靶向表皮生长因子受体shRNA质粒表达载体的构建和鉴定

目的构建靶向表皮生长因子受体（EGFR）的短发卡状RNA（shRNA）质粒表达载体并进行鉴定。方法设计两个小分子干扰RNA（siRNA）序列，体外合成DNA模板引物，与Pgenesil-1质粒构建成编码shRNA的表达载体，进行酶切鉴定和测序，再转染人大肠癌LoVo细胞，进行荧光摄像和G418抗性筛选。结果构建的质粒表达载体完全符合设计要求，转染成功的细胞在荧光显微镜下显示为绿色，G418可以筛选出阳性克隆。结论成功构建了编码EGFR—shRNA的质粒表达载体，并可以进行稳定筛选。     

pGenesil-2.1- iASPP-shRNA质粒的构建及转染

目的构建针对iASPP基因的短发卡RNA干扰（iASPP-shRNA）质粒,并转染胃癌细胞AGS（p53野生型）。方法以iASPP为靶基因设计两条带有短发卡结构的寡核苷酸序列,连接到pGenesil-2．1载体,转化感受态大肠杆菌DH5a,提取质粒转染胃癌细胞并培养形成稳定的细胞系,PCR检测转染AGS细胞中的iASPP基因。结果构建的pGenesil-2．1-iASPP—shRNA质粒测序证实iASPP基因序列完全正确,该质粒转染AGS细胞后,其iASPP基因表达受抑制。结论成功构建了pGenesil-2．1-iASPP—shRNA质粒,并可成功转染AGS细胞而抑制其iASPP基因的表达。     

CXCR4基因shRNA表达质粒的构建及筛选鉴定

目的 构建编码CXCR4mRNA的短发卡样RNA(shRNA)表达质粒用以筛选出基因沉默效果最明显的shRNA质粒表达载体.方法 根据GenBank中登录的CXCR4基因的核苷酸序列,应用shRNA设计软件设计并合成4条短发卡shRNA的oligo DNA,构建shRNA重组质粒.采用酶切电泳和测序方法进行鉴定.将鉴定后的CXCR4基因shRNA重组质粒经脂质体介导转染胶质瘤U251细胞,24 h后经RT-PCR筛选有效的shRNA重组质粒.结果 构建的质粒表达载体PCR鉴定均可扩增出目的条带,DNA测序结果与理论序列完全一致.RT-PCR检测显示,转染pG-PU6/GFP/Rac 1-421的U251细胞CXCR4基因mRNA的转录水平下降.结论 成功构建CXCR4基因shRNA表达质粒,并筛选出效果最为明显的shRNA质粒表达载体为pGPU6/GFP/Rac1-421.     

肝纤维化相关细胞因子双重RNA干扰质粒的构建及转染肝星状细胞研究

目的构建以大鼠CTGF和TIMP-1基因为靶点的双重RNA干扰表达载体质粒,以检测其转染肝星状细胞的效率.方法筛选出对CTGF和TIMP-1基因最有效的RNA干扰靶位,各设计1对含有短发夹结构的RNA 干扰靶点序列,分别克隆到质粒载体psiRNA-DUO-GFPzeo,构建含目的靶基因片段的重组质粒载体psiRNA-GFP-CT-GF、psiRNA-GFP-TIMP-1和psiRNA-GFP-Com（含有CTGF和TIMP-1）,进行酶切和测序鉴定.将构建成功的重组质粒psiRNA-GFP-CTGF、psiRNA-GFP-TIMP-1和psiRNA-GFP-Com转染大鼠肝星状细胞,在荧光显微镜下观察质粒转染情况,用流式细胞仪检测转染效率.结果酶切与测序结果提示重组质粒 psiRNA-GFP-CTGF、psiR-NA-GFP-TIMP-1和psiRNA-GFP-Com成功构建;成功将重组质粒psiRNA-GFP-CTGF、psiRNA-GFP-TIMP-1和psiRNA-GFP-Com转染肝星状细胞,在24小时,空质粒组、CTGF组、TIMP-1组和CTGF ＋TIMP-1组转染效率分别为15±2%、13±1%、15±1%和14±2%,均低于质粒psiRNA-GFP-Com转染组（Com组,20±2%,P〈0.05）;在48小时,空质粒组、CTGF组、TIMP-1组和CTGF＋TIMP-1组转染效率分别为10±2%、9±1%、8±2%和10±1%,均低于Com组的15±2%（P〈0.05）.结论成功构建靶向大鼠CTGF和TIMP-1最有效的RNA干扰靶位的双重RNA干扰表达质粒,能转染至肝星状细胞,并且psiRNA-GFP-Com转染效率最高.     

