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1.
目的 基于网络药理学探究胃复方治疗胃癌的作用机制。方法 应用中药系统药理学数据库及分析平台、DrugBank、GeneCards等数据库检索胃复方所含12味中药的有效化学成分及治疗胃癌的潜在靶点,将潜在靶点导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,筛选出潜在的生物过程和涉及的信号通路。采用CCK-8及Western blotting对KEGG分析富集程度最大的信号通路进行验证。结果 胃复方治疗胃癌可能涉及以槲皮素、木樨草素为代表的88种有效活性成分,可能作用于以TP53、STAT3、Akt为代表的194个靶点。GO分析涉及148个生物过程,KEGG分析筛选出PI3K/Akt、TNF、HIF-1等信号通路。体外实验证实胃复方提取物可抑制人胃癌细胞HGC-27增殖,降低其p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt蛋白表达水平;而对于人正常胃黏膜上皮细胞GES-1,胃复方提取物可促进其增殖,上调其p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt蛋白表达。结论 本研究初步预测了胃复方治疗胃癌“中药-多成分-多靶点-多通路”的调控网络,并验证了胃复方提取物可能通过抑制PI3K/Akt信号通路相关蛋白的表达发挥抑制胃癌细胞增殖的作用,证明了网络药理学技术挖掘胃复方具有一定的可信度,但同时兼有不全面性,为进一步探索胃复方的作用机制奠定了基础。  相似文献   

2.
摘要:目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨加味六安煎(JWLAD)治疗咳嗽变异性哮喘(CVA)潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选JWLAD的活性成分及其潜在靶点,利用Genecards、Drugbank、OMIM、Disgenet、TTD数据库检索CVA相关靶点。运用Cytoscape及STRING平台构建活性成分-靶点、蛋白质互作(PPI)网络,借助Metascape对共同靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最后由Autodock Vina实现主要活性成分及核心靶点的分子对接。结果:最终得到中药活性成分64种涉及348个潜在靶点,CVA相关靶点1 290个,两者共同靶点167个。GO分析过程涉及2 336条生物过程、112条细胞组分和118条分子功能。KEGG共富集169条主要涉及各种癌症通路,白细胞介素17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、神经活性配体和受体相互作用、细胞凋亡,Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路等。分子对接结果提示主要活性成分与核心靶点均有较强的亲和能力。结论:JWLAD通过多成分-多靶点-多通路综合调控网络发挥治疗CVA的作用,为后期临床和实验研究提供理论基础。  相似文献   

3.
贾媛  高兰  公雯 《中国医药科学》2022,(17):26-29+62
目的 基于网络药理学方法探讨项痹晕宁汤治疗颈椎病的潜在作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选项痹晕宁汤主要活性成分,并对其潜在靶点进行预测;检索GeneCards、Drugbank数据库筛选颈椎病的相关疾病靶点;采用Bisogenet对药物、疾病靶点进行蛋白质相关作用网络构建,筛选出项痹晕宁汤治疗颈椎病的关键核心靶点,并对其进行富集分析。结果 项痹晕宁汤方剂中所含8味中药共筛选出活性成分84个,药物靶点244个,颈椎病靶点1032个,最终获得关键核心靶点204个。项痹晕宁汤治疗颈椎病主要活性成分为槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、山奈酚、卡维丁等。关键靶点为神经营养性酪氨酸激酶受体1(NTRK1)、肿瘤蛋白P53(TP53)、表皮生长因子受体(EGFR)、淀粉样前体蛋白(APP)等。关键的通路可能包括磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶(PI3K/Akt)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等。结论 本研究通过网络药理学初步揭示了项痹晕宁汤多成分、多靶点、多通路治疗颈椎病的潜在作用机制...  相似文献   

