基于网络药理学和动物实验探讨柠檬苦素抗肝纤维化的作用机制

目的 通过网络药理学方法探讨柠檬苦素治疗肝纤维化的作用机制,并运用分子对接和动物实验进行验证。方法 首先,利用SwissTargetPrediction、GeneCards和DisGeNet等数据库筛选柠檬苦素和肝纤维化的靶点,并运用微生信网站获得柠檬苦素与肝纤维化的共同靶点。然后运用STRING数据库和Cytoscape软件构建共同靶点的蛋白质相互作用网络,并利用CytoNCA插件筛选核心靶点;使用Metascape数据库对共同靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,以预测其可能的作用机制。最后运用AutoDock Vina软件对柠檬苦素与核心靶蛋白进行分子对接验证,并将网络药理学预测结果进行动物实验验证。结果 预测结果表明柠檬苦素可能作用于AKT1、VEGFA、HIF1A等86个靶点,参与激素应答、蛋白磷酸化、血管生成等生物过程和PI3K/AKT通路、HIF-1通路、VEGF通路等与肝纤维化相关的信号通路。蛋白质相互作用分析结果显示核心靶点包括AKT1、VEGFA、HIF1A、PIK3CA等11个靶点。分子对接结果表明柠檬苦素与AKT1、VEGFA、HIF1A 3个核心靶蛋白具...     

基于网络药理学探讨丹参抗乙肝病毒的活性成分与作用机制

应用网络药理学方法预测了丹参抗乙肝病毒(hepatitis B virus, HBV)的活性成分和作用机制。首先通过TCMSP、PubChem数据库及文献调研获取丹参的化学成分,通过SwissTargetPrediction和GeneCards数据库分别预测活性成分和HBV感染所对应的潜在作用靶点。使用String数据库构建蛋白互作关系网络、Cytoscape软件将成分-作用靶点网络可视化并进行拓扑学分析、DAVID平台进行GO功能及KEGG通路富集分析、AutoDock Vina软件将丹参关键活性成分与核心靶蛋白进行分子对接。共筛选出38种活性成分,获得疾病-化合物交集靶点178个,富集分析得到405个GO相关条目、68条相关信号通路(涉及T细胞/B细胞受体信号通路、PI3K/AKT信号通路及mTOR信号通路等)。分子对接结果显示,丹参大多数关键活性成分(丹参醌酚Ⅱ、丹参新酮、原儿茶酸、紫草酸和原儿茶醛)与核心靶点(PIK3CA、APP、STAT3、AKT1和mTOR)具有较好的亲和力。更进一步,在HBV复制小鼠模型上考察了丹参代表性活性成分紫草酸的抗HBV活性及对PI3K/AKT和...     

基于网络药理学的青蒿治疗肾阴虚型糖皮质激素性骨质疏松机制研究

目的 通过网络药理学和体外实验,对青蒿治疗肾阴虚型糖皮质激素性骨质疏松（GIOP）的潜在作用靶点及相关信号通路进行预测和初步验证。方法 通过TCMSP数据库和Uniprot数据库获取青蒿药物靶点并确定目标靶点基因名;通过GeneCards数据库、OMIM数据库和Drugbank数据库获取肾阴虚型GIOP的靶点基因,与药物靶点基因交叉分析获得共同作用靶点基因;利用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并利用Cytoscape软件进行可视化分析和核心靶点筛选;通过Metascape数据库对所有共同靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,最后通过体外实验对预测结果进行验证。结果 筛选出98个青蒿治疗肾阴虚型GIOP的作用靶点,其中核心基因17个。GO和KEGG功能富集分析结果表明,青蒿治疗肾阴虚型GIOP与激素应答、细胞死亡的正向调节和细胞外刺激应答等生物过程,以及PI3K/AKT、AGE/RAGE、MAPK和IL-17等信号通路有关,其中PI3K/AKT信号通路上富集的基因数最多。体外实验结果显示,青蒿可以促进地塞米松（DEX）损伤的成...     

