基于生物信息学分析γ-谷氨酰转移酶5在肝癌中的表达和意义

目的 探讨γ-谷氨酰转移酶5(GGT5)在肝细胞癌(HCC)中的表达,分析其与预后及免疫浸润的相关性。方法 通过TCGA、HPA、TIMER在线网站分析GGT5在HCC组织中的蛋白和基因表达水平。使用UALCAN数据库分析GGT5与临床特征的相关性。使用Kaplan-Meier分析探讨GGT5表达水平对HCC患者预后的影响。使用Linked Omics数据库分析与GGT5相关及共表达的基因。使用基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据评估GGT5参与相关生物学的过程和信号通路。通过TIMER在线网站分析GGT5与肿瘤免疫浸润的相关性。结果 与邻近的癌旁组织相比,GGT5在肝癌组织中的表达降低,GGT5的低表达与肿瘤分期显著相关。GGT5低表达的HCC患者的总生存期(OS)较短。功能分析表明,GGT5参与肝癌细胞的蛋白酶体重组。GGT5低表达与免疫细胞浸润水平呈正相关。结论 GGT5与HCC的预后和免疫浸润有关,可能是HCC的潜在治疗靶点。     

14-3-3zeta在肝细胞肝癌中的表达研究

目的初步探讨14-3-3zeta蛋白在肝细胞癌(HCC)患者癌组织和癌旁组织中的表达特征及其意义。方法选择大连大学附属中山医院在2012年1月-2018年12月病理确诊为肝细胞癌患者癌组织和癌旁肝组织标本72份,采用免疫组织化学染色法检测癌组织和癌旁肝组织14-3-3zeta蛋白表达情况,并分析其与临床相关特征关系。结果在本组HCC患者肝组织中,14-3-3zeta蛋白在HCC组织表达升高,癌组织中14-3-3zeta蛋白表达阳性率为61.1%(44/72),显著高于癌旁组织12.5%(9/72),差异具有统计学意义(P=0.00)。40例Ⅲ级和Ⅳ级组织学分化、39例术前血清AFP400ng/ml、23例发生血管浸润的癌组织14-3-3zeta蛋白表达阳性率分别为80.0%、79.5%和82.6%,显著高于32例Ⅰ级和Ⅱ级组织学分化、33例血清AFP≤400ng/ml和49例未发生肿瘤血管浸润的癌组织(分别为53.1%、48.5%和55.1%),差异均具有统计学意义(P0.05)。结论 HCC癌组织中14-3-3zeta蛋白表达显著高于癌旁组织,并与肿瘤组织学分级、术前血清AFP水平和是否发生肿瘤血管浸润有关,提示其表达强弱可能与预后相关。     

微染色体维持蛋白6高表达与肝细胞癌预后关系的研究

目的探讨肝细胞癌(HCC)患者微染色体维持蛋白6(MCM6)表达水平与临床病理特征的相关性,并判断其在HCC中的预后作用。方法 HCC患者的基因表达谱和临床资料从肿瘤基因组图谱(TCGA)肝癌数据库中获取得到。分析MCM6在HCC中的表达水平,评价MCM6在HCC中的预后作用。结果 MCM6在HCC组织中的表达水平明显高于癌旁组织。HCC中MCM6高表达与病理分期、T分期、组织学分级明显相关。Kaplan-Meier生存分析提示MCM6高表达的患者预后、生存期限明显差于MCM6低表达水平的患者。多因素Cox分析显示MCM6高表达是HCC的独立预后因素。结论 MCM6参与了HCC的进展,并可独立预测HCC的预后,可作为HCC的潜在诊断和预后标志物。     

PRPF3和CHEK1在肝细胞肝癌中的表达水平及临床意义

目的 研究肝细胞肝癌(HCC)患者组织中前mRNA加工因子3(PRPF3)和检查点激酶1(CHEK1)的表达水平,探讨两者的临床意义。方法 应用R语言分析癌症基因组图谱数据库中HCC癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1 mRNA表达水平的差异。利用免疫组化检测该院诊治的86例HCC患者的癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1的蛋白表达水平。Spearman秩相关分析癌组织中PRPF3和CHEK1表达水平的相关性。统计学分析癌组织中PRPF3、CHEK1表达水平与临床病理特征的关系。Kaplan-Meier生存分析(Log-rank检验)分析PRPF3、CHEK1表达水平与生存预后的关系。单因素及多因素COX回归分析影响HCC患者生存预后的危险因素。结果 TCGA数据库及免疫组化结果,HCC癌组织中PRPF3、CHEK1 mRNA及蛋白表达水平明显高于正常肝组织,差异有统计学意义(均P<0.05)。癌组织中PRPF3与CHEK1蛋白表达水平呈显著正相关(r=0.607,P<0.001)。不同肿瘤TNM分期、病理分级及肝内转移患者癌组织中PRPF3、CHEK1蛋白表达水平...     

