2014—2018年辽宁省柯萨奇病毒A6型分离株VP1区基因特征分析

目的:了解辽宁省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)患者中分离到的柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A group 6 type, CV-A6)VP1区基因特征。方法:收集2014—2018年辽宁省14个市送检的HFMD患者非肠道病毒A组71型(enterov...     

云南省2株柯萨奇病毒A12型VP1区基因特征分析

目的:了解云南省手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)监测中分离到的2株柯萨奇病毒A12型(Coxsackievirus A12, CV-A12)VP1区基因序列特征。方法:对HFMD监测中获得的临床标本开展RD细胞上的病毒分离培养,通过荧光定量PCR和测序方法鉴定为CV-A1...     

2017—2019年广州市柯萨奇病毒A6分子流行病学特征分析

目的:了解广州市手足口病的病原谱,对柯萨奇病毒A6 (coxsackievirus A6, CV-A6)型肠道病毒进行分子流行病学特征分析。方法:采用逆转录荧光定量PCR法对2017年5月至2019年12月各哨点医院及区疾病预防控制中心上送的手足口样本进行EV-A71、CV-A16、CV-A6及总肠道病毒检测。挑选CV...     

4株手足口病相关柯萨奇病毒A4型的全基因组特征

目的:了解青岛地区流行的柯萨奇病毒A4型(CVA4)的全基因组特征。方法:选取2013—2015年间青岛地区流行的4株CVA4病毒,通过一步法RT-PCR对毒株进行全基因组扩增,采用MEGA7.0软件进行序列比对及系统进化分析,采用similarity plots 3.5.1软件进行基因重组分析。结果:进化分析显示：在...     

一株分离自云南重症手足口病患者的柯萨奇病毒A组4型毒株的全基因组分析

目的:对从云南重症手足口病患者的粪便样品中分离出的1株柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)毒株的全基因组特征和部分区段重组情况进行分析,为深入认识CV-A4的流行和分子进化提供基础数据。方法:分别使用人类横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞、人胚肺二倍体(...     

九江地区手足口病病原柯萨奇A6病毒的分离、鉴定及分子流行病学特征

目的探讨九江地区流行手足口病病(HFMD)原体柯萨奇A6(CVA6)的分离、鉴定及分子流行特征。方法取手足口病患儿的咽拭子,将咽拭子病毒悬液接种于人横纹肌肉瘤细胞(RD细胞)。通过CVA6病毒致细胞病变效应(CPE)分析、MTT法检测病毒增殖效果、CVA6病毒特异性核酸聚合酶链反应(PCR)及同源和遗传进化分析等方法检测CVA6的致病效果和分子流行特征。结果咽拭子病毒悬液接种RD细胞盲传5代后出现CPE,收集其病毒培养基上清,再接种RD细胞2次,均出现CPE视为CPE阳性;CVA6病毒VP1区域通过序列比对,以此确认2株病毒为CVA6,分别命名JJ2012037和JJ2012039;CVA6呈时间依赖性抑制宿主细胞增殖;利用CVA6毒株的VP1序列和国内外流行的CVA6序列进行核苷酸同源性分析;该毒株与上海分离到CVA6(JX495144)序列发生的同源性最高(99.2%～99.6%)。结论成功分离出2株九江地区流行的手足口病病原CVA6病毒株,这2株CVA6分离株的分子流行特征接近上海地区的CVA6的流行病原,可能为同一个基因亚型。     

某高中一起柯萨奇病毒A组6型手足口病暴发疫情的流行病学调查

目的 了解某高中一起手足口病暴发疫情的流行病学特征,寻找导致该暴发发生的危险因素,同时了解柯萨奇病毒A组6型(CVA6)手足口病的临床表现.方法 按照病例定义开展病例搜索.采用统一设计的调查表调查患者一般情况和临床表现,采用病例对照研究分析暴发危险因素.结果 该学校从8月17日-9月10日出现28名病例(24例学生,4例家长),其中23例临床诊断病例,5例实验室确诊病例(检出病原体CVA 6).患者中82.1％ (23/28)的病例出现发热症状,64.3％ (18/28)的病例体温≥38.5℃;21.4％(6/28)的病例出现皮疹部位疼痛症状;46.4％(13/28)的病例恢复期出现脱皮症状;17.9％(5/28)的病例出现脱甲症状.发病前1周与手足口病患者接触、饭前不洗手是手足口病发病的危险因素.结论 患者未及时隔离、与患者密切接触和饭前不洗手是造成疾病蔓延的主要原因.CVA6导致的手足口病患者常出现高热、脱甲、脱皮等非典型手足口病临床症状.     

