乙型肝炎病毒XTP12在大肠埃希菌中表达及生物信息学分析

目的构建乙型肝炎病毒X蛋白反式激活蛋白2(XTP12)原核表达载体并诱导其在大肠埃希菌中表达。方法应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术,以从HepG2细胞提取的mRNA为模板,扩增XTP12目的基因片段,T-A克隆连接到pGEM-T载体,测序正确后将目的片段插入原核表达载体pET-32a( )中,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导XTP12融合蛋白的表达,并通过十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、Western blot免疫印迹分析和证实融合蛋白的表达。生物信息学方法对蛋白结构和功能进行预测。结果利用RT-PCR扩增获得XTP12基因片段,IPTG诱导BL21宿主菌成功表达了XTP12融合蛋白,经SDS-PAGE和Western blot分析得到证实。生物信息学预测结果显示此蛋白富含螺旋结构,为非跨膜蛋白,无信号肽。结论利用大肠埃希菌BL21(DE3)能够成功表达XTP12蛋白,结合生物信息学分析结果,为今后研究XTP12蛋白的免疫原性和生物学特性奠定了良好的基础。     

新基因NS4ATP1的生物信息学分析及在原核细胞中表达

目的对丙型肝炎病毒（HCV）非结构蛋白4A（NSgA）反式激活靶基因1（NS4ATP1）进行生物信息学分析，并进行原核表达。方法应用生物信息学方法对NS4ATP1基因编码产物进行分析。设计并合成序列特异性引物，聚合酶链反应（PCR）扩增NS4ATP1基因，产物克隆入原核表达载体pET32a（＋）中，转化大肠杆菌BL21（DE3），以0．1mol／LIPTG诱导，SDS-PAGE和WesternBlot方法检测NS4ATP1在原核细胞中的表达。结果NS4ATP1定位于染色体3q12．2，其氨基酸含有3个N端糖基化位点、8个蛋门激酶C磷酸化位点、9个酪蛋白激酶11磷酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点和4个N端酰基化位点。利用pET32a（＋）原核表达载体和相应的BL21（DE3）菌株，在体外成功表达了57．0kDa的NS4ATP1与His标签的融合蛋白。结论生物信息学技术可以全面分析新基因NS4ATP1的染色体定位及潜在的功能位点。新基因NS4ATP1在大肠杆菌中成功表达，为进一步研究其生物学功能提供平台。     

丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因4剪切体Ns5atp4a基因原核表达载体的构建和表达

目的构建丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因4剪切体（NS5ATP4A）的原核表达载体并进行表达。方法用PCR扩增NS5ATP4A基因,克隆入pET32a（＋）质粒,构建pET32a（＋）-NS5ATP4A表达重组体,转化DH5α和BL21菌,经IPTG诱导。SDS-PAGE分析,Western Blot验证蛋白带。结果成功构建大肠杆菌原核表达载体。经IPTG诱导,得到了目的蛋白分子量为35kD,用Western Blot证实其具有良好的抗原性。结论构建原核表达载体pET32a（＋）-NS5ATP4A,为抗原的制备及临床检测奠定了基础。     

丙型肝炎病毒NS5A在肝癌细胞对TLR4表达的影响

目的探讨丙型肝炎病毒非结构蛋白质5A（HCV NS5A）对Toll样受体4（TLR4）表达的影响。方法用含HCV NS5A基因的表达质粒pcNS5A瞬时转染QSG7701细胞,采用免疫细胞化学技术检测HCV NS5A及TLR4蛋白质的表达;采用逆转录聚合酶链反应观察HCV NS5A和TLR4的mRNA表达。结果转染pcNS5A质粒细胞内有HCV NS5A蛋白的表达。转染pcNS5A组TLR4 mRNA及蛋白质表达均较转染pRc/CMV和未转染质粒组明显增强,而后两组细胞TLR4 mRNA和蛋白质表达相似。结论 HCV NS5A可上调TLR4 mRNA和蛋白的表达。     

HepG2细胞中HCV NS5A蛋白对HCV IRES启动蛋白翻译的影响

目的探讨HepG2细胞中HCV非结构蛋白5A（NS5A）对HCV IRES启动蛋白翻译的影响，以了解HCV的复制调控机制。方法将构建的表达双荧光素酶的双顺反子载体pCMV-Rluc-IRES-Fluc和含HCV NS5A基因的表达质粒pcDNA-NS5A共转染HepG2细胞，用双荧光素酶检测系统检测虫荧光素酶的表达水平，细胞免疫荧光技术检测HCV-NS5A蛋白的表达，RT-PCR检测虫荧光素酶基因mRNA水平，并与相应对照做比较，以观察HCV NS5A对HCV IRES介导虫荧光素酶翻译水平的影响。结果转染pcDNA-NS5A的HepG2细胞中虫荧光素酶活性明显高于转染pCDNA3．I-3flag的对照组，并存在剂量依赖关系；而RT-PCR虫荧光素酶基因mRNA水平在两组间差异无统计学意义。转染pcDNA-NS5A的HepG2细胞质中可见HCV NS5A蛋白的表达。结论HCV NS5A蛋白对HCV IRES介导虫荧光素酶的翻译有正调节作用，并存在剂量依赖关系．     

