基于宏基因组学的慢性阻塞性肺疾病急性加重患者肠道菌群结构与功能相关性研究

目的研究慢性阻塞性肺疾病急性加重（acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease, AECOPD）患者的肠道菌群结构与功能基因、耐药基因、毒力因子的表达差异,探索肠道菌群在AECOPD发生发展中的作用。方法2020年12月—2021年10月,入选符合AECOPD诊断的患者共15例,并选取年龄、吸烟史相匹配的健康对照组5例,收集所有肠道粪便标本,进行宏基因测序,结合临床数据,分析AECOPD与对照组肠道菌群结构及功能等方面的差异性。结果AECOPD患者肠道微生物α多样性与对照组无统计学差异,β多样性存在差异（P=0.022）。AECOPD组栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、布劳特氏菌属（Blautia）、厌氧棒菌属（Anaerostipes）相对丰度低于对照组,肠球菌属（Enterococcus）、Lachnoclostridium相对丰度高于对照组（P<0.05）,AECOPD信号通路富集在糖酵解Ⅰ、Ⅱ通路,肠球菌属相关的耐药基因及毒力因子表达丰度增加。AECOPD在属水平表达相对丰度较高的肠道微生物菌群为肠球菌属（Enterococcus）,其表达相对丰度与年龄呈正相关（P<0.05）;肠球菌属表达丰度与耐药基因msrC、efmA表达丰度呈正相关（P<0.05）,与毒力因子acm、EcbA/fss3表达丰度呈正相关（P<0.05）。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与AECOPD用力肺活量（force vital capacity, FVC）呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与BMI呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属两者的表达丰度呈正相关（P<0.05）;Lachnoclostridium属的表达丰度与血液中CD4+/CD8+T淋巴细胞比例呈正相关（P<0.05）。结论AECOPD患者肠球菌属（Enterococcus）相对丰度高,栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属相对丰度较低,信号通路富集在糖酵解相关代谢通路。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与临床指标FVC及T淋巴细胞比例存在一定的相关性,提示肠道微生态的失衡可能通过“肠-肺轴”参与AECOPD的发生发展。     

氨基酸配方替代喂养对重度牛奶蛋白过敏婴儿肠道菌群特征的影响

目的 探讨氨基酸配方（AAF）替代喂养对重度牛奶蛋白过敏（CMPA）婴儿肠道菌群特征的影响。方法 纳入23例确诊为重度CMPA且人工喂养的≤3月龄婴儿,采用同一品牌AAF进行喂养干预。干预前及干预3个月后,收集所有婴儿的粪便样本,通过16S rRNA高通量测序及生物信息学分析评估肠道菌群的特征变化。结果 干预前后,重度CMPA婴儿肠道菌群Chao1指数、Shannon指数、observed species指数、 Simpson指数差异具有统计学意义（P<0.05）,Beta多样性具有差异,且组间差异大于组内差异。门水平的相对丰度分析及LEfSe分析结果均显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中厚壁菌门、拟杆菌门显著富集。属水平的相对丰度分析结果显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中拟杆菌属、粪杆菌属、双歧杆菌属的相对丰度较干预前明显升高,弓形菌属、克雷伯菌属、梭菌属的相对丰度较干预前降低,LEfSe分析结果显示拟杆菌属、粪杆菌属、弓形菌属、克雷伯菌属为在丰度上有显著差异的标志物种。在种水平上相对丰度排名前10的菌群中,产气荚膜梭菌、产酸拟杆菌、丁酸梭菌、格氏乳杆菌、罗伊氏乳杆菌...     

代谢综合征患者肠道菌群特征探析

目的分析代谢综合征(MS)患者肠道菌群的特征。方法选取26例MS患者为观察组,32例健康人群为对照组,运用PCR技术检测研究对象的肠道菌群,分析两组研究对象肠道菌群的特征差异。结果两组样品肠道菌群β多样性具有差异。观察组的菌群多样性指数(Ace指数和Shonnon指数)、瘤胃球菌属及毛螺菌属丰度低于对照组,芽孢杆菌属、梭菌属、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属丰度高于对照组(均P<0.05)。结论 MS患者肠道菌群的多样性及特定菌群丰度与健康人群存在差异,差异菌群集中在厚壁菌门(包括芽孢杆菌属、梭菌属)、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属、瘤胃球菌属、毛螺菌属等,肠道菌群失调可能与MS的发生和发展有关。     

