应用蝎形探针扩增阻滞突变系统检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变与病理改变的关系

目的 探讨非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤组织中表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的检出率,比较蝎形探针扩增阻滞突变系统(scorpions amplifieation refractory mutation system,以下简称Scorpions ARMS)即时荧光PCR和直接测序检测EGFR基因突变的敏感性.方法 应用显微切割术、Scorpions ARMS及直接测序检测82例NSCLC石蜡包埋肿瘤组织以及癌旁正常肺组织中EGFR基因的第18、19、20和2l外显子的突变.结果 Scorpions ARMS检测82例NSCLC中42例的瘤组织中存在EGFR突变,突变检出率为51.2%,其中20例为EGFR第19外显子框架内多核苷酸的缺失,18例为EGFR第21外显子L858R点突变,1例为EGFR第21外显子L861Q点突变,2例为EGFR第20外显子插入突变,另外1例为EGFR第20外显子$7681点突变.而PCR反应后行直接测序,82例标本中仅58例得到可分析的测序结果,其中25例瘤组织中出现EGFR突变,因此82例的突变检出率为30.5%,25例中13例为EGFR第19外显子框架内多核苷酸的缺失,10例为EGFR第21外显子L858R点突变,1例为EGFR第21外显子L861Q点突变,另外1例为EGFR第20外显子$768I点突变.直接测序检测出25例突变模式与Scorpions ARMS检测结果一致.结果 显示Scorpions ARMS具有很高的敏感度,部分直接测序阴性的病例经Scorpions ARMS检测出EGFR突变.结论 EGFR基因的点突变或缺失在中国NSCLC的患者中的检出率明显高于其他国家,以女性、腺癌和细支气管肺泡以及不吸烟患者突变率较高.Scorpions ARMS技术能快速、敏感、准确检测EGFR突变,能为临床冶疗及预后提供重要信息.     

等位基因特异性PCR法对血液和肿瘤组织EGFR基因突变的比较

目的采用等位基因特异性PCR法检测肺癌患者循环肿瘤DNA(ctDNA)和肿瘤组织样本中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变,分析两者关系及检测ctDNA EGFR突变的临床应用价值。方法收集22例非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的血液样本和肿瘤组织样本,提取相应血浆游离DNA(cfDNA)和肿瘤组织DNA(tDNA),通过等位基因特异性PCR法分别检测EGFR第18~21号外显子突变,并将两种样本结果进行比较分析。结果 22例NSCLC中,8例血液样本存在EGFR突变,突变率36.4%(8/22);13例肿瘤组织样本有EGFR突变,突变率59.1%(13/22);16例血液样本和肿瘤组织样本EGFR检测结果完全一致。以tDNA检出结果为标准,ctDNA诊断EGFR基因突变敏感度为61.5%,特异度为100%;与tDNA结果的一致率为72.7%。结论等位基因特异性PCR法检测ctDNA的EGFR基因突变,为无法获取肿瘤组织标本患者提供新的检测机会。     

非小细胞肺癌中表皮生长因子受体基因突变直接测序分析及其与临床病理特征的相关性

目的回顾性分析非小细胞肺癌(NSCLC)中采用直接测序法检测的表皮生长因子受体(EGFR)基因突变率、突变分布特征及其与临床病理的相关性。方法收集NSCLC共443例,其中包括手术切除样本299例、粗针穿刺活检标本59例、细针穿刺和胸腔积液细胞学样本85例。所有样本均通过石蜡包埋、切片后确定肿瘤细胞含量,显微切割富集肿瘤细胞后采用聚合酶链反应-直接测序法检测EGFR基因酪氨酸激酶编码区第18至21号外显子的突变。结果(1)在443例NSCLC标本中共检出EGFR基因突变193个,发生在189例患者中(42.7％);EGFR基因第18至21号外显子的突变率分别为2.0％( 4/193)、48.7％ (94/193)、6.7％ (13/193)和42.5％ (82/193);(2)EGFR基因总突变率与年龄无显著相关性,但在年龄大于中位年龄（57岁）的患者中第21号外显子的突变率(50.9％,54/106)高于年龄小于或等于中位年龄者(32.2％,28/87;P＜0.01);(3)女性患者中EGFR基因突变率(53.5％,107/200)高于男性患者突变率(33.7％,82/243;P ＜0.01);(4)腺癌中的突变率(46.5％,161/346)高于鳞癌(13.3％,4/30;P＜0.01)和低分化癌者(24.1％,7/29;P＜0.05),而与腺鳞癌(7/13)差异无统计学意义(P＞0.05);(5)在手术切除、粗针穿刺活检以及细针穿刺和胸腔积液细胞学样本中EGFR突变检出率有逐渐下降的趋势,分别为49.5％( 148/299)、35.6％ (21/59)和23.5％ (20/85),其中细针穿刺和胸腔积液的细胞学样本中的检出率较手术标本中的检出率为低(P＜0.01)。结论直接测序法是检测NSCLC中EGFR基因突变的有效方法,特别对未知突变类型的检出具有优势;NSCLC中EGFR基因突变在女性和腺癌中多见,以第19号外显子的缺失突变和第21号外显子的点突变为主;EGFR基因突变分布特征可能与年龄有一定关系;EGFR基因突变检出率与样本类型密切相关,活检组织及细胞学样本是检测EGFR基因突变的有用材料,但可能会漏检部分患者中EGFR基因的突变。     