靶向RhoA基因的shRNA质粒表达载体的构建与鉴定

目的 利用pSilencer3.1H1 Hygro载体构建靶向大鼠RhoA基因的shRNA干扰分子表达载体.方法 选择RhoA基因上两段序列体外合成RNA干扰分子的正义链和反义链模板序列,经退火成互补双链,与线性化的pSilenter3.0.H1连接、转化大肠杆菌和序列测定,并在大鼠脊髓少突胶质细胞体外培养模型上验证构建的干扰载体的抑制靶基因表达的效果.结果 正确构建了针对BhoA基因RNA干扰分子的表达载体,构建的表达RNA干扰分子的表达载体能有效抑制体外培养的少突胶质细胞砌RhoA蛋白的表达.结论 成功构建了针对RhoA基因的shRNA表达质粒,为进一步研究脊髓损伤奠定基础.     

RNA干扰体外抑制人食管鳞癌细胞Eca-109缺氧诱导因子-1α的表达

目的:观察缺氧诱导因子-1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)短发夹状RNA(short hairpin RNA,shRNA)对人食管鳞癌细胞系Eca-109中 HIF-1α基因的沉默效应,筛选有效干扰靶点．方法:设计合成干扰缺氧诱导因子-1α RNA 寡核苷酸片段,经退火、连接等步骤克隆至线性化的PGCsi真核表达载体上,测序鉴定．应用LipofectamineTM2000将该质粒分别转染Eca-109细胞和293T细胞,其中Eca-109抗性细胞又经2-4 wk的G418筛选．荧光显微镜评估转染效率,荧光定量RT-PCR检测HIF-1α mRNA表达情况,western blot检测HIF-1α蛋白表达情况．结果:成功构建了3个靶点的重组质粒pGCsi- H1-shHIF,293T细胞平均转染效率为约85．4％, Eca-109细胞的平均转染效率约73．2％．荧光定量RT-PCR和Western blot显示瞬时转染这3种重组质粒的293T细胞和筛选2 wk的Eca-109 细胞HIF-1 α mRNA和蛋白表达均较对照组有不同程度的下降,其中2号和3号靶点的干扰效应尤为明显．在瞬时转染72 h后的293T 细胞中,其抑制率分别达到了78．5％、86．9％ (P=0．000,P=0．000 vs 72 h空白对照组),筛选2 wk的Eca-109细胞中,3号靶点对HIF-1α mRNA的抑制率也达到了69．7％(P=0．000 vs 2 wk空白对照组)．结论:重组质粒pGCsi-shHIF能有效抑制食管鳞癌细胞Eca-109中HIF-1α基因的表达,经不同细胞中的瞬时和稳定转染筛选出了有效干扰靶位．     

