沙门菌脉冲场凝胶电泳分型与血清型的对应关系

目的分析沙门菌脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)与血清分型之间的对应关系.方法选择中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络PulseNet China沙门菌监测数据中鼠伤寒(Typhimurium)、肠炎(Enteritidis)、德尔卑(Derby)、阿贡纳(Agona)及山夫登堡(Senftenberg)前五位常见血清型菌株共1230株,进行PFGE聚类分析,以血清分型作为参照进行比对.确定这5种血清型PFGE优势带型的共有条带.结果1230株菌株中,1149株经PFGE预测的血清型与实际血清型一致,PFGE预测血清型的准确率为93.4%.5种血清型经PFGE预测的血清型阳性预测值多在90.0%以上、阴性预测值均在95.0%以上.结论PFGE聚类对5种常见血清型沙门菌血清分型具有较好的提示及验证作用.     

沙门菌血清及脉冲场凝胶电泳分型

目的 分析吉林省食品中分离的沙门菌血清型和脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别,探讨吉林省食品中沙门菌污染的同源性。方法 于2011年3月-2012年4月,对从市售生鸡肉和中式凉拌菜中分离出的28株沙门菌进行血清学和PFGE分子分型,采用BioNumerics version 6.0软件分析比较同源性。结果 28株沙门菌血清型分别为15株肠炎沙门菌、4株印弟安纳沙门菌、2株猪伤寒沙门菌、2株亚利桑那菌和5株血清未定型沙门菌;PFGE结果主要分为4个大群,其中1群包括14株,相似度为87.3%~100%;2群包括7株,分为2个亚群,2A亚群包括6株,相似度为91.9%~100%,2B亚群1株,相似度为73.6%; 3群包括3株,相似度为88.9%~100%;4群包括4株,分为2个亚群,4A亚群包括3株,相似度为84.6%~94.7%,4B亚群1株,相似度为72.7%。结论 吉林省食品中沙门菌血清型以肠炎沙门菌为主;PFGE结果显示相同血清型别菌株具有高度同源性。     

江苏省食品中沙门菌的监测及其脉冲场凝胶电泳分型研究

目的:建立脉冲场凝胶电泳(PFGE)细菌分型方法,研究我省不同地区、不同种类食品中分离的沙门菌菌株间的同源关系。方法:对2008年从不同地区不同种类食品中分离出的21株沙门菌进行PFGE分子分型,所得结果用BioNumerics软件进行分析。结果:分离的沙门菌存在多种PFGE型别,扬州的生猪肉中分离的沙门菌存在一定的同源关系,2号、3号与4号菌株有88%同源。但无论是同一地区还是同种食品,都没有发现完全相同的PFGE分子型。结论:与其他分型方法相比,PFGE是一种具有高分辨率,高稳定性和高重复性的全新的细菌分子分型方法。在食品安全事件的处理中,它将成为通过细菌分子分型追踪传染源的快速有效方法。     

伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

目的：运用脉冲场凝胶电泳研究宁波市伤寒沙门菌的分子流行病学。方法：选择XbaⅠ酶对伤寒沙门菌染色体DNA进行酶切，采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱，了解其流行状况。结果：14株伤寒沙门菌，根据电泳图谱分析，可分为3个带型。结论：PFGE具有分辨力高，重复性好的特点，是研究伤寒沙门菌分子流行病学较好的基因分型方法。     

一起甲型副伤寒沙门菌暴发的脉冲场凝胶电泳分型及其耐药性

目的了解2006年福建省某市甲型副伤寒沙门菌暴发流行的分子型别和耐药情况，为流行病学调查和疾病控制提供依据。方法采用脉冲场凝胶电泳方法和WHO推荐的药敏纸片法对甲型副伤寒沙门菌病人分离菌株进行分子分型和药敏试验。结果35株病人分离株PFGE图谱一致，与江西和福建省往年分离株的带型相似度为100％，与天津的分离株带型相似度96．5％。药敏结果显示，35株病人分离株对氨苄西林、阿莫西林＋棒酸、头孢噻肟、头孢泊肟、头孢他啶、氯霉素、环丙沙星和庆大霉素均为敏感，对头孢噻呋和四环素的敏感率在80％以上，对链霉素的敏感率为48．6％，对复方磺胺甲嘌唑的敏感率为5．7％，对萘啶酸、磺胺药和甲氧苄啶均为耐药。结论本次流行菌株的PFGE分子型别为常见甲型副伤寒沙门菌代表性带型。     