ARMS法与下一代测序法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的比较

目的本研究旨在通过对突变扩增阻滞系统(ARMS)法与下一代测序法(NGS)检测非小细胞肺癌(NSCLC)EGFR基因突变的比较分析,来探索更适合我国临床肺癌患者EGFR基因突变的检测方法。方法收集22例NSCLC患者标本,分别用ARMS法及二代测序法对标本进行EGFR基因突变检测,分析比较两种方法的优劣。结果本次实验的22例标本其中17例EGFR基因突变结果两种检测方法一致,结果为EGFR单突变6例,双突变1例,阴性10例;2例ARMS法检测为单突变,二代测序法检测为双突变;3例ARMS法未检测到突变,二代测序法检测到突变。结论 ARMS法与二代测序法检测EGFR基因突变结果基本一致,但各有优缺点,两种方法结合检测效果更好。     

非小细胞肺癌EGFR基因突变与扩增及蛋白表达的相关性分析

目的：观察非小细胞肺癌（ non-sma11 ce111ung cancer,NSCLC）发生、发展中表皮生长因子受体（ epiderma1 growth factor re-ceptor,EGFR）基因突变及扩增与蛋白表达的相关性;探讨EGFR基因突变及扩增与NSCLC临床病理特征的关系。方法应用实时荧光定量PCR（ quantitative rea1-time po1ymerase chain reaction,qRT-PCR）、荧光原位杂交（ f1uorescent in situ hybridization, FISH）及免疫组化（immunohistochemistry,IHC）技术同时对NSCLC石蜡包埋组织中EGFR基因（18~21号外显子）突变、扩增及蛋白表达进行检测。结果 qRT-PCR技术检测NSCLC组织中EGFR基因（18~21号外显子）的突变率为58.18%（32/55）,其中19号外显子缺失和21号外显子L858R点突变占87.50%（28/32）;EGFR基因突变与患者性别、吸烟史、组织病理分型有关（P<0.01）,与患者年龄、淋巴结转移及TNM分期无关（P>0.05）;EGFR基因扩增率为23.64%（13/55）,EGFR蛋白阳性率为70.91%（39/55）;EGFR基因突变与基因扩增具有一定相关性（ P<0.05）,EGFR这两种基因状态与其蛋白表达无相关性（P>0.05）。结论 NSCLC EGFR基因突变在女性、无吸烟史及腺癌中表达较高,是酪氨酸激酶抑制剂（tyrosine kinase inhibi-tors,TKI）筛查主要对象;EGFR基因突变与基因扩增具有一定相关性,但基因突变与扩增的先后顺序尚不清楚,需增加病例数进一步探讨;EGFR基因突变和扩增与蛋白表达不一致,原因有待进一步分析。     

非小细胞肺癌中EGFR突变与临床病理特征的关系

目的 观察非小细胞肺癌(non-small cell lung cancers,NSCLC)患者肿瘤组织中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)19号和21号外显子突变情况,探讨其与临床病理特征的关系.方法 应用显微切割技术及扩增阻滞突变系统检测108例石蜡包埋NSCLC组织中EGFR基因第19号和21号外显子突变情况.结果 108例NSCLC患者中,EGFR基因突变率为36.1%(39例),其中19号外显子突变率为13.0%(14例),21号外显子突变率为23.1%(25例);EGFR基因突变的患者多为不吸烟、肿瘤直径较小(<3 cm)、腺癌、无远处转移及临床分期较早(P<0.05),与患者性别、病理分级及淋巴结转移无显著相关性(P>0.05);所有鳞癌标本中均无EGFR基因突变;EGFR突变的患者应用吉非替尼靶向治疗后原发肿瘤和脑转移灶明显缩小.结论 EGFR基因19号和21号外显子突变作为有效的NSCLC靶向治疗的临床筛选指标,很可能参与NSCLC的发生、发展,与相关的临床病理指标结合可为NSCLC的靶向治疗提供更可靠的依据.     

