脑胶质瘤组织中FOXC1 mRNA的表达水平及其与预后的相关性

目的 探讨脑胶质瘤组织中叉头框C1 (FOXC1) m RNA表达水平及其与预后的相关性。方法 基于TCGA数据库中下载脑胶质瘤的基因表达谱数据和患者的临床-病理资料，比较701例脑胶质瘤组织及50例正常脑组织中FOXC1 m RNA表达水平的差异，多因素COX回归分析胶质瘤患者预后的危险因素，采用K-M曲线分析胶质瘤组织中FOXC1表达和总体生存率的关系，利用TIMER数据库分析胶质瘤组织中FOXC1表达与免疫细胞浸润程度的相关性。纳入我科20例脑胶质瘤患者和20例脑外伤患者作为研究对象，采用免疫组化法探讨胶质瘤组织及正常脑组织中FOXC1阳性表达率的差异。结果 脑胶质瘤组织和正常脑组织中FOXC1 mRNA表达水平分别为1.87 (1.54,2.16)和1.61 (1.14,1.92)，与正常脑组织比较，脑胶质瘤组织中FOXC1 m RNA表达水平显著升高，差异有显著统计学意义(P<0.01)。脑胶质瘤中FOXC1高表达和低表达患者的中位生存时间分别为933 d和2 835 d，脑胶质瘤中FOXC1高表达生存率显著降低(HR=1.76,95%CI:1.25～2.49,P=0....     

RPL3可作为低级别胶质瘤的预后标志物且与免疫细胞浸润相关

目的 研究核糖体大亚基蛋白3(ribosomal protein L3,RPL3)在低级别胶质瘤(low-grade glioma, LGG)中的表达、潜在的预后价值及其对免疫细胞浸润的影响。方法 提取肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)、基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression, GTEx)、基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis, GEPIA)、人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas, HPA)和肿瘤免疫评估资源(Tumor IMmune Estimation Resource, TIMER)数据库中LGG相关数据集，应用多种生物信息学分析，探讨RPL3与LGG预后、临床病理特征、免疫细胞浸润、免疫检查点表达等相关性。结果 与正常组织相比，LGG肿瘤组织中RPL3的mRNA水平和蛋白水平升高。单变量和多变量Cox分析发现，RPL3是LGG的独立预后因素，且RPL3低表达与LGG预后不良相关。RPL3表达与CD8^+<...     

基于生物信息学分析SSX1与卵巢癌预后及免疫细胞浸润的关系

目的 探究SSX1在卵巢癌（OV）中的表达水平、预后价值及与免疫细胞浸润的相关性。方法 基于癌症基因组图谱数据库（TCGA）、基因型组织表达（GTEx）数据库分析SSX1 mRNA在卵巢癌组织及正常卵巢组织中的表达差异。利用Kaplan-Meier(KM)plotter及COX回归评估SSX1在卵巢癌中的预后价值,利用TIMER2.0网站分析SSX1与卵巢癌患者免疫细胞浸润的相关性。结果 SSX1 mRNA在卵巢癌的表达水平明显高于正常卵巢组织（P<0.01）;Kaplan-Meier plotter和COX回归模型分析显示高表达SSX1与OV患者预后不良存在相关性（P=0.0013）,且SSX1高表达是OV患者预后的独立危险因素。免疫浸润结果显示,SSX1表达与多种免疫浸润细胞呈负相关。结论 通过生物信息学的数据挖掘发现SSX1在OV中高表达,且与OV患者的预后及免疫细胞浸润存在相关性。     

CREB1在胶质瘤中的表达及其对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响

目的：探讨CREB1在胶质瘤中的表达及其对人脑胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响。方法：采用中国脑胶质瘤基因组计划（CGGA）数据库中CREB1在不同级别胶质瘤组织中的表达数据,分析CREB1的表达水平与胶质细胞瘤患者临床预后的相关性。采用CREB1小干扰RNA（si?CREB1）转染胶质瘤U251及U87细胞,通过CCK8试验及Transwell试验观察下调CREB1表达后胶质瘤细胞增殖和侵袭能力的变化。结果：CREB1在人脑高级别胶质瘤组织中的表达高于低级别组,胶质瘤患者中高表达CREB1提示预后不良。下调CREB1表达可以抑制胶质瘤细胞的增殖和侵袭能力。结论：CREB1与胶质瘤的病理级别和临床预后相关,si?CREB1可以抑制胶质瘤细胞的增殖和侵袭能力。     

