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重型乙型肝炎病人中乙型肝炎病毒C基因启动子变异的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 了解重型乙型肝炎( 乙肝) 病人血清乙肝病毒(HBV)DNAC基因启动子(CP) 的变异。方法 对用聚合酶链反应(PCR) 法扩增的血清HBVDNA 直接测序。结果 7 例亚急性重型肝炎病人的HBV 分离株CP区分别有2~12 个替代变异,1 例病人有11bp 的碱基插入。CP变异主要发生于CP的第1 和第2 个AT丰富区,nt1 762 和nt1 764 的替代变异见于7 例亚急性重型肝炎病人的4 例中,是CP变异的热点,其中3 例HBeAg 阴性,说明和HBeAg 阴性表型相关。CP的第3 个AT丰富区、HBV逆转录起始位点(DR1) 和前C基因、前基因组转录起始位点未见变异。结论 重型肝炎病人的HBVCP区存在较多的变异,CP变异主要发生于和前C基因相关的第1 和第2 个AT丰富区,可能和HBeAg 阴性表型相关 相似文献
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目的 探讨乙型肝炎病毒核心蛋白(hepatitis B virus core protein,HBc)二聚体组装相关功能域突变对核心颗粒组装及HBV复制的影响.方法 基于HBc空间结构,PCR定点诱变二聚体组装核衣壳相关功能域重要氨基酸位点,以pcDNA3.1为载体构建4个突变体表达质粒pHBc14-18M、pHBc120-135M、pHBc23-39M和pHBc122-139M.将突变质粒与HBc缺失的含1.2拷贝HBV基因质粒pHBV1.2-core-共转染HepG2细胞,通过Northern blot检测HBV前基因组(pgRNA),Southern blot检测复制中间体,非变性琼脂糖凝胶电泳(native agarose gel electrophoresis)及Western blot检测细胞核心颗粒观察突变质粒自身形成核衣壳情况.将突变质粒与含有1.2拷贝HBV基因质粒pHBV1.2共转染HepG2细胞观测突变质粒对野生型HBc组装及HBV复制的影响.结果 突变质粒与pHBV1.2-core-质粒共转染HepG2细胞,pHBc14-18M、pHBc120-135M和pHBc122-139M突变能够组成核衣壳样结构.pHBc23-39M不能形成核衣壳样结构.Northern blot结果显示所有突变质粒组均未见pgRNA条带,Southern blot检测复制中间体也未见条带.将突变质粒与pHBV1.2共转染HepG2细胞,pHBc14-18M、pHBc120-135M和pHBc122-139M组HBV复制中间体及上清中病毒颗粒明显减少,而pHBc23-39M组无减少.结论 HBc23-39位氨基酸突变可阻止二聚体多聚化,不能形成核衣壳样结构,且不能与野生HBc二聚体相互作用.HBc14-18、120-135、122-139区域的氨基酸突变,能够形成核衣壳样结构但不支持HBV DNA复制,并且能与野生HBc二聚体相互作用,形成杂合体,干扰野生型HBV DNA的复制. 相似文献
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Detection of hepatitis B virus core mutants by PCR-RFLP in chronically infected patients 总被引:4,自引:0,他引:4
Barros MF Rodrigues PA Matias SR Carreira LM Machado-Caetano JA 《Journal of virological methods》2004,120(2):125-130
HBV chronic infection is an important health problem. The HBV core antigen carries several epitopes for T and B cell recognition and the immune response is crucial for determining the outcome of viral infection. Using PCR-RFLP several point mutations were detected in the HBV core ORF of HBV extracted from the serum of 140 chronically infected patients and 86 samples from another 37 patients followed-up in a longitudinal study. Mutations at position 2248 and 2147 (A3) and at 2038 (M2) were found most frequently. The wild type core genotype was found in about 50% of the samples. PCR-RFLP results were confirmed by direct sequencing of amplified products from HBV DNA present in chronically infected patients. The method is rapid and reliable and may be particularly useful for a rapid detection of viral mutants in a large number of patients. 相似文献
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丙肝病毒(HCV)及乙肝病毒(HBV)双表达载体的构建及表达 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 :为探索HCV/HBV高效联合基因免疫策略 ,构建具有 2套独立表达单元的HCV/HBV真核表达载体。方法 :分别将与HCV核心区基因互补的cDNA和HBV核心区基因克隆于具有 2套独立表达单元的真核表达载体pRSC的巨细胞病毒启动子和RSV启动子下游 ,称为pRSC HBV/HCV ,转染SP2 / 0细胞 ,通过免疫荧光和Western印迹法观测蛋白的表达 ,免疫Balb/c小鼠 ,用酶联免疫小鼠体液免疫应答。结果 :pRSC HBV/HCV转染SP2 / 0细胞可见HBcAg及HCV核蛋白染色阳性荧光细胞 ,SDS Page电泳显示在 14kD及 2 1kD处均可见蛋白条带 ,与HBcAg及HCV核蛋白的的理论预期值一致 ,Western印迹分析显示在 14kD及 2 1kD处可见特异性的蛋白条带。 5只免疫鼠中全部出现抗 HCV及抗 HBV抗体 ,而对照组全阴性。结论 :pRSC HBV/HCV可分别表达HBcAg及HCV核蛋白 ,免疫Balb/c小鼠后可诱导其体液免疫应答 ,为进一步开展HCV/HBV联合基因免疫奠定了实验基础。 相似文献