4.
目的 分析白屈菜-元胡药对(CHCR)的主要成分,预测其抗雌激素受体(ER)阳性乳腺癌的药效物质、潜在作用靶点及通路并进行验证。方法 采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)技术对CHCR乙醇提取物的成分进行分析;对所得成分进行网络药理学分析,构建CHCR“活性成分-靶点-通路”网络,并对富集通路进行体外细胞实验验证。结果共鉴定出58个化学成分,含生物碱57个、有机酸1个。网络药理学共筛选出活性成分38个,“成分-疾病”交集靶点的蛋白质-蛋白质互作网络中有核心靶点38个;得基因本体条目258个,京都基因与基因组百科全书通路137条,主要包括雌激素信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。验证实验结果显示,CHCR作用于MCF-7细胞的半数抑制浓度为693μg/mL;150、300、600μg/mL的CHCR可显著降低磷酸化PI3K、磷酸化Akt、ERα蛋白和ESR1 mRNA的表达水平(P<0.01)。结论 CHCR抗ER阳性乳腺癌的作用可能与调控ER、PI3K/Akt通路有关,具有多成分、多靶点的作用特点。  相似文献   

5.
目的 采用网络药理学和分子对接方法探究肤疾洗剂治疗皮肤瘙痒症的活性成分、关键作用靶点及潜在的分子机制。方法 运用TCMSP、Swiss Target Prediction、GeneCards数据库及文献报道对肤疾洗剂中活性成分、作用靶点及疾病靶点进行检索,Cytoscape软件进行成分–靶点网络图构建,通过DAVID数据库,进行基因本体(GO)功能分析与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后通过分子对接预测活性成分与靶点蛋白的结合能力。结果 获得肤疾洗剂61种有效成分和1 049个作用靶点,瘙痒症疾病靶点1 621个,其中肤疾洗剂146条信号通路,主要富集在癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)等。分子对接结果显示核心成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论 肤疾洗剂具有抑制炎症、免疫调控作用,其发挥作用的主要活性成分为生物碱类、柠檬苦素类和黄酮类等,涉及的主要靶点有蛋白激酶1(Akt1)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、黏着连接蛋白β1(CTNNB1)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)等,符合中药复方多成分、多靶点、多途径的特点,...  相似文献   

6.
[摘要]目的:通过网络药理学和分子对接探究定喘汤治疗儿童咳嗽变异性哮喘(cough variant asthma,CVA)的作用机制。方法:基于文献研究和中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库挖掘定喘汤中各个药物的活性成分,并利用TCMSP数据库预测活性成分作用靶点,借用Uniprot数据库校正靶点蛋白对应基因;通过GeneCards、OMIM数据库获得咳嗽变异性哮喘的疾病靶点。取药物靶点和疾病靶点的交集靶点并制作韦恩图,运用Cytoscape 3.7.2软件制作“中药-活性成分-靶点”网络并进行网络拓扑分析,利用String数据库构建蛋白互作网络并筛选出核心靶点。基于DAVID对交集靶点进行GO生物过程分析和KEGG通路富集分析;通过AutoDock Vina和Pymol将得到的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果:收集定喘汤复方中活性成分218个,得到相关潜在靶点452个,CVA相关靶点689个,得到交集靶点131个。核心靶点主要为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF),共有靶点主要富集于PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路。分子对接结果显示核心成分与靶点具有较好的结合活性。结论:定喘汤治疗CVA具有多成分、多靶点、多通路的特点,为进一步研究定喘汤治疗CVA的作用机制奠定了基础。  相似文献   

7.
目的 运用网络药理学技术探究知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过TCMSP数据库、TCM-ID数据库和BATMAN-TCM数据库,筛选知柏地黄丸的有效活性成分和作用靶点,利用GeneCards数据库、OMIM数据库、TTD数据库和GEO数据库检索获得乳腺癌内分泌治疗耐药的相关靶基因,并与活性成分作用靶点取交集得到共同靶点;通过String 11.5数据库构建知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的蛋白质互作(PPI)网络,并借助Cytoscape 3.8.2软件的CytoNCA插件筛选核心靶点;通过Metascape基因功能注释分析工具对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用Cytoscape 3.8.2软件构建药物活性成分–靶点–通路相互作用网络,获取核心活性成分。结果 共筛选出知柏地黄丸活性成分80个,与疾病的交集靶点117个,主要涉及肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL6)、雌激素受体1(ESR1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。KEGG通路富集分析显示磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt、MAPK、核因子-κB(NF-κB)、雌激素等信号通路可能是知柏地黄丸治疗乳腺癌内分泌耐药的关键信号通路,由药物活性成分–靶点–通路网络得出槲皮素、山柰酚、脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等是发挥作用的核心活性成分。结论 知柏地黄丸中的槲皮素、山柰酚、脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等核心活性成分,能够作用于TP53、Akt1、TNF、IL-6、ESR1、MAPK1等多个关键靶点,调节PI3K-Akt、MAPK、NF-κB、雌激素等信号通路,发挥治疗乳腺癌内分泌耐药的作用。  相似文献   

