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1.
目的 研究中国丙型肝炎患者Ⅲ/2a型丙型肝炎病毒(HCV)包膜蛋白E2/NS1高变区1(HVR1)序列变异的规律及意义。方法 应用逆转录巢式PCR技术,从38例Ⅲ/2a型HCV感染患者血清中,扩增HCV部分包膜区基因片断(nt140~1582,HCV-J6),纯化后直接采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果 本组Ⅲ/2a型HCV HVR1位于氨基酸(aa)384~408位,与有关文献报道的结果(  相似文献   

2.
丙型肝炎病毒血清学分型与基因分型研究   总被引:15,自引:1,他引:15  
为了解某农村单采浆供血员人群所感染丙型肝炎病毒(HCV)的血清型和基因型构成,并对两种分型方法进行比较,本工作以HCVC区型特异性多肽对抗-HCV进行血清学分型,对已确定血清型的血清进行5′非编码区(NCR)逆转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)分析以确定基因型,并对6份扩增产物进行序列测定。结果显示140份抗-HCV阳性血清中,血清Ⅰ型和Ⅱ型分别为44份(31.43%)和12份(8.57%),余84份未能分型。44株已知血清型的HCV中,1b、2a和3b等3种基因型分别为34株(77.27%)、9株(20.45%)和1株(2.27%)。两种分型方法一致率为93.18%(41/44)。对6株HCV5′NCR的序列分析证实了RFLP分型的正确性。结论认为该人群HCV感染以血清Ⅰ型或基因1b型为主;C区型特异性多肽血清学分型法与RFLP基因分型法符合率高,具有一定应用价值。  相似文献   

3.
丙型肝炎病毒包膜糖蛋白高变区1多抗原肽设计及?…   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 应用多抗原肽(MAP)研究丙型肝炎病毒包膜糖蛋白高变区1(HVR1)的抗原性。方法 根据已经获得的HCV-BJ株E2/NS1区氨基酸序列,参照国内外得所报道的HV HVR1序列及抗原性参数,设计并合成含HCV HVR1390-411aa序列22个氨基酸的线性表位多肽(以LP表示)及MAP(对称8分枝),分别以LP和MAP免疫Balb/C小鼠及家兔,比较其免疫原性。结果 MAP免疫原性明显强于  相似文献   

4.
丙型肝炎病毒1b型NS5 A区基因结构变异与α干扰?…   总被引:3,自引:1,他引:2  
目的 观察丙型肝炎患者丙型肝炎病毒(HCV)1b型基因组部分NS5 A区核苷酸,氨基酸的变异情况并探讨其与α干扰素疗效的相关性。方法 患者干扰素治疗前,中,后留血标本,用聚合酶链反应(PCR)扩增HCV病毒NS5 A区部分基因片段并用直接测序法测序。与HCV-J株及HCV-河北株(HCV-HB)比较核苷酸及氨基酸序列的同源性,根据α干扰素疗效分析HCV1b是否存在干扰素敏感决定区。  相似文献   

5.
丙型肝炎病毒E2/NS1区基因cDNA的克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
从北京地区1份丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清中提取RNA,经逆转录和套式聚合酶链反应扩增HCVE2/NS1区基因约930bp,将其插入至pGEM-T质粒载体中,利用双脱氧链末端终止法测出该基因5’端431bp的核苷酸序列,将此序列与其它9个HCV分离株的相应序列进行比较分析,结果表明,此序列与HCVⅡ型序列同源性较高,核苷酸水平同源性在80%以上。由其编码的HCV外膜蛋白N端存在两个高变部位(HVR),在HVR内、外具有几个保守氨基酸残基和氨基酸区域,它们与外膜蛋白空间构型的维持有关。  相似文献   

