杜氏盐藻2种碳酸酐酶基因跨内含子DNA序列的克隆和鉴定

目的：克隆杜氏盐藻双拷贝碳酸酐酶(DCA1)和碳酸酐酶(CA1)基因跨内含子基因组DNA序列。方法：利用跨内含子PCR方法,从杜氏盐藻基因组中克隆DCA1和CA1基因跨内含子基因组DNA序列。结果：DCA1基因跨内含子长度为4407bp,含7个外显子,由此推定的氨基酸序列长度为555个氨基酸残基;而CA1基因跨内含子长度为4473bp,含8个外显子,其推定的氨基酸序列长度为498个氨基酸残基。这2种基因的所有外显子一内含子交接点处序列都遵守GT—AG规律。结论：首次克隆得到了杜氏盐藻DCA1和CA1基因跨内含子DNA序列。     

改良的降落PCR与普通PCR结果比较

目的：设计并验证一改良的降落PCR(MTD—PCR)程序。方法：自盐藻bardawi1中提取基因组DNA作为PCR模板，使用TaqDNA聚合酶及pfu DNA聚合酶，运用普通PCR和MTD—PCR程序，扩增胡萝卜素生物合成相关基因(cbr)上游启动子序列，并电泳比较PCR扩增产物的特异性。结果：使用普通Taq酶进行PCR，普通PCR程序产生200bp，500bp和1272bp的3条带，而MTD—PCR程序仅克隆出1272bp的特异带；利用高保真的pfu DNA聚合酶作PCR，在MTD—PCR泳道中也仅有1272bpl条带，而普通PCR除了产生1272bp的特异带外，还出现1条500bp的非特异带。结论：无论使用普通Taq酶或高保真酶pfu，改良的MT—PCR程序均明显提高PCR的特异性，提示它可用于克隆普通PCR难以克隆的基因片段，或在假阳性难以去除的情况下提高PCR的特异性。     

母体血浆游离DNA分子浓度和片段完整性分析

目的应用荧光定量PCR技术研究母体血浆游离DNA分子的浓度和片段的完整性的分子生物学特性。方法提取本院2011年8月42例门诊16～20周妊娠女性和40例进行体检的非妊娠女性的血浆游离DNA,靶基因为lep-tin基因和SRY基因,用荧光定量PCR技术分别对其不同片段进行特异性扩增。leptin基因的扩增片段长度为80、202 bp,SRY基因为83、206 bp,观察其片段完整性和DNA浓度的变化。结果妊娠组和对照组leptin基因80 bp片段长度的DNA浓度平均值分别为681、439拷贝/ml(P<0.01);在片段长度为202 bp的DNA浓度平均值分别为157、91拷贝/ml,中位数为134、85拷贝/ml,表明均有显著性差异(P<0.01)。妊娠组胎儿SRY基因83 bp和206 bp的DNA浓度的平均值为94(38～369)拷贝/ml、80(71～88)拷贝/ml,与妊娠组leptin基因比较,有显著性差异。结论妊娠女性血浆DNA分子浓度明显高于非妊娠正常女性和胎儿游离DNA分子浓度。     

Level and different segments of free DNA molecules in maternal plasma

目的 应用荧光定量PCR技术研究母体血浆游离DNA分子的浓度和片段的完整性的分子生物学特性.方法 提取本院2011年8月42例门诊16 ～20周妊娠女性和40例进行体检的非妊娠女性的血浆游离DNA,靶基因为lep-tin基因和SRY基因,用荧光定量PCR技术分别对其不同片段进行特异性扩增.leptin基因的扩增片段长度为80、202bp,SRY基因为83、206 bp,观察其片段完整性和DNA浓度的变化.结果 妊娠组和对照组leptin基因80 bp片段长度的DNA浓度平均值分别为681、439拷贝/ml(P＜0.01);在片段长度为202bp的DNA浓度平均值分别为157、91拷贝/ml,中位数为134、85拷贝/ml,表明均有显著性差异(P＜0.01).妊娠组胎儿SRY基因83 bp和206 bp的DNA浓度的平均值为94(38 ～369)拷贝/ml、80(71～88)拷贝/ml,与妊娠组leptin基因比较,有显著性差异.结论 妊娠女性血浆DNA分子浓度明显高于非妊娠正常女性和胎儿游离DNA分子浓度.     