基于网络药理学及分子对接技术的复方丹参滴丸治疗心绞痛潜在分子机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制。方法 通过中药系统网络药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索复方丹参滴丸的活性成分,利用GeneCards、Disgnet和TTD数据库检索心绞痛疾病相关靶点,通过String数据库和Metascape开放平台对复方丹参滴丸与心绞痛的交集靶点进行京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析及基因本体论（gene ontology,GO）注释。采用SYBYL2.1软件的Surflex-Dock模块对筛选的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果 从复方丹参滴丸中筛选出76种活性化合物,涉及500个潜在靶点。复方丹参滴丸成分靶点与心绞痛疾病靶点取交集,共获得457个交集靶点;复方丹参滴丸治疗心绞痛作用靶标的蛋白相互作用（PPI）网络中共包含158个节点,其中重要的靶点有STAT3、TP53、AKT1、JUN、MAPK1、HSP90AA1等。复方丹参滴丸通过调控炎症反应、凋亡信号通路、积极调节细胞迁移等GO生物过程,参与流体剪切应力与动脉粥样硬化、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、IL17信号通路等信号通路,发挥治疗心绞痛的作用。分子对接结果表明筛选得到的活性成分与靶点有较强的结合。结论 运用网络药理学研究方法推测出复方丹参滴丸治疗心绞痛的潜在分子机制及作用靶点,分子对接验证了筛选的关键活性成分与重要靶点具有较强的结合活性。     

基于网络药理学及分子对接探讨蒙药三味阿拉坦其其格散治疗功能性消化不良的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接探讨蒙药三味阿拉坦其其格散治疗功能性消化不良的作用机制。方法 通过TCMSP和BATMAN数据库检索木鳖子、玫瑰花、金色诃子的有效成分和相应靶点基因,在Gene Cards和OMIM数据库收集功能性消化不良靶点并与三味阿拉坦其其格散靶点取交集,得出三味阿拉坦其其格散治疗功能性消化不良的交集靶点,“活性成分-作用靶点”网络由Cytoscape软件构建,蛋白互作（PPI）网络由STRING数据库构建,DAVID数据库用于KEGG通路分析、AutoDockTools软件进行分子对接。结果 通过筛选得出三味阿拉坦其其格散的有效成分47个、靶点1001个,收集到功能性消化不良靶点2476个,交集得出三味阿拉坦其其格散治疗功能性消化不良的靶点297个,KEGG通路分析得出135条通路与治疗功能性消化不良密切相关。分子对接表明三味阿拉坦其其格散中核心活性成分槲皮素与核心蛋白AKT1亲和度最高,为-7.9 kCal/mol。结论 本研究初步证明了三味阿拉坦其其格散主要通过其中成分槲皮素作用于AKT1蛋白,并通过PI3K-Akt信号通路,进而治疗功能性消化不良,可为进一步实...     

基于网络药理学探讨黄精防治痛风的机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术预测黄精防治痛风的有效成分作用靶点及通路。方法 利用TCMSP和Drugbank数据库获取黄精活性成分及作用靶点,利用TTD、OMIM和GeneCards数据库获得痛风相关靶点,将两者输入Venny 2.1中筛选得到黄精治疗痛风的核心靶点。通过Cytoscape 3.8.0软件构建“中药-成分-靶点-疾病”网络模型,STRING数据库构建PPI网络,Metascape数据库进行GO与KEGG通路富集分析,并用Autodock＿vina软件进行分子对接研究。最后,通过LPS结合MSU诱导RAW264.7细胞模拟体外痛风模型,并对预测结果进行验证。结果 预测共得到13种活性成分、90个潜在靶点、1 139个痛风相关疾病靶点,19个黄精-痛风交集靶点,涉及MAPK14、CAT、PPARG、NOS2、VEGFA等,并推断其作用机制可能与PI3K-Akt信号通路、血小板激活信号通路、钙信号通路和雌激素信号通路等有关。分子对接结果表明,活性成分与核心靶点的结合能在–10.4～–4.6 kcal·mol^-1,具有较好的结合能力。细胞实验显示,薯...     

基于网络药理学、分子对接和动物实验探究党参-茯苓药对对酒精性肝病的作用机制

目的 研究党参-茯苓治疗酒精性肝病的潜在机制。方法 利用TCMSP、Swiss Target Prediction获得党参茯苓有效成分及作用靶点;OMMI、DisGeNET、GeneCards数据库获取酒精性肝病(alcoholic liver disease, ALD)疾病靶点;STRING数据库构建PPI网络;使用Bioconductor软件进行GO、KEGG通路富集分析。Cytoscape3.7.1软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,筛选关键靶点进行分子对接;通过实验验证党参茯苓对ALD大鼠的作用。结果 剔除重复的靶点,获得36个化学成分和529个潜在作用靶点。GO富集分析,得到了生物过程2 245条、细胞组成74条和分子功能相关125个。KEGG富集分析涉及了159个信号通路,其中包括PI3K-Akt、MAPK和AGE-RAGE信号通路。分子对接结果显示,AKT1、MMP9等靶点可能是党参-茯苓治疗ALD的关键靶点。实验表明,党参-茯苓能改善ALD大鼠肝细胞炎症水平,降低ALD大鼠TC、TG、AST、ALT、GGT水平,PCR检测得出党参-茯苓可降低PI3K、AKT表达,电...     

