CUEDC2在肝细胞癌组织中的表达及其临床预后的意义

目的:检测含CUE结构域蛋白2(CUEDC2)在肝细胞癌组织中的表达,探讨其与临床预后的关系。方法:选取具有完整临床及预后资料的186例手术切除肝细胞癌组织的石蜡组织标本,采用免疫组化技术检测CUEDC2的表达,并结合肝癌临床病理因素及预后进行分析。结果:CUEDC2在85.5%(159/186)的肝癌组织中有表达,其中低表达为52.2%(97/186),高表达为47.8%(89/186);CUEDC2的表达状态与血清甲胎蛋白(AFP)水平、肿瘤大小、肿瘤数目、肝癌分化程度和TNM分期有关(P0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示CUEDC2高表达的患者术后总生存及无复发生存期较低表达者显著缩短;多因素Cox回归分析显示CUEDC2的表达状态、血清AFP和肿瘤数目是影响肝癌患者术后无复发生存(RFS)及总生存期(OS)的独立危险因素。结论:CUEDC2在多数肝癌组织中有表达,与肿瘤的生长、分化及预后有关;CUEDC2可以作为一个有价值的肝癌预后预测的新指标。     

基于生物信息学分析PI3在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及临床意义

目的 探究PI3基因在卵巢浆液性囊腺癌（OV）中的表达及临床意义。方法 利用多种生物信息学分析在线工具，基于GEO、TCGA、GTEx、GEA数据库挖掘PI3基因在OV的表达、生物学作用及临床意义。结果 PI3在OV组织的表达量高于正常卵巢组织（P<0.05）;OV患者中，PI3低表达组总生存期和无复发生存期比高表达组长（P<0.001）；在免疫细胞浸润方面，中性粒细胞水平与PI3在OV中的表达呈正相关，Th1细胞、Th2细胞、B细胞、嗜酸性粒细胞水平对OV患者生存有影响且与PI3表达高低有关；PI3参与了炎症反应、白细胞活化等生物学过程，参与了PI3K-Akt、Toll样受体等信号通路。结论 PI3基因在OV中高表达，可作为OV患者诊断、治疗的潜在靶点。     

CEP55蛋白在原发性肝细胞癌组织中的表达与临床特征及预后的相关性分析

目的 分析中心体蛋白55(CEP55)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达与临床特征及预后的相关性,为揭示肝癌诊断和治疗的新目标和策略提供依据.方法 基于TCGA-LIHC数据库分析CEP55在HCC和相应的正常组织中的表达差异,并进一步分析其与生存预后的关系.纳入185例于2015年4月至2016年7月在我院肝胆外科完成了肝切除术的HCC患者,对手术切除的肿瘤组织和癌旁组织(距离肿瘤边缘>5.0cm)制作组织蜡块.采用免疫组织化学染色法检测组织CEP55蛋白表达,分析CEP55表达与HCC患者不同临床特征的关系.采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,并使用Log-rank分析CEP55表达与预后的相关性.采用Logistic回归模型分析影响原发性肝癌患者预后的危险因素.结果 基于TCGA-LIHC数据库,418例肝癌组织中CEP55基因拷贝数明显高于癌旁正常组织(P<0.05),且根据每组CEP55表达水平的中位数值将患者分为两组.与LIHC队列中的低表达组相比,CEP55高表达组的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)明显缩短(Log-Rank检验,P<0.05).CEP55蛋白的表达与患者血管有无浸润、肿瘤直径、BCLC分期、T分期、N分期、分化程度、AFP水平有关(P<0.05).随访5年,CEP55蛋白高表达组和低表达组患者5年OS分别为64.9％(63/97)、84.0％(74/88)(Log-Rankχ2=10.192,P=0.001);5年PFS分别为54.6％(53/97)、69.3％(61/88)(Log-Rankχ2=5.750,P=0.016).经单因素和多因素Logistic回归分析,肿瘤组织CEP55高表达是影响患者预后的独立危险因素之一(P<0.05).结论 CEP55蛋白在HCC组织中普遍呈高表达,其与患者预后不良有关,可作为肝癌早期诊断或潜在治疗靶点的分子生物学指标.     

