孤立性肾盂扩张胎儿全基因组染色体拷贝数变异测序结果分析

目的探讨胎儿孤立性肾盂扩张染色体拷贝数变异测序（CNV-seq）结果及预后。方法对76例孤立性肾盂扩张胎儿进行介入性产前诊断,回顾性分析其染色体核型及CNV-seq结果,随访妊娠结局。结果76例孤立性肾盂扩张胎儿的染色体核型分析仅1例唐氏综合征,1例9号染色体倒位。76例胎儿CNV-seq分析同样仅有1例为唐氏综合征,2例为多态性拷贝数变异（CNV）,其余均未发现致病性、可能致病性或致病性未知的CNV。76例肾盂扩张出生胎儿中男孩51例,女孩25例。2例引产,其中1例因唐氏综合征引产,另1例因胎儿双肾重度积水引产。其余74例活产复查B超未见有肾盂扩张加重或肾积水。结论胎儿孤立性肾盂扩张绝大部分预后良好,除非孕妇唐氏筛查或无创产前检测高风险,产前无需常规行CNV-seq分析。     

基因组拷贝数变异测序与染色体核型分析在胎儿遗传学诊断中的比较

目的 比较基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)技术和染色体核型分析和在产前胎儿遗传学诊断中的应用价值.方法 收集来我院有产前诊断指征进行羊水穿刺的259例孕妇,取材后,送检染色体核型分析和CNV-seq,比较两种方法在产前诊断中的优缺点.结果 259例标本中,共诊断异常染色体核型及微缺失微重复23例,总阳性诊断率8....     

基因组拷贝数变异测序联合核型分析在产前诊断中的临床应用

目的 探讨基因组拷贝数变异测序（copy number variation sequencing, CNV-seq）联合核型分析在产前诊断中的临床应用价值。方法 选取2019年1月至2021年12月赤峰市妇产医院产前诊断中心就诊的884例孕妇,根据产前诊断指征分为高龄组（n=148）、血清学筛查高风险组（n=95）、无创产前检测高风险组（n=116）、超声结构异常组（n=174）、混合组（n=351）。孕妇羊水样本采用CNV-seq检测和核型分析,比较不同方法染色体异常检出情况。结果 884例孕妇年龄23～43岁,平均（32.6±4.5）岁,孕16～32周。无创产前检测高风险组染色体异常检出率最高（30.17%）,其次为混合组（11.40%）、血清学筛查高风险组（6.32%）和超声结构异常组（5.75%）,高龄组最低（2.03%）。二者联合检出染色体异常98例,检出率为11.09%,其中CNV-seq检出率为10.63%(94/884),核型分析检出率为8.48%(75/884),两者比较差异无统计学意义（P> 0.05）。CNV-seq染色体非整倍体异常检出率为7.35%(65...     

染色体G显带核型分析联合拷贝数变异测序技术在产前诊断中的应用

目的 探讨染色体G显带核型分析联合低深度全基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)技术在产前诊断中的应用价值。方法 选取就诊并具备产前诊断指征并行羊水穿刺的孕妇936例,采集孕妇羊水同时行染色体G显带核型分析和CNV-seq技术检测,比较两种方法单独及联合应用的结果及检出率。结果 孕妇年龄17～46岁,平均年龄(32.56±5.18)岁,产前诊断时的孕周为16⁺²～32⁺⁶周,平均孕周(18.95±3.47)周。在936例进行介入性产前诊断的羊水标本中,胎儿羊水染色体G显带核型分析检出异常74例,阳性检出率为7.91%(74/936)。CNV-seq检出染色体异常98例,阳性检出率为10.47%(98/936)。两者单独对染色体异常检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。两种检测方法联合应用,检出染色体异常118例,阳性检出率为12.61%(118/936)。羊水染色体G显带核型分析、CNV-seq二者单独检测与其联合检测对染色体异常检出率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 染色体G显带核型分析和CNV-seq技术各...     

高通量测序技术检测早期自然流产组织染色体非整倍体及拷贝数变异的临床意义

目的 应用高通量测序技术检测早期自然流产胚胎或绒毛组织染色体数目异常及结构异常的临床意义.方法 选择2019年1月至2020年8月在空军军医大学西京医院妇产科就诊孕妇中胚胎停止发育的91例患者,主要集中在孕周为6-12周,留取流产组织,提取DNA,制备文库,高通量测序,对流产物DNA进行测序分析,得出流产物的拷贝数变异...     

