肺结核抗结核药物致肝损伤患者HMGB1基因多态性

目的探讨肺结核抗结核药物致肝损伤患者HMGB1基因多态性。方法选择2016年8月-2019年8月中南大学湘雅医院附属海口医院滨江分院收治的肺结核患者200例,发展成ATDH的患者纳入ATDH组(n=79),未发展成ATDH的患者纳入非ATDH组(n=121),检测HMGB1基因单核苷酸多态性(SNPs)位点多态性,采用Logistic回归分析HMGB1多态性位点与ATDH的关系。结果ATDH组HMGB1基因rs1045411位点GG、GA、AA基因型分布频率和G、A等位基因频率与非ATDH组比较,差异有统计学意义(P<0.05),rs1412125、rs1360485以及rs2249825位点基因型分布和等位基因频率与非ATDH组比较,均无统计学差异;在共显性、显性、隐性模式下,ATDH组HMGB1基因rs1045411位点基因型分布与非ATDH组比较,差异有统计学意义(P<0.05),与GG基因型比较,GA和AA基因型与肺结核易感性有关,在超显性模式下,ATDH组HMGB1基因rs1045411位点基因型分布与非ATDH组比较,无统计学差异,而在超显性、共显性、显性以及隐性模式下,rs1412125、rs1360485以及rs2249825位点基因型分布与非ATDH组比较,均无统计学差异;rs1045411位点基因多态性与ATDH的发生存在相关性,且突变型诱发ATDH可能性更大,而rs1412125、rs1360485、rs2249825位点基因多态性与ATDH发生风险无关。结论HMGB1基因为ATDH的易感基因,其rs1045411位点多态性与ATDH的发生密切相关,其中突变型发生ATDH风险升高。     

NRAMP1基因D543N和3''''UTR位点多态性与肺结核易感性的研究

目的探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因D543N和3'UTR位点多态性与我国北方汉族成人肺结核发病的关系.方法采用11配对的病例对照研究设计,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)的方法检测NRAMP1基因中D543N和3'UTR两个多态性位点,对与肺结核相关的环境因素进行问卷调查的同时对肺结核病变的性质和程度进行了研究,应用SPSS软件进行单因素和多因素条件Logistic回归分析.结果对124对研究对象进行了D543N和3'UTR两个多态性位点的基因分型,D543N G/A、3'UTR TGTG+/del基因型病例组频率显著高于对照组,粗OR值(95%CI)分别为2.625(1.123～6.134)、2.733(1.513～4.938).对17个环境危险因素进行了单因素分析,多因素分析中在调整卡痕、婚姻状况、体质指数、接触史4个因素后,D543N G/A、3'UTR TGTG+/del基因型仍与肺结核显著相关,调整OR值(95%CI)分别为3.151(1.225～8.105)和3.306(1.517～7.201).研究未发现,在不同基因型中,病例和对照组肺结核病变性质差异具有显著性.结论 NRAMP1基因D543N、3'UTR位点多态性可能是我国北方汉族成人肺结核的易感因素.     

NRAMP1基因多态性与结核易感性关系的Meta分析

[目的]应用Meta分析探讨NRAMP1基因3'UTR,D543N和INT4多态性位点与结核易感性的关系。[方法]在CNKI、CBM、万方数据资源系统、Medline和Pubmed中,应用关键词"结核"、"基因多态性"(或"遗传多态性")、"等位基因"、"NRAMP1"、"tuberculosis"或"alleles"搜索1980年1月～2007年11月发表的相关中英文文献,最终入选有关文献16篇。应用RevMan4.2软件包分别对16项研究结果进行数据分析。[结果]Meta分析计算得出合并OR值(95%CI)TGTG+-/++为1.50(1.29～1.75),TGTG——/++为0.89(0.59～1.34),GA/GG为1.39(1.20～1.61),AA/GG为1.07(0.69～1.67),GC/GG为1.30(1.09～1.56),CC/GG为1.64(0.90～3.00)。计算3'UTR、D543N和INT4基因的失安全系数为193.87、325.08和157.87,说明分析结果是可靠的。[结论]NRAMP1基因3'UTR(TGTG+-)和D543N(GA)多态性位点均可能是结核的易感因素,尚不能认为INT4多态性位点与结核易感性有关。     