丙型肝炎病毒F蛋白反式激活蛋白2基因在酵母细胞中的表达

目的为探讨丙型肝炎病毒(HCV)F蛋白反式激活蛋白2(HCV FTP2)的功能,在真核生物酵母细胞中表达HCV FTP2基因.方法以HepG2细胞来源的mRNA作为模板,经过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HCV FFP2基因,克隆到pGEM-T载体中,双酶切后回收连接到酵母表达质粒pGBKT7中表达.提取酵母蛋白质,进行十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和Western blot免疫印迹分析.结果成功构建HCV FTP2基因酵母表达载体,Western blot免疫印迹显示HCV FTP2基因在酵母细胞中表达成功.表达产物相对分子质量27kD.结论HCV FTP2在酵母中表达成功.     

丙型肝炎病毒RNA依赖的RNA聚合酶在大肠埃希菌中的表达

目的 表达具有野生起点的丙型肝炎病毒(HCV)RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)并研究其聚合活性，分析其是否具有逆转录酶活性。方法 构建截短的具有野生起点的HCV RdRp表达质粒，观察不同诱导温度对表达产物可溶性的影响。以多聚腺昔为模板，分别观察在寡聚脱氧胸苷和寡聚尿苷引导下RNA的合成。以互补引物模板评价所表达的HCV RdRp的逆转录酶活性。结果 在16℃诱导温度条件下获得截短具有野生起点的HCV RdRp的可溶性表达。在聚合反应体系中同时具有引物与模板时，获得RNA链的合成，多聚核昔为引物的聚合效率明显高于以多聚脱氧核昔为引物的聚合效率。在表达的HCV RdRp指导下，脱氧核苷掺入到互补引物模板体系中，随着反应时间的延长，10聚的互补引物/模板延伸为13聚的产物，但不能延长至14聚。结论 获得可溶性的HCV RdRp表达，具有RNA依赖的RNA聚合酶活性及有限的逆转录酶活性。其RNA依赖的RNA聚合酶活性有一定的引物依赖性。     

丙型肝炎病毒非结构蛋白质5A激活Survivin基因的表达

目的探讨丙型肝炎病毒非结构蛋白质5A(HCV NS5A)对Survivin基因表达的影响。方法用含HCV NS5A基因的表达质粒(pCNS5A)转染HepG2细胞,采用免疫细胞化学技术检测HCV NS5A蛋白质的表达,采用逆转录聚合酶链反应和Western blot方法观察HCV NS5A对Survivin mRNA和蛋白质表达水平的影响。结果转染pCNS5A 的HepG2细胞胞浆可见HCV NS5A蛋白质的表达。转染pCNS5A的HepG2细胞内Survivin mRNA和蛋白质表达均比转染空白载体(pRc/CMV)的HepG2细胞及未转染质粒的HepG2细胞明显增强,而后两者Survivin mRNA和蛋白质表达相似。结论HCV NS5A可激活Survivin蛋白质表达,其途径可能通过调节Survivin基因的转录水平(mRNA转录增强)来实现。     

丙型肝炎病毒NS3基因酵母表达载体构建及表达

目的　为探讨丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3的功能 ,在真核生物酵母细胞中表达HCVNS3基因。方法　用聚合酶链反应 (PCR)的方法以HCV全长质粒pBRTM/HCV 1为模板扩增HCVNS3基因 ,克隆到 pGEM T载体中 ,双酶切后回收连接到酵母表达质粒 pGBKT7中表达。提取酵母蛋白质 ,进行十二烷基磺酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)和Western免疫印迹分析。结果　成功构建HCVNS3基因酵母表达载体 ,Western免疫印迹显示了HCVNS3在酵母细胞中表达。表达产物在胞内存在 ,相对分子质量为 70 0 0 0。结论　HCVNS3蛋白在酵母中表达成功。     

基因表达谱芯片技术筛选NS5ATP2(615)蛋白反式调节基因

目的:对新基因NS5ATP2(615)转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析,探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能.方法:应用生物信息学(bioinformatics)技术,分析我们研究组通过抑制消减杂交(SSH)技术筛选得到的新基因NS5ATP2(615)的全长编码序列,构建NS5ATP2的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP2(615).应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5ATP2(615)和pcDNA3.1(-)空载体分别转染的HepG2细胞的mRNA的差异性表达进行检测.结果:确定基因NS5ATP2(615)由615nt组成,编码204aa的蛋白.基因表达谱芯片所检测的1 152条目的基因均为GenBank中登录的基因,NS5ATP2(615)表达质粒转染的细胞有40条差异表达基因,其中18条基因表达增强,22条基因表达降低.这些差异表达的基因与细胞信号转导、凋亡、肿瘤的发生密切相关.结论:基因表达谱芯片技术对于初步探索新基因的功能提供重要的资料.本实验结果为进一步阐明NS5ATP2(615)生物学功能及HCV NS5A的致病机制提供了理论依据.     

