铜绿假单胞菌整合子Ⅰ和ISCR1分布及ERIC-PCR分型

目的研究临床分离铜绿假单胞菌的整合子Ⅰ和ISCR1的分布情况,并对其进行基因分型。方法分离临床234株铜绿假单胞菌,用WHONET5.4分析菌株药敏情况,PCR检测整合酶Ⅰ、整合子Ⅰ、ISCR1以及ISCR1携带的耐药基因。ERIC-PCR进行基因分型。结果铜绿假单胞菌对阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林、氯霉素、头孢唑啉、米诺环素、氨苄西林/舒巴坦高度耐药,对环丙沙星、头孢他啶、头孢哌酮/舒巴坦、阿米卡星、亚胺培南、美洛培南较敏感,118株整合酶Ⅰ阳性,95株Ⅰ类整合子可变区阳性,3株ISCR1和ISCRI携带的耐药基因阳性。118株整合酶Ⅰ阳性铜绿假单胞菌分为89个基因型。结论Ⅰ类整合子广泛存在于铜绿假单胞菌中,ISCRI携带率较低,ERIC-PCR可用于临床分离铜绿假单胞菌的基因分型。     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌Ⅰ类整合子及ISCR1与细菌耐药性的相关性研究

目的探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌临床分离株Ⅰ类整合子和插入序列共同区(ISCR1)的分布情况以及所携带耐药基因的种类,分析其结构及其与耐药性关系。方法收集并鉴定临床分离非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌株44株。采用VITEK2COMPACT全自动微生物鉴定药敏分析仪和纸片扩散法进行常规药物敏感试验,聚合酶链反应(PCR)检测整合酶Ⅰ、ISCR1及二者可变区携带的耐药基因。结果 44株肺炎克雷伯菌32株Ⅰ类整合子阳性,未检出Ⅱ/Ⅲ类整合子基因,29株Ⅰ类整合子可变区阳性,携带耐药基因aadA;6株ISCR1阳性,其中1株ISCR1携带的耐药基因sul1;5株同时携带Ⅰ类整合子和ISCR1基因的菌株有1株显示两种元件以串联的形式存在于耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌中。药敏试验结果显示,携带Ⅰ类整合子菌株比未携带Ⅰ类整合子菌株耐药性高。结论Ⅰ类整合子广泛存在于耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌中,对菌株耐药性有影响。ISCR1携带较少,其中两种元件以串联形式存在的复合结构影响耐药基因在不同耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株间的水平传播。     

耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的耐药机制

目的探讨该院耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌的耐药机制。方法采用ATB Expression进行细菌鉴定和药物敏感试验。应用PCR法对耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌耐药基因IMP、VIM和外膜孔蛋白基因OprD2进行检测。结果 70株耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌对多黏菌素、阿米卡星、庆大霉素耐药率分别为1.4%、47.1%、65.7%,对头孢他啶、头孢吡肟、环丙沙星的耐药率分别为64.3%、60.3%、71.4%;70株耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌中,IMP阳性30株(42.9%)、VIM阳性13株(17.6%),膜微孔蛋白OprD2缺失70株(100.0%)。结论耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌多重耐药情况严重。外膜孔蛋白基因OprD2的缺失是该院铜绿假单胞菌耐碳青霉烯类抗菌药物的主要机制。     

75株碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌ERIC-PCR菌种分型及其主要耐药机制研究

目的探讨碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌同源性及其主要耐药机制。方法收集临床标本946份,分离出碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌,采用琼脂稀释法进行体外药物敏感性试验;采用肠杆菌基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应(ERIC-PCR)进行耐药菌株同源性分析;筛选其金属β-内酰胺酶并测定主动外排系统表型来分析碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌的耐药性。结果共检测出75株碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌;ERIC-PCR同源性分析显示75株菌株共分为8个型别,其中A型占34.7%(26株)、B型占22.7%(17株);75株碳青霉烯类耐药的铜绿假单胞菌中有13株为产酶株,产酶率为17.3%;外排泵抑制剂MC207110可以使34株美罗培南耐药株的最低抑菌浓度(MIC)较单药时下降4倍或以上,占63.0%。结论本院分离的耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌主要有两种类型,产生碳青霉烯水解酶和外排泵机制是碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌耐药的重要机制。     

