广州市地区7234例新生儿耳聋基因突变分析

目的分析广州地区7234例新生儿4个常见遗传性耳聋基因热点突变情况,为广州地区遗传性耳聋的防治提供依据。方法收集广州市天河区中山大学附属第三医院2015年6月至2019年1月分娩的7234例新生儿脐带血液标本进行耳聋基因热点检测,基因突变新生儿行Sanger测序验证及基因外显子测序。结果检测到耳聋基因突变携带者266例(3.68%),其中GJB2基因突变159例(22.0%),SLC26A4基因突变85例(1.18%)。在266例的基因携带者中,GJB2 c.235delC杂合突变占49.6%(132/266),SLC26A4 IVS7-2A>G突变占28.2%(75/266),其余位点占22.2%。携带者一代测序验证结果与耳聋基因筛查结果一致,基因外显子测序中发现有3名双重突变患儿,两例为GJB2 c.235 del C与GJB2 c.109G>A双重杂合突变患儿,另一例为SLC26A4 IVS 7-2 A>G与SLC26A4 c.1983C>A双重杂合突变患儿,3例患儿经父母血液标本验证,双重杂合位点分别遗传自父母。结论本研究7234例新生儿聋基因筛查中,GJB2基因突变频率最高,其次是SLC26A4基因,为耳聋儿童的早期发现与早期干预提供参考与指导。现行热点突变检测位点可能漏检其他突变位点,可根据本地检测情况调整或者制定适合本地的筛查方案。     

宁波新生儿遗传性耳聋基因突变1781例分析

目的分析宁波市遗传性耳聋基因的突变类型和频率。方法2019年1月至9月,对在宁波市妇女儿童医院出生的1781例新生儿进行耳聋基因筛查,包括4个常见基因位点,22个突变热点。结果共检出耳聋基因突变104例(5.84%),其中男性59例,女性45例。GJB2基因突变率3.31%(59/1781),GJB3基因突变率0.56%(10/1781),mtDNA基因突变率0.39%(7/1781),SLC26A4基因突变率1.57%(28/1781)。结论宁波新生儿耳聋基因总突变率稍高于全国水平,GJB2基因突变尤为突出,应加强新生儿耳聋基因筛查。     

耳聋基因突变检测国家参考品的研制

目的建立耳聋基因突变检测国家参考品。方法收集健康人及含20种不同耳聋基因突变位点的志愿者血清,通过Sanger测序,从中筛选出野生型和突变型的血清样本,分装制备成一套含23份样本的候选耳聋基因突变检测国家参考品。用6个厂家8个耳聋基因突变检测试剂盒对参考品进行验证。参考品的均匀性和稳定性通过联合探针锚定聚合测序法进行检测。结果各家试剂对大部分参考品的验证结果基本一致。本实验室对参考品在验证过程中新出现的突变位点进行了测序确认。参考品的均匀性和稳定性满足要求。结论通过协作验证以及均匀性、稳定性评价,该耳聋基因突变检测国家参考品可用于耳聋基因突变检测试剂盒的质量评价。     

基于PASS技术的EGFR基因突变比例检测方法的建立与评价

目的 近期临床研究发现EGFR-TKI并非对所有EGFR基因激活突变的NSCLC患者都有效,提示EGFR-TKI的治疗效果也可能与NSCLC患者中EGFR基因突变比例相关。本研究基于平行等位基因特异性测序(Parallel Allele-Specific Sequencing, PASS)方法,建立一个稳定可靠的EGFR突变基因比例检测平台。方法 构建野生型和突变型EGFR基因重组质粒,建立EGFR基因突变比例检测的PASS平台,从灵敏度、精密度以及准确度对PASS检测平台进行性能评价。结果 建立的PASS平台可用于EGFR基因点突变和缺失突变的检测,能够检测到的最小基因拷贝数为1,能够稳定检测到的最小基因拷贝数为10,在野生型基因中最低能检测出0.01%的突变基因。线性回归分析显示,检测到的突变型/野生型比例与预期的突变型/野生型比例呈良好的线性相关(R₂=0.9962)。结论 该方法的建立能够对EGFR基因突变比例进行灵敏、准确测定,这对其在临床中的应用奠定了良好的技术基础,对于评价EGFR基因突变比例与EGFR-TKI靶向治疗NSCLC患者疗效的关系也具有重...     