6.
由分泌抗人C1-INHMcAb的杂交瘤F7细胞株提取总RNA,合成与VH基因FR1和FR4互补的通用引物,以RNA反转录合成的第一链cDNA为模板,PCR法克隆出F7VH基因的DNA片段。将分离获得的目的DNA片段亚克隆入pUC18/19测序载体,从两头进行双脱氧核苷酸随机终止法的DNA序列测定。结果显示:VH基因是由333个碱基组成,编码111个氨基酸残基。通过国际联机检索进行EMBL和Kabat基因库扫描发现,F7VHDNA仅与Ig同源,符合小鼠Ig的VH基因特征;同源性为60%~85%,应归属于Ig的VH基因。根据Kabat分类方法,F7VH基因推导的氨基酸顺序属于小鼠Ig的VH基因的Ⅱ(A)亚组,是由VH-D-JH3重排产生;其框架区的9和67位点为脯氨酸(Pro)和赖氨酸(Lys)(非芳香族氨氨酸),符合Ⅱ(A)亚组框架残基结构模式;其CDR3区含有7个氨氨酸残基,表明C1-INH抗原表面结构并不复杂;FR2和FR3的22和89位点为半胱氨酸残基(Cys),与VH片段二硫键形成有关。成功获得F7VH基因为进一步构建和表达单链Fv(scFv)抗体打下良好的基础。  相似文献   

7.
丙型肝炎病毒非结构基因5b(NS 5b)区一级结构的变异   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 分析中国丙型肝炎病毒非结构基因5 b 区核苷酸序列变异。方法 以逆转录套式聚合酶链反应(RTnestedPCR) 从49 例中国病人的血清中获得互补的DNA片段,产物克隆后测序。结果 33 株系基因Ⅱ1 b 型,16 株系Ⅲ2 a 型,中国HCV株型与日本HCV株型同属1 个基因亚型,但在一些核苷酸保守位点上有一定的差异,对33 株Ⅱ1 b 型和16 株Ⅲ2 a 型间的同源性进行比较,发现16 株Ⅲ2 a 型的同源性低于33 株Ⅱ1 b 型的同源性。首次在HCVNS5 b 区发现1 个新的3 个核苷酸的缺失突变及1 个移码突变。结论 同一基因亚型之内不同HCV株的核苷酸序列可能具有一定的地理分布特征,每个地区有一定的流行株。  相似文献   

8.
9.1C3分子是一种参与NK、巨噬细胞及LAK细胞杀伤过程的重要细胞表面分子,主要表达于外周血单个核细胞表面。本文运用分子生物学技术,从分泌9.1C3MCAb的杂交瘤细胞中提取总RNA,经反转录、PCR分另11分离了9.1C3McAb轻链可变区(VL)基因及重链可变区(VH)基因,并用全自动荧光DNA序列分析仪对9.1C3VH、VL基因序列进行了分析。结果表明:9.1C3VH基因为351bP,编码117aa残基,9.13VL为324bP,编码108aa残基;从推导出的氨基酸序列分析证实9.1C3VH、VL序列均符合小鼠lg可变区的氨基酸序列特征;根据Kabbat分类体系,9.1C3VH隶属Ig重链第Ⅱ(C)亚组,9.1C3VL隶属小鼠IgK链第Ⅴ亚组。9.1C3VH、VL基因的克隆成功为其单链抗体的构建、表达奠定了良好的物质基础。  相似文献   

9.
目的探讨单核细胞趋化蛋白-1单克隆抗体(MCP-1-meAb)或Losartan 拮抗血管紧张素Ⅱ(AugⅡ)介导的血管平滑肌细胞(VSMCs)增殖与迁移效应的可能性,为防治动脉硬化提供一定的理论依据。方法采用改良的Boyden小室法检测 VSMCs的迁移效应;以 MTT法、~3H-TaR掺入法、~3H-脯氨酸标记法和VSMCs计数评价VSMCs的增殖效应。将培养VSMCs分为 5组; 2%胎牛血清( 2%FCS)组、 AugⅡ组(其浓度为 10-10~10-6mol/L)、Losartan组(其浓度为 10-7~10-5mol/L)、MCP-lmcAb组(终浓度为 10μg/ml)和阳性对照组(含5%的酵母多糖活化血清)。结果(1) AugⅡ具有剂量依赖性的促进 VSMCs的增殖与迁移效应;(2) MCP-1mcAb或 Losar-tan能有效地拮抗AugⅡ介导的VSMCs增殖与迁移效应。结论 MCP-1mcAb或Losartan对动脉硬化性疾病可能具有较大的应用前景。  相似文献   

10.
合肥地区输血后慢性肝炎HCV基因分型研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:探讨合肥地区输血后慢性肝炎HCV感染的基因型。方法:用逆转录聚合酶链反应(RTPCR)检测HCVRNA,对HCVRNA阳性标本用型特异引物PCR进行HCV分型。结果:63 例患者中检出HCV RNA54 例,阳性率为85.7% ;其中Ⅱ型46 例(85.2%),Ⅲ型6 例(11.1%),Ⅱ/Ⅲ型2 例(3.7%)。结论:提示合肥地区HCV感染大多数属Ⅱ型。  相似文献   