蒙药安神补心六味丸抗抑郁作用网络药理学机制研究北大核心CSCD

目的应用网络药理学、分子对接技术、体外实验技术,预测以及验证蒙药安神补心六味丸的抗抑郁药理作用机制。方法TCMSP数据库及文献挖掘获取安神补心六味丸的活性成分,SwissTargetPrediction预测成分相关靶点信息,Cytoscape构建药材-成分-靶点网络。通过GeneCards、Drugbank、OMIM等数据库检索抑郁症靶点。STRING数据库获取蛋白相互作用关系网络信息。DAVID数据库进行GO生物过程富集分析和KEGG信号通路富集分析。Autodock vina软件进行分子对接验证。BV2小胶质细胞建立体外损伤模型,CCK-8法检测细胞活力,qPCR法检测相关核心靶点mRNA表达量。结果筛选出安神补心六味丸活性成分34个,涉及140个潜在作用靶点,筛选核心靶点59个,共涉及99条信号通路;分子对接结果显示桦木酸、豆甾醇、β-谷固醇、槲皮素等10种活性成分与AKT1、APP、ALB、MAPK3、VEGFA、MAPK1靶点均拥有良好的结合能力。体外实验结果表明,经给药后,BV2细胞活力较模型组明显上升。安神补心六味丸可调节各核心靶点mRNA的表达。结论安神补心六味丸可能主要通过羟色胺突触等信号通路以及相关核心靶点来发挥抗抑郁作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨藏药唐古特乌头抗炎作用机制北大核心CSCD

目的基于网络药理学、分子对接技术及体外细胞实验验证,拟探讨唐古特乌头抗炎作用的潜在分子机制。方法文献调研并使用数据库检索并筛选得到唐古特乌头活性成分靶点和疾病靶点;交集得到共同靶点,构建protein protein interaction(PPI)网络,得出核心靶点,绘制成分-靶点-疾病网络;对共同靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;将唐古特乌头二萜类生物碱活性成分和部分核心靶点进行分子对接验证。最后基于RAW264.7细胞体外炎症模型,采用MTT法、Griess试剂盒和实时荧光定量RT-PCR等方法验证唐古特乌头醇提物的药效及机制。结果文献搜集得到唐古特乌头17种活性成分,交集得到284个共同靶点;KEGG富集得到PI3K-Akt、Ras、MAPK、HIF-1等108条通路;分子对接结果显示,唐古特乌头活性成分与对接的核心靶点均具有较高的亲和力;体外细胞炎症实验表明,唐古特乌头能够抑制LPS诱导的RAW264.7细胞上清液中NO的释放,减少iNOS的表达。实时荧光定量RT-PCR显示,唐古特乌头可以通过调节PI3K-Akt信号通路发挥抗炎作用。结论唐古特乌头可通过PI3K-Akt等通路发挥抗炎作用,为更好地推进其开发应用提供了科学根据。     

基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨菟丝子治疗胰岛素抵抗(IR)的分子机制。方法 运用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库,筛选菟丝子的化合物和有效靶点;使用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库预测IR的相关靶点,并利用Uniprot数据库转换成相应的基因名称;选取Cytoscape软件构建菟丝子—活性成分—靶点网络关系图、String数据库构建靶点蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络;利用David数据库进行GO生物学功能富集分析和KEGG通路富集分析,并绘制柱状图和气泡图;使用Autodocktools软件对活性成分与核心靶点进行分子对接分析。结果 获得菟丝子的关键化合物10个、药物靶点207个、疾病靶点1 279个、交集靶点122个,得到JUN、AKT1、TP53、RELA、MAPK1和TNF 6个PPI网络核心分子,网络药理学结果提示菟丝子可能通过TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路和FoxO信号通路等121条信号通路参与调控IR。分子对接结果显示,菟丝子中活性成分槲皮素、苦参碱、β-谷甾醇与核心靶点JUN、TP53、MAPK1和RELA间存在结合位点。...     