8.
目的 利用网络药理学的方法研究桑白皮治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用靶点以及分子机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取桑白皮的活性成分及活性成分的作用靶点;在OMIM和GenCards数据库中检索筛选COPD相关的靶点,两者取交集获得桑白皮治疗COPD的核心靶点。由Cytoscape 3.7.0构建活性药物-疾病-成分-靶点网络;STRING数据库构建靶点蛋白互作网络;DAVID数据库对靶点基因开展生物功能与通路富集分析,构建桑白皮活性成分-核心靶点-作用通路网络图。结果 从桑白皮中筛选得到31个活性化合物和93个相应靶点,COPD 3565个相关靶点,两者映射获得治疗COPD作用的活性成分22种:主要为槲皮素、山奈酚等,作用于IL6、VEGFA、EGFR、MAPK8等76个COPD核心靶点,生物功能与通路富集分析表明,桑白皮主要通过调控凋亡过程、细胞增殖、氧化还原过程、老化等生物行为,对信号通路PI3K-Akt、TNF、MAPK、P53、HIF-1等施以调节,起到治疗COPD作用。结论 研究结果体现了桑白皮治疗慢性阻塞性肺疾病多成分、多靶点、多途径的作用特点,...  相似文献   

9.
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨广藿香抗肝癌的作用靶点及信号通路,阐明其可能的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索广藿香的化学成分、作用靶点,运用Uniprot数据库对靶点名称进行规范,利用GeneCards数据库及OMIM数据库收集肝癌作用靶点,使用Venny 2.1网站将广藿香作用靶点与肝癌靶点取交集,通过STRING平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,采用DAVID网站进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Cytoscape 3.8.2软件用于构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络,筛选出核心靶点,并将活性成分与排名前5位的核心靶点进行分子对接。结果 筛选出10个广藿香主要活性成分及165个活性成分作用靶点,123个交集靶点。核心靶点为蛋白激酶B(Akt)、肿瘤蛋白P53(TP53)、白细胞介素-6(IL-6)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶(CASP3)。GO分析表明广藿香对肝癌的治疗作用主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、转录的正调控和DNA模板化等283条生物过程,蛋白质结合、相同蛋白质结合和RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端区序列特异性DNA结合等57个分子功能,核和胞质溶胶等26个细胞组分;KEGG富集分析得到95条信号通路,主要包括癌症通路、乙型肝炎、人类T淋巴细胞病毒Ⅰ(HTLV-I)感染、肿瘤蛋白、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt等信号通路。分子对接结果显示,广藿香有效成分能够与核心靶点有效结合。结论 广藿香可通过作用于Akt1、TP53、IL-6、JUN、CASP3等靶点,调控乙型肝炎、HTLV-I感染、PI3K/Akt等信号通路发挥肝癌治疗作用。  相似文献   

10.
目的 探讨儿童清咽解热口服液治疗上呼吸道感染的潜在机制。方法 分别从TCMSP和Swiss Target Prediction数据库中提取儿童清咽解热口服液组方药物的潜在生物活性成分和相应的靶点,疾病靶点从GeneCards数据库中获取。通过Cytoscape软件构建"中药材-化合物-靶点"网络,并通过STRING web平台分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。在DAVID平台上进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,利用Maestro软件进行分子对接。采用RAW264.7细胞进行体外Western blottitng和免疫荧光实验验证。结果 共筛选儿童清咽解热口服液组方药材含有的41种有效化合物,177种成分和疾病的共同靶点。其中,黄芩苷、柴胡皂苷、槲皮素、鱼腥草素等是重要的活性化合物。PI3K、Akt、EGFR、MAPK3、GRB2、PIK3R1等是关键靶点。PI3K/Akt信号通路、HIF-1信号通路和FOXO信号通路被认为是3条重要的信号通路。相关成分、靶点和通路与抗炎、抗病毒和免疫调节有关。分子对接结果提示,筛选的12个关键靶点可与大多数主要活性化合物紧密结合。Western blotting和免疫荧光实验结果显示,儿童清咽解热口服液可以抑制PI3K和Akt的蛋白表达,与网络药理学的预测结果一致。结论 儿童清咽解热口服液主要通过调节PI3K/Akt等信号通路发挥治疗儿童急性上呼吸道感染的作用。  相似文献   

