PLAC1在结直肠癌及其肝转移组织中的表达及临床意义

目的探讨胎盘特异性基因PLAC1的表达与结直肠癌及肝转移生物学行为及预后。方法应用免疫组织化学的方法分析PLAC1在62例结直肠癌、13例肝转移癌、28例癌旁10cm正常组织标本的表达情况。结果 PLAC1表达在癌旁10cm正常黏膜、结直肠癌组织、肝转移癌组织中的表达率分别为:0(0/28)、56.5%(35/62)和61.5%(8/13),结直肠癌和肝转移癌组织中的表达显著高于癌旁10cm正常黏膜,其差异有统计学意义(P<0.01);结直肠癌组织和肝转移组织比较,其差异无统计学意义;PLAC1在女性表达高于男性;PLAC1表达增高与结直肠癌浸润深度、淋巴结转移、远处转移等因素相关。结论 PLAC1异常表达可能在结直肠癌及其肝转移的发生发展中起着重要作用。     

MTSS1蛋白在结直肠癌组织中的表达及临床意义

目的探讨肿瘤转移抑制因子1（MTSS1）基因的表达与结直肠癌生物学行为及预后之间的关系。方法应用免疫组织化学的方法分析MTSS1蛋白在60例结直肠癌患者组织,以及60例同一患者癌旁10cm正常黏膜组织标本中的表达情况,并应用SPSS13．0软件对实验数据进行统计学分析,MTSS1在癌旁正常黏膜和结直肠癌组织中的表达采用卡方检验四格表,MTSS1蛋白的表达与结直肠癌患者临床病理参数的数据采用RxC表的x2检验,校正使用Fisher确切概率法,以P〈0．05为差异具有统计学意义。结果MTSS1在癌旁10cm正常黏膜和结直肠癌组织中的表达率分别为：100％（60／60）和28．3％（17／60）,在结直肠癌组织中的表达显著低于癌旁10em正常黏膜,其差异有显著统计学意义x2=67．013,P〈O．01）;MTSS1的表达与性别、年龄、病灶位置、癌组织大体分型和远处转移等因素均无明显关系钟=0．134、0．019、0．002、0．334、1．433、P〉0．05）;MTSS1表达下调与结直肠癌浸润深度、分化程度、淋巴结转移以及Dukes分期等因素相关（x2=9．520、13．849、7．171、8．026、P〈0．05）。结论MTSS1蛋白异常表达可能在结直肠癌的发生发展及其浸润转移中起着重要作用。     

APCDD1在直肠癌及结直肠腺瘤中的定量表达

目的建立荧光定量逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）方法检测APCDD1 mRNA基因表达的方法，了解直肠癌及结直肠腺瘤组织中APCDD1 mRNA的表达水平。方法用荧光定量PCR方法检测86例直肠癌及癌旁组织、20例结直肠腺瘤及配对的正常黏膜组织APCDD1 mRNA相对表达水平并比较其差异。结果75％的结直肠腺瘤和65％的直肠癌表达上调，86例直肠癌APCDD1 mRNA平均相对表达水平为正常黏膜组的4．712倍，20例结直肠腺瘤中APCDD1 mRNA平均相对表达水平为正常黏膜组的3．872倍，直肠癌组和结直肠腺瘤组均较正常黏膜组织上调，差异有统计学意义（P〈0．05）。结论APCDD1 mRNA表达在腺瘤和直肠癌中表达上调，但在直肠癌中与病理分级无明显相关。     

生物钟基因hPer2在人结直肠癌中的表达及其临床意义

目的 检测hPer2蛋白在人结直肠癌中的表达,探讨其临床意义.方法 取人结直肠癌及癌旁组织各38例,以免疫组织化学方法检测其中hPer2蛋白的表达,并分析其表达与l临床及病理常用指标的关系.结果 在结直肠癌及癌旁正常黏膜细胞中hPer2均有表达,阳性表达率分别为81.6%(31/38)及97.4%(37/38),两者间差异有统计学意义(P<0.05).以癌旁组织为参照,hPer2在癌组织中表达下调者占63.1%(24/38),表达上调者占5.3%(2/38),无明显区别者占31.6%(12/38),其差异有统计学意义(P<0.01).hPer2表达失调与结直肠癌患者年龄≤50岁、肿瘤组织学分级高、浸润深度深、有淋巴结转移、TNM分期晚相关(P<0.05).结论 hPer2在人结直肠癌中表达下调.hPer2表达的失调甚至缺失可能与结直肠癌的生长、浸润、转移相关.     

