基于网络药理学与分子对接探讨紫草治疗银屑病的作用机制

目的运用网络药理学与分子对接探索紫草治疗银屑病的作用机制。方法通过TCMSP、PubChem及Swiss Targe Prediction数据库和Gene Cards、OMIM数据库筛选紫草活性成分、疾病靶点,运用Cytoscape软件构建药物与疾病间相互作用网络,筛选紫草治疗银屑病的活性成分及靶点;基于R软件进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;将活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果预测得到17个紫草治疗银屑病的活性成分和55个差异基因,并推断其作用机制可能与乙型肝炎、糖尿病并发症、胰腺癌、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Rap1信号通路、IL-17信号通路等有关。其中TNF、EGFR、MMP3、PTGS2等基因可能为关键靶点;分子对接结果显示:去氧紫草素与PTGS2蛋白的亲和力较好。结论紫草治疗银屑病具有多成分-多靶点-多通路的作用特点,为阐述紫草治疗银屑病的作用机制和开展进一步的研究提供依据。     

基于网络药理学探讨四妙丸治疗腰椎间盘突出症的作用机制

目的：采用网络药理学的研究方法,对四妙丸用于治疗腰椎间盘突出症(LDH)的药理作用以及机制问题进行研究和探讨。方法：借助TCMSP平台筛选出四妙丸活性药物成分及靶标预测。从OMIM数据库、GeneCards数据库、Drugbank数据库中检索出疾病靶标。采用R软件确定了四妙丸-LDH的交集靶点并利用STRING网站进行蛋白互作。利用Cytoscape软件构建了药物成分-交集靶点网络。最后在R软件将交集靶标进行富集分析。结果：分析研究显示共挖掘到了四妙丸中活性药物成分75种及预测靶点2 902个、399个LDH疾病相关靶点,取交集后得到四妙丸-LDH交集靶点45个,分析得到MAPK14、MAPK1、IL6、ESR1、FOS和JUN可能为核心靶点,汉黄芩素、槲皮素可能为四妙丸治疗LDH的关键活性化合物。GO富集分析得到GO条目2 004个,KEGG分析得到AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等可能为作用通路。结论：四妙丸中有多个对LDH有抑制作用的药效成分,多成分多靶标共同作用是其作用机制。     

基于网络药理学探讨黄芩治疗痤疮的作用机制

目的 采用网络药理学方法研究黄芩治疗痤疮的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索黄芩的活性成分和靶标,采用GeneCards和在线人类孟德尔遗传（OMIM）数据库筛选痤疮的潜在靶点;通过Cytoscape3.7.1软件绘制黄芩治疗痤疮的“成分-靶点-通路-疾病”网络图,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并对关键靶点进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 从黄芩中筛选出与痤疮有关的活性成分29个,通过干预36个靶点、247条通路治疗痤疮;富集分析显著的生物功能主要为核受体活性、转录因子活性,直接配体调节的序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、四吡咯结合等。KEGG信号通路结果显示,黄芩治疗痤疮的关键基因显著富集在白细胞介素-7(IL-7)信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、松弛素信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。结论 黄芩主要通过多成分、多靶点、多通路的作用治疗痤疮,而非通过单一机制...     

基于网络药理学探讨赤芍治疗肺动脉高压的活性成分及作用机制

目的 采用网络药理学研究赤芍治疗肺动脉高压的潜在作用靶点及信号通路。方法 检索TCMSP数据库得到赤芍的有效成分及作用靶点,肺动脉高压相关疾病靶点主要通过检索TTD、GeneCards和OMIM等数据库获得。通过绘制韦恩图获取赤芍和肺动脉高压的交集靶点,交集靶点蛋白相互作用网络（PPI）利用STRING数据库构建。利用DAVID数据库在线工具对赤芍和肺动脉高压的交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 获得赤芍有效活性成分共29个,包括鞣花酸、芍药苷、黄芩素和黄芩苷等,通过PPI图得到IL-6、AKT1、TNF、TP53、VEGFA等关键蛋白。富集分析显示,参与的通路主要集中在HIF-1信号通路、Toll-受体信号通路、NF-kB信号通路、和TNF信号通路等。结论 赤芍治疗肺动脉高压可能通过调节IL-6、AKT1、TNF、VEGFA和MMP9等关键蛋白,干预HIF-1信号通路、Toll-受体信号通路、NF-kB信号通路和TNF信号通路等来发挥作用,确切机制仍需要进一步的实验验证。     