NRAMP1基因INT4和3’UTR位点多态性与肺结核易感性的研究

目的 探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白1（NRAMP1）基因INT4和3＇UTR位点多态性与中国北方汉族成人肺结核发病的关系.方法 采用1：1配对的病例对照研究设计,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法检测NRAMP1基因中INT4和3＇UTR两个多态性位点,对与肺结核相关的危险因素进行问卷调查,进行单因素和多因素条件logistic回归分析,同时对基因型与肺结核病变的性质和程度进行研究.结果 对124对研究对象进行了INT4和3＇UTR两个多态性位点的基因分型,3＇UTR TGTG＋/del基因型病例组频率显著高于对照组,粗OR值（95%CI）为2.923（1.557～5.487）.病例组和对照组INT4各基因型频率比较差异均无统计学意义.对17个环境危险因素进行了单因素分析,在多因素分析中调整卡痕、体重指数、人均居住面积、家族史4个因素后,3＇UTR TGTG＋/del基因型仍与肺结核显著相关,调整OR值（95%CI）为2.955（1.369～6.381）.在INT4不同基因型中,病例组和对照组肺结核病变性质差异具有统计学意义（x2=9.634,P＜0.05）.结论 NRAMP1基因3＇UTR位点多态性可能是中国北方汉族成人肺结核的易感因素,而INT4多态性可能与肺结核的病变性质有关系.     

XPD 751、156位点多态性与辐射致染色体损伤易感性关系研究

目的探讨XPD基因751位点、156位点多态性与电离辐射损伤效应之间的相关性,为筛检电离辐射易感人群提供生物学指标。方法选择有染色体异常的放射人员为病例组,以无辐射损伤为对照组,进行1∶1配对。染色体分析采用微量全血培养法,XPD基因751、156位点基因型检测采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析。结果XPD751位点野生型AA与突变基因型(AC和CC)在病例组与对照组之间差异有显著性,病例组野生基因型频率高于对照组(OR=1.90,95%CI=1.10~3.28,P<0.05)。XPD156位点野生型CC与突变型基因(CA和AA)在病例组与对照组之间差异有显著性,病例组突变基因型频率高于对照组(OR=0.63,95%CI=0.41~0.97,P<0.05)。同时携带751(AA)和156(CA或AA)基因型在两组间分布差异有显著性(OR=2.27,95%CI=1.22~4.23,P<0.05),病例组分布频率高于对照组。结论XPD751位点野生基因型AA是辐射致染色体损伤的危险因素。XPD156位点突变基因型(GA和AA)是辐射致染色体损伤的危险因素。同时携带XPD751AA和156(GA或AA)基因型者对辐射致染色体损伤更易感。     

肺结核易感性与CD209基因多态性病例对照研究

目的 探讨中国汉族人群肺结核发病与CD209基因-336位点多态性的关系,并分析其在肺结核发病中与环境因素的交互作用.方法 采用1:1配对病列对照设计,用序列特异性引物-聚合酶链反应(SSP-PCR)技术检测167对病例和对照的CD209基因-336位点的基因型分布;对肺结核相关环境因素进行问卷调查,并进行单因素和多因素条件Logistic回归分析.结果 AA、GA和GG基因型在病例组和对照组的分布频率分别为21.0%,42.5%,36.5%和35.3%,45.4%,19.1%.单因素条件Logistic回归分析显示,GG基因型在病例组中频率显著高于对照组(OR=1.768,OR 95% CI=1.167～2.679,P=0.007).调整环境因素后,多因素条件Logistic回归分析显示,GG基因型与肺结核发病仍有关联(OR=1.918,OR 95% CI=1.234～2.979,P=0.004);GG和GA基因型与卡介苗接种史(P=0.000)以及与吸烟史(P=0.000)对肺结核发病均有正相乘模型交互作用.结论 CD209基因-336位点GG基因型可能是中国汉族人的肺结核易感基因型,GG和GA基因型可能与环境因素存在交互作用.     