对共转化的pC-3-1细胞中乙型肝炎病毒DNA存在状态及HBsAg表达稳定性的研究

用单拷贝(HBV)DNA重组质粒与 TK 基因共转化小鼠Ltk-细胞获得的 HBsAg表达阳性的 pC-3-1 细胞系中,HBV DNA仍以单拷贝存在,并未形成首尾相连的双拷贝结构。对pC-3及其亚系细胞的研究表明,在传代过程中,一些细胞丢失了HBV DNA,一些细胞虽含HBV DNA但不能表达 HBsAg,提示 HBsAg表达的稳定性不但与 HBV DNA是否丢失有关,而且可能与其完整程度和存在状态有关。通过再次克隆和改变HAT培基组分,可以获得HBsAg的稳定表达。     

PCR直接测序法在脓肿分枝杆菌鉴定中的应用

目的探讨聚合酶链式反应（Polymerase chain reaction,PCR）与DNA测序技术鉴定脓肿分枝杆菌的效果。方法利用细菌16S r RNA基因通用引物PCR扩增疑似分枝杆菌的16S r RNA基因的DNA片段并进行DNA测序分析。DNA测序获得序列经生物信息学比对分析获得相关分枝杆菌的信息;针对相关分枝杆菌分别设计非同源区域特异性引物对1 500 bp的克隆DNA片段扩增验证。结果细菌16S r RNA基因通用引物扩增获得约1 500 bp的DNA片段,但DNA测序仅获得其中部分DNA序列约296 bp;部分DNA序列经生物信息学比对分析后获得四种同源性高达98%的分枝杆菌信息,并且四种分枝杆菌的特异性引物对1 500 bp的克隆产物进行扩增后仅在脓肿分枝杆菌中获得特异性PCR产物。结论疑似结核患者体内的抗酸染色阳性菌为非结核分枝杆菌中的脓肿结核分枝杆菌,并且PCR直接测序法可快速鉴定细菌的种属。     

应用染色体原位杂交技术进行基因定位的研究

染色体原位杂交技术是人及哺乳动物基因定位的一种重要技术,可以将克隆的基因或特异的DNA序列直接地并相当精确地定位到染色体的特定区带。我们建立这一方法后,对小鼠a干扰素基因及人21号染色体克隆的DNA序列的定位结果,证明这种技术可用于低拷贝及单拷贝基因及特异DNA序列的定位。     

衣原体基因的分子生物学检测技术研究

沙眼衣原体所致的生殖泌尿系感染,在一些发达国家已被视为性传播疾病之首,我国也已证实有该病存在。本实验研制了衣原体基因的多聚酶链反应和生物素化寡核苷酸探针斑点杂交检测衣原体的技术,结果表明本检测技术为衣原体属特异性,产生210bp的特异性扩增带,检测灵敏度达到相当于1个拷贝的衣原体DNA分子,方法较简便,探针易标记,保存时间较长,反应快速,可在4h左右报告结果,试剂材     

抗菌肽Aurein1.2基因的同向串联及其克隆载体的构建和鉴定

目的: 构建抗菌肽Aurein1.2基因多拷贝串联体,并将目的基因串联产物克隆到载体pUC18上.方法: 分别合成含相同黏性末端的Aurein1.2单拷贝基因、EcoRⅠ前接头及SalⅠ后接头.单拷贝基因分别与前、后接头连接,通过控制基因和接头加入的量及时间,可得到两侧有EcoRⅠ和SalⅠ酶切位点的同向串联的多拷贝基因,选取合适拷贝数的基因,将其克隆到载体pUC18上.结果: PCR鉴定、酶切鉴定和DNA测序证明多拷贝基因重组质粒构建成功.结论: 该方法能方便高效地获得所需的多拷贝基因,为进一步克隆到表达载体并进行高效表达打下基础.     

