2010—2012年韶关市儿童呼吸道感染病毒病原学分析

目的探讨韶关市儿童常见呼吸道感染的病原学特点和分布特征。方法采集2010年7月至2012年7月因呼吸道感染于粤北人民医院的住院患者呼吸道标本171份,采用荧光定量PCR方法,对呼吸道标本同时进行甲型流感病毒（FluA）,乙型流感病毒（FluB）,腺病毒（ADV）,博卡病毒（BoV）,副流感病毒1型（PIV1）、2型（PIV2）、3型（PIV3）,鼻病毒（HRV）,呼吸道合胞病毒（RSV）,冠状病毒229E、0C43、HKUl、NL63,偏肺病毒（MPV）等14种常见呼吸道病毒核酸检测。结果171份标本中检出阳性标本93份,核酸阳性率为54．4％（93／171）,其中FluA占首位,阳性率为8．2％（14／171）,其他依次为ADV7．6％（13／171）,HRV7．6％（13／171）,PIVI／II／III 7．0％（12／171）,RSV 6.4％（11／171）,FluB5．8％（10／171）,BoV5．3％（9／171）,MPV3．5％（6／171）,冠状病毒（HCoV—OC43／HKUl）2．9％（5／171）。不同性别问患儿呼吸道病毒阳性率差异无统计学意义（P〉0．05）。≥6月龄组阳性率最低（37．5％）,1—3岁年龄组阳性率最高（62．1％）。结论韶关地区儿童发热呼吸道病毒感染病例的病原体以甲型流感病毒、腺病毒和鼻病毒为主。     

多重PCR检测儿童呼吸道感染常见病毒

目的 对深圳、粤东地区儿童呼吸道病毒感染进行监测、分析,探讨其流行规律.方法 2006年6月-2008年6月,于汕头大学附属医院、深圳市第四人民医院、揭阳市人民医院采集毛细支气管炎、支气管肺炎、喘息支气管炎等的患儿咽拭子或鼻咽分泌物标本686份,多重PCR进行9种呼吸道病毒检测.结果 在686例标本中病毒阳性362例(52.77%),其中呼吸道感染患儿中呼吸道合胞病毒(RSV)感染占首位,达到31.22%(113/362),其次是鼻病毒(RHV)为16.85%(61/362),最低是流感病毒B型(IVB)占0.83%(3/362),流感病毒A型(IVA)占14.36%(52/362),副流感病毒1型(PIV1)和副流感病毒3型(PIV3)分别占7.73%(28/362)和8.29%(30/362),腺病毒(AdV)达到9.67%(35/362),而人博卡病毒(hBOV)和人偏肺病毒(hMPV)分别占6.08%(22/362)和4.97%(18/362).结论 RSV、RHV及IVA是华南地区儿童呼吸道感染的主要病毒病原,混合感染以RSV、IVA联合其他病毒感染为主,诊治时应根据所感染病原体制定有针对性的措施.     

呼吸道合胞病毒的分型研究

目的 了解北京地区１９９０￣１９９１年和１９９７￣１９９８年两个非连续的流行年中呼吸道合胞病毒（ＲＳＶ）Ａ、Ｂ亚型和基因型的流行情况。方法 用间接免疫荧光法（ＩＩＦ）检测ＲＳＶ阳性鼻咽分泌物（ＮＰＳ）标本或ＲＳＶ分离株,划分Ａ、Ｂ亚型。根据Ｎ基因片段的限制性酶切图型将ＲＳＶ分离株分成至少６个基因型ＮＰＩ－６ＮＰＩ,３和６属于Ｂ亚型,ＮＰ２４和５属于Ａ亚型。根据ＳＨ基因片段的核苷酸序列将Ａ亚型分离株     

多重实时荧光定量PCR对9种常见呼吸道病原体检测

目的探讨多重实时荧光定量PCR(MRT-PCR)检测9种常见呼吸道病原体的临床应用价值。方法采用Primer Express3.0(ABI)和Primer3 Input 4.0设计引物和探针建立MRT-PCR法,通过构建质粒标准品分析该方法的最低检出限和特异性。并对204例临床标本中副流感病毒1、2、3型、肺炎支原体、肺炎衣原体、呼吸道合胞病毒、腺病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒进行回顾性检测。结果 MRT-PCR法检测病原体的最低检出限达103copies/m L,特异性达100%,无交叉反应。204例咽拭子标本中,MRT-PCR检出呼吸道合胞病毒23例,副流感病毒1、2、3型13例,腺病毒15例,肺炎支原体15例,肺炎衣原体3例,甲型流感病毒13例与乙型流感病毒6例。该结果与其他试剂报告结果完全一致。结论多重实时荧光定量PCR具有快速、准确、特异性强等特点,在呼吸道病原体检测方面有重要价值。     