基于网络药理学和分子对接探讨四妙丸治疗高尿酸血症的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接探讨四妙丸治疗高尿酸血症的作用机制。方法 利用 TCMSP、SEA、Swiss 和PharmMapper数据库预测四妙丸活性成分的作用靶点,运用GeneCards和TCD数据库检索与高尿酸血症相关的疾病靶点。使 用Cytoscape 3.6.1构建蛋白质相互作用网络图,通过STRING平台对四妙丸治疗高尿酸血症的靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。利用SwissDock平台进行分子对接,预测主要化合物与关键靶点的结合度。结果 本研究共筛选出四妙丸中的28种活性成分及429个潜在靶点,与高尿酸血症相关的疾病靶点有494个,得到四妙丸与高尿酸血症的共同靶点有118个,并筛选出其中几个关键靶点AKT1、IL-6、JUN、TNF和CASP3进行分子对接,对接结果显示AKT1、IL-6、JUN、TNF和CASP3与小檗红碱、表小檗碱、豆甾醇、谷甾醇等具有良好的结合活性。预测AKT1、IL-6、JUN、TNF和CASP3可能是四妙丸治疗高尿酸血症的关键靶点。KEGG通路富集分析结果显示四妙丸可能通过TNF信号通路、IL-17信号通路、细胞凋亡信号通路等多条信号通路治疗高尿酸血症。结论 四妙丸是通过多组分、多靶点和多途径协同治疗高尿酸血症,为后续进一步研究四妙丸的活性成分及作用机制提供了依据。     

柴胡-黄芩药对治疗新型冠状病毒肺炎作用机制的网络药理学研究

目的:研究柴胡-黄芩药对治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法:从人类基因数据库(GeneCards)获取COVID-19的疾病靶点,应用中药系统药理学数据库(TCMSP)查找柴胡-黄芩药对的活性成分和靶点,查询条件设定为口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,使用Cytoscape3.7.2软件建立活性化合物-靶点网络图,STRING在线数据库构建靶点蛋白与蛋白之间互作网络,借助DAVID平台对靶蛋白进行基因功能(GO)和信号通路(KEGG)分析,构建靶基因-信号通路关系网络。结果:从柴胡-黄芩药对中筛选出槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、异鼠李素等53种有效活性成分,作用于PTGS2、PTGS1、DPP4、CALM1、NOS2、PPARG等42个COVID-19相关的靶蛋白,参与脂多糖反应、调控凋亡信号通路、应答氧化应激反应、生物刺激回应、细菌源性分子细胞反应、调控细胞因子产生等生物学过程,调控AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等信号通路。结论:揭示了柴胡-黄芩药对通过多成分,发挥多靶点、多信号通路治疗COVID-19的科学内涵。     

网络药理学视角下泻心汤对胃溃疡的作用机制

目的：通过网络药理学方法，以“药物-成分-靶点-通路-疾病”网络使泻心汤治疗胃溃疡的作用机制得以具体化、精准化、可视化展示，为进一步探讨泻心汤治疗胃溃疡作用机理奠定基础。方法：在TCMSP数据库中检索泻心汤的有效成分和作用靶点，在Uniprot数据库中检索药物靶点所对应的人类基因；在GeneCards数据库中检索胃溃疡的疾病靶点；使用韦恩图获取有效成分与疾病的共有靶点；在String数据库中进行蛋白相互作用（PPI）数据分析，在Cytoscape 3.7.1中进行PPI可视化分析；使用Metascape数据库实现GO功能、KEGG通路富集分析，使用在线网络作图工具绘制高级气泡图。在Cytoscape 3.7.1中制作“药物-有效成分-关键靶点-通路”网络图。结果：泻心汤有63个有效成分、228个作用靶点，与胃溃疡有109个交集靶点，获得1 803个GO条目、176条KEGG富集通路。结论：泻心汤通过槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、刺槐素、芦荟大黄素等有效成分调控AKT1、TP53、IL6、TNF、VEGFA等核心靶点，以及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、TNF信号通路等主要通路，发挥抗炎、抑酸、抗幽门螺杆菌、保护胃粘膜、防癌抑癌等作用，对胃溃疡起到治疗目的。     