11.
摘要:目的:基于网络药理学,预测复方白花蛇舌草胶囊治疗肝细胞癌的潜在靶点及其机制研究。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出本处方5味中药潜在活性成分,通过Drug Bank和化合物与蛋白质互作(STITCH)数据库分析筛选作用靶点;查询肝癌疾病特定数据库Liverome和Onco DB.HCC得到疾病靶点;韦恩图取得交集,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据库构建复方白花蛇舌草胶囊和肝细胞癌的交互靶点调控功能;通过中医药百科全书(ETCM)数据库分析药物属性和归经情况。同时利用Clu GO、DAVID分析平台进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路的富集。结果:本研究共筛选出134个潜在的活性成分与疾病映射后的41个靶点蛋白,且药物属寒性,主要对应肝经和脾经。处方中药物活性成分主要作用于TP53、PTGS2、ESR1、AR等靶蛋白,调控PI3K-AKT、MAPK和TNF信号通路等,发挥治疗肝细胞癌作用。结论:复方白花蛇舌草胶囊可以通过增强免疫力、抑制肿瘤细胞增殖和促进细胞凋亡的多靶点-多途径干预治疗肝细胞癌。  相似文献   

12.
目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨土茯苓防治炎症性肠病(IBD)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获得土茯苓的活性成分;在TTD、OMIM、Gene Cards数据库中去重、合并多平台的IBD靶点信息;获得活性成分和疾病靶点的交集并构建蛋白互作网络图(PPI)、“药物–成分–靶点–疾病”互作网络图;利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析,获得相关生物学过程信息及疾病作用通路;利用Cytoscape获得核心靶点并使用Auto Dock Tools 1.5.7对其进行分子对接。结果 共获得15个活性成分、190个药效成分靶点、2 171个疾病靶点,整理得到137个交集靶点,通过界值筛选得到28个核心靶点,其中5个为关键核心靶点,主要涉及P53核内磷酸化蛋白(TP53)、白细胞介素-6(IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等,并推测磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路是主要作用通路。分子对接结果显示关键核心靶点与土茯苓相关活性成分具有关键的结...  相似文献   

13.
目的 应用网络药理学和分子对接技术,探讨肾炎康复片治疗IgA肾病的作用机制。方法 通过数据库筛选肾炎康复片的主要活性成分,进行靶点预测。收集IgA肾病相关靶点,并与肾炎康复片活性成分靶点基因交集,选取共同靶点。构建蛋白质-蛋白质互作网络图和药物-活性成分-共同靶点网络图筛选出药物主要活性成分。通过MetaScape数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析并构建主要活性成分-靶点-信号通路网络图。选取关键成分和核心靶点,使用Pymol、MGLTools、AutoDock等软件做分子对接。结果 肾炎康复片的活性化合物共有182个,涵盖310个作用靶点,IgA肾病相关疾病靶点有1190个。筛选出共同靶点119个,主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶(PI3K/Akt)、白细胞介素17(IL-17)、细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路。网络分析和分子对接结果提示肾炎康复片中关键成分豆甾醇、β-谷甾醇可能通过作用于核心靶点B细胞淋巴瘤-2基因(BCL2)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、胱天蛋白酶3(CASP3)发...  相似文献   