非小细胞肺癌患者胸腔积液中EGFR基因突变的检测及临床意义

目的:探讨采用非小细胞肺癌患者胸腔积液标本肿瘤细胞进行表皮生长因子(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变检测的可行性及其临床意义.方法:采用Sanger测序法检测17例非小细胞肺癌患者胸腔积液及对应的17例手术或肺部穿刺组织标本EGFR基因18～21外显子基因突变,并进行统计分析.结果:胸腔积液标本17例共检出5例突变,检出率29.41％.手术或穿刺组织标本17例共检出7例突变,检出率41.18％.胸腔积液标本EGFR基因突变检出率略低于手术或穿刺组织标本.结论:采用Sanger测序法进行非小细胞肺癌患者胸腔积液中EGFR基因突变的检测,方法可行,尤其适用于无法获取手术或肺部穿刺组织标本的患者.     

微滴数字PCR和突变扩增阻滞系统法检测不同类型非小细胞肺癌标本及血浆标本表皮生长因子受体基因突变情况比较北大核心CSCD

目的 比较微滴数字PCR（ddPCR）与突变扩增阻滞系统（ARMS）技术在检测非小细胞肺癌不同类型标本表皮生长因子受体（EGFR）基因突变的差异,并探讨ddPCR在临床上的应用价值.方法 收集2016年79例非小细胞肺癌患者标本,其中包括胸水细胞块22例,手术标本18例,活检穿刺标本12例,血浆标本27例,并经ARMS法检测已知其EGFR基因突变情况,现用ddPCR法检测上述标本EGFR基因突变情况.结果 79例标本中,18例手术标本和12例活检穿刺标本ddPCR法检测与ARMS法检测结果完全一致,阳性比例分别为9/18和5/12;22例胸水细胞块中ARMS法阳性检出率为40.9%（9/22）,ddPCR法阳性检出率为45.5%（10/22）,其中有2例ddPCR法分别检测出EGFR基因19-del＋T790M双突变和L858R＋T790M双突变,而ARMS法检测分别为EGFR基因19-del和L858R,还有1例ddPCR检测为L858R突变,而ARMS法检测为阴性,其余19例结果一致;27例血浆标本中ARMS法阳性检出率为33.3%（9/27）,ddPCR法阳性检出率为37.0%（10/27）,其中2例ddPCR检测分别为L858R突变和19-del＋T790M双突变,ARMS法检测仅为阴性和19-del,其余25例结果一致.结论 对于非小细胞肺癌患者胸水细胞块和血浆标本EGFR检测,ddPCR法较ARMS法具有更高的灵敏度,在临床上具有更广的应用价值.     

应用ARMS检测不同类型的肺腺癌标本EGFR基因突变

目的：探讨应用扩增阻滞突变系统（ amp1ification re-fractory mutation system,ARMS）法检测不同类型肺腺癌标本表皮生长因子受体（ epithe1ia1 growth factor receptor,EGFR）基因突变的特点。方法收集80例山东省西部地区肺腺癌患者肿瘤标本（胸水细胞块、肺活检、手术切除组织）,采用ARMS法检测EGFR基因19、20、21号外显子突变状态,并分析EGFR突变与标本类型、患者性别、年龄、吸烟状态及家族史等的关系。结果肺腺癌中,总EGFR突变率为41.25%,胸水细胞块、肺活检、手术切除组织 EGFR 突变率分别为43.14%、31.25%、46.15%（ P =0.649）。EGFR 突变标本中,21号外显子错义突变（L858R）发生比例最高（59.58%,19/33）,其次为19号外显子缺失（19de1）（39.39%,13/33）,二者同时突变占3.03%（1/33）;女性与男性的突变率差异有显著性（54.55% vs 25.00%,P=0.008）;吸烟与不吸烟患者的突变率差异有显著性（25.81% vs 51.02%,P=0.026）。结论在肺腺癌中,胸水细胞块、肺活检、手术切除组织等标本均可用于EGFR基因突变检测,21号外显子L858R突变最常见;女性、不吸烟患者突变率明显高于男性、吸烟患者。     

