多态性均与LAA型脑卒中相关(P＜0.05).在显性模型中,rs3025058位点5A5A+5A6A基因型携带者患LAA型脑卒中的风险是6A6A基因型携带者的1.72倍(P=0.017,OR=1.72,95％CI:1.10～2.69);rs522616位点GG+ AG基因型携带者患LAA型脑卒中的风险是AA基因型携带者的0.52倍(P=0.005,OR=0.52,95％CI:0.33～0.82);rs679620位点AA+ GA基因型携带者患LAA型脑卒中的风险是AA基因型携带者的1.55倍(P=0.042,OR=1.55,95％CI:1.01～2.37).但是,3个SNPs基因型和等位基因频率在对照组与SAO型脑卒中之间差异无统计学意义(P＞0.05).另外,LAA组5A-A-A及6A-A-A单倍型高于对照组,差异有统计学意义(P＜0.05),而6A-G-G单倍型显著低于对照组(P＜0.01).结论 MMP-3血清水平在LAA型脑卒中急性期增高明显,SAO型脑卒中次之;中国北方汉族人群MMP-3基因rs3025058,rs522616及rs679620多态性可能与LAA型脑卒中易感性相关.     

TLR7基因单核苷酸多态性与江苏淮安哮喘患者易感性的相关性研究

目的:探讨Toll样受体7(TLR7)基因rs179009、rs179019、rs5935436位点多态性与江苏淮安地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例对照方法,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法比较158例支气管哮喘组与137例健康对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组TLR7基因rs179009、rs170019位点基因型及等位基因型频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。rs5935436位点基因型及等位基因型频率在哮喘组和对照组间差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:TLR7基因rs179009位点和rs179019位点的多态性可能与江苏淮安地区汉族人群哮喘相关;而rs5935436位点的多态性可能与江苏淮安地区汉族人群哮喘无关。     

云南汉族ATP2B1基因标签SNPs与原发性高血压的关系

目的探讨Ⅰ型细胞膜钙离子转运酶(ATP2B1)基因标签单核苷酸多态(SNPs)与云南汉族原发性高血压(EH)的相关性。方法用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法,检测1020例云南汉族人(EH组和对照组各510例)ATP2B1基因12个标签SNPs(rs10506974、rs10506975、rs2854371、rs957525、rs3741895、rs2681472、rs2070759、rs12423192、rs1050395、rs11105357、rs11105358和rs7975689)和ATP2B1基因附近区域的rs17249754位点的多态性。结果 rs17249754位点基因型和等位基因频率在EH组和对照组间的分布均具有显著性差异(P0.01),Logistic回归分析发现,rs17249754位点AA基因型和A等位基因使EH患病风险显著性降低(OR=0.60,95%CI 0.40~0.89,校正P0.05;OR=0.73,95%CI 0.60~0.88,校正P0.01)。结论 ATP2B1基因附近区域rs17249754位点与云南汉族人群EH相关,rs17249754 A等位基因可能是降低云南汉族EH风险的保护因子。     

孕酮受体基因多态性在宁夏回、汉族人群中的分布特征

目的:探讨孕酮受体基因(PGR基因)rs590688、rs1042838、rs11224592三个单核苷酸多态性(SNP)位点在宁夏回、汉族人群的分布特征并与1000Genomes网站上公布的其他群体分布频率进行比较分析。方法:采用TaqMan探针基因分型方法分析宁夏回、汉族人群867例(回族335例,汉族532例)PGR 3个SNPs位点rs590688、rs1042838、rs11224592基因型及等位基因频率的分布情况。结果:宁夏回、汉族人群PGR基因rs590688和rs1042838两个位点基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义;rs11224592位点基因型及等位基因频率在宁夏回、汉族人群的分布差异有统计学意义;3个SNP位点的基因型及等位基因分布频率在男、女性别间差异无统计学意义。宁夏人群PGR基因rs590688、rs1042838、rs11224592位点基因型及等位基因分布频率与1000Genomes网站公布的其他群体相比较,rs590688位点与欧洲人群及非洲人群差异均有统计学意义;rs1042838位点与欧洲人群的差异有统计学意义;rs11224592位点与非洲人群的差异有统计学意义。结论:PGR基因rs590688、rs1042838、rs11224592位点基因型及等位基因频率在宁夏回、汉族人群的分布中,rs590688和rs1042838两个位点的分布无民族差异;rs11224592位点的分布具有民族差异;3个SNP位点的分布无性别差异。PGR 3个SNP位点基因型及等位基因频率在不同种族和地区的分布不同。     

PAI-1基因4G/5G多态性与内蒙地区IgA肾病的相关性研究

目的：探讨纤溶酶原活化物抑制剂-1（plasminogen activator inhibitor-1,PAI-1）基因启动子区4G/5G多态性与内蒙地区IgA肾病的相关性。方法：随机收集包头医学院第一附属医院肾内科IgA肾病患者100例,另设100名健康体检者为对照组。采用等位基因特异聚合酶链反应（ASPCR）法进行PAI-14G/5G基因型分析。结果：IgA肾病组的4G/4G基因型发生频率（41%）显著高于对照组（23%,P值〈0.01）。4G、5G等位基因频率比较无统计学差异（χ2=1.818,P〉0.05）。结论：PAI-14G/4G基因型是内蒙地区IgA肾病发病的易感基因型,但PAI-14G等位基因不是内蒙地区IgA肾病的易感基因。     