直肠癌中差异表达的microRNA及其与预后因子的关系

目的：检测直肠癌组织中差异表达的microRNA（miRNA）,并分析其与预后因子的关系。 方法：选20例直肠癌患者手术所得癌组织标本与癌旁组织,用q-PCR方法筛选在癌组织与癌旁组织中有差异表达的miRNA以及相关的预后因子。 结果：筛选得到26个在直肠癌组织中有差异表达的miRNA,其中15个miRNA表达上调,11个表达下调。相关分析显示,下调的miR-4770、miR-4790-5p与CK20表达呈负相关;上调的miR-182、miR-125a-5p、miR-126与p53表达呈正相关、miR-143和k-ras呈负相关、miR-9与vilin基因呈负相关（均P<0.05）。 结论：直肠癌组织中差异表达的miRNA与预后因子密切相关,可作为直肠癌诊断或预后判断的生物标记。     

微小RNA let-7基因表达在膀胱癌生物学行为中的作用

目的 探讨膀胱癌组织中微小RNA(miRNA)表达在膀胱癌发生发展中的作用. 方法 Trizol法抽提9例膀胱癌患者癌组织及癌旁正常膀胱组织标本总RNA,分离与富集miRNA,随机选取2组miRNA标本与miRNA表达谱芯片杂交,采用LuxScan 3.0和SAM 2.1软件对芯片结果 进行图像数据分析.在差异性表达的miRNA中筛选出感兴趣的let-7基因,采用印迹杂交技术对9组miRNA标本中let-7基因进行验证. 结果 膀胱癌组织和正常膀胱组织标本中差异性表达有显著性意义的miRNA 71个,其中表达上调33个,表达下调38个;差异性表达有极显著性意义的miRNA(上调或下调≥4倍)26个,其中显著上调12个,显著下调14个.let-7基因验证结果 与芯片表达结果 一致,癌组织let-7基因表达吸光度值为479.6±228.2,正常膀胱组织为694.6±152.9,组间差异有统计学意义(P<0.05). 结论 膀胱癌组织和正常膀胱组织中存在差异表达的miRNA,let-7基因在膀胱癌的发生中可能起着抑癌基因的作用.     

直肠癌旁移行黏膜的分布规律及survivin基因表达的意义

目的　探讨survivin基因在直肠癌旁移行黏膜中的表达及意义。方法　应用黏液组化方法检测了解各种组织类型直肠癌旁移行黏膜的分布规律 ,应用免疫组化方法检测凋亡抑制基因sur vivin在直肠癌及癌前状态的表达情况。结果　黏液癌的癌旁移行黏膜范围平均为 7.83cm ,明显大于乳头状癌及管状腺癌 (P <0 .0 1) ;癌旁移行黏膜DukesC期平均 5 .61cm ,明显大于DukesA ,B期 (P<0 .0 5 ) ;正常黏膜 (NM )、移行黏膜 (TM )、非典型增生黏膜及癌组织中均有survivin基因产物表达 ,由正常直肠黏膜到癌组织表达率逐渐增加 ,4组间差别均有显著意义 (P <0 .0 5 )。结论　在非典型增生及癌组织存在survivin基因表达上调 ,提示survivin基因对直肠癌的发生发展起重要作用 ,有望成为直肠癌基因治疗的新靶点。在黏液癌及DukesC期直肠癌旁移行黏膜范围明显增宽 ,提示对低位黏液癌及DukesC期直肠癌保肛手术应持慎重态度。     

Survivin在结直肠癌中的表达及其意义

目的探讨Survivin基因在结直肠癌中的表达及其意义。方法应用免疫组织化学(SP)法和TdT介导的dUTP缺口末端标记技术原位观察48例结直肠癌患者的癌组织、癌旁组织和正常组织中Survivin蛋白的表达和细胞凋亡。结果癌组织Survivin的阳性表达相对含量(PU)值(38.76±5.14)明显高于癌旁(25.17±7.26)和正常组织(0.57±0.03),差异有统计学意义(t=2.54,P<0.05),正常大肠黏膜中极少见Survivin蛋白表达;癌旁和癌组织凋亡指数(AI)分别为(7.51±2.63)%和(4.65±1.76)%,两者差异有统计学意义(t=2.18,P<0.05);Survivin蛋白的阳性表达与患者的性别、年龄、肿瘤大小无相关性(P>0.05),与癌组织的分化程度、淋巴结转移和Dukes分期相关,低分化、有淋巴结转移和DukesC/D期的Survivin蛋白表达显著高于相关组别(P<0.05)。结论Survivin在结直肠癌组织中表达上调,Survivin表达可抑制结直肠癌的细胞凋亡,这可能是结直肠癌发生、发展的有关因素;Survivin的表达与结直肠癌的恶性生物学行为有关。     