亲环蛋白B在脑胶质瘤中的表达及意义

目的 探讨亲环蛋白B(cyclophilin B, PPIB)在脑胶质瘤中的表达与临床病理特征、患者生存期的关系,以及与肿瘤相关巨噬细胞浸润的相关性。方法 基于癌症基因组数据集(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库资料,比对正常、低级别和高级别脑胶质瘤中PPIB的表达情况,采用免疫组织化学染色方法检测脑胶质瘤病理组织中PPIB的表达;基于TCGA数据库临床病例资料,分析脑胶质瘤PPIB表达与临床病理特征的关系;采用Kaplan-Meier法评估PPIB表达差异对脑胶质瘤患者生存期的影响;免疫荧光法分析脑胶质瘤病理组织中PPIB表达及其与肿瘤相关巨噬细胞浸润的相关性。结果 高级别脑胶质瘤中PPIB的表达明显高于正常组织及低级别脑胶质瘤;PPIB与胶质瘤级别、IDH野生型、1p/19q非共缺失等显著相关(P＜0.001);PPIB高表达患者的总生存期、无进展间隔期均低于PPIB低表达患者;除高级别脑胶质瘤病理组织中PPIB表达升高外,PPIB高表达区域伴随大量肿瘤相关巨噬细胞浸润。结论 相较于低级别胶质瘤,高级别胶质瘤PPIB表达水平更高,且PPIB表达区域存在明显肿瘤相关巨噬细胞浸润。提示PPIB可能作为脑胶质瘤患者独立预后因素,为患者预后判断提供参考。     

ZMPSTE24表达水平与原发性胶质瘤的关系:一项基于CGGA数据库的研究

目的 探讨ZMPSTE24表达水平与原发性胶质瘤的关系。方法 从中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)下载325例胶质瘤患者的临床数据和mRNA测序数据。提取ZMPSTE24基因表达量并与临床数据配对合并,同时剔除相关临床数据缺失的病例。依据ZMPSTE24基因在原发性胶质瘤患者(n=210)组织中表达量的中位值(18.61)将入选病例分为高表达组(105例)和低表达组(105例)。采用Wilcoxon符号秩检验和Logistic回归分析ZMPSTE24表达水平与各临床因素的相关性。使用Cox回归和Kaplan-Meier方法评估ZMPSTE24表达水平与胶质瘤患者总生存期的影响。通过基因富集和共表达分析,推测ZMPSTE24可能参与的分子通路和上下游分子。用STRING数据库,寻找与ZMPSTE24存在相互作用的分子并评价其价值。利用TIMER2.0数据库探究ZMPSTE24表达水平与胶质瘤免疫浸润细胞之间的相关性。最后利用人类蛋白图谱数据库(HPA)和临床胶质瘤病理组织行免疫组织化学和蛋白免疫印迹实验进行验证。结果 在CGGA数据库中,原发性胶质瘤患者ZMPSTE24高表达组的总生...     

基于生物信息学分析ZNF217在低级别胶质瘤中表达的临床意义

目的利用生物信息学分析ZNF217在低级别胶质瘤(LGG)中表达的临床意义。 方法通过GEPIA、HPA、UALCAN、CGGA、TIMER2.0、cBioPortal和LinkedOmics等数据库对低级别胶质瘤患者ZNF217的差异表达、临床病理特征、预后价值、免疫细胞浸润、基因突变和启动子甲基化水平进行分析。 结果LGG组织中ZNF217 mRNA和蛋白表达水平较正常组织上调(P＜0.05),ZNF217 mRNA表达水平与患者的肿瘤分级、免疫细胞浸润及相关标志物呈正相关(P＜0.05),与患者总生存期和无病生存期呈负相关(P＜0.05)。ZNF217发生基因突变和启动子低甲基化(P＜0.05),进而导致LGG患者预后不良(P＜0.05)。 结论ZNF217在LGG中表达上调,其高表达与LGG患者预后不良有关,ZNF217可能成为LGG预后生物标志物和潜在的治疗靶点。     