基于高通道测序的肠道菌群与冠心病的相关性研究

背景　冠心病是发达国家及发展中国家最常见的死亡原因之一,肠道菌群的组成在冠心病的病理过程中起重要作用,越来越多证据表明,肠道菌群失调可导致脂质代谢紊乱、低度炎性反应、胰岛素抵抗、血压升高等,进而增加冠心病风险。目的　通过检测冠心病患者肠道菌群结构及多样性,了解其肠道菌群特点,进一步寻找冠心病危险因素,为冠心病患者提供新的诊疗方法。方法　选取2016年7月-2017年6月入住新乡医学院第一附属医院心血管内科及心脏重症监护病房（CCU）的冠心病患者62例,应用Gensini评分将其分为轻度组27例,中重度组35例;同时选取同期于本院体检的30例健康者作为对照组。采集研究对象的粪便样本,提取粪便样本的DNA并对其进行细菌16S rDNA V3区的聚合酶链式反应（PCR）扩增,对最终的PCR扩增产物进行生物信息学分析。结果　三组原始PE reads数目（PE_reads）、去除嵌合体后有效序列数目（Nochimera）、有效序列平均长度（AvgLen）、有效数据的GC百分比含量（GC）、Nochimera与PE_reads的百分比（Effective）比较,差异均无统计学意义（P>0.05）。三组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;其中,轻度组与中重度组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数均低于对照组（P<0.05）。三组拟杆菌门、变形菌门相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌门相对丰度低于对照组,变形菌门相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌纲、梭菌纲相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌纲相对丰度低于轻度组、梭菌纲相对丰度高于轻度组,轻度组拟杆菌纲相对丰度低于对照组、梭菌纲相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌属相对丰度比较,差异有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组相对丰度低于轻度组和对照组,轻度组相对丰度低于对照组（P<0.05）。Metastats差异分析结果显示对照组与轻度组拟杆菌属、巴斯德菌属、脱磷弧菌属、埃希杆菌-志贺杆菌属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;对照组与中重度组巴斯德菌属、Dialister属、黄杆菌属、Parasutterella属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;轻度组与中重度组脱磷弧菌属、Dialister属、埃希杆菌-志贺杆菌属、黄杆菌属、帕拉普菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）。结论　肠道菌群多样性、结构的改变,是冠心病的危险因素,因此调节肠道菌群、粪菌移植等方法可能成为冠心病新的治疗方法。     

过敏性哮喘患者肠道菌群特征分析

目的 分析过敏性性哮喘患者肠道菌群组成特点,以期为开发新的临床治疗方法提供理论基础。方法 收集2021年1月—2021年12月就诊于河北省中医院的过敏性哮喘患者（14例）以及同期健康人群（15例）的粪便标本,采用16S rRNA分析入组人员肠道菌群的菌群结构组成和多样性特征。结果 过敏性哮喘组和对照组的年龄、性别、体重指数及吸烟史差异无统计学意义（均P>0.05）。α多样性分析结果表明两组菌群丰富度存在显著差异（P<0.05）,而两组肠道菌群的多样性程度差异无统计学意义（P>0.05）。β多样性分析结果提示过敏性哮喘组与对照组的菌群结构组成存在显著差异（P<0.05）。两组在属水平的差异菌为粪杆菌属（Faecalibacterium）、罗氏菌属（Roseburia）、另枝菌属（Alistipes）、鞘脂单胞菌属（Sphingomonas）、多尔氏菌属（Dorea）、瘤胃球菌科（Ruminococcaceae＿UCG-002）、链霉菌属（Streptomyces）、凸腹真杆菌属（[Eubacterium]＿ventriosum＿group）、丁酸球菌属（Butyr...     

不同中医证型三阴性乳腺癌患者肠道菌群的多样性及差异性研究

目的 研究不同中医证型三阴性乳腺癌(Triple Negative Breast Cancer,TNBC)患者肠道菌群的多样性与差异性。方法 纳入符合标准的TNBC患者21例作为患者组,其中脾胃虚弱证组5例,肝肾阴虚证组8例,肝郁气滞证组8例,并纳入健康志愿者10例作为对照组,分别收集粪便标本,利用16S rDNA基因测序技术检测各组间肠道菌群的丰度和分布情况,并进行组间差异分析获得各组间的差异菌属(P＜0.05)。结果 TNBC患者组与正常组以及TNBC不同证型组之间的菌群多样性均无明显统计学差异(P＞0.05)。TNBC患者组较正常组显著减少（P＜0.05）的菌群包括毛螺菌属（Lachnospira）、光冈菌属 (Mitsuokella)、粪球菌属(Coprococcus)、臭气杆菌属(Odoribacter)、肠球菌属（Enterococcus）等。与健康对照组相比,脾胃虚弱证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括普雷沃氏菌属（Prevotella）、乳杆菌属（Lactobacillus）、（Tyzzerella）、成对杆菌属（Dyadobacter）、奇异球菌属（Deinococcus）、放线杆菌属（Actinobacillus）等,肝肾阴虚证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括（Tyzzerella）、戈登氏杆菌属（Gordonibacter）、亨盖特氏菌属（Hungatella）等。肝郁气滞证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括解黄酮菌属（Flavonifractor）、变形菌属（Proteus）、水栖菌属（Enhydrobacter）、柠檬酸杆菌属（Citrobacter）、厌氧球形菌属（Anaeroglobus）、醋杆菌属 (Acetobacter)等。结论 TNBC患者与健康人群的肠道菌群存在显著差异,且不同证型TNBC患者的肠道菌群组成也显著不同。TNBC的发生与肠道内粪球菌属等有益菌的减少和Hungatella等有害菌的增加有关,不同中医证型的证候差异与其肠道内环境的菌群变化也存在一定的联系。     