基于网络药理学和分子对接研究白芍-防风治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的 采用网络药理学方法和分子对接探索白芍-防风治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索白芍-防风活性成分及作用靶点;利用GeneCards、OMIM、TTD数据库检索疾病相关基因,以Uniprot数据库对相关基因标准化;运用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图;用STRING数据分析蛋白相互作用(PPI);应用DAVID数据库对关键靶基因进行GO与KEGG富集分析;用AutoDock和Pymol将核心有效成分β-谷甾醇、山柰酚、汉黄芩素与关键靶标进行分子对接。结果 白芍-防风药对共筛选出33种活性成分,潜在的药物靶标108个,与UC的交集靶点54个。其中山柰酚与UC交集基因数目27个、汉黄芩素27个、β-谷甾醇11个。白芍-防风药对与UC交集的核心靶点26个,主要作用于AKT1、IL6、TP53、MAPK8等基因,涉及NF-κB信号通路、PI3K-Ak信号通路和MAPK信号通路。结论 白芍-防风可能通过山柰酚、β-谷甾醇和汉黄芩素等活性成分作用于多个炎症和免疫相关的分子靶点和信号通路治疗UC。     

基于网络药理学及分子对接探讨湿润烧伤膏促进糖尿病溃疡愈合的作用机制

目的：利用网络药理学和分子对接技术对湿润烧伤膏治疗糖尿病溃疡的主要活性成分和潜在作用机制进行探讨。方法：基于TCMSP数据库筛选湿润烧伤膏主要活性成分和作用靶点，从GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库中查找糖尿病溃疡相关靶点，使用STRING 11.5数据库构建蛋白互作（PPI）网络筛选核心靶点，在Cytoscape 3.8.2软件中制作“药物-靶点-疾病”网络图筛选核心活性成分，使用R语言软件进行基因GO功能和KEGG通路富集分析，最后应用分子对接对筛选结果进行初步验证。结果：筛选出湿润烧伤膏37个活性成分映射100个作用靶点，糖尿病溃疡疾病靶点5 527个，交集靶点77个，PPI网络拓扑分析提示TP53、TNF、HSP90AA1等为关键靶点；“药物-靶点-疾病”网络图显示刺槐素、汉黄芩素、槲皮素、吴茱萸次碱等为核心活性成分；GO功能分析主要涉及血管生成、离子转运、管径调节、细胞因子受体结合等过程，KEGG富集分析主要包括PI3K-Akt、AGE-RAGE等信号通路；分子对接显示核心活性成分和关键靶点均具有较好的对接活性。结论：湿润烧伤膏治疗...     

基于网络药理学探讨运脾化浊膏干预代谢综合征的作用机制

目的：通过网络药理学探讨运脾化浊膏干预代谢综合征的作用机制。方法：筛选并重合运脾化浊膏与代谢综合征的靶点,于String11.5平台构建蛋白质互作网络,于Metascape平台进行GO,KEGG分析,通过Cytoscape3.8.2构建出“药物-四气五味归经”、“药物-成分-作用靶点”、“药物-疾病PPI”、“药物-成分-疾病-通路”等网络图并加以分析网络图与作用机制。结果：运脾化浊膏内有效成分99种,作用靶点261个;挖掘疾病数据库获得代谢综合征疾病靶点2464个,共同靶点261个,筛选出核心靶点26个。经Cytoscape3.8.2预测其主要活性成分可能为β-谷固醇及豆甾醇等,分析GO与KEGG通路,运脾化浊膏可通过结合DNA结合转录因子、磷酸酶、染色质、转录因子等,并调节信号受体激活剂、核受体、配体激活转录因子等活性来改善MS相关症状,及主要通路可能与AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路相关。结论：初步探究运脾化浊膏治疗代谢综合征的作用机制,其作用通路可能为AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路。     