人衰老相关DNA片段的筛选及特征分析

目的:探索衰老相关新基因.方法:采用RAPD法筛选衰老相关的DNA片段,采用Southern blot 分析基因状态,Northern blot 分析mRNA水平.结果:筛选出衰老特异的DNA片段,长894 bp,命名为sad.将sad片段克隆、测序,查询GenBank,确认为一种新的衰老相关序列,基因登录号为AQ324104.Southern blot分析表明,sad基因可能是一种单拷贝基因;sad在衰老2BS细胞中的Southern blot图谱不同于年轻细胞,而与人胃癌细胞系BGC-823类似.Northern blot分析显示,sad基因具有表达活性,其RNA长约0.5 kb,相对水平在各代龄的细胞间差异无显著性.结论:sad是一种新的与衰老相关的DNA片段,sad基因可能为单拷贝基因,具有表达活性.     

等位基因特异性-PCR联合限制性内切酶消化法检测JAK2V617F突变

目的：建立敏感特异的JAK2V617F点突变的临床检测方法。方法：基因组DNA从HEL细胞或正常志愿者外周血中提取。采用等位基因特异性-PCR（Allele specific—PCR,As—PCR）和限制性内切酶消化的方法检测基因组中JAK2V617F突变。结果：本AS—PCR法可对JAK2基因扩增出364bp的内参照条带,当存在JAK2V617F突变时,又可以扩增出203bp的突变条带。只有野生型内参照条带364bD可被BsaXⅠ消化切割。结论：AS—PCR法和限制性内切酶法是检测JAK2V617F突变的敏感特异的检测方法,可以成功应用于临床检测。     

Microdissection of human high resolution banded chromosome, polymerase chain reaction and microcloning.

A simple technique for microdissection of specific region of human high resolution banded chromosome, followed by polymerase chain reaction (PCR), and microcloning was successfully used to microdissect 4 chromosomal pieces from the distal one third from band 11.2 to the terminal of the short arm of Y chromosome where the testis determining factor is located; 3.6 x 10(4) clones were obtained after 30 cycles of PCR. We analysed 41 clones with insert. The size of insert ranges from 140 to 350 bp (average 250 bp). A Southern blot analysis was done for one of them, and a 2.5 kb Hind III fragment was detected.

     

人脑胶质细胞来源神经营养因子基因的克隆及测序

为研究人脑胶质细胞来源的神经营养因子（ｇｌｉａｌｃｅｌｌｌｉｎｅ ｄｅｒｉｖｅｄ ｎｅｕｒｏｔｒｏｐｈｉｃ ｆａｃｔｏｒ, ＧＤＮＦ） 在神经系统疾病中的作用,根据ＧＤＮＦ 的ｃＤＮＡ 序列设计并合成引物,以流产胎儿脑组织为来源,分别提取ＲＮＡ 和基因组ＤＮＡ 作模板,经ＲＴ ＰＣＲ 和ＰＣＲ 技术扩增人ＧＤＮＦ 基因片段,采用ＤＮＡ 重组技术将其克隆于ｐＧＥＭ Ｔ Ｅａｓｙ 载体中并测序。结果：ＲＮＡ 和基因组ＤＮＡ 体外扩增得到的片段均是４１０ ｂｐ ,两者无差异。ＰＧＥＭ ＧＤＮＦ 经酶切鉴定正确,测序结果与Ｇｅｎｅｂａｎｋ 比较基本相同。由于ＲＮＡ 和基因组ＤＮＡ 扩增得到的片段大小相同,证实该基因片段内无内含子插入,该片段可用于真核及原核表达。     