用基因芯片筛选胃黏膜癌变相关基因

目的 用基因芯片技术筛选与胃黏膜癌变相关的基因。方法 利用Affymetrix公司生产的U133A基因芯片，对癌旁黏膜和切缘正常胃黏膜基因表达谱进行检测，并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果 （1）癌旁黏膜与正常胃黏膜比较差异3倍以上共有150个基因，其中表达上调[SLR（信号比的对数值）〉1．5]有130个，表达下调（SLR〈-1．5）有20个。从表达差异的基因功能分类看，以酶和酶调控子活性改变最多（28，占18．7％）；其次是与核酸结合活性相关基因（17，占11．3％）；第三是与信号传导活性相关基因（15，占10％）；第四是与蛋白结合活性相关基因（13，占8．7％）。除了40个功能未知的基因占总数26．7％外，以上4大类共占基因总数的48．7％。（2）癌旁黏膜（P）和胃癌（T）同时与正常胃黏膜比较，有71个相同的基因表达差异。其中表达上调（癌旁上皮SLR〉1．5）有61个，表达下调（癌旁上皮SLR〈-1．5）有10个。71个同时出现癌旁黏膜和胃癌的基因在染色体定位，发现19号染色体异常基因最多有11个；其次是1、2、16、17号染色体，分别是6个；5、14、22号和Y染色体未发现异常的基因。结论 71个癌旁黏膜与胃癌同时出现、表达相同的基因可能与早期胃癌的演化有关。酶和酶调控子活性、核酸结合活性、信号传导活性和蛋白结合活性4大类相关基因是研究胃癌发生的重要基因。19号染色体及1、2、16、17号染色体是研究胃癌发生的重要基因位点。     

LINC01600在结直肠癌临床诊断中的应用价值

目的分析长链非编码RNA LINC01600在结直肠癌组织中的表达以及在临床结直肠癌诊断过程中的价值。方法选取2020年1月至2023年12月新乡医学院第一附属医院收治的37例结直肠癌患者的临床标本作为研究标本, 选择对应的癌旁组织作为对照样本。提取癌旁组织和结直肠癌组织的总RNA, 采用转录组学技术分析癌组织和癌旁组织差异表达的长链非编码RNA。选取差异最为显著的长链非编码RNA LINC01600作为研究对象。采用荧光定量聚合酶链反应技术检测结直肠癌组织和癌旁组织中LINC01600的表达水平。制作受试者工作特征曲线分析LINC01600对结直肠癌的临床诊断效能。采用单因素方差分析不同临床分期, 不同分化程度患者LINC01600表达水平。并分析LINC01600和患者预后的关系。结果结直肠癌和癌旁组织共检出39 123个长链非编码RNA, 其中包括2 018个新的长链非编码RNA。差异分析显示, 其中有1 626个差异表达的长链非编码RNA, 其中1 019个上调基因, 607个下调基因。长链非编码RNA主要富集于核糖体通路、柠檬酸循环通路和RNA剪接相关通路。本研究选取差异最为...     

胃癌和癌旁黏膜与距癌远端切缘胃黏膜基因表达谱差异的研究

目的用基因芯片技术研究胃癌 （T）和癌旁黏膜 （P）与距癌远端切缘胃黏膜 （C）基因表达谱差异,筛选与早期癌变相关的基因.方法利用国际学术界公认的标准化 Affymetrix公司生产的 U133A基因芯片分别检测 T和 P及 C基因表达谱,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析.结果 （1）T与 C比较差异 4倍以上共有 766个基因,其中表达上调 [信号比的对数值 （SLR）〉2]有 530个,表达下调 （SLR〈- 2）有 236个;（2）P与 C比较差异 4倍以上共有 64个基因,其中表达上调 （SLR 〉2）有 50个,表达下调 （SLR〈- 2）有 14 个;（3）T和 P同时与 C比较 （T、 P两者之一差异 4倍以上 ）共有 143个相同的基因,其中表达上调 （SLR 〉2）有 108个,表达下调 （SLR〈- 2）有 35个.结论癌旁黏膜在基因表达水平上显示 143个基因与胃癌表达的基因相同,提示这些基因可能与早期胃癌癌变的启动和演化有关.     

