舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

上海市肠炎沙门菌流行特征和分子分型研究

[目的]分析上海市2006—2007年肠炎沙门菌菌株,了解上海市肠炎沙门菌分子流行病学特征。[方法]回顾2002—2007年肠炎沙门菌食品株来源并与肠炎沙门菌腹泻株作耐药性比较;对2006—2007年全球沙门菌监测(GSS)病例和食品分离的肠炎沙门菌进行表型验证、药敏试验和脉冲凝胶电泳(PFGE)分析。[结果]2006—2007年肠炎沙门菌在本市非伤寒沙门菌病例中列首位,而80%的食品株源自禽及禽肉制品,食品株的抗生素耐药性高于腹泻株。2007年肠炎沙门菌腹泻株的耐药谱和2006年有较大差异。包括13株食品株在内共76株肠炎菌株可分为21种PFGE带型,遗传同源性接近80%,优势带型依次为3型(34株)、1型(12株)、2型(5株)和5型(5株),除2型外均发现有与腹泻株同型的食源株。2006和2007年的PFGE 1/2型病例分别为4例和12例。[结论]上海市肠炎沙门菌病例与食用污染的鸡肉等禽类制品有密切关系,PFGE 3型肠炎沙门菌是目前上海市肠炎沙门菌流行株的优势菌型,2007年发现由鹅肝传播的1/2型肠炎沙门菌可能是3型的变异株并有取代之成为流行菌株的趋势。开展对腹泻病例和食物链的综合监测和以实验室为主的实时分子分型检测能快速预警肠炎沙门菌散在爆发和追溯污染源。     

2018—2020年湖州市食源性疾病患者感染沙门菌耐药与分子分型研究

目的 分析湖州市食源性疾病患者所分离沙门菌的血清型别、耐药状况以及分子分型特征,为沙门菌引起的食源性疾病防治提供科学依据。方法 收集2018—2020年湖州市6家食源性疾病监测哨点医院分离到的105株阳性沙门菌株,采用玻片凝集法、微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)法,分别进行血清学分型、抗生素最小抑菌浓度测定和分子分型。结果 105株沙门菌主要是鼠伤寒沙门菌(37/105)和肠炎沙门菌(19/105)。沙门菌菌株对30种抗生素的耐药率为0%～70.48%,氨苄西林耐药率最高,达到70.48%(74/105),其次为四环素和多西环素,耐药率分别为67.67%(71/105)和65.71%(69/105)。分子分型显示,经XbaⅠ酶酶切后,105株沙门菌产生93个PFGE带型,各带型相似度28.50%～100.00%。结论 湖州地区食源性沙门菌耐药情况严重,PFGE带型既有多样性,又具有优势带型。     

北京市40株肠炎沙门菌多重耐药和分子分型研究

目的分析2009-2010年北京市肠炎沙门菌多重耐药和脉冲场凝胶电泳（pulsed-field gel electropho-resis,PFGE）分子分型。方法对2009-2010年北京市肠道门诊监测系统分离到的40株肠炎沙门菌进行生化鉴定、血清分型并运用纸片法进行药敏检测,并采用PFGE进行分子分型。结果发现40株肠炎沙门菌中,32株多重耐药菌株,其中4～5种抗生素耐药27株（84.38%）,10种抗生素耐药1株（3.13%）;可分为14个PFGE带型,其中4个PFGE型的菌株数超过1株。结论北京市肠炎沙门菌分离株多重耐药性比较严重,PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系,但同一PFGE型菌株的多重耐药谱较为接近。     

上海市长宁区2017年肠炎沙门菌多重耐药和分子分型研究

【目的】了解上海市长宁区2017年肠炎沙门菌的分子分型结果及抗菌药物耐药情况。【方法】对2017年上海市长宁区的感染性食源性病原菌监测标本进行沙门菌的分离鉴定、血清分型,检出33株肠炎沙门菌,运用国家致病菌识别网技术手册(2017年)的分子分型方法进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型,使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物耐药性的测定。【结果】33株肠炎沙门菌共分为11种带型,优势带型集中在Clade1中,共计30株。耐2种及2种以上抗菌药物的有22株,耐6种及6种以上抗菌药物的19株,并出现2株四代头孢全耐药。【结论】长宁区肠炎沙门菌多重耐药现象比较普遍,PFGE型别差异较小,相同PFGE型别的菌株多重耐药表型相近。     