14.
目的 基于网络药理学探讨表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)治疗阿尔茨海默病(AD)的相关作用靶点及主要信号通路,探讨其治疗AD的可能作用机制。方法 通过Pubchem数据库筛选EGCG活性成分及作用靶点;通过利用Genecards数据库和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索AD的基因靶点,将疾病靶点与药物作用靶点融合找出交集靶点。在String平台利用EGCG的靶标基因与AD靶标基因的交集基因构建蛋白相互作用(PPI),运用Cytoscape 3.7.2软件构建“EGCG-成分-靶点”网络,通过Metascape等数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后采用Auto Dock Vina软件进行分子对接。结果 获得EGCG有效成分和作用靶点有171个,其中与AD相关的靶点95个。EGCG改善AD病理变化的核心靶点主要集中在AKT1、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6等蛋白上。这些靶点涉及信号通路169条,包括磷脂酰肌醇3-羟激酶(PI3K)/Akt信号通路、低氧诱导因子(HIF)-1信号通路、促分裂原活化的蛋白激酶(MA...  相似文献   

15.
目的 基于网络药理学结合分子对接技术探究石榴皮治疗腹泻的作用机制。方法 通过TCMSP数据库获取石榴皮的活性成分和潜在作用靶点;GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库进行检索获得腹泻的潜在作用靶点,筛选两者交集靶点;应用Cytoscape软件构建蛋白相互作用(PPI)图并筛选核心靶点。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后采用AutoDock软件进行分子对接验证。结果 获得7个石榴皮主要化学成分,石榴皮与腹泻共同靶点114个。PPI分析显示,肿瘤抗原p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、胱天蛋白酶33(CASP)等可能为治疗关键靶点。通过KEGG分析表明,石榴皮可能通过癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路等起到治疗腹泻的作用。分子对接表明关键活性成分与核心靶点均可自发结合。结论 通过网络药理学和分子对接技术揭示石榴皮可以通过多成分、多靶点、多途径治疗腹泻,为后续研究提供理论依据。  相似文献   

16.
目的 运用网络药理学的方法挖掘中药复方急支糖浆治疗咳嗽的有效成分、关键靶点以及潜在作用通路。方法 分别利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Genecards数据库筛选急支糖浆的活性成分作用靶点和咳嗽的疾病靶点,两者靶点取交集后利用Cytoscape软件构建成分-靶点网络,String数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络,拓扑分析获取关键靶点和成分。通过David数据库进行基因本体论(GO)生物学功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。通过分子对接技术进一步佐证网络药理学结果的可靠性,通过小鼠咳嗽模型进行实验验证。结果 急支糖浆中共筛选出活性成分163种,可干预咳嗽相关靶点154个,GO富集586个,KEGG通路119条。其中,槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等可能为急支糖浆治疗咳嗽的关键成分,CXCL8、MAPK8、STAT3、TNF等为潜在靶点,GO富集分析的生物功能涉及到细胞增殖、血管生成、炎症反应等,KEGG通路富集分析涉及到TNF、PI3K-Akt、FoxO、HIF-1等信号通路。超过90%的分子对接结果均具有一定的结合活性。使用流式细胞术、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、酶联免疫吸附(ELISA)的方法验证了急支糖浆对咳嗽小鼠淋巴细胞分化、炎症因子和部分关键靶点表达的影响。结论 急支糖浆治疗咳嗽的作用机制是通过多种活性成分作用于多靶点、多通路产生了调控炎症过程、调节免疫功能、促进细胞增殖、修复受损机体等综合效果,该结果为进一步研究急支糖浆有效成分和作用机制奠定基础。  相似文献   