11.
输血后丙型肝炎与抗丙型肝炎病毒(HCV)阳性献血?…   总被引:2,自引:0,他引:2  
采用丙型肝炎病毒(HCV)5’-非编码区(5’-NCR)和C区具有型特异性的引物建立的逆转录-聚合酶链反应方法检测了25例丙型肝炎(HC)和26例抗-HCV阳性献血员的HCV RNA及基因型。结果25例HC患者HCV RNA阳性率为100.0%,26例抗-HCV阳性献血员HCV RNA阳性率为84.5%,(22/26)。25例HC中I、Ⅱ和混合型(I+Ⅱ、Ⅱ+Ⅲ、I+Ⅲ、I+Ⅱ+Ⅲ)分别占8.0%  相似文献   

12.
血清学标志阴性的非甲~戊型肝炎的病原学研究   总被引:8,自引:3,他引:5  
目的对血清学标志阴性的非甲~戊型肝炎进行病原学研究。方法用HBVPCR、HCVRT-PCR和HEVRT-PCR分别检测血清学标志阴性的非甲~戊型肝炎患者血清,并对其部分阳性产物进行克隆测序。结果87例非甲~戊型肝炎血清HBVDNA均为阴性,9例(10.3%)为HCVRNA阳性,部分经测序证实为HCV1b亚型;余78例为HBVDNA和HCVRNA均阴性。该78例中,14例因无血清未作HEVRNA检测,余64例中49例(76.6%)为HEVRNA阴性,15例(23.4%)为HEVRNA阳性。经序列分析显示,其中9例为典型的中国HEV株基因序列,6例变异较大,与典型的中国株基因序列的同源性仅为80%左右。49例HBVDNA、HCVRNA和HEVRNA均阴性的血清中16例(32.6%)HGVRNA阳性。由此可见,该87例中至少有9例为HCV感染,15例为HEV感染,16例为HGV感染。结论对血清学标志阴性的非甲~戊型肝炎的病人应该用PCR法进行病原学分型,以明确其诊断  相似文献   

13.
丙型肝炎病毒非结构基因5b的变异及与干扰素治疗的关系   总被引:1,自引:0,他引:1  
以聚合酶链反应直接序列分析方法测定了4例无症状慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染者,与9例接受干扰素治疗的慢性丙型肝炎患者血清中HCV非结构基因5b(NS5b)cDNA的序列。发现,与已发表的Ⅱ/1b型HCV序列相比,无症状慢性HCV感染者的HCV在核苷酸水平的同源性高于干扰素治疗有效的慢性丙型肝炎患者(95.65%±2.61%比94.35%±2.29%),后者又高于干扰素治疗无效的慢性丙型肝炎患者(92.70%±1.90%)。还发现在干扰素治疗后,治疗无效者血清中HCVNS5bcDNA序列发生明显变化,在所测定的380个核苷酸中有9~48个发生碱基替换,从而导致所编码的氨基酸中有6~20个发生突变。结果提示,HCVNS5b基因变异与病情及干扰素治疗有一定关系。变异较大者常出现明显的临床表现,且干扰素治疗可能趋势于失败。  相似文献   

14.
本文从分泌具有高中和活性和高保护作用的抗HSV-1/HSV-2型共同性糖蛋白C的鼠源性单克隆抗体(McAb)的杂交瘤细胞1A12中提取胞浆总RNA,以Oligo(dT)15为引物逆转录合成cDNA,用一对鼠抗体K链通用引物进行PCR,扩增出1A12VL基因,并克隆入pUC18质粒中。序列分析结果表明,1A12VL基因由330bp组成,编码110个氨基酸,隶属小鼠轻链k链4组。  相似文献   

15.
目的 了解庚型肝炎病毒(HGV)感染在广西柳州地区不同人群中的感染状况,并比较静脉毒瘾者与健康体检者HGV,乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)与HGV共同感染的特点,方法 应用酶联免疫法(ELA)检测抗-HGV,抗-HCV,HBVM(HBsAg,HBsAb,HBeAg,HBeAb,HBcAb),并对抗-HGV阳性者随机抽取20例(19%)进一步用逆转录套式PCR(PT-nPCR)法检测  相似文献   