2018—2021年北京市大兴区腹泻患者沙门菌分子分型及耐药性分析

目的 了解北京市大兴区肠道门诊腹泻患者沙门菌的感染情况、流行病学和病原学特征及耐药状况，为沙门菌防控及临床治疗提供依据。方法 2018—2021年收集大兴区3家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本进行沙门菌检测，对分离到的沙门菌开展血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 4年共检测粪便标本1 499件，检出沙门菌65株（4.34%），肠炎沙门菌（53.85%）为主要流行血清型；不同年龄组人群中沙门菌检出率差异有统计学意义（P<0.01），其中1～<11岁检出率最高（10.30%）；不同性别及职业人群沙门菌检出率差异均无统计学意义（均P>0.05）。药敏结果显示，沙门菌耐药程度差异较大，除对头孢西丁、美罗培南和阿奇霉素完全敏感外，对其他抗菌药物均有一定的耐药性。35株肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳后出现20种带型，其中B8和B10带型为优势带型，菌株之间的相似系数为40.6%～98.7%。结论 北京市大兴区沙门菌的优势血清型为肠炎沙门菌，PFGE带型呈高度多态性，耐药性较强，临床治疗时需合理使用抗菌药物。     

北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析

目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%～100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。     

2015—2016年淮安市售禽畜肉中沙门菌污染及其病原学特征北大核心CSCD

目的了解市售禽畜肉中沙门菌的污染情况,并研究分离菌株的病原学特征。方法 2015—2016年以随机采样方式从淮安市8个县区的超市和农贸市场采集禽畜肉样品,按照GB 4789.4—2010《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》方法检测沙门菌。对分离的沙门菌株进行血清分型,耐药特性分析,毒力基因携带情况分析以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究。结果 368份畜禽肉中共有37份检出沙门菌,总检出率为10.05%,其中,鸡肉、鸭肉、猪肉和牛羊肉中沙门菌的检出率分别为14.14%(14/99)、11.11%(10/90)、10.34%(12/116)和1.59%(1/63)。37株沙门菌共有8种血清型,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。药敏试验说明本地禽畜源沙门菌对氨苄西林和萘啶酸的耐药率最高(72.97%),对头孢西丁的耐药率最低(8.11%),不同样本来源及不同血清型沙门菌的耐药表型存在差异。肠炎沙门菌中inv H和sop E的携带率最高,鼠伤寒沙门菌中inv H、sop E、rhu M的携带率最高。PFGE分型研究发现,所有肠炎沙门菌的带型相似度均在81.56%以上,相同样本来源的肠炎菌株之间的亲缘关系更近;鼠伤寒沙门菌的带型各不相同,分离株的基因型别呈现多样性。结论淮安市售禽畜肉中沙门菌的污染率较高,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。沙门菌分离株的耐药状况严重,毒力基因携带率高。     

2015—2016年淮安市售禽畜肉中沙门菌污染及其病原学特征

目的了解市售禽畜肉中沙门菌的污染情况,并研究分离菌株的病原学特征。方法 2015—2016年以随机采样方式从淮安市8个县区的超市和农贸市场采集禽畜肉样品,按照GB 4789.4—2010《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》方法检测沙门菌。对分离的沙门菌株进行血清分型,耐药特性分析,毒力基因携带情况分析以及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究。结果 368份畜禽肉中共有37份检出沙门菌,总检出率为10.05%,其中,鸡肉、鸭肉、猪肉和牛羊肉中沙门菌的检出率分别为14.14%(14/99)、11.11%(10/90)、10.34%(12/116)和1.59%(1/63)。37株沙门菌共有8种血清型,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。药敏试验说明本地禽畜源沙门菌对氨苄西林和萘啶酸的耐药率最高(72.97%),对头孢西丁的耐药率最低(8.11%),不同样本来源及不同血清型沙门菌的耐药表型存在差异。肠炎沙门菌中inv H和sop E的携带率最高,鼠伤寒沙门菌中inv H、sop E、rhu M的携带率最高。PFGE分型研究发现,所有肠炎沙门菌的带型相似度均在81.56%以上,相同样本来源的肠炎菌株之间的亲缘关系更近;鼠伤寒沙门菌的带型各不相同,分离株的基因型别呈现多样性。结论淮安市售禽畜肉中沙门菌的污染率较高,优势血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。沙门菌分离株的耐药状况严重,毒力基因携带率高。     