多系统萎缩患者肠道菌群的变化

目的:探讨多系统萎缩(MSA)患者肠道菌群的变化。方法:收集2020年6月至2022年1月于郑州大学第一附属医院招募的MSA患者(MSA组)22例及其健康配偶(HC组)21例的临床资料及粪便样本,基于粪便菌群16S rRNA的测序结果,分析MSA患者肠道菌群组成和丰度的变化。结果:MSA组菌群丰度及多样性小于HC组(P<0.05)。在门水平,MSA组变形菌门丰度高于HC组,而拟杆菌门丰度低于HC组(P<0.05)。在科水平,MSA组乳杆菌科、链球菌科、肠杆菌科、肠球菌科、拜叶林克氏菌科、鞘脂单胞菌科、韦荣球菌科相对丰度高于HC组,而拟杆菌科、瘤胃球菌科相对丰度降于HC组(P<0.05)。在属水平,MSA组克雷伯氏杆菌属、柠檬酸杆菌属和利莫西乳杆菌属相对丰度明显高于HC组,而拟杆菌属、粪杆菌属、另枝菌属、芽孢杆菌属、毛螺旋菌属、副杆菌属、罗氏菌属、链球菌属、丁酸球菌属相对丰度低于HC组(P<0.05)。结论:MSA患者肠道菌群结构在门、科及属水平上均有明显变化,这些变化可能与MSA的发生有关。     

慢加急性肝衰竭合并自发性腹膜炎肠道菌群特征分析

目的：分析慢加急性肝衰竭并发自发性细菌性腹膜炎患者肠道菌群特征,探讨肠道菌群特征与其预后转归的关系。方法：选择37例慢加急性肝衰竭住院患者,提取粪便肠道菌群DNA行高通量测序,对所有入组患者依据临床经验及指南等进行规范化治疗,入院时并发SBP的病例及住院期间发生SBP病例均为B组,其余未并发SBP的病例为A组,应用生物信息分析软件对结果进行统计分析。结果：在属的水平上腹膜炎组患者肠道菌群丰度较高的为拟杆菌属、大肠杆菌志贺菌属、肠球菌属、副拟杆菌属、韦荣氏球菌属、魏斯氏菌属,而未发生腹膜炎组患者肠道菌群丰度较高的菌属主要有拟杆菌属、乳酸菌属、克雷伯菌属、普雷沃菌属、链球菌属、韦荣氏球菌属。Venn图分析结果显示无腹膜炎患者肠道菌群物种数量多于腹膜炎组。PCoA分析结果显示两组样本之间物种丰度有着明显的差异。功能分析结果显示两组间在氨基酸、碳水化合物、无机离子的转运代谢途径存在明显差异（P＜0.05）。结论：慢加急性肝衰竭并发SBP与其肠道菌群特征有着密切联系,肠道菌群对病情预后及转归有着一定的影响。     

基于高通量测序技术的2型糖尿病湿热困脾证患者肠道菌群结构特点与功能差异的研究

目的 探讨2型糖尿病湿热困脾证与健康人群肠道菌群结构差异及功能变化。方法 选择2019年1月—2020年1月就诊于南京市中医院2型糖尿病湿热困脾证患者30例,另选择同期健康体检者30例作为对照组,通过16Sr DNA高通量测序技术,获得样本的生物学信息,并进行两组间物种及功能注释的分析比较。结果 两组共有OTUs为433个,组间比较对照组有83个,湿热困脾证有96个;门水平下,湿热困脾证患者拟杆菌门、变形门的相对丰度显著上升;纲水平下,湿热困脾证患者拟杆菌纲、β-变形菌纲的相对丰度显著上升;目水平下,湿热困脾证患者拟杆菌目、伯克氏菌目、脱硫弧菌目、食物谷菌目的相对丰度较对照组显著上升;科水平下,普氏菌科、产碱菌科、脱硫弧菌科在湿热困脾证患者中的相对丰度上升;属水平下湿热困脾证患者普氏菌属、梭杆菌属、萨特菌属相对丰度较对照组显著上升。基于NMDS、ANOSIM的β多样性分析和以shannon、simpson指数代表的α多样性分析,提示与正常人群相比,湿热困脾证患者肠道菌群多样性存在显著差异（P<0.01,或P<0.05）;LEfSe分析可用以筛选湿热困脾证显著高丰度关键标志物...     