脉冲场凝胶电泳在沙门菌食物中毒调查检验中的应用

[目的]为肠炎沙门菌（Salmonella enteritidis）食物中毒的判定提供实验室检测依据。[方法]采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对1起食物中毒病人分离株和福建省以往分离的肠炎沙门菌株进行分子分型。[结果]不同病人的6株肠炎沙门菌PFGE结果均为同一型别,与往年分离的病人分离株的型别有异。[结论]PFGE分型技术可用于肠炎沙门菌的准确分型,有助于食物中毒的流行病学分析、溯源、判定和控制。     

2009年江苏省伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳基因分型分析

目的:对江苏省2009年分离出的伤寒沙门菌进行同源性分析.方法:用生化和血清学方法,对江苏省2009年从肠道传染病患者中分离到的伤寒沙门菌进行鉴定.伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析.结果:共从江苏省9个地区分离得到39株伤寒沙门菌,BioNumerics分析结果显示,共有31个不同的PFGE带型出现,除5株以外,其余34株分布于8个相似性在85%以上的簇内.结论:江苏省2009年可能存在8个主要的伤寒沙门菌克隆,这些克隆传播可能是同期伤寒流行的主要病原.PFGE指纹图谱为伤寒沙门菌分子分型网络监测打下了良好的基础,为疾病主动监测和传染来源追踪提供了技术支持.     

2019年—2021年衡阳市食源性沙门菌血清型、分子分型及耐药性研究

目的 了解衡阳市食源性疾病沙门菌血清型分布、脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)分型及耐药特征。方法 对2019年—2021年食源性疾病患者的粪便/肛拭子进行沙门菌分离鉴定及血清分型,微量肉汤稀释法进行药敏实验,PFGE分型,结果用SPSS 18.0软件进行统计分析,BioNumerics软件聚类分析。结果 沙门菌总检出率为16.3%,不同年份检出率差异无统计学意义(χ²=0.169,P=0.919);3岁以下婴幼儿检出率最高,为65.1%;男性检出率(61.1%)高于女性(38.9%)。血清型以鼠伤寒沙门菌(53.0%)占优势。所有沙门菌对亚胺培南敏感,对四环素耐药最高;耐3种及以上抗生素的菌株占65.1%;3年间耐药情况无明显变化。79株鼠伤寒沙门菌共产生64种PFGE带型,相似度为71.3%～100%,有12对完全相同的PFGE图谱。结论 衡阳市2019年—2021年食源性沙门菌检出率较高,3岁以下婴幼儿检出率最高,耐药严重,PFGE带型呈多态性分布。     

2005年河南省局部地区伤寒副伤寒沙门菌株脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 了解河南省伤寒、副伤寒沙门菌主要流行菌型.方法 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分型,NTSYSpc 2.1软件聚类分析.结果 来自河南省两个监测点的伤寒、副伤寒沙门菌6株分离菌,根据XbaI酶切PFGE基因指纹图谱分析,6株菌出现5个PFGE基因型别:甲、乙副伤寒沙门菌,伤寒沙门菌3个PFGE型别.结论明确了2...     

多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌分子分型的比较

目的 比较多位点序列分型技术和脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术在肠炎沙门菌菌株间分型的分辨率。方法 分别建立肠炎沙门菌的6个管家基因thrA、pure、sucA、aroC、hemD、dnaN和一个特异性的DNA标记Sdf Ⅰ的多位点序列分型技术，及以寡切点的XbaⅠ、SpeⅠ作为限制性内切酶的PFGE方法，并应用上述方法对食品中的分离株进行分型，比较两种方法的分辨率。结果 PFGE可以将50株肠炎沙门菌分为11个型。并且通过双酶系统的双重PFGE分型，还可以将PFGE型别再精细划分为亚型；MLST则揭示了在同一血清型内部，各菌株之间的管家基因碱基序列高度保守，而在沙门菌不同血清型的核苷酸序列之间，则分别存在不同数量的碱基差异。即MLST方法只能用于血清型之间，不能在血清型内部进行分型研究。结论 与MLST比较，PFGE方法在肠炎沙门菌的分型方面显示了比较高的分辨率。     