天津地区耐亚胺培南铜绿假单胞菌整合子的检测及其耐药机制研究

目的 调查天津地区临床分离的耐亚胺培南铜绿假单胞菌(imipenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,IRPA)的整合子流行情况,探讨耐亚胺培南铜绿假单胞菌的耐药机制.方法 收集天津地区60株临床分离的耐亚胺培南铜绿假单胞菌,检测其耐药情况.应用PCR限制片段长度多态性(PCR-RFLP)初筛整合子并分型,用PCR扩增整合子的可变区并测序.结果 60株耐亚胺培南铜绿假单胞菌中有11株检出整合子(18.3%);PCR-RFLP结果显示均为Ⅰ类整合子,未检出Ⅰ类和Ⅱ类整合子.IRPA对多数药物均有较高的耐药率.结论 Ⅰ类整合子为天津地区耐亚胺培南铜绿假单胞菌携带的主要类型,整合子中包括多种耐药基因.     

广东地区医院分离铜绿假单胞菌整合子及其携带耐药基因的研究

目的研究广东地区医院分离铜绿假单胞菌整合子携带现状及其耐药基因与菌株耐药的关系。方法采用基因扩增法,对广东省5所医院临床分离的铜绿假单胞菌三类整合子及耐药基因进行了检测,并检测阳性菌株整合子可变区。结果在30株铜绿假单胞菌中检出23株携带Ⅰ类整合子,有7株携带Ⅱ类整合子,有1株携带Ⅲ类整合子的基因。随机选取三类整合子携带菌各1株进行测序及序列分析,Ⅰ类整合子得到aac-3+aad2的组合形式;Ⅱ类整合子得到CmlA耐药基因盒;Ⅲ类整合子得到bla-MAP耐药基因盒。结论广东地区医院分离铜绿假单胞菌Ⅰ类整合子的检出率最高,检出1株携带Ⅲ类整合子基因。     

铜绿假单胞菌外排泵及整合子与碳青霉烯类耐药中的关系

目的明确金属酶、整合子和外排泵在铜绿假单胞菌碳青霉烯类耐药中的作用。方法对42株泛耐药铜绿假单胞菌采用K-B法检测MIC值,双纸片扩散法测金属β-内酰胺酶(MBL),PCR扩增整合子并测序基因盒,real-time PCR检测oprM基因表达,western blot检测外膜蛋白。结果亚胺培南耐药率高达45.23%,美罗培南耐药率71.42%;检出有22株产MBL;Ⅰ类整合子检出率52.30%,携带dhfrⅫ-orfF-aadA2和aacA4-blaVIM-4两种类型的基因盒组合形式;oprM基因高表达细菌是低表达细菌的3.56倍;25株高表达MexAB-OprM外膜蛋白。结论金属酶、整合子均不是铜绿假单胞菌对碳青霉烯类耐药的主要原因,MexAB-OprM高表达致美罗培南耐药。各种耐药机制相互影响,并相互协同。     

南京地区铜绿假单胞菌的整合子流行性调查

目的调查南京地区铜绿假单胞菌的整合子流行情况,并分析整合子与铜绿假单胞菌耐药的相关性。方法收集98株南京地区临床分离的铜绿假单胞菌,K-B法测定其药敏情况,简并引物PCR法扩增整合子的整合酶基因,对阳性PCR产物采用HinfⅠ内切酶作限制片段长度多态性(RFLP)分析进行整合子分类。结果98株铜绿假单胞菌对哌拉西林等14种抗菌药的耐药率从14.3%到82.7%。40.8%(40/98)的铜绿假单胞菌中检出整合子;PCR-RFLP结果显示均为Ⅰ类整合子,未检出Ⅱ类和Ⅲ类整合子。结论Ⅰ类整合子较广泛地存在于南京地区铜绿假单胞菌中;整合子与铜绿假单胞菌的耐药和多重耐药具有相关性。     

80株铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药机制的研究

目的检测和研究耐亚胺培南铜绿假单胞菌的临床特征及耐药机制。方法对2016年1月至2017年9月该院临床分离的80株耐亚胺培南铜绿假单胞菌的科室分布、标本类型及耐药性进行回顾性分析;运用PCR检测耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药基因blaIMP、blaVIM、blaNDM-1、blaSIM、blaSPM、blaGIM、blaOXA-10及膜孔蛋白OprD2基因。结果该院以神经外科送检标本的耐亚胺培南铜绿假单胞菌检出(28.0%)最多,主要分离自呼吸道标本(86.0%)。80株耐亚胺培南铜绿假单胞菌对阿米卡星的耐药率最低(7.5%),对复方磺胺甲噁唑的耐药率最高(97.5%)。耐药基因检测结果显示:blaVIM基因阳性1株(1.2%),blaOXA-10基因阳性4株(5.0%),其他耐药基因均未检出;膜孔蛋白OprD2基因缺失67株(83.8%)。结论本研究中铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药的主要机制是膜孔蛋白OprD2基因的缺失。     