狼疮性肾炎并肺人巨细胞病毒感染1例及文献复习

<正>狼疮性肾炎是指系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）合并不同病理类型的免疫性肾脏损害,同时伴有明显相应临床表现的一种疾病。其发病与免疫复合物形成、免疫细胞和细胞因子过度激活等免疫异常有关。激素及免疫抑制剂是治疗该病的主要药物,接受治疗后患者免疫功能受到抑制,发生严重感染的风险增加。人巨细胞病毒（human cytomegalovirus,HCMV）是一种疱疹病毒科β亚科的具有双螺旋结构的DNA病毒,基因结构复杂,碱基长度较长,     

宏基因组二代测序技术确诊儿童巨细胞病毒脑炎1例

<正>儿童巨细胞病毒脑炎是儿童感染人巨细胞病毒引起的中枢神经系统疾病,在免疫正常的儿童中少见,临床表现多样,易漏诊、误诊。宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,m NGS)是一种新型的、有效的病原体检测技术,近年来在临床中的应用逐渐增多。本文回顾了1例经mNGS技术确诊的儿童巨细胞病毒脑炎的诊治经过,并进行文献复习。     

二代测序辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎3例报道并文献复习

鹦鹉热衣原体肺炎是一种由鹦鹉热衣原体感染引起的人畜共患病,通过受感染的鸟类传播.由于病原学培养及血清学诊断困难,其误诊和漏诊时有发生,大规模流调也难以开展.本文报道浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院收治的3例鹦鹉热衣原体肺炎患者,其中2例有病情快速进展,重症化趋势.均有禽类、鸟类接触史,临床表现有咳嗽咳痰、呼吸困难、...     

宏基因组测序辅助HIV感染者发热待查的病原学诊断1例报告

探讨宏基因组测序（metagenomic next-generation sequencing,mNGS）技术在发热待查中的诊断应用价值。发热待查一直是临床诊治难点,本研究中1例人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者反复发热2+月,经涂片、5次外周血培养和1次骨髓培养、血清学和病理检查等常规病原微生物检测未发现病因。分别取淋巴结进行广谱聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR)检测和取外周血进行mNGS检测;广谱PCR和mNGS检测结果均确定病原菌为马尔尼菲篮状菌。追加外周血培养（并延长培养时间）最终获得菌株,并行全基因组测序。mNGS与之比较,全基因组序列查见耐药基因FLU1,但mNGS未能检出;全基因组序列显示该菌株与NCBI数据库中的已知菌株均没有亲缘关系,而mNGS因病原体数据量不够而不能做亲缘关系分析。本研究报告了1例应用mNGS诊断马尔尼菲蓝状菌感染的病例,表明mNGS能在辅助HIV感染者发热待查的病原学诊断中发挥重要作用,但mNGS的耐药基因检测和病原体溯源等功能尚需后续发展。     

晚发性宫内人巨细胞病毒感染致新生儿死亡三例报告并文献复习

人巨细胞病毒（human cytomegalovirus,HCMV）是引起胎儿宫内感染的常见病毒,也是导致胎儿异常和新生儿智力、听力障碍的重要原因之一。晚发性宫内HCMV感染对新生儿的危害较大,极易造成新生儿窒息死亡,且临床诊断和治疗较为困难。本研究报道了3例晚发性宫内HCMV感染致新生儿死亡患者的临床诊治经过,并结合文献复习,以期为该类疾病的临床诊治提供依据。     

低深度全基因组测序技术联合核型分析在无创产前检测高风险孕妇产前诊断中的应用

目的 探索低深度全基因组测序技术联合核型分析在无创产前检测高风险孕妇产前诊断中的应用.方法 对165例无创产前高风险孕妇行羊膜腔穿刺术,在对胎儿羊水样本进行G显带染色体核型分析的同时采用低深度全基因组测序技术检测胎儿羊水细胞基因组DNA,测序结果与人类参考基因组(GRCh37,UCSC release hg19)进行比对分析,然后通过ISC A、Decipher、ClinVar等数据库评估检测到的CNV致病性,进而比较G显带染色体核型分析与低深度全基因组测序结果间的差异.结果 送检的165例羊水样本中低深度全基因组测序检测出21三体44例,18三体10例,13三体1例,与G显带染色体核型分析结果一致;性染色体异常2例,比G显带染色体核型分析多检出1例;其他类型染色体异常10例,比G显带染色体核型分析多检出4例.低深度全基因组测序技术对染色体异常的总检出率为53.33％,与染色体G显带核型分析比较,致病性异常检出率提高了 3％.结论 低深度全基因组测序技术在无创产前检测高风险孕妇产前诊断中有良好的应用价值,该技术与G显带染色体核型分析联合应用能有效提高染色体异常检出率,降低出生缺陷,提高人口素质.     