脉冲场凝胶电泳对一起肠炎沙门菌食物中毒的分型研究

目的通过实验室检测分析,查明一起疑似群体食物中毒原因。方法采集样品19份(食物7份、病人肛拭子12份),按国家有关标准进行病原分离鉴定,用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对分离的菌株进行同源性分析。结果 19份样本均检出肠炎沙门菌,其生化、血清学试验结果均一致。结论根据病人临床症状、现场流行病学和卫生学调查及实验室检测结果,证实是一起由肠炎沙门菌污染食物引起的中毒。     

脉冲场凝胶电泳技术在鼠伤寒沙门菌分型中的应用

[目的]探讨脉冲场凝胶电泳(PFGE)在鼠伤寒沙门菌分型中的应用。[方法]选择XbaⅠ酶对鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切、脉冲场凝胶电泳。电泳带用Freeview软件进行相似性比较。[结果]13株鼠伤寒沙门菌经PFGE，根据其条带的差异可分为10个PFGE型别。[结论]PFGE法重复实验结果稳定，分型力较强，适合鼠伤寒沙门菌分型应用。     

北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析

目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%～100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。     

沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型在流行病学调查中的应用

沙门菌造成的食物中毒和食源性疾病暴发是全球性的公共卫生问题.对人感染的沙门菌进行血清分型,进一步对同一血清型菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型,可以增强识别食源性疾病暴发的能力,发现暴发病例,掌握流行趋势,追溯感染源头.此文对沙门菌血清分型和脉冲场凝胶电泳分子分型的研究进展及应用作了综述.     

2018—2021年北京市大兴区腹泻患者沙门菌分子分型及耐药性分析

目的 了解北京市大兴区肠道门诊腹泻患者沙门菌的感染情况、流行病学和病原学特征及耐药状况,为沙门菌防控及临床治疗提供依据。方法 2018—2021年收集大兴区3家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本进行沙门菌检测,对分离到的沙门菌开展血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 4年共检测粪便标本1 499件,检出沙门菌65株（4.34%）,肠炎沙门菌（53.85%）为主要流行血清型;不同年龄组人群中沙门菌检出率差异有统计学意义（P<0.01）,其中1～<11岁检出率最高（10.30%）;不同性别及职业人群沙门菌检出率差异均无统计学意义（均P>0.05）。药敏结果显示,沙门菌耐药程度差异较大,除对头孢西丁、美罗培南和阿奇霉素完全敏感外,对其他抗菌药物均有一定的耐药性。35株肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳后出现20种带型,其中B8和B10带型为优势带型,菌株之间的相似系数为40.6%～98.7%。结论 北京市大兴区沙门菌的优势血清型为肠炎沙门菌,PFGE带型呈高度多态性,耐药性较强,临床治疗时需合理使用抗菌药物。     

广州市市售食品中部分沙门菌耐药性及分子分型特征

目的 分析近年来广州市市售食品中部分沙门菌的耐药情况和分子分型特征,为广州市沙门菌疾病的防控提供实验室数据.方法 对分离到的沙门菌进行血清分型,药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE),并用BioNumerics软件分析菌株间的同源性.结果2016-2...     

江苏省2012-2015年伤寒/副伤寒沙门菌耐药及分子分型研究

目的 回顾性分析2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌的耐药表型和分子分型特征。方法 采集江苏省伤寒/副伤寒监测病例的血液和粪便标本,分离培养伤寒/副伤寒沙门菌后进行生化鉴定和血清分型;采用Kirby-Bauer纸片法检测菌株对抗菌药物的敏感性;应用PFGE技术对伤寒和甲型副伤寒沙门菌进行分子分型。结果 134株伤寒沙门菌和甲型副伤寒沙门菌对萘啶酸的耐药率最高,分别为61.2%和86.7%,其余抗生素的耐药率均低于15.0%。伤寒和甲型副伤寒沙门菌中只耐1种抗生素的菌株最多,多重耐药菌在伤寒沙门菌中占2.6%,而在甲型副伤寒沙门菌中占13.3%。2015年伤寒沙门菌的全敏感菌株构成比较2012年增加了44.3%,同年副伤寒沙门菌中出现了耐5种和6种抗生素的多重耐药株。甲型副伤寒沙门菌可分为8种PFGE型别,多重耐药株与其他菌株条带相似性低,不同型别与耐药谱有对应关系;伤寒沙门菌可分为68种PFGE型别,不同型别间变异度较大,与耐药谱无对应关系。结论 2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌对抗生素的耐药性总体随时间降低,耐药种类数有所增加。伤寒沙门菌株PFGE带型呈现多样性,无耐药谱对应性;而甲型副伤寒菌株PFGE带型较少,有耐药谱对应性。需要加强重点地区重点型别菌株的监测。     