三种呼吸道病毒实验室检测方法比较

目的在3种呼吸道多病原检测方法中筛选出敏感的实验室检测方法。方法以73份上呼道感染病例咽拭子标本作为检测对象,利用3种呼吸道多病原病毒检测方法,对17种呼吸道病毒检测指标进行平行检测,根据不同呼吸道病毒检测指标检出率,评价3种试剂检测效果。结果自建RT-PCR及PCR检测方法共检出56个阳性指标,市售多重RT-PCR检测试剂盒共检出41个阳性指标,市售多重实时荧光RT-PCR检测试剂盒共检出87个阳性指标。结论多重实时荧光RT-PCR检测试剂盒具有更高的检出率,可用于呼吸道多病原病毒的实验室检测。     

2009甲型H1N1流感流行期间北京急性呼吸道感染儿童常见呼吸道病毒的研究

目的了解2009至2010年甲型H1N1流感大流行期间北京地区急性呼吸道感染患儿中,除流感病毒外的其他几种常见呼吸道病毒感染的流行情况。方法设计并建立检测包括呼吸道合胞病毒（RSV）A/B亚型,副流感病毒（PIV）1、2、3型,腺病毒（ADV）和人博卡病毒（HBoV）在内的多重实时荧光PCR方法,并应用该方法对2009年6月至2010年2月甲型H1N1流感大流行期间,对首都儿科研究所附属儿童医院就诊的急性呼吸道感染患儿中甲型H1N1流感病毒检测阴性的咽拭子标本进行上述呼吸道病毒的核酸检测。结果新建立的多重RT-PCR方法最低可检测的目标基因含量为10～300拷贝数,未见与其他非目标病毒的交叉反应。本研究共检测标本849份,病毒检测总阳性率为39.0%（331份）,5岁以下占87.6%（290/331份）。各病毒的检测阳性率分别为RSV-A亚型1.4%（12份）,RSV-B亚型8.4%（71份）,PIV-1型8.2%（70份）,PIV-2型0.5%（4份）,PIV-3型3.9%（33份）,ADV13.9%（118份）,HBoV2.7%（23份）。RSV检出以B亚型为主（85.5%）,流行高峰在2009年11月至2010年2月。PIV检出以PIV-1型及PIV-3型为主,PIV-1型的流行高峰在2009年7月至2009年10月,PIV-2型及PIV-3型的流行高峰在2009年6～9月。ADV病毒在研究期间均有较高检出率（平均为13.9%）,HBoV的流行高峰在2009年9～12月。结论除流感病毒外,ADV、RSV-B及PIV可能也是2009甲型H1N1流感流行期间引起儿童急性呼吸道感染的重要病原。比较以往的资料可见各病原在2009甲型H1N1流感流行期间的流行季节性及检出率基本未受到新型流感病毒的影响。     

FQ-PCR检测淋球菌DNA的流行病学特点

目的 为了解近期本地区淋球菌DNA定量检测的流行病学特点.方法 用荧光定量PcR技术对本院2002年3月14日～2008年12月31日门诊妇产科和皮肤性病科的疑似淋病患者966例进行了NG DNA检测.并对结果 进行了分析.结果 966患者中,男性患者阳性率5.71%(14/245)、女性患者阳性率6.52%(47/721)(x2=0.20,P=0.65),检测人群总阳性率6.31%(61/966).男性NG DNA定量结果 为6.49±1.34,女性NG DNA定量结果 为6.03±1.45(t=0.84,P=0.40),所有检测人群NG DNA载量为6.13±1.43.近7年结果 中,除了2002年外,近7年NG DNA阳性率较稳定(P>0.05).NG病原体裁量最高的2003年(6.82±0.93)与最低的2007年(5.15±1.33)拷贝数有差异(t=2.97,P=0.01),其它年间数量无差异.结论 淋球菌DNA在本地区男女两性间流行特点相同,近7年来感染率较为稳定,病原体载量也相对稳定.     