卵巢癌中ETV4基因高表达对患者预后的临床意义

目的　探讨ETV4在卵巢癌中的表达及与预后的关系。 方法　分别利用BioGPS数据库、Oncomine数据库、癌症细胞系百科全书（CCLE）和Kaplan-Meier Plotter数据库分析ETV4基因在正常人体组织中的表达、卵巢癌组织中的表达，以及卵巢癌患者预后生存分析；利用cBioPortal数据库分析ETV4在卵巢癌中基因突变和预后关系。 结果　BioGPS数据库分析结果显示ETV4在正常卵巢组织低表达；Oncomine数据库检索出340项，ETV4表达水平有差异意义的结果32项，其中ETV4表达增高30项，ETV4表达降低2项；对符合设定条件的2项研究进行Meta分析发现，ETV4在卵巢癌组织中呈高表达状态（P<0.05）；CCLE分析结果显示ETV4在卵巢癌细胞中高表达；Kaplan-Meier Plotter数据库结果显示，ETV4高表达组的卵巢癌患者总体生存时间（OS）与无病生存时间（DFS）较低表达组均显著延长（P<0.05）。cBioPortal数据库结果显示ETV4在卵巢癌中基因突变率为2.5%，但对卵巢癌患者的OS与DFS均无显著影响（P>0.05）。 结论　ETV4在卵巢癌组织中高表达，且具有显著延长卵巢癌患者OS与DFS的作用，可作为卵巢癌临床预后的候选标志物；ETV4基因的突变对卵巢癌患者的OS与DFS无显著影响。     

通过生物信息学分析寻找影响结肠癌患者预后的铁死亡相关基因

目的 探讨结肠癌(CC)中具有预后意义的铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNAs),并构建预后相关的预测评分模型，最后得到与预后相关lncRNAs共表达的铁死亡相关差异基因。方法 从FerrDb数据库下载铁死亡相关基因(FGs),在TCGA数据库中共下载41例癌旁正常组织、473例肿瘤组织的表达数据和452位患者的临床数据，通过共表达和差异分析确定铁死亡相关的差异lncRNA(DEFlncRNAs),使用单因素Cox回归分析确定预后相关的DEFlncRNAs,再运用多因素Cox回归分析构建预后模型、计算患者的风险得分，根据风险得分的中位数将患者分为高风险组和低风险组，通过Kaplan-Meier风险曲线、单因素和多因素Cox回归分析和受试者工作特征(ROC)曲线验证模型的准确性，而后绘制列线图预测患者生存情况。最终，通过共表达分析找到调控DEFlncRNAs的铁死亡差异基因，并用免疫组织化学实验验证表达差异。结果 从TCGA数据库下载CC样本的表达及临床数据，并成功构建了含28个lncRNAs的风险预后模型，模型可较好地预测结肠癌患者的预后；成功构建了可预测患者总体生存期的列线图，该...     

肝细胞肝癌中LOXL2过表达与转移及预后的相关性

目的检测LOXL2和上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关基因在肝细胞肝癌组织中的表达,揭示LOXL2和EMT之间的关系,从而阐明LOXL2对肝细胞肝癌转移及预后的影响。方法采用免疫组化法检测106例肝细胞肝癌组织中LOXL2、Snail、E-cadherin和vimentin的表达,采用CD31/PAS双染法检测肝细胞肝癌中血管生成拟态(vasculogenic mimicry,VM)的情况,并分析LOXL2与EMT分子之间的相关性。采用χ~2和Spearman相关分析来分析其与VM形成和临床病理资料之间的关系。采用Kaplan-Meier法评估LOXL2对肝细胞肝癌患者生存时间的影响。采用Cox比例风险模型分析LOXL2对肝细胞肝癌预后的价值。结果 LOXL2表达与Snail、vimentin和E-cadherin的表达密切相关,LOXL2表达与肿瘤分级和VM形成相关。LOXL2阳性表达或VM形成的患者其总体生存期和无病生存期比LOXL2阴性表达和无VM形成的患者短(P0.05);同时具有LOXL2阳性表达和VM形成的患者预后最差。结论 LOXL2表达与EMT标记蛋白相关,并与肝细胞肝癌分级和VM形成密切相关,且对预后有一定的影响。     

爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白在肝细胞癌的表达及临床预后的意义

目的 分析爪蟾驱动蛋白样蛋白2靶蛋白(TPX2)在肝细胞癌(HCC)的表达及其临床预后的意义。方法 首先，分别利用UALCAN、K-M Plot以及HPA数据库分析TPX2在HCC的表达水平、生存预后及其相关性；再次，利用TIMER、GEPIA和SangerBox数据库分析TPX2的免疫细胞浸润以及与TP53突变相关性和突变景观图；最后，通过HCCDB数据库分析在HCC中TPX2的共表达基因及其预后价值，并对共表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果 TPX2在HCC高表达且不利于患者的总体生存(OS)、疾病特异性生存(DSS)、无进展生存(PFS)和无复发生存(RFS);同时，TPX2在HCC组织与肿瘤细胞纯度和多种免疫细胞(B细胞、CD4⁺T以及CD8⁺T等)显著相关；并且，TPX2在HCC中的表达水平与TP53突变显著相关。TPX2对HCC患者1年、3年和5年OS预后诊断的受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分别是0.73,95%CI(0.669～0.79)、0.668,95%CI(0.60...     

PTP1B蛋白高表达在卵巢癌临床预后评价中的意义

目的探讨PTP1B在上皮性卵巢癌中的表达及与临床病理特征和预后的关系。方法应用Oncomine数据库和免疫组化法检测卵巢癌组织中PTP1B的表达情况,进一步分析PTP1B表达与卵巢癌临床病理特征及预后的关系。结果通过Oncomine数据库分析发现PTP1B在卵巢浆液性囊腺癌组织中的表达高于正常组织(P 0. 001)。免疫组化结果显示PTP1B表达与卵巢癌FIGO分期(P 0. 001)和大网膜转移相关(P=0. 002)。Kaplan-Meier生存分析显示,与PTP1B低表达组相比,PTP1B高表达组患者的总生存期更短(P 0. 001)。多因素分析显示FIGO分期和PTP1B表达是影响卵巢癌患者总生存期的独立预后因素。结论卵巢癌中PTP1B表达与肿瘤进展和患者不良预后密切相关。PTP1B可能是影响卵巢癌患者不良预后的有价值评估指标之一。     

免疫评分在肝癌患者中的预后研究

目的　探讨免疫评分及PD-L1在肝癌组织的表达情况,分析肝癌患者的免疫评分与其临床病理特征及预后的关系。 方法　采用免疫组化检测免疫评分与PD-L1在61例肝癌患者中的表达,分析PD-L1、免疫评分与临床病理特征及预后之间的关系。 结果　肝癌中免疫评分较高的表达率为26.2%,较低的表达率为73.8%。统计分析发现免疫评分与AFP增高（P<0.05）及肝内复发（P>0.05）具有相关性;而与患者年龄、性别、肿瘤直径、分化程度、脉管癌栓等临床因素无相关性（P>0.05）。生存分析发现免疫评分较高患者的总生存期与无复发生存期显著高于免疫评分较低的患者（χ2=11.39,P<0.01;χ2=14.78,P<0.01）。肝癌组织PD-L1的阳性表达率为44.3%,对应癌旁低表达,具有统计学差异（χ2=7.313,P<0.01）。PD-L1阳性患者的总生存期与无复发生存期低于PD-L1阴性患者（χ2=5.598,P<0.05;χ2=10.90,P<0.01）。肝癌组织中PD-L1与免疫评分间具有负相关性（χ2=12.703,P<0.01）。 结论　免疫评分可作为患者预后的一个标志物,免疫评分高的患者预后较好,反之易早期复发且预后较差;肝癌组织PD-L1与免疫评分之间具有负相关性。     