16.
目的探讨丙型肝炎病毒(HCV)基因型与血清HCVRNA含量的关系及其对干扰素应答的影响。方法应用定量荧光PCR(Amplisensor-PCR)技术检测了135例不同基因型HCV感染的慢性丙型肝炎患者血清HCVRNA含量,另对其中77例进行干扰素治疗并随访12个月以上。结果HCV-Ⅱ型感染血清HCVRNA水平(107.8±3.4拷贝/ml)显著高于HCV-Ⅲ型感染(106.3±2.5拷贝/ml)(P<0.01),Ⅲ型感染的应答率(7/13,53.8%)显著高于Ⅱ型感染(20/64,31.3%)(P<0.05)。应答组治疗前血清HCVRNA含量(106.8±2.7拷贝/ml)显著低于无应答组(108.3±3.2拷贝/ml)(P<0.01)。HCVRNA含量低于106.5拷贝/ml者,无论何种型别HCV感染均应答较好,而HCVRNA高于108.0拷贝/ml者则应答极差。结论HCV基因型及病毒血症水平是预测干扰素疗效的重要因素,且后者比前者意义更大。Ⅱ型感染病毒血症水平较高可能是影响其疗效的原因之一。  相似文献   

17.
选用具有动物体内高保护作用的抗HSV-1/HSV-2型共同性糖蛋白C(gC)单克隆抗体1A12,从其杂交瘤细胞中提取总RNA,以Oligo(dT)15为引物反转录合成cDNA,用一对鼠抗体通用VH引物和一对V引物进行PCR,扩增出1A12VH和1A12VL基因,并分别克隆入pUC18质粒中,序列分析结果表明,1A12VH基因由336bp组成,编码112个氨基酸,隶属于小鼠重链第3组亚组(D);1A  相似文献   

18.
丙型肝炎病毒基因组5‘非编码区酶切分型研究   总被引:2,自引:1,他引:2  
对105例HCVRNA阳性标本用Sau3AⅠ和HaeⅢ两种酶对其5’NC区扩增产物进行酶切。结果呈现4种酶切类型。对不同酶切类型的扩增产物进行序列分析,结果显示,不同酶切类型的扩增产物都源于HCV,核酸序列中的酶切点与酶切结果完全吻合。对文献中已经确定基因型的33株HCV作了比较,分析了酶切类型与基因型的关系。发现对HCV5’NC区-297至-41片段PCR扩增产物用这两种酶分别酶切,可以把HCV按Chan氏分型(1992)分为1、2、3三组。本文105例标本,1组(包括Ⅰ、Ⅱ型)占82.9%,2组(包括Ⅲ、Ⅳ型)占15.2%,1、2组混合占1.9%,未发现3组。其中以1组(Ⅱ型)为最多,但不超过69.5%。  相似文献   

19.
丙型肝炎病毒RNA基因型与肝病临床转归的初步观察   总被引:1,自引:0,他引:1  
丙型肝炎病毒RNA基因型与肝病临床转归的初步观察李岱王宇基于不同的丙型肝炎病毒(HCV)克隆间核苷酸序列同源性的差异,全世界HCV基因型至少有10余种之多,广泛分布的有五个基因型:Ⅰ/Ia、Ⅱ/Ib、Ⅲ/2a、Ⅳ/2b和Ⅴ/3a型,我国至今为止除了Ⅱ...  相似文献   

20.
目的研究云南苯丙氨酸羟化酶基因点突变分布概况,以提高该地区苯丙酮尿症(PKU)的基因诊断率。方法应用PCR-ASO探针斑点杂交,PCR-SSCP、ASPCR和DNA直接测序等技术,对13/14名云南籍PKU患儿的苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因外显子4、5、6、7、10、11和12进行了鉴定分析。结果共检出5种错义突变:R243Q(5/26)、Y204C(3/28)、R413P(2/28)、T418P(1/28)及G247V(1/26),3种无义突变Y166X(C→G)(2/26)、W326X(1/28)及Y356X(2/26)和1种静止突变V399V(2/26)。经检索国际PAH基因突变数据库,其中Y166X(C→G)为首次发现的新突变。结论云南藉PKU与中国北方人群有相类似的最常见的PAH基因突变类型(R243Q、Y204C、Y356X、V399V和R413P),但与南方人群PAH基因突变特点则不同。该发现有助于提高云南PKU的基因诊断率,并对我国PAH基因突变不同地区及人群的分布、起源研究有参考价值。  相似文献   

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