乌梅木瓜汤对菌群失调小鼠肠道菌群及消化酶活性的影响

[目的] 研究乌梅木瓜汤对抗生素诱导的肠道菌群失调小鼠肠道菌群及消化酶活性的影响。[方法] 将32只BALB/c小鼠随机分为4组,分别为正常组、模型组及乌梅木瓜汤低、高剂量给药组,每组8只。除正常组外其余三组小鼠均采用混合抗生素灌胃8 d诱导肠道菌群失调模型。造模成功后,乌梅木瓜汤低、高剂量组分别灌胃乌梅木瓜汤[3.77、7.54 g/（kg·d）]连续8 d,正常组与模型组给予等量无菌水,记录小鼠体质量的变化。末次给药后收集各组小鼠粪便,分别采用16S rRNA高通量测序技术、福林酚比色法、DNS比色法检测分析小鼠肠道菌群及酶活性的变化。[结果] 与正常组相比,模型组小鼠肠道菌群多样性显著降低（P<0.01或P<0.05）,变形菌门、疣微菌门、克雷伯氏菌属、大肠杆菌-志贺菌属等菌丰度显著升高（P<0.01或P<0.05）,厚壁菌门、脱硫菌门、norank_f_Muribaculaceae属、乳杆菌属丰度显著降低（P<0.05）,蛋白酶、淀粉酶及纤维素酶活性显著升高（P<0.01）。与模型组相比,乌梅木瓜汤干预明显改善菌群失调小鼠肠道菌群多样性（P<0.05）,显著降低蛋白酶、淀粉酶及纤维素酶活性（P<0.01或P<0.05）,可显著增加菌群中norank_f_Muribaculaceae属、乳杆菌属等有益菌的丰度,减少变形菌门、克雷伯氏菌属、大肠杆菌-志贺氏菌属等条件致病菌的群落丰度性（P<0.01或P<0.05）。[结论] 乌梅木瓜汤可改善菌群失调小鼠肠道菌群结构及多样性,降低致病菌丰度、升高有益菌丰度,降低肠道消化酶活性,对菌群失调小鼠肠道微生态的平衡具有积极作用。     

基于16S rRNA基因测序的黄褐斑病人肠道菌群差异研究

目的：利用新一代16S rRNA测序技术比较黄褐斑病人与健康人的肠道菌群多样性和细菌表型差异。方法：纳入30例黄褐斑病人为研究组,以20名正常人作为健康对照,测序分析粪便样品中细菌群落的结构组成和表型特征。结果：研究组肠道微生物群落丰度、多样性相对降低。研究组拟杆菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目、普雷沃菌科、拟杆菌科、普雷沃氏菌、拟杆菌属等丰度显著降低,而厚壁菌门、放射菌门、放线菌纲、乳杆菌目、双歧杆菌目、毛螺菌科、布劳特氏菌等升高,差异均有统计学意义(P<0.05～P<0.01)。结论：黄褐斑病人与健康人肠道菌群存在一定差异。     

基于高通量测序技术分析慢性鼻窦炎患者的肠道菌群结构特点

目的 采用高通量测序技术,检测和比较慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者和正常人群的肠道菌群多样性、相对丰度及分布的改变,发现与慢性鼻窦炎伴鼻息肉显著相关的菌属结构,旨在探究慢性鼻窦炎发生发展过程中可能具有重要作用的菌群变化及预测相关代谢通路。方法 选取在广东省人民医院耳鼻喉头颈外科住院的慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者10例作为观察组,另随机选取同期健康体检者10 例作对照,对粪便样本相关细菌采用粪便基因组DNA提取试剂盒抽提粪便样本中DNA,并进行DNA片段长度测定和定量,用一系列PCR引物扩增原核生物16S rDNA基因的V3、V4高度可变区,再进行文库构建、Illumina MiSeq测序、序列比对和物种鉴定分析。分析肠道菌群的相对丰度、多样性及分布特点,进而预测相关代谢通路。结果 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的肠道菌群整体结构与健康对照人群具有显著的差异（P<0.05）,主要表现为糖多孢菌属 （Saccharopolyspora）丰度增加,而瘤胃菌科（Ruminococcaceae）、粪球菌属（Coprococcus）、柯林斯氏菌属（Collinsella）、杆菌属（Dialister）含量降低。其中在代谢通路预测中,9条代谢通路存在显著差异（P<0.05）。结论 慢性鼻窦炎组与健康对照组对比,肠道菌群结构特点发生了明显改变,预测其与多个代谢通路水平变化相关。在慢性鼻窦炎的发生发展中,肠道菌群微生态的改 变可能起到了重要作用。     