非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变与临床病理特征的关系

目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的临床病理学意义。方法应用即时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测1444例NSCLC患者肺癌组织中EGFR基因第19号和21号外显子突变状况,分析EGFR基因突变与年龄、性别、吸烟状况、组织学分级及临床分期之间的关系。结果1410例成功分型的NSCLC肿瘤组织中401例存在EGFR突变,突变检出率为27.8％,其中193例第19号外显子发生缺失突变,208例第21号外显子发生替代突变。EGFR突变更常见于腺癌、不吸烟或女性患者[突变率分别为33.5％ (367/1094)]、37.6％( 321/853)及43.2％ (225/521)。细支气管肺泡癌及伴细支气管肺泡癌分化特征的腺癌突变率显著高于普通腺癌[突变率分别为61.3％( 19/31)、48.0％( 12/25)及32.4％ (336/1038)]。随着吸烟暴露水平的增加,EGFR突变率呈下降趋势;女性、不吸烟、腺癌为EGFR基因突变状况的独立影响因素。结论NSCLC患者女性、不吸烟、腺癌患者突变率较高。即时荧光定量PCR技术可快速、敏感、准确地检测EGFR基因突变。     

肺腺癌EGFR基因19、21号外显子突变分析

目的 探讨肺腺癌表皮生长因子受体(EGFR)基因19、21号外显子突变特点及其临床意义.方法 对肺腺癌手术组织提取DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序法检测EGFR基因19号与21号外显子突变状态,分析与临床病理参数之间的相关性.结果 在54例被测肺腺癌肿瘤中,发现29例患者存在EGFR基因突变,占53.7％ (29/54).其中,19号外显子突变13例(24.1％),均为缺失突变;21号外显子突变病例为16例(29.6％),均为L858R点突变.高、中分化肿瘤的EGFR突变率均达60％以上,明显高于低分化肿瘤突变率44％.结论 肺腺癌存在较高频率的EGFR基因突变,在高、中分化肿瘤的突变率有高于低分化肿瘤的趋势.     

非小细胞肺癌患者肿瘤组织中EGFR和KARS基因突变的分子病理检测分析

目的：探讨非小细胞肺癌患者肿瘤组织中EGFR和KRAS基因各亚型突变情况。方法：应用直接测序方法检测非小细胞肺癌石蜡组织中1273例EGFR基因和1062例KRAS基因突变情况。结果：非小细胞肺癌肿瘤组织中EGFR基因总突变率为36.68%(467/1273),外显子18、19、20和21的突变率分别为1.02%(13/1273)、18.93%(241/1273)、2.59%(33/1273)和15.95%(203/1273);EGFR基因各外显子之间双重突变共17例(1.34%),其中18外显子与20外显子双重突变3例(0.24%),19外显子与20外显子双重突变7例(0.55%),19外显子与21外显子双重突变4例(0.31%)和20外显子与21外显子双重突变3例(0.24%);EGFR基因各外显子内双重突变共2例(2.18%),均为21外显子双重突变。KRAS基因总突变率为3.01%(32/1062),外显子2的密码子5、12、13和25的突变率分别为0.09%(1/1062)、2.64%(28/1062)、0.18%(2/1062)和0.09%(1/1062),外显子3密码子61的突变率为0.09%(1/1062)。结论：非小细胞肺癌患者中EGFR基因存在较高的突变率,尤其为19和21外显子突变,其基因突变亚型分类能指导EGFR-TKI的肿瘤靶向治疗,KRAS基因突变率虽低但不容忽视,其基因突变预示着EGFR-TKI原发耐药。     

Detection of epidermal growth factor receptor (EGFR) exon 19 E746-A750 deletion and EGFR exon 21 point mutations in lung adenocarcinoma by immunohistochemistry: a comparative study to EGFR exons 19 and 21 mutations analysis using PCR followed by high-resolution melting and pyrosequencing

Activating mutations in the epidermal growth factor receptor (EGFR) gene in non-small cell lung cancer (NSCLC) with adenocarcinoma histology confers susceptibility to treatment with EGFR tyrosine kinase inhibitors (TKI). Analysis of these activating mutations is typically performed by molecular techniques including polymerase chain reaction (PCR) amplification followed by deoxyribonucleic acid (DNA) melting curve analysis and/or direct sequencing. Recently developed mutation-specific immunohistochemical stains for the L858R point mutation in exon 21 and an E746-A750 deletion in exon 19 of the EGFR gene may offer a fast, cost-effective alternative to molecular testing. In this study, EGFR exons 19 and 21 mutations were analyzed using EGFR E746-A750 del and EGFR L585R point mutation-specific antibodies and the results were compared with the exon 19 deletions and exon 21 L588R point mutation as detected by molecular testing. The findings demonstrate a high concordance rate (100% in 12 cases) between the two methodologies for EGFR exon 21 L585R point mutation but a low concordance rate (54% in 22 cases) for exon 19 deletions when using EGFR E746-A750 mutation-specific antibody compared to molecular testing. This low concordance rate between the two methods is due to the fact that EGFR exon 19 mutations include deletions other than E746-A750 as well as insertion/deletions that will not be covered by exon 19 E746-A750 del mutation-specific antibody. Despite this limitation, the current EGFR mutation-specific antibodies can prove useful as an alternative to molecular tests for exon 21 L585R mutations as well as a subset of EGFR exon 19 deletion mutations, particularly in cases with low percentage of tumor concentration and in decalcified tissue specimens that are not suitable for DNA-based molecular assays.     