基于网络药理学及分子对接探究酸枣仁异喹啉生物碱与黄酮碳苷协同抗抑郁的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探讨酸枣仁异喹啉生物碱与黄酮碳苷协同抗抑郁的作用机制。方法：TCMSP等数据库中检索酸枣仁异喹啉生物碱与黄酮碳苷类化合物，Swiss Target prediction预测靶点，GeneCards等数据库中检索抑郁症靶点，取交集靶点。STRING、Cytoscape 3.7.2构建PPI网络图，DAVID进行KEGG富集分析。利用Auto Dock Tools1.5.6对活性成分及关键靶点进行分子对接验证。结果：获得异喹啉生物碱、黄酮碳苷与抑郁症三者交集靶点18个。主要通过TP53、Akt1、GSK3B等核心靶点，作用于神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、钙信号通路等多条通路。分子对接结果显示关键成分与Akt1、TP53的对接分数较低。结论：酸枣仁异喹啉生物碱与黄酮碳苷通过多靶点、多通路协同发挥抗抑郁作用。     

基于网络药理学分析土茯苓治疗银屑病的作用机制

目的:以网络药理学为基础分析土茯苓在银屑病治疗中的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献检索获取土茯苓的活性成分及有关靶标。利用GeneCards和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库筛选土茯苓活性成分治疗银屑病的潜在靶标。通过Cytoscape软件绘制土茯苓治疗银屑病形成的"成分-靶标-通路-疾病"网络图。利用STRING数据库进行靶点蛋白相关作用网络构建并对关键靶点的生物功能进行注释和通路分析。结果:从土茯苓中筛选与银屑病有关活性成分12个,107个共同靶点、7条生物代谢途径在治疗银屑病的过程中发挥作用。结论:土茯苓在治疗银屑病的过程中通过多个活性成分、作用靶点以及生物代谢途径发挥作用,而非通过某一单一机制发挥作用,其作用机制具有多靶点的特征。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨射麻口服液治疗新型冠状病毒肺炎作用机制

目的针对射麻口服液抗病毒机制不明的问题,采用网络药理学和分子对接技术,分析其主要有效成分和作用靶点并构建相应通路,探讨射麻口服液治疗新型冠状病毒的作用机制。方法利用TCMSP数据库及文献检索收集射麻口服液中每味药的活性成分及其作用靶点,运用GeneCards数据库收集新型冠状病毒肺炎的相关靶标,通过韦恩图获取射麻口服液抗新型冠状病毒的潜在靶点,应用STRING数据库与Cytoscape3.7.1软件构建潜在靶点的蛋白互作网络图,采用Cytoscape3.7.1软件构建中药饮片-化学成分-潜在靶点网络图,利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO富集分析,同时,在中药饮片-化学成分-潜在靶点网络图中筛选自由度较大的化学成分及单味药材质控成分作为主要活性成分,将主要活性成分与新型冠状病毒侵袭人体有关的靶点——血管紧张素转化酶II、新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶进行分子对接。结果中药饮片-化学成分-潜在靶点网络图共包括潜在活性成分86个,潜在靶点53个。GO富集分析得到具有统计学意义(P0.05)的生物过程条目有细胞凋亡信号通路、炎症反应、对活性氧的反应、对细胞因子的反应等,分子功能条目有转录激活子活性、RNA聚合酶II转录调控区序列特异性结合、氧化还原酶活性、细胞因子活性等,细胞组成条目有细胞外空间、内质网、高尔基体等。分子对接显示主要活性成分如汉黄芩素、黄芩素、麻黄碱、伪麻黄碱、野鸢尾黄素、芥子碱、苦杏仁苷、黄芩苷均与血管紧张素转化酶II、新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶有较好的亲和力。结论射麻口服液可通过多成分、多靶点、多通路作用于新型冠状病毒肺炎并发挥疗效。     

基于网络药理学探讨独活-羌活-细辛治疗膝骨关节炎的作用机制*

目的 基于网络药理学的方法分析和预测独活-羌活-细辛治疗膝骨关节炎可能的作用机制。方法 利用TCMSP数据库获取独活、羌活、细辛的活性成分及靶点,与CTD、NCBI等数据库获取的膝骨关节炎疾病基因靶点映射,构建药物-活性成分-疾病靶点网络。进行MCODE聚类分析,通过Omicshare云平台和DAVID数据库GO、KEGG通路富集分析。结果 从3味药中共筛选出了36个活性成分及205个靶点,主要有山柰酚、 β-谷甾醇、芝麻脂素、异紫花前胡苷等关键成分,AKT1、ESR1、JUN、CASP3等为关键靶点,核心基因有NOS3、ESR1、COX1、NR1I2,关键的生物进程和通路有类固醇激素反应性、活性氧代谢过程、AGE-RAGE通路和TNF通路。结论 独活-羌活-细辛可能通过多成分、多靶点网络来治疗膝骨关节炎。     

