TCF7L2和KCNQ1基因多态性与2型糖尿病的关联

目的研究TCF7L2和KCNQ1基因多态性与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的关联,并探讨基因-环境之间的交互作用。方法采用以社区为基础的病例对照研究方法,在北京市房山区选取349例T2DM患者和300例对照,采用单碱基延伸方法对研究对象的基因型进行检测,运用广义多因子降维法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)分析基因-环境交互作用。结果 Logistic回归分析结果显示,TCF7L2基因rs12255372位点GT基因型个体患T2DM的风险是GG基因型个体的2.049倍(OR=2.049,95%CI:1.107~3.792),KCNQ1基因rs2237892位点CC基因型个体患T2DM的风险是TT基因型个体的2.619倍(OR=2.619,95%CI:1.609~4.263),rs2237897位点CC基因型个体患T2DM的风险是TT基因型个体的3.066倍(OR=3.066,95%CI:1.870~5.029),饮酒者患T2DM的风险是不饮酒者的2.749倍(OR=2.749,95%CI:1.753~4.311)。GMDR分析结果显示,饮酒-rs2237892-rs2237897-rs12255372模型的验证样本准确度(0.657 2)和交叉验证一致性(10/10)均最高。结论在本次调查的人群中,TCF7L2、KCNQ1基因多态性与T2DM存在关联,KCNQ1基因rs2237892、rs2237897位点、TCF7L2基因rs12255372位点与饮酒因素对T2DM发病存在交互作用。     

中国汉族人群5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与非综合征性唇腭裂关系的Meta分析

目的评价中国汉族人群5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因(MTHFR)C677T多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)易感性的关系。方法计算机检索中国学术期刊全文数据库、中国生物医学文献数据库、万方学术期刊数据库等,选择MTHFR基因C677T多态性与NSCL/P易感性有关的病例对照研究。采用Rev Man 5.1软件进行统计分析。结果共纳入研究5项包括1 598例研究对象。Meta分析结果显示,在中国汉族人群中,除携带突变纯合子(TT)基因的个体罹患NSCL/P的风险高于携带野生纯合子(CC)的个体(OR=1.69,95%CI 1.19~2.41)外,其他基因模型均不具有统计学意义(T vs.C:OR=1.26,95%CI 0.95~1.67;CT vs.CC:OR=1.54,95%CI 0.91~2.61;CT+TT vs.CC:OR=1.56,95%CI 0.92~2.64;TT vs.CC+TT:OR=1.27,95%CI 0.94~1.73)。结论 MTHFR基因C677T多态性是中国汉族人群发生非综合征性唇腭裂的潜在危险因素,仅携带突变纯合子(TT)基因的个体会增加罹患NSCL/P的风险。     

VEGF基因多态性与多囊卵巢综合征遗传易感性的相关性研究

目的 探索血管内皮生长因子基因（vascular endothelial growth factor gene, vegf）rs3025039C/T的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）和rs3025020C/T SNP与多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome, PCOS）发病风险的相关性。方法 运用聚合酶链反应 - 连接酶检测反应（polymerase chain reaction - ligase detection reaction, PCR - LDR）的方法分析了152例PCOS患者组和160例健康对照组vegf基因rs3025039C/T和rs3025020C/T 的单核苷酸多态性和PCOS发病风险的关系。结果 与CC基因型相比,携带CT基因型可能增加PCOS的发病风险,OR值为1.75（95%CI:1.04～2.95）。用2LD软件对这2个多态性位点进行了联合分析,结果显示,2个位点之间存在连锁不平衡现象（D＇ = 0.81）。用EH软件进行单体型分析,结果显示,CC是人群中最常见的单体型,CT单体型增加了PCOS的发病风险（OR = 1.62,95%CI:1.01～2.60）。结论 vegf基因rs3025039C/T SNP增加了对PCOS的遗传易感性,携带CT基因型增加了PCOS的发病风险。     