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目的建立扩增受阻突变检测系统(ARMS)检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型方法,并对慢性乙型肝炎(CHB)患者HBV基因型进行分析。方法通过对HBV全基因组序列比对分析,设计ARMS特异性引物和探针体系,建立检测HBVB和C基因型方法,对50例临床标本进行检测。结果50例临床样本中,B型的检出率为26%(13例),C型为74%(37例),其实验结果与测序结果完全一致。常州及周边地区乙型肝炎病毒C基因型HBV为优势株。C基因型患者A1762T/G1764A突变率为62%,明显高于B型。结论ARMS检测HBV基因型,快速、准确;常州及周边地区HBV基因型主要为B、C型,且C型携带A1762T/G1764A双突变率较高,与较为严重的肝病相关。 相似文献
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目的 初步确定流行于山西地区的乙肝病毒的基因型的基本情况。方法 采集山西地区乙型肝炎表面抗原阳性的血清,利用PCR扩增得到HBV的S基因和C基因;用MEGA3软件对其进行核苷酸序列分析,构建系统发生树,分析基因型。结果 约93%样本的HBVS基因和C基因序列均位于HBV系统发生树的基因型C,近7%的样本其S基因和C基因序列位于系统发生树的基因型B。结论 流行于山西地区的乙肝病毒多数为基因型C,少数为基因型B,未发现基因重组现象。 相似文献
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目的 初步确定流行于河南漯河地区的乙肝病毒的基因型的基本情况.方法 采集河南漯河地区乙型肝炎表面抗原阳性的血清,利用PCR扩增得到HBV的S基因;用DANSTAR软件对其进行核苷酸序列分析,构建系统发生树,分析基因型.结果约75.7%样本的HBV S基因序列位于HBV系统发生树的基因型C,约20%的样本其S基因位于系统发生树的基因型B,近4.3%的样本其S基因位于系统发生树的基因型D.结论 流行于河南漯河地区的乙肝病毒多数为基因型C,少数为基因型B,极少数为基因型D. 相似文献
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沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分子流行病学研究 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 研究沈阳地区乙型肝炎病毒基因型分布和特点。方法 应用半巢式聚合酶链反应(PCR)扩增乙型肝炎病毒P基因,将PCR产物应用ABI377自动测序仪直接做核苷酸序列分析,并用DNA STAR软件进行种系发生分析及基因型鉴定。结果 HBV DNA标准株P基因片段可进行基因分型。在沈阳地区慢性HBV感染者中可检出基因型B、C和D,检出率分别为22%、50%和28%,基因型C分布与基因型B、D的差异有统计学意义,在慢性乙型肝炎患者和慢性HBV携带者间各基因型间分布比较中差异无统计学意义。结论 通过测定HBV DNAP基因序列片段可进行HBV DNA基因分型。沈阳地区乙型肝炎病毒基因型有基因型B、C和D型,其中基因型C为优势基因型。 相似文献
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Hepatitis B virus (HBV) replication requires the viral polymerase to reverse transcribe the 3.5-kb pregenomic viral RNA within the nucleocapsid. It has been proposed that a sequence element designated phi (phi), which is located 32 nucleotides upstream of the 3' DR1 pregenomic RNA sequence and is complementary to epsilon, is required for efficient minus-strand synthesis because it may mediate the translocation of the viral polymerase plus the three nucleotide primer from epsilon to DR1. A mutation in phi has been identified which can be compensated for with a complementary mutation in epsilon. This observation supports the suggestion that epsilon and phi base pair during the process of polymerase translocation from epsilon to DR1. However, additional mutations in phi were not complemented by the corresponding mutations in epsilon indicating that the functional recognition of epsilon and epsilon/phi stem-loop structures by polymerase probably requires both sequence- and structure-specific information. 相似文献
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Toll样受体3介导抑制Bewo细胞中乙型肝炎病毒复制 总被引:1,自引:0,他引:1