基于网络药理学及分子生物学验证探讨畲药黄荆条黄酮类成分抗类风湿关节炎的作用机制

目的 运用网络药理学及分子生物学验证探讨畲药黄荆条黄酮类成分治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 在中国知网、万方、维普和TCMSP数据库筛选黄荆条的黄酮类成分,通过Swiss Target Prediction平台获取活性成分的靶点;通过Gene Cards和CTD数据库获取RA的治疗靶点;利用Cytoscape软件构建黄荆条抗RA的活性成分-作用靶点网络和蛋白质相互作用（PPI）网络;应用R软件对黄荆条抗RA的作用靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;应用Autodock vina软件对关键活性成分和靶点进行分子对接验证。采用Western blot验证黄荆条醇提物（HJT-E）及关键成分木犀草素（LUT）对LPS刺激的RAW264.7细胞MMP9、COX-2和AKT1蛋白的调控作用。结果 共得到活性成分靶点309个,RA治疗靶点455个,黄荆条黄酮类成分抗RA的50个靶点;黄荆条治疗RA的关键黄酮类成分主要有LUT、槲皮素、芹菜素、金合欢素等,关键靶蛋白主要有CASP3、MMP9、PTGS2、AKT1等;GO富集分析及KEGG富集分析表明,黄荆条黄酮类成分可调控多种生物学过程及通路,包括AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等;细胞实验验证结果显示,HJT-E及LUT可通过抑制MMP9、COX-2和AKT1蛋白的表达发挥抗炎作用,证实了本研究中网络药理学分析结果的可靠性。结论 畲药黄荆条黄酮类成分通过多靶点和多途径调控成纤维样滑膜细胞增殖、促进其凋亡及缓解炎症反应以发挥抗RA的作用。     

基于网络药理学探讨九痛丸治疗肺癌胸痛可行性验证分析

现代医家临床应用九痛丸多依据《金匮要略》中“治九种心痛”的注解用以治疗心系疾病所致的心胸疼痛,但由于其用药峻猛,理论上与心系疾病常见的气虚血瘀、痰湿毒邪内阻的发病机理并不完全符合,因此临床研究较少。宋鲁成教授在临床诊疗中发现,九痛丸可能是张仲景治疗癌性胸痛的处方,效用极佳,但是近现代文献中尚未有人对九痛丸与治疗肺癌进行系统的研究。因此文中基于网络药理学和生物信息学等方法,研究应用九痛丸治疗肺癌胸痛的具体作用通路与可能机制,并通过实验验证九痛丸治疗肺癌胸痛的理论以及可行性。文章主要通过药理学数据库检索,得到九痛丸药物组成中的活性成分及对应靶点,然后再挖掘肺癌已知发病相关基因靶点,将药物与疾病靶点做成靶点网络后取交集进行分析,筛选九痛丸与肺癌相关性最强的特异性靶点并进行信号通路富集分析,显示九痛丸作用于肺癌的关键节点涉及的信号通路主要被富集在细胞周期调控、细胞增殖、凋亡、肿瘤转录调控失调、病毒致癌及其他肿瘤通路等100余条信号通路。筛选其中肿瘤细胞周期调控这一关键作用机制,选择人肺癌细胞(SPC-A1)进行实验验证,结果发现流式细胞分析显示九痛丸可明显抑制SPC-A1的增殖,明显促进其凋亡。提示九痛丸能通过抑制肿瘤细胞增殖来治疗肺癌。     