Cystatin B在肝癌组织中的表达及其与患者预后的关联

目的：研究Cystatin B(CSTB)在肝癌组织中的表达及其与肝癌患者预后的相关性。方法：利用Real-time PCR和Western blot分别检测肝癌病人癌与癌旁组织中CSTB mRNA水平和蛋白的表达,进一步通过免疫组织化学法检测组织芯片中CSTB表达并分析其与肝癌临床特征的关系。采用Kaplan-Meier生存分析法分析CSTB与肝癌预后的关系。结果：在肝癌组织中CSTB mRNA水平和蛋白水平的表达明显高于癌旁(P<0.05);生存分析发现CSTB高表达肝癌患者比低表达的患者更易复发且总体生存期短(P值均小于0.05);CSTB的表达与年龄、性别、BCLC分级以及肿瘤大小差异均无统计学意义(P值均大于0.05),CSTB高表达的患者更容易形成门脉癌栓(P<0.05)。结论：CSTB在肝细胞癌组织中高表达,其表达水平与肝癌病人预后有关,有望成为肝癌预后指标。     

HBsAg阳性肝癌患者预后及病理因素与ALK基因表达的相关性研究

 目的:检测ALK基因在HBsAg阳性肝细胞癌患者中的表达,并分析其与临床特征及预后的相关性。方法:收集我院2005~2010年261例术后经病理确诊的HBsAg阳性肝癌患者肿瘤组织及癌旁组织标本,采用免疫组织化学法和FISH法对标本石蜡切片进行分析,检测ALK表达情况,并探讨其对HBsAg阳性肝癌患者临床病理因素和预后的影响。结果:在肿瘤组织中,免疫组织化学法和FISH法分别检测到ALK阳性表达率为44.8%和32.6%。免疫组化结果进一步显示ALK蛋白表达与患者性别、肿瘤数目和微转移密切相关(P<0.05),而与患者的年龄、AFP水平、肿瘤大小、临床分期等无关;ALK阳性患者总生存期和无进展生存期均明显低于阴性患者(P<0.01);多因素分析显示,ALK表达和微转移是对患者无进展生存期具有统计学显著性的预后因素。结论:ALK在HBsAg阳性肝癌组织表达状态与肝癌的生长和转移关系密切,可以作为反映肝癌生物学行为和判断预后的有效指标。     

基于生物信息学分析POSTN基因在胃癌中的表达及免疫意义

目的：探讨骨膜蛋白（POSTN）在胃癌免疫和预后中的价值。方法：利用生物信息学方法分析POSTN在胃癌中的表达及其与胃癌患者生存预后的关系。比较TCGA胃癌队列中癌组织和正常组织中的免疫细胞分布。从TISIDB数据库提取POSTN相关免疫调节剂，并通过GO和KEGG通路富集分析POSTN相关免疫事件。基于POSTN相关免疫调节剂，采用Cox回归开发一个多基因风险预测模型，由此产生风险评分。使用受试者工作特征曲线评估模型的预测准确性。构建带有校准曲线的预后诺模图预测个体五年生存率。结果：POSTN在胃癌组织中的表达明显高于非肿瘤组织。POSTN高表达组总生存期比POSTN低表达组缩短。POSTN高表达与多数免疫细胞高免疫浸润水平呈正相关。基于46个POSTN相关免疫调节剂进行的KEGG路径分析显示，NF-κB信号通路和细胞黏附分子参与其中。风险评分可作为胃癌患者预后的独立预测因子。结论：POSTN在胃癌组织中高表达，其表达与胃癌患者总体生存相关。POSTN与肿瘤免疫浸润相关，提示POSTN可能是胃癌的潜在免疫治疗靶点。     