海军潜艇官兵代谢指标与肠道菌群关联研究

目的 调查某部海军潜艇官兵代谢性疾病的患病情况,并探讨其与肠道菌群多性性的关联。方法 随机抽取某部潜艇官兵30名作为研究组,选取年龄和体重指数（BMI）匹配的健康体检30人作为对照组,进行代谢指标检测及粪便肠道菌群多样性分析。结果 研究组舒张压低于对照组,而血尿酸、血红蛋白及总胆固醇（TC）等代谢指标均高于对照组（P<0.05）。2组肠道菌群在各细菌学分类水平差异有统计学意义（P<0.05）。研究组肠道菌群中的厚壁菌门、栖粪杆菌属和普氏栖粪杆菌丰度高于对照组,拟杆菌门、变形菌门则低于对照组（P<0.05）。其中拟杆菌属丰度与BMI和TC水平均呈现负相关,栖粪杆菌与血尿酸及TC水平呈现正相关（P<0.05）。结论 血尿酸、TC等代谢指标在海军潜艇官兵中有增高趋势,且与特定肠道菌群结构多样性改变有一定关联。     

原发性干燥综合征患者肠道菌群特点分析

目的 探索原发性干燥综合征（pSS）与健康人之间肠道菌群是否存在差异。方法 收取18例符合纳入标准的女性pSS患者的粪便样本,其中9例为病情活动组（A组）、9例为病情不活动或低活动组（B组）,另外收取10例健康人的粪便（C组）。收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,针对16SrDNA基因的V3~V4区进行illumina hiseq 2500高通量测序,得到3组的肠道菌群生物信息数据,随后结合文献智库信息挖掘进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及LEfSe分析。结果 肠道菌群多样性比较：α多样性（Alpha diversity）指数分析,Shannon指数在A组和B组间、Simpson指数在A组和B组间及A组和 C组间差异存在统计学意义（P<0.05）;菌群结构比较：将3组分别进行序列分析,在门水平上3组均主要有 4 个菌门组成,分别是：厚壁菌门（Firmicutes）,拟杆菌门（Bacteroidetes）,放线菌门（Actinobacteria）,变形菌门（Proteobacteria）,在属水平上3组均主要有4个菌属组成,分别是：大芬戈尔德菌属（Finegoldia）,普雷沃菌属（Prevotella）,链球菌属（Streptococcus）,棒状杆菌属（Corynebacterium_1）,在门水平和属水平上分析显示3组肠道菌群主要菌门和主要菌属两两比较差异无统计学意义（P>0.05）,但Streptococcus属在3组之间比较,差异具有统计学意义（P<0.05）;肠道菌群结构的差异分析：肠道菌群 16S V3~V4 区组间显著性差异分析,在属水平上,3 组间相比,在 Alloscardovia 属、Bacteroides 属、Barnesiella 属 、Butyricicoccus 属 、Facklamia 属 、Faecalibacterium 属 、Lachnospiraceae_FCS020_group 属 、 Lachnospiraceae_ND3007_group属、Lachnospiraceae_UCG-001属、Lachnospiraceae_UCG-004属、Lachnospiraceae_UCG-008属、Ruminococcaceae_UCG-002属、Streptococcus属之间存在统计学差异（P<0.05）;在Coprococcus_1属存在显著性差异（P=0.005,P<0.01）。3组间肠道微生物进行高维生物标识和揭示基因组特征的分析,差异存在统计学意义（P<0.05）。结论 pSS患者与健康人之间的肠道菌群多样性存在一定差异,在主要菌门水平和菌属水平上虽无显著性差异,但在Streptococcus属等一些特定细菌比例有显著差异;3组肠道菌群在16S V3~V4区组间差异具有统计学意义,提示菌群结构的差异在pSS的发病中起一定作用。     

