胃癌患者p16基因启动子甲基化检测及其临床意义

目的 探讨p16基因启动子CpG岛甲基化在胃癌发生、发展中的作用.方法 应用特异性甲基化PCR(MSP)检测58例胃癌及癌旁组织和30例正常胃黏膜组织中p16基因启动子CpG岛的甲基化状态,分析其与胃癌临床病理参数的关系.结果26例(44.8％)胃癌组织、5例(8.6％)癌旁组织也检测出甲基化的存在,30例正常胃黏膜组织标本中均未检测出p16基因甲基化的存在(P ＜0.05);p16基因甲基化与胃癌淋巴结转密切相关(P＜0.05).结论 p16基因启动子CpG岛甲基化可促进胃癌的发生、发展;此基因的异常甲基化可作为胃癌早期诊断的敏感指标.     

胃癌患者TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化状态及蛋白表达

目的探讨胃癌组织中TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化及蛋白的表达与胃癌生物学行为的关系,并分析TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化与其蛋白表达的相关性。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)技术和免疫组织化学SP法检测45例患者的胃癌组织、正常胃黏膜组织中TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化情况及蛋白的表达。结果 TIMP3基因启动子区CpG岛在胃癌及正常组织中的甲基化阳性率分别为31.1%和0(P<0.05);TIMP3蛋白在胃癌及正常组织中的阳性表达率分别为46.7%和90.5%(P<0.05);TIMP3基因启动子区CpG岛甲基化及蛋白的表达分别与胃癌的分化程度、淋巴结转移有关(P<0.05)。TIMP3基因启动子甲基化与蛋白表达呈明显的负相关(P<0.05)。结论 TIMP3基因启动子区CpG岛的异常甲基化是引起蛋白表达缺失的主要原因,TIMP3基因启动子区CpG岛的异常甲基化与胃癌的发生发展有关。     

p16、hMLH1基因甲基化与结肠癌的相关性研究

目的检测正常黏膜、结肠腺瘤、结肠癌中p16、hMLH1基因CpG岛甲基化状态,评价其在结肠癌发生中的作用及临床意义。方法收集四川省人民医院2008年10月～12月结肠组织标本60例,其中结肠癌20例、腺瘤20例、正常组织标本20例。采用特异性甲基化PCR（MSP）方法检测p16、hMLH1基因的CpG岛甲基化状态。结果 MSP方法检测发现p16启动子CpG岛甲基化阳性表达率结肠癌组与腺瘤组、正常组比较有显著性差异（P=0.020、0.020）,而腺瘤组与正常组比较无显著性差异（P〉0.05）。hMLH1启动子CpG岛甲基化阳性表达率结肠癌组与正常组比较有显著性差异（P=0.047）,结肠癌组与腺瘤组、腺瘤组与正常组比较无显著性差异（P〉0.05）。p16、hMLH1基因CpG岛甲基化与Dukes分期、肿瘤大小、淋巴结转移、分化程度具有相关性（P〈0.05）,与肿瘤部位、性别无相关性（P〉0.05）。结论 p16、hMLH1启动子区CpG岛甲基化是促进结肠癌发生的重要基因事件,且可能与结肠癌Duke分期相关。     

hMLH1基因高甲基化在胃癌发生、发展中的作用

基因启动子区CpG岛甲基化使许多基因失活，从而导致恶性肿瘤的发生和发展。目的：检测hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化水平，探讨其胃癌发生、发展中的作用。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测41例胃癌、40例癌前病变和38例对照组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化状态，并分析其与胃癌患者临床病理特征的关系。结果：胃癌组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化阳性率为34．1％，显著高于癌前病变组的5．0％和对照组的0％（P〈0．05）。hMLHl基因甲基化阳性率与胃癌患者的年龄和肿瘤浸润深度有关（阳性率分别为46．4％对7．7％和55．0％对14.3％，P〈0．05），与性别、肿瘤分化程度和淋巴结转移无关（阳性率分别为34．8％对33．3％、28．0％对43．8％和38．1％对30．0％）。结论：胃癌组织中存在hMLHl基因启动子区CpG岛高甲基化，可能与胃癌的发生、发展有关．且可能在老年胃癌患者的肿瘤发生过程中起重要作用。     