FasL基因siRNA真核表达载体的构建及意义

目的构建针对细胞凋亡基因FasL的小干扰RNA（siRNA）表达载体,探讨载体介导的RNA干扰技术用于肺间质纤维化基因治疗的可行性。方法依据siRNA靶序列的设计原则,以FasL mRNA为靶基因,合成两对编码短发卡结构的两条DNA序列,经退火合成DNA双链,再克隆至siRNA表达载体pSilencer2．0中,转化后进行PCR鉴定和DNA序列测定。将构建的载体用脂质体介导转染入人肺腺癌A549细胞株,采用实时荧光定量PCR法检测细胞FasL mRNA水平变化。结果成功构建发卡样FasL siRNA真核表达载体;其转染人肺腺癌A549细胞后,细胞FasL mRNA的表达水平显著下降。结论FasL siRNA真核表达载体能显著抑制人肺腺癌A549细胞FasL mRNA的表达;本研究为肺间质纤维化的基因治疗奠定了基础。     

小鼠TRAF6基因shRNA真核表达载体的构建与表达

目的:构建并筛选肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)短发夹RNA(shRNA)表达质粒.方法:针对小鼠TRAF6 mRNA设计4条理论上最佳的siRNA序列,经退火成互补双链,将相应双链DNA插入pGCsi-U6/GFP/Hygro质粒中,构建重组表达质粒pGCsi-TRAF6 -shRNA1,2,3,4,并以不同比例DNA质粒/脂质体转染重组质粒(1∶2、2∶5、1∶3和1∶4)至RAW 264.7细胞中,观察转染效果.结果:靶向TRAF6 mRNA的4个shRNA重组质粒载体pGCsi-TRAF6 shRNA1,2,3,4,经测序分析,shRNA编码序列与设计的片段完全一致,证实载体构建成功.应用荧光显微镜分析转染效率显示,DNA(g)/脂质体转染重组质粒(L)按1∶2、2∶5、1∶3和1∶4比例转染细胞的效率分别为13.7%±1.2%、24.5%±2.1%、19.3%±1.7%、16.3%±2.8%,以2∶5为最佳比例.只加了脂质体未加质粒(试剂对照)的细胞无荧光表达.结论:TRAF6靶向RNA干扰重组表达质粒构建成功,为进一步研究阻断TRAF6表达对急性肝衰竭过度炎症反应的基因治疗奠定基础.     

RhoC—miRNA真核表达载体的构建及其在卵巢癌细胞系中稳定表达

目的 体外合成RNA干涉小分子构建pcDNATM6.2-GW/EmGFP-RhoC-miRNA真核表达载体,分析其在人卵巢癌细胞SKOV3中稳定表达情况.方法 设计并合成单链oligo,经退火形成双链的DNA oligo,将其与线性的pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR质粒连接,构建重组质粒pcDNATM6.2-GW/EmGFP-RhoC-miRNA真核表达载体,经扩增、筛选、鉴定及测序后,用脂质体法将重组质粒转染SKOV3细胞,筛选稳定转染细胞系、观察转染细胞的形态并进一步通过Western印迹法检测细胞内RhoC蛋白表达.结果 重组质粒进行PCR鉴定及DNA序列测定证实DNA oligo已被成功连接到载体中并且序列完全正确;经重组质粒转染的SKOV3细胞24 h后的荧光显微镜下观察到少量细胞带有绿色荧光信号,RhoC-miRNA稳定转染的SKOV3细胞形态变圆,折光性增强,收缩不铺展.Western印迹结果显示,与SKOV3细胞株及pcDNATM6.2-GW/EmGFP-miR-neg细胞相比,pcDNATM6.2-GW/EmGFP-RhoC-miRNA细胞中RhoC蛋白表达水平明显降低,表明所设计的RhoC-miRNA能有效抑制SKOV3细胞中内RhoC蛋白表达.结论 该实验成功构建了RhoC-miRNA真核表达载体pcDNATM6.2-GW/EmGFP-RhoC-miRNA,利用脂质体法将其转染卵巢癌细胞后,能有效地抑制细胞内RhoC蛋白表达,为进一步研究RhoC的功能及探讨以RhoC为靶点的基因治疗提供了研究平台.     