长蛇灸治疗脾肾阳虚型功能性腹泻的临床研究

【目的】观察长蛇灸疗法对脾肾阳虚型功能性腹泻患者的临床疗效及对肠道菌群的影响。【方法】将60例脾肾阳虚型功能性腹泻患者随机分为观察组和对照组,每组各30例。观察组给予长蛇灸治疗,每周1次,连续治疗4周。对照组给予四神丸合附子理中丸治疗,每次各9 g,每日2次,7 d为1个疗程,共治疗4个疗程。评价2组临床疗效,比较2组患者治疗前后各项中医症状积分及症状总积分的变化情况,以及观察组患者肠道菌群物种丰度、Alpha多样性指数、优势菌群、菌群分布及治疗前后群落差异等指标。【结果】(1)观察组总有效率为73.33%,对照组为56.67%。观察组疗效优于对照组(P<0.05)。(2)治疗后,2组患者的各项临床症状积分均明显改善,但差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,2组患者症状总积分明显改善(P<0.05),且观察组优于对照组(P<0.05)。2组患者治疗前后症状总积分差值比较,观察组优于对照组(P<0.05)。(3)治疗前后能够检测到的比例在1%以上的肠道菌群共有5个门,即拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门、放线菌门、梭杆菌门。其中长蛇灸疗法治疗后梭杆菌门的相对丰度明显高于治疗前(P<0.05),其他菌门相对丰度值治疗前后比较,差异无统计学意义(P>0.05)。(4)治疗后观察组毛螺菌属、嗜血杆菌属、萨特氏菌属相对丰度值明显低于治疗前,而梭杆菌属相对丰度值明显高于治疗前(P<0.05)。(5)观察组属分类水平物种丰度聚类热图结果显示:普雷沃氏菌属、拟杆菌属、栖粪杆菌属在各样本中丰度较高;患者治疗前后样本肠道菌群的优势菌群存在明显区别。(6)观察组患者治疗后Observed species指数较治疗前下降(P<0.05),治疗前后Chao1指数、Shannon指数、Simpson指数和PD whole tree指数变化无统计学意义(P>0.05)。(7)Beta多样性检测显示,治疗前5个样本分布比较集中;治疗后3个样本较集中、2个样本分布离散,可能是由于个体差异的存在,治疗对不同个体的肠道菌群结构的作用也存在一定差异。(8)观察组治疗后毛螺菌科梭菌属较治疗前显著升高,梭菌科梭菌属、毛螺菌属以及厚壁菌门梭菌目菌属均较治疗前显著下降。(9)2组患者中仅有1例患者在长蛇灸治疗后出现了少量局部的水泡,其余患者均无不良反应发生。【结论】长蛇灸疗法治疗脾肾阳虚型功能性腹泻具有良好的临床疗效,其疗效可能是通过改善肠道菌群结构来实现的。     

食管鳞癌原位模型小鼠肠道菌群分析

背景随着肠道菌群高通量测序技术的应用与发展,越来越多的研究证实肠道菌群与多种肿瘤的发生、发展密切相关。食管鳞癌是威胁我国人民健康的常见肿瘤,其与肠道菌群的关系备受关注。目的分析比较食管鳞癌原位模型小鼠与正常小鼠肠道菌群的多样性,筛选出食管鳞癌特异性改变的菌属。方法2020年8月至2021年5月,将20只雌性SPF级C57BL/6小鼠适应性喂养1周后随机分为对照组（DZ组）和模型组（MX组）,每组10只。DZ组小鼠常规喂养并给予普通饮用水32周,MX组小鼠按照造模方法常规喂养并给予含0.1 mg/ml诱癌剂4-硝基喹啉-1-氧化物（4NQO）的饮用水喂养16周,之后给予普通饮用水喂养至32周。收集两组小鼠粪便,提取DNA,应用聚合酶链式反应（PCR）扩增后进行高通量测序,获得的测序数据聚类成为基于序列间相似度的分类操作单元（OTU）,并根据物种注释情况进一步分析Alpha多样性、Beta多样性、物种丰度。结果两组小鼠在实验过程中未出现死亡,MX组小鼠均造模成功。MX组与DZ组相比,拟杆菌门（Bacteroidota）及厚壁菌门（Firmicutes）比例升高,而疣微菌门（Verrucomicrobiota）及变形菌门（Proteobacteria）比例降低。Alpha多样性结果显示,MX组小鼠肠道菌群Shannon指数低于DZ组（P<0.05）。Beta多样性分析中PCoA图显示,MX组与DZ组样本分别聚集在不同的象限,相距较远,样本间多样性差异较大（t=22.444,P=0.004）。在门水平,MX组Unidentified_ Bacteria、蓝细菌（Cyanobacteria）、易感微生物（Elusimicrobia）、弯曲杆菌（Campilobacterota）丰度高于DZ组（P<0.05）。在属水平,MX组普雷沃菌科_UCG-003（Prevotellaceae_UCG-003）、拟杆菌属（Bacteroides）、毛螺菌科NK4A136组（Lachnospiraceae_NK4A136_group）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、普雷沃菌科_UCG-001（Prevotellaceae_UCG-001）、普雷沃菌属（Prevotella）、大肠埃希菌（Colidextribacter）、毛螺菌科_UCG-006（Lachnospiraceae_UCG-006）丰度高于DZ组,罗姆布茨菌（Romboutsia）、土杆菌属（Turicibacter）丰度低于DZ组（P<0.05）。LEfSe分析结果显示,在属水平上,Prevotellaceae_UCG-003、埃希菌-志贺菌属（Escherichia-Shigella）、Bacteroides、Lachnospiraceae_ NK4A136_group在MX组丰度增高（P<0.05）;而Romboutsia丰度在DZ组增高（P<0.05）。结论食管鳞癌原位模型小鼠与正常小鼠相比肠道菌群物种多样性降低,存在特异性差异菌属,其中Prevotellaceae_UCG-003、Bacteroides、Lachnospiraceae_NK4A136_group和Romboutsia可作为食管鳞癌诊断的生物标志物。     