天津地区耐亚胺培南铜绿假单胞菌blaIMP-1及相关整合子分析

铜绿假单胞菌是一种医院感染常见的条件致病菌,耐药机制复杂,易造成多重耐药,给临床抗感染治疗造成很大困难.碳青霉烯类抗生素是临床治疗铜绿假单胞菌感染最有效的一类药物,然而随着碳青霉烯类抗生素在临床的广泛应用,铜绿假单胞菌对其的耐药率也逐渐升高.细菌获得并表达金属β内酰胺酶(metallo-β-lactamase,MBL)是主要耐药机制之一.整合子在金属酶基因的快速播散中意义重大.本研究对天津地区分离的60株耐亚胺培南铜绿假单胞菌(IRPA)金属酶基因及相关整合子进行了分析,现报道如下.     

临床分离大肠埃希菌耐药机制和基因分型研究

目的研究临床分离大肠埃希菌的耐药机制及遗传多态性。方法用WHONET5.4分析菌株药敏情况。PCR检测大肠埃希菌I类整合酶基因、插入序列共同区（ISCR/orf513）和产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）基因;以肠杆菌科间的重复序列（ERIC）-PCR检测基因型,SPSS分析多态性。结果除亚胺培南、美洛培南、四环素和哌拉西林/他唑巴坦,产ESBLs菌的耐药率明显高于不产ESBLs菌（P〈0.05）。72株产ESBLs株中I类整合酶,ISCR,blaTEM,blaSHV,blaCTX-M的阳性率分别为51.4%,12.5%,80.6%,0%和36.1%;而27株不产ESBLs株中的阳性率分别为37.0%,3.7%,81.5%,3.7%和3.7%。根据指纹图谱把99株大肠埃希菌基因型分为79种,经SPSS系统聚类分析,可归为18个大泪。结论我院产ESBLs大肠埃希菌主要是CTX-M型;产ESBLs株的I类整合酶阳性率明显高于不产ESBLs株,整合子和ISCR可以共存;ERIC-PCR是一种效果较好的基因分型方法,我院大肠埃希菌散发存在。     

Evolution of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates obtained from elderly patients with respiratory tract infections

OBJECTIVES: To study the evolution between 1999 and 2002 and mechanisms of antibiotic resistance in a multidrug-resistant Acinetobacter baumannii clone predominant in isolates from elderly patients with respiratory tract infections. METHODS: Susceptibility to antimicrobials was determined using an agar dilution method. Bacterial clones were identified by PCR-fingerprinting and PFGE with ApaI. Carbapenemases were detected by phenotypic tests; by PCR with primers specific for bla (OXA-40), bla(IMP), bla(VIM-1) and bla(VIM-2); and by hybridization with DNA probes. Class 1 integrons were detected using PCR. RESULTS: In 1999 isolates were grouped into two main genotypes: clone I (33%) and clone II (55%). These were also detected in 2002 with a different distribution: clone I (69%), clone II (22%). Resistance to amikacin, meropenem and imipenem increased significantly in clone I over this time, whereas clone II was not affected. In 2002, the incidence of bla(OXA-40) rose to 91% in clone I isolates with some also harbouring bla(VIM-2) and bla(IMP) genes. Different class 1 integrons were detected ranging in size from 550 to 1200 bp. No relationship was found between carbapenemases and class 1 integrons. CONCLUSIONS: In elderly patients, a single clone became predominant among A. baumannii isolates, coinciding with an increase in antibiotic resistance rates. The majority of isolates harboured the bla(OXA-40) carbapenemase gene and some of them also harboured bla(VIM-2) and bla(IMP) genes. The presence of class 1 integrons also increased over time.     