长链非编码RNA UCA1在神经胶质瘤中的表达及与临床预后的关系

目的：探讨UCA1在神经胶质瘤组织中的表达及其与临床预后的关系。方法：实时荧光定量PCR 法检测64例神经胶质瘤组织（WHO Ⅰ～Ⅱ级22例,Ⅲ～Ⅳ级42例）及10例对照正常脑组织中UCA1 mRNA 的表达,分析其与神经胶质瘤患者临床病理特征及预后之间的关系。结果：神经胶质瘤组织中UCA1 mRNA 的表达水平明显高于对照正常脑组织（P＜0.001）;UCA1 的表达与患者的WHO分级明显相关（P＜0.05）,而与患者的年龄、性别、肿瘤大小和KPS评分等无关（P＞0.05）。结论：lncＲNA UCA1与胶质瘤恶性程度及预后密切相关,可能成为胶质瘤预后判断的一个独立因子及治疗新靶点。     

补体C3a受体1与低级别胶质瘤预后及免疫细胞浸润的关系

目的 借助癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究低级别胶质瘤(LGG)组织中补体C3a受体1(C3AR1)的表达水平及其与LGG患者预后及肿瘤免疫细胞浸润的关系.方法 从TCGA数据库下载514例LGG患者的基因表达谱数据和临床信息.比较C3AR1基因在LGG组织和正常组织中的表达水平,分析不同WHO分级LGG组织样本中...     

人脑胶质瘤组织中增殖细胞核抗原表达与病理分级和患者预后关系的研究

目的研究人脑胶质细胞瘤组织中的增殖细胞核抗原（PCNA）表达及其与肿瘤临床病理学特征和患者预后的关系。方法应用免疫组化检测了25例人脑胶质瘤细胞中PCNA的表达水平,并分析人脑胶质瘤细胞中PCNA的表达水平与病理分级、患者生存时间的关系,取10例正常脑组织作对照。结果人脑胶质细胞瘤组织中PCNA阳性表达显著高于对照组,染色强弱与肿瘤的病理分级呈正相关,而与预后呈负相关。结论检测胶质瘤组织中PCNA表达能快速、准确地反映肿瘤细胞的增殖状态及评估患者预后,有望成为临床判定胶质瘤恶性程度及患者预后的重要指标。     

脑胶质瘤组织中miR-4744、RIOK2表达及其对患者预后的预测价值

目的 分析脑胶质瘤组织中微小RNA-4744(miR-4744)、右开放阅读框激酶2(RIOK2)表达情况及对患者预后的预测价值。方法 纳入2014年12月—2017年11月河北北方学院附属第一医院神经外科收治脑胶质瘤患者102例,术中收集脑胶质瘤组织及相对应的癌旁正常组织,实时荧光定量PCR法检测miR-4744、RIOK2信使RNA(mRNA)表达水平,免疫组化检测RIOK2蛋白表达。分析脑胶质瘤组织miR-4744、RIOK2 mRNA表达水平与患者临床病理特征的关系,miR-4744与RIOK2 mRNA表达水平的相关性,miR-4744、RIOK2 mRNA表达水平与预后的关系,脑胶质瘤患者预后的影响因素,miR-4744、RIOK2 mRNA表达水平对患者术后5年内死亡的预测价值。结果 与癌旁组织比较,脑胶质瘤组织中miR-4744表达水平明显降低,RIOK2 mRNA和蛋白阳性率均明显升高[t(χ²)P=44.282/<0.001、15.538/<0.001、101.868/<0.001];脑胶质瘤组织miR-4744、RIOK2 ...     

ncRNA介导的EphB4上调与低级别胶质瘤不良预后及肿瘤免疫浸润的相关性

目的 探讨促红细胞生成素生成人肝细胞受体B4(erythropoietin-producing human hepatocellular receptors B4,EphB4)在低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)组织中的表达、其上游靶点以及与患者预后及肿瘤免疫浸润的相关性,分析其作为治疗靶点的潜在作用。方法 首先应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库胶质瘤数据分析EphB4在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析EphB4对不同癌症生存期的影响。用R语言和starBase数据库分析EphB4可能上游调节非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)。用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库进行EphB4表达与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物和免疫检查点相关性分析。结果 UBA6-AS1/hsa-miR-346轴是最有潜力影响LGG中EphB4表达的上游ncRNA相关通路。同时,EphB4水平与LGG肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物、免疫检查点表达均呈显著正相关。结论 ncRNA介导的EphB4上调与LGG的不良预后和肿瘤免疫浸润相关。     

DNA损伤修复基因FANCI与肝癌预后和免疫浸润相关性

【目的】探究DNA损伤修复基因FANCI在肝癌中的表达水平,及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。【方法】在本研究中,使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系;使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系;使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白;使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析;通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。【结果】与正常组织相比,肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调（P<0.001）;高表达FANCI的肝癌患者预后较差（P<0.001）;肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4+T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关,且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低（P<0.01）;GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中;细...     