基于网络药理学探讨平消胶囊通过AKT1/β-catenin信号促进乳腺癌凋亡的作用机制

目的：探究平消胶囊治疗乳腺癌的潜在作用机制。方法：利用TCMSP、TCM-ID、GeneCards等数据库筛选平消胶囊与乳腺癌的相关靶点；Cytoscape软件构建“药物-靶点-疾病”网络；运用R软件进行GO和KEGG分析；使用Autodock Vina和Pymol软件进行平消胶囊活性成分与核心靶点的分子对接及可视化；通过R软件survival包对核心靶点进行分析，筛选出与总体生存时间密切相关的基因；通过CCK-8法检测细胞活力；流式细胞术检测细胞凋亡；Western blot检测p-AKT1、β-catenin和cyclinD1的蛋白表达水平。结果：筛选出药物靶点194个，疾病靶点1 612个，韦恩图求交集靶点共127个，核心靶点主要包括TB53、AKT1、TNF、CASP3等20个；GO分析主要与氧化应激反应、细胞对化学反应的调控等生物活性有关；KEGG分析主要通过PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等通路有关；分子对接结果显示活性成分与核心靶点AKT1、MAPK1、RELA均有较好的结合；细胞实验表明槲皮素（40、80、120μmol/L）促进乳腺癌细胞凋...     

藏药三果汤治疗糖尿病作用机制的网络药理学与分子对接技术分析

目的 基于网络药理学及分子对接对三果汤治疗糖尿病靶点及通路进行分析，并通过分子对接进行验证，为基础研究及临床用药提供科学依据。方法 通过中药系统药理学数据库与分子平台（TCMSP）、有机小分子生物活性数据库（PubChem）及文献查阅筛选三果汤中诃子、毛诃子、余甘子的活性成分及作用靶点，使用Genecard数据库、DRUGBANK数据库筛选糖尿病相关靶点，构建“药物-成分-靶点-疾病”网络，取药物疾病靶点交集，使用STRING构建蛋白PPI网络，运用Matescape数据库对交集靶点基因进行GO、KEGG富集分析。将筛选出的有效成分与靶点进行分子对接验证。结果 通过网络药理学收集三果汤及糖尿病靶点信息，采用GO富集分析和KEGG通路分析发现，三果汤和糖尿病共同作用靶点共269个，靶点作用最为突出的为AKT1、HAS2、MAP2、CDH1、PRKCG、PLAT，三果汤作用于糖尿病的通路主要在癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路。分子对接结果显示，鞣花酸和没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2存在亲和力，鞣花酸对HAS2亲和力最好。结论 通过本研究中网络药理学分析及分子对接分析，三果汤中鞣花酸、没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2通路靶点具有亲和力，为后续实验提供研究思路。     