菏泽市2021年畜肉及其制品沙门菌耐药分析及脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 了解菏泽市2021年售畜肉及其制品中沙门菌的流行趋势、常见血清型、耐药现状及分子分型情况。方法 对2021年菏泽市销售场所售卖的畜肉及其制品进行抽样检测，分离出沙门菌41株，并进行血清型分型。对全部菌株进行耐药分析和脉冲场凝胶电泳分子分型分析。结果 41株沙门菌分属于19个血清型；优势血清型主要有伦敦沙门菌(17.07%)、德贝沙门菌(14.63%)、瑞森沙门菌(9.76%)、阿格纳沙门菌(9.76%)、鼠伤寒沙门菌(7.32%)。41株沙门菌分成了36个PFGE带型。沙门菌对头孢类抗生素较为敏感，对亚胺培南最为敏感，敏感率为97.56%;只有2株对14种抗生素敏感，其余39株都有不同程度的耐药。结论 菏泽市畜肉及其制品中的沙门菌具有不同的血清型和PFGE型别，且具有不同程度的耐药性；应加强沙门菌的PFGE分子分型和耐药性检测，为沙门菌疾病的预防、控制及治疗提供科学依据。     

2011—2013年北京某城区感染性腹泻患者致病菌检测分析

目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE分析。结果 1 179份标本,共培养肠道病原菌330株,其中检出居前4位的肠道致病菌依次为志贺菌属93株(28.18%)、沙门菌属69株(20.91%)、副溶血性弧菌44株(13.33%)及致泻性大肠埃希菌11株(3.33%)。18株宋内志贺菌PFGE分为8个型别,聚类相似度接近88%;69株沙门菌属细菌分为18个血清型,共41种PFGE型别,其中山夫登堡沙门菌和肠炎沙门菌具有明显的优势带型;23株副溶血性弧菌PFGE型别较为分散。结论 3年间感染性腹泻患者致病菌的血清型和PFGE带型分布较为广泛,应注意沙门菌属和志贺菌属细菌的PFGE优势菌型,警惕其引发的感染性腹泻暴发流行。     

长沙市沙门菌表型特征及PFGE分子分型

目的研究长沙市沙门菌的血清型分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自长沙地区食源性疾病粪便标本及市售食品中的70株沙门菌,用玻片凝集试验确定血清型,微量肉汤稀释法检测14种抗生素的敏感性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占51.43%,其次是肠炎沙门菌,占7.15%。在抗生素敏感性测试中,对氨苄青霉素、磺胺嘧啶和氯霉素的耐药率较高,分别为68.57%、61.43%和57.14%。62.86%(44/70)的沙门菌呈多重耐药,且鼠伤寒沙门菌的多重耐药率比其他血清型高,差异有统计学意义(χ2=7.068,P0.01)。PFGE分型结果显示69株沙门菌按照100%的相似度可分为57个PFGE型,36株鼠伤寒沙门菌可分为4个聚类,相似度在58.1%~100%之间。结论本市的沙门菌以鼠伤寒和肠炎沙门菌为主,PFGE分型结果显示可能存在沙门菌的流行株,且菌株耐药形势严峻。     

温州市沙门菌血清型、耐药性和PFGE指纹图谱研究

目的了解2017年温州市沙门菌的血清型、耐药情况和PFGE指纹图谱。方法对分离自腹泻病例的77株沙门菌进行血清分型;采用微量肉汤稀释法对优势菌株进行12种抗生素的药敏试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行指纹图谱分型研究。结果 77株沙门菌共分为23种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌,22株占28.58%;肠炎沙门菌,11株占14.29%。33株优势血清型沙门菌对氨苄西林耐药率最高(84.85%),其次为四环素(69.70%)和萘啶酸(63.64%);多重耐药14株,占42.42%;除氨苄西林、萘啶酸外,鼠伤寒沙门菌的耐药率普遍高于肠炎沙门菌。22株鼠伤寒沙门菌可分成16种PFGE指纹图谱;11株肠炎沙门菌分成3种PFGE指纹图谱。结论温州市食源性沙门菌的血清型分布广泛,耐药状况严重,PFGE指纹图谱呈多样性,其聚集性与血清型存在关联性。     