目的探讨Toll样受体3(TLR3)介导的天然免疫对Bewo细胞中乙型肝炎病毒(HBV)复制的影响。方法首先用TLR3配体polyI:C处理Bewo细胞,观察细胞TLR3 mRNA表达的动力学。然后将2μg 1.3倍HBV全基因重组质粒pcDNA3.1(+)-HBV1.3转染Bewo细胞,12h后,以polyI:C处理3d。最后,用抗TLR3处理Bewo细胞1h后,加入25μg/ml polyI:C刺激。采用荧光定量RT-PCR、微粒子酶免疫分析法(MEIA)和荧光定量PCR法分别检测细胞TLR3mRNA表达、HBsAg、HBeAg及HBV DNA水平。结果 polyI:C可显著诱导Bewo细胞TLR3 mRNA表达(P〈0.05),呈时间和剂量依赖性;与对照组比较,polyI:C可显著抑制HBV复制(P〈0.001),抗TLR3可显著逆转polyI:C对HBV复制的抑制作用(P〈0.01)。结论 TLR3介导的天然免疫能一定程度抑制Bewo细胞中HBV复制,为防治HBV宫内感染提供了新的途径。 相似文献
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目的 研究慢性乙肝患者HBV核心基因的单核苷酸多态性(SNP)与血清HBV DNA水平的相关关系.方法 采用PCR-RFLP和限制性内切酶Tsp509I榆测HBV核心基因的SNP,采用双脱氧终止法对核心基因进行序列测定,实时荧光PCR技术用于HBVDNA水平的定量检测.结果 慢性乙肝人群中发现5种典型的PCR-RFLP图谱,分别是RFLP-C、RFLP-D、RFLP-E、RFLP-G和RFLP-C/G,各种RFLP图谱的分布频率依次为61.5%、2.6%、9.6%、16.7%和9.6%.A165T、A336C、A336T、T337C和T385C等5种SNP与RFLP图谱的变化有关,但是只有SNP A336C和A336T会导致HBcAg第83位的Glu被Asp所替代.RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.02)和RFLP-C/G组(P=0 006),而且RFLP-C/G组患者血清ALT的阳性率显著低于RFLP-C、RFLP-E和RFLP-G组;当HBeAg阳性时,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.015)和RFLP-C/G组(P=0.008).结论 本研究中使用的PCR-RFLP能够用于检测核心基因的SNP,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组和RFLP-C/G组,可能与Glu83 Asp突变有关.Abstract: Objective To investigate the relation between a set of single nucleotide polymorphisms (SNP) in core gene of HBV in chronic hepatitis B patients and HBV DNA levels. Methods PCR restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) assay and restriction enzyme Tsp509I were adopted to determine HBV SNP in HBV core gene. Nucleotide sequences of core gene were determined using the dideoxy chain termination method. HBV DNA levels were quantitated with real-time PCR. Results Five typical RFLP patterns, RFLP-C, RFLP-D, RFLP-E, RFLP-G and RFLP-C/G mixture were found and the distribution of HBV RFLP patterns was as follows: C, 61. 5% ; D, 2. 6% ; E, 9.6%; G, 16.7%; C/G mixture, 9.6%. Five SNPs, A165T, A336C, A336T, T337C and T385C, were found to be associated with RFLP patterns change and only SNP A336C or A336T caused the substitution of Glu-83 with Asp in HBcAg. The serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P =0. 02) and RFLP-C/G group(P = 0. 006) , respectively, furthermore, the positive rate of serum ALT in RFLP-C/G group was lower than that in RFLP-C, RFLP-E and RFLP-G group, respectively. Under the condition of HBeAg-positive, the serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P = 0. 015) and RFLP-C/G group(P =0.008) , respectively. Conclusion PCR-RFLP used in this study can be adopted to determine HBV SNPs, not genotypes in Chinese patients with chronic hepatitis B. The serum HBV DNA level in RFLP-C group higher than that in RFLP-G or RFLP-C/G group maybe associated with amino acid mutation, Glu83 Asp. 相似文献
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广州地区小儿乙肝无症状携带者及其父母的HBV DNA基因型研究 总被引:4,自引:0,他引:4