枣庄市4129例孕妇常见耳聋基因筛查结果及临床意义分析

目的 分析枣庄市4 129例孕妇常见耳聋基因突变位点筛查结果,探讨枣庄市孕期女性常见耳聋基因突变分布特点及耳聋基因筛查的临床意义。方法 选取2020年10月至2022年4月就诊于枣庄市妇幼保健院进行耳聋基因筛查的4 129例孕妇为研究对象,经知情同意后采集外周血,利用高通量测序法检测18个耳聋相关基因共100个突变位点,分析各突变位点的检出率及分布情况。对耳聋基因携带者孕妇的配偶进行基因测序,并对孕妇妊娠结局进行随访。结果 在4 129例受检者中,共检出311例携带耳聋基因突变,总体突变携带率为7.53%。其中,GJB2突变携带者140例（3.39%）,SLC26A4突变携带者105例（2.54%）,GJB3突变携带者21例（0.51%）,线粒体12S rRNA突变携带者34例（0.82%）,TMC1突变携带者1例（0.02%）,纯合或复合杂合突变者4例（0.10%）,双基因突变携带者6例（0.15%）。线粒体12S rRNA基因突变者均未出现听力缺失,其新生儿也均通过了听力筛查。结论 在枣庄市孕期女性常见耳聋基因突变位点中,阳性检出率较高的3种变异分别是GJB2 235 del C(...     

沧州市非综合征性耳聋患者常见耳聋基因突变的分析

目的：筛查沧州市非综合征青少年耳聋患者常见耳聋基因热点突变,初步了解该地区耳聋基因热点发生频率和突变谱系。方法对沧州市特殊教育学校的30例非综合征感觉神经性耳聋患者采集外周血5 mL,通过基因芯片检测技术对GJB2、GJB3、SLC26A4、线粒体12SrRNA基因20个位点进行测序。结果30例患者中共检出耳聋基因热点突变阳性者6例,阳性率为20%。其中GJB2基因突变235delC纯合突变2例,235delC杂合突变1例,299-300delAT 杂合突变1例, SLC26A4 IVS7-2A〉G 纯合突变1例,SLC26A4IVS7-2A〉G 合并 IVS7-2A〉G 杂合突变1例。结论 GJB2基因突变是引起非综合征性耳聋的主要致病基因,SLC26A4为最常见的耳聋突变基因。未检测到线粒体12SrRNA基因突变。     

广西玉林特殊教育学校耳聋相关基因突变分析

目的 分析广西玉林地区耳聋患者相关致病基因突变,初步了解玉林地区耳聋患者发病的分子机制.方法 对玉林地区2个特殊教育学校191例耳聋患者进行分子病因信息采集,对6岁以上患者行纯音测听和声导抗进行听力评估;小于6岁的患儿行40Hz相关电位、畸变产物耳声发射(distortion product otoacoustic emission,DPOAE)和听性脑干反应(auditory brainstem response,ABR)进行听力评估.采集外周血4mL并提取基因组DNA,用耳聋基因微阵列芯片技术对4个致聋基因的9个突变位点(GJB2基因:c.35delG、c.235delC、c.176de116、c.299delAT;GJB3基因:c.538C＞T;SLC26A4基因:c.919-2A＞G、c.2168A＞G;线粒体DNA 12SrRNA基因:m.1494C＞T、m.1555A＞G)进行基因突变分析.结果 在28例耳聋患者中检出GJB2、SLC26A4和线粒体DNA 12SrRNA基因突变,总检出率为14.66％(28/191),其中GJB2基因c.235delC纯合突变3例,c.176_191de116和c.235delC复合杂合突变1例,c.235delC杂合突变2例,c.299_300delAT杂合突变合并SLC26A4基因c.919-2A＞G杂合突变1例;SLC26A4基因c.919-2A＞G纯合突变4例,c.919-2A＞G杂合突变13例,c.919-2A＞G和c.2168A＞G复合杂合突变2例;线粒体DNA 12SrRNA基因m.1555A＞G均质突变2例. 结论 广西玉林地区耳聋患者热点突变基因以SLC26A4基因最为常见.玉林地区耳聋患者的相关基因检出阳性率、GJB2基因、SLC26A4基因及线粒体DNA 12SrRNA基因的携带率均低于全国平均水平.     

p53基因突变检测方法的演进和趋势

p53基因是肿瘤蛋白P53 (tumor protein p53)的编码基因,在维持基因组稳定、调控细胞周期和凋亡及抑制肿瘤血管生成中发挥着重要的作用.p53基因突变信息在肿瘤分子筛查诊断、预防、药物疗法选择等方面具有重要的参考价值.本文分析了p53基因与P53蛋白突变检测的重要性、突变检测方法的发展概况,如传统的DNA测序、限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、单链构像多态性(single-stranded conformation polymorphism,SSCP)等8类实验室常规基因突变检测策略及酵母中分离的等位基因功能分析技术(separation of gene function analysis in yeast,FASAY),近年来新兴的技术包括生物传感器、芯片、高分辨率溶解曲线(high resolution melting,HRM),及下一代测序技术,以期较为全面地展示现今p53及P53突变检测的整体情况,为p53或其他基因突变研究者选择突变检测方法提供参考.     