基因芯片在筛选胆管癌相关基因差异性表达的应用研究

目的　应用cDNA芯片技术进行肝外胆管癌相关基因表达谱差异分析 ,筛选胆管癌相关基因。方法　按一步法分别抽提 6例胆管癌和正常人胆管黏膜总RNA、纯化 ,逆转录合成掺入荧光分子的cDNA链探针 ,与 10 68条人PCR微矩阵芯片杂交 ,扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析比较二种组织基因表达谱差异。结果　胆管癌与正常胆管黏膜的基因表达谱分析 ,发现有 194条基因表达差异 ,6组标本 47条与肿瘤相关的基因一致向上或向下表达 ,2 3条表达上调 ,2 4条表达下调。结论　基因芯片能快速筛选胆管癌相关基因 ,分析这些差异表达的基因能够阐明胆管癌复杂的生物学特性与基因表达之间的内在联系 ,并识别肿瘤的标记物。     

全基因组寡核苷酸表达谱筛选哈萨克族食管癌相关靶基因

目的 筛选哈萨克族食管癌与正常食管黏膜的差异表达基因.方法 新鲜标本取自哈萨克族食管鳞癌患者.采用RNA保护技术保护组织标本,分离癌组织、正常食管黏膜组织标本,提取RNA,线性扩增获得足量cRNA,利用基因芯片分别检测癌组织和正常食管黏膜组织基因表达谱,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析.结果 癌组织和正常食管黏膜组织比较差异10倍以上共有170个基因,其中表达上调(信号比的对数值>3)有39个,表达下调(信号比的对数值<-3)有131个.表达异常的基因与细胞周期调节、细胞凋亡、细胞骨架、细胞外基质、细胞内信号传递、蛋白质的翻译合成及免疫功能等相关.结论 利用全基因组寡核苷酸芯片可准确、高效地筛选出哈萨克族食管癌相关的候选靶基因170个,这些基因与哈萨克族食管癌的发生、发展有关.     

前列腺癌相关基因表达谱研究

目的 寻找前列腺癌相关基因以用于前列腺癌的诊断和治疗。方法 应用含有4366条人类全长基因cDNA基因表达谱芯片，研究一组前列腺癌和正常前列腺组织样本的基因表达谱，找出研究前列腺癌组织和正常前列腺组织中差异表达的基因。结果 前列腺癌与正常前列腺组织有差异表达基因287条，其中未知基因165条，已知基因122条，从已知基因中筛选出有显著差异表达的基因56条，其中上调基因20条，下调基因36条。结论 运用cDNA微矩阵基因芯片对基因表达谱进行分析，能有效筛查出新的前列腺癌相关基因。     

前列腺癌相关基因表达谱分析

目的　探讨前列腺癌发生发展中相关基因群的表达意义。　方法　应用含有 4 36 6条人类全长基因cDNA基因芯片研究一组前列腺癌及正常前列腺组织基因表达谱的差异性。同时进行生物信息学分析。　结果　在前列腺癌与正常前列腺组织间存在差异表达的基因 2 87条 ,未知基因16 5条 ,已知基因 12 2条。已知基因中有显著差异表达基因 5 6条 ,其中上调基因 2 0条 ,下调基因 36条。　结论　生物信息分析显示 :显著差异表达基因与肿瘤的发病机理可能存在相关性。     