NRAMP1和SP110基因多态性与蒙古族结核病易患的关系

目的 探讨NRAMP1基因rs17235409A/G、NRAMP1基因rs17235416TGTG/(-)和Sp110基因rs3948464C/T位点（以下简称NRAMP1rs17235409、NRAMP1rs17235416、SP110rs3948464）基因多态性与蒙古族结核病易患的关系。方法 采用病例-对照研究,收集蒙古族132例结核病患者和108例健康体检者静脉血,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法检测3个位点基因分型,运用卡方检验、广义多因子降维法(Generalized Multifactor Dimensionality Reduction,GMDR)分析NRAMP1和Sp110基因多态性及交互作用与结核病易患的关系。 结果 (1)病例组和对照组NRAMP1rs17235409位点GG型,GA型,AA型和NRAMP1rs17235416位点TGTG/TGTG型,TGTG/(-)型,(-)/(-)型基因频率分别为66.67%,30.30%,3.03% vs 86.11%,12.96%,0.93%和60.61%,33.33%,6.06% vs 80.55%,18.52%,0.93%,2个位点基因型与等位基因型在两组的构成均存在差异(〖XC五号.EPS;P〗=12.178,〖XC五号.EPS;P〗=12.462;〖XC五号.EPS;P〗=11.935,〖XC五号.EPS;P〗=13.193,均P＜0.05)。(2)Sp110rs3948464位点CC型和CT型在病例组和对照组的基因频率分别为90.15%,9.85% 和71.30%,28.70%,2组间基因型与等位基因型构成存在差异 (〖XC五号.EPS;P〗=14.105;〖XC五号.EPS;P〗=12.681,均P＜0.05)。(3)GMDR法分析结果显示,NRAMP1rs3948464和NRAMP1rs17235409位点之间存在交互作用(P＜0.05)。结论 NRAMP1rs17235409,NRAMP1rs17235416和Sp110rs3948464位点基因多态性与蒙古族结核病易患有关,NRAMP1rs17235409,NRAMP1rs17235416两位点基因多态性存在交互作用。     

干扰素调节因子3基因多态性检查在慢性淋巴细胞白血病患者中的预后价值

目的研究干扰素调节因子3(IRF3)基因多态性在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者中的表达,探讨其基因型在CLL预后中的意义。方法采用变性高效液相色谱法(DHPLC)对患者样本进行基因分型,对IRF3基因的3个位点rs7251、rs1140375和rs2304206进行单体基因型分析,同期检测常规预后相关指标。结果 CLL患者经过治疗后,rs7251各基因型中无事件生存率(EFS)分别为:32.0%(杂合型CG和突变型GG)和72.7%(野生型CC),CC基因型患者EFS明显高于携带CG+GG基因型患者。rs2304206各基因型中EFS分别为28.2%(杂合型CT和突变型TT)和62.5%(野生型CC),CC基因型患者EFS高于携带CT+TT基因型患者;rs7251位点的杂合型CG和突变型GG基因型、rs2304206位点的杂合型CT和突变型TT基因型的ZAP-70、CD38表达率明显高于表达rs7251位点的野生型CC和表达rs2304206位点的野生型CC基因型,上述差异均有统计学意义(P0.05)。结论 IRF-3基因多态性与汉族人群CLL预后相关,IRF-3基因多态性可能与ZAP-70、CD38两项临床预后指标具有相关性,IRF-3基因多态性检测可作为一个新的相对独立的CLL患者生存预后指标。     