ADCY3基因多态性与脂肪肝的关联性研究

目的探讨腺苷酸环化酶3(adenylate cyclase 3,ADCY3)基因多态性与脂肪肝易感性间的关系。方法采用横断面研究,以整群随机抽样的方法抽取浙江省宁波市当地常住居民1964人。采用标签SNP方法筛选ADCY3基因的12个位点。采用连接酶检测反应技术进行基因分型检测。采用多因素Logistic回归模型分析ADCY3基因多态性与脂肪肝易感性间的关系。结果在校正了年龄、性别等因素后,rs4665273位点TT基因型者患脂肪肝的危险性是CC基因型者的0.25倍(OR=0.25,95%CI=0.07~0.93);rs7593130位点CC基因型患脂肪肝的危险性是TT基因型者的3.33倍(OR=3.33,95%CI=1.16~9.56);rs1344840位点TT基因型患脂肪肝的危险性是CC基因型者的4.00倍(OR=4.00,95%CI=1.08~14.76)。结论 ADCY3基因多态性可能与脂肪肝发生风险有关。其中,rs4665273位点TT基因型是脂肪肝的保护性因素,而rs7593130位点CC基因型和rs1344840位点TT基因型是脂肪肝的危险因素。     

亚洲人群MDM2基因SNP309多态性与乳腺癌易感性的Meta分析

目的综合评价MDM2基因SNP309多态性与亚洲人群乳腺癌易感性的关系。方法电子检索PubMed、Embase、VIP、CNKI和万方数据库中关于MDM2基因多态性与乳腺癌关系的病例对照研究,按照纳入与排除标准筛选文献,提取数据、评价纳入研究质量后进行Meta分析,计算合并OR值及95%CI,并进行敏感性分析和发表偏倚评估。结果共纳入11篇文献,涉及3 439例乳腺癌患者和3 499例对照。Meta分析结果显示,与携带TT基因型个体相比,携带GG基因型个体与乳腺癌风险增高相关(OR=1.37,95%CI:1.00~1.88),而携带GT基因型个体乳腺癌发病风险并未明显增高(OR=1.21,95%CI:0.99~1.49);与携带TT基因型个体相比,携带GT、GG基因型个体的乳腺癌发病风险增加(OR=1.26,95%CI:1.01~1.59);与携带GT、TT基因型个体相比,携带GG基因型个体的乳腺癌发病风险未明显增高(OR=1.18,95%CI:0.95~1.47)。结论在亚洲人群中,MDM2基因SNP309G可能是乳腺癌易感性增加的危险因素。     

MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒遗传易感性关系

目的探讨MPO、NQO1、GSTP1和UGT1A6基因多态与慢性苯中毒易感性的关系。方法采用病例-对照研究,以268名苯中毒工人为病例组,268名接触苯而没有中毒表现的工人为对照组。应用TaqManPCR分析技术判定MPO(rs7208693),NQO1(rs1800566),GSTP1(rs947894)和UGT1A6(rs6759892,rs1105879,rs4124874,rs3755319,rs887829和rs4148323)基因型。结果携带GSTP1基因rs947894G等位基因个体患慢性苯中毒的危险性比AA基因型个体降低0.657倍(95%CI0.434~0.994,P=0.046);携带MPO基因rs7208693A等位基因人群中,UGT1 A6 rs6759892G等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT基因型的2.702倍(P=0.024),UGT1 A6 rs1105879C等位基因个体发生慢性苯中毒的危险性是TT型的2.619倍(P=0.035)。在饮酒人群中,携带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加9.000倍(95%CI1.460~55.478,P=0.021);在吸烟人群中,带NQO1基因rs1800566TT基因型个体慢性苯中毒的发病风险较携带CC和CT基因型个体增加7.000倍(95%CI1.555~31.575,P=0.012)。单倍型分析显示,本人群携带UGT1A6基因TACGGG单倍型个体慢性苯中毒的发病风险是携带TAATGG单倍型个体的1.446倍(OR=1.446,95%CI1.005~2.080,P=0.046)。结论同时携带MPO基因rs7208693A和UGT1A6基因rs6759892G或rs1105879C等位基因型个体对苯中毒易感;携带NQO1基因rs1800566TT基因型且同时吸烟或饮酒的个体对苯中毒易感;携带UGT1A6基因TAATGG单倍型个体可增加慢性苯中毒的发病风险;GSTP1基因多态与慢性苯中毒遗传易感性的关系仍需进一步研究。     