注意缺陷多动障碍合并肥胖患儿肠道菌群特点观察

  目的  探究注意缺陷多动障碍(ADHD)合并肥胖患儿发病过程中肠道菌群特点。  方法  选取2018年8月—2019年10月期间杭州市第七人民医院接诊的64例ADHD患儿作为本次研究对象,根据体重指数将其分为正常体重ADHD患儿(对照组,32例)和肥胖伴ADHD患儿(观察组,32例),采用宏基因组测序的方法测定粪便菌群,比较2组儿童之间菌群α多样性、物种分类的相对丰度及菌数量的差异。  结果  观察组和对照组儿童肠道菌群α多样性差异较小(均P＞0.05)。从菌属方面来看,观察组患儿的韦荣球菌属和粪肠杆菌属丰度低于对照组,但气味杆菌属和肠球菌属丰度高于对照组(均P＜0.05)。从菌种方面来看,观察组患儿的毛螺科菌、普氏栖粪杆菌、小韦荣球菌以及活泼瘤胃球菌丰度低于对照组,木假单胞菌、粪拟杆菌以及内脏拟杆菌丰度高于对照组(均P＜0.05)。对照组患儿的直肠真杆菌菌数明显高于观察组,多形拟杆菌、双歧杆菌属以及乳酸杆菌菌数明显低于观察组(均P＜0.05)。  结论  ADHD合并肥胖患儿肠道菌群发生了改变,或可为ADHD患儿治疗提供参考资料。      

首发抑郁症患者肠道菌群与认知情绪调节关系研究

背景　近年来抑郁症和肠道菌群的相关研究大多集中于动物实验,而人体肠道菌群的相关研究相对较少,结合心理特征的研究则更少。目的　了解首发抑郁症患者与健康人群在肠道菌群、认知情绪调节方面的差异,进一步探讨抑郁症、肠道菌群及认知情绪调节之间的关系。方法　选取2017年1-12月就诊于宁夏医科大学总医院心理卫生中心门诊的首发抑郁症患者30例（抑郁症组）,同期选取宁夏“十三五”科技重大项目流调体检健康志愿者31例（对照组）。完成一般情况调查问卷、汉密尔顿抑郁量表、认知情绪调节量表（CERQ）的评定与粪便的收集;采用高通量测序及生物信息学方法分析微生物群落多样性和丰度变化;探讨情绪调节策略、抑郁严重程度与肠道菌群的相关性。结果　抑郁症组和对照组一般情况（年龄、性别、BMI、吸烟、文化程度）比较,差异无统计学意义（P>0.05）。本研究以97%的相似性将所有样本的有效序列聚类为Operational Taxonomic Units（OTUs）,所得稀释曲线趋向平坦,说明测序数据量合理。抑郁症组与对照组肠道菌群多样性指数比较,差异无统计学意义（P>0.05）。与对照组相比,在门水平,抑郁症组厚壁菌门、放线菌门、柔壁菌门丰度降低,拟杆菌门丰度增高（P<0.05）;在属水平,抑郁症组Ruminococcus、Subdoligranulum、Enterobacter、Coprococcus、Bifidobacterium、Lactobacillus菌属减少,而Klebsiella、Flavonifractor、Bacteroides菌属增多（P<0.05）。LEfSe分析显示,抑郁症组肠道菌群中主要以拟杆菌、产碱菌科（Alcaligenaceae）,伯克菌目（Burkholderiales）,Β-变形菌纲、Erysipelotrichaceae、幽门螺杆菌等致病菌为主;对照组以厚壁菌门、双歧杆菌、Subdoligranulum、乳酸杆菌等有益菌为优势菌。抑郁症组自我责难、沉思、灾难化、责难他人分量表得分高于对照组,积极重新评价、理性分析分量表得分低于对照组（P<0.05）。CERQ分量表中自我责难得分与Enterobacter菌属呈正相关,与Odoribacter、Alistipes菌属呈负相关（P<0.05）;沉思分量表得分与Subdoligranulum、Alistipes、Faecalibacterium、Odoribacter菌属呈负相关（P<0.05）;重新关注计划、积极重新评价分量表得分与Weissella菌属呈正相关（P<0.05）;灾难化分量表得分与Dialister菌属呈负相关（P<0.05）。抑郁严重程度与拟杆菌门及Flavonifractor菌属呈正相关（P<0.05）,与Ruminococcus、Subdoligranulum、Coprococcus、Dialister、Odoribacter、Faecalibacterium、Butyricimonas菌属呈负相关（P<0.05）。结论　抑郁症患者与健康对照者在肠道菌群、认知情绪调节策略方面均有较大差异,情绪调节策略自我责难、沉思、灾难化,肠道菌群条件致病菌的增多及丁酸盐产生菌、益生菌的减少与抑郁症密切相关。     