Wnt1/β-catenin 与食管鳞状细胞癌临床病理及预后的相关性研究

目的 探究Wnt1/β-catenin 信号通路与食管鳞状细胞癌(ESCC)的临床病理及预后因素的相关性.方法 用实时定量PCR(RT-PCR)和免疫组织化学技术分析70 例ESCC(包括癌组织与癌旁非癌组织)中Wnt1/β-catenin 的表达情况,统计分析其与临床病理及预后的关系.结果 癌组织中Wnt1 mRNA 水平(1.9934 ±1.9888 vs.0.8863 ±0.6658,P ＝0.0000)和蛋白质水平(0.3830 ±0.0947 vs.0.2721 ±0.1474,P ＝0.0000)均较癌旁组织中显著高表达;Wnt1 mRNA 表达与病理分期和淋巴结转移及预后相关(P <0.05),但蛋白质水平未显示相关.癌组织中β-catenin mRNA 水平(0.2854 ±0.1298 vs.0.8863 ±0.6658,P ＝0.0000)和蛋白质水平(0.2835 ±0.0844 vs.0.2352 ±0.0670,P ＝0.003)较癌旁组织中显著高表达,β-catenin mR-NA 表达与病理分期、淋巴结转移及预后相关(P <0.05),但蛋白质水平并未显示相关.在蛋白质水平上,Wnt1 和β-catenin 表达水平无相关性.结论 Wnt1/β-catenin 在ESCC 组织中显著高表达,可能成为判断ESCC 分期和预后的重要分子标记物.且Wnt1/β-catenin mRNA 表达水平与ESCC 临床病理分期、淋巴结转移呈逆相关,mRNA 的异常表达者预后不佳,但可能不是独立预后因素.     

Rac1基因在肝细胞癌中的过表达与转移侵袭的关系

[目的]探讨rac1基因mRNA及其蛋白在肝细胞癌(HCC)中的表达规律及其与转移侵袭的关系.[方法]应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和免疫组织化学(S-P)法检测48例HCC及癌旁肝组织中Rac1基因mRNA及蛋白的表达情况,结合患者的临床病理资料分析Rac1基因与HCC转移侵袭的关系.[结果]HCC组织中Rac1基因mRNA及蛋白的表达水平明显高于癌旁肝组织的表达水平其差异均有显著性(P＜0.05),且Rac1基因蛋白的表达与患者的性别、肿瘤的大小、甲胎蛋白(AFP)、HBsAg以及有无肝硬化无关(P＞0.05),而与肿瘤的分化程度、有无包膜及有无门静脉癌栓有关(P＜0.05).[结论]Rac1基因在HCC的表达与其分化程度、有无包膜及有无门静脉癌栓密切相关,其表达水平可能成为判断HCC转移、侵袭能力重要分子生物学指标.     

磷脂酰肌醇蛋白多糖-3在肝细胞肝癌的表达及其与术后复发的相关性

目的探讨磷脂酰肌醇蛋白多糖-3（GPC-3）mRNA在肝细胞癌（HCC）癌组织及癌旁组织的表达及其与术后复发的相关性。方法用逆转录聚合酶链反应测定60例HCC癌组织及癌旁组织中GPC-3 mRNA的表达。PCR产物经凝胶电泳,比较HCC组织及癌旁组织中GPC-3与-βactin条带的灰度值之比,半定量分析GPC-3 mRNA的表达水平,分析术后3年不易复发HCC患者的癌组织GPC-3 mRNA的表达水平。结果 GPC-3 mRNA在HCC癌组织中高度表达,阳性率为68.3%,癌旁组织中低表达或未见表达,术后3年内未复发的HCC患者癌组织中GPC-3 mRNA呈现低表达水平,GPC-3 mRNA表达与肿瘤大小、肿瘤数目、有无包膜、门静脉癌栓、HBsAg及AFP水平无明显相关。结论 GPC-3 mRNA在HCC癌组织中的表达明显高于癌旁组织,可能是HCC的一种新的潜在的肿瘤特异标志物;癌组织中GPC-3mRNA低表达的HCC患者不易复发,可能是判断HCC进展和评价预后的一个潜在重要指标。     