IFN-γ基因多态性与内蒙古汉族IgA肾病易感性关系的研究

目的:探讨IFN-γ基因+874位点单核苷酸多态性与内蒙古汉族IgA肾病患者易感性的关系.方法:从131例内蒙古汉族IgA肾病的患者和138例健康对照者外周血中提取DNA,采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术检测IFN-γ基因+874位点单核苷酸多态性.比较两组的基因型和等位基因的分布.结果:IgA肾病...     

1p13.3 rs599839单核苷酸多态性与早发冠状动脉粥样硬化性心脏病的关联研究

目的 探讨中国汉族人群染色体1p13.3 rs599839基因多态性与早发冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称早发冠心病)的相关性.方法 用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析303例经冠状动脉冠脉造影确诊的早发冠心病患者rs599839基因多态性,以同期冠脉造影阴性、排除冠心病诊断的312名受试者为财照组,比较两组间rs599839基因多态性频率分布差异.结果 早发冠心病组与对照组中均检出AA、AG基因型,GG基因型末检出.G等佗基因频率在早发冠心病组和对照组中分别为5.0%、9.1%,差异有统计学意义(P=0.004),使用Logistic回归分析排除吸烟、高血压、糖尿病等因素的影响后,两组G等位基因频率差异仍有统计学意义(P＜0.05).两组中G等位幕因携带者(AG型)低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein-cholesterol,LDL-C)水平均低于AA纯合子.结论 中国汉族人群染色体1p13.3 rs599839基因多态性可能与早发冠心病发病相关;rs599839基因多态性可能与血清LDL-C浓度差异相关;rs599839基因多态性与冠脉狭窄程度无关.     

用PCR-SSO检测IgA肾炎HLA-DRB1、DQA1、DQB1等位基因及其临床意义

利用聚合酶链区应（PCR）和序列特异性寡核苷酸（SSO）探针技术对47例经临床及免疫荧光证实的IgA肾病（IgAN）患者HLA-DRB1、DQA1、DQB1等位基因频率进行了检测。结果显示IgAN患者组DR4基因频率明显高于正常人组,相反DQB1*0602基因频率与对照组相比呈显著下降。IgAN患者中蛋白尿组DR4基因频率显著高于对照组,而肉眼血尿组与对照组无显著差异。约 1/4 DR4基因阳性的IgAN病理表现为局灶节段硬化性肾小球肾炎。 IgAN肾衰组DR4阳性的发生率显著高于非肾衰组。由此可见,IgAN中HLA-DR4基因频率而著增高, DR4阳性IgAN临床多表现蛋白尿,易发生肾衰,病理多呈局灶节段硬化型;DQB1*0602等位基因对IgAN可能有一定抵抗性。这些研究结果提示IgAN有免疫遗传的背景。     

ABCG1基因两个单核苷酸多态位点与冠状动脉粥样硬化性心脏病易感性及病情严重程度的相关性分析

目的 应用基于群体的病例-对照关联研究方法探讨ABCG1基因上的遗传多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)及病情严重程度的相关性.方法 在山东汉族人群中收集541例冠心病患者和649名正常对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态方法对ABCG1基因内两个单核甘酸多态位点进行基因分型,统计学分析.结果 rs225374等位基因C在病例组中的频率显著高于对照组(OR=1.186,95%CI:1.009～1.394,P=O.039),在男性病例组与对照组中的差异同样具有统计学意义(OR=1.236,95%CI:1.014～1.506,P=O.036).rs1044317等位基因A在病例组中的频率显著高于对照组(OR=1.187,95%CI:1.009～1.397,P=0.039).单独在病例组内的分析结果显示,rs225374等位基因C频率在高Gensini积分组中显著高于低Gensini积分组(OR=1.303,95%CI:1.024～1.657,P=O.031).结论 ABCG1基因上两个单核苷酸多态位点与冠心病易感性及病情严重程度具有一定相关性.     

Polymorphisms of the <Emphasis Type="Italic">IL23R</Emphasis> Gene Are Associated with Psoriasis but not with Immunoglobulin A Nephropathy in a Hungarian Population

Recently, associations were found between autoimmune diseases and variants of interleukin-23 receptor (IL23R) gene; here, we analyzed the association of nine IL23R polymorphisms with psoriasis and with immunoglobulin A nephropathy (IgAN). Groups of patients with psoriasis, IgAN, and controls were genotyped using polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) methods. We observed a significant increase in the carriage of the minor allele of rs11805303 in psoriasis patients compared to controls. Similarly, for rs2201841 prevalence of the CC genotype and for rs10889677, the AA genotype showed a more than two- and threefold increase, respectively in patients compared to controls. There was no difference in the distribution of IL23R variants between controls and IgAN patients. We confirmed the association of IL23R with psoriasis in a Hungarian population and demonstrated the effect of the rs11805303 SNP, which was tested so far only for other autoimmune diseases. We could not detect any association between the IL23R variants and IgAN.     