硒蛋白S基因多态性与内蒙古汉族人群胃癌发病风险的关联研究

目的探讨内蒙古汉族人群硒蛋白S(SelS)基因单核苷酸多态性(SNP)与胃癌发病风险的关联性。方法采用PCR-RFLP技术对133例内蒙古汉族胃癌患者及135例体检健康对照者进行SelS基因分型,并经测序验证结果。采用SPSS17.0分析SelS基因SNP rs34713741与胃癌发病风险的相关性。结果 SelS基因SNP rs34713741基因型CC、CT、TT及等位基因C、T在胃癌组和健康对照组间差异有统计学意义(分别为6.105、6.294,P均0.05)。内蒙古汉族人群中携带T等位基因的CT/TT个体患胃癌的风险是CC基因型个体的1.57倍(OR=1.570,95%CI:1.084~2.274);携带T等位基因且吸烟的个体患胃癌的风险增加,是CC基因型的2.216倍(OR=2.216,95%CI:1.530~3.209)。结论 SelS基因SNP rs34713741与内蒙古汉族人群胃癌的发病具有相关性,T等位基因可能是胃癌发病的危险因素之一,吸烟可增加发病的风险。     

miR-34b/c启动子区多态性与原发性肝细胞肝癌易感性的关联研究

目的探讨miR-34b/c rs4938723 T>C与中国人群原发性肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关系。方法采用病例对照研究设计,选取501例原发性肝细胞肝癌病例和548例正常对照。选取miR-34b/c rs4938723 T>C为研究位点,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法进行多态性检测,应用Logistic回归计算OR值及95%CI,比较不同基因型与HCC发病风险的关系。结果在调整年龄、性别、吸烟、饮酒因素后,携带rs4938723 TC/CC基因型者与携带rs4938723 TT基因型个体相比,发生肝癌的风险增加了40%(调整OR=1.40,95%CI=1.10～1.80)。进一步分析显示在原发性肝细胞肝癌的发生中rs4938723基因型与饮酒存在交互作用(相乘交互作用P=0.049,相加交互作用P=0.012)。结论本研究表明位于miR-34b/c启动子区的rs4938723 T>C多态性可能影响中国人群原发性肝细胞肝癌发病风险。     

HLA-DP基因多态性与卵巢癌临床病理参数的关联研究

目的探讨人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigens,HLA)DP基因多态性与卵巢癌临床病理参数的关联性。方法应用TaqMan探针方法,检测rs3077和rs9277535位点基因型,比较卵巢癌患者和健康对照者,探讨不同基因型与卵巢癌患病风险以及卵巢癌临床病理参数的关系。结果 rs3077和rs9277353位点突变纯合基因型AA病例组中占比均显著高于对照组(调整OR=1.82,95%CI:1.11~3.01;调整OR=1.89,95%CI:1.26~2.97);与携带rs3077 GG+GA和rs9377357GG+GA基因型的个体相比,携带1~2个危险基因型的个体发生卵巢癌的风险显著(P0.01);尚未发现HLADP基因遗传多态性与卵巢癌临床病理参数存在关联。结论 HLA-DP基因多态性与卵巢癌的发病风险存在关联。     