DNA芯片技术筛选K562肿瘤细胞特异性基因

目的 应用DNA芯片技术筛选人白血病K562细胞中的肿瘤特异性基因。方法 提取正常人白细胞和K562细胞基因组DNA，并用限制性内切酶Sau3AI酶切。其中K562细胞基因组酶切产物经DNA聚合酶Ⅰ补平加A后克隆到T-载体，挑选阳性克隆，用PCR扩增．以纯化的PCR产物做探针，制备K562细胞基因组DNA芯片。正常人白细胞基因组酶切产物加上人工通用接头，用限制性标记技术标记上荧光标记物Cy3，与制备的K562细胞基因组DNA芯片杂交。结果 芯片杂交结果经扫描分析，发现42个K562细胞肿瘤特异性基因，进一步用序列分析证实．其中有1个为BCR(breakpoint cluster gene)基因。结论 我们自制的K562细胞基因组DNA芯片可以成功地用于筛选肿瘤特异性基因．为更好地从基因组水平研究肿瘤发生的分子机制提供了新的技术途径。     

三个鼠源性肿瘤细胞系的RAPD分析

目的：探讨鼠源性肿瘤细胞系基因组不稳定程度或基因组损伤与肿瘤发生的关系。方法：用145条RAPD引物对鼠源性Lewis肺癌、SCC891乳腺癌及B16黑色素瘤及其相应正常组织基因组DNA进行RAPD扩增，扩增产物在含溴化乙锭的1．5％琼脂糖凝胶中电泳，紫外透射仪上观察照相。结果：145条引物绝大多数能扩增出清晰、明显的条带。多数引物扩增出的条带呈单态性，在肿瘤及其相应正常组织之间无差异。部分引物扩增出的DNA序列在肿瘤组织与其相应正常组织间存在差异，表现为多态性，即肿瘤组织与其相应正常组织的DNA片段相比，出现带的缺失、增加、移动和强度变化。扩增Lewis肺癌的105条引物中有25条表现多态性；扩增B16黑色素瘤的105条引物中有24条表现出多态性；扩增SCC891乳腺癌的120条引物中有18条表现出多态性。结论：RAPD扩增结果表明三个恶性度较高的瘤株，其基因组损伤程度亦较高，表现为基因拷贝数的增加或等位基因的丢失，进步证实了细胞的癌变与基因组某些改变密切相关。     

体外转录系统质粒pNI-11和pNI-12的构造

本文介绍将大鼠心房肽(ANP)前体的互补DNA(proANP—cDNA)的PstI片段再克隆到具有双向转录启动子的质粒pGEM—2中,构建了体外转录系统的质粒pNI—11和pNI—12。用限制性內切酶AccI消化重组的质粒,结合电泳比较酶谱,区别出插入段cDNA的方向。用这种质粒可以体外合成高灵度的探针,可供基因调控、原位杂交等多方面研究。判断插入基因在重组质粒中方向的方法有普遍意义。     

新的白血病相关基因LRP16的克隆

目的 发现新的白血病相关基因及探讨白血病的发生机制。方法 应用分子克隆技术ＲＬＧＳ及ＲＡＣＥ技术自急性髓细胞白血病骨髓标本中克隆新的白血病相关基因。结果 克隆到一个长度为２９４８ｂｐ的ＤＮＡ片段,经国际基因库同源检索证明为一未知基因的一部分,并定位于第１１号染色体长臂１１区,进一步克隆到这一基因的全长ｃＤＮＡ,其长度为９８０ｂｐ,并被国际基因库以新的人类基因ＬＲＰ１６收录入库。结论 ＲＬＧＳ及ＲＡ     

拖丝蛋白全基因亚克隆文库的构建和部分序列的测定

目的 为获得蜘蛛拖丝蛋白全基因。方法 以斑点杂交、Southem印迹结果证实了的蜘蛛拖丝蛋白全基因的克隆，构建其亚克隆文库，采用鸟枪法测序的策略，选取以HinfI为酶切工具，对Scos—DS1的DNA做大量酶切，以pUC19为载体，取插入片段大小为500bp左右的阳性重组子100个构建拖丝蛋白基因的亚克隆文库。结果 成功地构建了蛛丝蛋白基因Scos—DS1由HinfI酶切片段连接而成的亚克隆文库，得到了其部分序列。结论 亚克隆方法可以得到拖丝蛋白基因全序列。