小鼠纤维介素基因shRNA表达质粒的构建及体外RNA干扰

目的探讨纤维介素蛋白（fg12）的双链RNA（dsRNA）在体外对fg12凝血酶原酶基因表达的干扰作用及其规律。方法构建能产生鼠fg12（mfg12）的发夹状双链RNA（shRNA）的载体p-mfg12shRNA。将其与mfg12-EGFP融合基因表达质粒pEGFP—mfg12共转染（用量比为1：5）到中国仓鼠卵巢细胞（CHO细胞）作为实验组。另仅转染pEGFP—mfg12或共转染无关序列shRNA表达质粒和pEGFP—mfg12（用量比为1：5）作为对照组。转染24，48、72h后。观察mfg12-EGFP融合蛋白在CHO细胞中的表达情况，并通过流式细胞仪检测荧光细胞阳性率。分别将p—mfg12shRNA和mfg12cDNA表达质粒pcDNA3．1-mfg12共转染（用量比为1：5）到CHO细胞和人宫颈癌细胞（Hela细胞），作为试验组，另转染pcDNA3．1-mfg12或共转染无关序列shRNA表达质粒和pcDNA3．1-mfg12（用量比为1：5）或不转染任何质粒作为对照组。通过逆转录聚合酶链反应和免疫组织化学检测mfg12在CHO和Hela这两种细胞株中表达的情况。结果实验组较对照组的绿色荧光强度明显减弱。荧光细胞数明显减少。在CHO和Hela两种细胞株。均显示mfg12shRNA显著抑制mfg12mRNA和蛋白质的表达。结论本研究所构建的mfg12shRNA表达质粒p-mfg12shRNA可在体外高效特异地抑制mfg12的表达，为进一步的体内实验奠定了基础。     

survivin基因shRNA真核表达载体的构建及其对人胃癌细胞株中survivin表达的影响

背景:胃癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,survivin是凋亡抑制蛋白家族的新成员,在胃癌组织中高表达。目的:构建survivin基因短发夹RNA(shRNA)真核表达载体并观察其对人胃癌细胞株BGC823和SGC7901中survivin表达的影响。方法:根据GenBank中survivin基因序列设计并合成能转录shRNA的双链DNA序列,插入含有绿色荧光蛋白(GFP)基因和U6启动子的真核表达载体pRNAT-U6.3中,构建重组载体pRNA-shSUR。重组载体经鉴定后转染胃癌细胞株BGC823和SGC7901,以转染pRNA-shControl作为阴性对照。荧光显微镜下观察转染情况,蛋白质印迹法检测survivin蛋白表达,Annexin V-FITC/PI双染法检测胃癌细胞凋亡情况。结果:成功构建了针对survivin基因的shRNA表达载体。转染胃癌BGC823和SGC7901细胞48 h后,与阴性对照组相比,pRNA-shSUR组GFP表达增强,survivin蛋白表达受到明显抑制(P<0.05),胃癌细胞早期凋亡率明显增加。结论:成功构建靶向survivin基因的特异性shRNA真核表达载体,转染胃癌细胞后可抑制survivin蛋白表达并促进细胞凋亡,为进一步研究survivin基因与胃癌生物学行为以及化疗耐药等的相关性奠定了基础。     