MTHFR、MTRR基因多态性与中国女性多囊卵巢综合征相关性的meta分析

目的:系统评价基因MTHFR C677T和A1298C、MTRR A66G多态性与中国女性多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性。方法:计算机检索PubMed、Web of Science、EMBASE、CNKI、WanFang和VIP等中英文数据库,搜集关于MTHFR C677T和A1298C、MTRR A66G基因多态性与中国女性PCOS相关的病例对照研究。采用Stata 11.0软件进行meta分析,计算优势比及95%置信区间评价其关联度,同时进行敏感性分析及发表偏移的评估。结果:共纳入8项MTHFR C677T基因多态与PCOS相关性的病例对照研究(PCOS 1424例,健康对照1576例),7项MTHFR A1298C基因多态性与PCOS相关性的病例对照研究(PCOS 1079例,健康对照1269例)和4项MTRR A66G基因多态与PCOS相关性的病例对照研究(PCOS 522例,健康对照633例)。MTHFRC677T的5种模型T比C(OR=1.48, 95%CI 1.06~2.08)、TT比CC(OR=2.08, 95%CI 1.08~4.02)、CT比CC(OR=1.64, 95%CI 1.09~2.49)、(TT+CT)比CC(OR=1.78, 95%CI 1.09~2.89)、TT比(CC+CT)(OR=1.60, 95%CI 1.06~2.42);MTHFR A1298C的5种模型C比A(OR=1.54, 95%CI 1.30~1.82)、CC比AA(OR=1.54, 95%CI 1.35~1.76)、AC比AA(OR=1.19, 95%CI 1.08~1.31和(CC+AC)比AA(OR=1.25, 95%CI 1.15~1.37),MTRR A66G的隐性比较模型GG比(AG+AA)(OR=1.58, 95%CI 1.37~1.83)与PCOS相关。结论:MTHFR C677T和A1298C、MTRR A66G基因多态性与中国女性PCOS有关。     

脂联素基因多态性与北方汉族人群缺血陛脑卒中易感性关系研究

目的 探讨脂联素基因多态性与北方汉族人群缺血性脑卒中易感性的关系.方法 采用荧光定量PCR的TaqMan探针方法检测357例缺血性脑卒中首发病例及345名健康对照的脂联素基因(rs2241766、rs266729)多态性,用logistic回归分析计算各基因型与缺血性脑卒中的相关性.结果 总体人群中rs2241766等位基因T＞G突变增加了缺血性脑卒中的易感性(OR=1.55,P=0.01);调整各因素后,多因素logistic回归分析仍为缺血性脑卒中的危险因素(OR=1.55,P=0.00).rs266729多态性与总体人群缺血性脑卒中易感性无关(OR=1.13,P=0.57),但在女性中GG纯合突变增加了缺血性脑卒中的易感性(OR=3.25,P=0.04).结论 rs2241766基因多态性与北方汉族总体人群缺血性脑卒中的易感性相关;rs266729等位基因GG纯合突变可能是北方汉族女性缺血性脑卒中易感性的危险因素.     

CD55启动子区rs2564978多态性影响肝癌遗传易感性

目的 探讨CD55在肝癌中表达及预后影响,并分析CD55 rs2564978遗传变异对肝癌遗传易感性的影响。方法 通过数据库GEO和Kaplan-Meier plotter分析CD55在肝癌中表达及预后影响;随机抽取中国北方汉族334例肝癌患者和940例健康对照进行成组设计病例对照研究。PCR-RFLP法进行基因多态检测,卡方检验比较分类变量的分布,非条件logistic校正混杂因素,OR及其95%CI评价各基因型与肝癌易感性的关系。结果 CD55在肝癌组织中表达上调（t=-3.130,P=0.003）且CD55高表达与携带肝炎病毒的肝癌患者不良预后相关（HR=2.28,95%CI:1.10～4.72,P=0.022）。与TT基因型携带者相比,CT基因型（OR=1.45,95%CI:1.08～1.96,P=0.014）与CC基因型（OR=1.55,95%CI:1.08～2.22,P=0.018）携带者肝癌易感性均上升。分层分析显示,rs2564978 T>C变异增加男性肝癌易感性（OR=1.58,95%CI:1.03～2.41,P=0.036）;高年龄组（>60岁）CC携带者具有更高的肝癌易感性（OR=2.46,95%CI:1.35～4.47,P=0.003）;吸烟人群和饮酒人群中,CC携带者肝癌易感性上升（吸烟:OR=1.91,95%CI:1.02～3.58,P=0.042;饮酒:OR=2.37,95%CI:1.20～4.67,P=0.013）。结论 CD55在肝癌组织中表达上调并导致肝癌患者预后不良;CD55启动子区rs2564978遗传变异可能与肝癌易感性相关。     

