人类白细胞抗原-DQB1等位基因多态性与我国南方汉族人群多发性硬化的相关性研究

目的探讨人类白细胞抗原(HLA)-DQB1基因多态性与我国南方汉族人群多发性硬化(MS)的相关性。方法采用基因测序的方法(SBT)对42例南方汉族MS患者及48名健康对照者进行HLA-DQB1等位基因的检测,并比较MS组与健康对照组之间等位基因型频率的差异。结果共检测到15种HLA-DQB1等位基因片段,其中DQB1*0502等位基因频率MS组(35.7%)显著高于健康对照组(8.9%)(P=0.0018,Pc=0.027,OR=4.29);DQB1*0303等位基因频率MS组(19.0%)低于健康对照组(39.6%)(P=0.04,OR=0.48),但差异经校正后无统计学意义。HLA-DQB1*0601和DQB1*0602等位基因频率在MS组患者与健康对照组之间差异无统计学意义。结论我国南方汉族人群MS与HLA-DQB1*0502等位基因有关,而与HLA-DQB1*0601和DQB1*0602等位基因无关。     

HLA-DQ基因多态性对重症肌无力遗传易患性的相关研究

目的：探讨HLA－DQ基因多态性与重症无力（MG）易患性的相关性。方法：运用聚合酶链反应－限制片段长度多态性（PC－RFLP）法对60例MG病人进行HLA－DQA1、DQB1基因分型。结果：DQA1位点：病人按不同胸腺组织,不同发病年龄及性别分组,与对照组比较,都有DQA1＊0301频率的明显增高,差异有显著性;DQB1位点;MG病人组（包括亚组）与对照组比较,都有DQB1＊0303频率明显增高,DQB1＊0601和DQB1＊0602频率明显降低,差异都有显著性意义,结论：DQA1＊0301与胸腺增生型和≤30岁发病的男性MG病人易患者有关,DQB1＊0303与MG的易患性有关,而DQB1＊0601和DQB1＊0602是保护基因。     

HLA-DQB1等位基因多态性与新疆人群重症肌无力的相关性研究

目的探讨HLA-DQB1基因多态性与新疆人群重症肌无力(MG)的相关性。方法采用基因测序的方法对120例新疆地区MG患者及120例健康对照者进行HLA-DQB1等位基因的检测,并比较MG组与对照组之间等位基因型频率的差异。结果共检测出14种HLA-DQB1等位基因片段,其中DQB1*05:03等位基因频率MG组显著高于健康对照组(OR=2.818,P=0.002),而DQB1*02:01:01、DQB1*06:02等位基因频率显著低于对照组(OR=0.179,P=0.006;OR=0.511,P0.001)。DQB1*04:01:01、DQB1*05:03等位基因频率在MG汉族组显著高于对照汉族组(OR=4.000,P=0.009;OR=3.077,P=0.006),DQB1*02:01:01、DQB1*06:02等位基因频率MG汉族组显著低于对照汉族组(OR=0.358,P=0.002;OR=0.207,P0.001)。MG维吾尔族组与对照维吾尔族组相比DQB1等位基因频率差异无统计学意义。结论新疆MG患者可能和HLA-DQB1*05等位基因有关,DQB1*04:01:01可能与汉族人群MG相关。MG患者中缺乏DQB1*06:02、DQB1*02:01:01,可能在新疆人群中起保护作用。     

HLA-Ⅱ基因多态与贵州地区多发性硬化患者遗传易患性

目的 探讨HLA-Ⅱ基因多态与多发性硬化(multiple sclerosis,MS)患者遗传易患性之间的关系.方法 从来自贵州地区32例无血缘关系的MS患者、36例神经科其他疾病患者以及30名健康人的抗凝全血中提取基因组DNA,用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)联合技术进行HLA-Ⅱ类基因DRB1、DQB1位点的分型.结果 与其他疾病对照组以及健康对照组比较,MS组HLA-DR16(三组分别为1/36、0/30、7/32)、DR11(3/36、1/30、7/32)和DQB1*0502等位基因频率(6/36、4/30、10/32)较高,DQB1*0601等位基因频率较低(12/36、17/30、8/32).HLA-DR16等位基因频率与健康对照组比较χ2=7.398,RR=17.94,P=0.007,校正后P=0.011;与其他疾病对照组比较χ2=5.52,RR=9.8,P=0.015,校正后P=0.022,均有统计学意义.DR11、DQB1*0502、DQB1*0601与对照组比较差异无统计学意义.各等位基因不同性别、年龄之间比较差异无统计学意义.结论 HLA-DR16可能与贵州地区MS患者的遗传易患性有关.     