广东省非综合征耳聋患者GJA1基因及常见耳聋基因突变分析

目的:研究广东省非综合征耳聋患者常见耳聋基因突变的发病情况.方法:对来自广东省某特殊学校的73例非综合征感觉神经性耳聋患者采集外周血,对GJA1、GJB2、GJB3、SLC26A4、mtDNA12S rRNA基因编码区进行测序.结果:73例患者中检测到GJB2基因突变235delC 5例;GJB3基因突变547G＞A 1例;SLC26A4基因突变IVS7-2 A＞G 7例,2168A＞G杂合突变1例;mtDNA 12S rRNA纯合突变3例.结论:本研究为19.18％的研究对象明确了分子病因;GJB2基因突变不是本研究的主要致病基因,SLC26A4为最常见的耳聋突变基因;未检测到GJA1基因突变.     

MYO7A基因突变分析与儿童先天性耳聋的相关性研究

目的 分析MYO7A基因突变与儿童先天性耳聋相关性。方法 选取2019年5月至2021年5月于本院就诊的先天性耳聋患儿48例作为耳聋组,另选取同期体检结果呈健康的儿童48例作为对照组。使用Madsen502便携式听力计测试两组研究对象纯音听阈均值（PTA）;采用Titan IMP440中耳分析系统测试两组研究对象宽频声导抗（WBT);采集所有研究对象外周血检测MYO7A基因突变。结果 耳聋组患者各频率下PTA明显高于对照组（P<0.05）;耳聋组患者0.5～4.0 kHz各个频率下WBT吸收率均明显低于对照组（P<0.05）;耳聋组c.462位点基因型CC、CA和AA的分布频数与对照组有显著差异,等位基因C的频率明显低于对照组（P<0.05）;耳聋组患者MYO7A基因EX43＿46Del突变人数明显多于对照组（P<0.05）;c.462C>A突变和EX43＿46Del突变对PTA和WBT影响不显著（P>0.05）。结论 MYO7A基因EX43＿46Del和c.462C>A突变与儿童先天性耳聋存在一定相关性,可通过上述两个位点基因突变情况初步预测...     

铜仁市育龄妇女耳聋基因突变检测结果分析

目的 分析铜仁市各族育龄妇女耳聋基因携带情况.方法 选取2019年8月至2020年10月在本院进行产前检查的育龄妇女1 723例为研究对象,采用广东凯普生物科技有限公司提供的耳聋基因检测杂交试剂盒对各族育龄女性进行遗传性耳聋4个基因GJB2、SLC26A4、GJB3、线粒体12SrRNA的21个突变位点筛查.结果 本次...     

广东佛山地区地中海贫血基因突变类型分析

目的：了解佛山地区α与β地中海贫血患者的基因突变类型,为开展佛山地区α与β地中海贫血的遗传咨询,产前诊断和预防计划提供参考。方法：回顾性分析2011年1月至2012年12月佛山市第二人民医院地中海贫血基因检测PCR阳性的351名患者的地贫基因突变类型。结果：351名地中海贫血患者中200名仅地中海贫血患者,其中东南亚型缺失（--^SEA）154例,右侧缺失（-^3.7）20例,左侧缺失（-^4.2）8例,缺失型HbH病（--^SEA／-^3.7）11例,缺失型HbH病（--^SEA／-^4.2）7例。136名β地中海贫血患者,其中CD41-42杂合子53例,ISV-Ⅱ-654杂合子38例,CD28杂合子16例,CD17杂合子13例,CD29杂合子3例,CD43杂合子3例,BE杂合子5例,CD41-42纯合子、CD17纯合子、CD71-72杂合子、CD41-42,ISV—Ⅱ-654双重杂合子、Int杂合子各1例,15名αβ复合型地中海贫血患者。结论：佛山地区的α地贫人群中东南亚缺失型占主导地位,而CD41—42突变与TSV-Ⅱ-654突变是β地中海贫血最常见的基因突变类型。     

广东地区非小细胞肺癌EGFR基因的突变研究

目的 探讨广东地区非小细胞肺癌(NSCLC)患者中EGFR基因的突变情况.方法 用微分离富集肿瘤细胞,采用QIAGEN DNA提取试剂盒提取基因组DNA,通过PCR扩增及DNA测序技术分析非小细胞肺癌患者中EGFR基因突变情况.结果 43例非小细胞肺癌中,有22例(51.2%)存在EGFR基因的突变,其中13例为外显子...     