2011—2020年兰州市住院严重急性呼吸道感染病例常见呼吸道病毒监测结果分析

目的:了解兰州市住院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)病例常见呼吸道病毒病原谱及流行病学特征,为兰州市SARI病例的防控和治疗提供参考依据。方法:收集2011年1月至2020年12月兰州大学第一医院SARI病例的咽拭子、痰液及少量肺泡灌洗液样本2 57...     

深圳市流感样病例感染常见呼吸道病毒的流行特征分析

目的 了解深圳地区急性呼吸道感染患者中15种常见呼吸道病毒及其亚型的感染状况.方法 于2012年10月-2013年9月在深圳市两家流感监测哨点医院采集了1603例流感样病例的咽拭子样本,应用荧光定量PCR方法检测15种常见呼吸道病毒及其亚型,分析病例流行病学特征.结果 1603份标本中共检出呼吸道病毒阳性801份,阳性率为49.97％.鼻病毒的检出率最高,为15.53％(249/1603),其它检出率较高的病毒为甲型流感病毒(12.10％,194/1603)、呼吸道合胞病毒B型(6.8％,109/1603)、腺病毒(5.24％,84/1603)、副流感病毒3型(2.87％,46/1603)、间质肺病毒B型(2.37％,38/1603)、乙型流感(1.37％,22/1603)和冠状病毒OC43型(1.06％,17/1603).呼吸道病毒总阳性率3月份最高,11月份最低.各种病毒的流行季节不同,鼻病毒夏季高发,呼吸道合胞病毒在冬春季和夏季流行,腺病毒在冬季和夏季高发.0-4岁和5-14岁组儿童的呼吸道病毒阳性率(分别为60.4％和49.3％)高于其它年龄组.结论 深圳地区存在多种呼吸道病毒流行,鼻病毒、甲型流感病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒为主要病原体,其流行季节各不相同,低年龄组儿童为呼吸道病毒感染的高危人群.     

北京地区2010年10月至2011年4月急性呼吸道感染病毒流行特征分析

目的 通过对北京地区2010年10月-2011年4月急性呼吸道感染病毒病原谱构成及流行特征分析,为临床诊断、治疗和呼吸道传染病的预防控制提供病原学依据.方法 随机采集北京市五家哨点医院接诊的急性呼吸道感染病例咽拭子样本425份,利用多重RT-PCR和PCR方法进行甲型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、...     

多重实时PCR检测三种呼吸道病毒

目的建立多重实时PCR检测体系可同时快速检测引起人呼吸道感染的甲型流感病毒（IAV）、呼吸道合胞病毒（RSV）和SARS冠状病毒（SARS-CoV）。方法通过对PCR反应条件的优化，建立了同时检测IAV、RSV和SARS-CoV的多重实时PCR方法。结果经熔解曲线分析，证实了该法可同时或分别检测3种重要呼吸道病毒。检测灵敏度分别为10^0.7 TCID50／ml、1 TCID50／ml和10^-0.5 TCID50／ml。采用相同的反应体系和条件，分别对其他7种呼吸道病毒（包括乙型流感病毒，副流感病毒2型，柯萨奇病毒B3和B5血清型及腺病毒2、3和7血清型）进行扩增，均未检测出扩增产物。此种方法可在4h内完成。结论建立的多重实时PCR检测方法适用于3种重要呼吸道病毒的快速检测。     

儿童急性呼吸道感染常见病毒分布及其流行病学特征分析

目的分析儿童急性呼吸道感染常见病毒的分布及其流行病学特征。方法 7 248例急性呼吸道感染患儿统计其呼吸道病毒检出情况, 统计不同年龄段、性别、临床诊断及季节患儿呼吸道病毒检出情况。结果 7 248例急性呼吸道感染患儿中共检出呼吸道病毒感染2 015例, 检出率为27.80%, 其中单一呼吸道病毒感染1 977例, 检出率27.28%, 混合呼吸道病毒感染38例, 检出率0.52%。不同年龄段急性呼吸道感染患儿呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)、人类偏肺病毒(human metapneumovirus, hMPV)、副流感病毒(parainfluenza virus, PIV)、乙型流感病毒(influenza B virus, FluB)、腺病毒(adenovirus, ADV)、博卡病毒(human bocavirus, hBoV)、甲型流感病毒(influenza A virus, FluA)检出率差异具有统计学意义(P<0.05)。下呼吸道感染hBoV、FluA、ADV检出率高于上呼吸道感染(P<0.05)。RSV、P...     