中国人群VEGFR2 rs2071559与胶质瘤风险的潜在关联性研究

目的探讨中国人群血管内皮细胞生长因子受体2（VEGFR2）多态性与胶质瘤发生风险之间的潜在关联性。方法采用病例-对照研究方法,对504例胶质瘤患者和527例对照者进行血液样本和病历资料收集,以及流行病学问卷调查。Qiagen Blood试剂盒行DNA提取和浓度标化、分装,Mass ARRAY系统等位基因特异性基质辅助激光解析离子化-时间飞跃质谱法完成VEGFR2 rs2071559基因分型,Haplo View 4.1统计软件检验Hardy-Weinberg遗传平衡状态,SPSS 17.0统计软件分析单核苷酸多态性差异。结果 （1）单核苷酸多态性基因分型,VEGFR2 rs2071559分型成功率达99.70%,Hardy-Weinberg遗传平衡检验表明对照组VEGFR2 rs2071559基因型频率处于平衡状态（P=0.451）,具有群体代表性。（2）等位基因频率分析,VEGFR2 rs2071559之C等位基因是胶质瘤危险等位基因,与胶质瘤风险增加有关（OR=1.424,95%CI：1.186~1.710;P=0.000）。（3）基因型分析,VEGFR2 rs2071559之CT和CC基因型与胶质瘤风险增加有关（校正OR=1.407,95%CI：1.071~1.847,P=0.014;校正OR=1.947,95%CI：1.294~2.928,P=0.001）。结论中国人群VEGFR2 rs2071559之CT和CC基因型或C等位基因与胶质瘤风险增加有关,但VEGFR2 rs2071559多态性在胶质瘤易感性中的作用尚待进一步研究。     

眼肌型重症肌无力临床特点及其与HLA-DQ基因多态性相关研究

目的探讨眼肌型重症肌无力(OMG)的临床特点及其与人类白细胞抗原(HLA)DQA1、B1基因多态性的相关性。方法运用聚合酶链反应方法-序列特异性引物(PCR-SSP)对26例OMG、60例全身型MG(GMG)和93名健康对照(对照组)的HLA-DQA1、B1基因多态性进行分析。结果 OMG发病年龄(24.38岁)早于GMG(31.28岁;P=0.039),女性OMG发病年龄(22.21岁)亦早于女性GMG(32.92岁;P=0.016)。OMG组DQB1*0501等位基因频率(29%)明显高于GMG组(16%,P0.05,OR=2.16,95%CI为0.99~4.68)和对照组(11%,P0.01,OR=3.19,95%CI为1.50~6.76);GMG组DQA1*0501(24%,P0.05,OR=1.96,95%CI为1.09~3.53)、DQB1*0301(23%,P0.01,OR=2.55,95%CI为1.35~4.84)等位基因频率高于对照组(分别为14%、10%);OMG和GMG组DQA1*0103等位基因频率(分别为4%、5%)均低于对照组(16%)(分别P=0.02,OR=0.21,95%CI为0.048~0.90;P=0.003,OR=0.27,95%CI为0.11~0.68);DQB1*0601等位基因频率(分别为6%、7%)也均低于对照组(17%)(分别P=0.047,OR=0.31,95%CI为0.09~1.05;P=0.01,OR=0.36,95%CI为0.16~0.81)。结论 OMG患者,尤其是女性OMG患者发病年龄早于GMG患者。DQB1*0501可能是OMG患者的易感基因。     

颅内动脉狭窄与HLA-DQA1、DQB1基因多态性关系研究

目的 探讨白细胞抗原(HLA)-DQA1、DQB1基因多态性与颅内动脉狭窄的关系.方法 运用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法 对自2006年7月至2007年3月天津医科大学总医院神经内科收治的15例缺血性卒中伴颅内动脉中重度狭窄患者(简称狭窄组)、49例缺血性卒中且无动脉狭窄患者(简称无狭窄组)和52例健康体检者(对照组)进行HLA-DQA1和DQB1基因多态性分型. 结果 狭窄组DQA1*0501和DQB1*0501出现频率增高,与其它2组比较差异有统计学意义(P<0.05);而无狭窄组与对照组相比,DQA1*0301和DQB1*0301频率增高,差异有统计学意义(P<0.05). 结论 DQA1*0501和DQB1*0501是缺血性卒中伴颅内动脉狭窄易感基因,DQA1*0301和DQB1*0301为缺血性卒中易感因素.     