宏基因组学第二代测序技术辅助诊断内脏利什曼病1例并文献复习

<正>内脏利什曼病(visceral leishmaniasis, VL)又名黑热病(Kala-azar),是由趋内脏的利什曼原虫引起的一种寄生虫病,白蛉为传播媒介^[1]。我国内脏利什曼病致病的病原体主要为杜氏利什曼原虫和婴儿利什曼原虫,现主要分布在我国西北部,发病率最高的3个地区为新疆维吾尔自治区、甘肃省和四川省^[2]。临床表现包括长期不规则发热、消瘦、肝脾肿大、全血细胞减少、高球蛋白血症等。及时、正确诊断内脏利什曼病,     

胎儿先天性巨细胞病毒感染的产前超声诊断（附3例报告）

目的 探讨产前超声在胎儿先天性巨细胞病毒感染诊断中的价值。方法 回顾性分析2017年2月-2021年10月在浙江省温州市中心医院超声科检查并诊断为先天性巨细胞病毒感染的3例胎儿的产前超声图像,并总结声像图特征。结果 3例先天性巨细胞病毒感染胎儿其颅内声像图均可见两处及以上先天性巨细胞病毒感染征象,其中1例羊膜腔穿刺检测到巨细胞病毒DNA确诊。结论 产前超声可根据多个声像图异常指标提示先天性巨细胞病毒感染,结合血清学阳性结果可诊断,确诊可通过羊膜腔穿刺抽取羊水做病毒学检测。     

全基因组测序技术在结核病病原学诊断和监测中应用的研究进展

中国政府在《遏制结核病行动计划(2019-2022年)》中提出,各地要提高结核病实验室诊断能力,缩短诊断时间,病原学阳性的肺结核患者耐药筛查率应达90％以上,最大限度发现耐药结核病患者.但目前传统的检测方法不但耗时长,而且精确度有限.微生物全基因组测序技术是近年来兴起的结核分枝杆菌菌种鉴定、耐药检测和公共卫生监测手段....     

应用宏基因组二代测序技术诊断结核病4例并文献复习

目的:用宏基因二代测序(mNGS)技术诊断结核病,讨论mNGS技术对结核菌感染诊断的价值.方法:收集4例可疑结核病患者,并对其肺泡灌洗液(BALF)或胸腔积液进行mNGS检测.检索万方、中国知网及PubMed数据库中英文文献并分析.结果:4例患者中2例胸腔积液mNGS报告为结核分枝杆菌(MTB)及MTB复合群,临床诊断...     

二代测序技术诊断肺炎克雷伯菌肝脓肿侵袭综合征1例并文献复习

目的:分析1例经二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)确诊的肺炎克雷伯菌肝脓肿侵袭综合征(invasive Klebsiella pneumoniae liver abscess syndrome,IKPLAS)的临床特征并进行文献复习.方法:对我院感染科收治的1例经NGS确诊为I...     

基于全基因组甲基化测序技术探究益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征的疗效机制

[目的] 评价益气养阴祛瘀方治疗原发性干燥综合征(primary Sj?gren’s syndrome,pSS)的疗效,并通过全基因组甲基化测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)技术研究中医药疗效相关的表观遗传标志。[方法] 纳入50例pSS患者,分为中药组30例和西药组20例,对治疗前及治疗12周后的临床信息进行病情评估,并分析疗效。从中药组中选取3例有效患者,对其中药治疗前后的全血样本进行WGBS,通过甲基化位点分析,差异甲基化关联基因的基因本体(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和分子特征数据库(The Molecular Signatures Database,MSigDB)富集分析等,研究疗效相关差异甲基化基因及路径。[结果] 与中药治疗前组比较,中药治疗12周后组干燥综合征疾病活动指数(Sj?gren’s syndrome disease activity index,SSDAI)、血沉(erythrocyte sedimentation rate,ESR)、免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)水平显著降低(P<0.05);与西药治疗前组相比,西药治疗12周后组SSDAI、ESR水平明显下降(P<0.05)。中药治疗12周后组与西药治疗12周后组比较,SSDAI、ESR等指标差异均无统计学意义(P>0.05)。WGBS共识别到29个差异甲基化区域(differentially methylated regions,DMRs),主要集中在重复元件和蛋白编码基因的位点上,共覆盖了68 个基因,包括了mRNA、长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和circRNA三种RNA类别。富集分析提示,治疗作用与抗原处理和呈递、干扰素相关通路、辅助性T细胞(helper T cell,Th)1和Th2细胞分化等路径密切相关。[结论] 益气养阴祛瘀方能调节DNA甲基化,从而抑制pSS患者体内免疫应答反应,发挥治疗作用。