硒蛋白S基因多态性与布鲁氏菌病遗传易感性的关联性

目的 检测内蒙古包头地区布鲁氏菌病患者硒蛋白S（selenoprotein S,SelS）基因rs28665122、rs34713741位点基因型和等位基因分布频率,探讨SelS基因多态性与本地区布鲁氏菌病患者遗传易感性的关联性。方法 采用一种快速点突变检测技术-等位基因特异性PCR（allele - specific PCR,AS - PCR）技术检测32例慢性期布鲁氏菌病患者和30例健康对照者SelS基因（rs28665122、rs34713741）基因型和等位基因分布频率。结果 布鲁氏菌病患者组与对照组SelS基因rs28665122位点GG、GA、AA基因型及G、A等位基因频率比较无统计学差异（χ2分别为0.203,0.852,均P＞0.05 ）;rs34713741位点CT、CC、TT基因型和C、T等位基因分布频率比较存在统计学差异（χ2分别为9.209,6.580,均P＜0.05）,与C等位基因相比,携带T等位基因者感染布鲁氏菌风险增高3.194倍（OR = 3.194,95%CI:1.489～6.847）,与CC基因型相比,CT和TT基因型者感染布鲁氏菌风险均增高（OR = 3.273,95%CI:0.876～12.223;OR = 4.364,95%CI:1.217～15.641）。结论 本地区布鲁氏菌病与SelS基因rs34713741位点基因多态性有关联,T等位基因可能是其风险易感基因。     

间质金属蛋白酶基因多态性与中心性肥胖在非酒精性脂肪肝病中交互作用研究

目的 探讨间质金属蛋白酶-9(MMP-9)-1562C/T(rs3918242)以及MMP-2-1306C/T(rs243865)位点单核苷酸多态性(SNP)与非酒精性脂肪肝(NAFLD)遗传易感性以及与中心性肥胖交互作用。方法 对545例NAFLD患者和636例正常对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析rs24386以及rs3918242基因型、非条件logistic分析各基因型与脂肪肝发病易感性关系,利用非条件logistic分析和广义多因子降维(GMDR)法分析rs3918242、rs243865与中心性肥胖的交互作用。结果 MMP-9 rs3918242位点T基因携带者(TT/CT)与非T基因携带者(CC)的NAFLD罹患风险明显增加(OR=1.67,95%CI:1.32～2.12,P=0.001;调整OR=1.65,95%CI:1.31～2.01,P=0.008);而MMP-2 rs243865位点T基因携带者(TT/CT)与非T基因携带者(CC)的NAFLD罹患风险明显降低(OR=0.68,95%CI:0.53～0.86,P=0.001;调整OR=0.66,95%CI:0.49～0.90,P=0.007)。广义多因子降维法分析结果显示,rs3918242与中心性肥胖在NAFLD发病中存在交互作用(P=0.001)。利用非条件logistic校正年龄、性别、腰围、BMI、LDL-C、HDL-C、FPG、胰岛素抵抗指数后,分析显示,携带rs3918242 TT/CT基因型中心性肥胖个体罹患NAFLD的风险高于携带CC基因非吸烟个体(OR=4.50,95%CI:2.78～7.17,P=0.007)。结论 MMP-9基因的rs3918242以及MMP-2基因的rs243865与NAFLD患病罹患风险紧密相关,rs3918242与中心性肥胖在NAFLD发病中具有协同效应。     

PSCA基因多态性及其与胃癌发病风险的关联

目的 探究四川省汉族人群中PSCA基因多态性与胃癌发病风险之间的关联。方法 采用1∶1配对病例对照研究,纳入原发性胃癌病例及健康对照共308对。收集研究对象的人口学特征及胃癌危险因素信息,并对PSCA rs2294008及rs2976392两位点基因多态性进行检测。结果 rs2294008 CC、CT、TT基因型在全部胃癌病例组与对照组中的分布频率分别是:42.9%、46.8%、10.3%和46.8%、46.8%、6.4%;在非贲门癌病例组与对照组中的分布频率分别是:43.2%、44.3%、12.5%和44.9%、47.7%、7.4%。经条件Logistic回归分析发现CT+TT基因型人群患胃癌的风险高于CC基因型携带者（调整OR = 2.272,95%CI,1.263,4.088）。同时,CT+TT基因型人群患非贲门癌的风险亦高于CC基因型携带者（调整OR = 2.238,95%CI,1.139,4.397）。连锁分析显示,rs2976392与rs2294008位点呈完全连锁不平衡（D’=1.000,r2= 1.000）。结论 PSCA rs2294008和rs2976392基因位点多态性与全部胃癌及非贲门癌发病有关。     