基质金属蛋白酶-9在人脑胶质瘤中的表达及意义

目的 探讨基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinases,MMP-9)与脑胶质瘤发生发展的关系.方法 以52例人脑胶质瘤组织标本作为研究对象,采用免疫组织化学方法检测MMP-9的表达,并应用原位杂交技术检测MMP-9 mRNA在人脑胶质瘤中的表达情况.结果 MMP-9、MMP-9 mRNA的表达水平与肿瘤的分级呈正相关(r=0.925,P均<0.01).结论 MMP-9在脑胶质瘤发生发展中具有重要作用,MMP-9可能与判断预后有关.     

vimentin在人脑胶质瘤中的表达及临床意义

目的 研究vimentin在人脑胶质瘤中的表达及意义.方法 采用免疫组织化学和RT-PCR的方法检测了49例人脑胶质瘤组织中vimentin的表达,并分析其与临床病理资料的关系.Western blot分析不同人脑胶质瘤细胞中vimentin的表达,Transwell侵袭试验检测细胞的侵袭能力.结果 在49例人脑胶质瘤组织中vimentin表达明显高于对应的正常脑组织(P<0.01),同时人脑胶质瘤的表达与其病理分化程度存在明显的相关性(P<0.01).vimentin在低分化的人脑胶质瘤细胞SHG-44中呈高表达,而在分化较好的CHG-5细胞中表达较低.Vimentin的表达与细胞体外迁移、侵袭能力有关.结论 人脑胶质瘤细胞中vimentin表达增高,vimentin的表达可能与胶质瘤的侵袭性和迁移性有关.     

ARID1A表达与肝内胆管癌免疫细胞浸润及预后的相互关系研究

目的：探讨ARID1A基因的表达与肝内胆管癌免疫细胞浸润的关系及预后分析。方法：纳入2011年1月—2017年12月天津医科大学肿瘤医院接受手术治疗的136例肝内胆管癌患者,收集患者的临床资料和病理组织标本,构建组织微阵列芯片,采用免疫组织化学染色方法检测ARID1A表达和不同类型的免疫细胞浸润程度。分析ARID1A基因的预后价值、临床特征和免疫细胞浸润的关系。通过在线数据库评估ARID1A拷贝数与多种肿瘤免疫细胞浸润关系。结果：136例肝内胆管癌患者中ARID1A在108例(79.4%)中表达,而在28例(20.6%)中表达缺失。与癌旁组织相比,CD4+、CD8+T淋巴细胞和CD163+巨噬细胞在肿瘤组织中浸润明显减少(t=6.962、7.364、7.905,均P<0.000 1),而CD66b+中性粒细胞在肿瘤组织浸润明显增加(t=4.093,P<0.000 1)。在ARID1A表达缺失组和ARID1A表达组中CD163+巨噬细胞的浸润水平与生存呈负相关(log-rankχ²=5.399、6.376,P=0.02、0.012)。ARID1A的表达与...     

MAGOH在胶质瘤组织中的表达及其临床意义

目的探讨mago-nashi同源基因(MAGOH)在不同WHO分级胶质瘤标本中的表达量变化及其与肿瘤预后相关性分析。方法使用R语言挖掘CGGA mRNA microarray数据库和CGGA mRNA seq FPKM数据库,分析MAGOH在不同级别胶质瘤组织中的表达数据。通过Quantitative Real-Time PCR(qRT-PCR)技术检测MAGOH在临床胶质瘤样本中的表达水平,并分析MAGOH的表达差异性以及其与胶质瘤的分级、预后相关性。结果在两个公共数据库中:MAGOH的表达量与胶质瘤组织分级呈正相关,且MAGOH高表达组的预后显著差于低表达组。qPCR也证实了MAGOH在不同级别胶质瘤组织中存在差异表达,即MAGOH表达量越高,胶质瘤组织分级越高。ROC分析显示MAGOH的表达量对胶质瘤有较高的诊断效能。共表达分析发现,MAGOH与O(6)-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)存在显著表达相关性。结论 MAGOH的表达量与胶质瘤组织分级呈正相关,与肿瘤预后呈负相关。MAGOH可作为胶质瘤诊断及预后的潜在标记物。MAGOH可能通过影响MGMT参与调节胶质瘤发生、发展过程。     