河南省2009-2011年伤寒副伤寒沙门菌分子分型与耐药研究

目的 分析2009-2011年河南省伤寒副伤寒沙门菌临床分离株耐药状况与PFGE分型特征。方法 根据PulseNet公布的伤寒副伤寒沙门菌PFGE分型操作规程与美国临床实验室标准协会(CLSI)沙门菌K-B法药敏测试方案,对2009-2011年分离自河南省监测哨点医院78株伤寒副伤寒沙门菌进行抗生素药敏测试与PFGE分子分型。结果 78株伤寒副伤寒沙门菌对8类13种抗生素均有不同程度的耐药,62株为多重耐药菌株(79.5%),其中耐2～3种4株(5.1%),耐5～8种41株(52.6%),耐9～10种14株(17.9%),耐11～12种3株(3.8%);菌株对头孢类、喹诺酮类等5类抗生素耐药率总体呈上升趋势。经XbaⅠ酶切与PFGE后,获得14种带型,每种带型包含菌株数1～47株不等,相似度为66.03%～100.00%。结论 2000-2011年河南省临床分离的伤寒副伤寒沙门菌耐药状况普遍比较严重,PFGE带型呈现多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性和聚集性。     

中国四省甲型副伤寒分离株脉冲场凝胶电泳分析及分型数据库建立

目的对中国4个甲型副伤寒流行省份的分离株进行标准化脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型分析。方法对来自4个省的甲型副伤寒沙门菌利用XbaⅠ酶切染色体DNA进行PFGE分析，利用BioNumerics建立数据库和进行相似性聚类。结果分离自1998-2002年的89株甲型副伤寒分离株共有11种PFGE带型，这些菌株中具有优势带型。有3种带型相似性在96．3％，这3种带型的菌株占到分析菌株的865％，并在不同省份和年度中出现。结论建立了中国甲型副伤寒沙门菌的用于网络监测分析的PFGE技术和数据库，近年中国部分省份的甲型副伤寒沙门菌分离株PFGE型别集中，存在同型菌株的广泛流行。     

沙门菌脉冲场凝胶电泳分型研究

目的为研究河北省食品中污染的主要沙门菌菌株间的同源关系,特建立了脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,通过PFGE分型研究在我省建立沙门菌DNA指纹图谱基因库,以便将来对不同来源的沙门菌DNA图谱进行即时比较,确定同源性,进而确定食源性疾病的传染源、传播途径、流行范围等,为从根本上防止食源性疾病的发生提供技术基础.方法对2005～2007年间我省食源性致病菌监测网从各类食品样品中分离出的7种主要沙门菌(山夫登堡沙门菌、鸭沙门菌、阿贡纳沙门菌、猪霍乱沙门菌、德比沙门菌、伊鲁木沙门菌、肠炎沙门菌),用蛋白酶K和TE缓冲液提取菌体DNA后,用Xba I限制性内切酶消化胶块,然后在CHEF-DRⅢ型仪器上进行脉冲场凝胶电泳,电泳条件为0.5 ×TBE电泳缓冲液、冷却温度14℃、initial switch 2.16 8,final switch 63.8 8,time17hours,angle=120,6volt/cm.应用H9812作为脉冲场凝胶分子量标准.结果我省7种主要沙门菌存在的PFGE型别较多,各菌株间亲缘关系较远,在同种沙门菌间相似性系数最小值为4.4%,但也有同源菌株存在.结论7种主要沙门菌均未显示流行趋势,同时也表明PFGE是一种灵敏、可靠的研究沙门菌分子流行病学的基因分型方法.