表皮生长因子受体基因突变与非小细胞肺癌临床病理特征及预后的关系

目的检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因第19和21号外显子突变情况并探讨其与临床病理特征及预后的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)技术对282例NSCLC患者手术标本的石蜡包埋癌组织EGFR基因第19和21号外显子片段进行扩增并测序,分析EGFR突变与临床病理特征及预后的关系。结果282例NSCLC组织中120例(42.6％)存在EGFR基因突变,包括第19号外显子突变61例,第21号外显子突变66例,其中7例第19和21号外显子同时存在突变。女性EGFR突变率(55.2％,53/96)高于男性的(36.0％,67/186),年龄51～60岁患者EGFR突变率(51.3％,39/76)高于≤50岁者(30.4％,21/69)和＞60岁者(43.8％,60/137),非吸烟者的EGFR突变率(54.3％,69/127)高于吸烟者的(32.9％,51/155),EGFR突变与吸烟呈负相关（P =0.000,rs=-0.216）;腺癌（47.8％,64/134）、细支气管肺泡癌(73.0％,27/37)、腺鳞癌(7/9)中EGFR突变率均明显高于鳞癌(23.6％,17/72)、其他类型(16.7％,5/30)中的突变率,分化程度中高、中、低、未分化的EGFR突变率分别为55.7％ (68/122)、50.8％( 30/59)、22.7％( 17/75)、19.2％ (5/26),随着分化程度的降低而降低,EGFR突变与肺癌组织分化程度呈正相关(P =0.000,rs=0.296);EGFR基因突变型的患者生存期明显较野生型的长(P =0.027),EGFR突变与临床TNM分期不相关。结论EGFR基因突变在女性患者、年龄51 ～60岁患者、非吸烟者及腺癌、细支气管肺泡癌、腺鳞癌中多见,EGFR突变与肺癌组织分化程度呈正相关,存在基因突变的患者预后较好,有利于患者靶向治疗的临床筛选。     

非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变检测及其与临床病理特征的相关性

目的探讨中国非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变特点及与临床病理特征的相关性。方法采用优化寡核苷酸探针聚合酶链反应(PCR)法检测309例甲醛固定、石蜡包埋NSCLC组织中EGFR基因第18 ～21号外显子突变情况,分析EGFR突变与临床病理特征的关系。结果受检309例NSCLC样本中,E...     

Comparison of EGFR mutation status between plasma and tumor tissue in non-small cell lung cancer using the Scorpion ARMS method and the possible prognostic significance of plasma EGFR mutation status

Background: The aims were to compare the consistency of epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations in the plasma and tumor tissue of NSCLC patients, and to explore the prognostic significance of plasma EGFR mutation status in tyrosine kinase inhibitors (TKIs)-treated patients with tumor EGFR mutation. Methods: We evaluated EGFR gene (exons 18, 19, 20 and 21) mutation status in paired plasma and tumor tissue from 94 NSCLC patients before EGFR-TKIs treatments using the Scorpion amplification refractory mutation system (Scorpion-ARMS) method. Results: Our results demonstrated that the rates for EGFR mutations in 94 NSCLC patients were 20% (19/94, plasma samples) and 40% (38/94, tumor tissue samples), respectively. The consistency of EGFR mutations between plasma and tissue reached 80% (75/94, P<0.001). The sensitivity of tests using plasma samples was 50% (19/38) and the specificity was 100% (49/49) compared with tissue samples. 29 of the 38 patients were treated with TKIs. Among the 29 patients, 14 patients had EGFR mutations in both plasma and tumor tissue, and these patients had a significantly shorter overall survival (OS) than those with EGFR mutations in tumor tissue only by univariate analysis (P=0.019). Conclusions: Our data demonstrated the feasibility and potential utility of plasma cell-free DNA (cfDNA) as a source of specimens for EGFR mutation detection using the Scorpion ARMS method. Moreover, plasma EGFR mutation status before TKIs therapy might be of prognostic significance for TKIs-treated NSCLC patients with tumor tissue EGFR mutation.