多重PCR技术检测小儿咽拭子呼吸道病毒的临床分析

目的 研究多重荧光聚合酶链式反应（PCR）技术对小儿咽拭子呼吸道病毒、病原菌检测的应用价值。方法 筛选2018年1月~12月到乌鲁木齐市社区服务门诊就诊的社区获得性肺炎（CAP）患儿524例,采用多重PCR技术检测患儿咽拭子病原菌,分析CAP病原菌的分布情况及其与年龄、季节等的关系。结果 CAP病原检测结果大部分属于病毒性,以乙型流感病毒、肺炎衣原体、肺炎支原体等为主,细菌类以肺炎克雷伯菌等为主;与患儿年龄、季节有关,3岁以下患儿仍是CAP的主要发病年龄段,尤其是婴幼儿最多,发病多集中在秋季和冬季;2种以上病原混合感染形式严峻。结论 多重PCR技术对小儿咽拭子病原菌检测的应用效果良好,快捷方便。     

2021—2022年桂林地区急性呼吸道感染住院儿童病毒谱与流行特征

目的了解2021—2022年间桂林市急性呼吸道感染住院儿童病例中呼吸道病毒谱的构成, 探究不同呼吸道病毒的流行特征。方法收集2021年9月至2022年10月广西桂林市14岁以下急性呼吸道感染(acute respiratory infection, ARI)住院儿童作为研究对象, 共检测638例。采集的患儿咽拭子, 采用实时荧光逆转录-聚合酶链反应的方法进行核酸检测, 对包括不同亚型在内15种常见种或型呼吸道病毒进行筛查, 分析急性呼吸道感染住院患儿病例的病毒谱特征。结果 638例标本中, 检出包括不同亚型在内的病毒12种, 有365例至少1种或型病毒检测结果为阳性, 阳性率为57.21% (365/638), 感染两种及以上病毒检出率12.85%(82/638)。不同季节的病毒检出率的差异有统计学意义(P<0.002)。不同年龄组样本的病毒阳性检出率以0～2岁组最高(40.66%), 其次为3～5岁组(34.80%)和≥6岁组(24.54%)。结论 2021年9月至2022年10月期间, 12种呼吸道病毒在桂林地区存在流行, 具有明显的夏季高峰特点, 提示当地夏季时应重点针对可...     

2010-2012年南京市呼吸道冠状病毒流行病学特征分析

目的 分析2010年11月至2012年10月南京地区4个型别冠状病毒流行病学特征.方法 采集江苏省人民医院与南京医科大学第二附属医院流感样(influenza-like illness,ILI)病例咽拭子标本,并收集患者相关信息,利用RT-PCR方法进行检测,应用SPSS 17.0对数据进行统计分析.结果 1233例标本中,冠状病毒核酸阳性者共有115份(总阳性率9.33％),主要为229E型(36.52％,42/115)、OC43型(29.57％,34/115)与HKU1型(25.22％,29/115).2010-2012年不同年份间,冠状病毒229E型、HKU1型与NL63型阳性率有统计学差异(229E亚型:X2=18.072,P＜0.001;HKU1亚型:X2 =22.091,P＜0.001;NL63亚型:X2 =6.470,P=0.039).结论 南京地区冬季为冠状病毒流行高峰期,夏季为低谷期,春秋季小高峰趋势不明显.2010-2012年南京地区人呼吸道冠状病毒主要流行亚型为229E型、OC43型与HKU1型.不同年份冠状病毒主要流行亚型存在一定差异.     