柯萨奇病毒A组6型与肠道病毒71型感染所致手足口病临床特征比较

目的 了解柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒71型手足口病临床特点,为指导临床诊断,调整手足口病防控策略提供科学依据.方法 采用前瞻性调查的方法,收集2013至2014年在北京市西城区手足口病临床确诊病例信息,将手足口病原核酸检测阳性的病例分为CA6、EV71组,分析比较2组的临床特点、流行特征、预后等.结果 CA6组130例,EV71组121例.2组的年龄、性别分布差异无统计学意义.CA6组发热比例高达82.3％,明显高于EV71组(34.7％,P＜0.05),其中大于等于38℃占85.0％.CA6组出现大疱疹(7.4％)、恢复期脱皮(16.9％)、脱甲(10.0％)的比例高于EV71组(P＜0.05).不同年份流行主要毒株不同.结论 与EV71感染相比,CA6感染引起的高热比例较高,部分病例可表现为大疱疹、脱皮、脱甲,整体预后较好.CA6和EV71感染所致的HFMD发病高峰季节不一致.     

柯萨奇病毒A组2型的分离鉴定与遗传进化分析

目的 对2017年山东省临沂市手足口病(hand, foot and mouth disease,HFMD)患儿粪便标本进行病毒分离与鉴定,并对其基因特征进行分析。方法 对HFMD患儿粪便标本进行核酸检测。用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离。对病毒进行全基因组序列测定,通过与人类肠道病毒比较,对分离株进行系统发育分析和基因重组分析。结果 自重症HFMD患儿粪便标本中成功分离到1株柯萨奇病毒A组2型(coxsackievirus A group 2 type, CoV－A2),命名为CoV-A2 SD17-430,系统进化分析进一步确定其基因型属于D2基因型。SD17-430衣壳蛋白编码区与CoV-A2国际原始株同源性高,在非结构蛋白编码区与CoV-A4(MH086949)和CoV-A14(KP036482)同源性高。结论 与原始毒株相比,CoV-A2 SD17-430株发生了较大程度的遗传变异,其进化过程中可能与多个A组肠道病毒发生了基因重组。应继续加强对HFMD病原的全面监测,以便进一步了解其病原谱变化,为制定更有效的HFMD防控策略提供数据参考。     

Molecular characterization of Coxsackievirus A16 strains isolated from children with severe hand,foot, and mouth disease in Yunnan,Southwest China,during 2009-2015

Coxsackievirus A16 (CV-A16) commonly causes mild symptoms, but severe diseases, such as aseptic meningitis, encephalitis, and even fatal cases, have been reported. Thirteen CV-A16 strains were isolated from patients with severe hand, foot, and mouth disease in Yunnan, Southwest China, from 2009 to 2015. Subgenotype B1a and B1b of CV-A16 were predominantly circulating the region with B1b the predominant strain in recent years. The mean rate of nucleotide substitution based on the VP1 gene sequence was 4.545 × 10 ⁻³ substitution per site per year from 2009 to 2015. These results may help in understanding the genetic diversity of CV-A16 and develop a CV-A16 vaccine.     

Identification,phenotypic analysis,and full-length nucleotide sequence of a Dutch Coxsackievirus A20 isolate

Recombination between (human) enteroviruses is a common event in nature. Recently, it has been recognised that this feature has a major impact on the use of the live-attenuated polio vaccine during the end stage of polio eradication. The constraints for successful recombination between (vaccine-derived) polioviruses and human enteroviruses are, however, largely unknown. Here, we describe the identification and characterisation of a HEV-C field strain, isolated from the stool of a 2-year-old Dutch boy. Serotyping indicated that strain 89490 is a variant of strain CAV20a, which is already a variant of the prototype CAV20 strain. Amino acid sequence identity of 94.1% for the entire P1-region, and 92.4% for the major structural protein (VP1) indicates that this strain is indeed related to CAV20. However, virus neutralisation and Western blot analysis failed to show antigenic homology between the prototype CAV20 strain and our field strain. Furthermore, the 89490 field strain, just like the sub-prototype CAV20a, is able to replicate on RD-cells, while the prototype CAV20 and another sub-prototype CAV20b are not. On the basis of the phylogenetic analysis of the P2 and P3 region we expect that strain 89490 can act as recombination partner for the attenuated poliovirus strains of the Oral Polio Vaccine (OPV).     