pGPH1-GFP—RKIP的构建及其对白血病细胞株CCRF-CEM化疗敏感性的影响

目的构建Raf激酶抑制蛋白（RKIP）小干扰RNA（siRNA）重组质粒pGPHl-绿色荧光蛋白（GFP）-RKIP,观察其对白血病细胞株CCRF-CEM化疗敏感性的影响。方法构建RKIP的siRNA重组质粒pGPHl-GFP-RKIP,电穿孔转染至儿童白血病细胞CCRF—CEM,以Westernblot法检测细胞RKIP、磷酸化细胞外调节蛋白激酶（P．ERK）、磷酸化核因子KB抑制蛋白（p-IKB）;以不同浓度9-硝基喜树碱（9NC）处理上述细胞,Westernblotting法检测细胞RKIP,流式细胞仪法检测细胞caspase-3活性（计算细胞凋亡率）,同上检测RKIP表达。结果成功构建pG．PHl-GFP-RKIP;pGPHl-GFP-RKIP和pGPHl-GFP的转染效率分别为90．04％、91．32％;与pGPHI．GFP转染的细胞比较,pGPHl-GFP-RKIP转染的细胞RKIP表达下调,p-ERK、P—IKB表达上调（P均〈0．05）;9NC处理后CCRF-CEM细胞RKIP表达上调、细胞凋亡率下降（P均〈0．05）。结论成功构建了RKIP的siRNA质组质粒,RKIP表达变化可能与白血病细胞化疗敏感性有关。     

RNAi对结肠癌HCT-8细胞桩蛋白表达的沉默作用观察

目的观察RNA干扰（RNAi）对结肠癌HCT-8细胞桩蛋白（Paxillin）表达的沉默作用。方法构建针对Paxillin基因序列的短发卡RNA（shRNA）表达载体,并转染至结肠癌HCT-8细胞,72 h后分别用实时定量PCR和Western blot法测定转染细胞中Paxillin mRNA及蛋白。结果根据针对Paxillin基因设计了小干扰RNA（siRNA）序列,构建了shRNA表达载体,并成功转染至HCT-8细胞。以空白对照组作均一化,转染Paxillin-shRNA_1、Paxillin-shRNA_2、Paxillin-shRNA_3、Paxillin-shRNA_NC的细胞及空白对照组细胞Paxillin mRNA相对表达量分别为0.66±0.28、0.31±0.11、1.00±0.22、1.05±0.32、1.00±0.29,Paxillin蛋白相对表达量分别为0.62±0.11、0.39±0.13、0.74±0.21、0.94±0.09、1.00±0.16。结论 RNAi可沉默结肠癌HCT-8细胞Paxillin的表达。     

靶向PCSK9基因shRNA慢病毒载体的构建及其对PCSK9基因表达的沉默

目的设计以PCSK9基因为靶点的短发夹状RNA（shRNA）,构建重组慢病毒载体并鉴定此RNA干扰体系对PCSK9基因表达的影响。方法将3条人PCSK9基因的shRNA片段插入至慢病毒载体pLentilox3．7,与pCDNA3-hPCSK9．FLAG质粒用Lipofectamine2000共转染293细胞,Western blotting法鉴定出最有效的shRNA。此重组质粒与pCre—VSV-G、pLoxp．CMV—R8．91经293细胞包装后,产生的重组慢病毒感染293细胞,48h后转染pCDNA3．hPCSK9-FLAG质粒,Western blotting法检测人PCSK9基因表达的情况。结果经双酶切鉴定,构建了PCSK9shRNA慢病毒载体pLentilox—hPC—SK9,鉴定出hshRNA-2为最有效的shRNA。重组的慢病毒能明显的抑制人PCSK9的表达。结论慢病毒介导的shRNA干扰技术可特异性的阻断PCSK9的表达,为进一步探讨PCSK9特异性的shRNA治疗脂代谢异常疾病奠定了基础。     

Inhibition of hepatitis B virus surface antigen expression by small hairpin RNA in vitro

AIM: To explore the anti-hepatitis B virus effect of RNA interference (RNAi) using small hairpin RNA (shRNA) expression vector. METHODS: Hepatitis B virus surface antigen green fluorescent protein (HBs-GFP) fusion vector and shRNA expression vectors were constructed and cotransfected transiently into HepG2 cells. mRNAs extracted from HepG2 cells were detected by real-time PCR. Fluorescence of HBs-GFP protein was detected by fluorescence-activated cell sorting (FACS). The effective shRNA expression vector was transfected into HepG2.2.15 cells. HBsAg and HBeAg in HepG2.2.15 cells were analyzed by radioimmunoassay (RIA) method. RESULTS: FACS revealed that shRNA targeting at HBsAg reduced the GFP signal by 56% compared to the control. Real-time PCR showed that HBs-GFP mRNA extracted from HepG2 cells cotransfected with pAVU6+27 and HBs-GFP expression plasmids decreased by 90% compared to the empty vector control. The expressions of HBsAg and HBeAg were also inhibited by 43% and 64%, respectively. CONCLUSION: RNAi using shRNA expression vector can inhibit the expression of HBsAg, providing a fresh approach to screening the efficient small interfering RNAs (siRNAs).     