基于网络药理学与分子对接研究中药乐脉颗粒治疗冠心病心绞痛的活性物质及作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探究乐脉颗粒治疗冠心病心绞痛的物质基础及作用机制。方法:通过TCMSP、ETCM等数据库及文献检索收集乐脉颗粒的化学成分信息;利用SwissTargetPrediction数据库收集活性成分靶点;疾病靶点通过GeneCards、DisGeNET等数据库收集;使用Venny获得交集靶点并绘制韦恩图;运用DAVID数据库进行生物功能注释与富集分析;使用Cytoscape软件构建乐脉颗粒活性成分-冠心病心绞痛靶标网络并进行网络拓扑学分析;通过AutoDock进行分子对接验证。结果:乐脉颗粒7味中药共有176个化学成分及975个靶点,冠心病心绞痛共有234个靶点,疾病与成分共有靶点65个;网络药理学技术分析得到乐脉颗粒通过丹酚酸A、芍药内酯苷、丹参新醌D、亚油酸、拟丹参醛、槲皮素和芍药苷等主要活性成分,参与PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路和钙信号通路等多种信号通路,作用于IL-6、MMP-9、TNF、ICAM-1等关键靶点来影响炎症反应、缺氧反应和血栓形成等病理过程。分子对接结果显示主要成分与核心靶点之间结合情况好。结论:乐脉颗粒治...     

基于网络药理学和分子对接探讨宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术，探究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID数据库筛选宣肺润燥解毒方活性成分，利用有关数据库筛选新冠肺炎相关靶点。以Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络，并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出宣肺润燥解毒方有效成分3019个，潜在靶点525个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素与关键靶点ATK1、TNF、TP53具有良好亲和力。结论 本研究初步明确宣肺润燥解毒方通过多成分-多靶点-多通路治疗新冠肺炎的作用机制，为深入研究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制提供了前期参考。     

基于网络药理学及分子对接探讨乌梅丸治疗腹泻型肠易激综合征的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接探讨乌梅丸改善腹泻型肠易激综合征(IBS-D)的作用机制。方法 通过中医药系统药理学平台(TCMSP数据库)检索和预测乌梅丸中各药物活性成分及对应靶点,在GeneCard、OMIM等数据库筛选IBS-D靶点,利用相关软件分别构建Venn图、“中药-活性成分-靶点”作用网络及PPI网络,并进行GO、KEGG分析和分子对接及相关结果的可视化。结果 乌梅丸治疗IBS-D的活性成分129个,治疗靶点191个。PPI网络分析得到30个核心靶点,其中包括HSP90AA1、 JUN、RELA、MAPK1、AKT1、ESR1、IL6、FOS、MAPK8、NCOA1等。GO分析显示生物过程有2177条,分子功能有169条,细胞成分有77条。KEGG分析提示IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll-like受体信号通路和NF-κB信号通路在乌梅丸治IBS-D过程中起着关键作用。分子对接显示,核心靶点JUN、MAPK1、FOS与部分活性成分结合较为稳定。结论 乌梅丸可能通过活性成分槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚与HSP90AA1、JUN、RELA、MAPK1、AKT1、ESR1...     

基于网络药理学和分子对接探究甘草附子汤治疗类风湿关节炎的机制

目的：通过网络药理学结合分子对接的研究方法,预测甘草附子汤治疗类风湿关节炎的作用靶点,探究其治疗类风湿关节炎的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索甘草附子汤中包含的4种中药的有效成分及其靶基因。GEO数据库下载类风湿关节炎数据,筛选差异基因(DEGs)并与甘草附子汤有效成分靶基因取交集,获得甘草附子汤治疗类风湿关节炎的潜在靶点。通过Cytoscape软件构建中药-活性成分-疾病靶点网络,PPI网络分析得到甘草附子汤治疗类风湿关节炎的关键靶点并通过Metascape数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,预测其作用机制,最后应用AutoDuck及PyMOL进行分子对接,验证其结合能力。结果：中药-活性成分-疾病靶点网络包含药材节点4个,活性成分节点95个,作用靶基因节点44个。Network Analysis显示槲皮素、山萘酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮,柚皮素及芒柄花素为可能的关键活性成分。甘草附子汤活性成分作用于类风湿关节炎可能主要通过IL-17 信号通路,TNF 信号通路,破骨细胞分化等信号通路。分子对接结果显示甘草附子汤中的活性化合物与关键靶点分子 MMP9、CXCL8、PPARG、EGFR具有较高的亲和力。结论：甘草附子汤中的活性成分可能通过与MMP9、CXCL8 、PPARG、EGFR等靶点调节多条信号通路,从而发挥对类风湿关节炎的治疗作用,为研究甘草附子汤治疗类风湿关节炎分子机制提供新思路。