尿液分离大肠埃希菌耐复方磺胺甲噁唑相关基因研究

目的了解尿液分离大肠埃希菌对复方磺胺甲噁唑耐药的相关基因的分布特征。方法从临床尿液标本中分离得到145株大肠埃希菌株,采用K-B法对甲氧苄啶和复方磺胺甲噁唑的药物敏感性测定。对甲氧苄啶耐药菌株中的Ⅰ、Ⅱ类整合子进行扩增,并酶切分析相应的可变区,从具有相同酶切图谱的菌株中各选取一株进行测序。测序结果在GenBank中进行核酸序列同源性搜索。对复方磺胺甲噁唑耐药株扩增sul1、sul2、sul3三种基因。对Ⅰ类整合子阳性菌株进行ERIC-PCR基因分型。结果对甲氧苄啶和复方磺胺甲噁唑耐药率分别为73.1%、79.9%。在109株耐甲氧苄啶菌株中,I类整合子含有7种基因盒类型,Ⅱ类仅含有1种类型基因盒,发现4种类型dfrA基因。在119株耐复方磺胺甲噁唑菌株中,sul1阳性72株,sul2阳性81株,sul3阳性2株。在甲氧苄啶和(或)复方磺胺甲噁唑耐药株中,80株Ⅰ类整合酶阳性株ERIC-PCR分为59个基因型。结论在复方磺胺甲噁唑的耐药基因分布中,dfrA17、sul2、sul1携带率较高。在耐药性播散方面,耐药基因的水平转移比菌株克隆传播作用更大。     

广泛耐药鲍曼不动杆菌氨基糖苷类药物获得性耐药基因研究

目的了解重症监护病房（ICU）患者分离的广泛耐药（XDR）-鲍曼小动杆菌（AB）对氨基糖苷类药物获得性耐药基因情况。方法用phoenix-100全自动细菌鉴定药物敏感性分析仪对AB进行细菌鉴定和药物敏感性试验,gyrA和parC基因扩增测序确定AB。聚合酶链反应（PCR）测定20株XDR—AB的10种氨基糖苷类修饰酶基因、6种16SrRNA甲基化酶基因和外排泵adeB基因,并用DNA测序比对。结果20株XDR—AB中,氨基糖苷类修饰酶基因aac（3）-I、aac（6’）-Ib、ant（3”）-I、aph（3’）-I检出率分别为90．0％、30．0％、95．0％、95．0％,而aac（3）-lI、aac（6’）-Iad、aac（6’）-lI、ant（2”）-I、ant（4’）-I及aph（3’）-VIa基因均未检出。armA型16SrRNA甲基化酶基因和外排泵adeB基因检出率均为100％。结论20株XDR—AB均携带rarmA和adeB基因,同时aac（3）-I、ant（3”）-I和aph（3）-I检出率较高,提示ICU分离的XDR—AB对氨基糖苷类药物高水平耐药可能与携带的耐药基因有关。     

大肠埃希菌和克雷伯菌临床分离株中整合子介导的多重耐药性的相关性分析Ⅰ

目的研究整合子介导的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌的多重耐药性。方法采用聚合酶链反应（PCR）对临床分离的135株大肠埃希菌和59株克雷伯菌进行Ⅰ型和Ⅱ型整合酶基因的检测。结果在135株大肠埃希菌和59株克雷伯菌中，大肠埃希菌产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）率为50．4％，克雷伯菌产ESBLs率为37.3％，共检出105株细菌携带Ⅰ类整合酶基因，72株为大肠埃希菌，占53.33％（72／135），33株肺炎克雷伯菌，占55.93％（33／59）；其中携带Ⅱ类整合酶基因3株，全部为大肠埃希菌，此3株同时携带Ⅰ类整合酶基因并产ESBLs。结论Ⅰ类整合子在大肠埃希菌和克雷伯菌中分布广泛。整合子与大肠埃希菌和克雷伯菌的耐药有关，即整合子阳性菌比整合子阴性菌更容易产生耐药。     

大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌外排泵转录水平与耐药的关系

目的调查细菌耐药性与其主动外排泵系统的作用关系,并探讨大肠埃希菌外排泵调控基因对其外排泵结构基因表达水平的影响,分析其耐药机制。方法收集大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌共59株,根据头孢他啶耐药情况分为实验组（耐药）与对照组（敏感）,多重聚合酶链反应（PCR）扩增外排泵调控基因acrR并测序,实时定量逆转录（RT）-PCR检测外排泵及调控基因marA的相对转表达水平,三维试验检测AmpC酶。结果实验组大肠埃希菌46.7%（7株）acrAB基因转录水平增高,肺炎克雷伯菌中51.9%（14株）acrAkp基因转录水平增高,敏感组外排泵基因均未见增高。实验组大肠埃希菌中,3株acrR发现突变,9株marA基因转录水平增高。59株菌株中39株（66.1%）AmpC阳性。结论主动外排泵系统是细菌耐药机制之一,常与其他耐药机制共同存在。acrR突变与marA表达增高均可引起大肠埃希菌acrAB表达增加。     