17.
目的 利用网络药理学及分子对接探究消渴清颗粒治疗糖尿病前期的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库搜索有关于消渴清颗粒中中药的有效成分与靶点,在GeneCards数据库、OMIM数据库搜索糖尿病前期的基因靶点,进而获得药物-疾病交集靶点,将交集靶点导入String蛋白质相互作用数据库和Cytoscape构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,并筛选核心靶点,再将药物-疾病交集靶点导入DAVID数据库,对其分别进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,筛选出与疾病相关的通路,通过Cytoscape得出“通路-靶点”网络图,再通过插件分析得出“通路-靶点”网络核心靶点,取二者度值排名前7位的靶点交集作为消渴清颗粒治疗糖尿病前期的关键靶点,最后选择关键靶点与有效成分用AutoDock与Pymol软件进行分子对接及可视化。结果 筛选出消渴清颗粒中药活性成分36种,其中筛选出6种关键活性成分,分别为槲皮素、山柰酚、小檗碱、β-谷甾醇、花生四烯酸、知母皂苷C,靶点基因232个;筛选出糖尿病前期靶点685个,交集靶点93个,关键靶点5个,分别为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、环加氧酶2(PTGS2)。GO通路富集主要涉及内容有炎症、药物反应,细胞生长凋亡等;KEGG通路富集分析显示糖尿病并发症中的晚期搪基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、IL-17信号通路、胰岛素抵抗通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信号通路等,分子对接结果显示关键靶点与有效成分具有较稳定的结合能力。结论 消渴清颗粒中各种药物成分通过多靶点、多通路协同治疗糖尿病前期的作用机制,为进一步研究治疗糖尿病提供了线索。  相似文献   

18.
目的 探讨健脾消脂方异病同治2型糖尿病(T2DM)合并脂代谢紊乱潜在作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得健脾消脂方中主要的活性成分及其潜在靶蛋白。利用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选出与T2DM、脂代谢紊乱相关的疾病靶点,并通过Cytoscape3.7.0软件构建“成分-靶点-基因-疾病”网络图;将T2DM、脂代谢紊乱的共同靶点导入STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络图,并将PPI分析数据导入Cytoscape3.7.0软件中,筛选出健脾消脂方异病同治T2DM合并脂代谢紊乱的核心靶点,并构建核心靶点网络图。在DAVID数据库中进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果 检索到健脾消脂方71种药物活性成分,262个有效靶点,2型糖尿病相关靶点2 078个、脂代谢紊乱相关靶点1 467个,药物与疾病的共同靶点133个。GO与KEGG分析表明健脾消脂方治疗T2DM合并脂代谢紊乱主要涉及晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、...  相似文献   

19.
目的 利用网络药理学方法探讨半夏麻黄丸治疗心律失常的潜在作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),以类药性(DL)、脂水分配系数对数值(ALogP)为条件筛选半夏麻黄丸的活性成分并收集靶点信息;使用人类基因数据库(Genecard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取疾病靶点,进而构建韦恩图,得到半夏麻黄丸治疗心律失常的潜在作用靶点;采用Cystoscap 3.7.2软件构建“中药-成分-疾病-靶点”网络,运用STRING数据库构建蛋白互相作用(PPI)网络,并对靶点基因功能(GO)和KEGG通路进行分析。结果 从半夏麻黄丸中共筛选出槲皮素、芹菜素、木犀草素等36个活性成分,涉及包括PTGS2、PRSS1、RXRA、ADRB2、DPP4在内的165个基因靶点,主要富集于2 467条生物过程、155条分子功能和89个细胞组分,调节175条与心律失常相关的信号通路。结论 半夏麻黄丸可能是通过CRP、CXCL2、CCL2等靶点,调控PI3K-Akt、TNF、IL-17等信号通路,从而发挥多成分、多靶点和多通路治疗心律失常的作用优势。  相似文献   

20.
目的 利用液相色谱质谱联用和网络药理学、分子对接技术探讨秦巴硒菇提取物治疗慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia, CML)的潜在活性靶点及相关信号通路,并通过体外实验进一步验证。方法 应用液相色谱质谱分析秦巴硒菇提取物的活性成分,通过Swiss Target Prediction数据库预测药物靶点;从GeneCards、DisGeNET数据库获取CML的疾病靶点。筛选出药物和CML的共同靶点,通过STRING数据库进行蛋白质互作分析,利用Cytoscape软件构建蛋白互作网络图,并通过DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析。分别应用DockThor和Pymol进行分子对接及可视化处理。利用CCK-8法测定秦巴硒菇提取物对K562细胞的增殖抑制作用,Western blot验证其对相关蛋白及磷酸化水平的影响。结果 秦巴硒菇提取物活性成分共126种,药物和疾病共同靶点172个;KEGG通路分析结果显示PI3K/Akt/mTOR信号通路可能在治疗CML疾病中起到关键作用。秦巴硒菇提取物在K562细胞中24、48 h的IC50分别为1...  相似文献   

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