中国人群人类白细胞抗原A、B和DRB1基因测序分型中模棱两可等位基因的鉴别

背景：人类白细胞抗原基因测序分型中，当某些等位基因间的差异碱基位于测序范围外时，无法得到清晰的等位基因结果。 目的：分析中国人群人类白细胞抗原A、B、DRB1基因测序分型中模棱两可等位基因的分布规律，探讨其在中华骨髓库大样本人类白细胞抗原 A、B、DRB1基因的测序分型中的解决方案。 设计、时间及地点：采用随机抽样方法对研究样本进行人类白细胞抗原A、B、DRB1基因的测序分型，并对其中的模棱两可等位基因进行验证性实验，于2006-01/2008-06在深圳市血液中心完成。 材料：658名深圳骨髓库汉族供者乙二胺四乙酸盐抗凝血5 mL。 方法：采用聚合酶链式反应--测序分型方法对658名深圳骨髓库供者的人类白细胞抗原A、B和DRB1基因进行高分辨分型，并采用针对相应位点的高分辨聚合酶链式反应-序列特异性引物方法对其中由于碱基差异位于检测区外而产生的模棱两可等位基因进行鉴别。 主要观察指标：模棱两可等位基因的分布及确认。 结果：658份标本中，人类白细胞抗原A、B和DRB1三个基因座的模棱两可等位基因分别为9个(2种)、140个(5种)、406个(8种)，占等位基因总数的14.06%(555/3 948)。高分辨聚合酶链式反应-序列特异性引物鉴定结果显示，中国报道的DRB1*1401被全部确认为DRB1*1454；12例B*0705/B*0706中，有1例被确认为B*0706，其他13种等位基因的鉴定结果分别为A*6801、A*7402、B*2705、B*3501、B*4402、B*5801、DRB1*0101、DRB1*0406 、DRB1*0803、DRB1*1101、DRB1*1201、DRB1*1302 和DRB1*1502。 结论：在中华骨髓库大样本人类白细胞抗原基因的测序分型中可以应用直接鉴别的方法区分模棱两可等位基因，但在临床移植前的高分辨确认试验中则需要采用实验方法进行精确分型。     

HLA class Ⅱ alleles and risk for peripheral neuropathy in type 2 diabetes patients

The potential impact of human leukocyte antigen (HLA) genotype variations on development of diabetic peripheral neuropathy (DPN) is not well determined. hTis study aimed to identify the association of HLA class II alleles with DPN in type 2 diabetes (T2D) patients. Totally 106 T2D patients, 49 with DPN and 57 without DPN, and 100 ethnic-matched healthy controls were analyzed. Both groups of the patients were matched based on sex, age, body mass index (BMI) and duration of T2D. Polyneuropathy was diagnosed using electrodiagnostic methods. HLA-DRB1 and DQB1 genotyping was performed in all subjects by the polymerase chain reaction with sequence-specific primers (PCR-SSP) method. T2D patients with DPN showed higher frequencies of HLA-DRB1*10 and DRB1*12 alleles compared to control group (P = 0.04). HLA-DQB1*02 allele and HLA-DRB1*07-DQB1*02 haplotype were associated with a decreased risk for developing DPN in T2D patients (P = 0.02 andP = 0.05 respectively). Also, patients with severe neurop-athy showed higher frequencies of DRB1*07 (P = 0.003) and DQB1*02 (P = 0.02) alleles than those with mild-to-moderate form of neuropathy. The distribution of DRB1 and DQB1 alleles and haplotypes were not statistically different between all patients and healthy controls. Our ifndings implicate a possible protective role of HLA-DQB1*02 allele and HLA-DRB1*07-DQB1*02 haplotype against development of peripheral neuropathy in T2D patients. Therefore, variations in HLA genotypes might be used as genetic markers for prediction and potentially management of neuropathy in T2D patients.     

应用完整外显子2/3序列解决HLA-DRB1座位基因分型的歧义结果

背景：人类白细胞抗原基因测序分型中，当等位基因的差异碱基位于测序范围之外或不同等位基因对的杂合序列相同时，无法得到清晰的结果。 目的：通过完整外显子2/3序列的测定，解决常规HLA-DRB1基因分型中的高比例歧义结果。 方法：初次分型采用常规的测序方法检测320份样本的HLA-DRB1外显子2第一高变区以外的序列，测序反应设置codon86。后期采用一次性扩增外显子2/3，测序反应针对外显子2设置组特异性引物：DRB1*04/07/09为一组，其它基因家族为一组，设置conden86，对初次分型后为歧义结果的样本重新分型。 结果与结论：初次分型有180份样本为歧义结果，占总样本数的56.25 %。其中A类为差异碱基位于测序范围之外，共114例；B类为等位基因对的杂合序列相同，共17例；C类为两种情况同时存在，有49例。3种类别的歧义等位基因数分别为119个、34个、98个，占等位基因总数的33.06%、9.44 %、27.22%。完整外显子2/3序列的测定使歧义结果比例从56.25%下降到14.37%，其中A类103例、B类8例、C类23例样本的等位基因得到确认。此次研究中发现了一个新等位基因，与跟它最相近的等位基因DRB1*110101相比，其外显子3的第381位碱基G>T，导致第98位氨基酸AAG(赖氨酸 Lys)>AAT(天冬酰氨 Asn)。序列已提交Genbank，编号HM807583，2010-08被世界卫生组织HLA因子命名委员会命名为HLA-DRB1*1197(编号HWS10010999)。提示，完整外显子2/3序列的测定能大幅降低歧义分型结果的比例。