广州市136株沙门菌耐药表型与分子分型研究

目的研究广州市2013年腹泻患者感染的沙门菌的血清型分布、耐药情况以及分子流行特征。方法用传统血清学方法鉴定沙门菌的血清型,并用纸片扩散法进行抗菌药物敏感性试验,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对斯坦利沙门菌、肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌和Ⅰ4,5,12:i:-沙门菌进行分子分型研究。结果 136株沙门菌被鉴定为29种血清型,数量居前三位的血清型为斯坦利沙门菌(19.9%)、肠炎沙门菌(15.4%)和鼠伤寒沙门菌(15.4%)。所有沙门菌菌株对四环素和萘啶酸耐药率最高,分别达到44.8%和39.7%,对环丙沙星的敏感率仅为19.9%;对头孢他啶、头孢噻肟和头孢曲松的耐药率均为7.4%。对3类及以上抗生素耐药的多重耐药菌有56(41.2%)株。27株斯坦利沙门菌和21株肠炎沙门菌分别可分为25个PFGE型和15个PFGE型。结论在广州市引起腹泻的沙门菌主要以斯坦利沙门菌、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,分成多种PFGE型,呈高度散发。本地区沙门菌菌株的多重耐药现象严重,对于氟喹诺酮类和头孢类药物的耐药性升高。     

长沙市某医院2015年夏季粪便分离的肠炎沙门菌的耐药性及聚集性分型分析

目的 了解长沙市某医院2015年夏季从腹泻病人粪便中分离到的肠炎沙门菌的耐药性特征及其流行关系。 方法 经生化和血清学鉴定后,对分离自腹泻病人大便的9株肠炎沙门菌菌株进行药物敏感性试验;脉冲场凝胶电泳对菌株进行PFGE分型分析。 结果 通过生化和血清学实验共鉴定到9株肠炎沙门菌,药敏试验中所有菌株对呋喃妥英耐药,对亚胺培南、环丙沙星、左氧氟沙星、复方新诺明敏感,对氨苄西林、氨曲南及头孢类抗生素部分耐药。PFGE结果显示9株菌株共分为四个带型,相似度达到了87.34％~96.30％,分离时间接近的菌株,PFGE带型一致。 结论 肠炎沙门菌对抗菌药物的敏感性仍然较高,但需注意产β-内酰胺酶趋势。相同时期分离到的肠炎沙门菌菌株在流行病学上高度相关,在长沙地区可能具有优势带型,并且可能造成一定程度的传播。     

辽宁省肠炎沙门菌耐药性及分子分型特征

目的分析近年辽宁省腹泻病例中检出的肠炎沙门菌血清型、耐药性及分子分型。方法对辽宁地区50株沙门菌临床分离株进行血清型分型;采用微量肉汤法,进行16种抗菌药物的药敏试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对选取的16株肠炎沙门菌株进行基因分型。结果肠炎沙门菌是沙门菌中的优势血清型。所有菌都对链霉素耐药。16株肠炎沙门菌分成7种型别,其中6个PFGE型别间仅有1条~3条带的差异,相似度在78.68%~100%,菌株间具有很近的亲缘关系。结论辽宁省感染性腹泻病例中沙门菌感染率较低。PFGE分子分型较多,无明显聚集性。     

河南省2009-2011年伤寒副伤寒沙门菌分子分型与耐药研究

目的 分析2009-2011年河南省伤寒副伤寒沙门菌临床分离株耐药状况与PFGE分型特征。方法 根据PulseNet公布的伤寒副伤寒沙门菌PFGE分型操作规程与美国临床实验室标准协会(CLSI)沙门菌K-B法药敏测试方案,对2009-2011年分离自河南省监测哨点医院78株伤寒副伤寒沙门菌进行抗生素药敏测试与PFGE分子分型。结果 78株伤寒副伤寒沙门菌对8类13种抗生素均有不同程度的耐药,62株为多重耐药菌株(79.5%),其中耐2～3种4株(5.1%),耐5～8种41株(52.6%),耐9～10种14株(17.9%),耐11～12种3株(3.8%);菌株对头孢类、喹诺酮类等5类抗生素耐药率总体呈上升趋势。经XbaⅠ酶切与PFGE后,获得14种带型,每种带型包含菌株数1～47株不等,相似度为66.03%～100.00%。结论 2000-2011年河南省临床分离的伤寒副伤寒沙门菌耐药状况普遍比较严重,PFGE带型呈现多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性和聚集性。     