X线交叉互补基因1多态性与铅中毒易感性

目的探讨X线交叉互补基因1（XRCC1）A194W和A399Q多态性与铅中毒易感性关系，寻找铅中毒易感性生物学标志。方法采用病例一对照研究，收集122例确诊铅中毒病人作为病例组，142例健康人群作为对照组。应用PCR-限制性片段长度多态性（PCRRFLP）技术检测2组人群基因型，分析不同基因型对铅中毒易感性的影响。结果XRCC1 A194W和A399Q的野生型、杂合突变型和纯合突变型在病例组和对照组分布频率差异均有统计学意义（P均〈0．05）；XRCC1 A194W的杂合突变型（CT）、纯合突变型（TT）和突变型（CT＋TT）分别增加铅中毒易感性达2．03，2．59和2．12倍。XRCC1 A399Q的杂合突变型（GA）和突变型（GA＋AA）分别减少铅中毒易感性达0．37和0．52倍；纯合突变型（AA）与铅中毒的易感性无关。结论XRCC1 A194W和A399Q基因多态性与铅中毒易感性有关，可考虑作为铅中毒的重要易感性生物学标志。     

2型糖尿病家系人群两种基因多态性分布

目的检测中国常州汉族2型糖尿病家系人群中PEA 15基因与KCNJ 10基因中2个单核苷酸位点多态性分布情况,探讨该遗传标记与2型糖尿病的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对该地区55个2型糖尿病高发家系265名成员的PEA 15基因（rs8175359）及KCNJ 10基因（rs2486253）2个单核苷酸多态性位点（SNPs）进行分析。结果在2型糖尿家系人群中,rs8175359位点基因型频率为：病例组中GG、GA分别为98.6%,1.4%;在未患病亲属组中为GG 99.2%,GA 0.8%,未发现AA纯合子。rs2486253位点基因型频率为：病例组中GG、GT分别为92.9%,7.1%;在未患病亲属组中为GG 91.1%,GT 8.9%。2组间基因型频率、等位基因频率的差异均无统计学意义。按性别等因素分层分析显示,rs2486253位点基因型频率构成比差异均无统计学意义。结论该两位点是否可作为2型糖尿的相关遗传标记需进一步在大样本人群研究中重复验证。     

自然抗性相关巨噬细胞蛋白1基因多态性与肺结核易感性的研究

目的　探讨自然抗性相关巨噬细胞蛋白 1基因 (NRAMP1)多态性与中国汉族人群肺结核发病的关系。方法　采用以医院为基础的病例对照研究设计 ,用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)法检测NRAMP1基因中INT4、D5 4 3N及 3′UTR 3个多态性位点的基因型 ,并对结核病相关危险因素进行问卷调查 ,应用SPSS软件进行单因素和多因素非条件logistic回归分析。2 0 0 1年 4月至 2 0 0 2年 6月选择 110例肺结核病例 ,平均年龄为 (2 8± 13)岁 ;对照组为 180名健康体检者 ,平均年龄为 (2 7± 9)岁。对NRAMP1基因各多态性位点进行单因素分析。结果　病例组D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型频率显著高于对照组 ,OR值 (95 %CI)分别为 2 2 2 (1 0 3～ 4 78)和 1 93(1 14～ 3 2 6 )。病例组和对照INT4各基因型频率比较差异无显著性。多因素分析调整暴露史和疫苗接种史 2个因素后 ,D5 4 3NG/A及 3′UTRTGTG +/del基因型仍与结核病显著相关 ,调整OR值 (95 %CI)分别为 3 0 4 (1 12～ 8 2 7)和 2 36 (1 2 0～ 4 6 4 ) ,而病例和对照组INT4位点多态性比较差异未见显著性。结论　NRAMP1基因D5 4 3N及 3′UTR位点多态性可能是汉族人群肺结核的易感因素。     

miR-499 rs3746444多态性抑制宫颈癌细胞的增殖作用及分子机制

目的 探讨miR-499 rs3746444多态性与宫颈癌临床特征相关性及对宫颈癌细胞增殖的影响作用与机制.方法 应用病例对照研究方法,选取2012年6月至2018年12月于内蒙古自治区人民医院就诊的宫颈癌病人857例作为实验组,同期873例健康志愿者作为对照组,两组年龄均在23～62岁,采用TaqMan探针法对rs3...     