人肝癌细胞系HepG2和Huh7中的基因组拷贝数变异分析

目的 利用人肝细胞癌拷贝数变异和转录组实验，结合临床公共数据，探索肝细胞癌的拷贝数变异对肝癌发生发展的影响。方法 用光学基因组图谱技术识别肝癌细胞系HepG2和Huh7中的拷贝数变异，随后分析两种细胞系拷贝数变异基因的功能，并根据富集通路绘制蛋白质相互作用网络。选取两个细胞系核心网络中的关键基因，分析肝细胞癌拷贝数变异与基因表达之间的关系。GEPIA数据库分析基因表达与患者临床生存的关系。用RNA-seq实验和公共数据验证基因的表达水平。结果 HepG2细胞主要存在拷贝数增加，相关基因富集在雌激素信号通路、金黄色葡萄球菌感染等通路；Huh7细胞系中既有拷贝数增加又有减少，相关基因主要富集嗅觉传导、细胞因子-细胞因子受体相互作用等通路。关键基因SRC、MAPK3和MAP3K7拷贝数与基因表达成正比，并且高表达这些基因的患者生存期显著降低(P<0.05)。相比于HEK293T细胞系，SRC、MAP3K7基因在两个肝癌细胞系的表达显著升高(P<0.001),提示了肝细胞癌的特异性变异，MAPK3无差异。结论 肝细胞癌拷贝数变异基因SRC、MAP3K7的表达与患者的预后显著相关，可...     

BAP1表达与肿瘤免疫浸润及卵巢癌患者临床预后的关系

目的 旨在分析BAP1表达与肿瘤免疫浸润及卵巢癌患者临床预后的关系。方法 通过基因组织表达数据库（GTEx）和癌症基因组图谱（TCGA）数据库分析人类泛癌（包括卵巢癌）中BAP1的表达情况。通过单变量生存分析和Kaplan-Meierplotter曲线分析卵巢癌组织中BAP1表达与患者总生存期（OS）、无病生存期（DFS）、无进展生存期（PFS）等预后的关系。基于TISIDB和TIMER数据库和Spearman相关系数分析BAP1与卵巢癌肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）及免疫检查点标志分子之间的相关性。最后,从TCGA数据库下载了RNA-Seq数据,选择BAP1及其共同表达基因进行基因集富集分析（GSEA）。结果 BAP1在卵巢癌组织中呈显著高表达（P<0.001）,经单变量生存分析和Kaplan-Meier曲线分析,BAP1高表达与患者总生存预后、无病生存预后、无进展生存预后不良有显著相关性（P<0.001）。基于TISIDB数据库和TIMER数据库分析,卵巢癌BAP1与9种TILs丰度和27种常见种免疫检查点标志物表达呈显著正相关性（P<0.05）。基于LinkedO...     