细胞外基质金属蛋白酶诱导因子RNAi慢病毒载体的构建

目的构建人细胞外基质金属蛋白酶诱导因子（EMMPRIN）RNA干扰（RNAi）慢病毒载体。方法参照文献设计RNAi靶点序列,合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经AgeⅠ和EcoRⅠ酶切后的pGCSIL-GFP载体连接产生RNAi慢病毒载体pGC-LV。PCR鉴定阳性克隆并测序,将测序正确的pGC-LV、pHelper 1.0和pHelper 2.0质粒经脂质体2000共转染293T细胞,获得重组慢病毒,用逐孔稀释法测定病毒滴度。结果合成的含EMMPRIN vshRNA慢病毒载体寡核苷酸链插入正确;病毒包装后滴度为1×109 TU/ml。结论应用基因工程技术成功构建了可供感染的EMMPRIN基因RNAi慢病毒载体,此为进一步研究EMMPRIN在急性白血病中的作用奠定了实验基础。     

GPC-3特异性短发夹型RNA干预基因转录对肝癌细胞增殖与凋亡的影响

目的观察磷脂酰肌醇蛋白多糖（GPC）-3基因特异性短发夹型RNA（shRNA）对HepG2细胞增殖的抑制作用。方法设计、合成和筛选GPC-3特异的高抑制率shRNA并构建质粒;观察shRNA沉默GPC-3基因对肝癌细胞增殖、细胞周期及凋亡的影响。结果成功构建了4种GPC-3 shRNA干扰质粒,以脂质体介导分别转染HepG2细胞后,筛选出的shRNA干扰质粒抑制率最高达89.3%;以该高效GPC-3 shRNA质粒转染HepG2细胞24h、48h和72h后,细胞增殖较对照组分别下降了33.2%、56.0%和71.1%（P〈0.05）,细胞多被阻滞在G1期;HepG2细胞凋亡率达65.6%,显著高于对照组（约为5%,P〈0.05）。结论 GPC-3特异性的shRNA可有效降低HepG2细胞中GPC-3基因转录水平,抑制增殖并促进其凋亡。因此,GPC-3可望成为肝癌基因治疗的靶目标。     

靶向人 BRG1基因的慢病毒载体构建及效率验证

目的：构建靶向人 BRG1基因的短发夹 RNA（shRNA）慢病毒载体并验证其沉默效率。方法：设计3个针对人 BRG1基因的特异性 shRNA 序列（shBRG1）,构建于 pLKO．1慢病毒载体中,并与 psPAX2和 pMD2．G 质粒共同转染293T 细胞以包装成慢病毒颗粒。将包装好的慢病毒感染人主动脉平滑肌细胞（HASMC）,应用实时荧光定量 PCR 和 western blot 检测 BRG1 mRNA 和蛋白表达水平,判断其沉默效率。结果：3种 shBRG1干扰序列均成功插入慢病毒载体中且测序正确,3种慢病毒均可有效降低 BRG1 mRNA 表达水平（P 均＜0．01）。其中 shBRG1-3的沉默效率最高,其感染HASMC 后 BRG1蛋白表达水平较对照组显著下降（P ＜0．01）。结论：靶向人 BRG1基因的 shRNA 慢病毒表达载体构建成功,shBRG1-3慢病毒能够有效降低 BRG1 mRNA和蛋白表达水平。