2009年徐州地区疑似肠道病毒感染病例病原学研究

目的了解2009年徐州地区肠道病毒感染引起手足口病情况,为手足口病防控工作提供科学依据。方法采用荧光RT-PCR方法对240例临床诊断为肠道病毒感染的手足口病例中的222例肛拭子和咽拭子标本同时进行EV和EV71、CAl6特异性RNA检测,用ELA方法对其中的114例急性期血清标本进行EV71．IgM抗体检测。同时检测健康儿童254份咽拭子和258份血清标本以及密切接触者咽拭子54份标本。结果240例疑似肠道病毒感染者,总EV感染率为72．50％（174／240）,其中EV71感染率为57．92％（139／240）,CoxAl6感染率为9．17％（22／240）,其他EV感染率为5．42％（13／240）。240例疑似肠道病毒感染者中的222份肛拭子标本EV7l-RNA阳性率为45．94％（102／222）、咽拭子EV71-RNA阳性率为25．68％（57／222）,114份急性期血清中EV71．IgM抗体阳性率为86．84％（99／114）。254份健康儿童咽拭子EV7l-RNA阳性率为1．57％（4／254）,未检出CoxAl6-RNA;258份健康儿童血清标本EV71-IgM抗体阳性率是2．71％（7／258）。密接（医护人员）咽拭子54份,EV-RNA检测均为阴性。结论徐州地区手足口病流行主要由EV71型引起。3岁以下儿童流行期间存在被EV71型隐性感染,并产生IgM抗体。成人即使密切接触传染源也不易被感染EV71。疑似病例急性期血清中EV71-IgM抗体检测阳性率最高（86．84％）,其次为肛拭子EV71（45．94％）和咽拭子EV71（25．68％）的RNA检测阳性率。ELA试剂盒用于EV71型感染的早期诊断,具有操作简单快速经济,值得在基层推广。     

Human milk can neutralize Coxsackievirus B4 in vitro

The role of enteroviruses in type 1 diabetes has long been suspected. A lower risk of type 1 diabetes is associated with breastfeeding, which could be due to a protective effect against enteroviruses. The neutralizing activity of breast milk against CVB4, a representative of enteroviruses was investigated in this study in vitro. Breast milk was cytotoxic to Hep‐2 cells up to a dilution of 1/32, whereas the aqueous fraction obtained after centrifugation was not cytotoxic; although it inhibited the cytopathic effect of CVB4 on Hep‐2 cell monolayers. The anti‐CVB4 neutralizing activity of aqueous fractions of breast milk from 49 donors living in Northern France and 15 donors living in Congo, where enteroviral infections are more prevalent, were determined. The levels of colostrum activity expressed as titre ranged from <2 to 32 in 36% of the donors from France whereas they were >128 in every donor from Congo. Pasteurized colostrum had a lower anti‐CVB4 activity compared to fresh samples (P < 0.0001, n = 49). The treatment of colostrum samples with jacalin‐coated beads that bind specifically to human IgA, showed that IgA plays a role in anti‐CVB4 activity. There was no correlation between the neutralizing activities of breast milk and serum (P = 0.37, n = 25). The current study showed that the variations in anti‐CVB4 activity in breast milk can be attributed to environmental and living conditions. Whether a low protective activity of breast milk against enteroviruses expose newborns to a higher risk of type 1 diabetes deserves further investigation. J. Med. Virol. 85:880–887, 2013. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.     

陕西省2010-2012年柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析

目的 对陕西省2010-2012年来源于手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）病例的科萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CVA16）毒株的VP1基因特征进行分析,以阐明其分子流行病学特征.方法 利用特异性引物对分离鉴定为CVA16的21株病毒进行VP1编码区扩增.对阳性产物进行序列测定,并用MEGA软件进行序列的生物信息学分析.结果 根据亲缘性分析,本研究的CVA16分别属于B1a和B1b基因亚型,其中仅2011年分离自宝鸡市的10株属于B1a基因亚型,分离自其他4个地市的11株则属于B1b基因亚型.B1a和B1b基因亚型内核苷酸序列同源性分别为99.9％ ～100％和92.93％ ～ 100％.不同基因亚型毒株间核苷酸序列差异为8.43％～9.45％.结论 2010-2012年,属于B1a和B1b基因亚型的CVA16在陕西省共同循环,其中B1b基因亚型流行范围较广,可能为陕西省的优势亚型.     

海南省2010年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析

目的 分析2010年引起海南省手足口病流行柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CA16）的分子流行病学特征.方法 从海南省2010年手足口病（hand,foot,and mouth disease,HFMD）标本中分离到56株CA16毒株,用RT-PCR的方法对VP1编码区扩增及核苷酸序列的测定和整理分析,并与CA16各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树.结果 其中34株属于B基因型中的B1a基因亚型,22株属于B1b基因亚型.B1a基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省西北部相邻的4个县市,B1b基因亚型的毒株主要分布于海口市以及海南省中部、西南部相邻的4个县市.结论 2010年海南省B1a和B1b基因亚型在人群中共循环,两个基因亚型呈现一定区域性分布的特点,提示在海南省CA16至少存在两条大的传播链.在2008年至2010年,海南省手足口病例中CA16感染的比例明显上升,分别为8.05％、5.35％、35.45％.