转化生长因子-β1基因多态性与食管鳞癌患者放疗和化疗疗效及生存的关系

目的 探讨转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)基因-509C/T多态性与食管鳞癌患者放疗和化疗疗效及生存的关系.方法 应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态(polymerase chain reaction-based restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法,检测了230例接受单纯放疗或放疗合并化疗的食管鳞癌患者TGF-β1基因-509C/T位点的基因型.采用非条件logistic回归模型计算OR值和95%CI值,评价各基因型与食管鳞癌患者放疗和化疗疗效相关性,并用单因素和多因素Cox回归模型计算不同基因型、不同临床参数与食管鳞癌放疗和化疗患者生存时间、死亡风险(HK)的关系.结果 在208例有上消化道造影疗效评价的患者中,87例对放疗和化疗敏感,其中TGF-β1基因-509CC、CT和TT基因型分别有17例(19.5%)、48例(55.2%)和22例(25.3%);在对放疗和化疗不敏感的121例患者中,3种基因型分别有39例(32.2%)、54例(44.6%)和28例(23.2%).与携带TGF-β1基因-509CC基因型的患者相比,携带至少1个T等位基因的患者(CT或TT基因型)对放疗和化疗更敏感,校正OR值为2.07(95%CI:1.05~4.09; P=0.036).携带CC基因型患者的中位生存时间是17.0(95%CI:12.0~23.0)个月,CT基因型患者是22.0(95%CI:16.0~33.0)个月,TT基因型患者是25.0(95%CI:15.0~41.0)个月.与CC基因型患者比较,CT和TT基因型患者生存时间差异接近统计学临界水平(P=0.063).与携带CC基因型患者相比,携带CT和TT基因型患者的HR有降低的趋势,校正HR值分别是0.81(95%CI:0.52~1.24)和0.86(95%CI:0.65~1.12),但差异无统计学意义(P>0.05).肿瘤部位、肿瘤临床分期、放疗和化疗疗效对食管鳞癌放疗和化疗患者的HR产生明显影响[校正HR值分别是1.28(95%CI:1.01~1.61,P=0.040)、1.49(95%CI:1.17~1.88,P=0.001)、1.55(95%CI:1.06~2.26,P=0.023)].结论 TGF-β1基因-509C/T多态性与食管鳞癌放疗和化疗疗效相关,可能是预测放疗和化疗疗效的遗传标志.

Abstract：

Objective To evaluate the association between polymorphism of transforming growth factor-β1(TGF- β1)-509C/T and radiochemotherapy response and survival in esophageal squamous cell carcinoma(ESCC) patients.Methods The genotype of TGF-β1-509C/T was detected by polymerase chain reaction-based restriction fragment length polymorphism assay(PCR-RFLP)in 230 ESCC patients receiving radiotherapy alone or in combination with chemotherapy.Unconditional multivariate logistic regression analysis was done to estimate adjusted odds ratios(ORs)along with the corresponding 95% confidence intervals(CIs)for the polymorphism and radiochemotherapy response.The associations between overall survival time or hazard ratio(HR) of ESCC patients and genetic variation or the clinical data were estimated by applying univariate and multivariate Cox-regression analyses.Results Among 208 patients with upper gastrointestinal contrast assessment,87 cases were susceptible to radiochemotherapy treatment and the TGF-β1-509CC,CT and TT genotype patients were 17(19.5%),48(55.2%)and 22(25.3%),respectively.Among the patients who were insensitive to radiochemotherapy treatment(n=121),the TGF-β1-509CC,CT and TT genotype patients were 39(32.2%),54(44.6%)and 28(23.2%),respectively.Compared with TGF-β1-509CC genotype,the CT and TT genotype carriers had a significantly better treatment response(adjusted OR=2.07,95%CI,1.05-4.09,P=0.036).The median survival time of CC genotype patients was 17.0(95%CI,12.0-23.0) months,CT genotype patients was 22.0(95%CI,16.0-33.0) months and TT genotype patients was 25.0(95%CI,15.0-41.0) months.Compared to CC genotype patients,the survival time difference of CT and TT group was close to the statistical break point(P=0.063).Our data showed that the subjects with CT or TT genotype had an decreased HR respectively as compared with those with CC genotype(CT,adjusted HR=0.81,95%CI,0.52-1.24; TT,adjusted HR=0.86,95%CI,0.65-1.12),but the difference was not statistically significant(P>0.05).However,tumor location,clinical stage and radiochemotherapy response affected the overall survival time of the patient significantly(adjusted HR=1.28,95%CI:1.01-1.61,P=0.040; 1.49,95%CI,1.17-1.88,P=0.001; 1.55,95%CI,1.06-2.26,P=0.023,respectively).Conclusion These results suggest that TGF-β1-509C/T polymorphisms were associated with radiochemotherapy for esophageal squamous cell carcinoma which might be genetic markers for prediction of the radiochemotherapy response in ESCC patients.     