胃癌TIMP3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究

目的:探讨组织金属蛋白酶抑制因子-3(tissue inhibitor of metalloproteinase 3,TIMP3)基因启动子甲基化与其蛋白表达的相关性,并分析 TIMP3基因CpG岛异常甲基化与胃腺癌及其临床病理特征的关联性．方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)技术和免疫组织化学方法分别检测78例患者的胃正常黏膜组织、胃癌组织及转移淋巴结中,TIMP3 基因启动子甲基化和蛋白表达情况．结果:胃正常黏膜组织、早期、进展期胃癌组织和转移淋巴结中TIMP3基因启动子均有甲基化修饰,其阳性率分别为35．9％(28／78); 85．0％(17／20),89．7％(52／58);转移淋巴结 100％(78／78)．胃癌组TIMP3基因启动子甲基化率明显高于胃正常黏膜组(尸<0．05)．胃正常黏膜组织TIMP3蛋白表达全部为阳性(100％), 20例早期胃癌中,6例阳性(30％),58例进展期胃癌中,2例阳性(3．4％),在转移淋巴结中全部不表达(0％)．胃癌70例蛋白表达阴性的标本中,64例TIMP3基因启动子甲基化阳性 (91．4％),TIMP3蛋白表达与启动子甲基化呈明显负相关(P<0．01)．结论:启动子区CpG岛高甲基化是胃癌组织中TIMP3基因表达失活的主要机制,可能成为胃癌分子诊断与病期评估的标志之一．     

RUNX3、RASSF1A启动子高甲基化与胃癌进展转移的关系

目的:探讨胃癌RUNX3、RASSF1A基因启动子甲基化在胃癌进展转移中的作用及意义.方法:RT-PCR和MSP检测62例胃癌标本及56例正常胃黏膜组织RUNX3、RASSF1A基因mRNA表达及甲基化状况,免疫组织化学检测VEGF在RUNX3、RASSF1A甲基化与非甲基化胃癌组织及20例正常组织中的表达,并分析RUNX3、RASSF1A甲基化与VEGF表达的关系.结果:胃癌组织RUNX3与RASSF1A表达较正常组织均明显降低(0.629±0.461 vs 0.893±0.543,0.653±0.476 vs 0.858±0.581,均P<0.05),且RUNX3与RASSF1A甲基化率均高于正常组织(69.4%VS 26.8%,66.1%vs 23.2%.均P<0.01).胃癌组织中RUNX3、RASSF1A甲基化组mRNA表达量较非甲基化组明显降低(0.545±0.299 vs 0.736±0.291,0.562±0.208 vs 0.674±0.185,均P<0.05).RASSF1A甲基化与肿瘤TNM分期及浸润深度相走RUNX3甲基化与肿瘤淋巴结转移、血管侵犯及TNM分期相关(P<0.05).RUNX3甲基化组胃癌组织VEGF蛋白表达高于非甲基化组(86.0%vs57.9%),RUNX3甲基化与VEGF表达相关(P<0.05).结论:RUNX3、RASSF1A启动子高甲基化可能是导致其表达降低的原因,并与胃癌进展演变相关.RUNX3甲基化可能参与胃癌血管、淋巴管转移.     

SOCS-3基因在结肠癌中的表达及其甲基化测定

目的通过对SOCS-3基因在结肠癌和癌旁组织中的表达及其启动子甲基化状态的测定,探讨其与结肠癌发生、发展和转移的关系。方法收集40例结肠癌患者的肿瘤标本、20例癌旁组织及10例正常结肠组织,运用甲基化特异性PCR测定SOCS-3基因CpG岛甲基化状态,同时运用实时定量PCR分析SOCS-3基因在结肠癌组织中的表达水平。结果40例结肠癌组织中有34例(85%)存在SOCS-3基因CpG岛的异常甲基化,癌旁组织中有2例(10%),而正常结肠组织中未检测到SOCS-3基因CpG岛的异常甲基化;结肠癌组织中SOCS-3基因CpG岛甲基化组与无甲基化组相比,其SOCS-3基因的相对表达量明显减少(P0.05),表明SOCS-3基因CpG岛甲基化可导致SOCS-3基因表达降低。SOCS-3基因CpG岛甲基化与性别、年龄无关(P0.05),而与肿瘤病理分级、TNM分期有关(P0.05)。结论结肠癌中存在SOCS-3基因CpG岛异常甲基化,且CpG岛的甲基化导致其基因表达降低。SOCS-3基因CpG岛甲基化可能参与了结肠癌的发生、发展和转移。     