Hsa＿circ＿0008934在原发性肝细胞癌诊断和预后评估中的临床价值

目的探讨hsa_circ_0008934在原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)诊断及临床预后中的意义。方法转录组测序(RNA-sequening,RNA-seq)检测3例有门静脉侵犯的HCC和3例无门静脉侵犯的HCC癌组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达情况,qPCR检测100对HCC癌与癌旁组织、20例HCC和20例健康人血浆中hsa_circ_0008934表达情况,并分析其与临床病理特征及预后的相关性,受试者工作特征曲线(Receiver operator characteristic curve,ROC)评估hsa_circ_0008934的诊断价值。结果 HCC癌组织和血浆中hsa_circ_0008934的表达水平分别显著高于癌旁组织和健康人,差异有统计学意义(P0.01,P0.01);hsa_circ_0008934在癌组织中的高表达与肿瘤直径(P=0.01)、AFP(P=0.03)及组织分化程度(P=0.01)显著相关。ROC曲线显示,血浆hsa_circ_0008934在鉴别HCC与健康人的曲线下面积(Area under of ROC curve,AUC)为0.851。生存分析表明,hsa_circ_0008934低表达组患者的总生存时间(overall survival,OS)显著长于高表达组(P=0.032);预后多因素分析显示,hsa_circ_0008934(P=0.033)和TNM分期(P=0.018)是HCC预后的独立危险因素。结论 hsa_circ_0008934可作为一种新的生物学标志物用于HCC的诊断和预后评估。     

Notch基因在口腔癌和癌前病变患者癌组织及癌旁组织中的表达

目的研究Notch基因在口腔癌及癌前病变患者癌组织、癌旁组织中的表达情况。方法回顾性选取口腔鳞状细胞癌患者组织标本36例和癌前病变组织标本30例,均取得相对应的癌旁组织标本。检测Notch信号通路受体Notch1、Notch3基因mRNA表达水平,比较不同病变组织Notch1、Notch3基因mRNA表达水平及表达阳性率,分析Notch1、Notch3基因表达阳性率与口腔癌病理特征的关系。结果口腔癌癌组织Notch1、Notch3基因mRNA表达水平均显著高于癌前病变癌组织(P 0. 05);口腔癌癌旁组织Notch1、Notch3基因mRNA表达水平均略高于癌前病变癌旁组织,但差异无统计学意义(P 0. 05)。口腔癌癌组织Notch1、Notch3基因表达阳性率75. 00%、72. 22%均显著高于癌前病变癌组织50. 00%、46. 67%(P 0. 05);口腔癌癌旁组织Notch1、Notch3基因表达阳性率均略高于癌前病变癌旁组织,但差异无统计学意义(P 0. 05)。Notch1基因表达阳性率与口腔癌临床分期、淋巴结转移、病理分级有显著相关性(P 0. 05); Notch3基因表达阳性率与口腔癌临床分期、病理分级有显著相关性(P 0. 05),与淋巴结转移无显著相关(P 0. 05)。结论口腔癌、癌前病变患者癌组织中Notch信号通路受体Notch1、Notch3基因mRNA表达水平较高,Notch基因尤其在口腔癌患者癌组织中表达活跃,且与口腔癌的发生发展具有相关性,但其在癌旁组织中的表达并不活跃。     

UHRF1在肝细胞肝癌中的表达及意义

目的:探讨UHRF1(Ubiquitin-like,containing PHD and RING finger domains 1)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:采用免疫组织化学方法检测556例HCC组织及其癌旁组织中UHRF1的表达,分析其与HCC患者临床病理特征的关系。结果:免疫组织化学结果显示,UHRF1蛋白阳性表达定位于HCC细胞核,UHRF1蛋白在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织。HCC组织中UHRF1蛋白阳性表达率为59%,其表达与肿瘤大小(P0.01)、肿瘤分化(P0.05)和微血管侵犯(P0.01)相关。结论:HCC中UHRF1的表达与其恶性表型相关,UHRF1可能参与HCC的侵袭和转移。     

PYCR1基因在肝细胞癌中的表达及与预后的关系

目的 探讨PYCR1基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系.方法 采用qRT-PCR和Western blot技术对80例HCC与癌旁组织的PYCR1 mRNA和蛋白表达水平进行检测.采用Cox比例风险模型对影响HCC患者预后的因素进行单因素、多...     