SCNM1在乙肝相关性肝癌中的表达及临床意义

目的:研究钠离子通道调节蛋白1(SCNM1)在乙肝相关性肝癌中的表达情况,并探讨其表达差异与临床病理特征及预后的关系。方法:标本来源于2013年1月～2015年12月在中山大学附属第三医院接收治疗的108例乙肝相关性肝癌患者,所有患者均签署知情同意书,符合医学伦理学规定。结合公共数据库中的肝癌资料,分析SCNM1的m RNA表达水平;应用RT-qPCR检测乙肝相关性肝癌组织及癌旁组织中SCNM1的m RNA表达水平,并分析SCNM1的表达水平与乙肝相关性肝癌临床病理特征的关系;利用Kaplan-Meier plotter分析SCNM1与肝癌患者预后的相关性。结果:TCGA数据库、Human Protein Atlas数据库和Oncomine数据库的分析结果显示,SCNM1在肝癌组织中的表达量明显高于正常肝组织(P 0. 01)。SCNM1主要分布于细胞核中。RT-qPCR检测结果显示,乙肝相关性肝癌组织中SCNM1的m RNA中位表达水平明显高于其配对癌旁组织(t=8. 082,P 0. 01)。乙肝相关性肝癌患者中SCNM1的表达水平与肝硬化、丙氨酸转氨酶和肿瘤大小具有相关性(P 0. 05),而与患者的性别、年龄和肿瘤包膜等临床病理特征无相关,SCNM1高表达的肝癌患者总生存时间较低表的患者达短(HR=1. 53,P=0. 016),SCNM1高表达的乙肝相关性肝癌患者总生存时间更短(HR=2. 41,P=0. 015)。结论:在乙肝相关性肝癌中,SCNM1高表达并且和患者的预后相关。SCNM1在乙肝相关性肝癌的发生中可能起着重要作用。     

肝细胞肝癌中CENPF的表达及临床意义

目的探讨CENPF在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)中的表达及临床意义。方法基于GEO数据库、TCGA、Oncomine平台及临床HCC样本探索CENPF基因在HCC中的表达情况,运用GEPIA平台绘制患者生存曲线;基于TCGA数据库,采用GSEA软件分析CENPF表达相关的潜在信号通路。结果与正常肝组织相比,HCC组织中CENPF基因呈高表达(P0.001)。CENPF表达与HCC临床分级、病理分期呈正相关,与HCC患者总生存期、无疾病进展生存期呈负相关(P0.01)。根据GSEA富集分析,CENPF与MAPK信号途径及细胞周期中G_2/M期的转换密切相关。结论 HCC中CENPF表达显著高于对应正常肝组织和癌旁组织,且与患者预后呈负相关,提示CENPF可能通过MAPK信号途径调控细胞周期来参与HCC的发生、发展。     

基于数据挖掘探讨BOLA2在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：探讨BOLA2在肺腺癌（LUAD）与正常肺组织中的表达差异及临床意义。方法：Oncomine探讨LUAD与正常肺组织中BOLA2表达差异。UALCAN数据库分析BOLA2在LUAD中的表达及与患者临床特征的关系。通过Kaplan-Meier和多因素Cox回归分析BOLA2表达水平与LUAD患者预后的关系。LinkedOmics数据库探讨BOLA2相关基因的表达及其KEEG通路。TISIDB数据库分析BOLA2表达与免疫浸润水平的关系。结果：在LUAD中，BOLA2表达明显高于正常组织，并与患者临床特征（吸烟、淋巴结转移等）相关。LUAD中BOLA2蛋白及甲基化水平升高。过表达的BOLA2与LUAD患者短生存期显著相关，是LUAD预后不良的独立危险因素。BOLA2与PPP4C、MRPL12等基因呈显著正相关，与KIAA1109呈显著负相关。BOLA2与其相关基因可能参与核糖体、蛋白酶体等通路过程。BOLA2表达与多种免疫细胞浸润（NK细胞、记忆CD4 T细胞等）相关。结论：BOLA2在LUAD中高表达，其可能影响免疫微环境并为预后不良的指标，有望成为LUAD精准治疗的潜在生物标志物...     