2021年长沙市食源性疾病沙门菌血清分型及PFGE分子分型分析

目的 了解长沙市食源性疾病沙门菌的血清分型和PFGE分子分型情况,为食源性疾病防控提供依据。 方法 按《食源性疾病监测工作手册》收集长沙市4所哨点医院食源性疾病病例粪便标本,从中分离沙门菌,并对沙门菌进行血清分型和凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE),通过Bionumerics 7.6 软件对电泳图谱进行分析。 结果 全年共监测528份标本,检出沙门菌50株,检出率为9.47%,阳性病例主要集中在5岁及以下年龄段,占74.00%(37/50),发病主要在夏秋5—9月,占全年的76.00%(38/50)。血清型共有12种,主要血清型是鼠伤寒沙门菌占60.00%(30/50),其次为斯坦利沙门菌4株占8.00%,肠炎沙门菌3株占6.00%。 50株沙门菌PFGE分型为41种带型,相似度为55.7％～100％,呈现多态性,主要分成两个簇,有8组相似度 100％ 的菌株,共17株(占34.00%,17/50),主要是鼠伤寒沙门菌;有10簇相似度90%以上的克隆系,包含32株沙门菌。 结论 长沙市2021年食源性疾病沙门菌感染的优势血清型是鼠伤寒沙门菌,沙门菌PFGE分子分型带型呈多态化,PFGE分型可识别共同感染来源的病例,可用于暴发疫情识别和控制。     

贵州省动物性食品中沙门菌耐药及分子特征相关性研究

目的 了解贵州省动物性食品中沙门菌的耐药和分子型别特征及二者相关性,为我省食源性沙门菌感染及防控提供科学依据。方法 对贵州省9个市(州)2017—2021年市售动物性食品中分离的146株沙门菌进行血清学分型,采用微量肉汤稀释法测定菌株对15种抗生素的耐药性,脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(multi-locus sequence typing, MLST)对菌株进行分子分型。结果 146株沙门菌分出27种血清型,以鼠伤寒(31/146,21.2%)、德尔卑(26/146,17.8%)、肠炎沙门菌(16/146,11.0%)为优势血清型。146株菌耐药率为79.5%(116/146),多重耐药率达60.3%(88/146),共有72种耐药谱。对氨苄西林、四环素耐药率分别达61%、64.4%。129株菌经PFGE共分出52个聚类76种带型,相似度在53.5%～100%,146株菌经MLST共检出29种ST型,以ST40(26/146,17.8%)、ST34(17/146,11.6%)、ST11(16/146、1...     

广东省2007年度非伤寒沙门菌监测及病原学特征分析

目的 了解广东省腹泻病患者中非伤寒沙门菌感染情况和菌株的血清型别、分布、耐药性变化.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2007年度共检测1128份腹泻粪便标本,分离到71株沙门菌,阳性检出率为6.29%;共分得29种血清型,肠炎和鼠伤寒沙门菌居多;大多数沙门菌对常用的头孢类和喹诺酮类抗生素敏感,鼠伤寒沙门菌的耐药率普遍较肠炎和斯坦利沙门菌高;除肠炎沙门菌外,其余的血清型没有同一PFGE型别的菌株;用Xba Ⅰ酶切17株肠炎沙门菌可分为PFGE-XbaⅠ 1～8型,其中PFGE-XbaⅠ 4型为优势型别.用Sfi Ⅰ和Not Ⅰ酶对12株肠炎沙门菌进行再分型,综合用Xba Ⅰ/Sfi Ⅰ/Not Ⅰ三种酶的结果 发现仍有三组菌的PFGE图谱是完全一致的.结论 2007年度广东省非伤寒沙门菌的感染多数为散发病例,头孢类和喹诺酮类抗生素是治疗非伤寒沙门菌感染的首选药物.