巢式MSP法检测胃癌患者血浆p16、MGMT基因甲基化

目的:探讨胃癌患者血p16和MGMT基因启动子区甲基化状态.方法:采用巢式甲基化特异性PCR法(nestedmethylation-specific PCR,nMSP)对6例胃癌患者血浆中p16和MGMT基因启动子区甲基化状态进行研究.同时以16例健康体检作为对照.结果:在受检的69例胃癌患者中,p15、MGMT基因启动子区甲基化率分别为30.4%(21/69)、17.4%(12/69).对照组未见p16、MGMT基因启动子区甲基化.胃癌患者血浆中存在p16和MGMT基因启动子区甲基化,其中p16基因启动子区甲基化与对照组相比差异显著,具有统计学意义.结论:检测血浆循环DNA中p16、MGMT基因启动子区的甲基化状态,可为胃癌的早期分子诊断提供了有用信息.     

胃癌p16基因启动子异常甲基化的临床意义

目的 观察胃癌组织中p16基因启动子区异常甲基化状态,并探讨其甲基化改变与临床特征的关系.方法 采用甲基化特异的聚合酶链反应检测胃癌组织及相应癌旁正常组织中p16基因启动子区甲基化状态.结果 胃癌组织p16基因的异常甲基化率显著高于相应的癌旁正常组织(P＜0.01).胃癌组织中该基因的异常甲基化与患者年龄、性别、肿瘤大小、病理分期、组织分化程度、肿瘤浸润深度及淋巴结转移等临床特征无显著相关性.结论 p16基因启动子区的异常甲基化是胃癌发生发展中的频繁事件,在胃癌的发生中具有肿瘤特异性.     

错配修复基因hMSH2启动子甲基化与胃癌的关系

目的:探讨hMSH2基因启动子区5CpG岛高甲基化在胃癌发生过程中的作用.方法:应用甲基化特异性PCR(methylationspecific PCR,MSP)方法检测胃癌及非癌组织中hMSH2基因启动子区甲基化状态.结果:40例胃癌中hMSH2基因启动子区高甲基化24例(60%),其癌旁黏膜组织中有15例(37.5%)发生甲基化,14例慢性萎缩性胃炎组织中有5例(35.7%)发生甲基化,6例慢性浅表性胃炎组织中未见甲基化.四组甲基化水平相比,差别有统计意义(P＜0.05).胃癌组甲基化水平高于癌旁组,差别有统计意义(P＜0.05).癌旁组、慢性萎缩性胃炎组、慢性浅表性胃炎组三组甲基化水平相比,差别无统计意义.胃癌各临床病理参数组之间相比差别无统计意义.结论:胃癌组织中hMSH2基因启动子区高甲基化可能是导致其错配修复功能缺陷的重要原因之一;而错配修复功能缺陷在胃癌的发生中起着重要作用,但可能与其发展关系不大.     