目的扩增HBV DNA S基因,建立 HBV DNA的分型方法,研究家庭中小儿乙肝无症状携带者与其父母的基因型.方法利用PCR-RFLP基因分型方法,扩增HBV DNA S基因,以限制性内切酶AvaⅡ,MboⅠ酶切分型;结果 12个家庭共27例乙肝无症状携带者血清,其中两个家庭儿童与父母的基因型相同,均为B型;9个家庭儿童与母亲的基因型相同(7个B型,2个C型),父亲HBV DNA阴性;1个家庭儿童与母亲为B型,父亲为C型,结论本文利用的分型方法经济实用,分型率高,广州地区的基因型以B型,HBV DNA的传播具有家庭聚集性特点及母婴传播的特点. 相似文献
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中国南北两城市乙型肝炎病毒基因型与血清型的构成差异 总被引:14,自引:0,他引:14
目的对我国南北两城市530份乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)进行血清型和基因型分型,以了解HBV基因型和血清型分布的特点和差异。方法 对黑龙江省哈尔滨市和广东省廉江市530份乙肝病毒表面抗原(HBsAg)阳性血清进行HBV DNA基因扩增,并对扩增产物直接测序,分析HBV血清亚型和基因型。结果 哈尔滨和廉江市HBV血清型以adrq为最多,分别为87.2%和73.5%,其次为adw2,分别为12.0%和25.7%,其分布差异有非常显著意义(P<0.001);两市HBV基因型均以C型为主,分别为87.8%,73.2%,其次为B型,分别为12.2%和26.1%,其分布差异有非常显著意义(P<0.001),在廉江市仅有1例D型,1例B、C混合型。结论我国南北两城市HBV血清亚型和基因型的构成较为单纯,均只有两个类型,其比例构成差异有非常显著意义。 相似文献
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目的观察疗效确切的抗病毒药物和免疫调节剂,叠加伍用对慢性乙型肝炎病人HBV复制和变异的影响.方法应用拉米夫定、干扰素α-2b、黄芪注射液三联叠加疗法,对慢性乙型肝炎病人进行抗病毒治疗,并与单独应用拉米夫定的抗HBV效果进行比较评价.检测HBVDNA阴转率和HBeAg-抗HBe血清转换率;血清HBVDNA浓度;HBVDNA的YMDD变异率和前C区变异率.结果A组(叠加用药组)与B组(拉米夫定单药组)比较,HBVDNA阴转率分别在第12周、36周及48周差异有显著性(P<0.05),HBeAg阴转率在第36周、48周差异有显著性(P<0.05),抗HBe阳转率仅在第48周差异有显著性(P<0.05);两组患者血清HBVDNA浓度比较,治疗12周时降低程度差异有显著性(P<0.05),治疗第36周和48周时差异有非常显著性(P<0.01);治疗后12周,A组出现前C区BCP变异;疗后24周、36周和48周,两组均出现YMDD和前C区变异.结论与拉米夫定单独用药比较,三联叠加疗法可增加慢性乙型肝炎患者HBVDNA阴转率和HBeAg-抗HBe血清转换率,更显著降低血清HBVDNA浓度,并减少YMDD变异,故其抗HBV疗效优于拉米夫定单独用药. 相似文献
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目的 初步确定新疆地区乙肝患者乙肝病毒基因型的基本情况.方法 对在新疆地区采集的2000余份血清中检测得到200份HBsAg阳性的血清,利用巢氏PCR法扩增其S基因并测序,用MEGA3软件将测序结果与GenBank中的HBV标准序列进行分析,构建并绘制系统发生树,分析基因型.结果 在200份样本中.127例(63.5%)成功检出基因型,其中B基因型10例(7.8%),C基因型58例(45.7%),D基因型59例(46.5%).结论 新疆地区HBV基因型以C、D型为主,少量为B型. 相似文献
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核酶对鸭乙型肝炎病毒感染体内抗病毒作用效果的观察 总被引:2,自引:0,他引:2
目的观察核酶在体内抗病毒作用效果。方法选择鸭乙型肝炎(DHBVLJ-76)及其鸭动物模型作为检测系统,将针对DHBVPre-S736位点的核酶(RzDS)插入pJ120质粒构建成pJ-RzDS。与痘苗病毒天坛761株(VV)同源重组后获得含RzDS的重组痘苗病毒(V-RzDS)。用DHBV感染1日龄北京鸭,分别在感染的同时、感染后24小时和72小时注射V-RzDS和VV,10天后检测血清中DHBVDNA和DHBsAg的含量。结果北京鸭在感染DHBV的同时注射V-RzDS,其DHBVDNA和DHBsAg的含量均低于VV对照组,两组之间有显著性差异。结论提示RzDS对DHBV基因组复制和表达均有抑制作用,其抑制率分别为45%和63%。 相似文献
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Molecular biology of hepatitis B virus: effect of nucleotide substitutions on the clinical features of chronic hepatitis B 总被引:2,自引:0,他引:2
Hepatitis B virus (HBV) is a major cause of liver disease worldwide. It is covered with envelope (surface antigen) proteins
with the nucleocapsid (core antigen) inside. In the nucleocapsid, there is an incomplete double-stranded DNA and a DNA polymerase.
Four genes, S, C, X, and P, are encoded, and these partially overlap. Mutations have been reported in each gene and in their
promoter regions, and these mutations can change the efficiency of HBV replication and the clinical course of patients. In
this article, we review the relationship between the molecular biology of HBV and its clinical outcome. 相似文献