聚ADP核糖聚合酶1在人类乳腺癌中的表达及其与临床预后相关因子的关系

目的研究聚ADP核糖聚合酶1(PARP-1)在人类乳腺癌中的表达及其与患者临床预后相关因子间的相关性。方法采用RT-PCR及免疫荧光染色技术,检测66例手术切除的人类乳腺癌组织及癌旁组织中PARP-1的表达,并分析乳腺癌患者的康复相关因子与PARP-1表达间的关系。结果与癌旁组织相比,94.9%(62/66)的癌组织中PARP-1 mRNA表达上调,90.9%(60/66)的癌组织中PARP-1蛋白表达上调。临床分期越晚、肿瘤分化程度越差,PARP-1的标记指数(LI)、表达指数(EI)越大;单纯癌、浸润癌患者中PARP-1的LI、EI值较大;乳腺癌转移患者的PARP-1的LI、EI值显著高于非转移患者。结论PARP-1基因在转录和翻译水平上的过表达与乳腺癌的分期、病理分级、病理类型、肿瘤转移等临床预后相关因子有关。     

肝癌中Survivin表达与PCNA和AFP的关系及意义

目的 :探讨Survivin在原发性肝细胞癌 (HCC)组织中的表达及与PCNA和AFP的关系。方法 :采用Westernblot和RT -PCR检测 4 3例肝癌组织、2 0例癌旁组织和 11例正常肝组织中Survivin蛋白和mRNA的表达情况。免疫组化 (SP法 )检测Sur vivin、PCNA和AFP蛋白的表达情况。结果 :4 3例HCC标本中分别有 30例表达Survivin蛋白 (6 9.8% ) ,除 1例癌旁组织外 ,其它癌旁组织和正常肝组织中未见Survivin蛋白表达。Survivin表达与肝癌的病理分级、临床分期和AFP的表达等无明显相关。Survivin表达与肝癌细胞增殖活性 (PCNA -LI)显著相关 (P <0 .0 5 )。结论 :Survivin在肝癌组织中高表达 ,提示Survivin在肝癌的发生、发展过程中起重要作用 ;Survivin的表达与肝癌细胞增殖活性 (PCNA -LI)显著相关 ,提示Survivin可能促进肝癌细胞的恶性增殖     

结合基序蛋白6在结直肠癌组织中的表达及临床意义

目的探讨RNA结合基序蛋白6(RBM6)在结直肠癌(CRC)中表达水平及临床病理学意义。方法应用免疫组织化学方法检测92例配对的CRC及癌旁组织石蜡包埋标本RBM6表达水平,观察其与CRC病人临床病理学参数的关系;再以Western印迹和qRT-PCR检测28例配对冷冻保存的新鲜CRC及癌旁组织中RBM的蛋白和mRNA表达水平。结果免疫组化结果显示:RBM6在92例CRC表达明显高于癌旁组织表达水平(癌组织30.4%,28/92vs癌旁10.9%,10/92;P0.01)。卡方检验显示:RBM6的表达与CRC肿瘤的大小、分化程度、浸润深度及淋巴结转移无明显相关性(P0.05),但与患者TNM分期和远处转移呈正相关(P=0.026,P=0.021)。单因素分析发现:RBM6高表达CRC患者预后更差(P=0.024)。qRT-PCR和Western印迹结果显示:RBM6在CRC中蛋白和mRNA表达均高于配对癌旁组织(P0.01;P=0.009)。结论 RBM6在CRC中呈高表达,并与患者临床分期、远处转移及不良预后相关,可能参与CRC的恶性进展。     

整合素α6在原发性肝细胞肝癌中的表达及意义

目的:比较整合素α6mRNA在原发性肝细胞肝癌(HCC)癌组织及正常肝组织中表达的差异,分析整合素α6mRNA的表达与HCC的侵袭程度、远处转移、临床分期之间的关系。方法:取肝癌患者手术切除标本,RT-PCR扩增整合素α6mRNA后对扩增产物进行电泳及图象分析。结果:癌组织、癌旁组织与相应正常肝组织中整合素α6mRNA定性表达阳性率差异有统计学意义(P<0.001)。但癌旁组织和正常肝组织之间整合素α6mRNA表达阳性率差异无统计学意义(P=0.4862)。在表达阳性的癌组织中,其半定量分析显示无包膜者高于有包膜者,有肝内或肝外转移者高于无肝内或肝外转移者。随着Edmondson分级增高,整合素α6及β1mRNA表达量不断增高(P<0.001)。结论:整合素α6mRNA在HCC癌组织、癌旁组织和相应正常肝组织中均有阳性表达。但在HCC癌组织中表达明显高于其他组织。HCC癌组织中整合素α6mRNA表达高低与侵袭程度、有无肝内或肝外转移及临床分期密切相关。高表达的整合素α6mRNA预示着肝癌的高度恶性、高侵袭性、高转移性和预后不良。整合素α6mRNA可以作为反映HCC转移和侵袭特性的分子标记物。     