死亡相关蛋白激酶基因高甲基化在胃癌形成过程中作用的初步研究

背景：DNA启动子区甲基化可导致肿瘤抑制基因表达沉默，在胃癌的发生、发展中发挥重要作用。目的：观察正常胃黏膜、慢性萎缩性胃炎伴肠化生、异型增生和早期胃癌组织中死亡相关蛋白激酶（DAPK）基因启动子区甲基化状态，探讨其与胃癌发生、发展的关系。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测20例正常胃黏膜、14例慢性萎缩性胃炎伴肠化生、27例异型增生和16例早期胃癌组织中DAPK基因启动子区甲基化状态．并分析其与患者临床病理特征的关系。结果：早期胃癌组织中DAPK基因启动子区甲基化率显著高于正常胃黏膜、慢性萎缩性胃炎伴肠化生和异型增生组织（43.8％对0％、7．1％和11．1％，P〈0．05），而后三者之间DAPK基因启动子区甲基化率无明显差异。DAPK基因启动子区甲基化与患者性别、年龄和病变部位均无关，与幽门螺杆菌（H.pylori）感染和血清癌胚抗原（CEA）水平显著相关（P〈0．05）。结论：DAPK基因启动子区高甲基化是胃癌发生的早期分子事件，在由慢性萎缩性胃炎伴肠化生和异型增生进展至早期胃癌的过程中起重要作用。     

p16 inactivation by methylation of the CDKN2A promoter occurs early during neoplastic progression in Barrett's esophagus

BACKGROUND & AIMS: The potential role of p16 inactivation by CDKN2A/p16 promoter hypermethylation and/or loss of heterozygosity (LOH) of the CDKN2A gene was investigated in neoplastic progression of Barrett's esophagus. METHODS: CDKN2A promoter hypermethylation was studied by methylation sensitive single-strand conformation analysis and sequencing using bisulfite modified DNA in Barrett's esophageal adenocarcinomas, premalignant lesions, and normal squamous esophageal epithelium. All of the lesions of interest were sampled by microdissection from paraffin-embedded fixed tissue sections. RESULTS: No methylation of the CDKN2A promoter was found in normal esophageal squamous cell epithelia, whereas methylation was detected in 18 of 22 (82%) adenocarcinomas and 10 of 33 (30%) premalignant lesions, including 4 of 12 (33%) samples with intestinal metaplasia only. LOH at the CDKN2A gene locus was found in 68% of adenocarcinomas and in 55% of premalignant lesions. Of 28 samples without p16 immunoreactivity, 25 (89%) showed CDKN2A promoter hypermethylation with or without LOH of CDKN2A. Only 2 (8%) samples expressing p16 protein were found to be methylated; these showed a mixture of completely methylated and unmethylated CDKN2A promoters. In 7 of 19 (37%) informative samples without LOH of CDKN2A, the CDKN2A promoter was found to be methylated at both alleles. Loss of p16 protein expression was strongly associated with CDKN2A promoter hypermethylation (P < 0.00001), but not with LOH (P = 0.33). CONCLUSIONS: Our results indicate that methylation of the CDKN2A promoter is the predominant mechanism for p16 inactivation. This hypermethylation is a very common event in esophageal adenocarcinoma and occurs as early as metaplasia.     

原发胃癌中p16基因及其甲基化状态、表达异常的研究

目的：检测胃癌组织中p16基因及启动了甲基化状态和p16蛋白表达情况。方法：选择p16基因及启动子区域,用PCR－SSCP、MSP（甲基化特异的PCR）法、测序和免疫组化等方法对100例胃癌患者的癌组织和癌旁组织进行检测。结果：71％的病例p16表达阴性,54％的病例具有p16基因启动子区的高甲基化,50％的病例同时有p16表达阴性和p16基因启动子区的高甲基化,无突变和纯合缺失检出。结论：提示p16基因启动子区域高甲基化是胃癌中p16基因失活的主要原因。     