基于网络药理学和分子对接研究艾叶治疗原发性痛经的分子机制

摘要：目的:采用网络药理学研究艾叶干预原发性痛经的潜在靶点和机制。方法:通过中药系统药理数据库及分析平台（TCMSP）筛选有效化合物,经美国国立卫生研究院（NIH）的开放化学数据库（PubChem）和预测分子亲脂性和水溶性程序ALOGPS 2.1确定,并预测艾叶作用靶点;通过DisGeNET、NCBI-Gene、DrugBank和GeneCards数据库收集原发性痛经靶点。通过功能性蛋白关联网络（String）和可视化网络软件（Cytoscaoe3.6）筛选出交集基因中的核心基因以及确定信号通路。结果:通过分子式预测艾叶的化合物作用靶点有442个。此外,4个数据库共收集到351个靶点,这两个靶点集相交集的靶点有66个。通过软件Cytoscape3.6筛选出丝氨酸/苏氨酸激酶（AKT1）、前列腺素-内过氧化物合酶（PTGS2）、血管内皮生长因子（VEGFA）等5个靶标蛋白核心基因,并构建药物-化合物-靶点-疾病网络图。在String数据库中显示艾叶与原发性痛经之间的信号通路有114条,最显著的通路集中在亚油酸代谢（hsa00591）、花生四烯酸代谢（hsa00590）、甾体激素生物合成（hsa00140）和卵巢甾体生成（hsa04913）信号通路。使用分子对接软件Autodock对5个核心靶点与9个化合物之间做分子对接,发现9个化合物中有8个化合物能和5个核心靶点有良好的对接。最后通过三维分子软件PyMOL计算靶点-化合物之间的作用关系。结论:该研究通过网络数据库及计算机分析验证初步发现艾叶干预原发性痛经的活性成分,为进一步深入验证和药物开发提供理论依据。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨京尼平苷治疗脑缺血的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接方法研究京尼平苷治疗脑缺血潜在作用机制。方法 通过PubChem、PharmMapper、GeneCards、OMIM数据库分别对京尼平苷和疾病的靶点进行预测,借助Venny 2.1.0工具将二者取交集获取共有靶点,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用（PPI）网络,随后通过Cytoscape 3.7.2软件对核心靶点进行网络拓扑分析;基于核心靶点基因开展基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）基因富集分析。利用AutodockTool软件对所筛选的核心靶点分别与京尼平苷进行分子对接。结果 通过STRING数据库构建交集靶点的PPI网络,获得173个交集靶点,包括酪氨酸蛋白激酶（SRC）、蛋白激酶B1(AKT1)、热休克蛋白90α家族A级成员1(HSP90AA1)、PIK3R1、表皮生长因子受体（EGFR）等。京尼平苷治疗脑缺血可能通过调控磷脂酰肌醇-3-羟激酶（PI3K）–蛋白激酶B(Akt)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末化产物（AGE）–晚期糖基化终末产物受体（RAGE）信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、...     

基于网络药理学及分子对接探究定喘汤治疗儿童咳嗽变异性哮喘的作用机制

[摘要]目的：通过网络药理学和分子对接探究定喘汤治疗儿童咳嗽变异性哮喘（cough variant asthma,CVA）的作用机制。方法：基于文献研究和中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库挖掘定喘汤中各个药物的活性成分,并利用TCMSP数据库预测活性成分作用靶点,借用Uniprot数据库校正靶点蛋白对应基因;通过GeneCards、OMIM数据库获得咳嗽变异性哮喘的疾病靶点。取药物靶点和疾病靶点的交集靶点并制作韦恩图,运用Cytoscape 3.7.2软件制作“中药-活性成分-靶点”网络并进行网络拓扑分析,利用String数据库构建蛋白互作网络并筛选出核心靶点。基于DAVID对交集靶点进行GO生物过程分析和KEGG通路富集分析;通过AutoDock Vina和Pymol将得到的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果：收集定喘汤复方中活性成分218个,得到相关潜在靶点452个,CVA相关靶点689个,得到交集靶点131个。核心靶点主要为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）,共有靶点主要富集于PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路。分子对接结果显示核心成分与靶点具有较好的结合活性。结论：定喘汤治疗CVA具有多成分、多靶点、多通路的特点,为进一步研究定喘汤治疗CVA的作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学和实验验证车前子治疗狼疮性肾炎的作用与调控机制

目的 利用网络药理学、分子对接和实验验证方法探讨车前子治疗狼疮性肾炎(LN)的潜在机制。方法 通过网络药理数据库获取车前子活性成分,预测其潜在作用靶点和LN疾病靶点,利用STRING和Cytoscape构建蛋白互作图,将核心靶点进行GO和KEGG富集分析。体外实验验证车前子活性成分Quercetin对TNF-α诱导人肾小球系膜细胞(HMC)异常增殖的改善作用。结果 经筛选得车前子和LN共同作用靶点60个,治疗主要与MAPK、PI3K等通路密切相关。分子对接结果表明,核心成分与AKT1、IL-1B等关键靶点有较好结合活性。通过体外实验,Quercetin可通过调控AKT,ERK1/2和IL-1β抑制TNF-α诱导的HMC异常增殖。结论 本研究表明车前子可能通过多成分-多靶点-多途径作用于LN,并为LN新药开发和机制研究提供了天然的候选产物和思路。     