野生型 p53-诱导的蛋白磷酸酶1过表达与胶质瘤患者预后的关系

目的：探讨野生型 p53-诱导的蛋白磷酸酶1（wild-type p53-induced phosphatase 1,Wip1）与脑胶质瘤患者预后相关性。方法通过免疫组织化学方法检测81例不同级别和类型胶质瘤组织与15例正常脑组织中 Wip1表达阳性与患者不同临床病理类型的关系,包括性别、年龄、胶质瘤的病理分级、肿瘤大小、肿瘤位置、KPS 评分、病理分级、PCNA 表达 p53表达。应用 Kaplan-Meier 生存曲线法分析 Wip1表达与患者预后的相关性。结果 Wip1在脑胶质瘤组织的阳性表达率为55．6％（45／81）,明显高于正常脑组织的0．0％（0／15）（χ2＝15．686,P ＜0．01）,Wip1阳性表达的胶质瘤患者生存率低于 Wip1阴性表达患者。Wip1的表达与 PCNA 表达呈正相关,低 KPS 评分、高Wip1表达和高病理分级是胶质瘤患者预后差的危险因素。结论 Wip1在人脑胶质瘤组织中呈高表达,与患者预后差有关。     

核因子红系2相关因子3高表达与胶质瘤预后及迁移能力的关系

目的 分析核因子红系2相关因子3(NFE2L3)在胶质瘤中的表达水平,及其与患者预后、胶质瘤迁移能力的关系。方法 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库、中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库、基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库和人类蛋白质图谱(HPA)数据库确定NFE2L3在各级别胶质瘤中的表达水平及其与患者预后的关系。构建NFE2L3-siRNA载体,并在胶质瘤U251、T98细胞系中进行转染。采用实时荧光定量PCR和Western blot检测转染NFE2L3-siRNA后胶质瘤U251和T98细胞中NFE2L3和MMP-9的表达水平。使用细胞划痕实验和transwell迁移实验检测NFE2L3对U251、T98细胞迁移功能的影响。结果 NFE2L3在人脑胶质瘤组织中高表达,其表达水平越高,患者预后越差(P<0.001)。NFE2L3的表达水平与患者年龄、组织学类型、化疗状态、1p19q编码缺失状态、IDH相关突变状态密切相关(P<0.001)。在U251细胞和T98细胞中,干扰组的迁移能力、MMP-9在mRNA和蛋白水平的表达均低于对照组(P<0.01)。结...     

TRIM21与胰腺癌临床病理特征及免疫浸润的相关性分析

目的：探讨三结构域蛋白家族成员21(tripartite motif 21,TRIM21)在胰腺癌中的表达及其与临床病理特征、预后及免疫浸润的关系。方法：应用Oncomine与GEPIA数据库分析TRIM21在胰腺癌中的mRNA表达水平;利用基因富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）预测TRIM21可能参与的信号通路;TIMER数据库分析TRIM21在胰腺癌中的表达水平与免疫细胞浸润丰度的相关性,并通过Kaplan-Meier Plotter数据库进行验证;免疫组织化学染色（immunohistochemistry,IHC）检测TRIM21在87例胰腺癌组织及36例癌旁组织中的蛋白水平,并分析其与临床病理特征、预后的关系。结果：TRIM21在胰腺癌组织中明显高表达,且与患者无复发生存时间负相关（P=0.041）;GSEA分析证实TRIM21参与胰腺癌患者免疫相关信号通路;TIMER数据库分析显示胰腺癌中TRIM21表达水平与B细胞（P=7.87e-06）、CD8+T细胞（P=1.18e-04）、巨噬细胞（P=1.43e-02）、中性粒细胞（P=2...