HLA-A, -B及-DRB1等位基因的多态性与白血病易感性的关联

目的:探讨甘肃汉族人群中白血病的易感性与HLA基因多态性之间的关联。方法:采用序列特异性寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSO),对57例白血病患者和45例健康对照组进行HLA-A、-B及-DRB1基因分型。结果:在等位基因HLA-A、-B及-DRB1中,白血病患者的HLA-A01、-B38及-DR15基因的基因频率高于正常对照组(P<0.05),而HLA-A11及-DR03基因的基因频率明显下降(P<0.05)。结论:甘肃省汉族人群基因HLA-A01、-B38及-DR15对白血病具有遗传易感作用;而基因HLA-A11和-DR03对白血病具有遗传拮抗作用。     

HLA-DRB1基因多态性与慢性髓性白血病的相关性研究

目的:探讨HLA-DRB1等位基因多态性与慢性髓性白血病(CML)关联性。方法:采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)DNA分型技术对762例慢性髓性白血病患者(男性492例,女性270例)及2 264例正常对照进行了HLA-DRB1基因分型。结果:正常人群的HLA-DRB1*15等位基因频率最高(17.25%),其次为DRB1*09(14.05%)、DRB1*12(11.73%)和DRB1*04(10.98%),DRB1*10等位基因频率最低(1.39%)。CML患者HLA-DRB1*08等位基因频率显著高于正常对照组(7.48%vs 5.39%,χ2=8.963,OR=1.023,P=0.004),男性患者的DRB1*08基因频率也明显高于正常对照(7.72%vs 5.39%,χ2=8.059,OR=1.025,P=0.007)。女性患者的DRB1*08基因频率也高于正常对照(7.04%vs 5.39%,χ2=0.115,OR=0.995,P=0.774),但没有统计学差异。结论:CML男性患者HLA-DRB1*08的表达明显高于正常人群,提示DRB1*08可能是男性CML患者的易感基因。     

内蒙古包头地区汉族人群TNF-α-308位点基因多态性与IgA肾病的相关性研究

目的：了解内蒙古包头地区汉族人群IgA肾病患者肿瘤坏死因子α（TNF-α）-308位点基因型的分布特点。方法：应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术检测97例IgA肾病患者和73例正常人的TNF-α基因型。结果：IgA肾病患者组中TNF-α基因G/A多态GG、GA、AA基因型频率分别为85.6%、11.3%和3.1%,其中G和A等位基因频率分别为91.2%和8.8%。正常对照组中,TNF-α基因G/A多态GG、GA、AA基因型频率分别为91.8%、5.5%和2.7%,其中G和A等位基因频率分别为94.5%和5.5%。IgA肾病患者组与正常对照组比较,基因型频率差异有显著性（χ^2=27.2,P〈0.05）,等位基因频率之间差异无显著性（χ^2=0.659,P〉0.05）。结论：TNF-α-308位点基因多态性与内蒙古包头地区汉族人群IgA肾病的发病有相关性,等位基因频率之间差异无显著性（χ^2=0.659,P〉0.05）。     

云南省傣族、汉族人群乙型肝炎病毒感染与IL-6-572C/G和IFNAR1-168G/C的关联性研究

目的:探讨云南省西双版纳地区傣族和汉族人群IL-6-572C/G和I型干扰素受体1(interferon alpha receptor 1,IFNAR1)-168G/C位点单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒(HBV)感染后疾病转归的关联性。方法:采集西双版纳州傣族、汉族人群血液样本共600份,其中每个民族包括健康对照组100名、HBV感染患者200名(含100名自限性恢复患者和100名慢性乙肝患者),运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和DNA测序技术对IL-6-572C/G和IFNAR1-168G/C位点进行基因分型。结果:傣族人群中,-572C/G位点基因型多态性与HBV感染后转归的关联性并无统计学显著性。C、G等位基因型在HBV感染组、正常对照组之间和慢性乙肝组、自限恢复组之间差异无统计学显著性。但是在G显性模式(GG+CG/CC)下,GG+CG基因型为HBV感染者发展成为慢性乙型肝炎患者的保护因素(P0.05)。汉族人群中,-572C/G位点基因型和等位基因分布频率在各组比较中无统计学显著性,并且在G显性模式和G隐性模式比较中也无统计学显著性。在上述4种比较中,IFNAR1-168G/C位点在汉族和傣族样本中的差异均无统计学显著性。结论:IL-6-572C/G位点GG+CG基因型可能是傣族人群中HBV感染者发展成为慢性乙型肝炎的保护因素,而IFNAR1-168G/C多态性与HBV感染后转归在傣、汉两族中并无显著性关联。