基于网络药理学探讨紫苏子—杏仁药对治疗咳嗽变异性哮喘的作用机制

目的 基于网络药理学探讨紫苏子—杏仁药对治疗咳嗽变异性哮喘(CVA)的潜在分子作用靶点及机制。方法 采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库对紫苏子—杏仁药对的有效活性成分进行筛选,并采用SwissTargetPrediction网站进行靶点预测。采用GeneCards数据库检索CVA相关靶点,借助Venny 2.1.0获取交集靶点,对交集靶点分别运用Cytoscape 3.9.1软件和STRING数据库构建主要活性成分—潜在治疗靶基因网络图和PPI蛋白互作网络,并筛选出关键有效活性成分和核心靶蛋白,通过DAVID数据库对交集靶点进行GO功能及KEGG通路的富集分析。结果 筛选出紫苏子—杏仁药对有效成分19个,与CVA相关靶点224个,核心靶点为AKT1、IL-6、TP53、SRC、MAPK3、EGFR、JUN、PTGS2、HSP90AA1、ESR1。GO功能富集分析显示分子功能165个、细胞组分79个、生物过程630个。KEGG通路富集分析显示得到信号通路155条,主要涉及cAMP信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症通路、化学致癌—受体激活通路、神经活性配体—受体相...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨四氢姜黄素对肝细胞癌作用的分子机制

目的 通过网络药理学靶点预测方法结合分子对接技术,探讨四氢姜黄素抗肝细胞癌(HCC)的作用机制。方法 从多个数据库中获得四氢姜黄素或HCC潜在作用靶点;通过在线富集分析平台Metascape,将核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析以及可视化处理,了解四氢姜黄素治疗肝细胞癌可能涉及的生物过程与信号通路;采用SYBYL2.0软件进行半柔性分子对接实验,以验证药物分子与其核心靶点的结合活性。结果 四氢姜黄素与HCC共同靶点77个;核心靶点共16个,包括TP53、EGFR、PIK3CA等;潜在作用靶点KEGG分析的97条通路包括PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路等。GO富集分析表明,四氢姜黄素参与细胞对化学压力的反应、细胞对氧含量降低的反应等。分子对接结果显示,四氢姜黄素与多个疾病关键靶点具有较高的结合能力,对接评分较高的为四氢姜黄素与PIK3CA靶点蛋白。结论 四氢姜黄素能够通过多靶点、多通路达到治疗肝细胞癌的目的,本研究为进一步研究四氢姜黄素抗肝细胞癌的作用机制提供了参考。     

基于网络药理学探讨表没食子儿茶素没食子酸酯治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 基于网络药理学探讨表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）治疗阿尔茨海默病（AD）的相关作用靶点及主要信号通路,探讨其治疗AD的可能作用机制。方法 通过Pubchem数据库筛选EGCG活性成分及作用靶点;通过利用Genecards数据库和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）检索AD的基因靶点,将疾病靶点与药物作用靶点融合找出交集靶点。在String平台利用EGCG的靶标基因与AD靶标基因的交集基因构建蛋白相互作用（PPI）,运用Cytoscape 3.7.2软件构建“EGCG-成分-靶点”网络,通过Metascape等数据库进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后采用Auto Dock Vina软件进行分子对接。结果 获得EGCG有效成分和作用靶点有171个,其中与AD相关的靶点95个。EGCG改善AD病理变化的核心靶点主要集中在AKT1、肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素（IL）-6等蛋白上。这些靶点涉及信号通路169条,包括磷脂酰肌醇3-羟激酶（PI3K）/Akt信号通路、低氧诱导因子（HIF）-1信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶（MA...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤治疗膝骨关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术分析桃红四物汤治疗膝骨关节炎的作用机制。方法 通过TCMSP数据库,OMIM、Dis Ge NET、Gene Cards数据库,获取桃红四物汤有效成分及膝骨关节炎相关靶点,利用String平台和Cytoscape 3.9.1软件,构建并可视化中药-化合物-靶点-疾病多层次分子网络。运用Metascape数据库导入交集靶点,进行GO及KEGG富集分析。最后,利用Autodock Tools 1.5.6、Auto Dock Vina、Py Mol等软件开展分子对接虚拟计算。结果 网络分析结果表明,桃红四物汤治疗膝骨关节炎的潜在活性成分44个,主要包括槲皮素、山柰酚、木犀草素等,潜在靶点有218个,主要包括TNF、IL-6、AKT1等。富集分析结果显示,桃红四物汤治疗膝骨关节炎的核心靶点主要通过TNF信号通路、IL-17信号通路及PI3K/Atk信号通路等,调控炎性反应、细胞凋亡、转录因子反应等实现延缓膝骨关节炎进展的目的。分子对接计算结果表明,桃红四物汤所含的槲皮素、山柰酚、木犀草素等主要成分与TNF、IL-6、AKT1等核心靶点有着较好的结合活性。结论 ...