Regulome - SNP: shc1 rs11264233与延边地区原发性肝癌风险性的研究

目的 探讨shc1 rs11264233与延边地区肝癌风险性的关系。方法 选取延边地区599名肝癌患者和599名健康对照组人群为研究对象。采用PCR - RFLP方法检测基因型及等位基因分布频率。二元logistic 回归模型分析shc1 rs11264233位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 shc1 rs11264233位点存在G和A两种等位基因,GG、GA和AA基因型。shc1 rs11264233位点基因型符合哈迪-温伯格遗传平衡规律。共显性模型中与携带GG基因型的个体相比携带AA基因型的个体更容易患PHC（调整OR = 1.512,95% CI:1.087～2.102,P = 0.014）,隐性模型中AA基因型PHC组风险度显著高于GG和GA组合型中（调整 OR = 1.461,95% CI:1.101～1.940,P = 0.009)。结论 shc1 rs11264233位点单核苷酸多态性与延边地区肝癌风险有明显相关性。     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

Systematic review and meta-analysis of the association between complement component 3 and age-related macular degeneration: a HuGE review and meta-analysis

The authors performed a meta-analysis to estimate the magnitude of polymorphism effects for the complement component C3 gene (C3) and their possible mode of action on age-related macular degeneration (AMD). The meta-analysis included 16 and 7 studies for rs2230199 and rs1047286, respectively. Data extraction and risk of bias assessments were performed in duplicate, and heterogeneity and publication bias were explored. There was moderate evidence for association between both polymorphisms and AMD in Caucasians. For rs2230199, patients with CG and GG genotypes were 1.44 (95% confidence interval (CI): 1.33, 1.56) and 1.88 (95% CI: 1.59, 2.23) times more likely to have AMD than patients with the CC genotype. For rs1047286, GA and AA genotypes had 1.27 (95% CI: 1.15, 1.41) and 1.70 (95% CI: 1.27, 2.11) times higher risk of AMD than did GG genotypes. These gene effects suggested an additive model. The population attributable risks for the GG/GC and AA/GA genotypes are approximately 5%-10%. Subgroup analysis by ethnicity indicates that these variants are very infrequent in Asians and that the observed gene effects are based largely on the high frequency within Caucasian populations. This meta-analysis supports the association between C3 and AMD and provides a robust estimate of the genetic risk.     

XRCC1基因单核苷酸多态性与铅毒性遗传易感性的关系

目的研究DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与铅毒性易感性的关系。方法采集326名某蓄电池企业铅作业工人外周静脉血样品,检测血铅和血锌原卟啉(ZPP),采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)检测XRCC1基因型,分析不同基因型铅作业工人与铅毒性易感性的关系。结果 326名铅作业工人XRCC1基因分布呈现多态现象,各基因型的分布频率符合遗传学的Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);不同基因型组(XRCC1-194CC/CT+TT、XRCC1-280 GG/GA+AA、XRCC1-399GG/GA+AA)工人ZPP差异无统计学意义(P>0.05);XRCC1-194CT+TT基因型组工人平均血铅值高于XRCC1-241CC基因型组(P<0.05),而XRCC1-280GG/GA+AA、XRCC1-399GG/GA+AA基因型组工人平均血铅值差异无统计学意义(P>0.05);以血铅水平1.90μmol/L为界,经χ2检验、logistic回归分析显示,高铅组XRCC1-194CT+TT基因型的比例大于低铅组(P<0.05),XRCC1-194CT+TT基因型组工人较XRCC1-194CC基因型组工人高血铅发生率的风险明显增高(OR=2.78,95%CI=1.49～5.28)。结论XRCC1 Arg194Trp基因单核苷酸多态性与血铅升高有一定关联性,C→T多态性提高了接铅工人对铅毒性易感的风险性,XRCC1-194CT/TT基因型可能是铅毒性易感基因型;XRCC1 Arg280His和XRCC1 Arg399Gln多态性可能与铅毒性易感性无关。