GSE74602芯片数据中直肠癌关键基因与治疗药物的生物信息学筛选

目的:通过生物信息学方法探寻结直肠癌的诊断标志物及潜在的治疗靶点与治疗药物。方法:从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台基因表达大棚车(GEO)下载芯片数据GSE74602,包括60个样本,其中30例结直肠癌样本,30例正常结直肠组织样本。用R语言中的Limma包对正常组织和癌症组织进行差异表达分析,用DAVID在线数据库对筛选出来的差异表达基因进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科(KEGG)信号通路分析,同时通过STRING在线数据库构建差异表达基因的蛋白互作网络,利用Cytoscape软件进行可视化编辑,并且通过MCODE插件进行子网络模块分析,筛选出结直肠癌发生过程中的核心基因。最后,用连通图数据库(c Map)分析具有潜在治疗结直肠癌的小分子药物。结果:总共筛选出231个差异表达基因,包括122个上调基因,109个下调基因。GO分析结果表明,表达上调的基因富集的生物学过程主要包括细胞周期、细胞分裂等,而表达下调的基因富集在免疫反应,细胞内信号级联和防御反应等生物学过程。KEGG通路分析发现表达上调的基因主要参与细胞中氮及矿物质的代谢和细胞中相关物质的分泌(胆汁、胰液)的信号通路,而表达下调的基因主要参与药物代谢、细胞循环以及p53信号传导通路。子网络模块分析发现了一些在结直肠癌发生的调控中起着重要作用的关键基因,如KIF20A、CENPF、NCAPG、PYY、IQGAP3;蛋白互作网络中的差异表达基因被映射到c Map上,筛选出若干个潜在治疗结直肠癌的小分子药物,如紫霉素、去甲骆驼蓬碱、斑鸠霉素等。结论:所发现的关键基因可能会成为诊断结直肠癌新的肿瘤标志物或者治疗结直肠癌的新的靶点;此外,筛选出的小分子药物有可能成为治疗结直肠癌的新型药物。     

应用抑制消减杂交和cDNA表达谱芯片筛选肝星形细胞持续活化的相关基因

目的：利用抑制消减杂交（suppression subtractive hybridization,SSH）和cDNA表达谱芯片筛选早期活化的肝星状细胞与大鼠正常肝脏组织、轻度肝纤维化组织、重度肝纤维化组织中差异表达的基因.方法：从SSH构建的大鼠轻度和重度肝纤维化中两个差异cDNA文库中挑选1 000条上调显著的基因,与正常大鼠4 136条基因克隆制作成一张芯片,筛选持续期活化的肝星状细胞相关基因.结果：获得与HSC持续活化相关的上调基因633条,下调基因715条,其中血清和糖皮质激素调节蛋白激酶（SGK）在正常大鼠基因克隆和2、8周SSH上调差异基因中均呈上调信号.结论：联合应用SSH和cDNA表达谱芯片是筛选和鉴定不同样本中差异表达基因的快速、经济和有效方法;SGK可能作为多种细胞信号传导通路和细胞磷酸化级联反应的一个功能性交汇点,参与了肝星状细胞的早期活化和信号传导.     

联合应用SSH和cDNA表达谱芯片筛选肝星状细胞早期活化的相关基因

目的利用抑制消减杂交(suppressionsubtractivehybridization,SSH)和cDNA表达谱芯片筛选早期活化的肝星状细胞(hepaticstellatecell,HSC)和大鼠正常肝脏组织、轻度肝纤维化组织、重度肝纤维化组织中差异表达的基因。方法从SSH构建的大鼠轻度肝纤维化、重度肝纤维化2个差异cDNA文库中挑选1000条上调显著的基因,与正常大鼠4136条基因克隆制作成一张芯片,筛选早期活化的肝星状细胞相关基因。结果获得与HSC早期活化相关的上调基因有202条,下调基因有80条,其中血清和糖皮质激素调节蛋白激酶(serumandglucocorticoidsensitivekinase,SGK)在正常大鼠基因克隆和2周及8周SSH上调差异基因中均呈上调信号。结论联合应用SSH和cDNA表达谱芯片是筛选和鉴定不同样本中差异表达基因的快速、经济和有效的方法;SGK可能作为多种细胞信号传导通路和细胞磷酸化级联反应的一个功能性交汇点,参与了肝星状细胞的早期活化和信号传导。     

特发性高草酸尿症大鼠肝脏差异表达基因的筛选研究

目的 从基因水平探索特发性高草酸尿症(IH)的发病机制,筛选可能导致其发病的相关基因.方法应用含有26 962条大鼠全基因组寡核苷酸芯片,研究3只IH模型大鼠和3只正常大鼠肝脏组织基因表达谱的差异性,同时进行生物信息学分析.结果 在IH模型大鼠与正常大鼠肝脏组织之间存在差异表达基因147条,其中上调基因123条,下调基因24条,包括细胞受体、免疫相关、细胞信号和传递蛋白、代谢蛋白、发育相关等多种基因.结论 基因芯片能有效筛选出IH模型大鼠肝脏中的差异基因,显著的基因差异表达与其发病机制可能存在相关性.