人β3-肾上腺素能受体基因第64位密码子突变频率的检测

目的建立一种简便、准确、实用的人β３－肾上腺素能受体基因第６４位密码子突变频率的检测方法。方法应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）特异性扩增β３－肾上腺素能受体基因含编码６４位氨基酸的基因序列，扩增产物用限制性内切酶ＢｓｔＯＩ酶切，聚丙烯酰胺凝胶电泳后，观察酶切位点的限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）图谱。结果运用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ法检测了１７４名汉族人β３－肾上腺素能受体基因第６４位密码子点突变，其中野生型纯合子频率为６９．５％，杂合子频率为２７．６％，突变型纯合子频率为２．９％。突变等位基因频率为０．１７。结论该方法简便、快速、准确，适合于一般实验室检测及大规模的人群调查。     

长沙地区血小板供者基因数据库理论建模分析*

摘要:目的分析长 沙地区血小板供者基因数据库建设情况,评估为临床提供HLA/HPA匹配的单采血小板的可能性。方法分析长沙地区血小板供者基因数据库1 029例无亲缘关系单采血小板供者HPA、HLA-A/B等位基因及抗原分布情况，评估长沙地区血小板供者基因数据库建设规模。结果在不考虑ABO血型的情况下,当库容为207人时,约有95%的患者能在该库中找到至少1名HPA基因型全匹配的供者;当库容为2127人时,约有95%的患者能在该库中找到至少1名HLA-A/-B表型匹配的供者;当库容为1 029人时,约有79.25%的患者能在该库中找到至少1名HLA-AB表型匹配的供者。单采血小板捐献者A.B抗原CREG表位不配合的概率最高分别为1C-2C和7C-5C, Broad CREG不配合概率最高的为4C-6C。结论长沙地区已建立已知HLA/HPA基因型的血小板供者基因数据库库容1029人，在扩大有效库容的同时将进一步验证理论建模的适用性和匹配概率的符合性。     

两广交界地区中重型珠蛋白生成障碍性贫血胎儿基因突变特征及妊娠结局分析

目的探讨产前诊断中重型珠蛋白生成障碍性贫血的类型及分布特征,为珠蛋白生成障碍性贫血防控提供咨询依据。方法对近年来在该院就诊的1274例夫妇为同型珠蛋白生成障碍性贫血基因携带者的孕妇行羊膜腔穿刺术获取胎儿羊水细胞,并进行珠蛋白生成障碍性贫血基因检测与细胞遗传学检查。结果1274例珠蛋白生成障碍性贫血基因产前诊断结果中,共检出320例中重型珠蛋白生成障碍性贫血,占总检人数的25.1%。--SEA/--SEA、--SEA/-α3.7、--SEA/-α4.2、--SEA/αCSα为主要的中重型α珠蛋白生成障碍性贫血基因类型,而重型β珠蛋白生成障碍性贫血基因类型多样,其分布则以βCD41-42/βCD41-42、βCD41-42/βCD17、βCD41-42/βIVS-Ⅱ-654、βCD41-42/β-28、βCD17/β-28、βCD41-42/βCD71-72为主,这10种基因类型占总检出中重型珠蛋白生成障碍性贫血的84%,该地区α合并β珠蛋白生成障碍性贫血携带者的比例为18%。产前诊断胎儿为重型珠蛋白生成障碍性贫血的检出率为7.60%。珠蛋白生成障碍性贫血产前诊断标本中检出16例染色体异常核型,检出率为1.26%。结论利用珠蛋白生成障碍性贫血产前基因诊断可检出中重型珠蛋白生成障碍性贫血胎儿,降低出生缺陷儿的发生率。同型珠蛋白生成障碍性贫血携带夫妇产前诊断时应建议同时行细胞染色体检查,避免染色体患儿的出生。     

辽宁地区血小板志愿捐献者HPA基因资料库的建立

目的对辽宁地区血小板志愿捐献者进行HPA基因分型,建立已知HPA基因型的血小板捐献者资料库。方法采用PCR-SSP方法对随机抽取的130名血小板捐献者进行HPA-1-6和HPA-15抗原系统共14个抗原的基因分型。结果辽宁地区血小板志愿捐献者HPA的基因频率分别是:HPA-1a0.9925、1b0.0075、2a0.9305、2b0.0695、3a0.5810、3b0.4190、4a1.0000、4b0.000、5a0.9810、5b0.0190、6a0.9885、6b0.0115、15a0.4615、15b0.5385。结论辽宁地区血小板志愿捐献者HPA-1—6和HPA-15抗原系统的基因频率符合Hardy-Wein-berg遗传定律,与其它地区和国家的同类资料相比显示出种族和地域性差异,由此建立起了辽宁地区已知HPA基因型的血小板捐献者资料库。