胰腺癌分泌型凋亡相关蛋白2基因第一外显子区甲基化模式及意义

目的 研究胰腺癌分泌型凋亡相关蛋白2(SARP2)基因第一外显子区CpG岛甲基化模式及其与临床生物学特征的关系,为胰腺癌早期诊断及预后判断奠定基础.方法 收集23例胰腺癌及相应癌旁组织、6例慢性胰腺炎和7例正常胰腺组织作为研究对象.抽提上述标本DNA进行亚硫酸氢盐修饰,聚合酶链反应扩增SARP2基因第一外显子区CpG岛区域,测序明确该区域CpG位点甲基化情况,并分析与临床生物学特征的关系.结果 胰腺癌SARP2基因CpG位点甲基化率(37.9%)显著高于正常胰腺(0.0%)、慢性胰腺炎(2.5%)及癌旁组织(15.2%),差异有统计学意义(P值均<0.05).SARP2基因CpG岛1区甲基化具有较好的胰腺癌特异性.胰腺癌SARP2基因CpG岛1区CpG位点甲基化与性别、年龄、诱因、肿瘤大小、肿瘤分级、分期、转移无关(P值均>0.05),但肿瘤直径较大者及分化程度较高者具有SARP2基因高甲基化趋势.结论 胰腺癌SARP2基因第一外显子区基因CpG岛甲基化分布具有不均衡性,部分CpG位点高甲基化具有胰腺癌特异性,可作为胰腺癌基因诊断的靶点,且与一些临床生物学特征有关,可能对胰腺癌预后评估有一定价值.     

前列腺癌组织中多基因异常甲基化检测及临床意义

目的 探讨前列腺癌组织中RARβ2、GSTP1和DAPK基因异常甲基化,与前列腺临床病理特征间的关系,及其在前列腺癌诊断中价值.方法 采用巢式甲基化特异性PCR(nestedmethylationspecificpolymerasechainreaction,NMSP)法对57例前列腺痛组织和35例良性前列腺增生(BPH)组织进行甲基化检测;分析其甲基化的发生与前列腺癌临床病理特征间的关系,以及在前列腺癌诊断中价值.结果 前列腺癌组织中RARβ2、GSTPI和DAPK基因甲基化检出率显著高于BPH组织(RARβ32:52.6%对0%;GSTPl:61.4%对2.9%;DAPK:43.9%对8.6%;均P<0.01).RARβ2基因甲基化率在前列腺癌不同Gleason评分和不同临床分期之间差异有统计学意义(4～7分对8～10分:34.8%对64.7%,B、C期对D期:37.0%对66.7%,x2=4.927和x2=5.004,P=0.026和P=0.025);GSTP1基因甲基化率在不同Gleason评分间差异有统计学意义(4～7分对8～10分:43.5%对73.5%,x2=11.530,P=0.001),而在不同临床分期之间差异无统计学意义(B、C期对D期:51.9%对70.0%,x2=1.975,P=0.16);DAPK基因甲基化率在不同Gleason评分和不同临床分期之间差异均无统计学意义(4～7分对8～lO分:39.1%对50.0%,B、C期对D期:33.3%对53.3%,x2=1.290和x2=2.309,均P>0.05).GSTP1基因诊断敏感度最高为61.4%(35/57),特异度为97.1%(34/35);RARβ2基因特异度最高为100%(35/35),敏感度为52.6%(30/57);DAPK基因的诊断敏感度和特异度分别为43.9%和91.4%(25/57和32/35).而RARβ2、GSTP1和DAPK基因甲基化联合检测能明显提高前列腺癌诊断敏感度,但诊断特异度却有所下降.结论 RARβ2、GSTP1和DAPK基因异常甲基化与前列腺癌的发生与发展相关,可作为前列腺癌的诊断有效指标之一.     

An inverse correlation between Interleukin-6 and select gene promoter methylation in patients with gastric cancer

BACKGROUND: Both serum IL-6 levels and CpG island methylation have been shown to have prognostic significance in gastric cancer, it was suggested that an important link existed between IL-6 and methylation of cancers. AIM: To investigate the prognostic value of IL-6 serum level and the association between serum IL-6 levels and CpG island methylation at p16, DAPK, MGMT and E-cadherin in patients with gastric cancer. PATIENTS AND METHODS: Methylation status was assessed by MSP in 75 surgical specimens of gastric adenocarcinoma. IL-6 serum levels were measured by chemiluminescent enzyme immunoassay (CLEIA). RESULTS: Methylation of p16, DAPK, MGMT, and E-cadherin were present in 53, 48, 32, and 59% of patients. Patients with tumors methylated at p16 and DAPK had lower serum levels of IL-6 compared to unmethylated tumors (1.8 vs. 4.8 pg/ml, p = 0.01 for p16; 1.5 vs. 6.2 pg/ml, p = 0.0001 for DAPK). But there was no difference with MGMT and E-cadherin methylation status. Serum IL-6 levels were also associated with TNM stage (p = 0.001), depth of tumor invasion (p = 0.002), lymphatic invasion (p = 0.01), vascular invasion (p = 0.008), metastasis (p = 0.002) and signet cell histology (p = 0.001). Conclusion: IL-6 is of prognostic value for patients of gastric cancer. Low serum IL-6 levels were associated with p16 or DAPK gene methylation in patients with gastric cancer.     