类风湿关节炎合并肺间质疾病患者Treg/Th17免疫失衡与肠道菌群变化的关系

目的 探讨类风湿关节炎（RA）合并肺间质疾病（ILD）患者调节性T细胞（Treg细胞）/辅助性T细胞（Th17细胞）免疫失衡与肠道菌群变化的关系。方法 选取2021年6月-2022年6月于石家庄市人民医院收治的RA患者100例为研究对象,纳入RA组。根据临床症状、X射线及胸部HRCT检查评估结果,将RA组分为RA-ILD组39例和NO-ILD组61例。收集两组患者基线资料;检测Treg/Th17细胞及相关因子;对粪便DNA样本16S rRNA V3-V4区域进行生物信息学分析;使用Spearman相关性分析检验RA-ILD患者肠道菌群丰度与Treg/Th17相关性。结果 与NO-ILD组相比,RA-ILD组的Shannon指数、Observed_species指数及Chao1指数均明显较低,类杆菌属(Bacteroides)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、梭状芽孢杆菌属(Acuformics-Prevot)、厚壁菌门(Firmicutes)、真杆菌属(Eubacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)、韦荣球菌属(Veilonella)相对丰度均明显较低,拟杆菌门(Bacteridetes)、变形菌门(Proteobactena)、戈登菌属(Ciordonaspp)、放线菌门(Actinobacteri)、普雷沃菌属(Prerotella)相对丰度均明显较高,Treg细胞比例及Treg/Th17明显较低,IL-23、IL-17水平及Th17细胞比例明显较高,差异均有统计学意义（〖WTBX〗P〖WTBZ〗<0.05）。Treg/Th17与类杆菌属、嗜血杆菌属、韦荣球菌属、真杆菌属、厚壁菌门、乳杆菌属的相对丰度呈明显正相关（均P<0.05）,与普雷沃菌属、变形菌门、梭状芽胞杆菌属、放线菌门、戈登菌属、拟杆菌门呈明显负相关（均P<0.05）。结论 RA合并ILD患者存在Treg/Th17细胞比例失衡,而肠道菌群失衡可能是其失衡的主要原因     

肠道菌群在体外循环心脏手术后围手术期神经认知障碍中的作用:基于菌群人源化大鼠模型

目的 通过肠道菌群人源化大鼠模型探讨体外循环（CPB）后肠道菌群紊乱可否通过激发炎症反应参与围手术期神经认知障碍（PND）的发生。方法 SPF级成年雄性SD大鼠30只随机分为3组（n=10）：伪无菌大鼠（S）组、伪无菌大鼠+接种健康人源粪菌滤液（NP）组和伪无菌大鼠+接种PND患者粪菌滤液（P）组。造模成功后对所有组别大鼠粪便进行宏基因组学检测,Elisa法测定血清炎症因子IL-1β、IL-6及TNF-α的含量,Western-blot法检测海马组织中GFAP、p-Tau蛋白的表达水平,Morris水迷宫实验评估造模后学习和记忆等认知功能。结果 宏基因组学测序结果显示粪菌移植后3组大鼠肠道菌群各自聚集,分区良好;S组克雷伯氏菌属（Klebsiella）(P<0.005)、P组阿克曼菌属（Akkermansia）(P<0.005)、NP组拟杆菌属（Bacteroides）(P<0.005)相对丰度显著增高,差异有统计学意义;与S组相比,NP组和P组IL-1β(P<0.05)、IL-6(P<0.05)和TNF-α(P<0.05)的浓度显著降低,GFAP(...