铁死亡相关基因DPP4与肿瘤免疫及预后的生物信息学研究北大核心CSCD

目的：分析铁死亡相关基因DPP4在泛癌中的表达及其在肿瘤免疫、预后等方面的作用，探讨DPP4在肿瘤免疫治疗及临床预后中的价值。方法：利用CCLE、TCGA及GTEx数据库对铁死亡相关基因DPP4进行泛癌的差异表达分析，并通过Kaplan-Meier及Cox回归分析DPP4与肿瘤预后的相关性；使用CIBERSORT算法评估TIMER数据库中肿瘤免疫细胞浸润情况，ESTIMATE算法评估肿瘤微环境，Spearman检验分析基因表达与免疫新抗原、肿瘤突变负荷及微卫星不稳定性的关联；GSEA软件研究DPP4在肿瘤中的表达与信号通路的相关性。结合人类蛋白质图谱数据库、TCGA数据库及GEO数据库对分析结果进行验证。结果：DPP4基因在多种肿瘤中的表达差异具有统计学意义，且与多种肿瘤的生存及预后密切相关，其中在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCPG）、胸腺癌（THYM）中可作为保护因素，对肿瘤预后有正向作用；DPP4与肿瘤的多种免疫细胞浸润及免疫微环境密切相关，最显著相关的3类肿瘤为膀胱尿路上皮癌（BLCA）、乳腺浸润癌（BRCA）、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PCPG）;DPP4与免疫新抗原、肿瘤突变负荷与微卫星不稳定性显著相关；GSEA分析结果显示存在多个与DPP4在肿瘤中高低表达相关的生物学通路，主要集中于物质代谢及炎症反应等通路；人类蛋白质图谱和TCGA、GEO数据库证实DPP4在肺癌、乳腺癌、直肠癌和前列腺癌中表达存在差异。结论：铁死亡相关基因DPP4可作为肿瘤免疫治疗的生物靶点用于泛癌预后评估，对临床肿瘤诊断、治疗及预后具有重要意义。     

TPX2的表达对胰腺癌预后的影响

目的 研究Xklp2靶蛋白(TPX2)在胰腺癌中的表达情况及其预测预后的潜在价值。方法 基于200个糖酵解代谢相关基因，从TCGA和GEO数据库获取胰腺患者的信息，对后者的糖酵解代谢特征进行评价，同时综合患者代谢特征及差异基因，采用Cox回归和Lasso回归分析建立风险模型，获得关键糖酵解相关基因TPX2,并用GEO数据库验证该模型的预后有效性。基于预后基因的表达分析胰腺癌患者的生存期，并分析正常胰腺组织和胰腺癌中预后基因的表达差异，最后在细胞水平验证预后基因的功能。结果 病例队列被分为高、中、低3个糖酵解代谢特征组，低速率糖酵解代谢患者存在一定生存优势，TPX2是该模型的关键基因，胰腺癌患者显示高表达TPX2,具有较差的预后。细胞水平上敲降TPX2可抑制胰腺癌细胞增殖和集落形成。结论 本研究基于糖酵解代谢模型有效地预测了胰腺癌患者的预后，TPX2有望成为胰腺癌预后预测的潜在标志性基因。     

SERPINE1对胃腺癌病人预后、免疫及细胞功能的影响

目的 探讨SERPINE1在胃腺癌中的表达及其对患者预后的影响。方法 应用GEPIA检索胃腺癌预后基因,并分析排名前10位的的预后基因在胃腺癌和胃正常组织中是否存在差异。HPA数据库分析SERPINE1在胃腺癌组织表达。STRING和GeneMANIA数据库分析SERPINE1的相关作用蛋白。TIMER数据库分析SERPINE1是否与胃腺癌免疫及预后是否相关。siRNA抑制SERPINE1表达,Quantitative Real-time PCR验证抑制情况。应用MTT和Transwell研究SERPINE1对胃腺癌细胞增殖和侵袭影响。结果 我们发现SERPINE1是胃腺癌预后差异基因;同时,SERPINE1高表达与胃腺癌病人总生存期和无病生存期相关。抑制SERPINE1表达后,胃癌细胞的增殖和侵袭能力降低。TIMER数据库分析证明SERPINE1与胃腺癌免疫细胞浸润相关。我们通过STRING和GeneMANIA数据库发现PLG,PLAT,PLAU,PLAUR和VTN在PPI中与SERPINE1密切相关。结论 SERPINE1在胃组织中不表达,在胃腺癌中表达;其高表达与胃腺癌患者不良的...