陕西省发热呼吸道症候群病原谱和呼吸道合胞病毒基因特征

目的 分析陕西省发热呼吸道症候群患者咽拭子中16种呼吸道病毒病原谱构成和呼吸道合胞病毒基因特征.方法 2010年1月至2011年1月收集符合监测定义患者咽拭子标本208份,采用基于毛细管电泳的多重RT-PCR反应进行病毒核酸检测,包括人鼻病毒(HRV)、冠状病毒(HCOV)、流感病毒(Flu)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(ADV)、呼吸道合胞病毒(HRSV)、人偏肺病毒(HMPV)以及博卡病毒(HBOV),并对其中HRSV检测阳性的标本进行G基因羧基末端测序与种系进化分析,研究流行于陕西的HRSV分子流行病学特征.结果 总病毒检出率为53％(109/208),检测到的阳性病毒病原构成率分别为:HRSV42.2％、Flu24.5％、PIV20％,HRV13.6％,ADV10.9％,HCOV7.3％、HMPV4.6％和3份HBOV2.7％.有20％(22/109)病例为混合病毒感染,其中有14例为PIV与其他病毒混合感染,15 ～ 39岁年龄组混合感染率最高,差异有统计学意义(P＜0.05).总呼吸道病毒的感染率在各年龄组中差别不大,除Flu、HMPV和PIV外,其他病毒(HRV、HBoV、HCoV、ADV、HRSV)的感染人群主要以0～4岁小儿为主.46例多重RT-PCR HRSV阳性病例中,42例为HRSV A血清型的NA1基因型;2例为B血清型,其中1例为BA9基因型,1例为GB2基因型.结论 @@陕西发热呼吸道症候群由多种呼吸道病毒引起,存在2种或以上病毒的混合感染,其中以PIV与其他病毒混合感染为主.HRSV是2010年陕西省发热呼吸道症候群的主要病原,其中A血清型的NA1基因型是陕西2010年流行的绝对优势型别.     

2019年福州市急性呼吸道感染病例病毒病原谱调查

目的:了解福州市病毒性急性呼吸道感染(acute respiratory infection, ARI)病原谱及其流行特征。方法:收集2019年福州市三家不同类型医院的ARI病例信息并采集呼吸道标本,采用实时定量荧光PCR(polymerase chain reaction,PCR)对标本进行腺病毒(adenoviru...     

荧光定量PCR检测4种常见性传播疾病DNA

目的调查我市近5年来4种常见性传播疾病(STD)的感染情况及流行情况。方法用荧光定量PCR技术对15481例可疑性传播疾病患者,对四种最主要的性传播疾病病原体———淋球菌、沙[衣原体、解脲支原体和人乳头状病毒进行检测,并进行详细的统计分析。结果近5年来4种常见性传播疾病病原体:沙[衣原体、解脲支原体和人乳头状病毒阳性率持续上升,淋球菌略有下降。淋球菌、沙[衣原体、解脲支原体和人乳头状病毒阳性率分别为15.90%、22.0%、36.57%、36.06%。结论性传播疾病已构成流行,其原因可能与混合感染和治疗不彻底有关,应引起全社会的高度重视。     

2007—2011年长沙地区急性下呼吸道感染住院儿童人偏肺病毒的流行状况

目的了解人偏肺病毒（hMPV）在长沙地区急性下呼吸道感染住院患儿中的流行病学特点。方法收集2007年9月至2011年2月因急性下呼吸道感染在湖南省人民医院儿科医学中心住院儿童的鼻咽抽吸物（nasopharyngealaspirates,NPA）样本2613份,采用逆转录聚合酶链反应法（RT—PCR）检测hMPVM基因,将阳性PCR扩增产物测序并与GenBank中已知的hMPV参考株进行比对、分析。结果2613份标本中hMPV阳性检出数135例,检出率为5．2％,男女之间的检出率比较有统计学差异（x2=8．007,P=0．003）,hMPV阳性检出患儿的年龄以1岁以内多见（63．2％）。hMPV阳性检出率在春季呈现高峰,从检出季节分布显示A2b型主要在冬春季节流行,而B2型主要在春夏季流行。135例hMPV长沙株分为A型和B型两个主要的基因型,其中A2b亚型在2007--2008年为优势流行型别,2009--2010年A2b和B2型共同流行,B2亚型在2011年呈优势流行型别。135例hMPV检出阳性患儿中有66例（48．9％）存在混合病毒感染,其中与HBoV混合检出率最高。结论长沙地区部分儿童的急性下呼吸道感染与hMPV有关,且阳性检出患儿年龄主要集中在1岁以下,男多于女,主要流行季节在春季,A2b型和B2型优势基因型在长沙地区共同流行,与其他病毒混合检出率较高。