LMXlA基因启动子甲基化以及在胃癌发展中的临床意义

目的通过检测胃癌癌旁距离原发灶不同距离组织及胃癌原发灶LMXlA基因启动子区甲基化状态的差异,分析正常胃组织、癌前病变及癌组织中该基因甲基化的动态变化以及LMXlA基因甲基化与胃癌原发灶病理学的关系,探讨LMXlA基因启动子区甲基化在胃癌阶段性发生及进展中的作用及临床意义。方法采用甲基化特异性PCR法（MSP）检测距胃癌癌灶边缘1、3、5cm组织及胃癌原发灶组织中LMXlA基因甲基化状态。结果LMXlA基因启动子区甲基化发生率在胃癌组织及距胃癌灶边缘1、3、5cm组织中分别为46．0％（23／50）、22．O％（11／50）、8．0％（4／50）和4．0％（2／50）,从距癌灶边缘5cm胃组织至胃癌原发灶组织中的表达中随距癌灶边缘距离的减少呈上升趋势,原发灶中甲基化阳性率显著高于距原发灶边缘3cm和5cm组织（x^2=15．42,P〈0．05;x^2=12．63,P〈0．01）。LMXlA基因启动子区甲基化发生率在正常胃组织、癌前病变组织及胃癌原发灶中分别为O％（0／25）、16．0％（4／25）和46．O％（23／50）,三者之间的差异具有统计学意义（×^2=24．85,P〈0．01）。LMXlA基因甲基化发生率在胃癌患者透浆膜组57．6％（19／33）显著高于未透浆膜组14．8％（4／27）（X^2=16．50,P〈0．05）;在转移淋巴结数大于7枚以上组52．9％（9／17）显著高于小于7枚组37．5％（6／16）（X^2=12．74,P〈0．05）。LMXlA基因甲基化在性别、年龄、不同大体类型、生长方式及分化程度上胃癌患者间差异无统计学意义。结论LMXlA基因启动子区异常甲基化可能与胃癌的临床进展有一定的相关性。     

Promoter methylation of E-cadherin gene in gastric mucosa associated with Helicobacter pylori infection and in gastric cancer

BACKGROUND:E-cadherin is an adhesion molecule involved in tumour invasion/metastasis. Silencing of E-cadherin by promoter CpG methylation has been shown in both familial and sporadic gastric cancers. Helicobacter pylori is a class I carcinogen in gastric cancer. AIMS: This study was undertaken to investigate the association between methylation of E-cadherin and H pylori in gastric mucosa from dyspeptic patients, and in intestinal metaplasia and primary and metastatic adenocarcinoma from surgical specimens of patients with gastric cancer. METHODS: E-cadherin methylation was studied using methylation specific polymerase chain reaction in microdissected tissue from biopsies or surgical resection specimens. E-cadherin expression was studied by immunohistochemistry. RESULTS: E-cadherin methylation was present in 31% (11/35) of gastric mucosae from dyspeptic patients, and was associated with H pylori infection (p=0.002), but was independent of the age of the patient or presence or absence of gastritis. E-cadherin methylation was present in 0% (0/8) of normal mucosa, 57% (12/21) of intestinal metaplasias, and 58% (15/26) of primary and 65% (21/32) of metastatic cancers. E-cadherin methylation status was concordant in 92% (11/12) of intestinal metaplasias and primary cancers, and in 85% (17/20) of primary and metastatic cancers from the same resected specimen. E-cadherin methylation in gastric cancer was associated with depth of tumour invasion (p=0.02) and regional nodal metastasis (p=0.05). CONCLUSION:E-cadherin methylation is an early event in gastric carcinogenesis, and is initiated by H pylori infection.