染色质解旋酶DNA结合蛋白7表达与肝癌临床病理特征及预后的关系

目的通过研究肝癌组织内染色质解旋酶DNA结合蛋白7(CHD7)的表达及其与肝癌患者临床病理特征及预后的关系,探讨CHD7作为肝癌预后预测指标的可行性。方法将286例肝切除术后病理确诊为肝细胞肝癌的标本制作成组织芯片。采用免疫组化法检测肝癌及癌旁肝组织中CHD7的表达水平,分析其与肝癌患者临床病理特征及预后之间的关系。结果免疫组化结果显示CHD7在肝癌组织中表达明显高于对应的癌旁肝组织。CHD7高表达与肿瘤数目、肿瘤包膜完整性、肿瘤血管侵犯、TNM分期及BCLC分期密切相关,与肝癌患者术后总体生存率呈负相关,而与肝癌患者术后复发率呈正相关。结论 CHD7在肝癌中明显高表达,可作为肝癌患者预后的独立预测指标之一。     

原发性肝癌组织中LASP-1 mRNA和HPA-1 mRNA表达水平及其临床意义

目的定量检测LIM和SH3蛋白1(LASP-1)mRNA和乙酰肝素酶-1(HPA-1)mRNA在原发性肝癌组织中的表达水平,探讨二者与肝癌发生、侵袭和转移的关系。方法利用实时荧光定量PCR检测法分别检测62例原发性肝癌癌组织、配对癌旁组织(距癌2 cm)和正常肝脏组织(距癌大于5 cm)中LASP-1mRNA和HPA-1 mRNA的表达水平,并分析二者与肝癌临床病理特征的关系。结果肝癌组织、癌旁组织、正常肝组织中HPA-1 mRNA表达水平分别为47.25±16.65、23.15±14.89、7.56±5.15,LASP-1 mRNA的表达水平分别为51.66±20.12、35.73±15.07、10.17±8.29。HPA-1 mRNA及LASP-1 mRNA在癌组织中的表达高于癌旁组织和正常组织(P均<0.05)。HPA-1及LASP-1的表达与肿瘤分化程度、浸润深度、淋巴结转移及TNM分期密切相关(P<0.05,P<0.01),与患者年龄、性别及肿瘤大小无关(P均>0.05)。Spearman等级相关分析显示LASP-1 mRNA和HPA-1 mRNA的表达呈正相关(OR=0.421,P<0.05)。结论肝癌组织中LASP-1 mRNA与HPA-1 mRNA的表达与肿瘤浸润深度、分化程度、淋巴结转移及TNM分期等密切相关。二者联合表达水平的增加可能促进肝癌的侵袭转移。     

胃癌组织中RBMS3及SFRP1的表达水平与临床参数的关系及之间的相关性研究

目的研究单链相互作用蛋白3(RBMS3)及分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)的表达水平与胃癌的临床参数之间的关系及两者表达水平与胃癌患者预后的相关性。方法回顾性收集新鲜人胃癌组织(23例)、对应的癌旁组织(23例),另收集172例胃癌组织及43例癌旁组织制成组织芯片。应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(qRTPCR)检测23对新鲜组织中RBMS3及SFRP1 mRNA的表达水平,同时应用蛋白免疫印迹(WB)技术检测RBMS1及SFRP1的蛋白表达水平。进一步运用免疫组化(IHC)检测172例胃癌组织及43例癌旁组织中RBMS3及SFRP1蛋白的表达水平。结果胃癌组织、癌旁组织中RBMS3及SFRP1均有表达;RBMS3及SFRP1在胃癌组织中的表达水平明显均低于其在癌旁正常组织(P0.05),RBMS3与SFRP1在胃癌组织中的表达水平(mRNA和蛋白)呈正相关;RBMS3在胃癌中的蛋白表达水平与胃癌的分化程度、浸润深度显著相关,SFRP1在胃癌中的蛋白表达水平与胃癌的分化程度显著相关;RBMS3与SFRP1在胃癌中的蛋白表达水平均与胃癌患者预后相关,且两者共表达水平是胃癌患者的独立预后因素。结论 RBMS3及SFRP1在胃癌组织、癌旁组织中差异表达且呈正相关;RBMS3及SFRP1共表达水平可能是胃癌患者预后的一个有价值的生物学指标。