亚胺培南耐药大肠埃希菌耐药基因型检测

目的研究临床分离的2株亚胺培南耐药的大肠埃希菌分子耐药机制。方法通过琼脂稀释法检测亚胺培南耐药的大肠埃希菌对多种抗菌药物的敏感性,采用肠杆菌科基因间重复性一致序列（ERIC）-聚合酶链反应扩增分析（PCR）对耐药菌株进行同源性分析,采用特异性PCR和序列分析、接合试验、质粒提取和质粒消除试验检测耐药菌株的分子耐药机制。结果大肠埃希菌对包括碳青霉烯类和喹诺酮类在内的多种抗菌药物耐药,同源性分析显示2株菌株属于同一克隆型,PCR和序列分析显示耐药株菌携带KPC-2、qnrA、TEM-1和I类整合酶基因并且伴有外膜蛋白OmpK36基因的缺失,质粒提取和质粒消除试验证实KPC-2和I类整合酶基因定位于约54 kb质粒。结论大肠埃希菌中出现质粒型碳青霉烯酶基因KPC-2,并且同时携带其他耐药相关基因,表现为多重耐药,KPC-2合并外膜蛋白缺失是大肠埃希菌对碳青霉烯类耐药主要机制。     

Class 1 integron-associated gene cassettes in Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona isolated from pig carcasses in Brazil

OBJECTIVES: Two multiresistant Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona isolates from pig carcasses were investigated for antimicrobial resistance genes and their location with particular reference to the detection of class 1 integrons. METHODS: The two S. Agona isolates were investigated for their in vitro susceptibility to antimicrobial agents and their plasmid content. The resistance genes and class 1 amplicons were identified by PCR assays. Amplicons of class 1 integrons were cloned and sequenced. Transferability of resistance plasmids was confirmed by conjugation. RESULTS: Both S. Agona isolates carried conjugative plasmids of approximately 150 kb which harboured all resistance genes detected in the respective isolates. S. Agona 231 was resistant to chloramphenicol by catA1, to tetracycline and minocycline by tet(B), and to sulphonamides by sul1. In addition, it harboured a streptomycin resistance gene strA and a class 1 integron with a new aadA variant designated aadA23, which mediates resistance to streptomycin and spectinomycin. S. Agona 242 also carried the genes catA1, tet(B), and sul1. Moreover, it harboured a second sulphonamide resistance gene, sul2, and a class 1 integron with intact gene cassettes carrying new variants of the trimethoprim resistance gene dfrA15b or the chloramphenicol resistance gene cmlA4. The third gene cassette consisted of a truncated aadA2 gene. CONCLUSIONS: The results of this study show that large conjugative multiresistance plasmids are present in S. Agona from pigs. Analysis of the class 1 integrons revealed the presence of new variants of resistance genes so far not detected in Salmonella isolates.     

鲍曼不动杆菌对氨基糖苷类药物耐药机制研究

目的研究对氨基糖苷类抗菌药物耐药的鲍曼不动杆菌分子流行病学特征和耐药机制。方法采用琼脂稀释法检测抗菌药物对鲍曼不动杆菌的最低抑菌浓度(MIC),采用肠杆菌科基因间重复一致性序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)研究耐药菌株的分子流行病学特征,采用特异性PCR、序列分析和接合试验研究介导耐药的分子机制。结果临床分离菌株对包括氨基糖苷类抗菌药物在内的多种药物广泛耐药,同源性分析显示属于7个流行克隆型。所有分离菌株均扩增出介导氨基糖苷类抗菌药物耐药的修饰酶和药物"外排泵"基因,部分菌株扩增出甲基化酶基因。结论修饰酶和甲基化酶介导鲍曼不动杆菌临床分离株对氨基糖苷类药物耐药,药物"外排泵"参与介导耐药机制形成,垂直传播和通过耐药性质粒的水平传递可能是耐药菌株播散的主要方式。