乙型脑炎病毒NS5蛋白原核表达与亚细胞定位研究

目的对乙型脑炎病毒NS5蛋白进行原核表达和亚细胞定位研究。方法通过PCR扩增乙型脑炎病毒NS5基因,并将之克隆至原核表达载体pET-28a（＋）中,构建的重组表达载体转化大肠杆菌感受态细胞,经IPTG诱导表达目的蛋白。将表达产物纯化后,免疫BALB/c小鼠,制备NS5蛋白特异性的多克隆抗体。同时,构建NS5基因与绿色荧光蛋白（EG-FP）融合表达的真核表达质粒pcDNA-NS5-EGFP,将之转染BHK-21细胞,利用激光共聚焦荧光显微镜观察NS5蛋白在BHK-21细胞中的亚细胞定位。结果 NS5蛋白在大肠杆菌中获得了高效表达,表达蛋白分子量大小约为103kD,该蛋白在真核细胞中的表达呈颗粒状不均匀分布于整个细胞,且颗粒状主要分布在细胞质中。结论成功表达乙型脑炎病毒NS5蛋白,并对NS5蛋白的亚细胞定位进行了分析,为进一步研究NS5蛋白提供依据。     

丙型肝炎病毒NS5A蛋白的反式激活作用研究

0引言 丙型肝炎病毒(HCV)是一种单股正链RNA病毒,编码一种多蛋白分子,在病毒和宿主细胞蛋白酶的共同裂解作用下,至少裂解为3种结构蛋白(C、E1和E2)和6种非结构蛋白(NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B)[1,2].NS5 A是非结构蛋白的一种,哺乳动物细胞表达的NS5A蛋白以两种形式存在,分子量分别为56 kD和58 kD.HCV NS5A是HCV基因组编码的一种最为重要的具有多种生物学活性的非结构蛋白质[3-5],是HCV基因组编码的一种具有反式激活作用等多种生物学活性的非结构蛋白质.其基因序列的变异,决定部分HCV病毒株对于IFN-α治疗的疗效应答.HCV NS5A蛋白还具有结合双链RNA激酶(PKR)的生物学活性,对于HCV感染的靶细胞的细胞周期与细胞凋亡的分子生物学调节机制密切相关[6].     

丙型肝炎病毒非结构蛋白2反式激活蛋白的原核表达及多克隆抗体制备

目的 对HCV非结构蛋白2反式激活蛋白(NS2TP)进行原核表达,制备多克隆抗体,并探讨其在不同肝组织中的表达情况.方法 PCR法获得HCV NS2TP基因,将其克隆至原核表达载体pET-32a(+)上,并转化入E.coli BL21.在大肠埃希菌中诱导表达,表达产物进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析,经免疫印迹分析验证后,大量表达并纯化该重组蛋白.将重组蛋白免疫家兔后获取多克降抗体,应用免疫组织化学技术检测健康人及慢性HCV患者的肝组织.结果 成功获得丁重组目的 蛋白(相对分子质量为33×103)及高滴度、高特异度的多克隆抗体.慢性HCV患者肝组织内NS2TP的表达高于健康肝组织,且以细胞核内分布为主.结论 明确了慢性HCV患者肝组织内NS2TP表达量及细胞内定位的变化,为进一步研究NS2TP的生物学功能和HCV的致病机制奠定了基础.     

Heterogeneity of CK2 phosphorylation sites in the NS5A protein of different hepatitis C virus genotypes

BACKGROUND/AIMS: The hepatitis C virus NS5A protein is phosphorylated by several cellular kinases, including casein kinase 2 (CK2). Little is known about CK2 phosphorylation of NS5A from different HCV genotypes and clinical isolates. METHODS: NS5A from patients with HCV-1a (24 cases), HCV-1b (9) or HCV-3 (16) was analyzed by direct sequencing and CK2 phosphorylation sites were defined using a well-validated prediction rule. In vitro phosphorylation assays were performed using recombinant CK2 and synthetic peptides or full-length NS5A. In vivo phosphorylation by endogenous CK2 of NS5A expressed in hepatoma cells was also investigated. RESULTS: The mean number of CK2 sites within full-length NS5A, was significantly higher in HCV-3 compared to HCV-1a (P<0.01) and HCV-1b (P<0.01). The number of CK2 sites was more homogeneous in HCV-3 variants compared to HCV-1a and HCV-1b variants (P<0.05). The number of predicted CK2 sites correlated with the degree of in vitro and in vivo phosphorylation of NS5A by CK2. CONCLUSIONS: CK2-dependent phosphorylation of NS5A is heterogeneous among different HCV genotypes and clinical isolates. This might have an influence on virus biology and pathogenicity.