RF6基因多态性与黔北人群非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的 探讨黔北地区人群IRF6基因rs2235371和rs2235373 SNP位点的多态性及其与非综合征性唇腭裂的相关性。方法 采用PCR和测序方法对153个对照儿童和123个NSCL/P儿童的IRF6基因中2个SNP位点rs2235371和rs2235373进行扩增和测序;对样本群体进行Hardy-Weinberg平衡分析,比较2组人群的基因型频率、等位基因频率及OR分析;两位点连锁不平衡分析。结果 对照组与病例组人群rs2235371基因型均含有GG、GA和AA型,rs2235373位点均含有CC、CT和TT型。对于2个位点,对照组和病例组均符合Hardy-Weinberg平衡法则(P＞0.05)。2组人群中,rs2235371和rs2235373位点的等位基因和基因型差异均有统计学意义(P＜0.05);rs2235371位点GGvsGA的OR值(95%CI) =1.725(1.025～2.902),GGvsAA的OR值(95%CI) = 2.100(1.109～4.328);rs2235373位点CCvsTT的OR值(95%CI) = 2.263(1.348～5.015),CTvsTT的OR值(95%CI) = 2.061(1.108～2.169);(P＜0.05)。rs2235371和rs2235373位点存在连锁不平衡,GC单倍型是主要的单倍体型,对NSCL/P均有致病风险,OR值(95%CI)= 1.722(1.219～2.431), (P＜0.05)。结论 在黔北地区人群中,IRF6基因 rs2235371和rs2235373位点均具有多态性;rs2235371位点的GG基因型和rs2235373位点的CC、CT基因型与NSCL/P的发生有相关性;rs2235371和rs2235373位点存在连锁不平衡,GC单倍型对NSCL/P有致病风险。     

硒蛋白S基因多态性与乳头状甲状腺癌发病风险的关联性

目的 探讨硒蛋白S（SelS）基因（rs34713741位点）基因多态性与乳头状甲状腺癌（PTC)发病风险的相关性。方法 采用等位基因特异性PCR（AS - PCR）技术检测138例PTC患者和140例健康对照者SelS基因（rs34713741位点）基因型和等位基因分布频率,并根据不同临床特征（年龄、性别、肿瘤大小和有无淋巴转移）进行分层分析,同时结合非遗传相关因素（吸烟、饮酒、BMI、碘盐摄入、精神状态等）联合分析该位点SelS基因多态性与PTC发病风险的关联性。结果 BMI、碘盐摄入、工作压力是PTC发病风险因素,精神状态是PTC保护性因素（P均＜0.1）。该位点SelS基因CT、CC、TT基因型和C、T等位基因分布频率在2组间无统计学意义（χ2分别为3.404,3.258,P均＞0.05）。分层分析显示:女性组、无淋巴转移组CC、CT、TT基因型分布与对照组相比存在统计学差异（χ2 = 4.430,P = 0.035,;χ2 = 3.967,P = 0.046）,PTC女性组、无淋巴转移组TT基因型明显高于对照组（OR = 1.554,95%CI:1.032～2.344;OR = 1.457,95%CI:1.006～2.109）。结论 PTC发病与BMI、碘盐摄入、精神状态和工作压力等相关,T等位基因可能是女性PTC发病因素之一,同时也是无淋巴转移保护性因素之一。